本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2521 | 2026-03-25 |
Integrative Multi-Omics and Single-Cell Profiling Identify Chitinase Domain Containing Protein 1 (CHID1) as a Prognostic Biomarker in Glioblastoma
2026, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.130519
PMID:41869455
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学和单细胞分析,鉴定CHID1作为胶质母细胞瘤的预后生物标志物 | 首次全面探索CHID1在胶质母细胞瘤中的表达模式及其与代谢和氧化还原相关通路的关联 | 研究主要基于生物信息学分析,缺乏深入的实验验证 | 探究CHID1在胶质母细胞瘤中的表达、功能及其作为预后标志物的潜力 | 胶质母细胞瘤患者样本及正常脑组织 | 生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序、转录组学分析、分子对接 | NA | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | TCGA-GBM和CGGA数据集中的胶质母细胞瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2522 | 2026-03-25 |
Spatial Omics in Gastrointestinal Oncology: Recent Advances, Therapeutic Insights, and Clinical Translation
2026, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.127381
PMID:41869445
|
综述 | 本文综述了空间组学技术在胃肠道肿瘤学中的最新进展、治疗见解及临床转化应用 | 整合了空间转录组学、蛋白质组学、代谢组学和表观基因组学等多组学技术,以高分辨率解析肿瘤微环境,揭示空间定义的生态位,为个性化治疗提供新视角 | 面临标准化、数据整合和临床验证等挑战,尚未完全融入常规肿瘤学实践 | 探讨空间组学技术在胃肠道肿瘤诊断、治疗分层和疗效监测中的应用潜力 | 胃肠道癌症,包括结直肠癌、胃癌和食管癌 | 数字病理学 | 胃肠道癌症 | 空间转录组学、空间蛋白质组学、空间代谢组学、空间表观基因组学 | NA | 空间多组学数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 空间代谢组学, 空间表观基因组学 | NA | NA |
| 2523 | 2026-03-25 |
Mapping Myeloid Cell Diversity in Diffuse Large B-Cell Lymphoma: Impact on T Cell Exhaustion and Clinical Prognosis
2026, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.121954
PMID:41869451
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术分析了超过3000名弥漫性大B细胞淋巴瘤患者的免疫微环境,揭示了恶性B细胞和髓系细胞的多样性及其与临床预后的关联 | 利用单细胞测序技术大规模描绘DLBCL肿瘤微环境中的髓系细胞多样性,并发现巨噬细胞与CD8 T细胞间的相互作用可能导致T细胞耗竭,为免疫抑制微环境提供了新见解 | 研究主要基于单细胞和RNA表达微阵列数据的回顾性分析,缺乏实验验证和前瞻性临床研究 | 研究弥漫性大B细胞淋巴瘤肿瘤微环境中的免疫细胞多样性及其对临床预后的影响 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤患者肿瘤组织中的恶性B细胞和髓系细胞 | 数字病理学 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤 | 单细胞测序,RNA表达微阵列 | NA | 单细胞数据,RNA表达数据 | 超过3000名DLBCL患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2524 | 2026-03-24 |
Hemp seed oil mediates injury mitigation and anti-inflammation in radiated splenic T cells
2026-May, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2026.158004
PMID:41797188
|
研究论文 | 本研究探讨了火麻籽油在急性辐射暴露下对小鼠脾脏T细胞的保护作用及其抗炎机制 | 首次结合单细胞RNA测序和网络药理学方法,系统揭示了火麻籽油通过调节T细胞分化和炎症反应来缓解辐射损伤的多靶点免疫调节作用 | 研究仅基于小鼠模型,尚未在人体中进行验证,且火麻籽油的具体活性成分和作用通路需进一步实验确认 | 评估火麻籽油对急性辐射诱导的造血损伤和免疫缺陷的防护效果,并阐明其分子机制 | 暴露于致死剂量辐射的小鼠及其脾脏T细胞 | 数字病理学 | 辐射损伤 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、HPLC分析、网络药理学、分子对接 | NA | 基因表达数据、细胞表型数据、化学分析数据 | 未明确说明具体样本数量,但涉及小鼠生存实验和脾脏细胞分析 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2525 | 2026-03-24 |
Sidaxue ameliorates rheumatoid arthritis by inhibiting synovial neutrophil migration: Insights from an integrated multi-omics analysis
2026-May, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2026.158050
PMID:41825207
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学分析,揭示了苗药四达雪通过抑制RAC1/PAK1/LIMK1/Cofilin1信号轴来减少滑膜中性粒细胞迁移和激活,从而改善类风湿关节炎 | 首次结合bulk RNA-seq、scRNA-seq和孟德尔随机化分析,识别出RAC1/PAK1通路作为RA中性粒细胞迁移的关键靶点,并验证了传统苗药四达雪通过该通路发挥治疗作用的新机制 | 研究主要基于胶原诱导的关节炎大鼠模型,人体临床试验数据缺乏,且苗药成分复杂,具体活性成分的贡献需进一步分离鉴定 | 评估苗药四达雪对类风湿关节炎中性粒细胞迁移的影响并揭示其分子机制 | 类风湿关节炎患者相关数据、胶原诱导关节炎大鼠模型、体外培养的中性粒细胞 | 多组学整合分析 | 类风湿关节炎 | bulk RNA-seq, scRNA-seq, 孟德尔随机化, UHPLC-MS, 分子对接, 分子动力学模拟 | 胶原诱导关节炎大鼠模型 | 转录组数据、质谱数据、体外功能实验数据、体内病理数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2526 | 2026-03-24 |
Sihe Tufuling formula alleviates imiquimod-induced psoriasis-like skin lesions in mice by modulating the HIF-1 signaling pathway
2026-May, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2026.158033
PMID:41825206
|
研究论文 | 本研究探讨了四和土茯苓方及其主药土茯苓通过调节HIF-1信号通路缓解咪喹莫特诱导的小鼠银屑病样皮肤病变的机制 | 首次结合转录组测序和单细胞RNA测序技术,系统揭示了四和土茯苓方及土茯苓通过抑制HIF-1信号通路减轻银屑病样病变的分子机制 | 研究基于小鼠模型,其结论在人体中的适用性需进一步验证;未详细探讨方剂中其他草药成分的单独作用 | 探究四和土茯苓方及其主药土茯苓的抗银屑病活性及作用机制 | 咪喹莫特诱导的银屑病样小鼠模型、四和土茯苓方、土茯苓 | 数字病理学 | 银屑病 | 超高效液相色谱-质谱联用、转录组测序、单细胞RNA测序、免疫组织化学、免疫荧光、定量逆转录PCR | 小鼠疾病模型 | 化学组分数据、转录组数据、单细胞RNA测序数据、组织病理图像 | 未明确说明具体样本数量,但涉及咪喹莫特诱导的银屑病样小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2527 | 2026-03-24 |
Liquiritigenin targets transferrin receptor to potentiate ferroptosis sensitivity in colorectal cancer cells
2026-May, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2026.158057
PMID:41833103
|
研究论文 | 本研究通过高通量筛选发现甘草素能靶向转铁蛋白受体,增强结直肠癌细胞对铁死亡的敏感性 | 首次发现甘草素作为铁死亡增敏剂,通过稳定转铁蛋白受体抑制其泛素化降解,从而促进细胞内铁积累和脂质过氧化 | 研究主要基于细胞和动物模型,临床转化效果需进一步验证;机制研究虽深入,但其他潜在靶点或通路未完全排除 | 系统筛选能增敏结直肠癌细胞铁死亡的自然化合物,并阐明其分子机制 | 结直肠癌细胞、皮下异种移植模型、人源类器官模型 | 癌症治疗 | 结直肠癌 | 高通量筛选、分子对接与动力学模拟、单细胞RNA测序数据分析、免疫共沉淀、泛素化检测 | NA | 实验数据、测序数据 | 未明确具体样本数量,涉及细胞系、动物模型和类器官模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2528 | 2026-03-24 |
Krüppel-like factor 2 regulates renin expression in mature juxtaglomerular cells
2026-Apr-01, American journal of physiology. Renal physiology
DOI:10.1152/ajprenal.00416.2025
PMID:41711369
|
研究论文 | 本研究探讨了Krüppel-like factor 2 (Klf2)在成熟肾小球旁细胞中调节肾素表达的机制 | 首次通过多组学分析揭示Klf2与肾素细胞身份相关,并利用条件性敲除小鼠模型证实Klf2在连接血流动力学信号与肾素转录中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类肾素细胞中的Klf2功能尚需进一步验证 | 阐明Klf2在肾素表达调控中的作用及其对血压调节的影响 | 小鼠肾素谱系细胞,特别是成熟肾小球旁细胞 | 分子生物学与生理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,条件性基因敲除,免疫组织化学,血压测量 | 条件性敲除小鼠模型 | 基因表达数据,组织形态数据,血压数据 | 未明确指定样本数量,但涉及多个年龄组和实验条件的小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2529 | 2026-03-24 |
DNAJA1 as a modulator of CD8+ T-cell function and prognosis in lung cancer: implications for immune regulation and therapeutic targeting
2026-Apr, Journal of drug targeting
IF:4.3Q1
DOI:10.1080/1061186X.2025.2571546
PMID:41060214
|
研究论文 | 本研究揭示了DNAJA1在肺腺癌中通过表观遗传激活驱动CD8+ T细胞耗竭和促肿瘤巨噬细胞极化,并可作为免疫失调肿瘤微环境中患者的潜在生物标志物 | 首次将DNAJA1确立为通过表观遗传机制协调CD8+ T细胞耗竭和巨噬细胞极化的关键免疫调节因子,并揭示了其与PD-L1表达的相关性 | 研究主要基于体外实验和异种移植模型,在人体内的直接功能验证和临床转化潜力仍需进一步探索 | 探究DNAJA1在肺腺癌免疫调节和肿瘤进展中的作用机制 | 肺腺癌组织、CD8+ T细胞、巨噬细胞、肿瘤细胞系 | 肿瘤免疫学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、转录组分析、甲基化分析、共培养实验、染色质分析、功能实验、异种移植模型 | NA | 测序数据、表观遗传数据、实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2530 | 2026-03-24 |
scResponse: A Rank-Based Method for Identifying Cell States That Contribute to Immunotherapy Response by Single-Cell Data
2026-Mar-23, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202524397
PMID:41869876
|
研究论文 | 本研究开发了一种名为scResponse的基于排序的方法,通过单细胞数据识别影响免疫治疗反应的细胞状态 | scResponse算法首次量化单细胞对免疫治疗的反应,能捕捉多种细胞亚型和状态(如血管细胞正常化、巨噬细胞极化、CD8 T细胞终末耗竭及成纤维细胞亚型)对疗效的细微影响,并跨癌症整合分析识别关键代谢通路 | 方法作为概念验证,主要依赖计算分析,实验验证仅限于肿瘤-CD8 T细胞共培养和小鼠模型,尚未在广泛临床样本中验证 | 开发一种评估免疫治疗疗效的单细胞分辨率方法,以促进新免疫治疗增敏策略的机制理解和靶点发现 | 单细胞数据中的细胞状态,包括血管细胞、巨噬细胞、CD8 T细胞和成纤维细胞亚型 | 单细胞分析 | 癌症 | 单细胞测序 | 基于排序的算法 | 单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2531 | 2026-03-24 |
IL-4 treatment induces apoptosis of blood monocytes and proliferation of recruited injury-associated macrophages to resolve liver injury
2026-Mar-20, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2026.117136
PMID:41865375
|
研究论文 | 本研究探讨了IL-4在急性肝损伤模型中的作用机制,发现其通过诱导血液单核细胞凋亡和促进损伤相关巨噬细胞增殖来促进肝损伤修复 | 揭示了IL-4治疗通过改变损伤相关髓系细胞的组成、数量和功能来促进肝损伤修复的新途径 | 研究主要基于小鼠模型,人类应用需进一步验证;未详细探讨IL-4在其他器官损伤中的普适性 | 阐明IL-4在肝损伤修复中的治疗机制 | 小鼠急性肝损伤模型中的髓系细胞(单核细胞和巨噬细胞) | NA | 肝损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 2532 | 2026-03-24 |
Methods of muscle atrophy analysis at the single-nucleus level
2026-Mar-20, Mechanisms of ageing and development
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.mad.2026.112178
PMID:41865775
|
研究论文 | 本文介绍了一种针对骨骼肌的组织解离和细胞核分离的详细协议,并概述了适用于单细胞核RNA测序数据的生物信息学分析流程 | 优化了骨骼肌的单细胞核RNA测序样本制备方法,并提供了针对肌肉萎缩状态的转录组比较分析流程 | NA | 研究肌肉萎缩的分子机制,特别是在衰老和神经肌肉病理条件下的肌肉功能衰退 | 骨骼肌组织,特别是肌肉纤维的细胞核 | 数字病理学 | 老年疾病 | 单细胞核RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2533 | 2026-03-24 |
A single-nucleus and spatial transcriptomic atlas of poplar leaves reveals the regulation of leaf polarity and cuticle deposition
2026-Mar-20, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2026.03.015
PMID:41866110
|
