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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
2601 2026-02-07
Mechanistic Insights into Threonine Tyrosine Kinase Mediated Cell Cycle Regulation in Triple-negative Breast Cancer
2026 Jan-Feb, Cancer genomics & proteomics IF:2.6Q3
研究论文 本研究探讨了苏氨酸酪氨酸激酶(TTK)在三阴性乳腺癌(TNBC)中通过调控细胞周期和Wnt/β-catenin信号通路驱动肿瘤进展的机制 结合bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据,揭示了TTK在细胞周期S期和G2/M期特异性高表达,并通过维持β-catenin-Cyclin D1信号轴促进TNBC增殖的新机制 研究主要基于体外细胞实验和生物信息学分析,缺乏体内动物模型验证和临床样本的直接功能验证 阐明TTK在三阴性乳腺癌发生发展中的分子机制,并评估其作为预后生物标志物和治疗靶点的潜力 三阴性乳腺癌细胞系、正常乳腺上皮细胞、公共乳腺癌RNA-seq数据集(包括bulk和单细胞数据) 癌症生物学 乳腺癌(三阴性亚型) RNA测序(bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq)、siRNA敲低、细胞增殖/克隆形成/迁移实验、细胞周期分析、免疫荧光、Western blot、功能富集分析、蛋白质-蛋白质相互作用分析、拟时序轨迹分析 NA 基因表达数据(RNA-seq)、蛋白质表达数据、细胞功能表型数据 未明确指定具体样本数量,使用了公共数据集、TNBC细胞系和正常乳腺上皮细胞 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
2602 2026-02-07
Exosomes Transfer ST6GAL1-mediated Therapeutic Resistance in Rectal Cancer Cells
2026 Jan-Feb, Cancer genomics & proteomics IF:2.6Q3
研究论文 本研究揭示了直肠癌细胞通过外泌体转移ST6GAL1蛋白介导放化疗耐药的机制 首次证明ST6GAL1蛋白可通过外泌体在直肠癌细胞间转移,导致治疗耐药性扩散 研究主要基于细胞系和类器官模型,缺乏临床样本验证 探究直肠癌放化疗耐药性的传播机制 结直肠癌细胞系和类器官 肿瘤生物学 直肠癌 单细胞RNA测序,流式细胞术 NA RNA测序数据,流式细胞数据 4个重复实验 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2603 2026-02-07
Adding highly variable genes to spatially variable genes can improve cell type clustering performance in spatial transcriptomics data
2026, Bioinformatics advances IF:2.4Q2
研究论文 本研究探讨在空间转录组学数据中,将高变异基因与空间变异基因结合是否能提升细胞类型聚类性能 首次系统评估了高变异基因与空间变异基因联合使用对空间转录组学数据聚类性能的影响,覆盖了超过50个真实数据集和多种平台 未详细探讨不同基因组合策略(如加权或集成方法)对聚类性能的潜在影响,且可能受限于所选数据集的代表性 评估高变异基因与空间变异基因结合在空间转录组学数据中提升细胞类型聚类性能的效果 空间转录组学数据集中的基因表达数据 空间转录组学 NA 空间转录组学技术 NA 转录组数据 超过50个真实空间转录组学数据集 NA 空间转录组学 NA NA
2604 2026-02-07
Single-Cell Sequencing Reveals the Immunosuppressive Trajectory in the Tumor Microenvironment of Human Giant Cell Tumor of Bone
2026, BioMed research international IF:2.6Q3
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了骨巨细胞瘤肿瘤微环境中的细胞异质性、免疫抑制轨迹及细胞间相互作用 首次在骨巨细胞瘤中应用单细胞RNA测序技术,系统描绘了其肿瘤微环境的细胞图谱,并揭示了肿瘤相关巨噬细胞、T细胞亚群的分化轨迹及细胞间通讯网络 样本量有限(仅一个肿瘤样本的7091个细胞),缺乏多中心或大样本验证,且为术后样本,可能无法完全反映体内原始状态 解析骨巨细胞瘤肿瘤微环境的复杂细胞组成、基因表达模式及免疫抑制机制 骨巨细胞瘤手术切除后的肿瘤组织细胞 单细胞组学 骨巨细胞瘤 单细胞RNA测序 伪时间轨迹分析,CellPhoneDB细胞互作分析 单细胞转录组数据 7091个细胞(来自一个骨巨细胞瘤样本) NA 单细胞RNA-seq NA NA
2605 2026-02-07
A Narrative Review of Synaptic Transmission and Its Role in Neurological and Psychiatric Disorders: A Molecular Perspective
2026-Jan, Cureus
综述 本文从分子角度,综述了突触传递在多种神经和精神疾病中的作用,并整合了分子遗传学、突触蛋白质组学、神经影像学和系统神经科学的最新进展,提出了一个跨诊断的系统级框架 整合了不同疾病背景下关于突触功能障碍的分散知识,提出了一个跨神经和精神疾病的、以突触为中心的系统级统一框架,并指出了具有转化潜力的新兴工具 作为一篇叙述性综述,其结论主要基于对现有文献的综合分析,而非原始研究数据,且所提出的框架仍需未来实验验证 旨在弥合关于突触功能障碍在神经和精神疾病中作用的现有知识鸿沟,提供一个整合的、跨疾病的分子视角 突触传递的分子过程及其在精神分裂症、自闭症谱系障碍、阿尔茨海默病、癫痫、重度抑郁症和帕金森病等疾病中的功能障碍 神经科学 神经和精神疾病(包括精神分裂症、自闭症谱系障碍、阿尔茨海默病、癫痫、重度抑郁症、帕金森病) 分子遗传学, 突触蛋白质组学, 神经影像学, 系统神经科学, 单细胞RNA测序, 空间蛋白质组学, 突触正电子发射断层扫描成像 NA NA NA NA 单细胞RNA测序, 空间蛋白质组学 NA NA
2606 2026-02-07
Diabetic kidney disease: integrating multi-omics insights, artificial intelligence, and novel therapeutics for precision medicine
2026, Frontiers in genetics IF:2.8Q2
综述 本文综述了糖尿病肾病研究的最新进展,重点整合了多组学见解、人工智能应用及新型治疗策略,以推动精准肾病学的发展 整合单细胞RNA测序、空间转录组学、代谢组学等多组学数据与人工智能深度学习模型,揭示了疾病异质性、早期代谢紊乱及免疫失调机制,并探讨了针对炎症、纤维化和代谢通路的新型治疗靶点 作为一篇综述文章,未涉及原始实验数据或具体模型验证,主要基于现有文献进行综合评述,可能未涵盖所有最新研究 旨在通过整合多组学技术、人工智能和新型治疗方法,实现糖尿病肾病的早期检测、精准风险分层和个性化管理 糖尿病肾病(DKD)的分子机制、生物标志物、疾病进展路径及治疗策略 数字病理学 糖尿病肾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、空间转录组学、代谢组学 深度学习模型(如DeepDKD) 图像(视网膜图像)、多组学数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
2607 2026-02-07
Synthetic Assessment of Transfer Learning Method From Cell Lines to Single-Cell on Drug Response Prediction
2026 Jan-Feb, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
研究论文 本研究首次对基于迁移学习的单细胞药物反应预测代表性模型进行了全面评估 首次系统性地比较和评估了从细胞系到单细胞的药物反应预测迁移学习方法,填补了该领域缺乏系统性评估的空白 研究依赖于公开数据集,可能无法覆盖所有临床场景;评估主要基于现有方法,未提出新的算法 评估迁移学习方法在单细胞药物反应预测中的效果,为模型选择和设计提供方法学指导 单细胞表达数据与药物敏感性预测模型 机器学习 癌症(泛指肿瘤疾病) 单细胞测序 迁移学习模型 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
2608 2026-02-07
Identification of common genes and biomarkers between Dermatomyositis and rheumatoid arthritis through integrated bioinformatics
2026, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 本研究通过整合生物信息学和机器学习方法,鉴定了皮肌炎和类风湿关节炎共有的关键基因、生物标志物及免疫微环境特征 首次通过整合多组学数据、加权基因共表达网络分析和机器学习模型,系统性地揭示了皮肌炎与类风湿关节炎共有的分子机制和免疫微环境重塑特征,并识别出具有诊断潜力的核心基因 研究主要基于公共数据库的转录组数据,缺乏实验验证;样本量有限,且外部验证队列的规模有待扩大 阐明皮肌炎与类风湿关节炎共病的分子机制,并识别潜在的诊断生物标志物 皮肌炎和类风湿关节炎患者的基因表达数据及免疫微环境 生物信息学 自身免疫性疾病 微阵列基因表达分析,单细胞RNA测序,加权基因共表达网络分析,机器学习建模 LASSO回归,随机森林 基因表达数据 基于多个GEO数据集(GSE55235, GSE55457, GSE12021, GSE159117),具体样本数未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2609 2026-02-07
