单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 9441 篇文献，本页显示第 2841 - 2860 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2841 | 2026-08-12 |
Role of Abca7-related microglial responses in linking type 2 diabetes mellitus to Alzheimer's disease progression: Evidence from single-cell transcriptomic analysis and experimental validation in animal and cell models
2026-Jul-15, European journal of pharmacology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.ejphar.2026.179152
PMID:42463036
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析和动物及细胞模型实验验证，探讨Abca7相关的小胶质细胞反应在2型糖尿病与阿尔茨海默病进展关联中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序揭示Abca7作为连接T2DM和AD病理的关键基因，并在体内外模型中验证其调节小胶质细胞过度激活的机制 | 未充分阐明Abca7在人类患者中的具体作用，且动物模型和细胞系可能与人类病理存在差异，机制验证部分依赖NF-κB信号通路和氧化应激抑制的间接证据 | 探究Abca7在小胶质细胞反应中连接T2DM和AD的潜在机制 | db/db小鼠和db/m小鼠海马组织、Aβ1-42诱导的AD小鼠模型、BV2小胶质细胞 | 数字病理学、单细胞转录组学 | 阿尔茨海默病、2型糖尿病 | 单细胞RNA测序、行为学测试、蛋白质印迹、免疫荧光 | 小鼠模型、小胶质细胞系 | 单细胞基因表达数据、动物行为数据、蛋白表达图像 | 涉及db/db和db/m小鼠各若干只、AD小鼠模型、BV2细胞系 | 未提及 | 单细胞RNA测序 | 未提及 | 未提及 |
| 2842 | 2026-08-12 |
Cerebrospinal fluid metabolites and brain imaging in epilepsy subtypes: Mendelian randomization and multi-omics analysis
2026-Jul-15, European journal of pharmacology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.ejphar.2026.179095
PMID:42361880
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研究论文 | 利用孟德尔随机化和多组学分析，探讨脑脊液代谢物、神经影像表型与癫痫亚型之间的因果关联，以识别候选基因和潜在治疗靶点 | 整合脑脊液代谢物、神经影像和基因表达等多组学数据，通过孟德尔随机化建立因果关系，并利用单细胞RNA测序定位关键基因到特定细胞类型，揭示细胞特异性病理机制 | 依赖公开的基因组关联研究数据，可能受样本选择和人群异质性影响，且孟德尔随机化假设的严格性可能限制结果的稳健性 | 探索脑脊液代谢物和神经影像表型与癫痫亚型的因果关系，并优先排序候选基因和潜在治疗靶点 | 癫痫患者，特别是局灶性癫痫，及其相关脑脊液代谢物、神经影像表型和基因表达数据 | 机器学习 | 癫痫 | 孟德尔随机化、多组学分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因组关联研究数据、基因表达数据、神经影像数据、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2843 | 2026-08-12 |
Reprogramming macrophages to treat liver diseases
2026-Jul-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001160
PMID:39716928
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综述 | 本文综述了肝脏疾病中巨噬细胞的多种激活程序及靶向治疗潜力，重点讨论了通过重编程巨噬细胞以恢复肝脏稳态的纳米治疗策略 | 利用最新的单细胞和空间转录组学研究揭示肝脏巨噬细胞的巨大异质性和多功能角色，并探讨了纳米级治疗工具用于巨噬细胞靶向干预的精准医学潜力 | 循环中可溶性标志物分析仅提供肝脏巨噬细胞亚群复杂性的部分信息，且综述未涵盖临床应用的详细数据 | 综述肝脏疾病（慢性炎症、肝硬化和肝细胞癌）中巨噬细胞相关治疗靶点及纳米治疗干预方法 | 肝脏巨噬细胞，包括常驻库普弗细胞和单核细胞来源的巨噬细胞 | 生物信息学 | 肝脏疾病 | 单细胞测序、空间转录组学 | NA | 基因组数据、空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 10x Chromium、10x Visium | 10x Chromium Single Cell 3'、10x Visium |
