单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202601-202612] [清除筛选条件]
当前共找到 9441 篇文献,本页显示第 2801 - 2820 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
2801 2026-08-12
Single-cell Profiling of Lymphoid and Myeloid Compartments Reveals Coordinated Immune Dysregulation and Enhanced Monocyte-centric Intercellular Communication in Relapsing Polychondritis
2026-Aug-11, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
研究论文 通过单细胞RNA测序分析复发性多软骨炎患者外周血单个核细胞,揭示免疫失调和单核细胞为中心的细胞间通讯增强 首次全面描绘RP外周免疫景观的单细胞图谱,发现单核细胞通过ANXA1-FPR1轴作为主导信号枢纽 样本量较小,且未进行功能验证实验 阐明复发性多软骨炎的免疫病理机制,寻找潜在治疗靶点 6名RP患者和5名健康对照的外周血单个核细胞 单细胞转录组学 复发性多软骨炎 scRNA-seq, ELISA NA 单细胞转录组数据, 血浆蛋白水平 11例外周血样本(6例患者,5例对照) NA 单细胞RNA测序 NA NA
2802 2026-08-12
Individual host variation in single-cell responses to enteroaggregative Escherichia coli infection modeled with human colon organoids
2026-Aug-11, mSphere IF:3.7Q2
研究论文 通过单细胞RNA测序分析人结肠类器官对肠聚集性大肠杆菌感染的反应,揭示宿主个体间的异质性 首次在单细胞水平上展示宿主个体对EAEC感染的差异性反应,挑战传统病原体为中心的范式,强调宿主因素在感染结局中的关键作用 人结肠类器官来源的结肠区域可能作为混杂因素,尽管观察到的类器官间变异超过以往报道的区域差异,但可能仍有影响 理解宿主驱动的疾病异质性,探索宿主遗传和细胞背景对EAEC感染易感性的影响 来自三个健康成年供体的人结肠类器官(HCOs) 单细胞测序、感染生物学 感染性腹泻 单细胞RNA测序 人结肠类器官模型 单细胞转录组数据 来自3个健康供体的结肠类器官 NA 单细胞RNA测序 NA NA
2803 2026-08-12
RUNX1-driven endothelial-to-mesenchymal transition contributes to remodelling in LMNA cardiomyopathy
2026-Aug-11, European heart journal IF:37.6Q1
研究论文 本研究通过空间转录组学和多组学分析,揭示了RUNX1驱动的内皮-间质转化在LMNA心肌病纤维化重塑中的作用,并验证了遗传和药理抑制RUNX1的治疗潜力 首次在人类LMNA-DCM心脏中识别出与纤维化相关的内皮细胞EndoMT转录和表观遗传特征,并证明了RUNX1作为关键调控因子,通过遗传和药理抑制策略在体外和体内恢复内皮功能和减轻心肌纤维化 摘要中未明确提及研究的局限性 阐明LMNA突变导致心肌纤维化重塑的机制,并评估RUNX1抑制作为潜在治疗策略 人类LMNA-DCM心脏组织、患者特异性iPSC来源的内皮细胞、工程心脏类器官和LMNAH222P/H222P小鼠模型 数字病理学 心血管疾病 空间转录组学、单核多组学、RNA-seq、ATAC-seq NA 基因表达数据、表观遗传数据、图像数据 人类LMNA-DCM心脏组织样本、iPSC来源的内皮细胞系、心脏类器官、LMNAH222P/H222P小鼠模型(具体数量未提供) 10x Genomics 空间转录组学、单细胞多组学 10x Visium, 10x Chromium 10x Visium空间转录组学、10x Chromium单核多组学
2804 2026-08-12
Single-cell landscape of neutrophil activation in primary sclerosing cholangitis
2026-Aug-11, International immunology IF:4.8Q2
研究论文 通过单细胞RNA测序分析原发性硬化性胆管炎肝脏灌流液中的中性粒细胞,揭示了其异质性和炎症程序 首次描绘PSC肝脏中性粒细胞的转录组异质性,识别四个与疾病相关的中性粒细胞亚群及其炎症信号通路 未提及 阐明中性粒细胞在PSC肝脏微环境中的状态及其在发病机制中的作用 健康供体移植物和PSC肝脏灌流液中的白细胞 单细胞转录组学 原发性硬化性胆管炎 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 未明确说明样本数,涉及健康供体移植物和PSC肝脏 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2805 2026-08-12
Single-cell RNA Sequencing Reveals a Distinct Resident Memory T Cell Phenotype in Prurigo Nodularis
2026-Aug-11, The British journal of dermatology
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
2806 2026-08-12
Correction to: Identification of ATF3 as a Potential Key Biomarker for Hypertensive Nephropathy via Single-Cell Transcriptome Sequencing
2026-Aug-11, Inflammation IF:4.5Q2
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
2807 2026-08-12
Decabromodiphenyl Ethane Sensitizes Zebrafish to Alcoholic Liver Injury by Compromising NAD+-Mediated Multicellular Responses
2026-Aug-11, Environmental science & technology IF:10.8Q1
研究论文 本研究探讨了新型溴化阻燃剂十溴二苯乙烷(DBDPE)对斑马鱼酒精性肝损伤进展的影响,发现其通过抑制NAD+介导的多细胞反应增加肝损伤易感性并阻碍恢复 首次揭示DBDPE通过NAD+缺乏机制破坏胆管细胞紧密连接和肝细胞酒精代谢通路,从而加剧酒精性肝损伤,并发现烟酰胺核苷补充可逆转该效应 研究基于斑马鱼模型,未在哺乳动物或人类中验证,且未探讨DBDPE暴露的长期影响或剂量依赖性 探究DBDPE暴露对酒精性肝损伤进展的影响及其潜在分子机制 雄性斑马鱼 毒理学 酒精性肝病 单细胞转录组测序 NA 单细胞基因表达数据 未明确样本数量(涉及斑马鱼肝脏组织) NA 单细胞RNA-seq NA NA
2808 2026-08-12
PD-1 blockade unleashes local hepatitis B virus-related B cell response inhibiting hepatocellular carcinoma
2026-Aug-10, Cancer cell IF:48.8Q1
研究论文 通过动态单细胞多组学分析,揭示PD-1阻断在肝细胞癌中通过增强肿瘤内三级淋巴结构中针对乙型肝炎病毒核心抗原的局部B细胞反应来抑制肿瘤的机制 首次发现PD-1阻断治疗肝细胞癌的机制涉及局部抗病毒B细胞免疫,特别是针对HBcAg的抗体反应和补体激活,而非仅依赖T细胞 摘要未提及明确的局限性 研究围手术期抗PD-1治疗对可切除复发性肝细胞癌的作用机制,并探索新的生物标志物 可切除复发性肝细胞癌患者及其肿瘤微环境中的免疫细胞和抗体 数字病理学 肝细胞癌 单细胞多组学、B细胞受体测序、空间转录组学 NA 单细胞转录组和B细胞受体序列数据 涉及患者样本,具体数量未在摘要中提及 10x Genomics 单细胞多组学 10x Chromium 10x Chromium单细胞多组学平台,结合空间转录组学
2809 2026-08-12
GDF15 suppresses liver inflammation independently of weight loss through neuroendocrine glucocorticoid signaling
2026-Aug-10, Cell metabolism IF:27.7Q1
研究论文 本研究利用热中性小鼠模型,发现GDF15通过GFRAL激活下丘脑-垂体-肾上腺轴,以不依赖体重减轻的方式抑制肝脏炎症和纤维化 首次揭示GDF15通过神经内分泌糖皮质激素信号通路独立于体重减轻发挥肝脏保护作用,并通过空间转录组学分析重塑肝脏免疫纤维化微环境 研究对象为小鼠模型,需在人类中验证;未完全阐明糖皮质激素信号下游的具体分子机制 阐明GDF15在代谢功能障碍相关脂肪性肝炎中的功能及其分子机制 GDF15及其受体GFRAL,涉及肝脏炎症、纤维化、免疫细胞及星状细胞 生物信息学 代谢功能障碍相关脂肪性肝炎 空间转录组学、RNA测序 NA 图像、文本 多个小鼠模型组(具体数量未提供) NA 空间转录组学, RNA-seq NA NA
2810 2026-08-12
Alpha-ketoglutarate ameliorates diabetes-associated skeletal muscle fibrosis by restoring TET2-dependent epigenetic remodeling in CD90 positive fibro-adipogenic progenitors
2026-Aug-10, Metabolism: clinical and experimental
研究论文 本研究探讨α-酮戊二酸通过恢复CD90阳性纤维脂肪祖细胞中TET2依赖的表观遗传重塑,改善糖尿病相关骨骼肌纤维化的机制 首次揭示代谢物α-KG和L-2HG通过调控TET2依赖的DNA羟甲基化影响CD90+ FAP的不对称细胞分裂,从而驱动糖尿病骨骼肌纤维化的新机制 主要基于小鼠模型和体外实验,人类样本验证有限 探究糖尿病骨骼肌纤维化中代谢-表观遗传机制,并评估α-KG补充的治疗潜力 CD90阳性纤维脂肪祖细胞(FAPs) 数字病理学 2型糖尿病 单细胞RNA测序,LC-MS NA 单细胞RNA测序数据,组织样本 人类糖尿病骨骼肌活检标本和小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
2811 2026-08-12
TNF Receptor 1 regulates colonic mesenchymal cell diversity and the epithelial stem cell niche
2026-Aug-10, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1
研究论文 本研究探讨了肿瘤坏死因子受体1在结肠间充质细胞多样性和上皮干细胞生态位中的作用,发现间充质TNFR1信号通过调控RSPO3维持干细胞生态位功能。 首次揭示了间充质TNFR1信号在维持结肠间充质细胞异质性和干细胞生态位中的关键作用,并鉴定了TNFR1依赖的TNF/干扰素响应间充质亚群,以及ITGA6信号在其中的调控机制。 研究主要基于小鼠模型和体外共培养系统,人类样本验证有限;未深入探讨TNFR1信号在疾病状态下的作用机制。 阐明间充质TNFR1信号如何调控结肠间充质细胞身份、干细胞生态位功能和上皮稳态。 结肠间充质细胞、肠道上皮干细胞、TNFR1缺陷小鼠模型和人类结肠肌成纤维细胞。 分子生物学 肠道疾病 免疫染色、western blot、bulk和单细胞RNA测序、类器官-间充质共培养、伤口愈合实验 小鼠模型(TNFR1-/-和Pdgfra-Cre;TNFR1fl/fl) 基因表达数据、图像数据 小鼠结肠组织样本和人类结肠肌成纤维细胞样本 NA 单细胞RNA测序、bulk RNA测序 NA NA
2812 2026-08-12
Hanchuan Zupa Granules attenuate host inflammatory and redox dysregulation in a pretreatment model of Pseudomonas aeruginosa-triggered acute lung injury
2026-Aug-10, Journal of ethnopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 本研究评估了寒喘祖帕颗粒(HCZP)对铜绿假单胞菌诱导的急性肺损伤小鼠模型的预处理保护作用,并整合了公共单细胞转录组数据、LC-MS分析和分子对接,探索其抗炎和抗氧化机制及潜在可追溯成分 首次系统评估HCZP在铜绿假单胞菌诱导的急性肺损伤模型中的预处理保护作用,并结合公共scRNA-seq数据、LC-MS和分子对接,优先确定了甘草苷和芹菜素作为潜在可追溯活性成分 未在论文标题和摘要中明确提及局限性 评估HCZP预处理对铜绿假单胞菌触发的急性肺损伤宿主损伤反应的保护作用,并探索相关通路和可追溯成分 昆明小鼠和A549细胞 机器学习 急性肺损伤 LC-MS, 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 分子对接 NA 基因表达数据, 图像, 质谱数据 昆明小鼠(数量未在摘要中明确)和A549细胞(细胞系) NA 单细胞RNA测序 NA 公共scRNA-seq数据(GSE276682)
2813 2026-08-12
scRNA-Seq in Gastric Cancer Reveals Macrophage-Derived C1q as a Diagnostic Marker
2026-Aug-10, Cancer science IF:4.5Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序研究胃癌中巨噬细胞来源的C1q,并评估其作为诊断标志物的潜力 首次鉴定并功能验证了胃癌中的C1QA TAM亚群,发现C1q通过促进M2巨噬细胞极化加速胃癌细胞迁移,并展示其作为非侵入性早期诊断生物标志物的前景 未提及具体局限性,但研究样本量有限(3名患者用于单细胞测序,100例组织样本和240例血浆样本),且体外实验可能无法完全反映体内复杂环境 探究胃癌中肿瘤相关巨噬细胞异质性,特别是C1q的表达和功能,并评估其临床诊断价值 胃癌患者的肿瘤组织、相邻组织、血浆样本,以及THP-1来源的巨噬细胞和胃癌细胞 数字病理学 胃癌 单细胞RNA测序、免疫组化、ELISA、体外迁移实验 NA 单细胞转录组数据、组织图像、血浆蛋白浓度数据 3名未治疗患者的配对肿瘤和相邻组织用于单细胞测序;100例胃癌组织用于免疫组化;240例患者血浆用于ELISA NA 单细胞RNA测序 NA NA
2814 2026-08-12
Calcified pituitary adenomas: First comprehensive characterization of a distinct clinical entity driven by GNAQ-mediated calcium-mitochondrial axis
2026-Aug-08, Experimental neurology IF:4.6Q1
研究论文 本研究首次全面表征了钙化垂体腺瘤的分子特征,发现GNAQ通过钙-线粒体轴驱动肿瘤钙化 首次对钙化垂体腺瘤进行分子水平全面表征,识别出独特的GNAQ-IP3/Ca2+-线粒体凋亡-钙化轴,不同于经典成骨途径 未在摘要中提及具体局限性 揭示钙化垂体腺瘤的分子机制,特别是GNAQ在钙化中的作用 115名钙化垂体腺瘤患者,其中36例影像可见钙化,以及GH3垂体腺瘤细胞和小鼠异种移植模型 数字病理学 垂体腺瘤 单细胞RNA测序,转录组测序 NA 基因表达数据,临床数据,影像数据 115名患者(36例影像可见钙化),GH3细胞系,小鼠异种移植模型 NA 单细胞RNA测序,批量RNA测序 NA NA
2815 2026-08-12
Single Cell-Type Spatial Proteomics Uncovers Regional Heterogeneity of Astrocytes
2026-08-07, Journal of proteome research IF:3.8Q1
研究论文 使用Microscoop Mint空间蛋白质组学平台直接分析小鼠脑组织中星形胶质细胞的蛋白质谱,揭示皮层和海马区的区域异质性 采用显微镜引导的空间蛋白质组学平台,实现福尔马林固定、OCT包埋脑组织中星形胶质细胞的亚细胞分辨率的蛋白质分析,无需单细胞分离 摘要中未提及明确局限性,可能包括样本量有限或需要进一步验证候选标记物 研究星形胶质细胞的区域异质性,通过空间蛋白质组学识别区域特异性蛋白标记物 小鼠脑组织中的星形胶质细胞 空间蛋白质组学 NA LC-MS/MS质谱法、空间蛋白质组学 NA 蛋白质组学数据、图像 小鼠脑组织样本(具体数量未提供) NA 空间蛋白质组学 Microscoop Mint 集成亚细胞区域特异性样本制备与LC-MS/MS质谱的显微镜引导平台
2816 2026-08-12
Transposable elements and homotypic niches drive immune dynamics and resistance in melanoma epigenetic-based immunotherapy
2026-Aug-07, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞多组学和空间转录组学分析黑色素瘤患者在表观遗传免疫治疗期间的纵向活检样本,揭示了肿瘤可塑性、转座子激活和同型微环境在驱动免疫逃逸和治疗抵抗中的作用 首次在表观遗传免疫治疗临床试验中结合单细胞多组学和空间转录组学,识别出罕见的Wnt/β-Catenin黑色素细胞状态和去分化神经嵴样状态,并发现NFATC2作为耐药的关键调控因子,为治疗提供了新靶点 样本量有限,且主要基于单一临床试验队列,可能限制结果的普适性 阐明表观遗传重塑在黑色素瘤免疫治疗压力下如何驱动免疫逃逸和治疗抵抗的机制 接受表观遗传免疫治疗(DNA甲基转移酶1抑制剂联合抗CTLA-4)的黑色素瘤患者的纵向活检样本 数字病理学 黑色素瘤 单细胞多组学、空间转录组学 NA 单细胞基因表达数据、染色质可及性数据、空间转录组数据 来自黑色素瘤患者的纵向活检样本(具体数量未说明) 10x Genomics 单细胞多组学、空间转录组学 10x Chromium、10x Visium 10x Chromium单细胞多组学(基因表达和染色质可及性)、10x Visium空间转录组学
2817 2026-08-12
A topology-based framework for robust cancer-associated gene signature identification from scRNA-seq data
2026-Aug-07, Computational biology and chemistry IF:2.6Q2
研究论文 提出一种基于拓扑学的框架,利用持续同调从单细胞RNA测序数据中识别稳健的癌症相关基因特征,超越传统基因选择方法 将持续同调引入基因特征识别,通过Vietoris-Rips过滤分析基因相关性拓扑结构,结合双阶段稳定性驱动分类策略,实现形状感知的生物学发现 摘要中未提及明确局限性 开发一种拓扑引导的框架,从scRNA-seq数据中提取结构不变且癌症相关的基因特征,提升生物标志物发现的准确性 乳腺癌和结直肠癌的单细胞RNA测序数据中的基因表达谱 机器学习 乳腺癌, 结直肠癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 持续同调(拓扑数据分析) 基因表达数据 摘要中未提及具体样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
2818 2026-08-12
Integrative multi-omics and experimental validation reveal the oncogenic role of DDX52 in liver hepatocellular carcinoma
2026-Aug-06, Molecular and cellular probes IF:2.3Q4
研究论文 综合多组学分析与实验验证揭示了DDX52在肝肝细胞癌中的致癌作用 首次系统分析DDX52在泛癌中的表达、预后、遗传改变及免疫微环境特征,并在肝肝细胞癌中结合单细胞测序、分子对接和实验验证其功能与治疗潜力 部分分析依赖公开数据库,缺乏体内实验验证,分子对接结果需进一步生物学验证 阐明DDX52在肝肝细胞癌中的表达、预后价值、免疫关联及致癌机制,评估其作为预后标志物和治疗靶点的潜力 DDX52基因及其在多种癌症,特别是肝肝细胞癌中的表达和相关细胞系HepG2和MHCC-97H 生物信息学、癌症基因组学 肝肝细胞癌 多组学分析(转录组、基因组)、单细胞测序、分子对接、细胞实验(siRNA沉默) NA 转录组数据、基因组数据、单细胞表达数据、药物敏感性数据 TCGA、GEO、HPA、SpatialTME数据库中的泛癌样本,及HepG2和MHCC-97H细胞系 NA 单细胞RNA测序 NA NA
2819 2026-08-12
Dual Lineage Tracing Identifies Cellular Mechanisms Underlying Radiation-Associated Changes in Atherosclerotic Lesion Composition
2026-Aug-06, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
研究论文 本研究利用双谱系追踪小鼠模型,探究辐射诱导的动脉粥样硬化斑块组成变化背后的细胞机制,发现平滑肌细胞和内皮细胞的差异化响应。 首次在同一病灶中同时进行平滑肌细胞和内皮细胞的谱系追踪,避免传统单谱系追踪可能导致的错误归属。 未明确提及具体限制,但可能包括小鼠模型与人类疾病的差异,以及辐射条件的特定性。 阐明辐射如何通过影响平滑肌细胞和内皮细胞的表型可塑性来改变动脉粥样硬化斑块的组成和稳定性。 双谱系追踪的Apoe缺陷小鼠的血管组织和动脉粥样硬化病灶。 生物医学研究 动脉粥样硬化 单细胞RNA测序 双谱系追踪小鼠模型 单细胞转录组数据、免疫染色图像 使用了双谱系追踪的Apoe缺陷小鼠,具体数量未在标题和摘要中提及。 NA NA NA NA
2820 2026-08-12
Sample Preparation for Imaging-Based Spatial Transcriptomics in Rigid Plant Tissues (Roots, Shoots)
2026-Aug-05, Bio-protocol IF:1.0Q3
研究论文 提出一种针对刚性植物组织(如水稻根)的基于成像的空间转录组学样本制备方案,确保组织处理、RNA完整性和空间结构保持,并包含样本附着测试。 优化了针对刚性植物组织的样本制备流程,包括组织固定、切片和附着测试,以确保高质量的空间转录组分析结果。 未提及具体局限性。 开发一种可靠且实用的样本制备方法,以支持刚性植物组织的空间转录组学研究。 刚性植物组织,特别是水稻根和茎。 空间转录组学 NA 成像-based空间转录组学 NA 图像 水稻根和茎样本,具体数量未提供。 NA 空间转录组学 商品化载玻片 未指定具体平台,但提及商业载玻片和探针杂交。
回到顶部