Cellular plasticity and regenerative mechanisms in the lung
2026-Jan, European respiratory review : an official journal of the European Respiratory Society IF:9.0Q1
综述 本文综述了肺组织在应对环境损伤时,其上皮细胞(尤其是驻留干细胞和祖细胞)的可塑性与再生机制,并探讨了这些机制在慢性肺病中的作用及治疗潜力 整合了动物模型和人类肺研究的最新发现,利用单细胞和空间转录组学揭示了新的祖细胞状态和过渡中间态,强调了细胞可塑性在正常修复和疾病发病机制中的核心作用 NA 阐明肺上皮细胞在损伤后的再生机制,并探讨其在慢性肺病(如特发性肺纤维化和COPD)中的病理意义及治疗靶点 肺组织中的驻留干细胞和祖细胞(如基底细胞、肺泡II型细胞、变异克拉拉细胞、细支气管肺泡干细胞等)及其在损伤修复中的行为 数字病理学 肺病 单细胞转录组学,空间转录组学 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
2610 2026-02-06
Single-cell transcriptomics and machine-learning reveal M1 macrophage-driven progression from minimal change disease to focal segmental glomerulosclerosis
2026-Dec, Renal failure IF:3.0Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组学和机器学习,揭示了M1巨噬细胞驱动从微小病变肾病向局灶节段性肾小球硬化进展的关键基因 首次结合单细胞转录组学和机器学习识别出六个与M1巨噬细胞激活相关的关键基因,作为预测疾病进展的潜在生物标志物 研究主要基于小鼠和SD大鼠模型,人类样本验证有限,且疾病进展机制可能涉及更多因素 探究微小病变肾病向局灶节段性肾小球硬化进展的分子机制,并识别预测性生物标志物 MCD和FSGS患者的单细胞转录组数据,以及SD大鼠模型 机器学习 肾病综合征 单细胞转录组学,qRT-PCR,免疫组织化学染色 机器学习算法 单细胞转录组数据,基因表达数据 基于公开数据集GSE213030和GSE176465,以及SD大鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2611 2026-02-06
Research on tissue-resident macrophages in the field of cancer research: a bibliometric analysis from 2004 to 2025
2026-Dec, Cell adhesion & migration IF:3.3Q3
综述 本研究通过文献计量学方法分析了2004年至2025年间肿瘤研究中组织驻留巨噬细胞的研究现状与趋势 采用VOSviewer、CiteSpace、R软件和WoSCC构建可视化文献计量网络,对TRMs在肿瘤学领域的研究进行定量分析,并深入探讨未来研究方向 NA 分析肿瘤微环境中组织驻留巨噬细胞的研究现状、热点和趋势 组织驻留巨噬细胞(TRMs),特别是小胶质细胞和库普弗细胞等亚群 肿瘤学 癌症 文献计量分析,单细胞测序 NA 文献数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
2612 2026-02-06
Efferocytosis-associated transcriptomic patterns characterize prognosis and immune landscape in osteosarcoma
2026-Apr, Journal of bone oncology IF:3.1Q2
研究论文 本研究通过整合多组学数据,构建了一个与胞葬作用相关的骨肉瘤预后特征,并揭示了MAGEA11通过Gas6-MERTK/AXL通路促进免疫抑制的机制 首次在骨肉瘤中系统性地将胞葬作用与预后、免疫微环境及单细胞/空间转录组特征联系起来,并鉴定出关键基因MAGEA11的功能机制 研究结论主要基于生物信息学分析和有限的实验验证,需要在更大规模的独立队列和更深入的体内外模型中进一步确认 阐明胞葬作用在骨肉瘤进展和免疫微环境重塑中的作用,并开发相关的预后标志物 骨肉瘤患者(来自TARGET-OS和GEO数据库的队列)及相关的细胞与动物模型 生物信息学,计算生物学,肿瘤免疫学 骨肉瘤 单细胞RNA测序,空间转录组学,加权基因共表达网络分析,机器学习模型,体内外功能实验 StepCox + Ridge 回归模型,机器学习模型 转录组数据,单细胞RNA-seq数据,空间转录组数据 多个公共数据库队列(TARGET-OS及三个GEO数据集)用于建模与验证,额外包括6名骨肉瘤患者的单细胞RNA-seq数据 NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
2613 2026-02-06
Oyster cellular architecture and innate immune programs resolved by single-cell RNA sequencing
2026-Mar, Fish & shellfish immunology IF:4.1Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序解析了香港牡蛎的组织细胞结构及其先天免疫程序 首次在海洋无脊椎动物中构建了组织分辨的单细胞图谱,定义了二十种细胞类型,揭示了吞噬细胞谱系的三种终末策略以及神经、上皮和免疫细胞群之间以NCAM和PTPRM为中心的关键通讯通路 研究聚焦于单一物种(香港牡蛎),其发现向其他海洋无脊椎动物的普适性有待验证 解析海洋无脊椎动物屏障黏膜组织的细胞结构、功能分工及先天免疫程序 香港牡蛎(Crassostrea hongkongensis)的组织细胞 单细胞组学 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 未明确说明样本数量 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2614 2026-02-06
Overexpression, clinical significance and potential mechanisms of protein kinase D1 in hepatocellular carcinoma: multi-omic analyses and pharmacological insights
2026-Feb-05, Functional & integrative genomics IF:3.9Q1
研究论文 本研究通过多组学分析和药理学实验,揭示了蛋白激酶D1 (PRKD1) 在肝细胞癌中的过表达、临床意义、潜在机制及其作为治疗靶点的潜力 首次在肝细胞癌中系统整合了免疫组化、bulk RNA测序、单细胞RNA测序和体外功能实验,全面阐明了PRKD1在肿瘤进展、免疫微环境调控和酪氨酸激酶抑制剂反应中的多面性作用,并发现了硝基氯喹啉作为潜在抑制剂 研究主要基于体外实验和回顾性数据分析,缺乏体内动物模型验证和前瞻性临床队列的验证 探究PRKD1在肝细胞癌中的表达、功能、临床意义及其作为治疗靶点的潜力 肝细胞癌组织、细胞系 (包括THP-1细胞) 及相关转录组数据 数字病理 肝细胞癌 免疫组织化学, bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, 体外功能实验, 分子对接 NA 图像, 转录组数据 339对肝细胞癌组织与癌旁组织,以及多中心bulk转录组数据和单细胞转录组数据 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
2615 2026-02-06
Dissecting the development of bovine testicular tissue using spatial transcriptomics
2026-Feb-05, Journal of animal science and biotechnology IF:6.3Q1
研究论文 本研究首次构建了牛睾丸组织的空间转录图谱,系统描述了精子发生过程中的动态转录变化 首次利用Stereo-seq技术构建牛睾丸组织的空间转录图谱,揭示了牛生殖细胞群体的动态转录过程 NA 研究牛睾丸组织的发育过程,特别是精子发生期间的转录动态 牛睾丸组织,包括两个年龄段的样本(小牛和成年公牛) 空间转录组学 NA 空间转录组学 NA 空间转录组数据 两个年龄段的牛睾丸组织样本(小牛和成年公牛) NA 空间转录组学 Stereo-seq NA
2616 2026-02-06
Single-cell RNA sequencing reveals the heterogeneity and microenvironment of temporal bone squamous cell carcinoma
2026-Feb-05, Clinical and experimental otorhinolaryngology IF:2.9Q1
研究论文 本研究首次利用单细胞RNA测序技术揭示了颞骨鳞状细胞癌的肿瘤异质性和微环境特征 首次报道了颞骨鳞状细胞癌的单细胞RNA测序数据,揭示了其肿瘤异质性、细胞分化轨迹以及免疫细胞间通讯特征 样本量较小(仅6名患者),且为罕见疾病,限制了结果的普适性 揭示颞骨鳞状细胞癌的肿瘤异质性和微环境特征,以寻找诊断和治疗生物标志物 颞骨鳞状细胞癌患者组织样本 数字病理学 颞骨鳞状细胞癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 6名患者的9个样本(5个癌组织,4个癌旁正常组织),共计113,344个细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2617 2026-02-06
XCR1+ Conventional type 1 dendritic cells exacerbate the inflammation in osteogenic arthritis through IL-17A+CD8+ T cells
2026-Feb-05, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和TCR分析,揭示了XCR1+传统1型树突状细胞通过IL-17A+CD8+ T细胞加剧骨性关节炎炎症的机制 首次发现cDC1s在骨性关节炎中通过MHC I抗原呈递与CD8+ T细胞相互作用,并利用versican衍生肽建立新型AS小鼠模型 样本量较小(33例患者标本),且小鼠模型可能无法完全模拟人类疾病复杂性 探究强直性脊柱炎和附着点炎相关关节炎的病理机制,特别是免疫细胞在骨重塑关节炎中的作用 早期类风湿关节炎和强直性脊柱炎患者的病变组织,以及新型AS小鼠模型 数字病理学 骨性关节炎 单细胞RNA-seq, TCR分析, 流式细胞术, 多重免疫荧光 NA RNA序列数据, 图像数据 33例患者标本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2618 2026-02-06
Single-Cell Sequencing Reveals Varying Cell-Mediated Immunity Profiles in Individuals with Distinct Antibody Responses Following Ad5-nCoV Booster
2026-Feb-05, The Journal of infectious diseases IF:5.0Q1
研究论文 本研究通过单细胞测序技术,分析了Ad5-nCoV加强针接种后不同抗体反应个体的细胞介导免疫特征,揭示了细胞免疫在疫苗免疫应答中的关键作用 首次在Ad5-nCoV加强针接种背景下,结合单细胞测序技术系统比较了高、低抗体滴度个体的细胞动态、转录组谱、免疫受体库和细胞通讯差异,为疫苗效力评估提供了整合体液和细胞免疫的新视角 研究样本仅基于PBMC,未涉及组织特异性免疫反应;队列规模为144人,可能限制了对罕见细胞亚群的检测;研究为观察性设计,未进行机制验证实验 探究Ad5-nCoV加强针接种后个体间免疫应答差异的细胞和分子机制,以完善疫苗效力评估框架 144名Ad5-nCoV加强针接种者的外周血单个核细胞(PBMC)样本,按抗体滴度分为高反应组和低反应组 单细胞组学 传染病(COVID-19) 单细胞测序 NA 单细胞转录组数据、免疫受体序列数据 144名参与者的PBMC样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2619 2026-02-06
Novel insights into the mechanism of formaldehyde-induced lung cancer: a network toxicology and molecular docking approach
2026-Feb-05, Toxicology mechanisms and methods IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过网络毒理学和分子对接技术,探索甲醛对肺癌的复杂影响,揭示其分子机制 结合网络毒理学、分子对接和单细胞RNA测序数据挖掘,从生物网络角度系统分析甲醛致肺癌的分子机制,发现传统毒理学方法难以揭示的复杂关系 研究主要基于数据库信息和计算模拟,缺乏实验验证,且样本来源和具体技术细节未明确说明 理解甲醛影响肺癌的分子机制,为预防甲醛暴露引起的肺癌提供策略见解 甲醛与肺癌相关的潜在靶点基因及信号通路 生物信息学 肺癌 网络毒理学、分子对接、单细胞RNA测序数据挖掘 NA 基因表达数据、蛋白质相互作用数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
2620 2026-02-06
HPV Integration in Head and Neck Cancer: Downstream Splicing Events and Expression Ratios Linked with Poor Outcomes
2026-Feb-04, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research IF:10.0Q1
研究论文 本研究通过分析头颈鳞状细胞癌(HNSCC)中的HPV整合事件,揭示了其与致癌基因网络、RNA剪接事件及临床预后的关联 首次基于大规模HNSCC队列,通过RNA而非DNA分析HPV整合,识别了致癌基因网络和HPV RNA特征(如剪接融合转录本和基因表达比)作为预后生物标志物 HPV整合与临床结局的关系先前未确认,且研究可能受样本异质性或队列差异影响 探究HPV整合在HPV相关头颈癌中对人类和HPV基因表达及临床结局(复发和总生存)的影响 261个HPV相关HNSCC的bulk和单细胞RNA测序样本,包括来自五个队列的数据,其中62个来自新密歇根大学队列 数字病理学 头颈癌 RNA测序(包括bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq) NA RNA测序数据 261个HPV相关HNSCC样本(包括bulk和单细胞RNA-seq),以及102个HPV阳性HNSCC参与者的DNA HPV整合事件数据 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
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