| 2844 | 2026-08-12 |
EphrinB2 Regulates DPSC Pericyte-like Functions via the Focal Adhesion Pathway
2026-07, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345251385554
PMID:41560563
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研究论文 | 本研究探讨了EphrinB2通过黏着斑通路调节牙髓干细胞（DPSCs）的周细胞样功能及其与内皮细胞的相互作用 | 首次揭示了EphrinB2通过Src/FAK/paxillin信号通路调控DPSCs的周细胞功能，并利用单细胞RNA测序和3D纤维蛋白珠实验验证了其对血管形成的促进作用 | 未在体内模型中验证EphrinB2对血管形成和牙髓再生的实际效果，且具体分子机制尚需进一步深入研究 | 阐明EphrinB2信号在DPSCs周细胞功能中的作用及其对血管形成的调控机制 | 健康人牙髓干细胞（DPSCs）和人脑血管周细胞，以及人脐静脉内皮细胞（ECs） | 数字病理学 | 不适用 | 单细胞RNA测序，bulk RNA-seq，免疫荧光染色，慢病毒转染，3D纤维蛋白珠实验 | 不适用 | 基因表达数据，图像 | 健康人牙髓样本（数量未明确） | 不适用 | 单细胞RNA测序，bulk RNA-seq | 不适用 | 不适用 |
| 2845 | 2026-08-12 |
EssentCell: Discovering Essential Evolutionary Relations in Noisy Single-Cell Data
2026 Jul-Aug, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2026.3691222
PMID:42096398
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研究论文 | 提出EssentCell算法，基于整数线性规划在噪声单细胞测序数据中发现所有最优系统发育树中必需的进化关系 | 首次关注单细胞测序数据中所有最优系统发育树共有的必需关系，并通过限制假阳性率参数化最小翻转问题，提出高效算法 | 未在本文中明确讨论算法在大规模数据集上的计算复杂性和扩展性限制 | 在噪声单细胞测序数据中，通过整数线性规划高效确定所有最优系统发育树中必需的进化关系 | 单细胞测序数据矩阵，表示细胞和突变关系 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 整数线性规划 | 二进制矩阵数据 | 多个数据集，具体样本数量未在标题和摘要中说明 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 2846 | 2026-08-12 |
AdPrST:An Adversarial Graph Deep Learning Pre-Clustering Framework for Deciphering Spatiotemporal Structures in Spatially Resolved Transcriptomics
2026 Jul-Aug, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2026.3697726
PMID:42202195
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研究论文 | 提出了一种基于对抗图深度学习的预聚类框架AdPrST，用于解析空间解析转录组学中的时空结构，包括空间域识别、轨迹推断和伪时空图构建 | 采用对抗自监督对比学习，结合Wasserstein距离GAN和对比学习，通过双视图图结构和点积注意力机制，实现空间域识别的准确性提升 | 未提及 | 准确解析复杂组织中的时空结构，以推进空间转录组学研究 | 空间解析转录组学数据中的基因表达和空间位置 | 深度学习 | NA | 空间转录组学 | GAN | 基因表达数据 | 多个数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2847 | 2026-08-12 |
scGDCF: Graphical Deep Clustering With Fused Common Information for Single-Cell RNA-Seq Data
2026 Jul-Aug, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2026.3698076
PMID:42224333
|
