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当前共找到 9441 篇文献,本页显示第 2441 - 2460 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
2441 2026-08-19
GPR132 antagonists alleviate atherosclerosis by suppressing M1 polarization and subsequent VSMCs proliferation and migration as revealed by transcriptomic profiling
2026-Aug-18, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.] IF:4.8Q2
研究论文 通过转录组分析发现GPR132拮抗剂通过抑制M1极化及随后的血管平滑肌细胞增殖和迁移来减轻动脉粥样硬化 首次阐明GPR132在动脉粥样硬化相关巨噬细胞极化中的特定作用,揭示其通过p38/MAPK信号通路驱动M1极化,并提供药物拮抗治疗的证据 未明确说明 探讨GPR132在动脉粥样硬化中巨噬细胞极化中的作用及其作为治疗靶点的潜力 高脂饮食喂养的ApoE-/-小鼠、小鼠和人动脉粥样硬化斑块中的巨噬细胞、GPR132过表达和敲除巨噬细胞、血管平滑肌细胞 转录组学 动脉粥样硬化 单细胞RNA测序、转录组分析、RNA测序 NA 基因表达数据 未明确说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
2442 2026-08-19
Integrative Multi-Omics Analysis Reveals Convergent Epigenome and Transcriptome Changes in Parkinson's Disease
2026-Aug-18, Movement disorders : official journal of the Movement Disorder Society IF:7.4Q1
研究论文 对帕金森病的多组学数据进行整合分析,揭示多巴胺能神经元中趋同的表观基因组和转录组变化,并生成外周血单核细胞的批量ATAC-seq图谱以评估系统性表观遗传特征 首次通过整合单细胞转录组和表观基因组数据,识别出帕金森病中趋同的基因、通路和网络水平变化,并发现SMARCA4作为关键上游调控因子,同时提供外周血单核细胞的初步跨组织表观遗传证据 探索性分析,样本量较小,表观遗传特征需在更大队列中验证 识别帕金森病中使多巴胺能神经元易发生退行性变化的趋同转录和表观遗传改变,并评估这些改变是否扩展到外周血单核细胞 帕金森病患者和对照组的诱导多能干细胞来源的多巴胺能神经元,以及帕金森病患者的周围血单核细胞 数字病理学 帕金森病 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序、批量ATAC测序 NA 基因表达和染色质可及性数据 27例帕金森病和11例对照的单细胞RNA测序样本,10例帕金森病和2例对照的单细胞ATAC测序样本,10例帕金森病患者和4例对照的外周血单核细胞样本 NA 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序、批量ATAC测序 NA NA
2443 2026-08-19
Φ-Space ST: A platform-agnostic method to identify cell states in spatial transcriptomics studies
2026-Aug-17, Cell reports methods IF:4.3Q2
研究论文 介绍了一种平台无关的方法Φ-Space ST,用于在空间转录组学数据中识别连续细胞状态,并利用多个单细胞RNA测序参考实现细胞类型去卷积和空间生态位识别。 Φ-Space ST是平台无关的,能够处理超细胞和亚细胞分辨率的数据,无需细胞分割即可注释细胞状态,并整合多个单细胞参考的注释结果,提供可解释的疾病细胞状态特征。 摘要中未提及研究的局限性。 开发一种稳健且可扩展的空间转录组学数据分析方法,以理解复杂组织和病理状态。 多种癌症组织样本,涉及CosMx、Visium、Xenium和Stereo-seq平台。 空间转录组学 癌症 空间转录组学 NA 空间转录组数据、单细胞RNA测序参考数据 四项案例研究,未明确样本数量。 NA 空间转录组学 CosMx, Visium, Xenium, Stereo-seq 包括CosMx、Visium、Xenium和Stereo-seq平台,但未提供具体配置。
2444 2026-08-19
Integrative epidemiological analysis, plasma metabolomics, and single-cell RNA sequencing reveal the protective effects and mechanisms of dietary flavonoids against abdominal aortic aneurysm
2026-Aug-17, Food & function IF:5.1Q1
研究论文 通过整合流行病学分析、血浆代谢组学和单细胞RNA测序,揭示了膳食黄酮类化合物对腹主动脉瘤的保护作用及其机制 首次结合UK Biobank大规模队列、代谢组学和单细胞RNA测序,全面探讨黄酮类化合物(特别是原花青素)对腹主动脉瘤的保护作用,并识别出CLEC4E作为潜在靶点 研究基于观察性数据,可能受未测量混杂因素影响;机制探索需进一步实验验证 评估膳食黄酮类化合物摄入与腹主动脉瘤风险的关联,并探究其潜在机制 188101名基线无腹主动脉瘤的UK Biobank参与者,以及单细胞RNA测序的细胞样本 机器学习, 数字病理学 腹主动脉瘤 代谢组学, 单细胞RNA测序 Cox比例风险模型, 弹性网络回归 临床数据, 代谢组学数据, 单细胞转录组数据 188101名参与者的流行病学数据 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'转录组测序
2445 2026-08-19
Integrative bulk and single-cell transcriptomics identify a recurrence-prognostic risk model with exploratory associations with treatment-response phenotypes in colorectal cancer
2026-Aug-17, Human cell IF:3.4Q3
研究论文 本研究通过整合bulk和单细胞转录组数据,构建了一个基于直肠癌的反应相关基因特征(RDRG)风险评分模型,用于结直肠癌复发分层,并探索其与治疗反应表型的关联 首次利用直肠癌(READ)衍生的反应相关基因签名进行复发分层,并在多个结直肠癌队列中进行探索性跨队列验证;结合单细胞RNA-seq分析揭示了恶性细胞的高风险特征及LEMD1的功能贡献 跨队列验证为探索性分析,时间依赖性AUC值中等;风险评分阈值因队列而异,而非固定;LEMD1的功能验证仅作为候选功能贡献者,而非确证的机制驱动因素 开发基于直肠癌的反应相关基因风险评分模型,用于结直肠癌复发分层,并探索其与治疗反应表型的关联 结直肠癌患者,包括TCGA-READ、TCGA-COAD、GSE190826和GSE17536队列 机器学习 结直肠癌 RNA-seq, 单细胞RNA-seq WGCNA, 逻辑回归, 单变量Cox回归, LASSO-Cox回归, 多变量Cox回归 转录组数据(bulk和单细胞) 多个结直肠癌队列,具体样本数未在摘要中提及(包括TCGA-READ、TCGA-COAD、GSE190826和GSE17536) NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
2446 2026-08-19
Preventing the inflammatory polarization of monocyte/macrophage provides an effective therapy for rheumatoid arthritis-associated vascular injury
2026-Aug-17, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 本研究旨在识别类风湿关节炎相关血管损伤中的关键免疫细胞,并探索通过防止单核细胞/巨噬细胞炎症极化来提供有效治疗策略 首次通过单细胞RNA测序结合临床数据,揭示单核细胞/巨噬细胞在类风湿关节炎相关血管损伤中的核心作用,并证明NF-κB抑制剂BAY 11-7085在减轻血管损伤方面优于现有药物 摘要未明确提及研究局限性 识别类风湿关节炎中脂质代谢紊乱与心血管疾病共存的常见致病免疫细胞,为靶向治疗提供依据 类风湿关节炎患者和健康个体的血液细胞、小鼠模型、大鼠模型(包括佐剂诱导关节炎和血管损伤模型) 免疫学 类风湿关节炎 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据、临床数据、动物模型数据 未明确样本数量,但包括不同疾病严重程度的患者和健康个体,以及小鼠和大鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
2447 2026-08-19
Robust identification of cell-cell communication heterogeneity in single cells
2026-Aug-17, Cell systems IF:9.0Q1
研究论文 本文介绍了一种利用单细胞和空间转录组数据推断细胞间通讯异质性的计算框架,并将其与细胞命运决定和细胞内反应联系起来 通过整合RNA剪接动力学和多层调控网络,实现了对细胞间通讯异质性及其与细胞命运关联的稳健识别 未提及 开发一种新方法,以揭示细胞类型内通讯行为的异质性,并连接细胞通讯与细胞命运决定及细胞内反应 单细胞和空间转录组数据,涉及角化细胞等生物样本 机器学习 NA 单细胞转录组测序、空间转录组测序 计算框架(具体模型类型未提及) 基因表达数据 未明确提及样本数量 NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
2448 2026-08-19
Characterizing intra- and intertumor heterogeneity in ovarian high-grade serous carcinoma subtypes using single-cell and spatial transcriptomics
2026-Aug-17, Genome research IF:6.2Q1
研究论文 本研究利用单细胞和空间转录组学技术,表征了卵巢高级别浆液性癌亚型内部及肿瘤间的异质性 首次将分子亚型与空间转录组学结合,量化了HGSC在2D空间内的肿瘤内和肿瘤间异质性,并发现了亚型特异性空间抗共定位现象及Midkine信号差异,提出多切片分析的必要性 未明确说明局限性,但暗示每患者单一切片可能不足以全面表征空间转录组 探索HGSC中基于转录组的分子亚型与空间表达结构域之间的关联及其在患者间的变异性 卵巢高级别浆液性癌(HGSC)的组织样本 空间转录组学 卵巢癌 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA 基因表达数据、空间数据 未提供具体数目 NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
2449 2026-08-19
Identifying phenotype-genotype-function coupling in 3D organoid imaging using Shape, Appearance and Motion Phenotype Observation Tool (SPOT)
2026-Aug-17, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 开发了标准化形状-外观-运动(SAM)表型组和观察工具(SPOT),用于从3D类器官成像中识别表型-基因型-功能耦合 提出了一种无需先验知识的、基于2D投影视频全面描述3D形态动态表型的工具,并结合单细胞RNA测序揭示WNT信号通路改变与肠道类器官形态异常的关系 未在文中明确提及限制,但可能包括对2D投影视频的依赖和特定类器官模型的适用性 利用活细胞成像识别表型-基因型-功能耦合关系,推动生物医学发现 小鼠和人类类器官,包括模拟类器官数据库和超过160万实例 计算机视觉 NA 活细胞成像,单细胞RNA测序 NA 图像(2D投影视频),转录组数据 超过160万个小鼠和人类类器官实例 NA 单细胞RNA测序 NA NA
2450 2026-08-19
Canonical and non-canonical miRNA degradation shapes state transitions and stemness in breast cancer
2026-Aug-17, The EMBO journal
研究论文 本研究结合CRISPRi介导的ZSWIM8敲低、miRNA测序和AGO2-eCLIP技术,绘制了乳腺癌亚型中的靶向miRNA降解(TDMD)图谱,并揭示了其调控细胞状态转变和干性的机制 首次在人类癌症中系统定义TDMD景观,并发现非经典TDMD机制(不依赖ZSWIM8和蛋白酶体),扩展了miRNA降解的机制谱 摘要中未提及明显的局限性 探究靶向miRNA降解在乳腺癌中的作用及其对细胞状态转变和干性的影响 乳腺癌细胞系及亚型,特别是三阴性乳腺癌中的恶性细胞亚群 基因组学 乳腺癌 CRISPRi、miRNA-seq、AGO2-eCLIP、单细胞转录组学 NA 测序数据(miRNA-seq、eCLIP、单细胞转录组) 未明确,涉及乳腺癌亚型及细胞系 NA miRNA-seq、单细胞转录组学 NA NA
2451 2026-08-19
CKLF1 Serves as a Pivotal Mediator of Blood-Brain Barrier Disruption and Neuroinflammation via PI3K/AKT/mTOR Signaling in Ischemic Stroke