研究论文 | 本研究利用单核和空间转录组学技术,绘制了杨树叶片的细胞图谱,揭示了叶片极性和角质层沉积的调控机制 | 首次整合单核与空间转录组学解析杨树叶片的细胞类型及其背腹极性,并鉴定MYC2作为调控角质层生物合成的关键转录因子 | 研究主要基于杨树模型,结果在其他植物物种中的普适性有待验证,且功能验证实验相对有限 | 探究叶片背腹极性的分子网络及其与代谢适应的整合机制 | 杨树叶片细胞 | 植物生物学 | NA | 单核转录组学, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 未明确指定样本数量,但涉及杨树叶片的多种细胞类型 | NA | 单核RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2534 | 2026-03-24 |
Single-Cell and Mendelian Randomization Analyses Identify Key Genes Common to COVID-19 and Multiple Sclerosis
2026-Mar-17, Viral immunology
IF:1.5Q4
DOI:10.1177/08828245261426986
PMID:41841545
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、全基因组关联研究和表达数量性状位点数据,识别了COVID-19和多发性硬化症共有的关键基因,并阐明了其在B细胞功能中的作用机制 | 首次结合单细胞测序与孟德尔随机化分析,系统性地识别了COVID-19和多发性硬化症共有的关键致病基因,并揭示了其在B细胞发育轨迹中的动态表达模式 | 研究中识别的关键基因名称在摘要中未明确列出,且样本来源和具体数量未详细说明 | 阐明B细胞在COVID-19和多发性硬化症发病机制中的共同分子机制,为开发更有效的治疗策略提供依据 | COVID-19患者和多发性硬化症患者的B细胞 | 生物信息学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序, 全基因组关联研究, 表达数量性状位点分析, 基因集富集分析, 伪时间分析 | 孟德尔随机化分析 | 单细胞RNA测序数据, 基因组关联数据, 表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2535 | 2026-03-24 |
Senescence-associated metabolic alterations aggravate calcific aortic valve disease
2026-Mar-17, European heart journal
IF:37.6Q1
DOI:10.1093/eurheartj/ehag191
PMID:41841768
|
研究论文 | 本研究揭示了衰老相关的NAD+代谢紊乱通过内皮细胞和巨噬细胞的不同机制,共同驱动钙化性主动脉瓣疾病的炎症和钙化过程 | 首次结合人类主动脉瓣的bulk RNA-seq和单细胞转录组学,系统绘制了NAD+通路图谱,并阐明了内皮细胞NAD+缺乏与巨噬细胞代谢多样性在疾病中的协同作用 | 动物模型和细胞实验的结果需要在更大规模的人类队列中进一步验证,且延迟治疗的疗效有限 | 探究细胞类型特异性的NAD+补救代谢紊乱是否驱动瓣膜炎症和钙化 | 人类主动脉瓣组织、Nampt基因敲除小鼠、瓣膜内皮细胞和巨噬细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | RNA-seq, 单细胞转录组学, 蛋白质组学, 孟德尔随机化 | 基因敲除小鼠模型 | 转录组数据, 蛋白质组数据, 遗传数据 | 涉及人类瓣膜组织、基因工程小鼠模型及UK Biobank队列数据 | NA | 单细胞转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2536 | 2026-03-24 |
Reactive astrocyte subpopulations with high Gfap and C4b expression in different Alzheimer's disease mouse models: Single-cell nuclear transcriptome analysis
2026-Mar-14, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-25-00789
PMID:41837502
|
研究论文 | 本研究通过单细胞核转录组测序分析,在阿尔茨海默病小鼠模型中识别出具有高Gfap和C4b表达的反应性星形胶质细胞亚群,并揭示了其在疾病早期发病机制中的潜在作用 | 首次在阿尔茨海默病小鼠模型中,利用单细胞核转录组测序技术,识别出具有高Gfap和C4b表达的反应性星形胶质细胞亚群,并发现其与RNA剪接通路相关,为疾病异质性提供了新的细胞和分子基础 | 研究样本量较小(仅涉及4只阿尔茨海默病模型小鼠和1只对照小鼠),且仅基于小鼠模型,可能无法完全反映人类阿尔茨海默病的复杂性 | 探究阿尔茨海默病早期阶段的细胞异质性和细胞类型特异性分子扰动,以识别新的靶向治疗策略 | 阿尔茨海默病小鼠模型(载脂蛋白E4敲入和淀粉样前体蛋白/早老素1小鼠)的海马组织 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞核转录组测序 | NA | 转录组数据 | 4只阿尔茨海默病模型小鼠(3只8月龄淀粉样前体蛋白/早老素1小鼠和1只6月龄载脂蛋白E4敲入小鼠)和1只6月龄载脂蛋白E3敲入对照小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2537 | 2026-03-24 |
Candidate pharmacogenetic signals at CCL2 and ITPA associated with JAK inhibitor response in Taiwanese rheumatoid arthritis
2026-Mar-12, Clinical and experimental rheumatology
IF:3.4Q2
DOI:10.55563/clinexprheumatol/17yc25
PMID:41841677
|
研究论文 | 本研究旨在通过遗传学和单细胞分析,识别与台湾类风湿关节炎患者对JAK抑制剂治疗反应相关的候选基因信号 | 整合了候选SNP分析、细胞类型特异性eQTL资源(scQTLbase)和单细胞RNA测序数据,以支持基因水平关联,并优先确定了CCL2和ITPA作为JAK抑制剂反应的候选药物遗传学信号 | 研究使用基于持续性的有效性终点,且次要EULAR结果评估为探索性,需要独立复制使用标准化ACR/EULAR结果 | 识别台湾类风湿关节炎患者中JAK抑制剂有效性的遗传预测因子 | 台湾类风湿关节炎患者 | 自然语言处理 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 遗传数据、单细胞RNA测序数据 | 275名接受JAK抑制剂治疗的RA患者(有效组217人,无效组58人) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2538 | 2026-03-24 |
RPS14 as an aging-related biomarker for early-onset alterations of testicular senescence-associated genes in spermatogenic dysfunction at childbearing age
2026-03-10, The journals of gerontology. Series A, Biological sciences and medical sciences
DOI:10.1093/gerona/glag020
PMID:41592225
|
研究论文 | 本研究识别了RPS14作为与衰老相关的生物标志物,用于早期检测年轻男性精子生成功能障碍中睾丸衰老相关基因的改变 | 首次将RPS14确定为年轻男性精子生成功能障碍中睾丸衰老相关基因早期改变的生物标志物,并揭示了其与睾丸免疫微环境及肥大细胞的关联 | 研究样本量有限,且机制研究主要基于相关性分析,需要进一步实验验证 | 识别与衰老相关的生物标志物,以早期检测年轻男性精子生成功能障碍中睾丸衰老相关基因的改变 | 年轻男性(生育年龄)的睾丸组织,包括精子生成功能正常和功能障碍的患者,以及老年小鼠和老年男性的睾丸组织 | 生殖医学 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、微阵列分析、免疫荧光 | NA | RNA测序数据、微阵列数据、图像数据 | 两个单细胞RNA测序数据集、三个批量微阵列数据集、老年小鼠、老年男性、生育年龄患者的睾丸组织 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 2539 | 2026-03-24 |
[Crosstalk of keratin 17-positive epithelial cells with CD8+ T cells in oral lichen planus and clinical relevance]
2026-Mar-09, Zhonghua kou qiang yi xue za zhi = Zhonghua kouqiang yixue zazhi = Chinese journal of stomatology
|
研究论文 | 本研究探讨了口腔扁平苔藓中角蛋白17阳性上皮细胞与CD8⁺ T细胞的相互作用,并评估了KRT17表达与临床严重程度的相关性 | 首次在单细胞水平上揭示了KRT17⁺上皮细胞在OLP中的关键作用及其通过HLA-A/B/C-CD8等信号通路与CD8⁺ T细胞的相互作用 | 样本量相对较小(单细胞数据仅5例,验证队列45例),且为单中心研究 | 探究口腔扁平苔藓的发病机制,特别是上皮细胞与免疫细胞的相互作用 | 口腔扁平苔藓患者(非糜烂型和糜烂型)及健康对照的口腔黏膜组织 | 单细胞组学 | 口腔扁平苔藓 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,多重免疫荧光染色 | NA | 单细胞RNA-seq数据,bulk RNA-seq数据,组织图像 | 单细胞测序:5例(2例NEOLP,2例EOLP,1例HC);bulk RNA-seq:40例(27例NEOLP,13例EOLP);验证队列:45例(20例NEOLP,20例EOLP,5例HC) | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2540 | 2026-03-24 |
A Zero-Inflated Hierarchical Generalized Transformation Model to Address Non-Normality in Spatially-Informed Cell-Type Deconvolution
2026-Mar-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.24.600480
PMID:41867857
|
研究论文 | 本文提出了一种零膨胀分层广义变换模型(ZI-HGT),用于解决口腔鳞状细胞癌(OSCC)空间转录组数据中的非正态性和高零膨胀问题,以改进细胞类型反卷积的准确性 | 开发了零膨胀分层广义变换模型(ZI-HGT)作为辅助贝叶斯技术,结合条件自回归反卷积(CARD)框架,首次解决了OSCC空间转录组数据的高零膨胀问题,并量化了细胞类型比例估计的不确定性 | NA | 改进口腔鳞状细胞癌(OSCC)空间转录组数据中的细胞类型反卷积方法,以更准确地解析肿瘤微环境 | 口腔鳞状细胞癌(OSCC)的空间转录组数据 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | 空间转录组学 | 零膨胀分层广义变换模型(ZI-HGT)与条件自回归反卷积(CARD)结合 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |