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当前共找到 9441 篇文献，本页显示第 2961 - 2980 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2961 | 2026-08-09 |
Spatial-cellular resolution analysis of ferroptosis-associated immune microenvironment heterogeneity in osteoarthritic cartilage
2026-Jul, Immunobiology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.imbio.2026.153212
PMID:42341350
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和空间转录组分析，揭示了骨关节炎软骨中铁死亡与免疫微环境异质性之间的关联，特别是铁死亡软骨细胞与巨噬细胞极化及SPP1信号通路的相互作用 | 首次在空间分辨率上解析骨关节炎软骨中铁死亡相关免疫微环境异质性，识别出SPP1信号通路作为铁死亡软骨细胞与促炎巨噬细胞间通讯的潜在介导因子 | 研究主要基于转录组数据和体外实验，缺乏体内功能验证；样本量可能有限，且未提供具体样本数量 | 阐明骨关节炎软骨中铁死亡与免疫微环境的相互作用，特别是铁死亡与巨噬细胞极化的潜在关联，并寻找治疗靶点 | 骨关节炎软骨组织中的铁死亡软骨细胞和免疫细胞（特别是巨噬细胞） | 数字病理学 | 骨关节炎 | 转录组测序、单细胞RNA测序、空间转录组测序 | NA | 转录组数据、单细胞数据、空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 2962 | 2026-08-09 |
A novel linker region truncating variant in BCL10 underlies a leaky immunodeficiency phenotype
2026-Jul, Pediatric allergy and immunology : official publication of the European Society of Pediatric Allergy and Immunology
IF:4.3Q1
DOI:10.1111/pai.70441
PMID:42473108
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研究论文 | 该研究描述了一个新型BCL10基因连接区截短变异导致的泄漏性联合免疫缺陷表型，并探讨其临床、免疫学和分子特征 | 首次报道BCL10连接区截短变异导致泄漏性免疫缺陷表型，结合单细胞转录组测序和多维度功能检测揭示CBM非依赖性炎症通路激活与经典NF-κB缺陷并存 | 仅报道单一患者，缺乏更多病例验证；体外实验可能不完全反映体内情况；机制探索依赖细胞系和患者样本，需进一步动物模型验证 | 表征新型BCL10纯合变异体的临床、免疫学和分子特征，并探索其泄漏表型的潜在机制 | 一名联合免疫缺陷伴免疫失调的患者及其外周血单核细胞、T细胞、B细胞、单核细胞和NK细胞 | 免疫学 | 联合免疫缺陷 | 全外显子测序、Sanger测序、转录本研究、蛋白质研究、信号转导检测、细胞因子检测、T细胞增殖检测、单细胞RNA测序 | 无 | 测序数据、基因表达数据、功能实验数据 | 1名患者 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序 |
| 2963 | 2026-08-09 |
Identification of potential diagnostic biomarkers for myocardial infarction using bioinformatics and machine learning
2026-Jul, Immunobiology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.imbio.2026.153216
PMID:42447510
|
研究论文 | 利用生物信息学和机器学习方法识别急性心肌梗死的潜在诊断生物标志物 | 整合差异表达分析、WGCNA和机器学习算法，识别出四个关键基因（NFKBIA、FCER1G、CD36、ICAM1）构建诊断模型，并通过单细胞测序数据验证其中三个基因的表达模式 | 外部验证仅基于单细胞测序数据集，可能未涵盖所有临床样本类型；生物标志物的临床应用价值需进一步验证 | 通过生物信息学与机器学习方法筛选与急性心肌梗死相关的潜在生物标志物，以改善诊断和患者管理 | 急性心肌梗死患者的相关基因表达数据及免疫细胞动态 | 生物信息学, 机器学习 | 心血管疾病（急性心肌梗死） | RNA测序，单细胞测序 | 机器学习模型（具体类型未指定） | 基因表达数据（转录组），单细胞转录组数据 | 未明确说明样本数量 | NA | RNA测序，单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2964 | 2026-08-09 |
Integrating Bulk and Single-Cell RNA Sequencing to Identify Prognostic Genes Associated with Adaptive Immunity and the Tumor Microenvironment in Cholangiocarcinoma for Risk Model Construction
2026-Jul, Immunobiology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.imbio.2026.153213
PMID:42468280
|
研究论文 | 通过整合批量与单细胞RNA测序数据，识别与胆管癌适应性和肿瘤微环境相关的预后基因，并构建风险模型 | 本研究首次将适应性免疫反应相关基因与肿瘤微环境组成相结合，用于胆管癌的预后分层，并揭示了免疫细胞中心机制和瘤内微生物群的影响 | 所有数据均来自公开资源，可能引入批次效应或异质性；风险模型的临床适用性需进一步验证 | 探讨适应性免疫反应如何影响胆管癌的肿瘤微环境和预后，并构建预后风险模型 | 胆管癌患者的肿瘤与正常组织样本，以及肿瘤微环境中的免疫细胞（如巨噬细胞） | 生物信息学、基因组学 | 胆管癌 | 批量RNA测序、单细胞RNA测序 | Cox回归风险模型、列线图（Nomogram） | 转录组数据（基因表达数据） | 公开数据集中的胆管癌患者样本（具体数量未在标题和摘要中提供） | NA | 批量RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2965 | 2026-08-09 |
Longitudinal Evolution and Cellular Plasticity in Meningioma: Insights From Single-Cell Transcriptomics
2026-Jul, Brain tumor research and treatment
DOI:10.14791/btrt.2026.0021
PMID:42543809
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综述 | 本文综述了脑膜瘤纵向演化、细胞可塑性、分子亚型转变及微环境重塑的最新证据，并基于单细胞转录组学探讨复发机制 | 整合了纵向单核RNA测序数据，揭示复发脑膜瘤中增殖、DNA修复和细胞外基质程序的富集，以及多向转录轨迹而非简单线性进展 | 所提出的基因-巨噬细胞相互作用证据主要基于相关性分析，且可能受原发与复发采样间治疗干预的影响 | 总结复发脑膜瘤纵向演化和细胞可塑性的研究进展，明确关键局限和未来研究方向 | 脑膜瘤，包括原发和复发性肿瘤样本 | 基因组学, 单细胞转录组学 | 脑膜瘤 | 单核RNA测序, 甲基化测序, 转录组测序 | NA | 基因表达数据, 甲基化数据 | 未明确，综述提及匹配的原发和复发样本 | NA | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | NA | NA |
| 2966 | 2026-08-09 |
Multi-Omics Analysis Reveals Abnormal Metabolism of Lysophosphatidylinositol in Nasal Polyp
2026-Jul, Allergy, asthma & immunology research
DOI:10.4168/aair.2026.18.4.566
PMID:42547469
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研究论文 | 通过多组学分析揭示鼻息肉中溶血磷脂酰肌醇的异常代谢 | 首次整合脂质组学和单细胞转录组学，发现LPI代谢轴与嗜酸性粒细胞激活相关，为CRSwNP的发病机制和内分型提供新见解 | 样本量相对较小，且未进行功能验证实验 | 探讨慢性鼻窦炎伴鼻息肉组织中脂质代谢的特征 | 鼻息肉患者和健康对照者的鼻黏膜组织 | 多组学、脂质组学、单细胞转录组学 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉 | 脂质组学、单细胞转录组学、免疫荧光染色、Western blot | NA | 质谱数据、单细胞转录组数据、图像 | 32例鼻息肉患者和20例健康对照者的鼻黏膜组织 | NA | 脂质组学、单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2967 | 2026-08-09 |
Stromal and endothelial transcriptional changes during progression from MGUS to myeloma and after treatment response
2026-Jun-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-74389-y
PMID:42336819
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序技术，揭示从意义未明的单克隆丙种球蛋白病（MGUS）进展至多发性骨髓瘤（MM）及治疗应答过程中，骨髓微环境中非免疫细胞（内皮细胞和间充质干细胞）的转录组变化 | 首次在遗传工程小鼠模型中描绘MGUS向MM进展过程中内皮细胞和间充质干细胞的动态转录组变化，并识别出由干扰素驱动的协调程序，该程序在治疗后受到抑制 | 研究主要基于小鼠模型，患者样本验证仅用于确认干扰素特征，未涉及功能实验或临床结局关联 | 阐明多发性骨髓瘤进展过程中骨髓微环境非免疫细胞的转录组变化及治疗对其的影响 | 内皮细胞（EC）和间充质干细胞（MSC） | 单细胞转录组学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 单细胞转录组数据 | 遗传工程小鼠模型（BIcγ1和MI模型）及患者样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium 单细胞3'转录组测序 |
| 2968 | 2026-08-09 |
MYDGF promotes pathological and physiological retinal angiogenesis via the Gαi1/3-Gab1-Akt-mTOR signaling
2026-Jun-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-74780-9
PMID:42336863
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序及人类患者验证，发现髓系来源生长因子（MYDGF）通过Gαi1/3-Gab1-Akt-mTOR信号轴促进病理性及生理性视网膜血管生成 | 首次识别MYDGF作为视网膜血管动力学调控的关键因子，并阐明其通过Gαi1/3-Gab1-Akt-mTOR轴促进血管生成的新机制 | 未明确提及 | 探究视网膜新生血管（RNV）发生发展中的关键调控因子及机制 | 视网膜内皮细胞、新生小鼠、雄性小鼠、增殖性糖尿病视网膜病变患者样本 | 分子生物学 | 增殖性糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确提及具体样本量 | 未明确提及 | 单细胞RNA测序 | 未明确提及 | NA |
| 2969 | 2026-08-09 |
Cluster replicability in single-cell and single-nucleus atlases of the mouse brain
2026-Jun-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-74171-0
PMID:42331798
|
研究论文 | 评估两个大型小鼠脑图谱中细胞集群的可重复性，通过转录组范围的邻居投票识别相互匹配的集群对。 | 首次对小鼠脑图谱中的细胞集群进行系统性的可重复性评估，利用转录组范围的邻居投票方法，并整合空间定位和基因表达协调性。 | 区分相近集群比区分一个集群与大多数其他集群更具挑战性，尤其是在使用标记基因时。 | 评估单细胞和单核RNA测序图谱中细胞集群的可重复性，为研究图谱定义的集群及其生物学意义提供更坚实的基础。 | 两个大型小鼠脑图谱中的细胞集群，来自多个物种的数据集。 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序、单核RNA测序 | 邻居投票 | 转录组数据 | 超过400万个细胞，超过5000个集群，来自两个小鼠脑图谱 | NA | 单细胞RNA测序、单核RNA测序 | NA | NA |
| 2970 | 2026-08-09 |
Interleukin-19 ameliorates drug-induced liver injury by limiting proinflammatory macrophage infiltration via SUMOylation of C/EBPβ
2026-Jun-18, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2026.05.025
PMID:42314952
|
研究论文 | 本研究探讨了白细胞介素-19（IL-19）通过促进C/EBPβ的SUMO化修饰来限制促炎巨噬细胞浸润，从而改善对乙酰氨基酚诱导的肝损伤，并揭示了其分子机制。 | 首次揭示了IL-19通过促进C/EBPβ的SUMO化修饰抑制促炎基因表达，从而限制S100A8/A9+促炎巨噬细胞浸润，改善药物性肝损伤的新机制。 | 研究主要基于小鼠模型，尚需在人体中验证；未深入探讨IL-19在其他类型肝损伤中的作用。 | 研究IL-19在对乙酰氨基酚诱导的肝损伤（AILI）中的作用及其分子机制，并评估其作为治疗靶点的潜力。 | Il19缺陷小鼠、髓系细胞特异性Il20r2敲除小鼠以及肝巨噬细胞。 | 机器学习和数字病理学 | 药物性肝损伤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），基因敲除，重组蛋白处理 | 单细胞转录组分析 | 基因表达数据（单细胞RNA测序数据） | 使用Il19缺陷小鼠、髓系细胞特异性Il20r2敲除小鼠及野生型对照小鼠，具体样本量未在摘要中提及。 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 未提供。 |
| 2971 | 2026-08-09 |
MGCL-ST: multi-view graph contrastive learning for spatial transcriptomics imputation
2026-Jun-04, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-026-01683-1
PMID:42237201
|
研究论文 | 提出MGCL-ST，一种多视图图对比学习方法，用于空间转录组数据的超分辨率插补，通过联合建模局部和全局空间图以及组织学特征来提高基因表达预测的准确性。 | 首次将多视图图对比学习应用于空间转录组插补，并整合病理学基础模型提取的组织学特征，以增强跨平台的插补性能和生物学解释性。 | 未明确提及，但可能受限于对高质量组织学图像的依赖以及不同平台间的可迁移性。 | 开发一种精确超分辨率的空间转录组插补方法，以解决空间数据稀疏性和分辨率不足的问题。 | 空间转录组数据，包括来自不同平台的未测量基因表达。 | 机器学习 | 肿瘤微环境分析（癌症相关） | 空间转录组测序 | 图对比学习模型 | 空间基因表达数据和组织学图像 | 未明确说明样本数量，但评估涉及三个不同的空间转录组平台。 | NA | 空间转录组学 | NA | 具体平台未在标题和摘要中提供 |
| 2972 | 2026-08-09 |
Tumor-infiltrating B cells inhibit nasopharyngeal carcinoma metastasis
2026-Jun-02, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08940-6
PMID:42230534
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和多重免疫荧光技术揭示了肿瘤浸润B细胞在鼻咽癌非转移组织中高度富集并形成完整三级淋巴结构，通过分泌IL-12和CXCL13等细胞因子抑制肿瘤转移的机制 | 首次阐明肿瘤浸润B细胞通过IL-12介导的EMT/血管拟态抑制和CXCL13介导的TLS形成双重通路协同抑制鼻咽癌转移，并验证了其在人源化小鼠模型中的抗肿瘤效果 | 未提及具体局限性，可能包括样本量有限或体外实验与体内环境的差异 | 探究鼻咽癌中肿瘤浸润B细胞的分布特征及其抗转移机制，评估其免疫治疗潜力 | 鼻咽癌组织中的肿瘤浸润B细胞及其微环境 | 数字病理学 | 鼻咽癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、免疫荧光图像 | 未明确提及具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2973 | 2026-08-09 |
Spatial transcriptomics of cervical cancer reveals microenvironment shaped the malignant epithelial programs and ECM-associated immune niches
2026-May-29, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-026-04439-3
PMID:42215810
|
研究论文 | 应用Stereo-seq空间转录组学技术研究宫颈癌微环境如何塑造恶性上皮程序及ECM相关免疫生态位 | 首次使用Stereo-seq空间转录组学技术对宫颈癌FFPE标本进行分析，鉴定了四种恶性上皮程序并揭示了其空间组织和分化轨迹 | 未提及 | 阐明宫颈癌进展和治疗反应受肿瘤内异质性和微环境影响，通过空间转录组学揭示恶性上皮亚型及其与免疫细胞的相互作用 | 宫颈癌FFPE标本、CIN III和浸润癌组织、公共scRNA-seq数据集 | 空间转录组学 | 宫颈癌 | Stereo-seq空间转录组学、免疫组织化学、单细胞RNA测序分析、细胞通讯分析 | NA | 空间转录组数据、免疫组化图像、单细胞转录组数据 | 宫颈癌FFPE标本数量未在摘要中明确 | BGI | 空间转录组学 | Stereo-seq | Stereo-seq空间转录组学平台用于FFPE宫颈癌样本分析 |
| 2974 | 2026-08-09 |
A multi-center cross-platform single-cell multimodal atlas of the mouse cerebral cortex
2026-May-11, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-026-07185-4
PMID:42115229
|
研究论文 | 基于九个小鼠数据集，构建了多中心、多平台的皮层细胞图谱，并进行了跨平台整合分析。 | 提出了一个多中心、多平台的小鼠皮层细胞图谱，并建立了跨技术和物种的标准化整合分析框架。 | 未在摘要中明确提及。 | 构建小鼠大脑皮层多模态单细胞图谱，并阐明跨平台和跨物种的细胞特性。 | 小鼠大脑皮层细胞。 | 单细胞组学 | 不适用 | 单细胞RNA测序、单核RNA测序 | 不适用 | 单细胞转录组数据、染色质可及性数据 | 173,081个高质量细胞，来自九个小鼠数据集 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、单核RNA测序 | 10x Genomics（具体产品未提及） | 10x Genomics和Drop-seq平台，分别进行单细胞和单核RNA测序 |
| 2975 | 2026-08-09 |
SPARC is associated with tumor nerve stroma interactions and perineural invasion in pancreatic ductal adenocarcinoma
2026-May-11, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-51848-6
PMID:42115728
|
研究论文 | 本研究通过垂直多共培养模型和蛋白质组学分析，发现SPARC在胰腺导管腺癌中与肿瘤神经间质相互作用及神经周围侵袭相关 | 首次采用垂直多共培养模型结合蛋白质组学鉴定SPARC为DRG和PSC共培养条件下的高表达因子，并整合公共转录组数据和免疫组化验证其临床相关性 | 未进行SPARC的功能验证，且研究局限于单一机构样本，样本量较小 | 探究胰腺导管腺癌中基质-神经相互作用在神经周围侵袭中的机制，并寻找相关生物标志物 | 人胰腺导管腺癌细胞、新生小鼠背根神经节神经元、人胰腺星状细胞以及81例手术切除的PDAC标本 | 数字病理学 | 胰腺导管腺癌 | 蛋白质组学、RNA-seq、scRNA-seq、免疫组化 | NA | 蛋白质组数据、转录组数据、图像 | 81例PDAC手术标本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2976 | 2026-08-09 |
Using CRISPR barcoding as a molecular clock to capture dynamic processes at single-cell resolution
2026-05-06, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.280915.125
PMID:42067223
|
研究论文 | 提出scDynaBar方法，结合CRISPR-Cas9动态条形码与单细胞测序，利用条形码突变记录细胞事件时间，并追踪小鼠胚胎干细胞向2C样状态的转变。 | 将CRISPR动态条形码作为分子时钟，通过突变积累记录细胞事件的时间顺序，为单细胞动态过程研究提供新工具。 | 摘要未提及具体局限性。 | 开发一种能在单细胞分辨率下捕捉动态生物学过程的新方法。 | 小鼠胚胎干细胞（mESCs）和小鼠胃样体（gastruloid）模型。 | 单细胞基因组学 | 不适用 | CRISPR-Cas9动态条形码、单细胞测序 | 不适用 | 单细胞转录组和基因条形码数据 | 小鼠胚胎干细胞和小鼠胃样体模型，具体样本量未在摘要中提及。 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 不适用 |
| 2977 | 2026-08-09 |
Suboptimal Responses to Anti-VEGF in Retinal Neurovascular Diseases: Linking Aging and Alternative Angioinflammatory Pathways
2026-05-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.67.5.4
PMID:42080790
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研究论文 | 本研究采用整合系统生物学框架，结合多组学数据、网络机器学习和疾病特异性通路映射，揭示视网膜神经血管疾病中抗VEGF治疗反应不佳的共享机制，并确定关键耐药枢纽和潜在治疗策略。 | 创新性地整合多组学数据集、网络机器学习与疾病特异性通路映射，识别出EGFR、HSP90AA1、SIRT1和STAT3作为连接血管生成和炎症过程的中心耐药枢纽，并利用单细胞RNA测序数据发现AMD-RPE中的细胞簇特异性基因枢纽。 | 研究结论基于计算分析和文献综述，需要进一步的疾病相关模型验证。 | 阐明视网膜神经血管疾病中抗VEGF治疗失败和疾病进展的共享机制。 | 视网膜神经血管疾病，包括糖尿病视网膜病变、年龄相关性黄斑变性、视网膜色素变性、青光眼和衰老。 | 机器学习 | 年龄相关性黄斑变性 | 多组学分析、单细胞RNA测序 | 网络机器学习 | 多组学数据、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2978 | 2026-08-09 |
Diabetes-induced TREM2-endothelial cell signaling impairs ischemic vascular repair
2026-Apr-22, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adu3761
PMID:42018669
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序和空间转录组学分析人类糖尿病血管，发现TREM2-内皮细胞信号传导损害缺血性血管修复，并验证了TREM2阻断可改善糖尿病相关外周动脉疾病的缺血恢复 | 首次构建人类糖尿病血管的单细胞和空间分辨率的转录组与相互作用组图谱，并揭示TREM2-内皮细胞相互作用作为糖尿病血管病变的新驱动因素和治疗靶点 | 摘要未提及研究局限性 | 探究糖尿病加速血管疾病（尤其是外周动脉疾病）的机制，特别是内皮细胞和巨噬细胞间的相互作用 | 人类肠系膜动脉（来自非糖尿病供体和2型糖尿病供体）以及小鼠后肢缺血模型 | 单细胞组学 | 糖尿病相关外周动脉疾病 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据 | 人类肠系膜动脉样本（来自非糖尿病和2型糖尿病供体）及小鼠缺血模型样本 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 2979 | 2026-08-09 |
Revealing novel subtypes of synovial sarcoma through single cell transcriptomics
2026-Apr-15, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-026-00711-5
PMID:41986365
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示滑膜肉瘤的四种分子亚型，补充传统分类并提示单相间充质型可能包含两种亚型 | 首次通过单细胞转录组学定义滑膜肉瘤的四种分子亚型，识别出NKD2、HOXD11、DCN和EPCAM亚型，并揭示其不同的肿瘤微环境特征和潜在治疗靶点 | 未提供具体样本量信息，且亚型的临床验证和功能实验尚未进行 | 通过单细胞RNA测序探索滑膜肉瘤的肿瘤内异质性，揭示其分子亚型及其临床意义 | 滑膜肉瘤肿瘤细胞及其微环境中的细胞类型 | 单细胞转录组学 | 滑膜肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未提供具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2980 | 2026-08-09 |
scDEBGCL: a deep embedding approach based on bipartite graph contrastive learning for single-cell RNA-seq data
2026-04-14, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-026-02598-4
PMID:41981652
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研究论文 | 本文提出scDEBGCL，一种基于二分图对比学习的深度嵌入方法，用于单细胞RNA测序数据，以提升下游分析如细胞聚类和轨迹推断的性能。 | 首次将奇异值分解(SVD)用于二分图增强，并结合图对比学习、图重构和数据重构，联合学习低维细胞嵌入，有效保留全局细胞-基因交互并捕获判别性细胞表示。 | 未明确提及局限性，但可能依赖计算资源，且对高维稀疏数据的处理效率需进一步验证。 | 解决scRNA-seq数据高维性和稀疏性问题，通过学习有效的低维嵌入表示，支持细胞聚类、轨迹推断和标记基因识别等下游分析。 | 单细胞RNA测序数据中的细胞和基因表达矩阵。 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 图对比学习（GCL）框架，基于深度嵌入算法 | 基因表达矩阵（转录组数据） | 未在摘要中提及具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |