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当前共找到 9441 篇文献，本页显示第 2761 - 2780 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2761 | 2026-08-13 |
CIITA/PRMT5 promote CD4+Gzma+ T cell activation via H3R2me2-mediated endothelial expression of MHC class II in smoking-induced atherosclerosis
2026-Jun-03, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-026-04975-w
PMID:42237295
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序等技术，揭示了吸烟通过CIITA/PRMT5介导的内皮细胞MHC II表达激活CD4+Gzma+ T细胞，进而促进动脉粥样硬化进展的免疫机制 | 首次阐明CIITA与PRMT5相互作用通过H3R2对称二甲基化修饰调控内皮细胞MHC II表达，进而激活CD4+Gzma+ T细胞在吸烟相关动脉粥样硬化中的作用 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，需进一步在人类样本中验证；具体信号通路细节及临床干预效果需深入探索 | 探究吸烟诱导动脉粥样硬化进展中CD4+Gzma+ T细胞活化的免疫机制及潜在治疗靶点 | ApoE敲除小鼠、小鼠动脉内皮细胞、人冠状动脉内皮细胞、CD4+Gzma+ T细胞 | 免疫学 | 动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序、质谱分析、免疫共沉淀、基因敲除/敲低 | NA | 单细胞转录组数据、蛋白质互作数据 | 小鼠模型及体外培养细胞，具体数量未在摘要中提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium 单细胞3'转录组测序 |
| 2762 | 2026-08-13 |
Cell trajectory inference based on schrödinger problem and a mechanistic model of stochastic gene expression
2026-May-21, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-026-00743-x
PMID:42168225
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研究论文 | 本文通过将薛定谔问题与随机基因表达的突发模型相结合，提出了一种基于突发性参考过程的细胞轨迹推断方法，以提高从时间标记的单细胞RNA测序数据中推断细胞分化轨迹的准确性 | 创新性地将突发性基因表达模型作为薛定谔问题的参考过程，替代传统的扩散过程，从而更准确地模拟真实基因动态，提升细胞轨迹推断的可靠性 | 研究主要基于模拟和假设条件，未在真实生物学数据上进行验证，且模型可能对参数选择敏感 | 旨在改进从时间标记的单细胞RNA测序数据中推断细胞分化轨迹的方法，通过引入更符合实际基因表达的参考模型提高推断精度 | 单细胞RNA测序数据中的细胞分化轨迹 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | Schrödinger桥模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2763 | 2026-08-13 |
Transcriptome graph transformer: a graph transformer-based unsupervised model for transcriptome data analysis
2026-May-21, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-026-06458-4
PMID:42168843
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研究论文 | 该文介绍了一种基于图变换器的无监督模型TGT，用于整合基因表达和生物学网络信息进行转录组数据分析，并在多种疾病数据集上展现出优越性能 | 提出了一个无监督图变换器框架，能处理异质性基因-通路图，并通过掩码节点预测进行预训练，支持疾病分类、生物标志物发现和零样本聚类 | 摘要中未提及研究局限性 | 开发一种能整合生物学网络信息、处理高维异质性转录组数据的通用分析方法 | 多个转录组数据集，包括阿尔茨海默病、癌症、急性肾损伤和COVID-19相关数据，以及单细胞和空间转录组数据 | 机器学习 | 阿尔茨海默病, 癌症, 急性肾损伤, COVID-19 | 转录组测序（RNA-seq）、单细胞RNA-seq、空间转录组测序 | 图变换器（Graph Transformer） | 基因表达数据、生物网络数据（STRING相互作用、通路注释） | 未提供具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组测序, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 2764 | 2026-08-13 |
MTFR2 promotes VDAC1 oligomerization to reprogram BCAA metabolism in tumor cells to polarize TAMs in LUAD
2026-May-20, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08871-2
PMID:42161922
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研究论文 | 该研究揭示了MTFR2通过促进VDAC1寡聚化重编程肿瘤细胞BCAA代谢，进而极化肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）促进肺腺癌（LUAD）进展的机制 | 首次阐明MTFR2与VDAC1的β8链Leu125位点结合并促进其寡聚化，导致mtDNA释放激活TLR9-NF-κB通路，上调BCAT1，最终通过BCKAs-M2轴极化TAMs，形成正反馈循环促进LUAD进展 | 研究主要基于体外共培养、3D球体和类器官模型，缺乏体内动物模型验证；未探讨MTFR2在其他肿瘤类型中的潜在作用 | 阐明MTFR2在LUAD中通过调控BCAA代谢重编程影响TAMs极化的分子机制，并探索潜在的治疗靶点 | 肺腺癌（LUAD）肿瘤组织和细胞模型 | 肿瘤免疫学 | 肺腺癌 | 转录组学、代谢组学、蛋白质组学、单细胞测序、流式细胞术 | 共培养模型、3D球体模型、类器官模型 | 基因表达数据、蛋白质组数据、代谢组数据、单细胞测序数据、免疫组化图像 | 未明确说明（涉及LUAD组织样本和细胞模型） | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 2765 | 2026-08-13 |
From histology to spatial transcriptomics: establishing a lightweight single-patch baseline
2026-May-18, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-026-06447-7
PMID:42151778
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研究论文 | 本研究从组织学图像预测空间基因表达，建立了一个轻量级单贴片基线模型，并在人类肝脏和乳腺癌数据集上验证其性能 | 首次探讨了孤立组织贴片预测空间基因表达的可行性，并建立了标准化的轻量级基线，同时通过固定数据分割和种子设置，提供了可复现的参考框架 | 该基线仅使用单贴片输入，未利用空间上下文信息，且在独立数据集上的验证仅限于乳腺癌，可能不充分覆盖所有组织类型 | 建立单贴片基因表达预测的轻量级高效基准，以评估空间上下文整合的边际收益 | 人类肝脏和乳腺癌的空间转录组数据集，以及对应的苏木精-伊红（H&E）染色组织学图像 | 计算病理学 | 肝癌，乳腺癌 | 空间转录组学（Visium平台），组织学图像分析 | 卷积神经网络（EfficientNet-B0，ResNet，DenseNet） | H&E组织学图像，空间基因表达数据 | 固定数据划分和种子的肝脏数据集，以及独立的乳腺癌数据集 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium平台用于空间转录组数据收集 |
| 2766 | 2026-08-13 |
Identification of METTL3 and PRMT5 as an oncogenic pair for the prognosis and therapeutic targets of colorectal cancer subtype
2026-May-12, Clinical epigenetics
IF:4.8Q1
DOI:10.1186/s13148-026-02144-7
PMID:42121254
|
研究论文 | 本文通过共表达网络分析，发现METTL3和PRMT5在结直肠癌中形成正反馈环，驱动肿瘤恶性进程，并作为预后标志物和治疗靶点 | 首次揭示METTL3和PRMT5之间的相互正反馈调控机制，并基于此进行患者分层和联合靶向治疗 | 研究主要基于细胞系和患者来源类器官，需更多临床样本验证，且具体分子机制仍待深入探索 | 建立METTL3共表达网络并识别结直肠癌的新型诊断和治疗靶点 | 结直肠癌患者、细胞系、患者来源类器官 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 转录组测序、单细胞测序、空间转录组测序、共免疫沉淀、MeRIP、qRT-PCR | NA | 转录组数据、单细胞数据、空间转录组数据、蛋白质互作数据 | 涉及结直肠癌临床队列、细胞系和患者来源类器官，具体样本数量未在摘要中说明 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 10x Chromium、10x Visium | 10x Chromium单细胞3'、10x Visium空间转录组 |
| 2767 | 2026-08-13 |
Immune landscape characterization of neurofibromas with atypical features in Neurofibromatosis1 reveals PD-1 and the Tim-3/Galectin-9 pathway as potential therapeutic targets
2026-05-03, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-026-02310-1
PMID:42071244
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研究论文 | 本研究通过免疫组化和单细胞RNA测序等技术，表征了神经纤维瘤病1型患者中具有非典型特征的神经纤维瘤和ANNUBP的免疫微环境，发现PD-1和Tim-3/Galectin-9通路可作为潜在治疗靶点 | 首次系统比较了非典型神经纤维瘤/ANNUBP与皮肤神经纤维瘤、丛状神经纤维瘤及恶性外周神经鞘瘤的免疫图谱，并发现PD-1和Tim-3/Galectin-9通路在非典型病变中的独特表达，提出免疫检查点分子作为免疫预防策略的新概念 | 样本量有限，且对于免疫微环境在控制肿瘤生长中的具体机制尚未完全阐明，需要进一步的功能验证 | 探索NF1相关非典型神经纤维瘤和ANNUBP的免疫微环境特征，寻找潜在的治疗靶点 | NF1患者的非典型神经纤维瘤、ANNUBP、皮肤神经纤维瘤、丛状神经纤维瘤和恶性外周神经鞘瘤样本 | 数字病理学 | 神经纤维瘤病1型相关肿瘤 | 免疫组化、单细胞RNA测序、NanoString转录组分析、多重免疫荧光、靶向DNA测序 | NA | 组织切片图像和单细胞RNA测序数据 | 包含来自NF1患者的多种神经纤维瘤亚型样本，具体数量未在摘要中提及 | NanoString, 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | NanoString nCounter, 10x Chromium | NanoString用于转录组分析，10x Chromium用于单细胞RNA测序 |
| 2768 | 2026-08-13 |
[Half a century of gene expression analysis : The path to modern spatial transcriptomics in autopsy tissue]
2026-May, Pathologie (Heidelberg, Germany)
DOI:10.1007/s00292-026-01551-0
PMID:41979651
|
综述 | 本文回顾了基因表达分析半个世纪的发展历程，并评估了现代空间转录组学平台在福尔马林固定石蜡包埋和死后组织中的应用 | 首次系统评估了Visium HD、GeoMx、CosmX和Xenium等空间转录组学平台在死后组织分析中的分辨率和适用性，并强调与神经病理学家的合作 | 基于文献综述，可能受限于现有研究的质量和数量，且对死后组织RNA质量的影响需要进一步标准化验证 | 展示基因表达分析的方法学发展，并评估当前空间转录组学平台在处理FFPE和死后组织时的分辨率、适用性和挑战 | 基因表达分析方法和空间转录组学平台，包括Visium HD、GeoMx、CosmX和Xenium | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | 10x Genomics, NanoString, Vizgen | 空间转录组学 | Visium HD, GeoMx, CosMx, Xenium | FFPE和死后组织分析 |
| 2769 | 2026-08-13 |
Single-Cell Sequencing Analysis Reveals Dysregulated Energy Metabolism and Altered Synaptic Connectivity in the Mouse Retina Following Dark Rearing
2026-05-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.67.5.35
PMID:42138518
|
研究论文 | 使用单细胞RNA测序分析揭示暗饲养小鼠视网膜中能量代谢失调和突触连接改变，并发现Müller胶质细胞来源的DIO2作为补偿机制维持甲状腺激素稳态 | 首次在单细胞水平上系统解析视觉剥夺引起的视网膜各细胞类型的转录组变化，特别是发现Müller胶质细胞中DIO2的动态补偿上调及其对视网膜结构和功能的保护作用 | 未明确提及研究局限性 | 探究暗饲养诱导的视觉剥夺如何影响视网膜各细胞类型的能量代谢和突触连接，并阐明潜在的补偿机制 | C57BL/6J小鼠的视网膜组织 | 单细胞转录组学 | 视觉剥夺相关视网膜病变 | 单细胞RNA测序、免疫荧光、qPCR、Seahorse代谢分析、流式细胞术、靶向生化测定 | NA | 单细胞转录组数据、图像、生理数据 | 暗饲养和正常饲养小鼠视网膜样本，具体数量未在摘要中说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2770 | 2026-08-13 |
Deep learning inference of cell type-specific gene expression from breast tumor histopathology
2026-Apr-16, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-026-01419-9
PMID:41986599
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研究论文 | 开发了SLIDE-EX深度学习框架，直接从乳腺癌组织病理全切片图像推断细胞类型特异性基因表达和丰度 | 首次利用深度学习直接从组织病理切片预测细胞类型特异性基因表达，无需单细胞或bulk RNA测序 | 对非主要细胞类型的预测性能有限，且训练和测试数据主要来自乳腺癌，泛化性有待验证 | 实现快速、低成本的细胞类型特异性基因表达推断，促进肿瘤微环境表征 | 乳腺癌组织病理全切片图像及对应的去卷积bulk RNA-seq数据 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 深度学习、全切片图像分析、去卷积转录组学 | 深度学习框架（具体架构未指定） | 图像（全切片图像）和基因表达数据 | TCGA乳腺癌队列及160例独立验证队列 | NA | bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2771 | 2026-08-13 |
Cellular signatures of melanocortin pathway genes across the locus coeruleus
2026-04-04, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-026-02287-x
PMID:41935248
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研究论文 | 本研究通过单核RNA测序和空间转录组学技术，表征了人类和小鼠蓝斑核中黑皮质素通路基因的细胞特征，并发现MRAP2在能量稳态与神经退行性疾病的潜在联系中起关键作用 | 首次在蓝斑核中解析了黑皮质素通路基因的细胞特异性表达模式，发现MRAP2在大多数DBH神经元中表达，并揭示了Mrap2与AD相关基因的共表达，为能量代谢与神经退行性疾病的关联提供了新的分子证据 | 研究中未检测到Mrap2阳性细胞表达所有黑皮质素受体基因，提示可能存在未知的代谢相关GPCRs，但作者未进行功能验证实验 | 探究蓝斑核中黑皮质素通路基因的细胞特征，以及它们与肥胖和阿尔茨海默病的潜在联系 | 人类和小鼠蓝斑核中的神经元，特别是DBH神经元 | 神经科学 | 肥胖症，阿尔茨海默病 | 单核RNA测序，空间转录组学 | NA | 单核RNA测序数据，空间转录组数据，RNAscope成像数据 | 人类蓝斑核样本和小鼠蓝斑核样本（具体数量未提供） | 10x Genomics | 单核RNA-seq，空间转录组学 | 10x Chromium，10x Visium | 10x Chromium单核RNA测序，10x Visium空间转录组学 |
| 2772 | 2026-08-13 |
Comprehensive Multi-Omics Characterization of CYP2R1 as a Diagnostic and Functional Biomarker in Hepatocellular Carcinoma
2026-04-01, Medical sciences (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/medsci14020178
PMID:42029602
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研究论文 | 本研究系统分析了多队列转录组数据中57个CYP基因，确定CYP2R1作为肝细胞癌的诊断和功能生物标志物。 | 首次全面表征CYP2R1在肝细胞癌中的诊断和预后价值，结合多组学数据和空间转录组学验证，并揭示其与免疫抑制微环境的关联。 | 未在蛋白质水平或独立前瞻性队列中验证CYP2R1的临床实用性。 | 评估CYP2R1作为肝细胞癌诊断和预后生物标志物的潜力，并探索其功能机制。 | 肝细胞癌患者的转录组数据和空间转录组数据。 | 机器学习 | 肝癌 | 转录组测序 | NA | 转录组数据 | 多队列数据集，具体数量未在摘要中提供 | NA | NA | NA | NA |
| 2773 | 2026-08-13 |
Dissociable perfusion chip (DPC): perfusable microfluidic chip for single-cell screening of anti-cancer drugs in live glioblastoma explants
2026-03-31, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d5lc01105a
PMID:41778300
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研究论文 | 本研究介绍了一种可分离灌注芯片（DPC），用于在活体胶质母细胞瘤切片中进行单细胞抗癌药物筛选，并支持下游单细胞RNA测序 | 采用机械夹持而非化学附着，实现正压灌注和无损分离组织切片，便于下游scRNA-seq | 仅为概念验证，未来需进行多药物筛选和更多新鲜人GBM切片的验证 | 开发一种能够针对肿瘤细胞亚群进行药物筛选的新方法，并实现高分辨率识别细胞类型特异性药物反应 | 人胶质母细胞瘤切除组织切片、小鼠胶质母细胞瘤样本 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 微流控芯片、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 图像、基因表达数据 | 人类GBM切除组织切片（具体数量未提供），小鼠GBM样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 微流控芯片（DPC）用于组织培养和药物扰动 |
| 2774 | 2026-08-13 |
CX3CL1/CX3CR1 axis dysregulation contributes to epileptogenic mechanisms in focal cortical dysplasia
2026-03-20, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-026-02274-2
PMID:41863015
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研究论文 | 通过转录组筛选、机器学习及单细胞RNA测序等多方法，揭示CX3CL1/CX3CR1轴失调在局灶性皮质发育不良相关癫痫发生机制中的作用，并验证其作为治疗靶点的潜力 | 首次将CX3CL1/CX3CR1轴与局灶性皮质发育不良的致痫机制联系起来，并确定分泌型CX3CL1为关键致痫因子，提出该轴作为治疗干预的潜在靶点 | 摘要未提及局限性信息 | 探究局灶性皮质发育不良相关癫痫发生中的神经免疫机制，并评估CX3CL1/CX3CR1轴作为诊断标志物和治疗靶点的可能性 | 局灶性皮质发育不良患者脑组织样本，包括Ia、IIa和IIb亚型，以及新生大鼠模型 | 机器学习 | 局灶性皮质发育不良相关癫痫 | 转录组测序，单细胞RNA测序，RT-qPCR，蛋白质印迹，免疫组织化学 | 机器学习模型（LASSO、SVM-RFE、RF），加权基因共表达网络分析，大鼠模型 | 转录组数据，单细胞RNA测序数据，图像数据（免疫组织化学） | 人类FCD亚型样本（Ia、IIa、IIb）和非癫痫对照样本，具体数量未提及；新生大鼠模型，具体数量未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2775 | 2026-08-13 |
Oligodendrocyte Precursor Cells Shape Retinogeniculate Refinement Via a CHD8-Dependent Phagocytic Pathway
2026-03-02, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.67.3.64
PMID:41914968
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研究论文 | 本研究揭示了少突胶质前体细胞通过CHD8依赖的吞噬途径参与视神经丘脑突触修剪，对视觉发育至关重要 | 首次发现少突胶质前体细胞是视觉发育关键期突触吞噬的主要细胞，并揭示CHD8直接调控吞噬相关基因表达 | 未提供明确的局限性信息 | 确定负责突触修剪的主要胶质吞噬细胞及其分子调控机制 | 少突胶质前体细胞和CHD8基因 | 神经科学 | 自闭症 | 三维成像、单细胞测序、基因组占有分析、条件性基因敲除、电生理评估 | NA | 图像、转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2776 | 2026-08-13 |
Bowman's glands act as facultative stem cells following olfactory epithelial lesion
2026-Mar-02, Chemical senses
IF:2.8Q2
DOI:10.1093/chemse/bjag023
PMID:42520269
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研究论文 | 本研究通过谱系追踪、培养模型和单细胞RNA测序，证明成年小鼠黏膜下鲍曼腺在严重嗅觉上皮损伤后能作为兼性干细胞产生支持细胞，参与上皮修复 | 首次直接证明鲍曼腺细胞在严重损伤后作为兼性干细胞分化成嗅觉上皮支持细胞，并鉴定BMP家族配体为调控信号，开发了体外培养模型 | 研究主要基于小鼠模型，未在人类样本中验证；具体信号通路机制仍需进一步阐明 | 探究成年哺乳动物嗅觉上皮修复中是否存在额外的干细胞群体，特别是鲍曼腺的潜在作用 | 成年小鼠的鲍曼腺细胞和嗅觉上皮支持细胞 | 细胞生物学 | 嗅觉功能障碍 | 谱系追踪、细胞培养、单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 小鼠模型（具体数量未在摘要中说明） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 2777 | 2026-08-13 |
The changing landscape of gene expression analysis
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag185
PMID:42028808
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观点文章 | 本文综述了基因表达分析领域25年来的演变历程，从表达序列标签和微阵列到RNA测序，再到单细胞和空间转录组学，并展望了未来发展方向 | 通过分析70,78,831篇开放获取全文文章，将广泛使用的计算工具映射到统一时间线上，提出未来三大方向：联盟规模可搜索转录组知识库、基因表达分析基础模型、可编程调控设计 | 分析主要基于已发表文章，可能未完全涵盖所有未发表的方法或工具 | 总结基因表达分析方法学里程碑，描述其四大革命阶段，并展望未来趋势 | 基因表达分析领域的计算工具和方法，以及转录组学数据 | 生物信息学 | 不适用 | 转录组学 | 不适用 | 文本数据（文献元数据） | 70,78,831篇开放获取全文文章 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 |
| 2778 | 2026-08-13 |
Uncovering the toxicological impact of benzo[a]pyrene on Alzheimer's disease via network toxicology, machine learning, and single-cell transcriptomics
2026-02, Journal of Alzheimer's disease : JAD
DOI:10.1177/13872877251405468
PMID:41384939
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研究论文 | 该研究整合网络毒理学、机器学习、单细胞转录组学和文献计量学，探究苯并[a]芘在阿尔茨海默病中的作用机制 | 首次结合多种方法系统揭示BaP通过靶向EGFR和HSP90AB1促进AD的分子机制，并发现EGFR作为早期诊断生物标志物的潜力 | 研究基于公开数据库和计算分析，缺乏实验验证；单细胞数据来源单一，可能限制结果的普适性 | 阐明BaP在AD发病中的分子机制，并评估潜在诊断生物标志物 | BaP-AD共同靶点、GEO基因表达数据、单细胞RNA-seq数据（GSE157827） | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 网络毒理学、机器学习、单细胞转录组学、分子对接、文献计量学 | LASSO和SVM | 基因表达数据、单细胞转录组数据、文献数据 | 253个BaP-AD共同靶点；GEO数据集和单细胞数据具体样本量未在摘要中说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2779 | 2026-08-13 |
Deficiency of SMARCB1 drives an immunosuppressive microenvironment in meningioma
2026-01-24, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-025-02217-3
PMID:41578352
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研究论文 | 本研究探讨SMARCB1缺陷如何通过IL-17/CSF1轴驱动脑膜瘤中的免疫抑制微环境，特别是CD163+巨噬细胞的富集。 | 首次揭示SMARCB1缺陷通过IL-17/CSF1轴调控CD163+巨噬细胞浸润，从而形成免疫抑制微环境，并提出了一个14基因特征来识别免疫原性亚型。 | 研究样本量相对较小，且机制验证主要依赖于体外和生物信息学分析，缺乏体内功能实验。 | 阐明SMARCB1缺陷在脑膜瘤免疫微环境中的作用，并探索其作为免疫治疗靶点的潜力。 | 脑膜瘤患者肿瘤组织及血清样本，包括不同WHO分级和疾病状态（原发或复发）的样本。 | 数字病理学 | 脑膜瘤 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 全外显子测序, 多重免疫荧光染色 | NA | 图像, 基因表达数据, 蛋白质组数据 | 113例患者的血清样本和35例患者的肿瘤组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 2780 | 2026-08-13 |
Single-cell dissection and multi-cohort validation identify a hypoxia-related prognostic signature with experimental verification in lung adenocarcinoma
2026, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2026.1845179
PMID:42422066
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研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序和多队列转录组数据，构建并验证了肺腺癌中与缺氧相关的预后特征模型，并通过实验验证了关键基因VWA1的功能。 | 首次在单细胞水平系统描绘肺腺癌中缺氧信号的细胞异质性，并结合多队列数据分析构建了一个跨队列验证的缺氧相关预后模型，且通过体外实验验证了关键基因的功能。 | 研究主要基于公共数据库的数据分析，缺乏临床样本的独立验证；体外实验仅针对单个基因，可能不足以全面反映模型的生物学机制。 | 探索肺腺癌中缺氧信号的单细胞分布及其对预后分层的作用，并建立一个可靠的预后模型。 | 肺腺癌患者，包括单细胞RNA测序数据、多队列批量转录组数据、临床随访信息以及A549细胞系。 | 生物信息学，数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | Cox比例风险模型 | 单细胞转录组数据，批量转录组数据，临床数据，基因表达数据 | 包含一个基因表达综合数据库的肺腺癌队列，TCGA训练队列以及两个独立外部验证队列，此外还使用了A549细胞系进行体外实验。 | NA | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | NA | NA |