单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 9441 篇文献，本页显示第 2881 - 2900 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2881 | 2026-08-12 |
Single-cell and functional profiling identifies an IL6-centered immunometabolic communication circuit in multiple myeloma
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1734500
PMID:42577287
|
研究论文 | 该研究通过整合单细胞RNA测序数据与功能实验，揭示了多发性骨髓瘤中以IL6为中心的免疫代谢通讯回路，并识别出糖酵解和谷氨酰胺代谢相关的治疗靶点 | 首次在单细胞水平构建了多发性骨髓瘤骨髓微环境中的IL6为中心的免疫代谢通讯回路，结合多种验证手段和药物组合实验，提出了协同代谢靶向治疗策略 | 主要基于公开数据集的二次分析，独立验证队列规模有限，且代谢抑制剂疗效主要基于体外细胞实验，尚需体内研究进一步验证 | 解析多发性骨髓瘤骨髓微环境中免疫与代谢的交互作用，识别参与疾病进展的关键通讯回路和潜在治疗靶点 | 多发性骨髓瘤患者的骨髓细胞，包括恶性浆细胞、肿瘤相关巨噬细胞、树突状细胞、T/NK细胞等 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、血清样本、组织切片图像 | 95,940个骨髓细胞，独立临床验证队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2882 | 2026-08-12 |
Integrative machine learning and single-cell analysis identifies nicotine-related diagnostic genes and myeloid remodeling in COPD
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1880745
PMID:42577419
|
研究论文 | 通过整合机器学习和单细胞分析，鉴定慢性阻塞性肺疾病（COPD）中与尼古丁相关的诊断基因及髓系细胞重塑 | 首次将尼古丁相关靶基因与COPD转录组数据结合，利用多种机器学习算法构建诊断模型，并整合单细胞测序揭示髓系细胞状态转变 | 尼古丁相关信号仅为香烟烟雾相关COPD生物学的一个组成部分，且样本量有限 | 识别COPD中尼古丁相关的转录组特征，并探讨其免疫和单细胞层面的相关性 | COPD患者和对照样本的转录组数据及单细胞RNA测序数据 | 机器学习、单细胞分析 | 慢性阻塞性肺疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | SVM, LASSO回归, 共识聚类 | 转录组数据, 单细胞表达数据 | GSE57148包含COPD和对照样本；GSE173896包含单细胞数据，具体样本数未提及 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2883 | 2026-08-12 |
The causal role of plasma protein ratios in ulcerative colitis: insights from mendelian randomization and single-cell sequencing
2026-Jan, Open medicine (Warsaw, Poland)
DOI:10.1515/med-2026-1434
PMID:42577736
|
研究论文 | 本研究通过孟德尔随机化和单细胞测序探究血浆蛋白比率与溃疡性结肠炎之间的因果关系。 | 首次利用大规模孟德尔随机化和单细胞测序结合的方法系统评估血浆蛋白比率与溃疡性结肠炎的因果关系。 | 局限性未在摘要中明确提及。 | 探究血浆蛋白比率对溃疡性结肠炎易感性的因果影响，并验证潜在生物标志物。 | 溃疡性结肠炎患者及健康对照的血液样本和遗传数据。 | 遗传流行病学、单细胞测序 | 溃疡性结肠炎 | 孟德尔随机化、单细胞测序、ELISA | 逆方差加权法 | 基因组数据、单细胞转录组数据、蛋白质比率数据 | 26对溃疡性结肠炎患者和健康对照 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 2884 | 2026-08-12 |
Technological advances in axonal regeneration and structural plasticity: optogenetics, single-cell omics, and tissue clearing
2026, Frontiers in cellular neuroscience
IF:4.2Q2
DOI:10.3389/fncel.2026.1857896
PMID:42577779
|
综述 | 本文综述了光遗传学、单细胞组学和组织透明化技术在中枢神经系统损伤后轴突再生和结构可塑性研究中的应用进展 | 结合光遗传学、单细胞测序和组织透明化技术，提供了对轴突从变性到再生动态过程的高分辨率、高灵敏度观察，并识别了新的再生相关基因 | 未提及 | 探讨现代技术如何揭示中枢神经系统损伤后轴突的动态结构和功能行为，并促进功能恢复 | 中枢神经系统中的神经元和胶质细胞，特别是脊髓和视神经损伤后的轴突 | 神经科学 | 中枢神经系统损伤 | 光遗传学、单细胞RNA测序、组织透明化 | NA | 图像、基因表达数据、三维影像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2885 | 2026-08-12 |
Characterization of Peripheral Blood Immune Cell Features in SSA/SSB Double‑Positive Primary Sjögren's Disease Based on Single‑Cell RNA Sequencing
2026, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S625722
PMID:42577999
|
研究论文 | 基于单细胞RNA测序，表征SSA/SSB双阳性原发性干燥综合征患者外周血免疫细胞特征 | 首次在单细胞水平探讨抗SSA和抗SSB抗体共存是否定义免疫学上不同的pSjD亚型 | 样本量较小，且未对功能机制进行深入验证 | 探究SSA/SSB双阳性pSjD是否具有独特的免疫细胞转录特征，以解释其更高的疾病活动性 | 原发性干燥综合征患者外周血单个核细胞，包括3名健康对照、5名SSA+/SSB-患者和5名SSA+/SSB+患者 | 单细胞RNA测序 | 原发性干燥综合征 | 单细胞RNA测序、流式细胞术 | 无 | 基因表达数据 | 13例外周血单个核细胞样本（3例健康对照、5例SSA+/SSB-患者、5例SSA+/SSB+患者） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2886 | 2026-08-11 |
M1 polarization accelerated bone aging through inflammatory signaling transduction regulated by cells crosstalk
2026-Oct-01, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.117114
PMID:42419146
|
研究论文 | 本研究探讨了衰老过程中骨免疫交叉对话的机制，发现M1巨噬细胞极化加速骨老化，并提出TREM2-DAP12-SYK信号通路作为治疗老年性骨质疏松的新靶点 | 首次在老年骨中发现M1巨噬细胞增多，并通过单细胞测序筛选出TREM2、TYROBP、SYK和PIK3CD四个共同差异表达基因，揭示TREM2-DAP12-SYK轴调控M1极化在骨老化中的作用 | 研究主要基于小鼠模型和临床样本的关联性分析，缺乏对信号通路的深入分子机制验证，且单细胞数据来源为公共数据库（GSE145477），可能存在样本异质性 | 阐明衰老过程中骨免疫细胞间相互作用的变化机制，并寻找老年性骨质疏松的潜在治疗靶点 | 老年骨组织、巨噬细胞、骨髓间充质干细胞及共培养系统 | 免疫学、细胞生物学 | 老年性骨质疏松 | 单细胞测序、转录组分析、共培养实验、条件培养基实验、药理学激活 | NA | 基因表达数据、临床数据、实验数据 | 临床样本为老年人群，动物样本为老年小鼠，具体数量未在摘要中提供 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 使用公共数据集GSE145477进行单细胞测序数据分析 |
| 2887 | 2026-08-11 |
Targeting Grx1 by hyperoside regulates Ncf4 post-translational modification to enhance mitophagy and accelerate diabetic wound healing
2026-Oct-01, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.117074
PMID:42361530
|
研究论文 | 本研究旨在探讨金丝桃苷通过调节Grx1对Ncf4的翻译后修饰以增强线粒体自噬，从而加速糖尿病伤口愈合的疗效及其分子机制 | 首次发现金丝桃苷通过靶向Grx1/Ncf4/Bnip3l轴，将Ncf4的翻译后修饰从磷酸化转变为谷胱甘肽化，抑制NOX2激活并增强Bnip3l介导的线粒体自噬，逆转巨噬细胞功能障碍，从而促进糖尿病伤口愈合 | 研究主要基于2型糖尿病小鼠模型，未涉及人类样本验证；且未深入探讨金丝桃苷在不同糖尿病阶段或不同伤口类型中的效果差异 | 评估金丝桃苷对糖尿病伤口愈合的促进作用，并阐明其分子机制 | 2型糖尿病小鼠伤口模型及高糖刺激的骨髓来源巨噬细胞 | 分子生物学、蛋白质组学、单细胞转录组学 | 糖尿病伤口 | DIA定量蛋白质组学、单细胞RNA测序、分子动力学模拟、CETSA/DARTS、免疫共沉淀、Grx1功能获得/丧失实验 | 小鼠模型、细胞模型 | 蛋白质组学数据、单细胞转录组数据、分子动力学模拟数据 | 未明确说明样本数量，但涉及2型糖尿病小鼠模型和高糖刺激的巨噬细胞 | NA | 单细胞RNA测序、蛋白质组学 | NA | NA |
| 2888 | 2026-08-11 |
ANXA2+/TNR- glioblastoma subpopulation drives tumor progression through via Src-STAT3 axis and neutrophil remodeling
2026-Oct-01, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.117075
PMID:42372585
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序等手段鉴定ANXA2+/TNR-胶质母细胞瘤亚群，揭示其通过Src-STAT3轴和中性粒细胞重塑驱动肿瘤进展的机制 | 首次鉴定ANXA2+/TNR-胶质母细胞瘤亚群，并阐明其通过Src-STAT3信号轴和诱导中性粒细胞N2极化促进肿瘤干性和免疫逃逸的新机制 | 研究主要基于体外实验和异种移植模型，需进一步在临床样本中验证其相关性和治疗潜力 | 探究胶质母细胞瘤中ANXA2+/TNR-亚群的功能作用及其驱动肿瘤进展的机制 | 胶质母细胞瘤细胞亚群ANXA2+/TNR-及其与中性粒细胞的相互作用 | 癌症生物学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、功能实验、转录组分析、药理学抑制、异种移植模型 | NA | 单细胞转录组数据、流式细胞术数据、功能实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2889 | 2026-08-11 |
GPR84 blockade in macrophages mitigates sepsis-induced liver injury via PPARα-driven metabolic reprogramming and M2 polarization
2026-09, Metabolism: clinical and experimental
DOI:10.1016/j.metabol.2026.156673
PMID:42263844
|
研究论文 | 本研究探讨GPR84在脓毒症相关肝损伤中的作用机制，发现其通过调节巨噬细胞代谢重编程和M2极化减轻肝损伤 | 首次揭示GPR84-PPARα调控轴是脓毒症相关肝损伤的核心驱动因素，并验证GPR84作为治疗靶点的潜力 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步在人类样本中验证 | 阐明GPR84在脓毒症相关肝损伤发病机制中的功能作用及其分子机制 | 小鼠脓毒症相关肝损伤模型中的肝巨噬细胞 | 数字病理学 | 脓毒症相关肝损伤 | 单细胞RNA测序、免疫组化、转录组分析 | NA | 基因表达数据、图像 | 未具体说明样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2890 | 2026-08-11 |
Nigrostriatal dopaminergic vulnerability in Parkinson's disease: Neuroprotective strategies
2026-Aug-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-25-00380
PMID:40808403
|
综述 | 本文综述了帕金森病中黑质纹状体多巴胺能神经元的易损性机制，并评估了新兴的神经保护策略 | 整合单核RNA测序和空间转录组学揭示的特定多巴胺能亚型易损性，提出精准靶向疾病修饰治疗的潜力 | 未提供具体实验数据或临床验证，依赖已发表文献的汇总 | 阐明黑质纹状体多巴胺能神经元选择性易损的机制并评估神经保护策略 | 多巴胺能神经元亚型，如AGTR1+/SOX6+和RIT2+群体 | 神经科学 | 帕金森病 | 单核RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因表达和空间转录数据 | NA | NA | 单核RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 2891 | 2026-08-11 |
Single-cell and spatial omics in liver identify cell-cell communication regulators in aging and insulin resistance
2026-08, Metabolism: clinical and experimental
DOI:10.1016/j.metabol.2026.156630
PMID:42114673
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序、ATAC测序和空间转录组学，研究年轻和老年小鼠肝脏细胞组成和分区，揭示衰老和胰岛素抵抗中细胞间通讯的调控机制 | 首次结合单细胞和空间多组学技术，系统解析了肝脏分区在衰老和胰岛素抵抗中的动态变化，并鉴定了HGF信号通路作为关键调控因子 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步在人类样本中验证；HGF治疗的长期效果和安全性未详细探讨 | 阐明肝脏在衰老过程中如何调节胰岛素抵抗，特别是细胞组成和空间结构的变化及其分子机制 | 年轻和老年小鼠的肝脏组织，包括肝细胞、肝星状细胞等细胞类型 | 单细胞组学、空间转录组学 | 衰老、胰岛素抵抗 | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序、空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据、染色质可及性数据、空间转录组数据 | 年轻和老年小鼠，具体数量未提供 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序、空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'、10x Visium空间转录组 |
| 2892 | 2026-08-11 |
Islet inflammatory macrophages drive MSC loss and multiple interactions involved in β-cell adaptation during diabetes
2026-08, Metabolism: clinical and experimental
DOI:10.1016/j.metabol.2026.156636
PMID:42144182
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序，研究糖尿病进程中胰岛内巨噬细胞和间充质干细胞间的相互作用及其对β细胞适应性的影响 | 首次揭示了胰岛内巨噬细胞与间充质干细胞在糖尿病进展中的动态变化及复杂的旁分泌交互作用，并证明了靶向这一交互作用可恢复β细胞功能和血糖控制 | 未提及 | 探究非β胰岛细胞（特别是巨噬细胞和间充质干细胞）在2型糖尿病进展中对β细胞功能适应性的调控作用 | 2型糖尿病小鼠模型中的胰岛细胞，包括巨噬细胞、间充质干细胞和β细胞 | 单细胞生物学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2893 | 2026-08-11 |
Macrophage-derived SPP1 promotes subretinal fibrosis by YAP1 phase separation in retinal pigment epithelium
2026-08, Metabolism: clinical and experimental
DOI:10.1016/j.metabol.2026.156648
PMID:42162902
|
研究论文 | 本研究揭示巨噬细胞来源的SPP1通过YAP1液相分离促进视网膜色素上皮细胞下纤维化，阐明了新生血管性年龄相关性黄斑变性向视网膜下纤维化转变的病理机制 | 首次发现SPP1通过CD44/RhoA通路诱导YAP1-2α亚型发生液-液相分离，并与TEAD4协同激活促纤维化基因转录，从而促进RPE细胞上皮间质转化，为SRF进展提供了新的病理机制 | 摘要中未提及研究的局限性 | 阐明脉络膜新生血管向视网膜下纤维化转变的病理机制，特别是巨噬细胞来源的SPP1在其中的作用 | 小鼠巨噬细胞、激光诱导的脉络膜新生血管和视网膜下纤维化模型、视网膜色素上皮细胞 | 分子生物学 | 新生血管性年龄相关性黄斑变性 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, Co-IP, Western blotting, 荧光显微镜成像, ATAC-seq | NA | 基因表达数据、图像 | NA | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, ATAC-seq | NA | NA |
| 2894 | 2026-08-11 |
Protocol to stress human primary pancreatic islets with diabetogenic factors for subsequent single-cell RNA sequencing
2026-Jul-30, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2026.104752
PMID:42531125
|
研究论文 | 本文描述了一种用糖尿病致病因子处理人类原代胰岛并进行单细胞RNA测序的方案，以研究1型糖尿病的发病机制。 | 提供了一个详细的实验协议，用于在单细胞水平上分析糖尿病应激因子对人类胰岛细胞的影响。 | 文章仅描述了实验方案，未提供实际实验结果或数据分析。 | 为了解1型糖尿病的起始和进展提供实验方法，通过处理原代人胰岛并分析单细胞转录组。 | 人类尸体原代胰岛细胞，特别是胰岛素分泌的β细胞。 | 单细胞转录组学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未指定样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2895 | 2026-08-11 |
Identification of Potential Biomarkers for Rheumatoid Arthritis Based on Integrated Bioinformatics and Single-Cell RNA-Seq
2026-07-21, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes17070828
PMID:42510868
|
研究论文 | 基于整合生物信息学和单细胞RNA-seq分析，识别类风湿关节炎的潜在生物标志物和治疗靶点 | 整合eQTL、pQTL和GWAS数据，通过孟德尔随机化识别可药物基因，并结合单细胞RNA-seq表征细胞类型特异性表达，筛选传统中药化合物 | 研究结果基于计算分析，需进一步实验验证 | 识别类风湿关节炎的潜在生物标志物和治疗靶点，并探索中药活性化合物 | 类风湿关节炎患者相关基因表达和调控数据 | 生物信息学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA-seq、组织转录组、孟德尔随机化 | 机器学习模型 | 基因表达数据、蛋白质定量数据、单细胞数据 | 未提供具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2896 | 2026-08-11 |
Single-Cell Profiling Identifies a CCR2+ Neutrophil-like Population Associated with Colorectal Cancer Liver Metastasis in a Murine Model
2026-07-21, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes17070831
PMID:42510872
|
研究论文 | 使用小鼠模型通过单细胞RNA测序鉴定与结直肠癌肝转移相关的CCR2+中性粒细胞样群体 | 首次在结直肠癌肝转移小鼠模型中鉴定出CCR2+中性粒细胞样群体，挑战了CCR2+促转移髓系细胞仅存在于单核细胞中的观点 | 研究受限于脾切除后肝转移模型，可能不完全代表自然转移过程 | 明确骨髓来源髓系细胞在结直肠癌肝转移前微环境中的转录程序 | MC38脾注射结直肠癌肝转移小鼠模型中的骨髓CD11b+Gr1+髓系细胞 | 单细胞转录组学 | 结直肠癌肝转移 | 单细胞RNA测序、 bulk RNA测序 | 无特定深度学习模型 | 基因表达数据 | 小鼠模型（具体样本数量未提及） | NA | 单细胞RNA测序、 bulk RNA测序 | NA | NA |
| 2897 | 2026-08-11 |
Whole-body single-cell atlas of an adult vertebrate in homeostasis and regeneration
2026-Jul-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.03.703562
PMID:42523349
|
研究论文 | 通过区域分层单细胞RNA测序和空间转录组学构建成年脊椎动物全身细胞类型图谱，并研究其稳态与再生过程 | 首次构建了成年脊椎动物的全身单细胞转录组图谱，结合空间转录组学绘制细胞类型和基因表达的空间分布，并揭示再生过程中的表达动态 | 摘要中未明确提及研究的局限性 | 构建成年脊椎动物全身细胞类型转录组图谱，以促进对动物细胞类型组成、组织和进化的理解，并研究再生机制 | 成年斑马鱼（一种小型、透明、可再生的硬骨鱼） | 单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据 | 成年斑马鱼全身，具体数量未在摘要中提及 | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 2898 | 2026-08-11 |
Integrated Single-Cell and Spatial Transcriptomic Analysis Reveals the Immunoregulatory Role of MIF Signaling in Colorectal Cancer
2026-07-17, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes17070817
PMID:42510857
|
研究论文 | 通过整合单细胞和空间转录组数据，系统剖析了结直肠癌微环境的细胞异质性与空间组织特征，并揭示了MIF信号通路在肿瘤免疫调节中的关键作用 | 首次从多维度整合单细胞和空间转录组数据，全面解析了结直肠癌微环境中MIF信号通路的空间分布与细胞通讯机制，并鉴定出MIF-(CD74+CD44)和MIF-(CD74+CXCR4)为主要受体复合物，为结直肠癌治疗提供了潜在靶点 | 研究主要基于公共数据集的整合分析，缺乏实验验证，且样本量有限，结果需进一步在临床样本中验证 | 系统解析结直肠癌微环境的细胞异质性与空间组织特征，阐明MIF信号通路在肿瘤免疫调节中的作用机制 | 结直肠癌原发肿瘤的单细胞RNA测序及空间转录组数据 | 单细胞组学、空间转录组学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 2899 | 2026-08-11 |
A succinylation-based classifier predicts chemotherapy response in prostate cancer and reveals KAT2A as a therapeutic target
2026-07, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70737
PMID:42415249
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于琥珀酰化的分类器，用于预测前列腺癌的化疗反应，并揭示KAT2A作为治疗靶点 | 首次构建基于琥珀酰化的评分系统（SS）用于前列腺癌预后和化疗反应预测，并发现KAT2A通过琥珀酰化PIK3R2驱动化疗耐药的新机制 | 未提及 | 评估琥珀酰化在前列腺癌中的预后意义，开发基于琥珀酰化的生物标志物，并阐明化疗耐药的机制 | 前列腺癌患者肿瘤样本、患者来源类器官、前列腺癌细胞系和异种移植模型 | 基因组学 | 前列腺癌 | RNA-seq、单细胞RNA测序、基因编辑、化学敏感性测定 | 单样本基因集富集分析 | 转录组数据、单细胞RNA测序数据、基因组数据 | TCGA-PRAD队列及患者来源类器官、细胞系和异种移植模型 | NA | RNA-seq、单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2900 | 2026-08-11 |
An interpretable multi-task whole-slide histopathology AI model for non-small cell lung cancer: Cross-cohort generalisation, spatial attention-transcriptomic integration, and molecular-immune profiling
2026-07, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70744
PMID:42494157
|
research paper | 开发了一种可解释的多任务全切片病理学AI模型SparseAGE-MTL，用于非小细胞肺癌的组织学亚型分类、分期概率预测和生存风险评估，并整合空间转录组学和分子免疫谱分析。 | 提出了一个共享投影拓扑编码器和端点特定头的弱监督多任务多实例学习框架，在7种病理特征空间和18个比较模型中稳定表现，并将注意力图与空间转录组学整合以提供生物学可解释性。 | 研究的回顾性设计、分期估计区分度较低且校准依赖队列，需要前瞻性、带有治疗注释的验证才能用于临床。 | 评估常规苏木精-伊红染色全切片图像是否能估计非小细胞肺癌的组织学亚型、病理分期概率、生存风险及空间相关的生物学关联。 | 非小细胞肺癌患者的全切片图像和微阵列切片，来自TCGA及外部验证队列。 | 数字病理学 | 非小细胞肺癌 | NA | 多任务多实例学习模型（SparseAGE-MTL） | 病理图像、空间转录组学数据、批量转录组学数据 | 954例TCGA训练病例，948例组织微阵列和324例全切片外部验证病例 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学分析 |