研究论文 | 提出了一种名为scGDCF的图深度聚类方法，用于单细胞RNA测序数据，通过融合特征和拓扑结构信息，有效识别细胞类型 | 创新性地引入稀疏特征表示方法，利用对抗损失函数处理数据稀疏性；设计互信息提取算子以深度挖掘和融合特征与拓扑结构信息的共同信息；提出双自适应注意力机制，在全局和局部层面调整不同邻节点和信息源的贡献 | 未明确提及局限性 | 解决单细胞RNA测序数据聚类中特征与拓扑结构信息融合不足及数据稀疏问题，提升聚类性能 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | RNA-seq | 深度聚类模型（图神经网络） | 基因表达数据 | 七个真实数据集和两个模拟数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2848 | 2026-08-12 |
Recipient-derived macrophages mediate acute cardiac allograft rejection via GSDMD-induced pyroptosis mechanism
2026-07, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70729
PMID:42403008
|
研究论文 | 本研究探讨了受体来源的巨噬细胞通过GSDMD介导的细胞焦亡促进心脏移植急性排斥反应，并验证了靶向GSDMD可延长移植物存活时间 | 首次证明受体来源的M1型巨噬细胞中的GSDMD依赖性焦亡驱动心脏移植急性排斥，并阐明TNFα/IL6激活NF-κB和STAT3上调GSDMD的分子机制 | 摘要未提及具体局限性 | 确定巨噬细胞GSDMD依赖性焦亡是否驱动心脏移植急性排斥反应，以及靶向GSDMD是否改善移植物存活 | 心脏移植模型中的巨噬细胞和CD8+T细胞 | 免疫学 | 心脏移植排斥 | 免疫印迹, 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 免疫组织化学 | NA | 基因表达数据, 图像 | 全球及巨噬细胞特异性GSDMD缺陷小鼠模型，具体数量未在摘要中说明 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞测序 |
| 2849 | 2026-08-12 |
DiffuST: A Latent Diffusion Model for Spatial Transcriptomics Denoising
2026 Jul-Aug, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2026.3690748
PMID:42085414
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研究论文 | 开发了一种名为DiffuST的潜在扩散模型，用于空间转录组数据的去噪 | DiffuST创新性地结合图自动编码器和预训练模型提取多尺度特征，并利用潜在扩散模型将不同尺度特征映射到同一空间进行去噪 | 未提及具体局限性 | 旨在提高空间转录组数据的信噪比，增强下游分析能力，并揭示生物学见解 | 空间转录组数据及匹配的病理图像 | 机器学习和数字病理学 | 不适用 | 空间转录组测序 | 潜在扩散模型、图自动编码器 | 基因表达数据和病理图像 | 多个空间转录组数据集 | 不适用 | 空间转录组学 | 不适用 | 不适用 |
| 2850 | 2026-08-12 |
scALGSL: Active Learning and Graph Structure Learning for Cell Type Annotation From Single-Cell RNA-Seq Data
2026 Jul-Aug, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2026.3693722
PMID:42133522
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研究论文 | 提出了一种结合主动学习与图结构学习的单细胞RNA测序数据细胞类型注释框架scALGSL | 创新性地融合了图引导的主动学习机制、可学习的图结构优化模块和基于预训练模型的细胞状态辅助通路，共同解决标签稀缺、图拓扑次优和细胞状态信息缺失三大挑战 | 未在文中明确提及局限性 | 提高单细胞RNA测序数据中细胞类型注释的准确性和鲁棒性，以促进肿瘤微环境分析和精准医学应用 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 图神经网络、主动学习、预训练模型 | 单细胞转录组数据 | 癌症数据集（具体样本数量未在文中提供） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2851 | 2026-08-12 |
Integrated DNA methylome and transcriptome signatures of lung CD4+ T-cells in sarcoidosis
2026-Jul, ERJ open research
IF:4.3Q1
DOI:10.1183/23120541.01611-2025
PMID:42577710
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研究论文 | 本研究整合了肺CD4+ T细胞的DNA甲基化和转录组数据，以识别与结节病及其进展相关的分子变化。 | 首次整合肺CD4+ T细胞的DNA甲基化和转录组数据，使用DIABLO方法进行多组学整合分析，并通过单细胞RNA测序验证发现IL18RAP作为候选生物标志物。 | 样本量较小，且未进行功能验证实验来确认IL18RAP在结节病发病机制中的直接作用。 | 识别与结节病风险及其进展相关的分子变化，并寻找潜在的生物标志物。 | 来自29名结节病患者（16名进展型，13名非进展型）和19名健康对照的支气管肺泡灌洗液CD4+ T细胞。 | 基因组学 | 结节病 | mRNA测序、DNA甲基化测序（Illumina HumanMethylationEPIC BeadChip）、单细胞RNA测序 | 线性模型、DIABLO | 基因表达数据、甲基化数据、单细胞表达数据 | 48个样本（29例结节病患者和19例健康对照） | Illumina | DNA甲基化测序 | Illumina HumanMethylationEPIC BeadChip | 未提供具体配置 |
| 2852 | 2026-08-12 |
Nur77 agonism invigorates Natural Killer cell immunity against hepatocellular carcinoma
2026-Jun-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-75027-3
PMID:42374019
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研究论文 | 该研究通过空间和单细胞转录组学揭示了Nur77在NK细胞介导的肝细胞癌免疫中的作用，并证明其激动剂可增强NK细胞的抗肿瘤功能 | 首次揭示Nur77在NK细胞抗肝细胞癌免疫中的关键作用，并证明Nur77激动剂可增强NK细胞的抗肿瘤功能，为改善NK细胞免疫治疗提供了新策略 | 摘要未提及研究的局限性 | 探究Nur77在NK细胞抗肝细胞癌免疫中的作用及其潜在治疗价值 | 自然杀伤细胞（NK细胞）和肝细胞癌（HCC） | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、功能实验 | NA | 基因表达数据、组织图像 | 人类和小鼠肝细胞癌肿瘤样本，具体数量未提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 10x Chromium、10x Visium | 10x Chromium单细胞3'文库、10x Visium空间转录组 |
| 2853 | 2026-08-12 |
Chromogenic in situ HCR as a targeted translational interface for routine molecular histology
2026-Jun-08, Histochemistry and cell biology
IF:2.1Q2
DOI:10.1007/s00418-026-02496-4
PMID:42257912
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评论 | 本文评论了显色原位HCR作为一种靶向分子组织学方法在常规组织学中的应用，并讨论其与空间转录组学的关系及潜在价值。 | 将显色原位HCR定位为靶向分子组织学方法，而非高维空间转录组学的替代品，强调其在验证和情境化预定义转录本中的应用。 | 显色原位HCR在成本、探针合成、优化和试剂可用性方面存在挑战，且其价值限于狭义的标记定义应用，不适用于复杂多基因空间细胞状态重建。 | 探讨显色原位HCR作为常规分子组织学的靶向界面，并为其实际应用提供建议。 | 显色原位HCR技术及其在常规组织学中的应用。 | 数字病理学 | NA | 原位杂交链式反应（HCR） | NA | 图像 | NA | NA | 靶向RNA检测 | NA | NA |
| 2854 | 2026-08-12 |
Hypomethylation of FAM83A in lung adenocarcinoma mirrors an epigenetic signature of airway cell differentiation states
2026-Jun-07, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05380-8
PMID:42251611
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研究论文 | 本研究探讨了肺腺癌中FAM83A基因的DNA低甲基化现象，并发现其表达与气道上皮细胞的分化状态相关，而非单纯的表观遗传异常。 | 首次揭示FAM83A在肺腺癌中的激活并非源于异常的DNA去甲基化过程，而是反映了肿瘤细胞向气道分化程序的转变，这与癌症生殖系基因MAGEA1的异常激活机制不同。 | 未明确提供样本量及具体平台信息，可能影响结果的普遍性。 | 阐明肺腺癌中FAM83A基因低甲基化及其表达上调的细胞起源，区分其究竟是表观遗传异常还是细胞分化重编程的结果。 | 正常肺组织、肺腺癌细胞系和组织样本，以及原代和永生化人肺基底细胞。 | 表观遗传学、癌症生物学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序、RT-qPCR、亚硫酸盐测序、转录组分析 | NA | 转录组数据、甲基化数据、基因表达数据 | 未提供具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2855 | 2026-08-12 |
NOTCH3 regulates myofibroblastic CAF differentiation via the P62-ROS signaling axis to promote bladder cancer progression
2026-Jun-06, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-026-03751-1
PMID:42251414
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研究论文 | 本研究整合患者来源的癌相关成纤维细胞、批量与单细胞转录组学、空间转录组学及多队列临床数据，系统解析了NOTCH3通过P62-ROS信号轴调控肌成纤维细胞分化以促进膀胱癌进展的机制 | 首次揭示NOTCH3通过招募HSPA8促进P62的K48连接泛素化降解，抑制P62-NRF2抗氧化通路，维持细胞内ROS积累，从而驱动肌成纤维细胞分化，并整合上游TGF-β信号与氧化还原和蛋白稳态控制 | 摘要未提及研究的局限性 | 阐明癌相关成纤维细胞促进膀胱癌恶性进展的分子机制，并评估NOTCH3作为潜在治疗靶点的价值 | 膀胱癌患者来源的癌相关成纤维细胞和正常成纤维细胞，以及皮下和原位膀胱癌小鼠模型 | 癌症生物学 | 膀胱癌 | 批量RNA测序、单细胞转录组学、空间转录组学、免疫组化、多重免疫荧光、PCR、免疫印迹、免疫荧光 | NA | 转录组数据、组织图像、细胞实验数据、小鼠模型数据 | 多队列临床数据集及患者来源的成纤维细胞和小鼠模型（具体数量未提及） | NA | 单细胞转录组学、空间转录组学、批量RNA测序 | NA | NA |
| 2856 | 2026-08-12 |
Pan-cancer single-cell and spatial transcriptomics analyses delineate response-associated heterogeneity and therapeutic targets of tumor-infiltrating B cells following immune checkpoint blockade
2026-Jun-05, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-026-04449-1
PMID:42247075
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研究论文 | 通过泛癌单细胞与空间转录组学分析，描绘了肿瘤浸润B细胞在免疫检查点阻断治疗中的反应相关异质性和治疗靶点 | 首次构建了泛癌ICB反应B细胞图谱，整合了单细胞和空间转录组数据，并利用Geneformer模型进行全基因计算机模拟扰动以识别关键候选基因 | 未提及具体局限性 | 揭示肿瘤浸润B细胞在免疫检查点阻断治疗中的生物学功能、空间生态位和交叉对话的异质性，并识别潜在的临床生物标志物和治疗靶点 | 肿瘤浸润B细胞及其亚群 | 单细胞转录组学、空间转录组学 | 泛癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、NMF分析、拟时间轨迹分析、Geneformer模型 | Geneformer | 单细胞转录组数据、空间转录组数据、TCGA数据 | 688个单细胞转录组，涵盖24种癌症类型，共241,645个细胞 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 2857 | 2026-08-12 |
Upregulation of ADAM19 in dendritic cells is associated with immune features and lower C-peptide levels in type 1 diabetes mellitus
2026-Jun-05, Diabetology & metabolic syndrome
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s13098-026-02170-8
PMID:42249412
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研究论文 | 该研究探讨了1型糖尿病中树突状细胞ADAM19表达与免疫特征及C肽水平的关联 | 首次揭示ADAM19在T1DM DCs中的表达上调与免疫失调和β细胞功能障碍相关，并评估其作为生物标志物的潜力 | 研究主要基于公共数据集和有限样本，需进一步验证ADAM19作为生物标志物的诊断和治疗应用 | 探究T1DM中DCs内ADAM19表达与免疫特征的关系，并评估其作为候选生物标志物的可能性 | 外周血单个核细胞和胰腺组织中的树突状细胞以及T1DM患者和健康对照样本 | 数字病理学 | 1型糖尿病 | RNA测序 | 偏最小二乘判别分析 | 基因表达数据 | 总共涉及多个数据集，包括129个PBMC样本（75例T1DM，54例对照）、20个内部PBMC样本（13例T1DM，7例对照）、117个scRNA-seq样本（55例T1DM，62例对照）以及44个PBMC验证样本（29例T1DM，15例对照） | NA | 批量RNA测序，单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2858 | 2026-08-12 |
MMP9 Genotype and Systemic T-Cell Subsets Correlate With Structural and Functional Outcomes in Neovascular Age-Related Macular Degeneration
2026-06-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.67.6.29
PMID:42300675
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研究论文 | 本研究探讨了MMP9基因型与系统性T细胞亚群对新生血管性年龄相关性黄斑变性结构和功能治疗结果的影响 | 首次将MMP9基因型与T细胞亚群频率结合，分析其在nvAMD治疗结果中的关联，并利用单细胞RNA测序和深度学习的OCT图像分析 | 样本量较小，特别是免疫表型分析仅涉及9名患者，可能限制统计效力 | 评估MMP9基因型和T细胞亚群频率对nvAMD结构和功能治疗结果的影响 | 新生血管性年龄相关性黄斑变性（nvAMD）患者 | 数字病理学 | 新生血管性年龄相关性黄斑变性 | 单细胞RNA测序、ELISA、流式细胞术、基因分型、深度学习OCT图像分析 | 深度学习 | RNA测序数据、图像、免疫表型数据 | 38名nvAMD患者，其中9名进行了高维免疫表型分析 | NA | 单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | NA |
| 2859 | 2026-08-12 |
IgG2a-formatted 4-1BB agonism combined with S100A9 inhibition enhances T cell activation and tumor control in a preclinical model of multiple myeloma
2026-May-04, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-026-03716-4
PMID:42082972
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研究论文 | 本研究探讨了IgG2a型4-1BB激动剂单独及联合S100A9抑制剂Tasquinimod在多发性骨髓瘤小鼠模型中的抗肿瘤疗效和免疫调节机制 | 首次证明4-1BB激动剂抗肿瘤疗效具有IgG亚型特异性，并发现其与S100A9抑制剂联合可协同增强T细胞活化和肿瘤控制 | 主要基于小鼠模型，且未进行长期生存分析或临床验证 | 评估4-1BB激动剂与Tasquinimod联合治疗多发性骨髓瘤的潜力，并探索其免疫机制 | 多发性骨髓瘤小鼠（5TGM1模型）和新诊断患者骨髓样本中的T细胞、NK细胞和髓系细胞 | 癌症免疫治疗 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、多参数流式细胞术 | 小鼠肿瘤模型 | 基因表达、细胞表型数据 | 使用5TGM1肿瘤小鼠和初诊多发性骨髓瘤患者骨髓样本（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA-seq、流式细胞术 | NA | NA |
| 2860 | 2026-08-12 |
Reflections on the use of LLMs for cell annotation
2026-May-04, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag312
PMID:42289049
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评论 | 本文对近期发布的基于大语言模型（LLM）的细胞类型注释平台AICellType进行评论，指出其依赖专有商业LLM的问题，并建议优先发展开源生物医学LLM、多模态视觉语言模型、本地部署等，以提高可重复性、隐私保护和合规性。 | 提出在生物医学细胞注释领域应减少对专有商业LLM的依赖，强调开源模型和多模态视觉语言模型的重要性，并关注本地部署、可重复性和隐私合规等实际问题。 | 未提供实验验证，仅为观点性评论，缺乏系统性比较或实证数据支持其建议。 | 探讨用于单细胞和空间转录组数据细胞类型注释的LLM平台（特别是AICellType）的局限性，并提出可持续改进方向。 | LLM平台（如AICellType）及用于细胞注释的LLM相关技术。 | 自然语言处理 | NA | 单细胞及空间转录组测序 | 大语言模型（LLM） | 文本， 单细胞和空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序， 空间转录组学 | NA | NA |