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当前共找到 3630 篇文献，本页显示第 2921 - 2940 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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| 2921 | 2026-01-25 |
Integrated in vivo combinatorial functional genomics and spatial transcriptomics of tumours to decode genotype-to-phenotype relationships
2026-Jan, Nature biomedical engineering
IF:26.8Q1
DOI:10.1038/s41551-025-01437-1
PMID:40721510
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研究论文 | 本研究开发了PERTURB-CAST和CHOCOLAT-G2P方法，结合空间转录组学与体内功能基因组学，以解析肿瘤中基因型与表型的关系 | 开发了PERTURB-CAST方法，利用RNA模板连接探针和商业10X Visium平台，首次在同一组织切片中整合扰动映射与全转录组表型分析；并提出了CHOCOLAT-G2P框架，用于研究模拟肿瘤异质性的高阶组合扰动 | NA | 解码肿瘤中基因型到表型的关系，并研究组合扰动在组织水平上的表型效应 | 自发性镶嵌性肝肿瘤 | 空间转录组学 | 肝肿瘤 | 空间转录组学，RNA模板连接探针 | NA | 空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10X Visium | 商业10X Visium空间转录组学平台 |
| 2922 | 2026-01-25 |
Single-cell RNA sequencing reveals immune regulatory mechanisms and molecular therapeutic strategies in the microenvironment of multiple myeloma
2026-Jan-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003306
PMID:40899849
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序、孟德尔随机化和分子对接模拟，揭示了多发性骨髓瘤微环境中的免疫调控机制和潜在治疗靶点 | 结合单细胞RNA测序、孟德尔随机化和分子对接模拟，系统解析多发性骨髓瘤微环境中的细胞互作和信号通路，并识别新的小分子治疗策略 | 研究主要基于生物信息学分析，缺乏实验验证；样本来源和数量可能有限，影响结果的普适性 | 探究多发性骨髓瘤微环境中的分子和细胞相互作用，以发现治疗靶点 | 多发性骨髓瘤微环境中的肿瘤细胞、免疫细胞和基质细胞 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 分子对接模拟 | Seurat, GSVA, 两样本孟德尔随机化 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2923 | 2025-09-09 |
Comments on "Tracking adipose-derived stem cell exosomes applied in a mouse crush injury model: insights from fluorescent labeling and spatial transcriptomics - an experimental study"
2026-Jan-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003382
PMID:40919925
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2924 | 2026-01-25 |
Immunological microenvironment differences between left and right colon cancer: dynamic interactions of CASC15+KLK6+ epithelial subpopulation with T cells and mast cells
2026-Jan-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003453
PMID:40932351
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了左右半结肠癌免疫微环境的差异，并鉴定出一个与预后不良相关的CASC15+KLK6+上皮亚群 | 首次在单细胞水平系统比较左右半结肠癌的免疫微环境差异，并发现了一个具有高拷贝数变异和恶性通路活性的特异性上皮亚群，其与T细胞、肥大细胞的相互作用通过MIF和CD99信号通路驱动免疫抑制 | 样本量较小（单细胞测序仅6例），验证队列规模有限（70例），且未进行功能性实验验证信号通路的具体机制 | 探究左右半结肠癌免疫微环境的差异及其对临床行为的潜在影响 | 左半结肠癌和右半结肠癌患者的肿瘤组织 | 数字病理学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序，免疫荧光 | Seurat, inferCNV, Monocle2, GSVA, CellChat | 单细胞转录组数据，图像数据 | 单细胞测序：3例左半结肠癌和3例右半结肠癌；验证队列：70例患者（30例左半结肠癌，40例右半结肠癌） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2925 | 2026-01-25 |
Single-cell transcriptome analysis reveals regulatory programs associated with tumor resistance during immunotherapy in colorectal cancer
2026-Jan-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003459
PMID:40932376
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了结直肠癌免疫治疗耐药期间T细胞亚群的调控程序 | 首次在转移性dMMR结直肠癌患者中系统比较了耐药与敏感组的单细胞转录组差异，并识别出TSTR和γδ T细胞的转录网络失调是耐药的核心机制 | 研究主要基于单细胞测序数据的生物信息学分析，缺乏体内外功能实验验证；临床样本量相对有限（190例） | 探究结直肠癌免疫治疗耐药的分子机制 | 转移性DNA错配修复缺陷（dMMR）结直肠癌患者 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、临床组织样本 | 190例结直肠癌患者及其配对癌旁正常组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2926 | 2026-01-25 |
Polyethylene terephthalate microplastics exposure enhances the risk of ulcerative colitis: insights from multiomics integration, machine learning, and molecular docking reveal intestinal toxicity mechanisms
2026-Jan-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003476
PMID:40981471
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研究论文 | 本研究通过多组学整合、机器学习和分子对接揭示了聚乙烯对苯二甲酸酯微塑料暴露增加溃疡性结肠炎风险的肠道毒性机制 | 首次整合多组学数据、机器学习算法和分子对接技术，系统性识别了PET-MPs诱导UC的关键靶点基因，并构建了高精度的风险预测模型 | 研究主要基于公共数据库数据和动物模型，缺乏直接的人类临床验证，且PET-MPs暴露剂量和时长可能无法完全反映真实环境暴露情况 | 探究PET微塑料暴露与溃疡性结肠炎风险增加的分子机制 | PET微塑料、溃疡性结肠炎相关基因靶点、动物模型肠道组织 | 机器学习 | 溃疡性结肠炎 | 多组学整合、机器学习、分子对接、单细胞测序分析、Western blot | 多种机器学习算法（包括SHAP分析） | 基因表达数据、蛋白质表达数据、分子对接模拟数据 | 未明确具体样本数量，但使用了公共数据库数据和动物模型 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 2927 | 2026-01-25 |
Selenomethionine alleviates aortic dissection via PGC-1α/NRF2/TFAM-mediated mitochondrial biosynthesis against ferroptosis: an experimental study
2026-Jan-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003561
PMID:41208796
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研究论文 | 本研究探讨了硒代蛋氨酸通过PGC-1α/NRF2/TFAM轴介导的线粒体生物合成抑制铁死亡，从而缓解主动脉夹层的治疗效果和机制 | 首次揭示了硒代蛋氨酸通过激活PGC-1α/NRF2/TFAM轴抑制铁死亡，从而减轻主动脉夹层的具体分子机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验，临床转化仍需进一步验证 | 探索硒代蛋氨酸治疗主动脉夹层的疗效及其潜在分子机制 | 小鼠主动脉夹层模型和血小板衍生生长因子-BB诱导的血管平滑肌细胞 | 心血管疾病 | 主动脉夹层 | 单细胞测序、转录组分析、小干扰RNA敲低技术 | 小鼠模型、细胞模型 | 基因表达数据、细胞表型数据 | 未明确指定样本数量，涉及小鼠模型和患者VSMCs | NA | 单细胞RNA-seq、转录组测序 | NA | NA |
| 2928 | 2026-01-25 |
Metformin Restores Mitochondrial Function and Neurogenesis in POLG Patient-Derived Brain Organoids
2026-Jan, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202417721
PMID:41355579
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研究论文 | 本研究利用患者来源的iPSC皮质类器官模拟POLG相关神经退行性疾病，并评估了二甲双胍在恢复线粒体功能和神经发生方面的治疗潜力 | 首次在POLG患者来源的脑类器官模型中，通过单细胞RNA-seq揭示不同神经元亚型的特异性脆弱性，并证明二甲双胍能恢复神经元身份、线粒体功能和代谢通路 | 研究基于体外类器官模型，可能无法完全模拟体内复杂环境；治疗剂量和时间窗口需进一步优化；未涉及长期疗效和潜在副作用评估 | 探究二甲双胍对POLG相关线粒体功能障碍和神经发生损伤的治疗作用及机制 | POLG患者来源的诱导多能干细胞（iPSC）皮质类器官 | 神经科学 | 线粒体疾病 | 单细胞RNA-seq，功能测定（线粒体膜电位、质量、氧化应激），钙测量，非靶向代谢组学 | 脑类器官模型 | 单细胞转录组数据，功能测定数据，代谢组数据 | 患者来源的iPSC皮质类器官 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2929 | 2026-01-08 |
Spatial transcriptomics decodes the cellular landscape of plant-pathogen interaction
2026-Jan, Nature plants
IF:15.8Q1
DOI:10.1038/s41477-025-02204-5
PMID:41495461
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2930 | 2026-01-25 |
Integrated analysis of bulk RNA and single-cell RNA sequencing data reveals potential biomarkers and immune infiltrates associated with N7-methylguanosine in osteoarthritis
2026-Jan-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003571
PMID:41056007
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研究论文 | 本研究通过整合分析bulk RNA和单细胞RNA测序数据，揭示了与骨关节炎中N7-甲基鸟苷修饰相关的潜在生物标志物和免疫浸润特征 | 首次在骨关节炎中系统研究m7G修饰的作用，识别了四个关键m7G调节因子作为新型生物标志物，并探索了其与免疫浸润和软骨退化的关系 | 需要进一步实验来阐明骨关节炎的分子机制 | 识别与骨关节炎中m7G修饰相关的基因，并研究其诊断价值和免疫浸润特征 | 骨关节炎患者样本（106个OA样本） | 生物信息学 | 骨关节炎 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 | LASSO回归, 无监督聚类分析 | RNA测序数据 | 106个骨关节炎样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2931 | 2026-01-25 |
Decoding the triglyceride-glucose index in metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease: integrative insights from Mendelian randomization, cross-tissue transcriptomics, and spatial multi-omics
2026-Jan-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003576
PMID:41056021
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研究论文 | 本研究通过整合孟德尔随机化、跨组织转录组学和空间多组学方法，揭示了甘油三酯-葡萄糖指数在代谢功能障碍相关脂肪性肝病中的因果机制和分子驱动因素 | 首次采用多组学框架结合孟德尔随机化、转录组范围关联研究和空间转录组学，系统解析了TyG指数与MASLD之间的因果关系及组织特异性表达模式 | 研究主要基于欧洲人群的遗传数据，可能限制了结果在其他人群中的普适性；空间转录组学数据来源于小鼠胚胎期，与人类成年期疾病状态存在差异 | 阐明甘油三酯-葡萄糖指数在代谢功能障碍相关脂肪性肝病发展中的因果作用机制 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病患者及小鼠模型 | 生物信息学 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 | 孟德尔随机化, 转录组范围关联研究, 空间转录组学, 单细胞测序 | IVW, GSMR, JTI-PrediXcan, SMulTiXcan, FOCUS, FUSION, PoPS | 基因组数据, 转录组数据, 空间转录组数据 | 基于UK Biobank的192个全基因组显著单核苷酸多态性 | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 2932 | 2026-01-25 |
SPP1 in notochord cells modulates intervertebral disc degeneration through CD44 recognition by macrophages based on single-cell transcriptome analysis
2026-Jan-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003454
PMID:41065569
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研究论文 | 本研究通过改进大鼠椎间盘压力模型，结合单细胞转录组分析，探讨了机械应力如何通过SPP1-CD44信号通路影响椎间盘退变 | 改进了大鼠椎间盘压力模型，并首次在单细胞水平揭示了机械应力下脊索细胞群的变化及SPP1-CD44信号通路在椎间盘退变中的作用 | 研究主要基于大鼠模型，人类数据验证部分依赖于公共数据库，缺乏直接的人类样本实验验证 | 探究机械应力导致椎间盘退变的分子机制 | 大鼠椎间盘组织及脊索细胞 | 单细胞转录组学 | 椎间盘退变 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 手术组与假手术组大鼠椎间盘样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2933 | 2026-01-24 |
CPE/HYOU1 axis-activated Hippo-YAP signaling pathway suppresses PANoptosis to facilitate osteosarcoma progression
2026-Feb-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.218121
PMID:41213463
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析，识别了与PANoptosis相关的骨肉瘤预后生物标志物，并揭示了CPE/HYOU1轴通过激活Hippo-YAP信号通路抑制PANoptosis以促进骨肉瘤进展的机制 | 首次将CPE/HYOU1轴与Hippo-YAP信号通路及PANoptosis抑制联系起来，揭示了其在骨肉瘤进展中的新调控机制 | 研究主要基于公开转录组数据，实验验证在体外和体内进行，但未涉及大规模临床队列验证 | 识别骨肉瘤中与PANoptosis相关的预后生物标志物并阐明其下游调控机制 | 骨肉瘤细胞、巨噬细胞、成骨细胞 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞转录组学、bulk RNA测序、免疫荧光、流式细胞术、Western blot、异种移植肿瘤实验 | 预后特征模型 | 转录组数据 | 基于公开单细胞和bulk转录组数据，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2934 | 2026-01-24 |
KLF7 as a biomarker for the pre-metastatic state promotes colorectal cancer liver metastasis via TGFβ autocrine signaling
2026-Feb-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.218123
PMID:41213461
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研究论文 | 本研究通过机器学习与生物信息学方法，定义了结直肠癌肝转移的“转移前状态”细胞亚群，并鉴定出KLF7作为其关键生物标志物，揭示了其通过TGFβ自分泌信号促进转移的机制 | 首次系统定义了结直肠癌肝转移的“转移前状态”细胞亚群及其两个亚型，并发现KLF7作为关键生物标志物通过TGFβ自分泌信号驱动转移，同时提出EGCG可作为潜在治疗药物 | 研究主要基于生物信息学分析和实验验证，临床样本验证及药物临床应用效果仍需进一步研究 | 识别和表征结直肠癌肝转移的转移前状态细胞亚群，探索其生物标志物和形成机制 | 结直肠癌细胞、转移前状态细胞亚群、KLF7基因、TGFβ信号通路 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 机器学习、生物信息学分析、批量RNA测序、单细胞测序、空间转录组学、双荧光素酶报告实验 | 机器学习模型 | 基因表达数据、测序数据 | 涉及人类细胞系、批量RNA测序、单细胞测序和空间转录组学数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 2935 | 2026-01-24 |
Spatial organization of stromal subtypes stratifies colorectal cancer patients and predicts clinical outcomes
2026-Feb-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.218228
PMID:41423053
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和多重成像技术，揭示了结直肠癌中肿瘤相关基质亚型的空间组织如何分层患者并预测临床预后 | 首次系统性地结合单细胞RNA测序与空间成像，识别了FAP TAS细胞和CD73肿瘤细胞与低生存率的相关性，并基于NGFR基质细胞的空间分布对三级淋巴结构进行分类，发现NGFR组织化TLS与改善的生存率相关 | 研究主要基于观察性数据，未深入探讨机制性因果关系，且样本量可能限制结果的普适性 | 探究肿瘤相关基质亚型在结直肠癌中的空间组织及其临床相关性 | 结直肠癌患者及其肿瘤微环境中的肿瘤相关基质细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 多重成像 | SCENIC分析 | 单细胞RNA测序数据, 图像数据 | 未明确指定样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2936 | 2026-01-24 |
Identification of therapeutic targets for giant cell arteritis through integrated analysis of multi-omics datasets
2026-Feb, Hepatobiliary & pancreatic diseases international : HBPD INT
IF:3.6Q2
DOI:10.1016/j.hbpd.2025.11.005
PMID:41318344
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研究论文 | 本研究通过整合大规模多组学数据集，系统性地识别了巨细胞动脉炎的潜在治疗靶点 | 构建了一个多阶段分析框架，整合了32个蛋白质组和6个转录组数据集，并首次通过孟德尔随机化、共定位分析等方法鉴定了43个与GCA有因果关联的血浆蛋白，其中17个为新型治疗靶点 | 研究结果在临床转化前需要实验验证，且主要基于欧洲血统人群的队列 | 系统性地识别巨细胞动脉炎的治疗靶点 | 巨细胞动脉炎患者 | 生物信息学 | 巨细胞动脉炎 | 蛋白质组学，转录组学，单细胞RNA测序，孟德尔随机化，共定位分析 | 多组学整合分析框架 | 蛋白质组数据，转录组数据，单细胞RNA测序数据 | 4个独立的欧洲血统GCA队列，包含32个蛋白质组数据集（覆盖2914个独特血浆蛋白）和6个转录组数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2937 | 2026-01-24 |
Molecular markers in oral squamous cell carcinoma: Insights into the tumor microenvironment, epigenetic regulation, and intercellular communications
2026-Feb, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer
DOI:10.1016/j.bbcan.2025.189516
PMID:41412275
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综述 | 本文综述了口腔鳞状细胞癌（OSCC）中新型生物标志物的研究进展，重点关注肿瘤微环境、表观遗传调控和细胞间通讯 | 强调了细胞外囊泡作为连接肿瘤微环境和表观遗传调控网络的关键介质，并探讨了单细胞测序和高通量质谱等新技术在揭示分子机制中的应用 | 作为一篇综述文章，未涉及原始实验数据，主要基于现有文献总结，可能未涵盖最新研究进展 | 总结OSCC的新型生物标志物研究进展，特别是肿瘤微环境、表观遗传调控和细胞间通讯的作用 | 口腔鳞状细胞癌（OSCC）及其肿瘤微环境、表观遗传调控和细胞间通讯 | NA | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞测序、质谱分析 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2938 | 2026-01-24 |
Hepatocyte cuproptosis promotes the progression of hepatic fibrosis: Emerging a potential therapeutic target
2026-Feb-01, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.116092
PMID:41429062
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和蛋白质组学分析，揭示了肝细胞铜死亡在肝纤维化进展中的关键作用，并评估了单宁酸作为铜死亡抑制剂的治疗潜力 | 首次在肝纤维化背景下系统研究了肝细胞铜死亡的细胞景观，并验证了铜死亡抑制作为治疗靶点的可行性 | 研究主要基于小鼠模型和有限临床样本，人类肝纤维化的异质性可能未被完全覆盖 | 探究肝细胞铜死亡在肝纤维化进展中的作用机制及治疗靶点 | 小鼠肝纤维化模型和肝纤维化患者的临床样本 | 单细胞组学 | 肝纤维化 | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 蛋白质组学数据 | 小鼠模型和肝纤维化患者临床样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2939 | 2026-01-24 |
Meeting report for the 2025 UC Irvine Center for Neural Circuit Mapping conference: The Changing Brain
2026-Feb, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-025-03411-4
PMID:41444403
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会议报告 | 本文报告了2025年加州大学尔湾分校神经回路映射中心举办的第五届年度会议“变化中的大脑”的主要内容，包括会议安排、参与情况及讨论主题 | 作为该中心年度会议系列的一部分，本次会议持续增长，已成为推动神经回路研究的重要论坛，特别关注正常脑功能及精神与神经疾病 | 本文为会议报告，不包含原创性研究数据或方法，其内容基于会议讨论和展示，可能缺乏深度技术细节 | 报告并总结神经回路映射领域在进化、发育、功能和疾病方面的最新进展 | 神经回路映射研究，涉及正常脑功能以及精神和神经疾病 | NA | 精神和神经疾病 | 空间转录组学、病毒-遗传工具 | NA | NA | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2940 | 2026-01-24 |
Molecular characterization of palmitoylation in prostate cancer reveals KIFC2 as a prognostic biomarker and potential therapeutic target
2026-Feb-01, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2026.111450
PMID:41520472
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研究论文 | 本研究通过整合批量转录组、单细胞RNA测序和空间转录组数据，全面分析了前列腺癌中的蛋白质棕榈酰化相关基因，揭示了KIFC2作为预后生物标志物和潜在治疗靶点 | 首次在前列腺癌中系统研究棕榈酰化相关基因，结合多组学数据识别出KIFC2的关键作用，并通过功能实验验证其促癌功能 | 研究主要基于生物信息学分析和体外细胞实验，缺乏体内动物模型验证和临床样本的直接机制研究 | 探究蛋白质棕榈酰化在前列腺癌中的作用，并寻找相关的生物标志物和治疗靶点 | 前列腺癌组织样本和细胞系（PC3和DU145） | 生物信息学与癌症研究 | 前列腺癌 | 批量转录组测序、单细胞RNA测序、空间转录组测序、加权基因共表达网络分析、功能实验（细胞增殖与凋亡检测） | 无监督共识聚类、加权基因共表达网络分析 | 转录组数据（批量、单细胞、空间） | 未明确指定样本数量，但使用了多个数据集和两种前列腺癌细胞系 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学、批量RNA测序 | NA | NA |