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当前共找到 9441 篇文献,本页显示第 2481 - 2500 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
2481 2026-08-18
Stage-Specific Gene Expression Profiles in Multiple Sclerosis Cortical Lesions Identified via Spatial Transcriptomics
2026-Aug-17, Omics : a journal of integrative biology IF:2.2Q3
研究论文 通过空间转录组学分析多发性硬化症皮层灰质病变不同阶段的基因表达谱,发现早期活动性、慢性活动性和慢性非活动性病变具有独特的转录组特征 首次使用空间转录组学技术对人类多发性硬化症皮层灰质病变进行分期特异性基因表达分析,揭示了不同病变阶段的独特分子特征 样本量有限,早期活动性病变仅由一个病变代表,研究结果属于探索性 探究多发性硬化症灰质病变不同阶段的分子机制,识别潜在的生物标志物 多发性硬化症患者死后皮层组织中的灰质病变(早期活动性、慢性活动性、慢性非活动性) 空间转录组学 多发性硬化症 空间转录组学 NA 基因表达数据 有限样本量(具体数量未提供,早期活动性病变仅一个) NA 空间转录组学 NA NA
2482 2026-08-18
Highly Sensitive Spatial Host-Microbiome Transcriptomics in FFPE Tissues via Iterative Hydrogel Expansion
2026-Aug-17, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本文介绍了一种名为Ex-spRandom的高灵敏空间转录组学平台,通过迭代水凝胶膨胀技术,克服了福尔马林固定石蜡包埋组织中空间分辨率与转录组灵敏度之间的权衡限制 创新点在于将随机引物原位cDNA合成化学与基于互穿聚合物网络的组织膨胀化学相结合,通过物理化学协同作用直接转化多样化的断裂RNA生物类型为稳定锚定的cDNA,同时提高空间信号限制和基因检测灵敏度 未明确提及 开发一种高灵敏的空间宿主-微生物组转录组学方法,用于存档FFPE组织,同时实现高空间分辨率和转录组灵敏度 胚胎眼和结肠组织,包括宿主和微生物RNA 空间转录组学 不适用 空间转录组学、原位cDNA合成、组织膨胀 不适用 基因表达数据 未明确提及样本数量,涉及胚胎眼和结肠组织 不适用 空间转录组学 不适用 不适用
2483 2026-08-18
Commensal Skin Microbiota Modulate Responses to Ultraviolet Radiation in Humans
2026-Aug-17, The British journal of dermatology
研究论文 本研究探讨了皮肤共生微生物群对健康人类紫外线辐射诱导的炎症(晒伤反应)的影响 首次通过乙醇消毒与未消毒皮肤的对照实验,结合空间转录组学技术,揭示皮肤微生物群在紫外线反应中促进角质细胞凋亡和炎症浸润、抑制增殖的新机制 样本量较小(n=10),且仅涉及Fitzpatrick I-III型皮肤,结果可能不适用于其他肤色人群 探究皮肤微生物群对紫外线辐射诱导的炎症反应的影响及其潜在机制 10名健康志愿者的上背部皮肤(Fitzpatrick皮肤类型I-III) 数字病理学 皮肤病 空间转录组学 NA 图像和基因表达数据 10名健康志愿者 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium 10x Visium空间转录组学
2484 2026-08-18
Multi-Omics Integration Identifies a CDH3-Associated Malignant Epithelial State and Immunosuppressive Niche to Predict Prognosis in Thymic Epithelial Tumors
2026-Aug-15, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 通过多组学整合分析,识别与CDH3相关的恶性上皮状态及免疫抑制微环境,以预测胸腺上皮肿瘤的预后 首次在多组学水平上整合单细胞RNA测序、空间转录组学、多重免疫荧光、批量转录组学、功能实验、异种移植验证和计算病理学,全面刻画胸腺上皮肿瘤中的恶性上皮异质性,并确定了CDH3作为连接恶性上皮可塑性与免疫抑制微环境及不良临床行为的生物标志物和治疗靶点 摘要未提及明确的研究局限性 表征胸腺上皮肿瘤中的恶性上皮异质性及其微环境组织,并识别预后相关生物标志物和治疗靶点 胸腺上皮肿瘤(TETs),包括胸腺瘤和胸腺癌,涉及细胞系、患者来源的类器官和异种移植模型 计算病理学 胸腺上皮肿瘤 单细胞RNA测序、空间转录组学、多重免疫荧光、批量转录组学、功能实验、异种移植验证、计算病理学 深度学习模型 基因表达数据、空间转录组数据、免疫荧光图像、H&E幻灯片图像 涉及TCGA-THYM数据集及患者来源的胸腺癌类器官,具体样本数量未在摘要中说明 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多重免疫荧光, 批量RNA测序 NA NA
2485 2026-08-18
Integrative genomic and proteomic analyses identify candidate genetic loci and genetically supported proteins in age-related macular degeneration
2026-Aug-14, Eye and vision (London, England)
研究论文 通过整合基因组和蛋白质组分析,识别年龄相关性黄斑变性的候选基因位点和遗传支持的蛋白质 首次通过多组学整合分析(包括GWAS、蛋白质组MR、共定位和SMR-HEIDI)识别出7个新AMD风险位点和23个遗传支持的蛋白质,并优先确定LAMC2和PLTP为一级风险基因 研究为探索性,需要实验验证提出的靶点和潜在机制;环磷酰胺的发现仅作为通路指示,因其毒性未作为直接治疗建议 识别AMD的候选基因位点和遗传支持的蛋白质,为一级预防提供转化基础 年龄相关性黄斑变性(AMD)的基因位点和血浆蛋白质 基因组学, 蛋白质组学 年龄相关性黄斑变性 GWAS, 蛋白质组MR, 共定位, SMR-HEIDI, 单细胞RNA测序, 基因敲除 孟德尔随机化模型 基因组、蛋白质组、单细胞转录组、免疫表型数据 28,543例病例和1,072,092例对照 NA 单细胞RNA测序 NA NA
2486 2026-08-18
Brain corticogenesis promotes SARS-CoV-2 neuro-glial tropism through lipid-dependent viral replication
2026-Aug-11, Stem cell reports IF:5.9Q2
研究论文 本研究利用多组学方法建立不同发育阶段的大脑类器官模型,揭示脑皮层形成过程通过脂质依赖性病毒复制增强SARS-CoV-2的神经胶质趋向性 首次定量分析SARS-CoV-2在成熟大脑类器官中的长期病毒传播动力学,并揭示脂质代谢重塑在介导脑成熟与病毒易感性之间的机制联系 研究主要基于体外类器官模型,可能无法完全模拟体内大脑微环境的复杂性和免疫反应 探究大脑发育成熟过程与SARS-CoV-2神经侵袭性之间的关系,并揭示其潜在机制 培养60天(EB60)和120天(EB120)的大脑类器官,模拟未成熟和成熟发育阶段 病毒学、神经科学、多组学 COVID-19相关神经系统病变 多组学(单细胞转录组学、RT-qPCR、免疫组化) 类器官模型 单细胞转录组数据、基因表达数据、图像数据 两种发育阶段的大脑类器官(EB60和EB120) NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组学使用未指定平台
2487 2026-08-18
High and intermittent hydrostatic pressure promotes maturation of engineered cardiac tissues derived from human pluripotent stem cells
2026-Aug-11, Stem cell reports IF:5.9Q2
研究论文 该研究开发了一种利用高且间歇性的静水压处理促进人多能干细胞来源工程心脏组织成熟的方法,并在大鼠心肌梗死模型中验证了其治疗效果 首次证明间歇性静水压(1小时/天,50 kPa,持续3天)可促进工程心脏组织的成熟,并发现内皮细胞在此过程中起关键作用 静水压处理的最佳参数(压力大小、时间、频率)尚未系统优化,且训练后的组织在临床转化中的长期安全性和有效性需进一步验证 利用静水压模拟心室负荷,促进人多能干细胞来源工程心脏组织的结构和功能成熟,以提高其在再生治疗中的应用潜力 人多能干细胞来源的心血管细胞、工程心脏组织、大鼠心肌梗死模型 组织工程与再生医学 心肌梗死 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据、组织学图像、功能测量数据 工程心脏组织样本及大鼠心肌梗死模型,具体数量未提供 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 单细胞RNA测序平台
2488 2026-08-18
Single cell CRISPR screen identifies antagonism between Nsd1-H3K36me2 and Ezh2-H3K27me3 orchestrates pluripotency transition
2026-Aug-11, Stem cell reports IF:5.9Q2
研究论文 利用单细胞CRISPR筛选揭示了Nsd1-H3K36me2与Ezh2-H3K27me3之间的拮抗作用,该作用调控小鼠胚胎干细胞的多能性转变 首次采用CROP-seq技术结合单细胞RNA测序,系统解析了表观遗传调控在多能性网络中的作用,并发现H3K36me2通过调控Dnmt1和Dnmt3a表达来影响DNA甲基化的新机制 未明确提及具体局限性 探究调控小鼠胚胎干细胞多能性网络的表观遗传机制 小鼠胚胎干细胞(mESCs) 单细胞组学 不适用 CROP-seq(CRISPR筛选耦合单细胞RNA-seq) CRISPR/Cas9基因敲除模型 单细胞转录组数据 不适用(未提供具体样本数量) 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'转录组测序
2489 2026-08-18
Brain injury reactivates a developmental program driving genesis and integration of transient LGE-class interneurons
2026-Aug-11, Stem cell reports IF:5.9Q2
研究论文 本研究揭示脑损伤后纹状体星形胶质细胞产生的一类瞬时LGE类中间神经元,能够成熟并整合到皮层-纹状体-丘脑回路中 首次证明脑损伤后由星形胶质细胞产生的神经元属于特定的LGE-MEIS2/PAX6中间神经元类别,而非成体纹状体神经元类型,并发现哺乳动物端脑星形胶质细胞共同致力于这一瞬时神经元类别 研究主要基于小鼠模型,且对神经元的瞬时性和功能整合的长期影响尚未完全阐明 探究脑损伤反应性神经发生中星形胶质细胞产生神经元的身份和整合机制 小鼠纹状体星形胶质细胞及其产生的神经元,以及皮层和纹状体星形胶质细胞 神经科学 脑损伤 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA 基因表达数据、空间转录组数据 小鼠模型,具体数量未提供 10x Genomics 单细胞RNA测序、空间转录组学 10x Chromium、10x Visium 单细胞RNA测序和空间转录组学平台,具体配置未详细说明
2490 2026-08-18
Quantitative RNA spatial profiling using single-molecule RNA FISH on plant tissue cryosections
2026-Aug-10, Plant communications IF:9.4Q1
研究论文 提出一种优化的单分子RNA荧光原位杂交方法(cryo-smFISH),用于植物组织冷冻切片的RNA定量空间分析 针对植物组织切片优化了smFISH方法,结合深度学习算法实现细胞核与细胞质中RNA丰度的精确分配,并与免疫荧光技术兼容,可用于验证scRNA-seq表达模式 未提及方法在厚组织或非模式植物中的适用性,也未详细讨论探针设计复杂度 开发并验证一种适用于植物组织冷冻切片的简单、稳健的smFISH方法,以实现单mRNA分子的可视化和定量 植物组织冷冻切片中的mRNA分子,包括低表达转录本和长链非编码RNA 数字病理学 NA 单分子RNA荧光原位杂交(smFISH)、单细胞RNA测序(scRNA-seq) 深度学习算法 图像 植物组织切片样本 NA 单分子RNA荧光原位杂交、单细胞RNA测序 NA NA
2491 2026-08-18
Binary-SPA: a reference-free method for cell annotation in high-resolution spatial transcriptomics
2026-Aug-10, Nucleic acids research IF:16.6Q1
研究论文 提出了一种无需参考数据的空间转录组细胞注释方法Binary-SPA,通过两阶段策略实现高分辨率细胞类型注释。 Binary-SPA无需匹配的单细胞RNA测序参考数据,采用内部参考进行标签转移,提高了注释准确性和覆盖率,并在多种平台和组织类型中表现稳健。 未明确提及,但可能依赖于预定义的标记基因集,对标记基因选择敏感。 开发一种可靠且无需参考数据的空间转录组细胞注释方法,广泛适用于研究和临床样本。 高分辨率空间转录组数据,包括骨髓活检等复杂样本。 计算生物学 NA 空间转录组学 分类器和标签转移方法 空间转录组数据,蛋白表达数据(用于验证) 多种空间平台、组织类型和保存协议的样本,具体数量未说明 NA 空间转录组学 NA 多种空间平台,具体未指定
2492 2026-08-18
d-serine as a metabolic immune checkpoint in the tumour microenvironment
2026-Aug, EBioMedicine IF:9.7Q1
研究论文 本研究通过小鼠模型和临床队列,发现d-丝氨酸作为代谢免疫检查点,促进肿瘤免疫逃逸并与免疫治疗耐药相关 首次发现d-丝氨酸在胃肠道癌症中作为免疫抑制代谢物,通过与SPP1相关的巨噬细胞信号和CD8+ T细胞抑制促进肿瘤进展 摘要未提及研究的局限性 确定d-氨基酸(特别是d-丝氨酸)如何塑造肿瘤免疫微环境并影响胃肠道癌症的临床结局 小鼠MC38肿瘤和原位胃癌类器官异种移植模型,以及胃肠道癌症患者(健康对照87例,胃癌患者三组共150例) 免疫学、肿瘤学 胃肠道癌症(胃癌) 单细胞RNA测序、流式细胞术、体外巨噬细胞-T细胞共培养、微生物组操作 小鼠肿瘤模型、类器官异种移植模型 单细胞转录组数据、流式细胞术数据、临床样本中d-氨基酸浓度数据 健康对照87例,胃癌患者三组(14例、108例、28例) NA 单细胞RNA测序 NA NA
2493 2026-08-18
Human single-cell atlas of proliferative diabetic retinopathy reveals a SOX15-overexpressing stromal population driving retinal fibrosis through the endothelin-1 -EDNRB axis
2026-Jul-22, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序构建人类增殖性糖尿病视网膜病变的单细胞图谱,揭示SOX15过表达的基质细胞群通过内皮素-1-EDNRB轴驱动视网膜纤维化的新机制 首次构建人类PDR视网膜的单细胞转录组图谱,并发现SOX15-EDN1-EDNRB轴是驱动视网膜纤维化的新机制,为抗纤维化治疗提供新靶点 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人体内的长期效应和临床转化仍需进一步验证 阐明PDR中视网膜纤维化的关键细胞机制,寻找有效的抗纤维化治疗策略 人类PDR视网膜组织、非糖尿病对照视网膜、小鼠模型及体外培养的成纤维细胞 单细胞转录组学 增殖性糖尿病视网膜病变 单细胞RNA测序、免疫荧光、条件性基因敲除、siRNA敲低、药物拮抗剂 scRNA-seq分析、条件性基因敲除小鼠模型 单细胞转录组数据、图像数据 PDR器官捐献者和非糖尿病对照的视网膜组织,具体数量未在摘要中提供 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2494 2026-08-18
Dissecting human organ development using spatial technologies
2026-Jul-08, Developmental cell IF:10.7Q1
综述 综述空间技术如何通过分子谱分析揭示人类器官发育中的基因调控、细胞互作与组织结构,并探讨将空间谱分析与类器官结合的方法及未来方向 系统整合了空间多组学、类器官模型与机器学习,提出通过结合空间分析与可操控类器官系统来推进发育生物学的机制性和预测性研究 人类发育组织获取受限和伦理约束限制了实验验证及机制研究,类器官模型可能不能完全重现体内器官发育的复杂性 总结当前空间技术及其在人类器官发育研究中的应用,并突出类器官集成与未来整合策略以促进机制性和预测性发育生物学 人类胚胎和胎儿器官,以及干细胞衍生的类器官模型 空间转录组学 不适用 空间转录组学、空间表观基因组学、空间蛋白质组学、空间代谢组学、空间多组学 不适用 空间分子谱数据(转录、表观、蛋白质、代谢) 不适用 不适用 空间转录组学、空间表观基因组学、空间蛋白质组学、空间代谢组学、空间多组学 不适用 不适用
2495 2026-08-18
Integrated Single-Cell and Bulk Transcriptomic Analyses Identify a B Cell- and Plasma Cell-Associated Prognostic Signature and a Candidate Tumor-Suppressive Role for FUT8 in Ovarian Cancer
2026-07-08, Genes IF:2.8Q2
研究论文 本研究整合单细胞和批量转录组数据,识别卵巢癌中B细胞和浆细胞相关的预后特征,并探索FUT8基因的潜在肿瘤抑制作用 首次将单细胞和批量转录组数据整合,构建B细胞和浆细胞相关的预后模型,并揭示FUT8在卵巢癌中的潜在肿瘤抑制功能 需要进一步的实验研究来验证和阐明涉及的精确分子机制 探讨卵巢癌中糖基化相关调节因子在肿瘤微环境中的功能,特别是FUT8在卵巢癌发展中的潜在作用 卵巢癌组织和正常卵巢组织的单细胞转录组数据,以及来自TCGA和GSE63885的批量转录组数据 生物信息学 卵巢癌 单细胞RNA测序、批量RNA测序、qRT-PCR、CCK-8实验、流式细胞术 预后模型 单细胞转录组数据和批量转录组数据 12个卵巢癌和正常卵巢组织样本(GSE184880),TCGA队列和GSE63885队列 NA 单细胞RNA-seq、bulk RNA-seq NA NA
2496 2026-08-18
Multiomics Insights Into the Role of Spondin-1 in the Pathogenesis and Prognosis of Atrial Fibrillation
2026-Jul-07, Journal of the American Heart Association IF:5.0Q1
研究论文 通过整合多组学方法,本研究识别出Spondin-1在心房颤动发病机制和预后中的潜在作用 采用多层遗传筛选结合孟德尔随机化和共定位分析,首次将SPON1确定为AF的候选靶点,并通过单核RNA测序、空间转录组学及实验验证进行深入表征 研究主要基于遗传关联和生物信息学分析,实验验证仅针对成纤维细胞表型,临床关联分析局限于UK Biobank队列,可能受未测量混杂因素影响 利用整合多组学方法识别心房颤动的新型蛋白靶点 心房颤动患者及UK Biobank队列中的个体,包括血浆蛋白水平、心脏磁共振表型和成纤维细胞 多组学、遗传学、转录组学 心房颤动 孟德尔随机化、共定位分析、单核RNA测序、空间转录组学 NA 遗传数据、转录组数据、蛋白组数据、临床表型数据 UK Biobank队列39,372名个体 10x Genomics 单核RNA测序、空间转录组学 10x Chromium、10x Visium 用于单核RNA测序和空间转录组学分析
2497 2026-08-18
Inflammatory and Structural Endotypes of Human Atherosclerotic Plaque Revealed by Integrated Transcriptomic Analysis
2026-07-02, Genes IF:2.8Q2
研究论文 通过整合批量RNA测序和单细胞RNA测序数据,揭示人类动脉粥样硬化斑块中与不稳定和稳定表型相关的炎症性和结构性内型 首次将批量转录组与单细胞转录组数据整合,将炎症和结构信号映射到特定细胞区室和调控网络,提出动脉粥样硬化斑块的炎症性和结构性内型框架 未明确提及局限性,但研究依赖于公开数据集,可能受样本异质性和批次效应影响 识别与稳定和不稳定动脉粥样硬化斑块表型相关的协调转录程序,并映射到具体细胞类型和调控网络 人类颈动脉斑块和冠状动脉粥样硬化病变 生物信息学、转录组学 动脉粥样硬化 批量RNA测序、单细胞RNA测序 limma、clusterProfiler、Seurat模块评分、decoupleR、DoRothEA 转录组数据(bulk RNA-seq和scRNA-seq) 来自GSE120521的稳定和不稳定人类颈动脉斑块样本,以及来自GSE131778的人类冠状动脉粥样硬化病变样本(具体数量未在摘要中提供) NA 批量RNA测序、单细胞RNA测序 NA NA
2498 2026-08-18
TREM1+ Neutrophils Determine Immunosuppressive Microenvironment and Immunotherapy Response in Hepatocellular Carcinoma
2026-07, Liver international : official journal of the International Association for the Study of the Liver IF:6.0Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和质谱流式细胞术,识别出TREM1+中性粒细胞在肝细胞癌中驱动免疫抑制微环境,并与不良预后及免疫治疗反应相关 首次揭示TREM1+中性粒细胞在肝细胞癌中的关键免疫抑制功能,并通过药理学抑制TREM1增强抗PD-1治疗效果 研究主要基于临床样本和临床前模型,需进一步验证TREM1靶向治疗在临床试验中的安全性和有效性 识别驱动肝细胞癌进展的关键中性粒细胞亚群,并评估其作为治疗靶点的潜力 肝细胞癌患者肿瘤组织中的中性粒细胞亚群及临床前模型 数字病理学 肝细胞癌 单细胞RNA测序,质谱流式细胞术,免疫荧光染色 NA 图像,基因表达数据 包含肝细胞癌患者队列及临床前模型,具体样本数量未在摘要中提供 10x Genomics, Fluidigm 单细胞RNA测序,质谱流式细胞术 10x Chromium, CyTOF 10x Chromium用于单细胞RNA测序,流体igm CyTOF系统用于质谱流式细胞术分析
2499 2026-08-18
IL15-mediated crosstalk between LSECs and CD8⁺ tissue-resident memory T cells drives alcohol-associated hepatitis
2026-Jul-01, Hepatology communications IF:5.6Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和功能实验,揭示了酒精相关性肝炎中肝窦内皮细胞与CD8组织驻留记忆T细胞之间的IL15介导的相互作用,促进了T细胞活化及肝损伤 首次发现并验证了肝窦内皮细胞通过IL15信号通路放大AKT途径,促进CD8组织驻留记忆T细胞的持续存在和炎症活性,并提出了靶向IL15-LSEC-AKT轴的治疗策略 主要基于小鼠模型和体外实验,人类数据仅限于公共数据集的再分析和免疫组化验证,样本量有限,可能需要进一步临床试验确认 阐明酒精相关性肝炎中组织驻留记忆T细胞的功能及其与肝窦内皮细胞的相互作用机制 小鼠和人类的肝脏及血液免疫细胞,特别是CD8 T细胞亚群和肝窦内皮细胞 免疫学 酒精相关性肝炎 单细胞RNA测序,批量RNA测序,免疫组化,体外共培养,流式细胞术 NA 基因表达数据,序列数据,图像数据 小鼠模型及人类肝组织样本(具体数量未提及) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
2500 2026-08-18
EPHX2 Orchestrates Intestinal Epithelial Barrier Repair in Ulcerative Colitis: An Integrated Multi-Omics and Experimental Study
2026-07, Clinical and translational science
研究论文 本研究整合多组学数据与实验验证,发现EPHX2在溃疡性结肠炎中调控肠道上皮屏障修复的关键作用 结合GWAS-eQTL与单细胞转录组数据筛选出UC因果基因EPHX2,并通过结肠炎小鼠和体外炎症模型验证其功能,揭示其在黏膜愈合中的新机制 摘要未提及研究局限性 探究溃疡性结肠炎的遗传决定因素,特别是EPHX2在肠道上皮屏障修复中的作用 溃疡性结肠炎患者及结肠炎小鼠模型的肠道上皮细胞 基因组学 溃疡性结肠炎 GWAS-eQTL分析、单细胞转录组测序、基因集富集分析、功能实验 NA 基因表达数据、单细胞转录组数据、动物模型数据 摘要未提及具体样本量 NA 单细胞转录组测序 NA NA
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