单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202601-202612] [清除筛选条件]
当前共找到 9441 篇文献,本页显示第 2781 - 2800 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
2781 2026-08-13
Single-cell transcriptomic analysis reveals age-related remodeling of brain endothelial cells
2026, Aging brain IF:1.7Q4
研究论文 利用单细胞RNA测序分析年轻和年老小鼠脑内皮细胞,揭示衰老导致的内皮细胞亚型分布、基因表达和代谢重塑,以及相关信号通路变化 首次通过单细胞转录组分析揭示脑内皮细胞在衰老过程中的亚型特异性重塑,包括亚型分布变化、代谢差异和独特的基因表达模式,并验证了关键标志物在人类脑组织中的保守性 研究主要基于小鼠模型,人类验证仅限于免疫组化,未深入探讨信号传导机制或因果关系 阐明衰老过程中脑内皮细胞和血管周细胞对血脑屏障完整性影响的分子机制 年轻和年老小鼠的脑内皮细胞(共68,316个细胞,表达15,564个基因)以及人类脑组织样本 单细胞转录组学 神经血管疾病 单细胞RNA测序 无监督聚类和注释 单细胞转录组数据 68,316个脑内皮细胞(来自年轻和年老小鼠)及人类脑组织样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
2782 2026-08-13
Integration of RNA-seq and scRNA-seq to investigate the role of cell cycle-related biomarkers in sepsis
2026, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 本研究通过整合RNA-seq和scRNA-seq数据,探讨了细胞周期相关生物标志物在脓毒症中的作用,并鉴定出四个关键的诊断标志物 首次将RNA-seq和scRNA-seq数据整合分析,结合机器学习算法筛选出四个细胞周期相关的脓毒症诊断生物标志物,并揭示了它们在单核细胞分化中的作用 研究主要基于计算分析和公共数据库数据,缺乏实验验证,且样本量可能有限 鉴定脓毒症中细胞周期相关的诊断生物标志物,并阐明其在免疫 dysfunction 中的作用 脓毒症患者和健康对照的转录组数据及单细胞RNA测序数据 机器学习 脓毒症 RNA-seq, scRNA-seq 机器学习算法 基因表达数据, 单细胞转录组数据 来自GEO数据库的多个转录组数据集,具体样本量未在摘要中说明 NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA NA
2783 2026-08-13
Immune Divergences Between the Skin Sensitizer 2,4-Dinitrochlorobenzene and the Respiratory Sensitizer Phthalic Anhydride Revealed by Mouse Single-Cell Transcriptomics
2026, Journal of immunology research IF:3.5Q2
研究论文 通过小鼠单细胞转录组学揭示了皮肤致敏剂2,4-二硝基氯苯和呼吸道致敏剂邻苯二甲酸酐之间的免疫差异 首次通过单细胞转录组学识别皮肤与呼吸道致敏剂特异性免疫特征,并发现树突状细胞对皮肤致敏剂的独特转录组签名及代谢转变 未明确说明局限性 区分皮肤和呼吸道致敏剂的免疫特征,以开发国际认可的鉴别方法 雌性BALB/c小鼠的耳廓淋巴结中的免疫细胞(包括B细胞、T细胞、树突状细胞等) 单细胞转录组学 化学诱导的过敏性反应 单细胞转录组学、流式细胞术、微球阵列细胞因子检测 NA 单细胞转录组数据、流式细胞数据、细胞因子浓度数据 小鼠耳廓淋巴结样本(具体数量未提供) NA 单细胞RNA测序、流式细胞术 NA NA
2784 2026-08-13
Revisiting TREM2: from multi-omics signaling networks to clinical translation
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
综述 本文全面综述了TREM2的生物学特性,包括其分子结构、信号通路以及在神经退行性疾病、癌症等多种疾病中的功能作用,并探讨了其临床转化前景。 整合了近期单细胞转录组学和代谢分析的新见解,并强调了TREM2在胶质母细胞瘤中的免疫保护作用及其与抗PD-1治疗的协同效应。 尽管有前景的发现,但理解TREM2在不同疾病中的复杂作用仍面临挑战,需要进一步阐明其精确机制并验证其治疗潜力。 全面概述TREM2的生物学,聚焦其分子结构、信号网络及在不同疾病背景下的功能,并探讨其作为治疗靶点的潜力。 TREM2受体及其在免疫细胞(如巨噬细胞、树突状细胞和小胶质细胞)中的作用。 多组学 神经退行性疾病、癌症、自身免疫性疾病 单细胞转录组学、代谢分析 NA NA NA NA 单细胞转录组学 NA NA
2785 2026-08-13
Global trends and hotspots of macrophage-related research in intervertebral disc degeneration from 2005 to 2025: a bibliometric and visualized analysis
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过文献计量学方法分析2005至2025年间巨噬细胞在椎间盘退变中作用的研究趋势与热点 首次对这一跨学科领域进行系统性文献计量分析,揭示研究前沿聚焦于单细胞测序、氧化应激、可注射水凝胶和组织再生 未提及具体局限性 阐明巨噬细胞参与椎间盘退变的研究现状、知识基础和研究前沿,为新型免疫疗法开发提供定量数据支持 2005至2025年间发表的550篇关于巨噬细胞在椎间盘退变中作用的文献 文献计量学 椎间盘退变 文献计量分析 NA 文献数据 550篇文献 NA NA NA NA
2786 2026-08-13
Single-cell transcriptional changes of artemisinin-sensitive K13C580 and artemisinin-resistant K13580Y Plasmodium falciparum upon dihydroartemisinin exposure
2026, Frontiers in cellular and infection microbiology IF:4.6Q1
研究论文 该研究利用单细胞RNA测序技术,比较了青蒿素敏感型K13C580和抗药型K13580Y恶性疟原虫在双氢青蒿素暴露后的转录变化,揭示了阶段特异性的应激反应差异,并确认GARP作为潜在治疗靶点。 首次将单细胞RNA测序与MELD框架相结合,对青蒿素抗性疟原虫的转录扰动进行高分辨率分析,并确认抗GARP抗体对抗药性寄生虫仍有疗效,提出新的干预靶点。 研究仅限于体外培养的等基因寄生虫系,未涵盖体内宿主因素;功能性验证仅限于GARP靶点,其他差异表达基因的生物学功能未做深入验证。 解析青蒿素部分抗性的分子机制,识别抗性相关的细胞通路及潜在治疗靶点。 恶性疟原虫的等基因系K13野生型(K13C580)和青蒿素抗性突变体(K13C580Y)。 单细胞组学 疟疾 单细胞RNA测序 计算框架MELD(流形增强潜在维度) 基因表达数据(单细胞转录组) 含两种寄生虫系(K13C580和K13C580Y)各经双氢青蒿素处理或未处理,未提供具体细胞数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
2787 2026-08-13
NECSO-based classification predicts immunotherapy efficacy and identifies FLAD1 as therapeutic target in kidney renal clear cell carcinoma
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
research paper 本研究构建了基于NECSO的分类系统来预测肾透明细胞癌的免疫治疗疗效,并鉴定FLAD1为治疗靶点 首次将NECSO相关基因用于肾透明细胞癌的亚型分类和预后模型构建,并发现FLAD1作为坏死-免疫轴的功能驱动因子 未提及 探索NECSO在肾透明细胞癌中的临床意义,并开发预测免疫治疗疗效的分类系统和预后模型 肾透明细胞癌患者及其肿瘤样本 机器学习 肾透明细胞癌 RNA-seq, 单细胞RNA测序 非负矩阵分解, 机器学习模型 转录组数据, 单细胞转录组数据 TCGA数据集及多个独立验证数据集,包括ICI治疗的KIRC患者队列、三个泛癌ICI队列、两个KIRC患者单细胞数据集和一个PD-1抑制剂治疗患者单细胞数据集 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
2788 2026-08-13
Molecular mechanisms of bacteria-mediated cancer immunotherapy: from intratumoral microbiota to engineered therapeutics
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
综述 本文综述了细菌介导的癌症免疫疗法(BCIT)的分子机制,包括瘤内菌群如何增强或抑制恶性肿瘤,以及利用合成生物学、单细胞测序和无菌动物模型等前沿工程技术将细菌改造为精准递送载体,并探讨了临床转化中的瓶颈和未来方向。 整合了从瘤内微生物群到工程化治疗药物的最新知识,提出了AI引导、微生物组整合的框架以加速临床转化,并讨论了将免疫学‘冷’肿瘤转化为‘热’肿瘤的概念框架。 临床转化面临安全性、药代动力学、监管科学和患者间异质性等挑战,且具体疗效和机制仍需进一步验证。 系统阐述细菌介导癌症免疫疗法的分子机制和工程策略,评估临床转化障碍,并展望未来研究方向。 瘤内细菌及其在癌症免疫治疗中的应用,包括细菌工程化改造和临床转化。 机器学习 多种癌症(未特指,文中提及其他领域,但重点为癌症) 合成生物学、单细胞测序、无菌动物模型 NA NA NA NA NA NA NA
2789 2026-08-13
Controllable diffusion-based generation for multi-channel biological data
2026, ... International Conference on Learning Representations
PMID:42583200
研究论文 本文提出一个统一的多通道扩散(MCD)框架,用于可控生成具有复杂通道间关系的结构化生物数据,并在空间蛋白质组学、临床影像和单细胞数据生成任务中取得最优性能 创新点包括层次化特征注入机制,实现多分辨率条件化到空间对齐的观测通道;以及两个互补的通道注意力模块,用于捕捉通道间关系并重新校准潜在特征;采用随机通道掩码策略训练,支持任意观测通道组合下的缺失通道重建 未明确提及局限性 开发一个统一的生成框架,联合建模空间结构和通道间依赖,并泛化到任意观测和缺失通道子集,用于生物数据的可控生成 多通道生物数据,包括成像质谱流式(IMC)和空间转录组学(ST)数据,以及单细胞数据集 机器学习 不适用 扩散模型 扩散模型 多通道生物数据(图像和基因表达数据) 未明确提及 不适用 不适用 不适用 不适用
2790 2026-08-13
Single-cell transcriptomic profiling identifies YY1 as a key regulator of fibroblast plasticity in hypertrophic scar formation
2026, Burns & trauma IF:6.3Q1
研究论文 通过单细胞转录组分析,识别出YY1作为肥大性瘢痕形成过程中成纤维细胞可塑性的关键调控因子 首次在肥大性瘢痕中鉴定出ADAM12+ COMP+ POSTNhi的Fib_5成纤维细胞亚群,并揭示YY1通过表观遗传调控成纤维细胞可塑性 文章未提及明确局限性 识别肥大性瘢痕中的关键成纤维细胞亚群及其调控转录因子,以填补转化医学空白 人类肥大性瘢痕和正常皮肤组织中的真皮细胞 单细胞转录组学 肥大性瘢痕 单细胞RNA测序、批量RNA测序、CUT&Tag、western blotting、免疫荧光 Seurat、Scissor 基因表达数据、表观遗传数据 43,303个细胞(人类HTS和NS组织),21个公共数据集样本 NA 单细胞RNA测序、批量RNA测序、CUT&Tag NA NA
2791 2026-08-13
Risk factors associated with meiotic errors in blastocysts with mosaic results on biopsy
2026, Human reproduction open IF:8.3Q1
研究论文 本研究通过回顾性队列和前瞻性研究,分析了391个嵌合体活检结果的囊胚中的减数分裂错误及相关风险因素,并比较了嵌合体胚胎移植与整倍体胚胎移植的妊娠结局。 建立了基于SNP的嵌合体量化平台,并通过单细胞DNA测序验证了高比例嵌合体的实际嵌合水平,揭示了减数分裂错误与高龄产妇、高比例嵌合和母源嵌合显著相关。 PGT-AO平台中固有的技术噪声难以与真实嵌合体完全区分;嵌合体胚胎移植队列样本量有限,产前/产后遗传验证的病例较少;单细胞研究中验证的胚胎数量较少,且CNV检测阈值为10 Mb,可能低估小于10 Mb的CNV。 探讨嵌合体活检结果的囊胚中减数分裂错误的风险因素及PGT-AO的临床应用价值。 391个嵌合体活检结果的囊胚,以及7个捐赠的囊胚。 数字病理 生殖遗传疾病 SNP阵列、单细胞DNA测序、FISH 多变量逻辑回归 基因组数据 391个嵌合体囊胚、288个匹配整倍体胚胎、7个捐赠囊胚(314个细胞) NA NA NA NA
2792 2026-08-12
ConMGIN: Interpretable multilayer GIN-Bayesian framework for spatial domain analysis
2026-Nov, Neural networks : the official journal of the International Neural Network Society IF:6.0Q1
研究论文 提出ConMGIN,一种结合图同构网络与混合贝叶斯网络的图表示学习模型,用于空间转录组数据的空间域识别 创新性地引入基于切比雪夫距离的图构建方法,强调最大坐标偏差以形成更稳健的邻域连接,增强边界清晰度,并集成混合贝叶斯网络以更好建模空间异质性 未提及局限性 解决空间转录组中空间域识别对空间异质性信息利用不足的问题 多个空间转录组数据集,涵盖不同平台和空间分辨率 生物信息学 NA 空间转录组测序 图同构网络(GIN)、混合贝叶斯网络 空间转录组数据 多个数据集,具体数量未提及 NA 空间转录组学 NA NA
2793 2026-08-12
Single-cell analysis identifies a type I interferon-associated neutrophil signature in bacterial meningitis
2026-Sep, Journal of neuroimmunology IF:2.9Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析,绘制了细菌性脑膜炎小鼠模型中脑膜免疫细胞的转录组图谱,并发现中性粒细胞呈现I型干扰素相关特征 首次通过单细胞转录组分析揭示细菌性脑膜炎中中性粒细胞的特异性转录特征,即干扰素刺激基因表达升高和代谢基因程序下调,并预测其通过趋化因子介导的途径参与脑膜免疫网络 研究主要基于公共数据库的scRNA-seq数据,缺乏体外或体内功能验证实验,且样本量有限 探究细菌性脑膜炎中中性粒细胞的转录组特征及其在疾病发病机制中的作用 小鼠细菌性脑膜炎模型中的脑膜免疫细胞,特别是中性粒细胞 单细胞转录组学 细菌性脑膜炎 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA 公共数据库GSE221681中的scRNA-seq数据
2794 2026-08-12
Pharmacological activation of NO-cGMP signalling attenuates metabolic dysfunction-associated steatohepatitis
2026-Sep, British journal of pharmacology IF:6.8Q1
研究论文 该研究探讨了药理学激活NO-cGMP信号通路对代谢功能障碍相关脂肪性肝炎(MASH)的影响,发现该通路可调节肝星状细胞活化并减缓疾病进展 首次使用转基因cGMP传感器小鼠在活体HSCs中监测NO诱导的cGMP,并利用HSC特异性cGKI敲除模型及BAY-543激活剂证明NO-GC激活剂可作为MASH治疗策略 摘要中未明确提及研究的局限性 探究NO-cGMP信号通路在MASH进展中对肝星状细胞活化和纤维化的调节作用,并评估药理学激活该通路的治疗潜力 肝星状细胞(HSCs)、MASH小鼠模型(ApoE缺陷小鼠)、人肝组织样本 数字病理学、分子生物学 代谢功能障碍相关脂肪性肝炎(MASH) scRNA-seq、转基因小鼠模型、药理学激活 NA 基因表达数据、组织图像 未明确样本数量,但包括转基因小鼠、ApoE缺陷小鼠、人肝组织 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA NA
2795 2026-08-12
A single-cell transcriptomic atlas of peripheral blood immune cells spanning progressive canine leishmaniosis
2026-Aug-21, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本研究构建了跨越犬利什曼病不同进展阶段的外周血免疫细胞单细胞转录组图谱 首次绘制了从亚临床到终末期的犬利什曼病外周血免疫细胞单细胞图谱,揭示了淋巴向髓系主导的免疫景观转变和T细胞耗竭等新机制 未提供具体局限性信息 阐明犬利什曼病从亚临床阶段到终末期进展的免疫机制 未感染和自然感染的犬只,涵盖不同疾病阶段的外周血免疫细胞 单细胞转录组学 犬利什曼病 单细胞RNA测序 NA 单细胞基因表达数据 未提供具体样本数量 未提供信息 单细胞RNA测序 未提供信息 未提供信息
2796 2026-08-12
Precision omic portrait deciphers the epigenetic variable during cellular identity reshaping of metastatic head and neck squamous cell carcinoma
2026-Aug-15, Science bulletin IF:18.8Q1
研究论文 本研究整合单细胞RNA测序数据描绘头颈鳞状细胞癌转移的泛转移细胞图谱,发现WDR54通过表观遗传修饰启动部分上皮-间质转化并促进转移 首次揭示WDR54作为表观遗传调控因子,通过选择性H3K4me3和H4K16ac修饰启动TGF-β驱动的部分上皮-间质转化程序,从而重塑细胞身份并促进转移 NA 阐明头颈鳞状细胞癌转移过程中细胞身份可塑性的表观遗传机制 头颈鳞状细胞癌的原发灶、淋巴转移灶和远处转移灶样本 单细胞组学 头颈鳞状细胞癌 单细胞RNA测序、CUT&Tag、蛋白质结构比对、功能实验 NA 单细胞转录组数据、表观遗传数据 12个原发灶、12个淋巴转移灶和12个远处转移灶 10x Genomics 单细胞RNA测序、CUT&Tag 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序及CUT&Tag分析
2797 2026-08-12
Single-Cell Analysis Reveals the Soft Tissue Structure Heterogeneity Aggravates Peri-Implantitis Through MDK Signaling
2026-Aug-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2
研究论文 通过单细胞RNA测序分析种植体周围炎与牙周炎软组织异质性,揭示MDK信号通路在种植体周围炎发病机制中的作用 首次通过单细胞转录组学系统比较种植体周围炎与牙周炎的软组织结构异质性,发现MDK-NCL通路介导上皮细胞与基质细胞通讯抑制,为种植体周围炎的早期靶向干预提供分子依据 样本量有限且仅基于体外过表达实验验证MDK功能,缺乏体内功能验证及长期临床随访数据 阐明种植体周围炎与牙周炎在软组织结构及分子机制上的差异,揭示种植体周围炎发病的关键分子通路 种植体周围炎和牙周炎患者的牙龈软组织样本 单细胞转录组学 种植体周围炎 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 未明确说明具体样本量 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'转录组测序平台
2798 2026-08-12
CPTCs Drive Somatic-Visceral Communication via the Wnt Axis in Somatic Mechanotherapy: A Single-Cell Deep Learning Study
2026-Aug-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2
研究论文 通过单细胞深度学习框架识别CD34PDGFRα端粒细胞作为体细胞机械疗法中驱动躯体-内脏通信的关键细胞,并揭示其通过Wnt轴促进内脏修复的机制 首次提出CPTC驱动的机械共振轴,并通过自解释深度学习框架CARSS识别CPTCs为体细胞机械刺激的主要机械感受器 未提及 阐明体细胞机械刺激(如针灸)如何通过细胞桥梁转化为内脏修复信号的机制 CD34PDGFRα端粒细胞(CPTCs)以及细菌性结肠炎中的筋膜和结肠组织 机器学习 溃疡性结肠炎 单细胞RNA测序 自解释深度学习框架CARSS 单细胞转录组数据 未提及 NA 单细胞RNA测序 NA NA
2799 2026-08-12
Mechanochemical endothelial-astrocyte signalling via Piezo1-Epac1 drives neurovascular injury after stroke
2026-Aug-11, Brain : a journal of neurology IF:10.6Q1
研究论文 本研究揭示了卒中再灌注后内皮细胞Piezo1通过微囊泡cAMP-Epac1信号传导至星形胶质细胞,驱动神经血管损伤的机械化学级联机制 首次阐明内皮细胞Piezo1作为机械传感器,将再灌注后的血流扰动和组织硬化转化为cAMP富集的微囊泡信号,特异性地传递给邻近星形胶质细胞并激活Epac1,从而诱导细胞凋亡 摘要中未提及研究的局限性 探究卒中再灌注期间神经血管内皮如何感知和响应机械力变化,以及这些物理线索如何驱动病理损伤 小鼠卒中模型中的脑血管内皮细胞、星形胶质细胞和小胶质细胞 神经科学、分子生物学 缺血性卒中 单细胞转录组学、电子显微镜、生化分析、条件性基因敲除、近红外二区成像、原子力显微镜、光纤光度测定 条件性基因敲除小鼠模型 转录组数据、图像、生化数据 使用小鼠模型,具体样本数量未在摘要中提及 NA 单细胞转录组学 NA NA
2800 2026-08-12
Spatial and single-nuclei transcriptomics reveals idiosyncratic and generic patterns in papillary and anaplastic thyroid cancers
2026-Aug-11, Molecular oncology IF:5.0Q1
研究论文 本研究利用单核RNA测序和空间转录组学技术,揭示了乳头状和间变性甲状腺癌中特异性和通用性的转录模式。 首次通过实验设计区分生物学和技术变异,发现肿瘤细胞及多种免疫细胞类型的转录变异多为肿瘤特异性,且这种特性常被批量整合方法掩盖,并提出基于分化标志物表达顺序的新分类方法。 未在摘要中明确提及局限性。 探究乳头状甲状腺癌(PTC)和间变性甲状腺癌(ATC)的肿瘤异质性,并识别亚型特异性和通用的转录特征。 BRAF突变乳头状甲状腺癌(PTC)和间变性甲状腺癌(ATC)患者组织样本。 基因组学、转录组学 甲状腺癌 单核RNA测序(snRNA-seq)、空间转录组学 NA 基因表达数据、空间转录组数据 未在摘要中明确样本数量。 NA 单核RNA测序、空间转录组学 NA NA
回到顶部