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当前共找到 9441 篇文献，本页显示第 2661 - 2680 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2661 | 2026-08-14 |
Activated Macrophages Promote TNF-α-Associated Tumor Cell Necroptosis in Pituitary Apoplexy Through the PIEZO1-NFATC2/REL Axis
2026-Jun-22, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27125635
PMID:42353349
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和组织学验证，研究垂体卒中相关微环境中巨噬细胞的机械敏感信号（PIEZO1-NFATC2/REL轴）如何促进TNF-α相关的肿瘤细胞坏死性凋亡。 | 首次将巨噬细胞的机械敏感信号通路（PIEZO1）与垂体卒中的炎症放大和组织损伤联系起来，揭示了新的病理机制。 | 研究主要基于体外实验和临床样本的关联分析，缺乏体内模型的直接验证。 | 探究垂体神经内分泌肿瘤中，巨噬细胞机械敏感信号是否促进炎症放大和组织损伤，并分析其与临床严重程度的相关性。 | 人垂体神经内分泌肿瘤（PitNET）样本，包括卒中和非卒中类型，以及相关巨噬细胞。 | 数字病理学 | 垂体卒中 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、组织学验证、临床分层、体外功能实验 | NA | 单细胞转录组数据、组织图像、临床数据 | 垂体腺瘤样本（卒中和非卒中），具体数量未明确；体外实验使用AtT-20和GH3细胞系。 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2662 | 2026-08-14 |
Stepwise Protocol for Alternative Splicing Analysis in Single-Cell SMART-Seq2 RNA-Seq Data
2026-Jun-20, Bio-protocol
IF:1.0Q3
DOI:10.21769/BioProtoc.5735
PMID:42367213
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研究方案 | 提出一个逐步协议，用于分析儿童高级别胶质瘤（pHGGs）中具有H3.3K27M突变的单细胞SMART-Seq2 RNA测序数据中的可变剪接（AS）。 | 该协议结合了基因表达聚类和突变检测来识别肿瘤群体，并使用MARVEL包结合自定义脚本实现了PSI值计算、可变AS事件识别、降维、聚类、差异AS分析和剪接模式可视化。 | 该协议专门针对SMART-Seq2数据，可能不适用于其他类型的单细胞测序数据，且依赖于低通量的全长RNA-seq方法。 | 建立标准化的单细胞分辨率下分析AS的工作流，以研究肿瘤细胞中的剪接异质性。 | 儿童高级别胶质瘤（pHGGs）细胞，携带H3.3K27M突变。 | 生物信息学, 转录组学 | 儿童高级别胶质瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq，SMART-Seq2） | MARVEL包（基于R的统计模型） | 单细胞RNA测序数据 | 未在摘要中提供具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq（全长） | SMART-Seq2 | SMART-Seq2单细胞全长转录组测序 |
| 2663 | 2026-07-08 |
Assessing Transduction Efficiency And Cell Targeting By Cell-penetrating Peptides In The Mouse Lung
2026-06-16, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/71217
PMID:42406821
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研究论文 | 提出一种综合工作流程，用于评估细胞穿透肽在小鼠肺部的转导效率和细胞靶向性 | 首次整合互补读数（FACS分选、单细胞RNA测序、流式细胞术和共聚焦成像）来验证CPP在体内细胞类型水平的选择性 | 仅针对肺泡上皮II型细胞和单一CPP（cR11A）进行了测试，未评估其他细胞类型或器官的适用性 | 评估细胞穿透肽在体内的细胞类型特异性和转导效率 | 小鼠肺泡上皮II型细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠肺组织样本，具体数目未提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 用于单细胞RNA测序的10x Chromium平台 |
| 2664 | 2026-08-14 |
DDR1 Modulates Cytoskeletal Remodeling and Podosome Formation in Renal Fibroblasts
2026-Jun-16, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27125419
PMID:42353135
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研究论文 | 本研究探讨了DDR1在肾成纤维细胞中如何调节细胞骨架重塑和足体形成，以及其与基质力学之间的双向关系。 | 首次揭示DDR1在肾成纤维细胞中通过抑制应力纤维组装和促进足体形成，调节基质降解与收缩重塑程序之间的平衡，并发现DDR1表达与基质刚度存在双向调控关系。 | 研究主要基于体外实验和小鼠模型，未在人类样本中验证，且DDR1的上下游信号通路尚未完全阐明。 | 阐明DDR1在肾成纤维细胞激活过程中对细胞骨架组织和胶原重塑的调控作用及其机制。 | 小鼠肾成纤维细胞和单侧输尿管梗阻（UUO）小鼠肾脏组织。 | 数字病理学 | 肾脏纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确在标题和摘要中提供具体样本数量。 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2665 | 2026-08-14 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis Identifies an OLFM4-Associated Gastric Cancer Cell State with Palmitoylation-Related Signatures and Altered Metabolic Activities
2026-Jun-15, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom16060880
PMID:42352346
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和批量转录组分析，识别出胃腺癌中与OLFM4相关的细胞状态，该状态具有棕榈酰化相关特征和改变的能量代谢活动 | 首次识别出OLFM4相关的胃癌细胞亚型，并揭示其与棕榈酰化和代谢重编程的关联，同时构建了基于该亚型相关基因的预后风险模型 | 未明确提及研究的局限性 | 表征胃腺癌中的恶性上皮亚型，并探索OLFM4相关细胞状态在代谢异质性和预后中的潜在作用 | 胃腺癌患者的肿瘤细胞和胃癌细胞系 | 机器学习和转录组学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、功能实验（重组蛋白处理、siRNA敲低） | 预后风险模型 | 转录组数据 | 未明确提及患者样本数量 | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 2666 | 2026-08-14 |
Single-Cell Transcriptomic Profiling Reveals Dual Antitumor and Adaptive Resistance Mechanisms of a Novel HSP90 Inhibitor, SP11, in T-Cell Acute Lymphoblastic Leukemic Cells and DLA Mouse Model
2026-Jun-12, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27125321
PMID:42353040
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析评估新型HSP90抑制剂SP11在T细胞急性淋巴细胞白血病中的抗肿瘤效果及适应性耐药机制 | 首次利用单细胞转录组技术揭示新型HSP90抑制剂SP11的双重抗肿瘤机制和适应性耐药转录状态，并提出BCL2抑制剂联合治疗策略 | 未提供明确的局限信息 | 评估SP11在T-ALL中的治疗潜力，并揭示其抗肿瘤和耐药机制 | T细胞急性淋巴细胞白血病细胞系和DLA小鼠模型 | 单细胞转录组学 | T细胞急性淋巴细胞白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确提及样本数量，涉及MOLT4细胞系和DLA小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2667 | 2026-08-14 |
IL-1β/EPAS1-Associated Ferroptotic Stress Impairs Skeletal Stem/Progenitor Cell Function in Inflammation-Associated Fracture Nonunion
2026-Jun-09, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb48060606
PMID:42353610
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研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序数据，揭示了IL-1β/EPAS1相关的铁死亡应激损害骨骼干/祖细胞功能，导致炎症相关骨折不愈合的机制 | 首次将铁死亡与炎症相关骨折不愈合中的骨骼干/祖细胞功能障碍联系起来，并鉴定IL-1β/EPAS1信号轴作为关键调控通路，通过孟德尔随机化提供遗传证据 | 部分验证基于小鼠模型，人体证据主要依赖遗传关联而非直接功能实验 | 阐明炎症相关骨折不愈合中骨骼干/祖细胞功能受损的细胞内在机制，并探索潜在治疗靶点 | 小鼠骨膜、正常骨折愈合和炎症相关骨折不愈合模型中的骨骼干/祖细胞 | 机器学习 | 骨折不愈合 | 单细胞RNA测序 | 轨迹推断、转录因子网络分析、细胞间通讯建模 | 单细胞转录组数据 | 公开和内部小鼠单细胞RNA测序数据集，含多个模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2668 | 2026-08-14 |
Combined Analysis of Bulk and Single-Cell Transcriptomic Data Reveals Dormancy-Associated Genes in Colorectal Cancer
2026-Jun-08, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27125191
PMID:42352915
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研究论文 | 整合批量与单细胞转录组数据分析结直肠癌休眠相关基因 | 通过批量转录组通路评分与单细胞RNA测序的联合分析，首次识别出23个结直肠癌休眠相关基因，并发现其通过代谢过程调控休眠，同时评估了这些基因的预后价值及潜在治疗药物 | 未提及具体限制，但可能涉及样本量或验证范围有限 | 阐明结直肠癌休眠的分子机制，识别相关基因并评估其预后价值 | 结直肠癌的上皮细胞、癌症干细胞和免疫细胞 | 转录组学、机器学习和数字病理学 | 结直肠癌 | 批量转录组分析、单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | 转录组数据（批量与单细胞） | 两个独立CRC队列（GSE41258和GSE41568）及TCGA结肠直肠癌数据集 | NA | 批量RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2669 | 2026-08-14 |
Integrated Bulk and Single-Cell Transcriptomic Analysis Followed by Clinical Validation Reveal Programmed Cell Death-Related Shared Molecular Signatures in OA and MDD
2026-Jun-06, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27125154
PMID:42352882
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研究论文 | 本研究通过整合批量与单细胞转录组分析及临床验证，揭示骨关节炎和重度抑郁症中程序性细胞死亡相关的共享分子特征 | 首次在OA和MDD中联合分析PCD相关基因，利用多种机器学习方法及单细胞RNA测序定位关键基因，并经独立临床队列验证 | 由于使用独立的疾病特异性数据集而非真正的共病发现队列，结果仅为候选标志物，需功能验证，且样本量有限 | 探索OA与MDD共病中程序性细胞死亡相关共享分子特征及其潜在机制 | 骨关节炎滑膜组织和重度抑郁症外周血及脑组织转录组数据及临床样本 | 生物信息学、基因组学 | 骨关节炎、重度抑郁症 | 批量RNA-seq、单细胞RNA-seq、qRT-PCR、Western blot | LASSO、SVM-RFE、随机森林、WGCNA | 转录组表达数据、单细胞表达数据、临床样本数据 | 包含6个训练集、7个验证集、2个单细胞RNA-seq数据集及一个独立临床队列 | NA | 批量RNA-seq、单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2670 | 2026-08-14 |
Syringin disrupts the DLAT/MYC axis to dampen TAM polarization and suppress hepatocellular carcinoma progression
2026-Jun, Acta pharmaceutica Sinica. B
DOI:10.1016/j.apsb.2026.03.036
PMID:42368569
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研究论文 | 本研究筛选出天然化合物紫丁香苷，通过破坏DLAT/MYC轴抑制肿瘤相关巨噬细胞的M2极化，从而抑制肝细胞癌进展。 | 首次发现紫丁香苷直接靶向DLAT并破坏DLAT/MYC轴，通过抑制MYC乙酰化促进其泛素化降解，从而调控巨噬细胞极化；同时建立了单细胞RNA测序和ABPP技术联合应用的新范式。 | 未提供明确的局限性说明。 | 探索能够抑制肝细胞癌进展的天然化合物，并阐明其分子机制，以期为HCC治疗提供新的辅助策略。 | 肝细胞癌肿瘤相关巨噬细胞和肝细胞癌进展相关机制。 | 分子生物学、癌症研究 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序，基于亲和力的蛋白质分析（ABPP） | NA | 基因表达数据，蛋白质相互作用数据 | 小鼠模型和患者来源的异种移植模型 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序, 质谱分析 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium单细胞RNA测序，Illumina NovaSeq测序 |
| 2671 | 2026-08-14 |
Identifying Single-Cell Expression Quantitative Trait Loci Using a Bootstrap Penalized Hurdle Model
2026-May-29, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes17060625
PMID:42353785
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研究论文 | 提出了一种名为BPHurdle的统计框架，专门用于单细胞RNA测序数据的eQTL分析 | 采用hurdle模型框架，结合逻辑回归处理零膨胀和泊松回归评估多个SNP对基因表达的影响 | 摘要中未明确提及局限性 | 开发一种适用于单细胞RNA测序数据的eQTL分析方法，以识别细胞类型特异的调控变异 | 单细胞RNA测序数据中的基因表达和SNP数据 | 机器学习 | NA | scRNA-seq | Hurdle模型（逻辑回归+泊松回归） | 单细胞基因表达数据和基因型数据 | 模拟研究和真实数据案例研究（具体样本数量未提供） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2672 | 2026-08-14 |
Monocyte-Derived Macrophage Ferroptosis Amplifies Cholangitis in Primary Biliary Cholangitis via a Calpain/ACSL4 Axis
2026-May-27, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines14061208
PMID:42351634
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序及小鼠模型，揭示单核细胞来源的巨噬细胞通过钙蛋白酶/ACSL4轴发生铁死亡，从而放大原发性胆汁性胆管炎的胆管炎症 | 首次在原发性胆汁性胆管炎中定义单核细胞来源巨噬细胞的铁死亡程序，并识别钙蛋白酶/ACSL4轴作为调控和治疗靶点 | 摘要中未提及明确的局限性 | 探究单核细胞来源巨噬细胞是否通过铁死亡放大原发性胆汁性胆管炎的炎症，并评估钙蛋白酶/ACSL4轴作为治疗靶点 | 原发性胆汁性胆管炎患者肝脏样本、PBC样小鼠模型及骨髓来源巨噬细胞 | 数字病理学 | 原发性胆汁性胆管炎 | 单细胞RNA测序、多重免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据、图像 | 公开人类肝脏单细胞RNA测序数据集及PBC样小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2673 | 2026-08-14 |
HO-1-modified umbilical cord MSCs alleviate pulmonary arterial hypertension by reducing inflammation and endothelial dysfunction
2026-05-18, Stem cells translational medicine
IF:5.4Q1
DOI:10.1093/stcltm/szag036
PMID:42367077
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研究论文 | 评估过表达HO-1的脐带间充质干细胞对肺动脉高压的治疗效果，并探索其通过调节炎症和内皮功能障碍的潜在机制。 | 首次利用空间转录组学和单细胞RNA测序分析人肺动脉高压组织中HO-1的表达与定位，并验证HO-1修饰的MSCs在动物模型中的协同治疗效果。 | 缺乏对HO-1修饰MSCs长期安全性和临床转化潜力的评估。 | 评估HO-1修饰的脐带间充质干细胞在肺动脉高压中的治疗效率，并探讨其作用机制。 | 人肺动脉高压组织样本和大鼠、小鼠肺动脉高压模型（MCT诱导和SuHx）。 | 数字病理学 | 肺动脉高压 | 空间转录组学，单细胞RNA测序，RNA-seq | NA | 基因表达数据，组织图像 | 人肺动脉高压组织样本和多种动物模型（具体样本量未提供） | 10x Genomics, Illumina | 空间转录组学，单细胞RNA测序，RNA-seq | 10x Visium, 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 空间转录组学使用10x Visium，单细胞RNA测序使用10x Chromium，RNA-seq使用Illumina NovaSeq测序平台 |
| 2674 | 2026-08-14 |
Epithelial cell-based multi-omics integration identifies SPINK5 and SRI as novel diagnostic biomarkers for ulcerative colitis
2026, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2026.1797539
PMID:42358364
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量转录组数据，结合多种机器学习算法，识别出SPINK5和SRI作为溃疡性结肠炎的新型诊断生物标志物，并在临床样本中进行实验验证 | 首次从上皮细胞特异性角度整合多组学数据，利用四种机器学习算法交叉验证，确定SPINK5和SRI为UC的稳健诊断标志物，并通过多种实验方法在临床组织中验证其表达变化 | 研究基于公共数据集和有限临床样本，未进行大规模前瞻性验证，且免疫微环境分析采用估算方法（CIBERSORT），可能存在偏差 | 识别溃疡性结肠炎中上皮细胞来源的可靠诊断生物标志物，并评估其与免疫微环境的关系 | 溃疡性结肠炎患者的肠道上皮细胞和临床组织样本 | 机器学习 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序、批量转录组测序 | LASSO、随机森林、支持向量机、K近邻 | 基因表达数据 | 多个公共数据集和若干临床UC组织样本（具体数量未提供） | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 2675 | 2026-08-14 |
Understanding the immune microenvironment of ovarian cancer
2026, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2026.1837496
PMID:42358534
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序在揭示卵巢癌免疫微环境方面的进展，重点关注CD8 T细胞耗竭和免疫抑制机制，为精准免疫治疗提供转化框架 | 强调单细胞分辨率解析肿瘤免疫微环境中的免疫抑制屏障，揭示终末耗竭T细胞来自可塑性祖细胞群（如GZMK亚群），并阐明腹水作为免疫调节储库的作用 | 摘要中未提及具体局限性 | 总结单细胞RNA测序驱动的卵巢癌肿瘤免疫微环境研究进展，为精准免疫治疗策略提供依据 | 卵巢癌肿瘤免疫微环境中的免疫细胞，特别是CD8 T细胞、髓系细胞和淋巴样细胞 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2676 | 2026-08-14 |
PRDM1 Drives a TIM3+ Macrophage Immunosuppressive Niche via LGALS9 Signaling in Prostate Cancer Progression
2026, Oncology research
IF:2.0Q3
DOI:10.32604/or.2026.079316
PMID:42358835
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研究论文 | 本研究通过整合公共单细胞RNA-seq数据集，揭示了PRDM1驱动的TIM3+巨噬细胞免疫抑制微环境在前列腺癌进展中的作用，并验证了LGALS9-TIM3信号轴作为潜在治疗靶点 | 首次在前列腺癌中明确TIM3作为微环境检查点的髓系定位，并鉴定PRDM1为TIM3高表达巨噬细胞的上游转录调控因子，同时发现LGALS9-TIM3正反馈环路促进免疫抑制表型 | 主要基于公共数据集和体外实验，缺乏体内模型验证；未探讨TIM3阻断在联合治疗中的具体效果 | 阐明前列腺癌微环境中髓系检查点TIM3的谱系定位和调控机制，并评估其作为治疗靶点的潜力 | 前列腺癌微环境中的单核细胞/巨噬细胞，特别是TIM3高表达肿瘤相关巨噬细胞 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序、染色质免疫沉淀-定量PCR、荧光素酶报告基因实验 | 不适用 | 基因表达数据、表观遗传数据 | 多个公共单细胞RNA-seq数据集（包括原发、转移性激素敏感和去势抵抗性前列腺癌）及TCGA-PRAD和独立队列（具体样本量未提供） | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 不适用 |
| 2677 | 2026-08-14 |
The postpartum uterus reveals compartment-specific remodeling processes with distinct immune signatures
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1824792
PMID:42358955
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研究论文 | 本研究分析了产后子宫的区室特异性重塑过程及其免疫特征，揭示了肌层、内膜和子宫系膜三角区的独特重构机制。 | 首次通过单细胞RNA测序和动物模型，明确了产后子宫不同解剖区室（肌层、内膜、子宫系膜三角）的重塑过程及其独特的免疫细胞分布，特别是CD206neg巨噬细胞在损伤区域的浸润和胶原包膜对炎症的限制作用。 | 研究主要基于公开数据和动物模型，未直接验证人体组织中的免疫保护机制，且未完全阐明炎症消退与纤维化预防的因果关系。 | 探究产后子宫修复过程中不同区室的重塑机制及免疫微环境的作用，以理解组织再生与过度纤维化的平衡。 | 人类产后第7天和非妊娠个体的肌层单细胞RNA-seq数据，以及同种异体交配和未交配的C57/BL6雌性小鼠的子宫组织。 | 数字病理学 | 产后子宫修复相关疾病（如纤维化） | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、流式细胞术、免疫组织化学、免疫荧光、定量实时聚合酶链反应 | NA | 单细胞转录组数据、组织图像、基因表达数据 | 人类非妊娠和产后第7天的肌层样本（具体数量未说明），以及小鼠子宫组织（数量未说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2678 | 2026-08-14 |
Cytotoxic lymphocyte heterogeneity in glioblastoma: insights from single-cell and spatial multiomics toward precision immunotherapeutic reprogramming
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1837084
PMID:42358950
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综述 | 这篇综述整合了单细胞和空间多组学数据，探讨胶质母细胞瘤中细胞毒性淋巴细胞的异质性及其免疫抑制机制，并提出了精准免疫治疗策略。 | 创新性地从单细胞和空间多组学角度，系统比较CD8 T细胞和自然杀伤细胞的耗竭机制差异，并提出针对中枢神经系统肿瘤微环境的空间和细胞解析的精准免疫治疗框架。 | 由于是综述，未提供原始实验数据，且所引用的研究主要基于有限样本，可能无法全面代表胶质母细胞瘤的异质性。 | 旨在阐明胶质母细胞瘤中细胞毒性淋巴细胞异质性的免疫学机制，并为开发针对性的精准免疫治疗提供理论基础。 | 胶质母细胞瘤中的细胞毒性淋巴细胞（包括CD8 T细胞和自然杀伤细胞）及其肿瘤微环境。 | 单细胞组学、空间转录组学、免疫学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序、空间多组学 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 2679 | 2026-08-14 |
A Novel CAF-Related Signature for Precise Prediction of Clinical Outcomes and Immunotherapy Response for Breast Cancer Patients: Based on Multiomics Analyses and Experimental Validation
2026, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/mi/9934495
PMID:42359574
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研究论文 | 开发了一种基于癌症相关成纤维细胞（CAFs）的基因签名，通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，预测乳腺癌患者的临床结局和免疫治疗反应，并进行了实验验证。 | 首次整合单细胞RNA测序与批量RNA测序数据，构建包含11个基因的CAF相关风险评分模型，用于预测乳腺癌预后和免疫治疗反应，并通过多种实验方法验证了高风险基因的表达及CAF丰度与CD8+ T细胞浸润的相关性。 | 仍需在大型多中心队列中进一步验证，并扩展到其他恶性肿瘤以促进临床转化应用。 | 开发CAF相关基因签名，以预测乳腺癌患者的临床结局和免疫治疗反应，探索CAF在肿瘤微环境中的作用机制。 | 乳腺癌患者，包括来自TCGA和GEO数据库的基因表达谱和临床数据，以及临床乳腺癌组织样本。 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA-seq，qPCR，免疫组织化学（IHC），多重免疫荧光（mIF），Western blot | Cox回归，LASSO回归，风险评分模型 | 基因表达数据，临床数据，组织样本 | 未明确指定具体样本数量，包括TCGA和GEO数据库中的乳腺癌患者数据及临床组织样本。 | NA | 单细胞RNA测序，批量RNA测序，qPCR，免疫组织化学，多重免疫荧光，免疫印迹 | NA | NA |
| 2680 | 2026-08-14 |
Integrated NEK7-inflammasome and platelet transcriptomic signature generates mechanistic hypotheses in heart failure
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0352124
PMID:42361012
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研究论文 | 通过整合人类心力衰竭样本的 bulk RNA-Seq 和 scRNA-Seq 数据，识别与 NEK7 炎症小体和血小板活化相关的四基因特征，并生成心脏纤维化的发病机制假说 | 首次将 NEK7 炎症小体、血小板活化和心脏纤维化联系起来，通过整合转录组数据和机器学习方法识别新的四基因特征，并结合分子对接预测潜在治疗化合物 | 初步判别模型需在前瞻性多中心队列中进一步验证，部分基因（如 ISLR）在小鼠模型中表达增加不显著 | 探索心力衰竭中 NEK7 炎症小体、血小板活化和心脏纤维化之间的转录组关联，生成发病机制假说 | 人类心力衰竭样本和血管紧张素II诱导的小鼠心力衰竭模型 | 生物信息学 | 心力衰竭 | RNA-seq, 单细胞RNA测序(scRNA-Seq), 分子对接 | LASSO, SVM-RFE, WGCNA | 转录组数据（bulk和单细胞） | 多个公共数据集（GSE116250, GSE57338, GSE183852）及小鼠模型样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | NA |