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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 241 | 2026-09-23 |
CXCL13-CXCR5 Signaling in CD8+ T Cell Recruitment and Lymphoid Immune Organization in Clear Cell Renal Cell Carcinoma
2026-May-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.04.722710
PMID:42146336
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研究论文 | 本文研究CXCL13-CXCR5信号轴在透明细胞肾细胞癌中调控CD8 T细胞募集、分化及淋巴免疫组织形成的作用 | 首次系统揭示CXCL13-CXCR5轴在ccRCC中驱动CD8 T细胞募集并促进干细胞样CD8 T细胞在淋巴聚集体中的空间组织,提出其作为生物标志物和治疗靶点的潜力 | 研究主要基于高-risk非转移性ccRCC样本,样本量有限,且小鼠模型与人类肿瘤微环境存在差异,CXCL13-CXCR5轴的具体治疗干预效果仍需进一步临床验证 | 探究CXCL13-CXCR5轴在透明细胞肾细胞癌中对CD8 T细胞募集、分化和免疫组织结构的调控作用 | 高风险非转移性透明细胞肾细胞癌患者肿瘤组织、血浆、配对癌旁肾组织及同源小鼠模型 | 数字病理学 | 肾癌 | ELISA、定量PCR、迁移实验、多重免疫荧光、单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 图像、文本 | 人类肿瘤、血浆及配对癌旁肾组织样本,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 242 | 2026-09-23 |
The abscopal effect of IRE combined with anti-PD-1 achieves local ablation and systemic control of PDAC
2026-May-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.04.722535
PMID:42146443
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研究论文 | 本文研究了不可逆电穿孔(IRE)联合抗PD-1抗体在胰腺导管腺癌(PDAC)临床前模型中诱导远端效应,实现局部消融和全身控制 | 首次证明IRE联合抗PD-1抗体可在转移性PDAC临床前模型中触发强烈的远端效应,揭示了cGAS-STING通路激活、髓系细胞浸润和M1极化、以及B细胞在IRE介导的全身抗肿瘤免疫中的重要作用 | 研究仅限于临床前模型,尚未在人体临床试验中验证IRE联合抗PD-1的远端效应和安全性 | 探讨IRE联合抗PD-1抗体是否能诱导远端效应,并实现PDAC的局部消融和全身控制 | 转移性PDAC临床前模型(包括原位小鼠PDAC肿瘤模型和B细胞敲除小鼠模型) | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | RNA-seq, scRNA-seq, 空间免疫荧光 | NA | RNA-seq数据, 单细胞RNA-seq数据, 图像 | 多个模型(具体数量未提及) | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 243 | 2026-09-23 |
Genetic suppression of myeloid receptor Clec7a attenuates microglia neuroinflammation and promotes microglial phagocytosis to delay disease progression in ALS models
2026-May-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.04.722437
PMID:42146463
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研究论文 | 该研究揭示了髓系受体Clec7a(Dectin-1)在调控小胶质细胞激活及肌萎缩侧索硬化(ALS)疾病进展中的关键作用,发现Clec7a缺失可减轻神经炎症、促进小胶质细胞吞噬hTDP43并延缓疾病进展 | 首次确定Clec7a作为疾病相关小胶质细胞(DAM)核心标志基因在ALS中调控小胶质细胞激活和疾病进展的具体作用,并证明小胶质细胞中选择性敲除Clec7a可促进对病理性hTDP43的吞噬并延缓ALS疾病进展 | 研究主要基于SOD1G93A小鼠模型,人ALS样本验证有限,Clec7a作为治疗靶点的临床转化潜力尚需进一步验证 | 确定Clec7a在调控小胶质细胞激活和ALS疾病进展中的作用 | SOD1G93A ALS小鼠模型、人ALS样本、小胶质细胞 | 机器学习 | 肌萎缩侧索硬化 | 单细胞RNA测序、双光子成像 | NA | 图像、文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 244 | 2026-09-23 |
Macrophage metabolism directs regenerative versus fibrotic healing through BMP signaling in the mouse digit tip
2026-May-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.04.722661
PMID:42146602
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研究论文 | 本研究利用小鼠指尖截肢模型,通过单细胞RNA测序、空间转录组学和代谢组学分析,揭示了巨噬细胞代谢通过BMP信号通路决定再生与纤维化愈合的机制。 | 首次鉴定出一群特异性存在于P3再生指尖的巨噬细胞群体,该群体定位于生长骨前沿,表达BMP配体驱动邻近成骨细胞中BMP激活,并受脂肪酸氧化增加与糖酵解活性降低的双重代谢开关调控;揭示了再生特异性巨噬细胞信号中心在模式化骨形成中的作用。 | 研究基于小鼠指尖截肢模型,结论是否适用于其他组织或人类再生医学尚需进一步验证。 | 探究驱动巨噬细胞与周围细胞不同交叉通讯通路从而决定愈合结局(再生与瘢痕形成)的机制。 | 小鼠指尖截肢模型中的巨噬细胞及周围骨细胞 | 空间转录组学、单细胞组学、代谢组学 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学、代谢组学分析 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据、代谢组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics, metabolomics | NA | NA |
| 245 | 2026-09-23 |
Gene-Modulated Network Diffusion for Improved Modeling of Amyloid- β Spread in Alzheimer's Disease
2026-May-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.04.722725
PMID:42146687
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研究论文 | 本文扩展了网络扩散模型,通过引入基因调控的区域脆弱性来改进阿尔茨海默病中淀粉样蛋白β扩散的建模 | 提出了一种扩展网络扩散模型框架,包含蛋白质合成项,并利用空间转录组学数据调制区域级合成速率参数,使用APOE、SORL1和FGL2等基因进行调控 | 基线网络扩散模型在机制可解释性方面存在不足,基因扩展模型在轻度认知障碍和阿尔茨海默病组中的性能提升仅在P<0.10水平上显著 | 研究淀粉样蛋白β在白质结构脑网络中的病理生理扩散,并改进其建模和预测 | 阿尔茨海默病神经影像学队列中的淀粉样蛋白β沉积,以及阿尔茨海默病测序计划的外部队列 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学 | 网络扩散模型 | 影像、文本 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 246 | 2026-09-23 |
Modeling human B cell development with pluripotent stem cells
2026-May-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.04.722674
PMID:42146710
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研究论文 | 该研究建立了一种从人多能干细胞(hPSCs)高效生成B细胞并使其成熟为浆细胞的培养方案,用于模拟人类B细胞发育过程 | 首次通过多组学单细胞RNA测序证明hPSC来源的B细胞发育经过pro-B、pre-B和naïve B细胞阶段,准确重现成人骨髓B淋巴细胞生成;发现IL-7对功能性IgH重排的抑制效应;揭示卵黄囊和永久造血祖细胞均具有B细胞潜能 | 未明确讨论该培养体系的长期稳定性、规模化生产可行性及体内功能验证的局限性 | 建立从人类多能干细胞高效生成功能性B细胞和浆细胞的方案,为B细胞发育机制研究和B细胞疗法开发提供平台 | 人类多能干细胞(hPSCs)及其定向分化产生的B系细胞(pro-B、pre-B、naïve B和浆细胞) | 干细胞生物学、免疫学、发育生物学 | NA | 流式细胞术、多组学单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据、流式细胞术数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 247 | 2026-09-23 |
Human neural organoid modeling of diffuse midline glioma captures the complexity of patient tumors
2026-May-07, Journal of neuro-oncology
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s11060-026-05515-5
PMID:42098359
