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当前共找到 9441 篇文献,本页显示第 2621 - 2640 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
2621 2026-08-16
From islet to blood: macrophage remodeling signatures for diagnosis and risk stratification in type 1 diabetes
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究整合多组学数据,表征了1型糖尿病胰岛微环境中的巨噬细胞重塑特征,并开发了基于外周血的诊断和风险分层模型 首次将胰岛巨噬细胞异质性和重塑轨迹转化为外周血可检测的生物标志物,结合机器学习和SHAP分析提高了模型可解释性,并通过纵向队列验证了预后模型 未提及具体局限性 开发基于外周血的生物标志物,用于1型糖尿病的诊断和风险分层,以改进疾病进展预测 人类胰岛组织样本、外周血单个核细胞样本、小鼠胰腺组织 机器学习 1型糖尿病 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 机器学习模型(具体未提及,可能包括逻辑回归、随机森林等) 转录组数据、空间转录组图像 未明确提及具体数量,包含多个公开和内部外周血队列及纵向胰岛自身免疫队列 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq NA NA
2622 2026-08-16
Single cell transcriptomics analyses reveal functional heterogeneity and anti-tumor role of mast cells in esophageal squamous cell carcinoma
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过单细胞转录组学分析揭示了食管鳞状细胞癌中肥大细胞的功能异质性和抗肿瘤作用 首次在食管鳞状细胞癌中鉴定出五种肥大细胞亚型,并发现T型活化肥大细胞通过TNF-α发挥抗肿瘤作用 研究主要基于转录组数据,缺乏蛋白质水平的验证;功能实验仅限于体外,未在体内模型中验证 阐明肥大细胞在食管鳞状细胞癌中的异质性和功能状态,及其在肿瘤进展和免疫调节中的作用 食管鳞状细胞癌组织中的肥大细胞及其亚型,以及肿瘤微环境中的相互作用 单细胞转录组学 食管鳞状细胞癌 单细胞RNA测序、批量RNA测序、免疫荧光染色、空间转录组学 NA 单细胞转录组数据、批量转录组数据、空间转录组数据、免疫荧光图像 84例食管鳞状细胞癌样本(来自四个独立队列) NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
2623 2026-08-16
Clinical and immunological features of a patient exhibiting delayed puberty, microcephaly, scoliosis and epilepsy caused by a novel mutation in IGSF10
2026, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1
研究论文 本文研究了一名中国患者因IGSF10基因新发突变导致的青春期延迟、小头畸形、脊柱侧弯和癫痫,并通过全外显子测序和单细胞RNA测序分析了遗传缺陷和免疫变化 首次在IGSF10基因中鉴定出一个新发移码突变,并扩展了IGSF10缺陷的表型谱,提出其可能包括脊柱侧弯和癫痫,同时初步揭示了免疫扰动与生殖、神经和骨骼表型之间的潜在关联 研究仅基于单一病例,且免疫改变与临床表型的因果关系缺乏功能性验证 探究IGSF10基因新突变与青春期延迟、小头畸形、脊柱侧弯和癫痫的关联及其免疫机制 一名中国青春期延迟、小头畸形、脊柱侧弯和癫痫患者及其父母 基因组学 青春期延迟 全外显子测序, Sanger测序, 单细胞RNA测序, 定量实时PCR NA 基因测序数据, 单细胞转录组数据 1名患者和2名父母(外周血样本) NA 单细胞RNA测序 NA NA
2624 2026-08-16
Identification and validation of circadian rhythm and astrocyte-associated diagnostic and therapeutic model for cirrhosis encephalopathy patients via integrative bioinformatic pipelines and in vitro validation
2026, Frontiers in neuroscience IF:3.2Q2
研究论文 通过综合生物信息学流程和体外验证,识别并验证了与昼夜节律和星形胶质细胞相关的肝硬化脑病诊断和治疗模型 首次整合昼夜节律紊乱和星形胶质细胞功能障碍,揭示了它们在肝硬化脑病发病机制中的协同作用,并利用人工智能药物筛选框架发现潜在治疗化合物 研究主要基于公共数据库的转录组数据,体外验证仅使用细胞系,缺乏体内实验和临床样本的进一步验证 识别与昼夜节律和星形胶质细胞相关的肝硬化脑病诊断和治疗的分子靶点 肝硬化脑病患者及认知障碍患者的转录组和单细胞数据 生物信息学 肝硬化脑病 RNA测序、单细胞RNA测序 随机森林 基因表达数据、单细胞转录组数据 多个公共数据集,包括GSE41919、GSE53808、GSE184220、GSE149741和GSE163577,具体样本数量未明确 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
2625 2026-08-16
FN1 governs global protein lactylation in acute myocardial infarction: a metabolic-epigenetic axis driving cardiac injury and impeding stem cell repair
2026, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1
研究论文 本研究揭示纤维连接蛋白1(FN1)在急性心肌梗死中调控全局蛋白质乳酸化,通过代谢-表观遗传轴驱动心脏损伤并阻碍干细胞修复 首次发现FN1作为蛋白质乳酸化的关键上游调控因子,连接代谢应激与表观遗传修饰,并揭示靶向FN1-乳酸化轴结合干细胞治疗的新策略 研究主要基于细胞和动物模型,需要进一步临床验证;FN1的经典功能(如纤维化)可能独立于乳酸化作用,需深入区分 识别急性心肌梗死中蛋白质乳酸化的核心调控因子,并开发微环境重编程策略以增强干细胞治疗 急性心肌梗死患者转录组数据、氧糖剥夺细胞模型、小鼠梗死模型、人子宫内膜间充质干细胞 机器学习、单细胞RNA测序 急性心肌梗死 转录组测序、单细胞RNA测序、机器学习、基因沉默、乳酸补充 机器学习算法、单细胞RNA测序分析方法 转录组数据、单细胞RNA测序数据 急性心肌梗死患者样本及小鼠模型(具体数量未提供) NA 单细胞RNA测序 NA NA
2626 2026-08-16
APOE-associated lipid-handling macrophages in hepatocellular carcinoma: ligand-receptor communication and host Apoe-linked myeloid remodeling
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究分析了10例肝细胞癌患者的配对肿瘤及邻近肝组织单细胞转录组数据,发现APOE相关脂质处理巨噬细胞在肿瘤中富集,并探讨了其配体-受体通讯及宿主Apoe连锁的髓系重塑。 首次在肝细胞癌中系统表征APOE阳性脂质处理巨噬细胞,并利用CellChat推断其介导的配体-受体相互作用,结合多种小鼠模型验证宿主Apoe缺陷对肿瘤微环境的影响。 研究主要基于单细胞转录组数据,缺乏蛋白质水平的验证;小鼠模型与人类HCC的差异可能限制结论的普适性;未深入探讨APOE信号通路的分子机制。 探究肝细胞癌中脂质处理巨噬细胞的状态富集及其与配体-受体通讯和肿瘤微环境重塑的关系,并验证宿主Apoe的作用。 10例肝细胞癌患者的肿瘤和邻近肝组织、Hepa1-6皮下肿瘤模型、Nras-Myc驱动的肝肿瘤模型、骨髓来源巨噬细胞。 数字病理学 肝细胞癌 单细胞RNA测序 CellChat、模块评分 单细胞转录组数据 10例患者的配对样本;小鼠模型若干 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2627 2026-08-16
Nfe2l2-knockout mouse model exhibits oxidative stress-associated stromal degeneration and inflammatory activation resembling keratoconus pathology
2026, PeerJ IF:2.3Q2
研究论文 本研究利用CRISPR/Cas9技术生成Nfe2l2基因敲除小鼠模型,发现其角膜呈现与圆锥角膜相似的氧化应激相关基质变性和炎症激活特征 首次建立了NRF2缺失与圆锥角膜病理学关联的体内小鼠模型,并利用全角膜单细胞RNA测序揭示多种细胞类型的变化及细胞间信号重塑 摘要未提及具体局限性,如模型仅模拟部分病理特征,或需进一步验证人类相关性 探究NRF2缺失如何驱动氧化应激和炎症反应,导致角膜基质退化及神经改变,并验证NRF2激活剂RTA-408的潜在治疗效果 Nfe2l2基因敲除小鼠的角膜组织,包括上皮、基质、神经及免疫细胞 数字病理学 圆锥角膜 CRISPR/Cas9基因敲除、单细胞RNA测序、光学相干断层扫描、组织学、免疫荧光、透射电子显微镜、活性氧检测 基因敲除小鼠模型 图像、基因表达数据、组织学数据 4个月大的Nfe2l2敲除小鼠与对照小鼠,具体数量未在摘要中指明 NA 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序,使用Seurat和CellChat进行数据分析
2628 2026-08-16
ArchetypeShift: An R Package Integrating KEGG-Informed Pathway Analysis and IPA-Derived Functional Predictions for Validation of Single-Cell Archetypes
2026, Bioinformatics and biology insights IF:2.3Q3
研究论文 ArchetypeShift是一个R包,整合KEGG通路分析和IPA功能预测,用于验证单细胞RNA测序数据中的功能原型 整合现有原型分析方法与IPA和KEGG注释,提供一体化分析框架,自动化生成多种图形和轨迹分析,简化生物学解释 未提及 简化单细胞RNA测序数据中功能原型的分配和注释过程,提高效率 单细胞RNA测序数据 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 原型分析 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
2629 2026-08-16
Regulatory effects of smoking cessation on the cellular microenvironment and differentially expressed genes in precancerous lesions of pulmonary nodules in mice based on single-cell RNA sequencing and immune repertoire-sequencing
2026, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 本研究基于单细胞RNA测序和免疫组库测序,探讨戒烟对小鼠肺结节癌前病变细胞微环境和差异表达基因的调控作用 首次利用单细胞RNA测序和免疫组库测序技术,在B[a]P诱导的小鼠肺结节癌前病变模型中,系统揭示戒烟(B[a]P撤除)对免疫细胞组成、信号通路和基因表达的调控机制 研究仅在动物模型中进行,尚未在人类样本中验证;且观察时间仅为8周,长期效果未知 阐明戒烟影响肺结节癌前病变发展的调控机制,为其临床益处提供机制见解 B[a]P诱导的肺结节癌前病变小鼠模型 单细胞测序, 转录组学, 免疫组库测序 肺癌, 肺结节癌前病变 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 免疫组库测序(IR-seq), 微MRI, H&E染色 不适用 单细胞基因表达数据, 免疫组库序列数据, 影像数据, 组织病理图像 小鼠模型,具体样本数量未提供 NA 单细胞RNA测序, 免疫组库测序 NA NA
2630 2026-08-15
Integrative single-cell sequencing and environmental metabarcoding reveals genetic complexity and hidden diversity of the dinoflagellate Tripos (Dinophyceae)
2026-Sep, Harmful algae IF:5.5Q1
研究论文 整合单细胞测序与环境宏条形码技术,揭示甲藻Tripos属的遗传复杂性和隐藏多样性,为分类学复杂的甲藻提供分子-形态参考框架 首次整合单细胞形态学分析、单细胞18S rDNA V4高通量测序和eDNA宏条形码技术,首次鉴定13种Tripos物种的18S rDNA V4序列,并发现每个细胞存在一个优势ASV伴随多个非优势ASV的普遍核糖体DNA基因内变异现象 基于形态学与分子数据的物种对应关系复杂,存在一对一、一对多和多对多关系,可能限制不同生态地理区域间结果的直接可比性 整合单细胞测序与环境宏条形码技术,提高分类学复杂的甲藻Tripos属的物种级分辨率和物种多样性理解 从南海和山东沿海区域分离的113个Tripos单细胞以及1578个环境野外样本 基因组学、生态学 无 单细胞18S rDNA V4高通量测序、eDNA宏条形码 NA DNA序列、形态学图像 89个南海Tripos单细胞、24个山东沿海Tripos单细胞、1578个环境样本 NA 单细胞克隆测序、环境DNA宏条形码 NA NA
2631 2026-08-15
Integrated scRNA-Seq and ATAC-Seq Decipher the Xylem Development Atlas and Regulatory Landscape in Rubber Tree (Hevea brasiliensis)
2026-Aug-14, Plant, cell & environment
研究论文 利用单细胞RNA测序和ATAC测序构建橡胶树木质部发育图谱及调控网络,揭示不同生长速率品种间的细胞异质性和转录调控差异 首次建立橡胶树分化中木质部的单细胞转录组图谱,并整合ATAC-seq揭示品种特异性的染色质可及性和转录因子结合基序,通过拟南芥突变体验证关键基因功能 未提供明确的局限性信息 阐明橡胶树木质部分化过程中的细胞异质性和调控网络,为遗传改良提供资源和靶点 橡胶树两个品种(RK525和RY73397)的分化中木质部原生质体 单细胞组学 NA scRNA-seq, ATAC-seq, WGCNA NA 单细胞基因表达数据、染色质可及性数据 两个橡胶树品种的木质部原生质体,具体细胞数量未提供 NA 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 NA NA
2632 2026-08-15
Clinical, genomic, and spatial transcriptomic features of pancreatic adenosquamous carcinoma support subtype-specific therapeutic strategies
2026-Aug-14, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research IF:10.0Q1
研究论文 本研究旨在表征胰腺腺鳞癌(ASQ)的临床结局、基因组景观和空间转录组结构,并与传统胰腺导管腺癌(PDAC)进行比较。 首次利用空间转录组学分析ASQ的肿瘤微环境,发现其免疫细胞共定位模式与PDAC不同,且鳞状区域富集EMT、炎症等通路,为亚型特异性治疗策略提供依据。 回顾性设计、单中心样本、空间转录组样本量小(n=11),可能影响结果的普遍性。 比较ASQ与PDAC的临床、分子和空间转录组特征,探索亚型特异性治疗策略。 胰腺腺鳞癌(ASQ)和胰腺导管腺癌(PDAC)患者的肿瘤样本。 数字病理学、空间转录组学 胰腺癌 空间转录组学(Visium)、基因组分析(FoundationCore) NA 临床数据、基因组数据、空间转录组数据 178例ASQ患者(2013-2023)、244例ASQ和29,021例PDAC基因组数据、11例ASQ肿瘤样本(来自8例患者)和4例PDAC样本 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium 10x Visium空间转录组学分析
2633 2026-08-15
Integrated population-based evidence, network toxicology, single-cell profiling, and in vitro studies elucidate mechanisms connecting PAHs to stroke
2026-Aug-13, Ecotoxicology and environmental safety IF:6.2Q1
研究论文 通过整合人群暴露分析、网络毒理学、转录组学、单细胞测序和体外实验,阐明多环芳烃暴露(以2-萘酚为代表)与卒中风险关联的潜在机制 首次结合多层次框架(人群流行病学、网络毒理学、单细胞测序和体外验证)来揭示多环芳烃代谢物2-NAP与卒中之间的细胞类型特异性机制,并确定LAMP2为关键靶点 研究主要依赖横断面数据,无法确证因果关系;PAH代谢物仅以2-NAP为代表,可能无法全面反映所有PAH暴露的影响;体外实验主要基于细胞模型,需进一步验证在体效果 探讨PAH暴露与卒中风险的关联,并揭示其分子机制和细胞类型特异性 人群样本、细胞系(内皮细胞、巨噬细胞、小胶质细胞) 数字病理学 心血管疾病 网络毒理学、转录组学、单细胞RNA测序、分子对接、体外实验 机器学习模型 人群数据、转录组数据、单细胞表达数据、图像 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
2634 2026-08-15
ATP6AP2 dysregulation as a central hub in DMD pathogenesis: An integrated multi-omics and therapeutic study
2026-Aug-13, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 该研究通过多组学分析揭示了ATP6AP2在杜氏肌营养不良症发病机制中的核心作用,并验证了替莫唑胺的治疗潜力 首次通过单细胞RNA测序识别ATP6AP2为DMD中多种肌肉细胞类型的关键上调基因,并利用CMap分析发现替莫唑胺作为潜在治疗药物,通过体内外实验验证其通过调节ATP6AP2信号轴和抑制巨噬细胞介导的炎症反应来减轻肌营养不良病理 研究主要在mdx小鼠模型中进行,未在人类样本中验证;替莫唑胺的作用机制尚需进一步探索其临床适用性和长期安全性 阐明DMD中ATP6AP2失调的细胞驱动机制,并评估替莫唑胺作为新型免疫药理学治疗策略的潜力 杜氏肌营养不良症(DMD)小鼠模型(mdx和严重mdx小鼠)及相关的骨骼肌细胞类型,如内皮细胞、成纤维细胞和成肌细胞 多组学分析、单细胞转录组学、药物重定位 杜氏肌营养不良症 单细胞RNA测序、加权基因共表达网络分析、富集分析、连接图谱分析、转录组学、代谢组学、免疫荧光、Western blot WGCNA、CMap 单细胞转录组数据、转录组数据、代谢组数据、图像、蛋白表达数据 涉及mdx和严重mdx小鼠,具体样本量未提及 NA 单细胞RNA测序 NA NA
2635 2026-08-15
Spatial transcriptomics reveals heterogeneity in rejection and recovery after heart transplantation
2026-Aug-13, Nature cardiovascular research IF:9.4Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
2636 2026-08-15
hoodscanR: profiling single-cell neighborhoods in spatial transcriptomics data
2026-Aug-13, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 开发了hoodscanR,一个用于空间转录组数据中单细胞邻域分析与可视化的Bioconductor包 提出细胞级邻域概率图谱,支持部分成员关系,超越了传统的硬分配方法 未提及具体局限性 精确识别和分析空间转录组数据中的细胞邻域 乳腺癌和肺癌数据集 生物信息学 乳腺癌、肺癌 空间转录组学 概率模型(邻域概率图谱) 空间转录组数据 多个数据集(具体数量未指定) NA 空间转录组学 NA NA
2637 2026-08-15
GCAN: A data feature learning method for scRNA-seq data
2026-Aug-07, Computational biology and chemistry IF:2.6Q2
研究论文 提出一种针对单细胞RNA测序数据的数据特征学习方法,通过自适应高变基因选择和混合图自编码器改善聚类性能 结合改进随机森林进行自适应HVG选择,融合图注意力网络和图卷积网络的混合图自编码器,并采用MMD正则化和Spearman相关性特征过滤进行生物学信息优化 未在摘要中明确说明局限性 自动识别噪声scRNA-seq数据中的生物学相关特征,建模多尺度细胞关系以实现稳健聚类,并提供可解释的表征用于机制洞察 多个单细胞RNA测序数据集中的细胞 机器学习 NA 单细胞RNA测序 混合图自编码器(图注意力网络与图卷积网络) 基因表达数据 17个scRNA-seq数据集 NA 单细胞RNA测序 NA NA
2638 2026-08-14
Prognostic and diagnostic evaluation of HSPG2 gene expression in oral squamous cell carcinoma: A case-control study
2026-Oct, Archives of oral biology IF:2.2Q2
研究论文 本研究评估了口腔鳞状细胞癌中HSPG2基因的表达,并利用外部数据集验证其临床相关性,发现其在组织和血浆中高表达,且与不良预后相关 首次在口腔鳞状细胞癌中结合qRT-PCR、TCGA和单细胞RNA-seq数据,全面评估HSPG2的表达及其诊断和预后价值,特别关注了非洲裔美国患者中的预后差异 样本量较小(25例患者和25例对照),且唾液样本中的HSPG2表达无显著差异,可能限制了其作为非侵入性生物标志物的应用 评估HSPG2在口腔鳞状细胞癌中的表达及其作为诊断和预后生物标志物的潜力 口腔鳞状细胞癌患者和健康对照的组织、血浆和唾液样本 数字病理学 口腔鳞状细胞癌 qRT-PCR, 单细胞RNA-seq NA 基因表达数据, 临床数据 25例口腔鳞状细胞癌患者和25例匹配健康对照 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2639 2026-08-14
Dimethylglycine accelerate atherosclerosis by mediating macrophages ferroptosis via NRF2 pathway suppression
2026-Oct, Pathology, research and practice
研究论文 本研究通过病例对照研究、前瞻性队列研究及体内外实验,揭示二甲基甘氨酸通过抑制NRF2核转位介导巨噬细胞铁死亡,加速动脉粥样硬化进程 首次发现DMG通过结合NRF2蛋白的I559位点抑制其核转位和GPX4/xCT启动子富集,从而促进巨噬细胞铁死亡,加速动脉粥样硬化 未在更大规模人群中验证DMG与MACE的关联,且未探讨DMG对其他细胞类型或信号通路的影响 阐明DMG在动脉粥样硬化进展中对巨噬细胞的具体作用及分子机制 冠心病患者、ApoE敲除小鼠、THP-1巨噬细胞 数字病理学 冠心病 单细胞RNA测序、蛋白质组学、分子对接、定点突变 NA 基因表达、蛋白质、临床数据 冠心病患者(具体数量未提供)、ApoE敲除小鼠、THP-1细胞 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'试剂盒
2640 2026-08-14
Occlusal abnormalities and temporomandibular joint osteoarthritis: A narrative review of cross-scale mechanical-metabolic-immune mechanisms
2026-Oct, Archives of oral biology IF:2.2Q2
综述 本文综合近期多尺度证据,提出咬合异常在颞下颌关节骨关节炎发病机制中作用的统一机械-代谢-免疫框架。 提出一个统一的机械-代谢-免疫框架,整合了从分子(如Piezo1、整合素)到细胞(如巨噬细胞)再到组织器官(颞下颌关节)的多尺度机制,并强调性别差异在疾病发生中的潜在作用。 缺乏颞下颌关节特异性的验证,尤其是性别相关免疫调节机制在TMJ中的直接证据不足。 阐明咬合异常通过机械转导、代谢重编程和免疫重塑促进颞下颌关节骨关节炎的机制。 颞下颌关节骨关节炎相关的临床、影像、动物、细胞、组学和机制研究。 生物医学 颞下颌关节骨关节炎 文献综述、单细胞转录组学、谱系追踪 NA 文献数据、单细胞转录组数据 不适用(综述性文章) NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA NA
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