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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2721 | 2026-03-20 |
Single-Cell Transcriptome and Microbiome Profiling Uncover Ileal Immune Impairment in Intrauterine Growth-Retarded Piglets
2026, Current pharmaceutical design
IF:2.6Q2
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组和微生物组分析,揭示了宫内生长迟缓(IUGR)仔猪回肠免疫功能受损的机制 | 首次结合单细胞RNA测序和16S rRNA测序,系统探究IUGR仔猪回肠免疫细胞亚群分布、信号通路及微生物组变化,并识别出新的免疫相关转录因子和关键微生物作为潜在治疗靶点 | 样本量较小(仅3只IUGR仔猪和3只正常仔猪),且研究局限于7日龄仔猪,未涵盖其他发育阶段 | 探究IUGR仔猪肠道免疫功能障碍的基因调控模式和微生物组变化 | 宫内生长迟缓(IUGR)仔猪和正常同窝仔猪的回肠组织及内容物 | 单细胞组学 | 宫内生长迟缓 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),16S rRNA扩增子测序(16S-seq) | NA | 单细胞转录组数据,微生物组数据 | 3只IUGR仔猪和3只正常同窝仔猪 | NA | 单细胞RNA-seq,16S rRNA测序 | NA | NA |
| 2722 | 2026-03-20 |
Liver Sinusoidal Endothelial Cells Promote Metabolic Dysfunction-associated Steatohepatitis Progression via Interleukin-1R1-mediated Chemokine Production Induced by Macrophage-derived Interleukin-1β
2026, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2025.101698
PMID:41344438
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研究论文 | 本研究揭示了巨噬细胞来源的IL-1β通过LSEC上的IL1R1信号通路诱导趋化因子产生,从而驱动MASH炎症和纤维化进展的机制 | 首次阐明了在MASH中,巨噬细胞与肝窦内皮细胞之间通过IL-1β/IL1R1轴相互作用,并利用空间转录组学技术定位了这种相互作用主要发生在门静脉周围区域 | 体外研究使用了细胞系而非原代细胞,动物模型为饮食诱导,可能无法完全模拟人类MASH的复杂性 | 阐明IL-1β在代谢功能障碍相关脂肪性肝炎(MASH)病理进展中的作用机制 | THP-1巨噬细胞系、TMNK-1肝窦内皮细胞系、内皮细胞特异性Il1r1敲除小鼠、Cxcl10全身敲除小鼠、MASH患者肝组织 | 数字病理学 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 | RNA测序、空间转录组学分析 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据 | 小鼠模型(Il1r1ΔEC和Cxcl10-/-小鼠)、MASH患者肝组织样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2723 | 2026-03-20 |
GPR65 as a Laryngeal Cancer Risk Gene Identified through Single-Cell Transcriptomics, Mendelian Randomization Analysis, and Experimental Validation
2026, Anti-cancer agents in medicinal chemistry
IF:2.6Q3
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学、孟德尔随机化分析和实验验证,识别出GPR65作为喉癌的潜在风险基因,并探讨其在癌症发生中的功能机制 | 首次结合单细胞转录组学、孟德尔随机化分析和体外实验验证,系统识别并验证GPR65作为喉癌风险基因的功能 | 研究主要基于体外细胞实验,缺乏体内动物模型验证,且样本来源和数量可能有限 | 识别喉癌的潜在风险基因并研究其功能机制 | 喉鳞状细胞癌(LSCC)细胞系(TU686和Hep-2)、正常上皮细胞、肿瘤组织与正常组织 | 数字病理学 | 喉癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、全基因组关联研究(GWAS)、表达数量性状位点(eQTL)分析、qRT-PCR、免疫组化、细胞增殖、迁移和侵袭实验 | NA | 单细胞转录组数据、GWAS数据、TCGA数据、实验数据 | 未明确指定样本数量,但涉及LSCC细胞系、正常上皮细胞及组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2724 | 2026-03-20 |
A clustering method for single-cell RNA sequencing data based on denoising and masking learning
2026, Frontiers in bioinformatics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fbinf.2026.1758257
PMID:41852496
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研究论文 | 本文提出了一种基于去噪和掩码学习的单细胞RNA测序数据聚类方法scDMAC,旨在解决数据高维、稀疏和噪声问题 | 结合零膨胀负二项分布去噪自编码器和掩码自编码器,通过概率去噪和特征重建学习基因相关性,提升聚类性能 | 未在更广泛或更复杂的单细胞多组学数据上验证,且计算效率可能受数据规模影响 | 开发一种针对单细胞RNA测序数据的高效聚类方法,以应对数据稀疏性和噪声挑战 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 自编码器(包括ZINB去噪自编码器和掩码自编码器) | 基因表达数据 | 多个基准scRNA-seq数据集,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2725 | 2026-03-19 |
High-sensitivity in situ detection of Sox21 reveals transcript asymmetry from the zygote stage
2026-May, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2026.02.002
PMID:41692143
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研究论文 | 本研究利用高灵敏度原位检测技术,揭示了小鼠胚胎发育中Sox21基因转录不对称性早在2细胞阶段就已出现 | 首次在2细胞阶段检测到Sox21 mRNA的异质性表达,并发现其优先从雄性原核表达,这为哺乳动物早期谱系决定的机制提供了新见解 | 研究主要基于小鼠模型,在人类或其他哺乳动物中的普适性尚需验证,且技术方法可能无法完全排除检测假阳性的可能性 | 探究哺乳动物早期胚胎发育中谱系决定的时间点和分子机制 | 小鼠早期胚胎(从受精卵到4细胞阶段) | 发育生物学 | NA | 杂交链式反应(HCR)结合共聚焦成像,单细胞RNA-seq | NA | 图像数据,转录组数据 | 未明确说明具体样本数量,但涉及多个发育阶段的小鼠胚胎 | NA | 单细胞RNA-seq,原位杂交 | NA | NA |
| 2726 | 2026-03-19 |
Immune landscape in NOD.H-2h4 mouse model thyroid revealed by single-cell RNA sequencing
2026-04-16, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2026.153484
PMID:41734714
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了NOD.H-2h4小鼠甲状腺在桥本甲状腺炎不同阶段的免疫景观 | 首次在NOD.H-2h4小鼠模型中构建甲状腺单细胞转录组图谱,揭示了甲状腺细胞可塑性和Treg功能障碍作为疾病进展的潜在驱动因素 | 研究基于小鼠模型,结果可能无法完全反映人类桥本甲状腺炎的复杂性 | 探究桥本甲状腺炎中甲状腺细胞类型在免疫失调中的具体作用 | NOD.H-2h4小鼠的甲状腺组织 | 数字病理学 | 桥本甲状腺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 38,461个细胞,来自三个疾病阶段(4、8和16周)的小鼠甲状腺组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2727 | 2026-03-19 |
Identification and experimental confirmation of TBC1D10C as a shared transcriptional link between abdominal aortic aneurysm and major depressive disorder
2026-04-09, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2026.153456
PMID:41702190
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据,识别并实验验证了TBC1D10C作为腹主动脉瘤和重度抑郁症之间的共享转录调控因子 | 首次发现TBC1D10C作为AAA和MDD的共同关键枢纽基因,并通过scRNA-seq和小鼠模型验证其在免疫细胞中的表达与淋巴细胞活化的负相关性 | 研究主要基于生物信息学分析和动物模型验证,缺乏直接的人类临床干预数据 | 揭示腹主动脉瘤和重度抑郁症之间的共享分子通路,寻找共同治疗靶点 | 腹主动脉瘤和重度抑郁症患者及小鼠模型的基因表达数据 | 生物信息学 | 心血管疾病 | RNA-seq, scRNA-seq | 机器学习 | 基因表达数据 | 七个基因表达数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2728 | 2026-03-19 |
Deciphering transcriptional plasticity in pancreatic ductal adenocarcinoma reveals alterations in sensory neuron innervation
2026-Mar-18, Molecular oncology
IF:5.0Q1
DOI:10.1002/1878-0261.70233
PMID:41847880
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了胰腺和胰腺导管腺癌(PDAC)中的感觉神经元转录组,揭示了肿瘤相关神经重塑的分子机制 | 首次在PDAC小鼠模型中鉴定出感觉神经元内存在肿瘤来源的RNA,提示了细胞外囊泡介导的RNA转移新机制 | 研究基于小鼠模型,结果在人类PDAC中的适用性需进一步验证 | 探究胰腺导管腺癌中感觉神经元转录组的变化及其在肿瘤进展中的作用 | 野生型和PDAC小鼠模型中的胰腺感觉神经元 | 单细胞转录组学 | 胰腺导管腺癌 | 单细胞RNA测序、免疫荧光、类器官培养、qPCR | NA | 单细胞转录组数据 | 野生型和PDAC小鼠的背根神经节感觉神经元 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2729 | 2026-03-19 |
Tumor Necrosis Factor Receptor-Associated Factor 1 Inhibits Macrophage Killing of Sporothrix schenckii by Enhancing Expression and Activity of Inducible Nitric Oxide Synthase
2026-Mar-17, The Journal of infectious diseases
IF:5.0Q1
DOI:10.1093/infdis/jiaf646
PMID:41428466
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和实验模型,揭示了TRAF1通过稳定NOS2表达抑制巨噬细胞杀伤申克孢子丝菌的机制,并探讨了局部热疗的治疗作用 | 首次发现TRAF1通过结合NOS2抑制其泛素化降解,从而延迟孢子丝菌病愈合,并阐明热疗通过下调TRAF1和NOS2表达发挥治疗作用 | 机制研究主要在体外和动物模型中进行,临床转化需进一步验证 | 探究TRAF1和NOS2在孢子丝菌病免疫逃逸中的作用及热疗的治疗机制 | 申克孢子丝菌感染的巨噬细胞及孢子丝菌病病变组织 | NA | 孢子丝菌病 | 单细胞RNA测序, 免疫共沉淀, 泛素化分析, 定点突变 | NA | 单细胞RNA测序数据, 实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2730 | 2026-03-19 |
A Novel Low-Dimensional Sparse and Low-Rank Representation Method for Single-Cell RNA Sequencing Data Clustering
2026-Mar-17, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2026.3674992
PMID:41843533
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研究论文 | 本文提出了一种名为LDSLRR的新型低维稀疏低秩表示方法,用于单细胞RNA测序数据的聚类分析 | 将降维、自表示矩阵构建和聚类过程集成到一个端到端模型中,通过同时优化这三个模块来提高聚类准确性 | NA | 解决单细胞RNA测序数据因高维度和稀疏性带来的聚类挑战,以实现更精确的细胞聚类 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | LDSLRR(低维稀疏低秩表示模型),结合图正则化非负矩阵分解 | 基因表达矩阵 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2731 | 2026-03-19 |
DUSP6 ablation restores CAR T-cell fitness impaired by tumor CD58 loss through invigoration of AP-1 signaling
2026-Mar-17, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-026-02597-5
PMID:41844571
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研究论文 | 本研究揭示了肿瘤CD58缺失通过减弱AP-1信号导致CAR-T细胞功能障碍,并发现阻断DUSP6可恢复CAR-T细胞的适应性 | 重新定位CD58不仅是免疫突触成分,更是CAR-T细胞生物学中的代谢检查点,并确定DUSP6阻断是增强CAR-T细胞效力的新工程靶点 | 未明确说明 | 探究肿瘤CD58缺失导致CAR-T细胞功能障碍的机制,并寻找恢复CAR-T细胞适应性的治疗策略 | CAR-T细胞 | 肿瘤免疫治疗 | 癌症 | CRISPR/Cas9筛选、单细胞RNA-seq、转录组分析 | NA | 转录组数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2732 | 2026-03-19 |
Human umbilical cord mesenchymal stromal cells therapy for neuromyelitis optica spectrum disorder: a phase 1/2a trial
2026-Mar-17, Cell death and differentiation
IF:13.7Q1
DOI:10.1038/s41418-026-01720-x
PMID:41844898
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研究论文 | 本研究评估了人脐带间充质干细胞治疗视神经脊髓炎谱系疾病的安全性和有效性 | 首次在临床试验中系统评估hUC-MSCs对NMOSD的疗效,并探索了其通过硫氧还蛋白和氧化磷酸化途径增强Treg细胞功能的潜在机制 | 单臂、开放标签设计,样本量较小(31例),缺乏对照组,随访时间有限(15个月) | 评估hUC-MSCs减少NMOSD复发和改善神经功能障碍的安全性与疗效 | 31名NMOSD患者 | NA | 视神经脊髓炎谱系疾病 | 单细胞RNA测序,代谢组学检测 | NA | 临床数据,MRI影像,单细胞RNA测序数据,代谢组学数据 | 31例NMOSD患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2733 | 2026-03-19 |
Cathepsin B promotes asthma potentially via macrophage-associated autophagy and apoptosis
2026-Mar-17, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.1093/jimmun/vkag020
PMID:41847863
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研究论文 | 本研究整合遗传学、转录组学和实验方法,揭示了组织蛋白酶B(CTSB)通过巨噬细胞相关的自噬和凋亡途径促进哮喘发病的机制 | 首次通过孟德尔随机化分析证实循环CTSB水平升高与哮喘风险存在因果关系,并利用单细胞RNA测序技术将CTSB表达定位到巨噬细胞,阐明了其通过调控自噬和凋亡影响哮喘的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外数据,在人类中的直接验证尚不充分;CTSB抑制剂的选择性及其在临床治疗中的安全性和有效性仍需进一步评估 | 探究组织蛋白酶B(CTSB)是否以及如何参与哮喘的发病机制 | 哮喘患者(人类数据)和C57BL/6小鼠卵清蛋白诱导的哮喘模型 | NA | 哮喘 | 孟德尔随机化分析、全基因组关联研究(GWAS)、RNA测序(RNA-seq)、单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 遗传数据、转录组数据、实验数据 | 大规模GWAS数据、哮喘患者RNA-seq数据、scRNA-seq数据集、C57BL/6小鼠模型 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 2734 | 2026-03-19 |
Representation learning of single-cell RNA-seq data
2026-Mar-16, RNA (New York, N.Y.)
DOI:10.1261/rna.080889.125
PMID:41506911
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序数据的表示学习方法,包括因子模型、自编码器、对比学习和基于Transformer的基础模型,并提供了分类和挑战分析 | 将多种scRNA-seq表示学习方法统一到表示学习范式下,提供概念分类和基准测试讨论 | 作为综述,未提出新方法,主要基于现有文献总结 | 综述单细胞RNA测序数据的表示学习方法及其应用 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 因子模型, 自编码器, 对比学习, Transformer | 基因表达数据 | 超过1亿个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2735 | 2026-03-19 |
miRNA regulation in brain tissue space: the 3'UTR perspective
2026-Mar-16, RNA (New York, N.Y.)
DOI:10.1261/rna.080850.125
PMID:41672779
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综述 | 本文综述了miRNA及其靶向3'UTR在脑组织空间中的调控作用,重点关注神经发育和神经元功能,并总结了当前空间定量方法及未来研究方向 | 首次从3'UTR角度探讨miRNA在脑组织空间中的调控,强调同时量化miRNA和3'UTR的空间表达及异构体变异的重要性,并提出未来研究策略 | 当前尚无方法能同时量化miRNA和3'UTR在空间中的表达,且3'UTR异构体的空间变异研究不足 | 探讨miRNA介导的基因调控在脑组织空间中的作用,特别是在神经发育和神经元功能中的复杂功能 | 脑组织中的miRNA和3'UTR | 自然语言处理 | NA | 空间转录组学 | NA | RNA表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2736 | 2026-03-19 |
Inhibition of NFAT after human uterus transplant promotes loss of tissue-resident NK cells and attendant pregnancy complications
2026-Mar-11, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adp2196
PMID:41811989
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研究论文 | 本研究通过比较子宫移植受者与健康对照的样本,揭示了NFAT信号抑制导致组织驻留子宫自然杀伤细胞减少,进而引发妊娠并发症的机制 | 首次在人类中揭示了NFAT信号在调节子宫自然杀伤细胞组织驻留程序中的关键作用,并关联了子宫移植后妊娠并发症的生物学基础 | 研究基于子宫移植受者这一高风险人群,样本量可能有限,且机制研究主要依赖体外实验,需进一步验证 | 探究子宫移植后妊娠并发症的生物学机制,特别是组织驻留子宫自然杀伤细胞的作用 | 子宫移植受者的子宫内膜和蜕膜组织样本,以及健康对照的相应组织 | 单细胞组学 | 妊娠并发症 | 流式细胞术、免疫荧光显微镜、单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、图像数据 | 子宫移植受者队列与健康对照的子宫内膜和蜕膜组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2737 | 2026-03-19 |
Reconstitution of the uterine immune milieu after uterus or hematopoietic stem cell transplantation
2026-Mar-11, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adp2583
PMID:41811987
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和高参数流式细胞术,探讨了子宫移植或造血干细胞移植后人类子宫免疫微环境的重建过程 | 首次在人类中系统评估子宫移植和造血干细胞移植后子宫免疫系统的重建,利用单核苷酸多态性和HLA表达差异追踪供体与受体细胞起源,揭示了免疫细胞在转录组、表型和空间层面的恢复能力 | 研究样本量有限,且受他克莫司药物影响,可能限制了组织驻留淋巴细胞特征的体外诱导观察 | 探究人类组织特异性免疫系统的建立与重建机制,特别是在子宫这一持续再生器官中的免疫持久性和恢复能力 | 接受子宫移植或造血干细胞移植的女性患者的子宫内膜免疫细胞 | 单细胞组学 | 移植免疫 | 单细胞RNA测序, 高参数流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | 未明确具体样本数量,涉及接受子宫移植或造血干细胞移植的女性患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2738 | 2026-03-19 |
Macrophage SLC9A1 Links Endocytic Trafficking to Innate Immune Activation in Myocardial Injury
2026-Mar-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.27.708643
PMID:41847017
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研究论文 | 本研究揭示了巨噬细胞中的钠氢交换体SLC9A1通过调节巨胞饮作用,连接膜离子转运与心肌损伤后先天免疫激活的新机制 | 首次发现SLC9A1作为连接膜离子转运与炎症信号传导的桥梁,并证实巨噬细胞巨胞饮作用是心肌梗死后先天免疫激活的关键调节器 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体中得到验证;SLC9A1抑制剂EIPA的特异性可能影响其他细胞功能 | 探究心肌梗死后巨噬细胞感知缺血危险信号的上游机制,特别是巨胞饮作用和SLC9A1在先天免疫激活中的作用 | 心肌梗死小鼠模型中的巨噬细胞,特别是梗死相关巨噬细胞 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,药理学抑制,基因敲除技术 | NA | 基因表达数据,功能表型数据 | 使用单核细胞和单核细胞来源巨噬细胞特异性敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2739 | 2026-03-19 |
Crohn's disease under single-cell map: from INFLARE metaplastic cells to rare immune cell subpopulations
2026-03-05, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2026.153347
PMID:41610714
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综述 | 本文综述了利用单细胞测序技术在克罗恩病中发现的多种新型免疫细胞亚群及其在疾病发病机制中的作用 | 系统总结了单细胞测序揭示的克罗恩病相关新型免疫细胞亚群,如INFLAREs、CAITs等,并探讨了它们作为未来治疗靶点的潜力 | 这是一篇综述文章,主要整合现有研究发现,未提供新的原始实验数据 | 总结克罗恩病中通过单细胞测序技术鉴定的关键免疫细胞亚群,并探讨其病理作用与治疗潜力 | 克罗恩病患者样本中的免疫细胞 | 单细胞组学 | 克罗恩病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2740 | 2026-03-19 |
Spatial transcriptomics reveals mechanism of autoimmunity driven by internalized autoantibodies
2026-Mar-05, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.64898/2026.02.14.26346329
PMID:41757163
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学揭示了自身抗体内化作为多种自身免疫性疾病共享的致病机制 | 首次通过空间转录组学证明抗体分泌细胞将细胞质物质(如免疫球蛋白RNA)转移到邻近受影响的细胞中,并揭示了自身抗体诱导的转录程序与细胞损伤和特异性炎症反应相关 | NA | 探究自身抗体内化在自身免疫性疾病发病机制中的作用及其普遍性 | 抗Mi2皮肌炎、抗PM/Scl硬化性肌炎、抗U1RNP混合性结缔组织病、抗Ku重叠综合征和抗Scl70系统性硬化症患者的肌肉活检组织和其他组织样本 | 数字病理学 | 自身免疫性疾病 | 空间转录组学、bulk RNA测序、直接免疫荧光 | NA | 转录组数据、图像数据 | 多个独立队列的患者肌肉活检样本 | NA | 空间转录组学、bulk RNA-seq | NA | NA |