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研究论文 | 该研究利用人类iPSC来源的可扩展平面神经类器官(PNO)模型,结合NanoString GeoMx空间转录组技术,对三种DMG患者来源异种移植细胞系进行空间分析,验证该模型能复现患者肿瘤的转录组和蛋白质组特征 | 首次使用可扩展的人类iPSC来源平面神经类器官(PNO)系统建模弥漫性中线胶质瘤,该系统包含神经元、功能性星形胶质细胞和小胶质细胞,可模拟肿瘤微环境,并实现传统肿瘤细胞单培养无法完成的药物靶点旁观者毒性筛选 | 该研究仅为概念验证性研究,样本量有限(仅3个DMG PDX细胞系),尚未进行大规模药物筛选验证或体内实验验证 | 建立可靠、可扩展的DMG体外临床前模型,复现肿瘤微环境复杂性,并用于物种匹配的药物测试 | 3种DMG患者来源异种移植(PDX)细胞系与人类iPSC来源平面神经类器官(PNO)的共培养体系,以及DMG患者活检样本 | 数字病理学 | 弥漫性中线胶质瘤 | 空间转录组学 | NA | 图像, 文本 | 3个DMG PDX细胞系及DMG患者活检样本 | NanoString | 空间转录组学 | NanoString GeoMx | NanoString GeoMx空间转录组学系统用于空间分辨感兴趣区域(ROI)的转录组分析 |
| 248 | 2026-09-23 |
A diagnostic plasma omics-biomarker for Alzheimer's disease informed by microglial single-cell transcriptomics: A pilot study
2026-May-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.30.721959
PMID:42146366
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研究论文 | 该研究利用小胶质细胞单核RNA测序数据,通过统计方法筛选基因组合,并映射到血液单核细胞转录组数据,开发阿尔茨海默病早期诊断的血浆组学生物标志物 | 首次将小胶质细胞单细胞转录组数据与血液单核细胞转录组数据整合,通过基于最优传输统计的图映射方法开发阿尔茨海默病血浆诊断生物标志物 | 这是一项初步研究,样本量较小,300基因组方法对认知正常患者的预测准确性较低(53%),需要更大规模的验证研究 | 开发基于组学信息的阿尔茨海默病早期血液诊断生物标志物框架 | 阿尔茨海默病患者和认知正常对照者的血液样本及小胶质细胞单核RNA测序数据 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单核RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单核RNA测序 | NA | NA |
| 249 | 2026-09-23 |
Alzheimer's Disease and circadian disruption sex-specifically contribute to a loss of bone maintenance in APP/PS1 model mice
2026-May-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.01.722089
PMID:42146604
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研究论文 | 本研究探讨了阿尔茨海默病与昼夜节律紊乱如何性别特异性地影响APP/PS1模型小鼠的骨骼维持,通过μCT、拉曼光谱、三点弯曲和单细胞RNA测序等方法揭示了脑-骨轴的交互机制 | 首次揭示了阿尔茨海默病与昼夜节律紊乱协同作用对骨骼结构和骨髓祖细胞活性的性别特异性影响,并通过单细胞转录组将骨髓单核细胞的差异表达基因映射到单核细胞来源巨噬细胞的昼夜节律调控蛋白 | 研究基于APP/PS1转基因小鼠模型,结果向人类临床转化仍需进一步验证,且样本量有限 | 探索遗传和环境因素(阿尔茨海默病与昼夜节律紊乱)如何交互影响骨结构、骨髓祖细胞活性及单核细胞来源巨噬细胞 | APP/PS1转基因小鼠模型的骨组织、骨髓祖细胞和单核细胞来源巨噬细胞 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, 显微计算机断层扫描, 拉曼光谱, 三点弯曲力学测试 | NA | 图像, 文本 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 250 | 2026-09-23 |
Clonal embeddings allow exploratory analysis of lineage-resolved single-cell data
2026-May-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.30.720820
PMID:42146635
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研究论文 | 该文章提出了一种名为clone2vec的机器学习方法,直接从细胞表达流形中学习克隆嵌入,用于谱系分辨单细胞数据的探索性分析 | clone2vec直接从细胞表达流形中学习信息丰富的克隆嵌入,绕过离散细胞类型标签的依赖,在克隆仅由少量细胞代表时仍保持稳定,并将克隆变异总结为可解释的几何结构,支持探索分析、克隆-基因关联统计和跨数据集对齐 | 摘要中未明确提及该方法的局限性 | 开发一种可扩展的机器学习方法,解决克隆数据稀疏性和注释依赖性带来的分析挑战,实现谱系耦合单细胞RNA测序数据的探索性分析 | 高吞吐量谱系追踪与单细胞转录组学耦合的条形码数据集,涵盖胚胎发生、肿瘤发生、造血过程以及肿瘤微环境中的TCR测序数据 | 机器学习, 单细胞组学 | 肿瘤, 肺癌 | 单细胞RNA测序, 谱系追踪, TCR测序 | clone2vec(基于机器学习的嵌入模型) | 单细胞转录组数据, 克隆条形码数据, TCR序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 谱系追踪条形码测序, TCR测序 | NA | NA |
| 251 | 2026-09-23 |
Cross-assay RNA modeling reveals cancer biomarkers
2026-May-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.30.722009
PMID:42146664
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研究论文 | 该研究系统评估了整合四种转录组学平台(bulk RNA-seq、scRNA-seq、NanoString和微阵列)数据进行癌症预测建模的方法,并以高级别浆液性癌为模型系统 | 提出利用化疗前后配对样本的基因表达倍数变化来减少患者间和检测间变异,开发了跨平台协调策略,并构建了结合RNA-seq和NanoString的预测模型,在外部微阵列队列中验证了其有效性 | 各平台间存在系统性偏差,倍数变化方法不足以完全克服平台特异性偏差,微阵列和scRNA-seq数据仍显示系统偏差,需要更多样本来进一步验证 | 评估如何整合来自不同转录组学平台的数据以进行癌症预测建模,并开发跨平台数据协调策略 | 输卵管卵巢来源的高级别浆液性癌(HGSC)肿瘤样本 | 机器学习 | 卵巢癌 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, NanoString, 微阵列 | NA | 基因表达数据 | NA | Illumina, NanoString, Thermo Fisher | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 微阵列 | NA | NA |
| 252 | 2026-09-23 |
Tumor glycosylation engages CD301b-mediated myeloid regulation in breast cancer
2026-May-05, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-9347231/v1
PMID:42147159
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研究论文 | 该研究揭示了肿瘤糖基化通过CD301b/CLEC10A介导的髓系免疫调控促进乳腺癌进展的机制 | 首次鉴定CD301b(人类同源物CLEC10A)为乳腺肿瘤微环境中髓系免疫调控的关键受体,并揭示了跨物种保守的髓系调控程序 | 研究主要基于小鼠三阴性乳腺癌模型,人类数据以转录组分析为主,缺乏直接的功能验证实验 | 探究肿瘤糖基化与C型凝集素受体CD301b/CLEC10A之间的相互作用及其对乳腺肿瘤免疫微环境的调控作用 | 小鼠三阴性乳腺癌模型及人类乳腺癌样本中的CD301b阳性免疫细胞和CLEC10A阳性髓系细胞 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,转录组分析 | NA | 文本(转录组数据),图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 253 | 2026-09-23 |
Trajectory-guided dimensionality reduction for multi-sample single-cell RNA-seq data reveals biologically relevant sample-level heterogeneity
2026-05-03, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag192
PMID:42024616
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研究论文 | 该文章提出了MUSTARD,一种基于轨迹引导的降维方法,专为多样本、多条件的单细胞RNA测序数据设计,能够同时捕获伪时间轨迹和样本间的基因表达变异模式 | 创新性地将伪时间信息整合到降维过程中,提供了一种无监督方法,能够同时捕获沿伪时间轨迹和跨多个样本的主要基因表达变异模式,从而发现具有生物学意义的样本异质性、内型及相关基因标志物和模块 | 文章未明确说明局限性 | 解决涉及多个生物样本的单细胞RNA测序数据降维的分析挑战,发现样本水平的生物学异质性 | 多样本、多条件的单细胞RNA测序数据,包括两个COVID-19数据集和一个结核病数据集 | 机器学习 | COVID-19, 结核病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两个COVID-19数据集和一个结核病数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 254 | 2026-09-23 |
Senolytic Treatment With Fisetin Reverses Age-Related Endothelial Dysfunction Partially Mediated by SASP Factor CXCL12
2026-May, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70500
PMID:42021544
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研究论文 | 该研究通过单细胞转录组学分析了年轻和年老小鼠主动脉内皮细胞,发现衰老内皮细胞中SASP因子(尤其是Cxcl12)表达升高,非瑟酮可逆转此变化并改善年龄相关内皮功能障碍。 | 首次在单细胞水平揭示衰老内皮细胞的SASP特征,并确定CXCL12是年龄相关内皮功能障碍的关键驱动因子,证明非瑟酮通过清除衰老细胞改善内皮功能。 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人体临床验证不足,非瑟酮的长期疗效和安全性未知。 | 探究衰老内皮细胞的分子变化、SASP因子的作用及其对年龄相关内皮功能障碍的影响,并评估非瑟酮的治疗效果。 | 年轻(6个月)和年老(27个月)雌雄小鼠的主动脉内皮细胞,以及培养的人主动脉内皮细胞 | 单细胞转录组学、心血管生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、血液样本数据 | 年轻和年老雌雄小鼠的主动脉样本(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 255 | 2026-09-23 |
A transcriptional patient map of systemic lupus erythematosus reveals disease-related multicellular immune programs conserved between blood and kidney
2026-May-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.28.721379
PMID:42094356
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研究论文 | 通过分析1167个样本(包括单细胞和批量血液转录组及空间分辨肾脏组织转录组)构建了系统性红斑狼疮的转录组患者图谱,揭示了血液和肾脏之间保守的疾病相关多细胞免疫程序 | 采用无监督方法从两个独立单细胞RNA测序队列中推断患者层面的转录组免疫程序,整合了单细胞、批量及空间转录组多分辨率数据,发现了四种保守的免疫程序,并将血液免疫程序映射到肾脏组织病理中,建立了系统性免疫程序与局部组织病理之间的联系 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 构建系统性红斑狼疮的转录组患者图谱,解析疾病的临床和分子异质性,实现患者分层并揭示疾病相关的多细胞免疫程序 | 系统性红斑狼疮患者及健康对照者的外周血单核细胞和肾脏组织 | 数字病理学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 空间转录组学, 蛋白质组学 | 无监督学习方法 | 转录组数据, 图像 | 1167个样本(783例SLE患者,384例健康对照) | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 256 | 2026-09-23 |
Single-cell transcriptional landscape of muscle-derived stem/progenitor cells reveals hallmarks of aging and rejuvenation
2026-May-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.28.721405
PMID:42094422
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研究论文 | 该研究通过单细胞转录组学和蛋白质组学全面分析了不同年龄段小鼠肌肉来源的干/祖细胞(MDSPCs),揭示了其沿成熟连续谱的异质性以及衰老和年轻化相关的分子特征 | 首次在单细胞水平上全面描绘了MDSPCs的转录连续谱,发现早期阶段MDSPCs表达与胚胎祖细胞身份相关的基因程序,表明其具有非经典的多能样状态,并阐明了衰老通过降低干性特征、增强分化程序和氧化应激来重塑该连续谱 | 研究仅基于小鼠模型,尚未在人类中验证;单细胞转录组学和蛋白质组学可能遗漏低丰度转录本或翻译后修饰信息;未进行功能性的再生实验验证 | 解析MDSPCs的分子身份和发育状态,并揭示衰老和年轻化过程中其转录景观的变化 | 小鼠肌肉来源的干/祖细胞(MDSPCs) | 机器学习 | 老年疾病 | 单细胞转录组学, 蛋白质组学 | NA | 文本, 图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 257 | 2026-09-23 |
Differential peripheral immune dynamics underlie therapeutic response to chemotherapy and chemoimmunotherapy in triple-negative breast cancer
2026-May-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.28.721416
PMID:42094437
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研究论文 | 该研究整合系统级免疫状态建模与通路级机制推断,分析晚期三阴性乳腺癌患者外周血单个核细胞的单细胞RNA测序数据,揭示化疗与化学免疫治疗应答差异的外周免疫动态机制 | 首次将系统级免疫状态建模与通路级机制推断相结合,利用治疗臂、纵向采样和临床应答信息解析淋巴和髓系免疫程序,识别不同治疗和应答特异性的免疫状态,并将外周免疫程序投影到独立I-SPY2队列验证其泛化性 | 样本量相对有限,仅针对晚期TNBC患者,需要更大规模的前瞻性研究验证;外周免疫动态与肿瘤微环境的直接关联仍需进一步阐明;I-SPY2验证为投影分析而非直接实验验证 | 揭示三阴性乳腺癌中化疗与化学免疫治疗应答和耐药的外周免疫动态机制,建立外周免疫状态与治疗应答之间的联系 | 晚期三阴性乳腺癌患者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 晚期TNBC患者的纵向外周血单个核细胞样本,具体数量未在摘要中说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 258 | 2026-09-23 |
Single-Cell Characterization of Terminal States and State-Specific Transcriptional Regulatory Networks in Hepatocellular Carcinoma
2026-05, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.71214
PMID:42186138
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研究论文 | 该研究利用公开的单细胞RNA测序数据,建立了整合细胞命运动态与转录调控网络的框架,揭示了肝细胞癌的三种终末细胞状态及其特异性调控网络,并将增殖状态相关特征与不良临床预后相关联。 | 首次整合CellRank命运推断与SCENIC调控网络重建,系统刻画了肝细胞癌恶性细胞的终末状态及其状态特异性转录调控网络,并发现增殖状态来源的转录特征与患者总生存期较差相关。 | 研究基于公开单细胞RNA测序数据的再分析,缺乏实验验证;样本来源和数量受限于公共数据库;未进行前瞻性临床队列验证。 | 阐明肝细胞癌进展过程中肿瘤细胞状态沿命运轨迹的出现及其转录调控机制。 | 肝细胞癌恶性细胞。 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | CellRank, SCENIC | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 259 | 2026-09-23 |
Post-Stroke Depression Is Associated With Shared Neurodevelopmental Risk and Circuit Disruption
2026-May, Brain and behavior
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/brb3.71502
PMID:42178876
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研究论文 | 该研究整合跨疾病基因组学、发育空间转录组学和因果神经影像学,揭示了卒中后抑郁与共享的神经发育风险及神经环路破坏之间的关联。 | 首次将跨疾病基因组学、胚胎期空间转录组学(E16.5)和因果神经影像学(spDCM)整合,揭示了卒中后抑郁的发育-获得性统一病理生理机制,并识别出HDAC9/PITX2通路及AN-DMN环路作为潜在靶点。 | 样本量较小(16例PSD患者和14例匹配对照),空间转录组学映射基于胚胎小鼠脑而非人类脑组织,结论的临床推广需进一步验证。 | 探究卒中后抑郁的生物学基础,阐明其与神经发育风险及神经环路破坏之间的关系。 | 16例卒中后抑郁患者和14例匹配对照。 | 数字病理学、机器学习 | 卒中后抑郁、卒中、抑郁症 | 跨疾病基因组学、发育空间转录组学、静息态功能磁共振成像(fMRI)、独立成分分析(ICA)、功能网络连接(FNC)、谱动态因果建模(spDCM) | MiXeR、condFDR、gsMap、ICA、FNC、spDCM | 基因组数据、空间转录组数据、影像数据 | 16例卒中后抑郁患者和14例匹配对照,共30例 | NA | 空间转录组学、bulk RNA-seq | NA | NA |
| 260 | 2026-09-23 |
COX2+/PDGFRα+ fibroblasts selectively localize near bile ducts and interact with immune cells in early liver fibrosis in mice
2026-May, Physiological reports
IF:2.2Q3
DOI:10.14814/phy2.70938
PMID:42178880
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研究论文 | 该研究通过对健康小鼠肝脏中PDGFRα阳性成纤维细胞进行单细胞RNA测序,并结合胆管结扎诱导的肝纤维化模型,揭示了COX2阳性PDGFRα阳性成纤维细胞亚群定位于胆管周围并与免疫细胞相互作用 | 首次在健康小鼠肝脏中鉴定出COX2高表达的PDGFRα阳性成纤维细胞亚群,发现其选择性定位于胆管周围,并可能通过COX2与免疫细胞优先相互作用,揭示了PDGFRα阳性成纤维细胞在肝纤维化早期反应中的异质性 | 研究仅基于小鼠模型,尚未在人类肝脏纤维化中验证;样本仅来自健康小鼠肝脏,未涵盖不同纤维化阶段的动态变化;COX2阳性亚群的具体功能机制尚未通过体内功能实验充分验证 | 探究PDGFRα阳性成纤维细胞在肝纤维化早期的细胞异质性及其与免疫细胞的相互作用 | 健康小鼠肝脏中的PDGFRα阳性成纤维细胞及胆管结扎诱导的肝纤维化小鼠模型 | 单细胞组学 | 肝纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 来自健康小鼠肝脏的PDGFRα阳性成纤维细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |