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当前共找到 5215 篇文献，本页显示第 241 - 260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 241 | 2026-05-12 |
An Advanced Single-Cell RNA Sequencing (scRNA-seq) Protocol Utilizing Custom-Designed Multiplexing
2026-May-05, Bio-protocol
IF:1.0Q3
DOI:10.21769/BioProtoc.5678
PMID:42111707
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研究论文 | 介绍了一种利用定制设计多重标记技术的高级单细胞RNA测序协议，解决了商业小鼠标签在特定品系中的不兼容问题 | 开发基于生物素化抗体鸡尾酒和链霉亲和素结合寡核苷酸的稳健替代方案，实现可靠样本多重标记，并兼容多组学5'工作流程 | 未明确提及局限性 | 提出针对品系特异性或定制设计多重标记策略的实用解决方案，用于单细胞转录组学研究 | FVB/N小鼠肺组织样本 | 数字病理学 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 单细胞转录组数据 | FVB/N小鼠肺组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium 单细胞5'化学试剂盒 |
| 242 | 2026-05-12 |
Histone deacetylases and cell-cycle regulators orchestrate cell-identity transitions during Arabidopsis root regeneration
2026-05-04, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2026.03.013
PMID:41889170
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序、ATAC测序、成像和突变体分析，研究拟南芥根再生过程中细胞身份转变的轨迹 | 揭示了组蛋白去乙酰化酶和细胞周期调控因子协同调控植物细胞重编程顺序的机制，发现HDA9/HDA19抑制旧身份及应激反应，OBP1与SMRs调节分裂速率 | 未提及具体限制 | 阐明拟南芥根再生过程中细胞重编程的连续状态及其分子调控机制 | 拟南芥根再生过程中的细胞 | 单细胞组学， 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序， ATAC测序， 成像， 突变体分析 | NA | 单细胞基因表达数据， 染色质可及性数据， 图像数据 | 拟南芥根再生过程中的细胞样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq， 单细胞ATAC-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序和ATAC测序 |
| 243 | 2026-05-12 |
scPASU: A computational protocol for quantifying polyadenylation site usage and alternative polyadenylation from 3' scRNA-seq data
2026-May-04, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2026.104544
PMID:42085187
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研究方案 | 提出scPASU：一种从3'单细胞RNA测序数据中量化多聚腺苷酸化位点使用和可变多聚腺苷酸化的计算协议 | 开发了Snakemake工作流程scPASU，可灵活配置生物体和样本特定参数，支持多聚腺苷酸化位点发现 | 未明确说明 | 构建从3'scRNA-seq数据中量化多聚腺苷酸化位点使用和可变多聚腺苷酸化的计算协议 | 3'单细胞RNA测序数据中的多聚腺苷酸化位点 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 244 | 2026-05-12 |
GR2ST: spatial transcriptomics prediction based on graph-enhanced multimodal contrastive learning
2026-May-03, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag209
PMID:42036805
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研究论文 | 提出GR2ST深度学习模型，利用图增强多模态对比学习从组织学图像预测空间转录组 | 创新性地结合动态阈值功能图和半径约束空间图的双分支图架构，并通过多模态对比学习与细胞类型引导的回归头实现图像特征与基因表达的精准对齐 | 未详细说明模型在更多组织类型或低质量图像上的泛化能力，以及计算资源需求 | 开发从组织学图像高效预测空间转录组的方法，降低实验成本和时间 | 皮肤鳞状细胞癌和两种人类乳腺癌的空间转录组数据 | 数字病理学 | 皮肤癌, 乳腺癌 | 空间转录组学 | 图神经网络, 对比学习, 回归模型 | 组织学图像, 基因表达数据 | 三个癌症空间转录组数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 245 | 2026-05-12 |
TransGRN: A Transfer Learning-Based Framework for Inferring Gene Regulatory Networks Across Cell Lines
2026-May, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2025.3628564
PMID:41191474
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研究论文 | 提出TransGRN，一种基于迁移学习的框架，用于跨细胞系推断基因调控网络 | 采用跨细胞系预训练策略，结合多个源细胞系的单细胞RNA测序数据和大语言模型的生物学知识，实现通用调控模式的迁移 | 依赖源细胞系数据的质量和多样性，可能影响在目标细胞系数据极度稀缺时的性能 | 开发无需大量先验调控信息即可推断基因调控网络的方法 | 基因调控网络推断、细胞系间调控模式迁移 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 迁移学习模型 | 基因表达数据 | 多个源细胞系和目标细胞系样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 246 | 2026-05-12 |
Bispecific T-cell Engager (CD3 × EGFR)-Based Triplet Therapy Unlocks CD40/CD40L Crosstalk to Revert Immunosuppression in Third-Generation EGFR-Tyrosine Kinase Inhibitor-Refractory NSCLC
2026-May, Journal of thoracic oncology : official publication of the International Association for the Study of Lung Cancer
IF:21.0Q1
DOI:10.1016/j.jtho.2026.103607
PMID:41672197
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研究论文 | 研究针对第三代EGFR-TKI耐药的非小细胞肺癌，提出了一种基于双特异性T细胞衔接器（CD3×EGFR）的三联疗法，通过激活CD40/CD40L信号通路逆转免疫抑制 | 首次提出三联疗法结合双特异性T细胞衔接器、组蛋白去乙酰化酶抑制剂和4-1BB激动剂，以克服EGFR-TKI耐药肿瘤中的免疫抑制微环境 | 文中未明确提及具体局限性，但可能需要进一步验证该疗法在更大样本中的安全性和有效性 | 开发一种新的三联组合疗法，以恢复T细胞抗肿瘤活性，解决第三代EGFR-TKI耐药非小细胞肺癌的免疫抑制问题 | 非小细胞肺癌患者样本、人源化NOG-EXL小鼠模型 | 机器学习 | 非小细胞肺癌 | 单细胞RNA测序、多色荧光染色 | NA | 基因表达数据、图像数据 | 文中未明确样本数量，但包括非小细胞肺癌患者样本和小鼠模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3 |
| 247 | 2026-05-12 |
Deubiquitinase USP2 promotes hepatic stellate cell activation via p300 stabilization
2026-May, FEBS letters
IF:3.0Q3
DOI:10.1002/1873-3468.70301
PMID:41703985
|
研究论文 | 该研究通过去泛素化酶抑制剂筛选发现USP2在肝星状细胞活化中稳定p300，促进肝纤维化 | 首次识别USP2作为p300的新型去泛素化酶，揭示其在肝星状细胞活化和肝纤维化中的关键调控作用，为纤维化治疗提供新靶点 | 未明确说明研究局限 | 探索肝星状细胞活化过程中p300稳定性的上游调控机制 | 肝星状细胞、纤维化肝脏组织、慢性肝病患者样本 | 数字病理学 | 肝纤维化、代谢功能障碍相关脂肪性肝病 | 单细胞RNA测序、去泛素化酶抑制剂筛选 | NA | 单细胞转录组数据 | 人纤维化肝脏组织样本（具体数量未提及） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 248 | 2026-05-12 |
Comparison of single-cell sequencing technologies for allele-specific expression analysis in rabbit spermatids
2026-May, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2026.111224
PMID:41780767
|
研究论文 | 通过比较单细胞测序技术，分析兔子精子细胞中等位基因特异性表达，以识别可用于遗传生物防治的候选基因 | 首次对欧洲兔精子细胞进行等位基因特异性表达分析，并比较短读长和长读长测序技术的适用性 | 仅对三个候选基因进行了分析，且未来需要进一步评估这些基因在遗传生物防治中的适用性 | 识别欧洲兔中可能存在的自然基因驱动，探索其在遗传生物防治中的应用潜力 | 欧洲兔的精子细胞 | 自然语言处理 | NA | 单细胞测序，短读长测序，长读长测序 | NA | 基因表达数据 | 兔子精子细胞样本 | Illumina | 单细胞RNA测序 | Illumina NovaSeq | 短读长测序平台，长读长测序平台 |
| 249 | 2026-05-12 |
Single-cell transcriptomics identifies NF-κB/STAT3-associated neutrophil inflammatory reprogramming in rheumatoid arthritis synovium
2026-May, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2026.111231
PMID:41831621
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析了类风湿关节炎滑膜中中性粒细胞的炎症重编程 | 首次揭示NF-κB/STAT3轴在类风湿关节炎中性粒细胞炎症重编程中的候选调控作用，并通过计算敲除实验验证 | 基于计算预测，缺乏直接功能实验验证NF-κB/STAT3轴的关键作用 | 阐明类风湿关节炎滑膜中中性粒细胞的异质性和炎症重编程机制 | 类风湿关节炎患者滑膜组织中的中性粒细胞 | 单细胞转录组学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq)，hdWGCNA共表达分析，计算敲除 | NA | 单细胞转录组数据，批量RNA-seq数据 | 8例类风湿关节炎患者（66,539个细胞），独立批量RNA-seq队列（n=19） | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |
| 250 | 2026-05-12 |
Unannotated noncoding transcripts as a source of intratumor heterogeneity in malignant cell states
2026-May, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-025-3273-6
PMID:41870780
|
research paper | 本研究通过分析12种常见癌症类型的单细胞RNA-seq数据，发现了大量未被注释的非编码转录本，这些转录本的表达与恶性细胞状态及肿瘤内异质性密切相关 | 首次系统性地揭示了未注释非编码转录本作为肿瘤内异质性新来源的机制，并通过功能实验验证了其促进肺癌细胞增殖和迁移的作用 | 未明确说明，需进一步阅读全文 | 探究未注释非编码转录本在恶性细胞状态中作为肿瘤内异质性来源的作用 | 12种常见癌症类型的肿瘤样本及癌细胞系 | machine learning | lung cancer | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq, multi-omics | NA | gene expression data, epigenetic data | 12种癌症类型的单细胞RNA-seq数据及多区域采样的bulk RNA-seq数据 | 10x Genomics | single-cell RNA-seq | 10x Chromium | 3' tag-based single-cell RNA-seq |
| 251 | 2026-05-12 |
Endothelial cells recruit pro-inflammatory macrophage clusters via App-Cd74 exacerbating ICI-associated myocarditis
2026-May, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2026.111238
PMID:41905617
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究ICI相关心肌炎中内皮细胞通过App-Cd74轴招募促炎性巨噬细胞簇的机制 | 首次揭示App-Cd74信号轴在ICI相关心肌炎中内皮细胞与促炎性巨噬细胞簇之间的相互作用，并利用深度学习框架scTenifoldXct验证该配体-受体互作 | 未明确提及，但可能包括小鼠模型与人类疾病的差异及研究样本量有限 | 阐明ICI相关心肌炎的免疫病理机制，探索潜在治疗靶点 | 小鼠ICI心肌炎模型的心脏组织 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | 深度学习框架scTenifoldXct | 单细胞转录组数据 | 小鼠ICI心肌炎模型的心脏组织样本，具体数量未提及 | 未明确提及 | 单细胞RNA测序 | 未明确提及 | 未明确提及 |
| 252 | 2026-05-12 |
COVARE for modeling latent random effect correlations to detect genes with specific spatial expression patterns
2026-May, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2026.111242
PMID:41941898
|
研究论文 | 提出COVARE方法，基于线性混合效应模型检测具有特定空间表达模式的基因 | 通过线性混合效应模型纳入多种预设生物学信息并考虑协变量间的潜在相互作用，实现对基因空间表达的多因素共调控精确分析，弥补现有方法中协变量独立假设的不足 | 未明确提及局限性 | 检测空间可变基因并解析基因表达的复杂空间模式 | 空间转录组学数据中的基因表达模式 | 机器学习 | NA | 空间转录组测序 | 线性混合效应模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 253 | 2026-05-12 |
OMICX: An AI-powered web platform for integrative analysis of multi-condition single-cell transcriptomics data
2026-May, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2026.111243
PMID:41941899
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研究论文 | 介绍了一个由大型语言模型助力的无代码交互式网络平台OMICX，用于多条件单细胞转录组数据的综合分析 | 集成大型语言模型助手，通过自然语言对话实现单细胞数据分析，无需编程，提高了可及性和易用性 | 未在摘要中明确提及局限性 | 提供一个交互式无代码平台，简化多条件单细胞转录组数据的综合分析流程 | 单细胞RNA测序数据、批量RNA测序数据和GWAS汇总统计数据 | 机器学习 | NA | scRNA-seq, bulk RNA-seq, GWAS | 大型语言模型 | 文本，基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | NA | NA |
| 254 | 2026-05-12 |
Single-cell transcriptomics reveals the impact of sex and age in the healthy human liver
2026-May, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2026.101773
PMID:41990579
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研究论文 | 通过单细胞转录组学分析了37个健康人肝脏样本，揭示性别和年龄对肝脏细胞类型基因表达和细胞间相互作用的影响 | 首次在单细胞分辨率下系统揭示了性别和年龄对人肝脏所有细胞类型基因表达谱、信号通路和细胞间通讯的影响 | 未说明具体限制 | 通过单细胞测序技术研究性别和年龄如何影响健康人肝脏的基因表达和细胞功能 | 37个健康人肝脏样本，包含女性和男性捐赠者，年龄跨度超过七十年 | 数字病理学 | NA | 单核RNA测序, 差异表达分析, 通路富集分析, 配体-受体和蛋白-蛋白相互作用预测 | NA | 基因表达数据 | 37个健康人肝脏样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 255 | 2026-05-12 |
Multiomics and multi-region spatial transcriptome analysis reveal cellular networks and pathways associated with HCC recurrence
2026-May, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2026.101790
PMID:41950768
|
研究论文 | 通过多组学和多区域空间转录组分析，揭示与肝细胞癌复发相关的细胞网络和信号通路 | 发现了INTS6+内皮细胞亚群，其在复发患者的肿瘤中富集并与肿瘤细胞空间共定位，且与微血管侵犯区域相关 | 研究样本量有限，仅涉及4名患者和17个组织样本 | 研究肝细胞癌复杂肿瘤微环境中不同细胞类型间的相互作用及其在疾病复发中的作用 | 肝细胞癌手术切除后的多区域组织样本 | 机器学习和数字病理学 | 肝细胞癌 | 空间转录组学，批量RNA测序，免疫荧光，多重免疫组织化学 | NA | 基因表达数据，组织图像 | 4名患者的17个组织样本（空间转录组），90名患者的329个分区（批量RNA测序） | NA | 空间转录组学，批量RNA测序 | NA | NA |
| 256 | 2026-05-12 |
Tocilizumab Mitigates Immune Checkpoint Inhibitor-Induced Colitis and Inhibits Tumor Growth by Targeting the IL-6-JAK2-STAT3 Signaling Pathway
2026-May, Journal of gastroenterology and hepatology
IF:3.7Q2
DOI:10.1111/jgh.70293
PMID:42051049
|
研究论文 | 该研究通过建立PD-1抑制剂诱导的结肠炎小鼠模型，探究IL-6-JAK2-STAT3信号通路在免疫检查点抑制剂相关结肠炎中的作用，并验证托珠单抗通过靶向该通路缓解结肠炎症并抑制肿瘤生长的治疗效果 | 首次揭示托珠单抗通过靶向IL-6-JAK2-STAT3通路同时缓解PD-1抑制剂诱导的结肠炎和抑制肿瘤生长，为临床治疗提供了新思路 | 仅基于小鼠模型验证，尚需临床试验进一步评估托珠单抗在人类患者中的安全性和有效性 | 阐明免疫检查点抑制剂相关结肠炎的发病机制并探索潜在治疗策略 | PD-1抑制剂诱导的结肠炎小鼠模型 | 机器学习 | 结肠炎 | RNA测序，单细胞RNA测序，HE染色，免疫组化，ELISA，Western blot，小动物活体成像，肿瘤细胞功能分析 | NA | 基因表达数据，图像 | 小鼠模型（具体数量未说明） | Illumina | 单细胞RNA测序，bulk RNA-seq | Illumina NovaSeq | NA |
| 257 | 2026-05-12 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals APOE genotype-dependent sex differences in Alzheimer's disease
2026-May, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz.71463
PMID:42108391
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示APOE基因型依赖的阿尔茨海默病性别差异 | 首次在单细胞水平系统研究了性别与APOE基因型在阿尔茨海默病中的相互作用 | 未提及具体局限性 | 探索阿尔茨海默病中性别和APOE基因型相关的单细胞转录组差异 | 阿尔茨海默病患者的大脑细胞 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 54种高分辨率细胞类型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 258 | 2026-05-12 |
Integrated Bulk and Single-Cell RNA-Seq Analysis Reveals Transcriptional Activation of PTGS2 by FOS in Progression From T2DM to T2DM-Associated NAFLD
2026-May, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.71182
PMID:42108421
|
研究论文 | 通过整合批量RNA-seq和单细胞RNA-seq数据，揭示FOS介导的PTGS2转录激活在2型糖尿病进展为非酒精性脂肪性肝病中的作用 | 首次通过批量与单细胞转录组整合分析，揭示FOS直接结合PTGS2启动子并驱动其转录在T2DM向NAFLD进展中的机制 | 未提及体内实验验证，缺乏更大样本量的临床验证 | 探究T2DM向T2DM相关NAFLD进展过程中FOS介导的PTGS2激活的调控机制 | T2DM相关NAFLD患者的批量RNA-seq数据、单细胞转录组数据及临床样本 | 机器学习 | 2型糖尿病，非酒精性脂肪性肝病 | RNA-seq | LASSO回归，随机森林 | 转录组数据 | NA | NA | 批量RNA-seq，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 259 | 2026-05-12 |
SLA2 is Associated With Immune evasion and Exhaustion of CD8+ T Cells in Gastric Cancer
2026-May, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.71164
PMID:42108520
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研究论文 | 本研究探讨了Src样适配蛋白2（SLA2）在胃癌组织中高表达及其与CD8+T细胞耗竭和免疫逃逸的关系 | 首次揭示了SLA2在胃癌肿瘤微环境中通过负调控T细胞受体信号导致CD8+T细胞功能耗竭的机制，并发现启动子甲基化和组蛋白修饰可能调控其表达 | 具体实验数据和样本量未在摘要中明确说明，机制研究主要基于体外实验 | 探索SLA2在胃癌肿瘤微环境中对CD8+T细胞功能的影响及其分子机制 | 胃癌组织样本、CD8+T细胞 | 机器学习 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 260 | 2026-05-12 |
Microenvironmentally derived fatty acid-binding proteins 4 and 5 are novel therapeutic vulnerabilities in multiple myeloma
2026-May, Blood neoplasia
DOI:10.1016/j.bneo.2026.100229
PMID:42109313
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研究论文 | 研究发现微环境来源的脂肪酸结合蛋白4和5是多发性骨髓瘤的新型治疗靶点 | 首次揭示微环境来源的FABP4/5支持多发性骨髓瘤进展，并提出双重靶向策略 | 未明确说明研究的局限性 | 验证微环境来源的FABP4/5促进多发性骨髓瘤进展的假设 | 多发性骨髓瘤患者和老鼠模型 | 机器学习 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | 多发性骨髓瘤患者数据和老鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |