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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2861 | 2026-03-17 |
Endogenous Multilayer Control of Cambial Stem Cells and Its Consequences for Wood Formation
2026-Feb-26, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants15050710
PMID:41829741
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综述 | 本文综述了维管形成层作为木材形成基本分生组织的调控机制,包括多肽、转录因子和植物激素等复杂网络,以及染色质状态、蛋白质稳定性和非编码RNA等附加调控层 | 整合了单细胞和空间转录组学与定量建模,以解析形成层异质性并预测木材形成的动态特征 | NA | 综述维管形成层的调控网络,以理解其如何协调干细胞活性、细胞分裂和分化,从而改善木材形成潜力 | 维管形成层及其干细胞 | 植物生物学 | NA | 单细胞转录组学, 空间转录组学, 定量建模 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2862 | 2026-03-17 |
Accelerating Resistance Breeding: Emerging Methods to Identify and Validate Plant Immunity Genes
2026-Feb-25, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants15050685
PMID:41829717
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综述 | 本文综述了加速植物抗病育种的新兴方法,重点介绍了识别和验证植物免疫基因的技术 | 讨论了超越传统遗传关联的新策略,如MutRenSeq和单细胞RNA测序,这些方法能加速实验时间线、减少实验规模并提供抗病机制见解 | NA | 加速植物抗病育种,通过新兴技术更有效地识别和验证植物免疫基因 | 植物免疫基因,如NLR、PRR和易感基因 | 自然语言处理 | NA | MutRenSeq, 单细胞RNA测序, 空间组学, 邻近标记, 计算预测, CRISPR筛选, 细胞死亡检测 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2863 | 2026-03-17 |
The ubiquitin-proteasome system is an important driver of EBV-associated nasopharyngeal carcinoma progression: a meta-analysis of transcriptomic data
2026-Feb-24, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-34808-4
PMID:41735356
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荟萃分析 | 本研究通过荟萃分析转录组数据,揭示了泛素-蛋白酶体系统(UPS)是EBV相关鼻咽癌进展的重要驱动因素 | 首次在单细胞分辨率下系统性地将EBV-宿主基因相互作用与鼻咽癌的转录组变化联系起来,并识别出UPS作为关键的调控枢纽和预后标志物 | NPC数据集样本量较小,导致预后关联性仅达到边缘显著水平;研究主要基于公共数据集分析,需要进一步的实验验证和功能研究 | 识别EBV相关鼻咽癌中EBV与宿主基因的相互作用,并探究其在肿瘤进展和免疫逃逸中的作用 | EBV相关鼻咽癌的转录组数据、单细胞RNA测序数据以及相关的EBV-宿主相互作用数据 | 生物信息学 | 鼻咽癌 | 转录组数据分析、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、荟萃分析、通路富集分析 | NA | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 基于多个公开数据集,具体样本数量未明确说明,但提及NPC数据集样本量较小 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2864 | 2026-03-17 |
TAZ (Wwtr1) deficiency leads to ER stress and mitochondrial dysfunction in a mouse model of Fuchs' endothelial corneal dystrophy
2026-Feb-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.17.706456
PMID:41756894
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研究论文 | 本研究通过TAZ基因敲除小鼠模型,揭示了Fuchs角膜内皮营养不良的发病机制,涉及内质网应激和线粒体功能障碍 | 首次结合单细胞转录组学、透射电镜和免疫荧光染色,系统阐明了TAZ缺失导致角膜内皮细胞退行性变的机制,并明确了年轻与老年小鼠在细胞反应上的年龄相关差异 | 研究基于小鼠模型,其病理机制向人类疾病的直接转化仍需进一步验证 | 探究Fuchs角膜内皮营养不良的发病机制,并评估TAZ敲除小鼠作为非手术治疗策略测试平台的潜力 | TAZ敲除小鼠的角膜内皮细胞 | 数字病理学 | Fuchs角膜内皮营养不良 | 单细胞RNA-seq, 透射电子显微镜, 免疫荧光染色 | 基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据, 图像数据 | 年轻(2月龄)和老年(11月龄)TAZ敲除小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2865 | 2026-03-17 |
Antibiotic Persistence Emerges from Cell-State-Driven Transcriptional Reprogramming
2026-Feb-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.16.705191
PMID:41756826
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研究论文 | 本研究利用细菌单细胞RNA测序技术,揭示了抗生素持久性形成的转录异质性机制,表明细胞预处理转录状态通过塑造应激反应的冗余性共同决定生存结果 | 首次在细菌系统中应用单细胞RNA测序解析持久性形成的动态过程,建立了生长阶段作为转录变异轴的系统框架,证明预处理细胞状态对持久性频率的决定性作用 | 研究主要关注特定生长阶段和抗生素类型,尚未全面涵盖所有环境压力条件,单细胞测序技术可能遗漏低表达基因 | 阐明抗生素持久性现象的分子机制,探索通过调控细胞状态增强抗生素疗效的策略 | 细菌细胞(具体菌株未明确说明) | 单细胞组学 | 细菌感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2866 | 2026-02-10 |
Integrating single-cell and spatial transcriptomics with pan-cancer bulk sequencing identifies OSR2 as a multifaceted biomarker for prognosis and tumor immunity
2026-Feb-09, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04595-z
PMID:41661456
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2867 | 2026-03-17 |
JAG1 expression in papillary thyroid cancer stem-like cells predicts poor prognosis and implicates angiogenesis
2026-Feb-09, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04601-4
PMID:41663780
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研究论文 | 本研究通过分析单细胞RNA测序数据,探讨了甲状腺癌干细胞样细胞的特性及其与肿瘤组织中其他细胞的相互作用,特别是JAG1基因在预测预后中的作用 | 利用单细胞RNA测序数据识别甲状腺癌干细胞样细胞,并揭示JAG1与NOTCH1/4在血管生成中的关键相互作用及其对预后的影响 | 研究基于两个独立的数据集,样本量可能有限,且未进行实验验证 | 探索甲状腺癌干细胞样细胞的基因表达谱、细胞间相互作用及其与预后的关联 | 甲状腺癌干细胞样细胞、内皮细胞及临床患者数据 | 单细胞测序分析 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序 | Seurat R包、CytoTRACE、STRING、cytoHubba、clusterProfiler、CellChat | 单细胞RNA测序数据、临床数据 | 两个独立数据集(GSE191288和GSE250521),具体样本数未明确 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2868 | 2026-03-17 |
Senescence-Linked Fibrosis in the Aging Human Ovary Revealed by p16-Based Histological Profiling and Spatial Transcriptomics
2026-Feb-06, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-8290960/v1
PMID:41674822
|
研究论文 | 本研究通过p16INK4a蛋白表达的空间解析,结合空间转录组学和AI引导的数字病理学,揭示了人类绝经后卵巢中衰老细胞的空间分布及其与纤维化的关联 | 首次在人类绝经后卵巢中利用p16INK4a作为衰老标志物进行空间定位,并整合多组学技术识别衰老微环境,开发了BuckSenOvary基因签名 | 研究主要聚焦于绝经后卵巢,样本可能有限,且衰老细胞的动态变化和功能验证需进一步探索 | 探究衰老细胞在人类卵巢衰老中的作用及其微环境特征 | 人类绝经后卵巢组织 | 数字病理学 | 老年疾病 | 空间转录组学, 免疫组织化学, 多重免疫荧光, AI引导的数字病理学 | AI | 图像, 文本 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2869 | 2026-03-17 |
Molecular architecture of human dermal sleeping nociceptors
2026-Feb-04, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.12.048
PMID:41643676
|
研究论文 | 本研究通过Patch-seq方法结合单细胞转录组学、电生理学表征以及跨物种数据整合,鉴定了人类皮肤中机械不敏感的C纤维(CMis)的分子标记物OSMR和SST,并验证了其配体oncostatin M对CMis的调节作用 | 首次在人类皮肤中识别出CMis的分子标记物OSMR和SST,并通过跨物种整合和功能验证,为神经病理性疼痛的靶向治疗提供了新框架 | 研究主要基于猪模型和人类志愿者注射实验,样本规模有限,且人类皮肤组织的直接分子验证仍需进一步扩展 | 揭示人类皮肤中休眠伤害感受器(CMis)的分子结构,以促进对神经病理性疼痛机制的理解和靶向治疗策略的开发 | 人类皮肤中的机械不敏感C纤维(CMis)、猪感觉神经元以及健康人类志愿者 | 神经科学 | 神经病理性疼痛 | Patch-seq、单细胞转录组学、单核转录组学、空间转录组学、电生理学(膜片钳)、跨物种数据整合 | NA | 转录组数据、电生理数据、空间数据 | 涉及猪感觉神经元和健康人类志愿者,具体样本数量未在摘要中明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq、单核RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 2870 | 2026-03-17 |
Integrated Stress Response and Drug-Induced Acute Kidney Injury: Involvement of Activating ATF4-STAT1-GBP2 Signaling
2026-Jan-20, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000984
PMID:41563239
|
研究论文 | 本研究揭示了整合应激反应通过激活ATF4-STAT1-GBP2信号通路促进药物诱导的急性肾损伤的机制 | 首次发现ATF4作为整合应激反应的关键调控因子,通过激活STAT1-GBP2信号通路促进肾小管上皮细胞焦亡,从而驱动药物诱导的急性肾损伤 | 研究主要基于动物模型和体外实验,尚未在人类患者中进行大规模临床验证 | 阐明药物诱导急性肾损伤中细胞焦亡的分子机制,为开发新的治疗策略提供理论基础 | 肾小管上皮细胞、转基因小鼠模型、人类和小鼠的急性肾损伤样本 | 分子生物学与病理生理学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序、RNA测序、转录组分析、免疫组织化学、免疫荧光、荧光素酶报告基因检测、免疫共沉淀、Western blotting | NA | 基因表达数据、蛋白质数据、组织图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、RNA测序 | NA | NA |
| 2871 | 2026-03-17 |
Natural progression of glioma enhances functional connection with the cerebral cortex through synaptogenesis
2026, NeuroImage. Clinical
DOI:10.1016/j.nicl.2026.103942
PMID:41506055
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研究论文 | 本研究通过结合多灶性胶质瘤患者的功能磁共振成像分析和胶质瘤小鼠单细胞RNA测序数据,系统探索了胶质瘤的自然进展轨迹 | 首次通过多模态、跨尺度方法揭示胶质瘤自然进展中与大脑皮层的功能超连接性及其背后的突触发生分子机制 | 研究样本量有限(24例患者),且依赖于小鼠模型数据,可能无法完全反映人类胶质瘤的复杂性 | 理解胶质瘤的自然进展机制以改善临床管理 | 多灶性胶质瘤患者和胶质瘤小鼠模型 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 功能磁共振成像(fMRI),单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 图像,基因表达数据 | 24例多灶性胶质瘤患者,胶质瘤小鼠模型(早期、中期和终点病变样本) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2872 | 2026-03-17 |
Single-Cell Profiling Identifies JUNB/SPI1-Driven Inflammatory Programs and Novel Communication Axes in Myeloid Cells of Sepsis
2026, Endocrine, metabolic & immune disorders drug targets
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析,揭示了脓毒症中髓系细胞的促炎通路、关键转录调控因子及细胞间相互作用模式 | 识别了JUNB/SPI1驱动的炎症程序及髓系细胞中新的通讯轴,如MPZL1-MPZL1和FASL-FAS相互作用 | 样本量较小(仅4名脓毒症患者和5名健康对照),且数据来源于公共数据库,可能缺乏临床验证 | 表征脓毒症中浸润细胞的特性,为脓毒症治疗提供新见解 | 脓毒症患者和健康对照者的全血单细胞RNA测序样本 | 单细胞组学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | Seurat, clusterProfiler, SCENIC, CellChat | 单细胞RNA测序数据 | 4名脓毒症患者和5名健康对照者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2873 | 2026-03-16 |
PPRC1 is a prognostic biomarker and key regulator of mitochondrial oxidative phosphorylation in multiple myeloma
2026-Dec, Annals of medicine
IF:4.9Q1
DOI:10.1080/07853890.2026.2639658
PMID:41814677
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研究论文 | 本研究探讨了PPRC1在多发性骨髓瘤中的临床和生物学意义,发现其作为预后生物标志物和线粒体氧化磷酸化的关键调节因子 | 首次将PPRC1鉴定为多发性骨髓瘤的独立预后因子,并揭示其通过维持线粒体氧化磷酸化促进肿瘤进展的机制 | 研究主要基于公共数据库和细胞系实验,缺乏体内动物模型验证和临床样本的功能性验证 | 探索PPRC1在多发性骨髓瘤中的预后价值和生物学功能 | 多发性骨髓瘤患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序,siRNA沉默,Kaplan-Meier分析,Cox回归分析 | NA | 基因表达数据,临床数据 | 公共数据库和独立本地队列的多发性骨髓瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2874 | 2026-03-16 |
Gut-brain axis-mediated mechanisms and immune regulatory pathways in vascular dementia: Insights into microbiota-derived metabolites and novel therapeutic strategies
2026-May-08, Behavioural brain research
IF:2.6Q3
DOI:10.1016/j.bbr.2026.116113
PMID:41722735
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研究论文 | 本研究通过整合多组学分析和机器学习方法,识别了血管性痴呆的关键致病基因PIK3CG,并探索了肠道微生物代谢物通过肠脑轴调控神经炎症的潜在治疗策略 | 首次结合单细胞RNA测序、机器学习优先排序和孟德尔随机化分析,系统揭示了PIK3CG在血管性痴呆中的关键作用,并发现六种具有药物相似性的肠道微生物代谢物可能通过靶向PIK3CG发挥治疗潜力 | 研究主要基于生物信息学分析和体外分子对接,缺乏体内实验验证;样本来源和规模未明确说明,可能影响结果的普适性 | 阐明血管性痴呆的分子机制,探索基于肠脑轴的微生物代谢物干预策略 | 血管性痴呆相关基因、肠道微生物代谢物、神经炎症通路 | 生物信息学 | 血管性痴呆 | 单细胞RNA测序、机器学习(LASSO、神经网络、SVM-RFE)、孟德尔随机化、分子对接 | LASSO、神经网络、SVM | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2875 | 2026-03-16 |
MICALL2 promotes angiogenesis of colorectal cancer by regulating the EGFR/PI3K/AKT/KLF5/VEGFA axis
2026-May, Biochemical pharmacology
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.bcp.2026.117757
PMID:41617093
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研究论文 | 本研究揭示了MICALL2通过调控EGFR/PI3K/AKT/KLF5/VEGFA轴促进结直肠癌血管生成的新机制 | 首次发现MICALL2在结直肠癌血管生成中的关键作用,并阐明其通过稳定EGFR激活下游信号通路的具体分子机制 | 研究主要基于细胞系和动物模型,缺乏临床患者样本的验证,且未探讨MICALL2在其他癌症类型中的普适性 | 探索结直肠癌血管生成的新机制和潜在治疗靶点 | 结直肠癌细胞、人脐静脉内皮细胞、鸡胚绒毛尿囊膜、异种移植模型 | 肿瘤生物学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、加权基因共表达网络分析、免疫组织化学、体外功能实验、体内动物模型 | NA | 基因表达数据、图像数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2876 | 2026-03-16 |
Single-cell RNA sequencing of human embryonic stem cells reveals immediate and deferred transcriptomic responses to retinoic acid-mediated effects across cell subpopulations
2026-May, Toxicology in vitro : an international journal published in association with BIBRA
IF:2.6Q3
DOI:10.1016/j.tiv.2026.106213
PMID:41679446
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,分析了H9人胚胎干细胞在视黄酸处理下的转录组响应,揭示了其在多能性和分化过程中的即时与延迟效应 | 首次在单细胞分辨率下,系统描绘了视黄酸对人胚胎干细胞转录组的动态影响,并关联了发育轨迹的改变 | 研究仅基于H9细胞系,可能无法完全代表所有人类胚胎干细胞;样本量相对有限;未深入验证功能机制 | 探索视黄酸作为发育毒性物质或形态发生素,在人胚胎干细胞中的分子签名,以支持未来发育毒性化学筛选的转录组生物标志物开发 | H9人胚胎干细胞系 | 单细胞组学 | 发育毒性 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | H9细胞系在多种处理条件下的样本(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2877 | 2026-03-16 |
Deciphering the single-cell transcriptomic atlas of donkey (Equus asinus) gonad development in early gestation
2026-May, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2026.02.003
PMID:41690667
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研究论文 | 本研究构建了妊娠早期(4周和8周)驴胚胎性腺的单细胞转录组图谱,揭示了卵巢发育过程中的细胞类型组成、生殖细胞动态分化及相关信号网络的差异 | 首次构建了驴早期妊娠期性腺发育的单细胞转录组图谱,系统揭示了卵巢形态变化、细胞类型异质性、生殖细胞相关基因表达动态以及TGF-β等信号通路的差异,并提出了颗粒细胞可能起源于卵巢上皮细胞的新见解 | 研究仅聚焦于妊娠早期(4周和8周)两个时间点,未能覆盖更完整的发育周期;样本量有限;功能验证实验不足 | 解析驴早期妊娠期性腺发育的分子机制,以探究其低繁殖率的成因 | 妊娠4周和8周的驴胚胎性腺组织 | 单细胞转录组学 | 生殖障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 妊娠4周和8周的驴胚胎性腺组织(具体样本数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2878 | 2026-03-16 |
Machine learning derived proliferating T cell-related signature: a novel biomarker for prognosis and treatment efficacy in clear cell renal cell carcinoma
2026-Apr-15, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.116361
PMID:41740344
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于增殖T细胞相关基因的机器学习评分模型(TRRS),用于预测透明细胞肾细胞癌的预后和治疗效果 | 首次利用增殖T细胞相关特征构建了ccRCC的预后和治疗反应预测模型,并通过多组学分析鉴定了关键介质CST3 | 模型基于回顾性数据开发,需要前瞻性研究进一步验证其临床实用性 | 开发可靠的生物标志物以预测ccRCC患者的临床结局和治疗反应 | 透明细胞肾细胞癌患者 | 机器学习 | 肾癌 | 转录组学、空间转录组学、单细胞转录组学 | 机器学习框架 | 转录组数据 | 多个独立队列(CheckMate025、IMmotion151、JAVELIN Renal 101、TCGA-KIRC、华西医院队列) | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 2879 | 2026-03-16 |
Targeting macrophage-mediated clearance of apoptotic cells overcomes anti-VEGF resistance in choroidal neovascularization
2026-Apr-15, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.116410
PMID:41740341
|
研究论文 | 本研究利用Stereo-seq空间转录组技术,揭示了脉络膜新生血管(CNV)微环境中巨噬细胞清除凋亡细胞的功能障碍是抗VEGF治疗抵抗的关键机制,并提出联合抗CD47治疗可克服此抵抗 | 首次在单细胞分辨率下构建了视网膜-脉络膜-巩膜复合体的空间转录组图谱,并发现巨噬细胞介导的凋亡内皮细胞清除障碍是抗VEGF治疗抵抗的新机制 | 研究基于小鼠激光诱导的CNV模型,其结果在人类nAMD患者中的普适性有待验证 | 探究脉络膜新生血管(CNV)微环境中导致抗VEGF治疗不完全应答(IRT)的细胞与分子机制 | 健康对照小鼠及激光诱导CNV模型小鼠的视网膜-脉络膜-巩膜(RCS)复合体 | 空间转录组学 | 年龄相关性黄斑变性 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 健康对照、未治疗CNV及抗VEGF治疗CNV三组小鼠的RCS复合体样本 | 华大基因(BGI) | 空间转录组学 | Stereo-seq | Stereo-seq技术(用于构建单细胞分辨率空间转录组图谱) |
| 2880 | 2026-03-16 |
Inhibition of LRRK2 alleviates LPS-induced hippocampal pericyte loss and depressive-like behaviors through suppressing the RIPK1-mediated necroptosis pathway
2026-Apr-15, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.116414
PMID:41740343
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研究论文 | 本研究揭示了LRRK2抑制剂通过抑制RIPK1介导的坏死性凋亡通路,减轻LPS诱导的海马周细胞丢失和抑郁样行为 | 首次将LRRK2激活与RIPK1介导的坏死性凋亡通路联系起来,并证明LRRK2抑制剂能通过该机制保护周细胞、改善血脑屏障功能和抑郁样行为 | 研究主要基于LPS诱导的炎症模型,在人类临床样本中的验证尚不充分 | 探究LPS诱导的抑郁样行为发病机制中周细胞丢失的作用及分子机制 | 小鼠海马组织、人脑血管周细胞 | 神经科学 | 抑郁症 | 单细胞RNA测序、微阵列分析、免疫共沉淀 | NA | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 微阵列 | NA | NA |