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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2881 | 2026-06-07 |
Integrating spatial and single-cell transcriptomics analysis reveals MYCN-UBE2C-TFRC signaling endows ferroptosis resistance in neuroectodermal tumors
2026-Jun, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-025-3233-3
PMID:41915328
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研究论文 | 通过整合空间和单细胞转录组学分析,揭示了MYCN-UBE2C-TFRC信号轴赋予神经外胚层肿瘤铁死亡抗性 | 首次发现MYCN通过转录激活UBE2C,进而促进TFRC的泛素化降解,减少铁内流,赋予肿瘤细胞铁死亡抗性,并揭示MYCN-UBE2C-TFRC-铁死亡调控轴驱动神经外胚层肿瘤生长 | 未明确提及 | 探究MYCN扩增肿瘤中MYCN与铁死亡通路之间的机制联系 | 神经外胚层肿瘤 | 数字病理 | 神经外胚层肿瘤 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,CUT&Tag,深度覆盖质谱蛋白质组学 | NA | 基因表达数据,蛋白质组学数据 | 未明确提及 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 2882 | 2026-06-07 |
Chitin Derivative-Based Detachable Microneedles for Effective Treatment of Androgenic Alopecia
2026-Jun, Advanced healthcare materials
IF:10.0Q1
DOI:10.1002/adhm.202504691
PMID:41958248
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研究论文 | 利用甲壳素衍生物基可分离微针治疗雄激素性脱发,并验证其促毛发生长效果及机制 | 首次报道甲壳素衍生物的抗雄激素性脱发活性,并基于可分离微针递送系统实现高效、安全的治疗 | 未提及长期安全性及临床转化中的潜在挑战 | 开发安全、经济有效的雄激素性脱发新型疗法 | C57BL/6j小鼠雄激素性脱发模型及离体毛囊 | 数字病理学 | 雄激素性脱发 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠模型(C57BL/6j雄激素性脱发模型)及离体毛囊样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒 |
| 2883 | 2026-06-07 |
Viral orchitis and male infertility: A comprehensive review of pathogenic mechanisms and outcomes
2026-Jun, Journal of reproductive immunology
IF:2.9Q2
DOI:10.1016/j.jri.2026.104910
PMID:42107396
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综述 | 系统性回顾病毒性睾丸炎及其导致男性不育的致病机制和临床结局 | 整合单细胞测序与多组学技术,探讨病毒-宿主相互作用及治疗新靶点,并引入睾丸类器官模型等前沿转化方法 | 现有治疗策略效果欠佳,缺乏有效靶向干预手段 | 总结病毒对睾丸功能的影响,为未来干预措施提供指导 | 病毒性睾丸炎患者及男性不育症相关病理机制 | 机器学习 | 男性不育 | 单细胞测序、多组学技术 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2884 | 2026-06-07 |
Lipid accumulation in tuberculosis granulomas inhibits macrophage-CD4+ T cell interactions and infection control
2026-Jun, Nature microbiology
IF:20.5Q1
DOI:10.1038/s41564-026-02317-3
PMID:41933199
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研究论文 | 利用空间转录组学和免疫荧光显微镜分析结核病肉芽肿中巨噬细胞与T细胞的空间结构和转录组,揭示脂质积累抑制巨噬细胞-CD4+T细胞相互作用及感染控制 | 首次通过空间转录组学和免疫荧光显微镜在人体肺标本和小鼠模型中详细刻画结核肉芽肿中巨噬细胞和T细胞群体的空间结构,并识别出坏死性肉芽肿中MHC II类分子减少和CD4 T细胞活化降低的机制,发现胆固醇积累导致MHC II类分子滞留在溶酶体中,从而损害抗原呈递和抗结核免疫反应 | 仅在晚期感染阶段在动物模型中验证了药理学恢复胆固醇稳态的效果,尚需在人体临床试验中进一步验证其治疗潜力 | 研究结核病肉芽肿中巨噬细胞与CD4+T细胞相互作用受损的机制,以及脂质积累在其中的作用 | 人类肺部样本和结核病小鼠模型中的肉芽肿、巨噬细胞和CD4+T细胞 | 空间转录组学 | 肺结核 | 空间转录组学、免疫荧光显微镜 | NA | 空间基因表达数据、免疫荧光图像 | 人类肺标本和小鼠模型样本(具体数量未在摘要中说明) | NA | 空间转录组学 | NA | 具体平台细节未在摘要中提供 |
| 2885 | 2026-06-07 |
Identifying clinically relevant cell state interactions in the tumor microenvironment of IDH-mutant gliomas using CSI-TME
2026-Jun, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.1038/s44320-026-00201-0
PMID:41807578
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研究论文 | 提出名为CSI-TME的计算流程,利用大量批量转录组数据集推断IDH突变型胶质瘤肿瘤微环境中的预后性细胞状态相互作用 | 将合成致死等基因相互作用概念扩展到细胞状态层面,并直接利用大型批量转录组数据集进行预后性细胞状态相互作用推断 | 主要依赖批量转录组数据,缺乏单细胞RNA测序数据中的细胞环境信息,可能漏掉部分细胞状态相互作用 | 系统性地表征肿瘤微环境中的功能性细胞状态相互作用,并识别预后性细胞状态相互作用及治疗靶点 | IDH突变型胶质瘤(包括星形细胞瘤和少突胶质细胞瘤)的肿瘤微环境 | 机器学习 | 胶质瘤 | 批量转录组测序 | NA | 转录组数据 | 多个批量转录组数据集 | NA | 批量RNA测序 | NA | NA |
| 2886 | 2026-06-07 |
Single-Cell Analysis Identifies LYPD6B as a Tumor-Intrinsic Candidate Associated With Immunotherapy Nonresponse in Breast Cancer
2026-Jun, Thoracic cancer
IF:2.3Q2
DOI:10.1111/1759-7714.70311
PMID:42231559
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序数据分析,识别与乳腺癌免疫治疗无应答相关的肿瘤内在候选基因LYPD6B | 首次通过整合公共scRNA-seq数据,系统鉴定LYPD6B作为乳腺癌免疫检查点阻断治疗无应答的肿瘤内在标志物,并验证其通过抑制抗原呈递和干扰素信号传导促进免疫逃逸的功能 | 基于公共数据集的二次分析,缺乏独立大规模验证队列;功能验证主要基于体外实验,需更多体内模型确认 | 阐明乳腺癌患者对抗PD-1/PD-L1免疫治疗应答与不应答的肿瘤微环境差异及肿瘤内在免疫逃逸机制 | 接受PD-(L)1治疗的51例乳腺癌患者及其327022个单细胞的scRNA-seq数据 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 51例乳腺癌患者,327022个单细胞 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | NA |
| 2887 | 2026-06-07 |
Integrated Single-Cell and Machine Learning Analysis Identifies Fibroblast-Associated Hub Genes and Potential Therapeutics in Ischemic Cardiomyopathy
2026-Jun, Chemical biology & drug design
IF:3.2Q3
DOI:10.1111/cbdd.70329
PMID:42249649
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研究论文 | 整合单细胞和机器学习分析,识别缺血性心肌病中与成纤维细胞相关的核心基因及潜在治疗药物 | 首次将单细胞RNA测序数据与四种独立的批量转录组数据整合,系统鉴定与成纤维细胞相关的核心基因,并通过计算药物重定位和分子对接筛选潜在化合物 | 主要依赖计算分析,缺乏实验验证;数据来源有限,需更多独立队列验证;虚拟敲除和药物结合尚需后续实验确认 | 揭示缺血性心肌病的分子机制,识别诊断性核心基因,并探索潜在治疗药物 | 缺血性心肌病患者的单细胞和批量转录组数据 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | 机器学习算法(127种方法组合) | 基因表达数据 | 多个数据集,具体数量未说明 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 单细胞RNA测序 |
| 2888 | 2026-06-07 |
The GATA1 N terminus coordinates metabolic reprogramming in erythropoiesis
2026-May-28, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2025030464
PMID:41587073
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示GATA1 N末端缺失通过代谢重编程导致红细胞生成缺陷的分子机制 | 首次证明GATA1 N末端缺失通过诱导PKM启动子组蛋白乳酸化增强糖酵解通量,而不影响线粒体呼吸,并将GATA1s驱动的红细胞生成缺陷与糖酵解失调联系起来 | 未提供 | 阐明GATA1 N末端区域在红细胞生成中的分子功能 | Gata1突变胚胎的胎肝细胞和急性GATA1删除的红系细胞 | 机器学习和单细胞组学 | 唐氏综合征相关髓系白血病和戴-布二氏贫血(DBA) | 单细胞RNA测序、精准核糖体转录测序、CUT&RUN | NA | 单细胞转录组数据 | Gata1突变胚胎和DBA患者样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒 |
| 2889 | 2026-06-07 |
Urinary single-cell transcriptomics in kidney transplantation: Elucidation of donor-recipient cellular dynamics and fibrogenic stress
2026-May-14, American journal of transplantation : official journal of the American Society of Transplantation and the American Society of Transplant Surgeons
IF:8.9Q1
DOI:10.1016/j.ajt.2026.05.007
PMID:42134416
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研究论文 | 通过尿液单细胞转录组学揭示肾移植中供体-受体细胞动态与纤维化应激机制 | 首次建立高质量尿液单细胞RNA测序工作流程,并通过基因型反卷积准确区分供体与受体细胞来源,为非侵入性监测肾移植排斥和纤维化提供新方法 | 样本量较小(仅12名受者),且未指定 | 探索尿液单细胞RNA测序在肾移植中捕获细胞动态和纤维化应激的可行性 | 12名不同临床状态的肾移植受者尿液样本 | 数字病理学 | 肾移植相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 12名肾移植受者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2890 | 2026-06-07 |
Single-cell transcriptomics and metabolomics demonstrate that Taohe Chengqi decoction alleviates sepsis-associated acute lung injury by modulating immunometabolism
2026-May-10, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2026.121283
PMID:41619860
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研究论文 | 通过单细胞转录组学和代谢组学分析,揭示桃核承气汤通过调节免疫代谢缓解脓毒症相关急性肺损伤的机制 | 首次整合单细胞转录组学和代谢组学方法,系统阐明桃核承气汤通过调节糖酵解通路改善肺泡-毛细血管屏障、重塑免疫微环境治疗脓毒症相关急性肺损伤的免疫代谢机制 | 研究仅基于单批次桃核承气汤,需要多批次验证以确保结果的可重复性和临床相关性 | 探索桃核承气汤治疗脓毒症相关急性肺损伤的免疫代谢机制 | 桃核承气汤及脂多糖诱导的脓毒症相关急性肺损伤小鼠模型 | 数字病理学 | 脓毒症相关急性肺损伤 | 非靶向代谢组学, 单细胞转录组学 | NA | 代谢组学数据, 单细胞转录组数据 | 脂多糖诱导的脓毒症相关急性肺损伤小鼠模型(具体样本量未提供) | NA | 单细胞RNA测序, 非靶向代谢组学 | NA | NA |
| 2891 | 2026-06-07 |
Circulating Tumor Cells Predict Response to the DLL3-Targeting Bispecific Antibody Tarlatamab
2026-May-01, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-25-1483
PMID:41532856
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研究论文 | 循环肿瘤细胞预测靶向DLL3的双特异性抗体Tarlatamab的疗效反应 | 首次利用单细胞RNA测序分析小细胞肺癌活检组织中DLL3表达的异质性,并通过循环肿瘤细胞区分患者为DLL3阳性或DLL3低表达,前瞻性队列中CTC的DLL3表达预测Tarlatamab临床获益具有高灵敏度和特异性 | 样本量较小(20例患者),未提及长期随访数据,耐药机制分析仅限于部分病例 | 评估循环肿瘤细胞上DLL3表达作为小细胞肺癌患者Tarlatamab治疗疗效预测生物标志物的可行性 | 小细胞肺癌患者 | 医学图像分析 | 小细胞肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本、图像 | 20例患者的前瞻性队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2892 | 2026-06-07 |
An integrative multi-cohort transcriptomic study reveals cell cycle- and adhesion-related hub genes as diagnostic biomarkers for pulmonary arterial hypertension
2026-May, Advances in biological regulation
DOI:10.1016/j.jbior.2026.101145
PMID:41576688
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研究论文 | 通过整合多个GEO数据集和实验验证,发现细胞周期和黏附相关关键基因CDK1、TPX2、IGF1和VCAM1可作为肺动脉高压的诊断生物标志物 | 首次综合多队列转录组分析并结合单细胞测序数据及动物模型验证,鉴定出CDK1、TPX2、IGF1和VCAM1四个关键基因作为PAH的多基因诊断标志物 | NA | 筛选并验证肺动脉高压相关关键基因作为无创诊断生物标志物 | 肺动脉高压患者血液或组织样本及尼古丁诱导的肺动脉高压小鼠模型 | 生物信息学 | 肺动脉高压 | 基因表达芯片、单细胞测序、RT-qPCR | NA | 基因表达数据 | 5个GEO数据集(GSE117261, GSE24988, GSE53408, GSE113439, GSE33463, GSE228644)及小鼠模型样本 | NA | 批量RNA-seq | NA | NA |
| 2893 | 2026-06-07 |
Monocyte-derived macrophages promote retinal damage after ischemic stroke via IL-1β-dependent mechanism
2026-May, Experimental neurology
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.expneurol.2026.115676
PMID:41621472
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研究论文 | 本研究利用小鼠模型证明单核细胞来源的巨噬细胞通过IL-1β依赖机制促进缺血性卒中后的视网膜损伤 | 首次阐明单核细胞来源的巨噬细胞在缺血性卒中后视网膜损伤中的关键作用及其IL-1β依赖机制 | 主要基于小鼠模型,未在人类样本中验证;可能未涵盖所有潜在的免疫细胞亚型 | 探究缺血性卒中后视网膜损伤的炎症机制 | 利用中脑动脉闭塞模型模拟缺血性卒中的小鼠视网膜 | 数字病理学 | 心血管疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 免疫荧光染色, Luminex检测 | NA | RNA测序数据, 图像数据 | 涉及小鼠样本,具体数量未在摘要中说明 | Illumina | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | Illumina NovaSeq | 视网膜bulk RNA测序和单细胞RNA测序使用Illumina平台 |
| 2894 | 2026-06-07 |
Mosaic variants in KRAS and STAT5B associated with a mixed phenotype of 2 acquired errors of immunity
2026-May, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2026.01.018
PMID:41628732
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研究论文 | 该文章报告了一例18岁女性患者携带KRAS和STAT5B体细胞嵌合变异,导致混合性获得性免疫缺陷的病例 | 首次报道两种不同的获得性免疫缺陷(Ras相关自身免疫性白细胞增殖性疾病和非克隆性STAT5B功能获得性疾病)共同导致混合临床表型 | NA | 研究一例携带KRAS和STAT5B功能获得性嵌合变异的独特病例,探讨其与免疫缺陷疾病的关联 | 一名18岁女性患者,患有炎症性肠病、脾肿大、血小板减少、支气管扩张、单核细胞增多和嗜酸性粒细胞增多 | 数字病理学 | 免疫缺陷疾病 | 全基因组测序、靶向扩增子测序、短读长单细胞RNA测序、长读长单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | 基因序列数据、单细胞RNA测序数据、流式细胞术数据 | 1例患者的纵向血液和组织样本 | Illumina | 单细胞RNA测序 | Illumina NovaSeq | 短读长和长读长单细胞RNA测序 |
| 2895 | 2026-06-07 |
Multi-omics identifies an epithelial-B cell cross-talk that drives functional B cell diversion in breast cancer lymph node metastasis
2026-May, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2026.112394
PMID:41610965
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研究论文 | 通过多组学分析揭示乳腺癌淋巴结转移中上皮细胞与B细胞间的相互作用,导致B细胞功能分化 | 首次整合单细胞RNA测序、空间转录组学和体内功能模型,系统描绘乳腺癌转移过程中B细胞状态和相互作用 | NA | 阐明乳腺癌淋巴结转移中B细胞的功能异质性和作用机制 | 乳腺癌原发肿瘤和转移淋巴结中的B细胞 | 机器学习和数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 测序数据, 图像数据 | 配对的原发肿瘤和转移淋巴结样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞RNA测序, 10x Visium空间转录组学 |
| 2896 | 2026-06-07 |
Depression-related chronic stress promotes ovarian cancer progression via metabolic dysfunction and IRF1-mediated immune suppression
2026-May, Brain, behavior, and immunity
DOI:10.1016/j.bbi.2026.106471
PMID:41605304
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研究论文 | 探讨抑郁相关慢性应激如何通过代谢功能障碍和IRF1介导的免疫抑制促进卵巢癌进展 | 首次揭示抑郁相关慢性应激通过下调IRF1表达、重塑免疫-代谢微环境促进卵巢癌进展的机制,并提出抗抑郁药联合化疗作为潜在治疗策略 | 未明确说明 | 研究抑郁与卵巢癌进展的关系及抗抑郁药物的潜在治疗价值 | 卵巢癌患者及小鼠模型 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序, 代谢组学 | NA | 基因表达数据, 代谢组数据 | 卵巢癌患者样本及小鼠慢性应激模型样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2897 | 2026-06-07 |
TNBC Spatial Transcriptomic Analysis across Clinical States Reveals Subtype-Specific Networks and Immunosuppressive Niches
2026-May-01, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-25-0808
PMID:42100798
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研究论文 | 通过GeoMx空间转录组学分析不同临床状态的三阴性乳腺癌,揭示亚型特异性网络和免疫抑制微环境 | 首次整合分子亚型、免疫浸润和空间结构,提出免疫-空间分子亚型(ISMS)框架,揭示三阴性乳腺癌在疾病进展中的异质性和免疫-空间可塑性 | NA | 通过空间转录组学分析三阴性乳腺癌在非转移性原发肿瘤、转移性原发肿瘤和淋巴结转移中的转录组和免疫空间变化,以阐明疾病进展机制 | 三阴性乳腺癌患者的非转移性原发肿瘤、转移性原发肿瘤和淋巴结转移样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 多个临床状态的肿瘤样本 | NanoString | 空间转录组学 | GeoMx | GeoMx空间转录组平台 |
| 2898 | 2026-06-07 |
scGHSOM: A Hierarchical Framework for Single-Cell Data Clustering and Visualization
2026 May-Jun, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2025.3593632
PMID:40811172
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研究论文 | 开发了一个基于层次生长自组织映射的框架scGHSOM,用于单细胞数据的分层聚类和可视化 | 提出了显著属性识别算法以最小化簇内变异并最大化簇间变异,并引入簇特征图和簇分布图两种新可视化工具 | 仅在三个CyTOF数据集上验证性能,未在更多样化的单细胞RNA测序数据上测试 | 解决高维单细胞数据分析中的层次聚类和可视化挑战 | 单细胞数据集,包括CyTOF和单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | CyTOF, 单细胞RNA测序 | 层次生长自组织映射 (GHSOM) | 高维单细胞数据 | 三个CyTOF数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2899 | 2026-06-07 |
Bufei formula attenuates airway mucus hypersecretion in COPD through inhibition of TRIM56-mediated ITGB4 ubiquitination
2026-Apr-24, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2026.121215
PMID:41580166
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研究论文 | 研究补肺方通过抑制TRIM56介导的ITGB4泛素化减轻COPD气道黏液高分泌的机制 | 首次发现补肺方活性组分BFF-4通过靶向TRIM56并抑制其介导的ITGB4泛素化来减轻COPD气道黏液高分泌,并利用DARTS技术、单细胞测序和分子对接等先进方法阐明其作用机制 | 未提及具体局限性,可能包括实验动物模型与人体差异、BFF-4的临床转化可行性待验证 | 探究补肺方通过TRIM56介导的泛素化缓解COPD气道黏液高分泌的机制 | 香烟烟雾诱导的COPD小鼠及香烟烟雾提取物诱导的气道上皮细胞 | 机器学习 | 慢性阻塞性肺疾病 | DARTS技术、免疫共沉淀、质谱、单细胞测序、分子对接 | NA | 基因表达数据、蛋白质互作数据 | COPD小鼠和体外气道上皮细胞(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2900 | 2026-06-07 |
SPP1+ macrophage-driven interactions shape the tumor microenvironment in lymph node metastatic acral melanoma
2026-Apr-22, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08755-5
PMID:42020397
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示SPP1+巨噬细胞驱动淋巴结节转移性肢端黑色素瘤的肿瘤微环境相互作用 | 首次识别出SPP1+巨噬细胞通过SPP1-CD44轴与S100A8黑色素瘤细胞相互作用,并发现S100A8细胞在转移性肿瘤中为优势恶性亚群,以及抗SPP1疗法在体内可诱导巨噬细胞表型转换并减少肿瘤负荷 | 未明确说明研究局限性 | 研究肿瘤微环境在肢端黑色素瘤淋巴结转移进展中的作用 | 肢端黑色素瘤患者的肿瘤组织和匹配的相邻正常样本,分为淋巴结转移阳性与阴性组 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 治疗初治的肢端黑色素瘤患者的肿瘤组织和匹配正常样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |