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当前共找到 3608 篇文献,本页显示第 261 - 280 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
261 2026-03-25
Novel protein biomarkers for risk stratification and personalized medicine
2026-Mar-24, Nephrology, dialysis, transplantation : official publication of the European Dialysis and Transplant Association - European Renal Association
研究论文 本研究探讨了尿液簇集蛋白和表皮生长因子作为反映肾小管损伤与修复的药效学生物标志物,在慢性肾脏病中分别对应内皮素受体拮抗剂和钠-葡萄糖协同转运蛋白2抑制剂的治疗反应 首次将尿液簇集蛋白和表皮生长因子作为机制导向的药效学生物标志物,分别用于评估内皮素受体拮抗剂和钠-葡萄糖协同转运蛋白2抑制剂在慢性肾脏病中的治疗反应,并揭示了其与不同病因、糖尿病状态及血糖控制的异质性关联 研究基于两个独立的临床试验人群,可能存在队列特异性偏差;生物标志物的长期预后价值及临床转化应用仍需进一步验证 评估尿液簇集蛋白和表皮生长因子作为慢性肾脏病治疗中机制特异性药效学生物标志物的可行性 慢性肾脏病患者 临床医学 慢性肾脏病 单细胞RNA测序 NA 尿液生物标志物测量数据、血清生物标志物数据、单细胞RNA测序数据 来自SONAR和DAPA-CKD两个随机临床试验的人群 NA 单细胞RNA-seq NA NA
262 2026-03-25
Same-Slide Spatial Multi-Omics Integration with IN-DEPTH Reveals Tumor Virus-Linked Spatial Reorganization of the Tumor Microenvironment
2026-Mar-24, Cancer discovery IF:29.7Q1
研究论文 本文介绍了一种名为IN-DEPTH的流程,用于在同一玻片上整合空间转录组学和蛋白质组学数据,以揭示肿瘤微环境中的空间重组机制 开发了IN-DEPTH工作流,实现单细胞空间蛋白质组学成像引导的转录组捕获,避免了RNA信号损失,并提出了SGCC框架用于整合多模态数据 未明确提及具体的技术限制或样本量不足等问题 旨在开发一种可扩展的空间多组学方法,以揭示临床相关的肿瘤微环境机制并支持空间多模态AI模型构建 弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)组织,包括EBV阳性和EBV阴性肿瘤样本 数字病理学 淋巴瘤 空间转录组学,空间蛋白质组学,单细胞成像 NA 图像,转录组数据,蛋白质组数据 NA NA 单细胞空间蛋白质组学,空间转录组学 NA NA
263 2026-03-25
spRefine denoises and imputes spatial transcriptomic data with a reference-free framework powered by genomic language model
2026-Mar-23, Genome research IF:6.2Q1
研究论文 本文提出了一种名为spRefine的深度学习框架,利用基因组语言模型对空间转录组数据进行联合去噪和插补 开发了一个无参考框架,利用基因组语言模型联合处理空间转录组数据的噪声和缺失值问题,并展示了其在数据整合、模型预训练及发现新生物学信号方面的优势 未明确提及具体局限性 解决空间转录组数据中高噪声水平和基因测量缺失的问题,以提高数据质量和下游分析效果 空间转录组数据 计算生物学/生物信息学 NA 空间转录组学 深度学习框架,基因组语言模型 空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
264 2026-03-25
FTO-CHRM3 axis regulates multiple myeloma progression: a machine learning-based identification
2026-Mar-23, Annals of hematology IF:3.0Q2
研究论文 本研究通过机器学习方法识别FTO-CHRM3轴在多发性骨髓瘤进展中的作用机制 首次结合机器学习、相关性分析和单细胞RNA测序技术系统性地鉴定FTO相关基因,并揭示FTO-CHRM3轴通过钙信号通路调控多发性骨髓瘤进展的新机制 研究主要基于生物信息学分析和初步实验验证,缺乏深入的体内外功能实验验证机制 探究FTO在多发性骨髓瘤进展中的作用机制,并识别关键调控轴 多发性骨髓瘤组织和相关基因表达数据 机器学习 多发性骨髓瘤 单细胞RNA测序,免疫组织化学,免疫浸润分析 机器学习模型 基因表达数据,单细胞RNA测序数据,免疫组织化学图像 未明确说明具体样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
265 2026-03-25
CX3CL1-CX3CR1 signaling orchestrates malignant progression of prostate cancer through luminal progenitor-macrophage crosstalk
2026-Mar-23, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
研究论文 本研究揭示了CX3CL1-CX3CR1信号轴在前列腺癌恶性进展中,通过管腔祖细胞与肿瘤相关巨噬细胞的相互作用,驱动免疫抑制和癌症干细胞样细胞扩增的关键机制 通过整合单细胞转录组学和基因工程小鼠模型,首次明确了CX3CL1-CX3CR1轴在管腔祖细胞与肿瘤相关巨噬细胞间互促恶性循环中的核心作用,并证明靶向该轴可抑制肿瘤进展 研究主要基于小鼠模型,其结论在人类前列腺癌中的普适性仍需进一步验证 旨在识别驱动去势抵抗性前列腺癌进展和治疗抵抗的肿瘤微环境中关键细胞间信号轴 前列腺癌肿瘤微环境中的管腔祖细胞和肿瘤相关巨噬细胞 数字病理学 前列腺癌 单细胞转录组学 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
266 2026-03-25
Integrated single-cell and spatial mapping coupled with machine learning unveils core stemness landscapes and regulatory drivers in triple-negative breast cancer
2026-Mar-23, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和大规模转录组数据,结合机器学习方法,揭示了三阴性乳腺癌中的核心干性景观和调控驱动因子 首次结合单细胞RNA测序、空间转录组学和机器学习算法,识别高干性细胞群体并构建基于XGBoost的风险预测模型,同时利用虚拟敲除实验验证核心基因在干性维持中的作用 未明确提及样本量或实验验证的局限性,可能缺乏大规模临床队列验证 阐明三阴性乳腺癌中癌症干细胞相关的干性特征与肿瘤进展之间的分子调控机制 三阴性乳腺癌细胞,特别是癌症干细胞群体 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序,空间转录组学,bulk转录组测序 XGBoost, hdWGCNA, Monocle3, scTour, CellChat, SHAP, scTenifoldKnk 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据,bulk转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq NA NA
267 2026-03-25
Reduced cartilage matrix stiffness in temporomandibular joint osteoarthritis impairs the functions of superficial zone chondrocytes via downregulation of CREB5-PLPP3 signaling
2026-Mar-23, Molecular biomedicine IF:6.3Q1
研究论文 本研究揭示了颞下颌关节骨关节炎中软骨基质硬度降低通过下调CREB5-PLPP3信号通路损害浅层区软骨细胞功能 首次阐明软化细胞外基质通过CREB5-PLPP3信号通路损害浅层区软骨细胞功能的分子机制 研究主要基于动物模型和体外实验,人类样本验证有限 探究颞下颌关节骨关节炎中软骨基质硬度变化对浅层区软骨细胞功能的影响机制 颞下颌关节浅层区软骨细胞 骨关节炎研究 颞下颌关节骨关节炎 单细胞RNA测序,mRNA测序 NA 基因表达数据 患者样本和大鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
268 2026-03-25
DyGFormer:Transformer With Resistance-Distance Bias for Semi-Supervised Cell-Type Identification
2026-Mar-23, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
研究论文 本文提出了一种名为DyGFormer的半监督模型,用于单细胞空间转录组数据中的细胞类型识别,该模型通过结合几何空间先验、自注意力机制和基于电阻距离的位置偏置来提升分类性能 提出了DyGFormer模型,该模型引入了基于电阻距离的相对位置偏置、邻居交互历史编码器以及基于三元组的度量监督,能够自适应学习细胞间连接权重并稳定跨层邻居交互 未在摘要中明确说明 开发一种半监督学习方法,以克服单细胞空间转录组数据中存在的测序噪声、平台异质性、标签覆盖不均和标注预算有限等障碍,实现准确的细胞类型识别 单细胞空间转录组数据 数字病理学 癌症 单细胞空间转录组学 Transformer 空间转录组数据 多个单细胞分辨率空间数据集(如NanoString/CosMx和MERFISH) NanoString, MERFISH 空间转录组学 CosMx, MERFISH NA
269 2026-03-25
Single-cell transcriptomics reveals a new marine parasite: Characterization and distribution of Rozellomyces from the Gulf of Alaska
2026-Mar-23, Mycologia IF:2.6Q2
研究论文 本文通过单细胞转录组学在阿拉斯加湾发现并描述了一种新的海洋寄生虫Rozellomyces,揭示了其在生态系统中的多样性和分布 首次利用单细胞转录组学技术从阿拉斯加湾分离并鉴定出一种新的Rozellomycota门寄生虫,建立了新属,并基于宏数据库分析其地理分布 研究仅基于单一分离株,可能未完全代表该寄生虫的多样性;地理分布分析依赖于数据库中的ASV数据,可能存在偏差 探索海洋生态系统中寄生虫的多样性、分布及其生态角色,特别是针对Rozellomycota门这一研究不足的谱系 从阿拉斯加湾分离的Rozellomycota门寄生虫(新属Rozellomyces)及其宿主硅藻 微生物学 NA 单细胞转录组学,系统基因组学分析(基于238个基因),扩增子序列变异(ASV)分析 NA 转录组数据,序列数据 单一分离株(来自阿拉斯加湾),结合metaPR数据库中的ASV数据 NA NA NA NA
270 2026-03-25
Multiomic characterisation of the clinical efficacy of guselkumab induction therapy in ulcerative colitis
2026-Mar-23, BMJ open gastroenterology IF:3.3Q2
研究论文 本文详细评估了古塞奇尤单抗治疗中重度活动性溃疡性结肠炎患者的细胞和分子变化 首次描述了通过抑制IL-23p19亚基实现临床疗效的分子变化,并整合了多组学数据(包括bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq和血清蛋白质组学)来全面分析治疗反应 研究样本量相对有限(单细胞RNA-seq仅52例),且仅关注诱导治疗阶段(至第12周),缺乏长期随访数据 评估古塞奇尤单抗在溃疡性结肠炎治疗中的临床疗效及其分子机制 中重度活动性溃疡性结肠炎患者 数字病理学 溃疡性结肠炎 bulk RNA测序、单细胞RNA测序、流式细胞术、血清蛋白质组学分析 NA RNA测序数据、蛋白质组学数据、流式细胞术数据 313名患者参与随机分组,其中257例进行bulk RNA-seq,52例进行单细胞RNA-seq,30例进行流式细胞术分析,302例进行血清蛋白质组学分析 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, 蛋白质组学 NA NA
271 2026-03-25
Dynamic changes of the immune microenvironment in ovarian cancer following neoadjuvant chemotherapy
2026-Mar-23, Cell death discovery IF:6.1Q1
研究论文 本研究通过分析单细胞RNA测序数据并结合体外和体内实验,揭示了卵巢癌新辅助化疗后前列腺素介导的免疫抑制微环境形成是化疗耐药的关键机制 首次系统揭示了前列腺素在卵巢癌新辅助化疗后免疫抑制微环境形成中的核心作用,并验证了联合使用顺铂和前列腺素特异性抑制剂可恢复CD8T细胞功能并提高疗效 研究主要基于已发表的单细胞测序数据,临床样本验证和前瞻性临床试验数据尚待补充 探索卵巢癌新辅助化疗后肿瘤微环境的动态变化及化疗耐药机制 高级别浆液性卵巢癌患者样本、卵巢癌细胞系及动物模型 单细胞组学 卵巢癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 基于已发表的高级别浆液性卵巢癌患者单细胞RNA测序数据 NA 单细胞RNA-seq NA NA
272 2026-03-25
Visinin-like protein 1 disrupts calcium homeostasis and promotes atrial fibrillation in human and rodent models
2026-Mar-23, Signal transduction and targeted therapy IF:40.8Q1
研究论文 本研究整合了人类心房颤动患者和啮齿动物模型的转录组学与电生理学数据,揭示了视锥蛋白样蛋白1通过破坏钙稳态促进心房颤动的机制,并验证了其作为治疗靶点的潜力 首次在心肌细胞中鉴定出VILIP-1是心房颤动中钙稳态失调的关键上游调节因子,并发现其通过依赖豆蔻酰化的运输机制增加NCX-1膜表达,从而驱动心律失常 研究主要基于动物模型和体外机制验证,在人类患者中的直接干预效果和长期安全性仍需进一步临床试验确认 探究VILIP-1在心房颤动发生发展中的作用机制,并寻找潜在的治疗靶点 人类心房颤动患者的心房组织、起搏诱导的大鼠心房颤动模型、心房心肌细胞 心血管疾病研究 心房颤动 bulk RNA测序、单细胞转录组学、电生理学分析 NA 转录组数据、电生理记录数据 人类AF患者和啮齿动物AF模型(具体数量未明确说明) NA bulk RNA-seq, single-cell transcriptomics NA NA
273 2026-03-25
Giant cell tumor of bone inhibits osteoblastogenesis via WNT5B
2026-Mar-23, Journal of bone and mineral metabolism IF:2.4Q3
研究论文 本研究揭示了骨巨细胞瘤通过表达WNT5B抑制成骨细胞生成,从而拮抗骨形成 首次发现骨巨细胞瘤通过WNT5B抑制成骨细胞分化,扩展了对该肿瘤骨破坏机制的理解 研究主要基于体外细胞系实验,缺乏体内验证;样本来源有限,仅使用单一细胞系 探究骨巨细胞瘤对骨形成的影响机制 人骨巨细胞瘤细胞系(NCC-GCTB1-C1)和人脂肪来源干细胞(ADSCs) 数字病理学 骨巨细胞瘤 单细胞RNA测序,空间转录组分析,CRISPR/Cas9基因敲除 NA RNA测序数据,空间转录组数据 使用人骨巨细胞瘤细胞系和人脂肪来源干细胞进行共培养实验 10x Genomics 单细胞RNA-seq,空间转录组学 10x Visium 10x Visium FFPE(针对骨巨细胞瘤石蜡切片进行空间转录组分析)
274 2026-03-25
Tissue-restricted secondary TCR engagement drives the transition from stem-like to CD200+ Egr2hi arthritogenic Th17 cells
2026-Mar-23, Nature immunology IF:27.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和T细胞受体分析,揭示了关节炎致病性T17细胞的异质性及其向高度致病状态转变的关键调控机制 首次发现关节组织中限制性的次级TCR信号是驱动T17细胞从干细胞样状态向CD200+ Egr2hi高度致病状态选择性转变的关键决定因素,而非炎症信号的默认进程 研究基于小鼠自身免疫性关节炎模型,其在人体中的普适性仍需验证 探究自身免疫性关节炎中致病性T17细胞的异质性、发育轨迹及其增强致病性的机制 关节组织中的CD4 T细胞,特别是白介素-17产生的辅助T细胞和调节性T细胞 单细胞组学 自身免疫性关节炎 单细胞RNA测序,谱系追踪,T细胞受体库分析 NA 单细胞转录组数据,TCR序列数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
275 2026-03-25
Chemokine-defined macrophage niches establish spatial organization of tumor immunity
2026-Mar-23, Nature immunology IF:27.7Q1
研究论文 本研究揭示了肺癌中巨噬细胞亚群的空间组织和功能分工,通过单细胞和空间转录组学技术,识别了表达趋化因子的巨噬细胞亚群及其在肿瘤免疫调控中的作用 首次阐明了组织驻留CD206和CD206间质巨噬细胞亚群与招募巨噬细胞在肺癌中的分工,并发现趋化因子表达巨噬细胞亚群在空间定位和功能上的对立作用,为靶向巨噬细胞的免疫治疗提供了新策略 研究主要聚焦于肺癌模型,结果在其他肿瘤类型中的普适性有待验证,且单细胞和空间转录组学技术可能受限于样本处理和测序深度 探究巨噬细胞谱系和空间组织如何塑造抗肿瘤免疫,以开发增强免疫治疗效果的策略 肺癌中的巨噬细胞亚群,包括组织驻留CD206和CD206间质巨噬细胞、Ly6c2Fn1Vcan招募巨噬细胞,以及单核来源树突状细胞 单细胞转录组学 肺癌 单细胞转录组学, 空间转录组学 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
276 2026-03-25
kUncited referencesCo-localization analysis of spatial transcriptomics in ligand-receptor pairs from tumor microenvironment
2026-Mar-21, Critical reviews in oncology/hematology
综述 本文综述了基于空间转录组学的共定位分析在肿瘤微环境中配体-受体对研究中的应用、计算方法和未来前景 系统性地整合了空间原位信息以提升配体-受体对分析的准确性,并探讨了人工智能技术在该领域的应用潜力 作为一篇综述文章,未提出新的实验方法或模型,主要基于现有文献进行总结和展望 探讨空间转录组学共定位分析在识别肿瘤微环境中细胞间相互作用(特别是配体-受体对)中的应用价值 肿瘤微环境中的细胞间相互作用及配体-受体对 空间转录组学 肿瘤 空间转录组学 NA 空间基因表达数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
277 2026-03-25
Human Single-cell Atlas Analysis Reveals Heterogeneous Endothelial Signaling
2026-Mar-20, Genomics, proteomics & bioinformatics
研究论文 本研究通过整合超过三百万个单细胞RNA-seq数据,系统分析了15种人体组织中内皮细胞的异质性及其在细胞间通讯中的作用 首次在血管类型和组织微环境的双重背景下,系统研究内皮细胞异质性,并利用主题建模识别了组织特异性的细胞间通讯模式 研究依赖于现有单细胞RNA-seq数据集,可能受数据质量和覆盖范围的限制,且未进行实验验证 探究内皮细胞在不同组织和血管类型中的异质性及其微环境调控机制 人体15种组织中的内皮细胞 单细胞组学 NA 单细胞RNA-seq 主题建模 单细胞RNA-seq数据 超过三百万个单细胞,来自15种人体组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
278 2026-03-25
Gene regulatory network determinants of rapid recall in human memory CD4+ T cells
2026-Mar-20, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本文利用单核多组学测序技术,研究了人类记忆CD4+ T细胞快速回忆反应的基因调控网络机制 首次结合单核多组学测序(基因表达与染色质可及性)来动态分析CD4 T细胞激活响应,并识别出记忆相关转录因子(如MAF、PRDM1、RUNX2、SMAD3和KLF6)在快速回忆中的调控作用 未在摘要中明确提及具体局限性 探究人类记忆CD4+ T细胞快速回忆反应的基因调控网络决定因素 人类记忆CD4+ T细胞 单细胞组学 免疫介导疾病 单核多组学测序(基因表达与染色质可及性)、染色质免疫沉淀测序、单细胞RNA测序 基因调控网络重建 单细胞多组学数据 NA NA 单核多组学测序, 单细胞RNA测序 NA NA
279 2026-03-25
Single-cell RNA sequencing reveals the characteristics of porcine viral diseases, development, and immune repertoires: Current status and challenges
2026-Mar-20, Infection, genetics and evolution : journal of molecular epidemiology and evolutionary genetics in infectious diseases
综述 本文系统综述了单细胞RNA测序技术在猪研究中的应用进展,包括解码疾病机制、探索发育生物学和分析免疫学特征,并讨论了该技术面临的挑战与未来应用前景 首次系统性地从疾病机制、发育生物学和免疫学特征三个维度综述了scRNA-seq技术在猪研究中的应用,并分析了该领域特有的技术挑战(如猪参考基因组注释不完整) 本文为综述文章,未涉及原始实验数据;技术挑战部分主要基于现有文献分析,未提出具体解决方案 总结scRNA-seq技术在猪病毒性疾病、发育和免疫研究中的应用现状,分析技术挑战并展望未来应用前景 猪(作为农业经济动物和人类疾病模型) 单细胞组学 病毒性疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
280 2026-03-25
Heterogeneity of lymphoid cells in PBMCs in the acute phase of SFTS: Single-cell transcriptome profiling
2026-Mar-19, Journal of biomedical research IF:2.2Q3
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序和生物信息学分析,探讨了SFTS急性期淋巴细胞功能异常的机制以及糖皮质激素治疗对淋巴样细胞的影响 首次在SFTS急性期患者中应用单细胞转录组测序技术,系统性地揭示了淋巴样细胞的异质性及其在疾病进程中的作用,并评估了糖皮质激素治疗的免疫调节效果 样本量较小(仅16名参与者),且研究设计为观察性,未能进行随机对照试验以验证糖皮质激素治疗的最佳方案 阐明SFTS急性期免疫功能障碍的机制,并评估糖皮质激素治疗对淋巴样细胞功能的影响 健康志愿者和急性SFTS患者的外周血单个核细胞中的淋巴样细胞 数字病理学 病毒感染性疾病 单细胞RNA测序,生物信息学分析 NA 单细胞转录组数据 16名参与者(3名健康志愿者和13名急性SFTS患者) NA 单细胞RNA-seq NA 捕获mRNA的3'端转录本
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