2026-Aug-17, Molecular neurobiology IF:4.6Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序、调控网络分析和机器学习筛选,确定CKLF1为缺血性卒中的关键内皮调节因子,并验证其在血脑屏障破坏和神经炎症中的作用机制。 首次通过整合单细胞测序、调控网络分析和机器学习方法,鉴定CKLF1为缺血性卒中相关内皮调节因子,并阐明其通过PI3K/AKT/mTOR信号通路调控血脑屏障破坏和神经炎症的机制。 尚未明确CKLF1在缺血性卒中中的上游调控机制,以及其与其他信号通路的相互作用。 探究CKLF1在缺血性卒中中血脑屏障破坏和神经炎症中的作用及机制。 缺血性卒中相关内皮细胞、小胶质细胞和外周中性粒细胞。 机器学习和单细胞转录组学 缺血性卒中 单细胞RNA测序、调控网络分析、机器学习筛选 机器学习模型(具体未提及) 单细胞转录组数据 未提及具体样本数量,使用tMCAO/R小鼠模型。 NA 单细胞RNA测序 NA NA
2452 2026-08-19
Tumor-driven arginine depletion induces T-cell metabolism reprogramming to suppress atherosclerosis in colorectal cancer
2026-Aug-17, Acta pharmacologica Sinica IF:6.9Q1
研究论文 本研究探讨了结直肠癌对动脉粥样硬化的影响,发现肿瘤驱动的精氨酸耗竭通过重编程T细胞代谢来抑制动脉粥样硬化。 首次揭示肿瘤通过系统性精氨酸耗竭诱导斑块内T细胞向氧化磷酸化主导状态转变,从而改变动脉粥样硬化斑块的炎症微环境,并证明精氨酸补充可逆转此效应。 研究主要基于小鼠模型和临床数据,精氨酸代谢干预的长期效果及在人类中的适用性仍需进一步验证。 阐明结直肠癌对动脉粥样硬化发展的影响及其潜在机制,探索针对斑块的免疫代谢干预策略。 合并动脉粥样硬化和结直肠癌的患者,以及携带皮下MC38肿瘤的ApoE和Ldlr小鼠、自发性肠道腺瘤的APCApoE小鼠。 多组学整合分析 结直肠癌、动脉粥样硬化 单细胞RNA测序、空间转录组学、代谢组学、批量RNA测序 NA 基因表达数据、代谢物数据、空间转录数据 临床患者数据及三种小鼠模型(具体数量未提及) 10x Genomics, Illumina, 其他 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 10x Chromium, 10x Visium, Illumina NovaSeq 单细胞RNA测序和空间转录组学平台专用于分析斑块组织,代谢组学和批量RNA测序用于全局分析
2453 2026-08-19
The LncRNA-Tumor Immune Microenvironment Nexus: Integrative Insights for Cancer Immunotherapy
2026-Aug-17, Genomics, proteomics & bioinformatics
综述 该文章综合探讨了长链非编码RNA与肿瘤免疫微环境之间的相互作用,并强调了其在癌症免疫治疗中的潜在应用价值。 通过整合多组学分析、单细胞转录组学和计算建模,系统揭示了lncRNA在调控肿瘤免疫微环境中的复杂网络,并提出了将其作为生物标志物和治疗靶点的新策略。 由于是综述文章,未提供新的实验数据,且lncRNA靶向治疗的临床转化仍面临递送和特异性等挑战。 总结lncRNA在肿瘤免疫微环境中作用机制的最新发现,并探讨其作为免疫治疗靶点的转化前景。 长链非编码RNA(lncRNA)及其在肿瘤免疫微环境中的调控网络。 自然语言处理 癌症 高通量测序、单细胞转录组学 NA 文本 NA NA NA NA NA
2454 2026-08-19
SPCC: Inferring Spatial Cell-Cell Interaction by Integrating Single-cell and Spatial Transcriptomics
2026-Aug-17, Genomics, proteomics & bioinformatics
研究论文 开发了一种名为SPCC的深度学习计算框架,通过整合单细胞和空间转录组数据,推断细胞间的空间相互作用。 利用对抗性联合变分自编码器和随机森林模型,实现未配对单细胞和空间数据的对齐与映射,提高对测序噪声的鲁棒性,并成功识别出新的细胞间相互作用,如PECAM1-SOX4。 摘要中未提及局限性。 旨在通过整合单细胞和空间转录组数据,准确推断个体细胞分辨率的空间结构,并识别空间细胞间相互作用。 小鼠躯体感觉皮层、乳腺癌和黑色素瘤脑转移数据。 机器学习 乳腺癌、黑色素瘤 空间转录组测序、单细胞RNA测序 对抗性联合变分自编码器、随机森林 基因表达数据 三个数据集,具体样本数量未提及 NA 空间转录组学 NA NA
2455 2026-08-19
ICOS-ImmunoPET Monitors T Cell Activation After Combination Immune Checkpoint Blockade in a Mouse Model of Melanoma Brain Metastasis
2026-Aug-15, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究利用ICOS免疫PET成像技术监测黑色素瘤脑转移小鼠模型联合免疫检查点阻断治疗后的T细胞活化情况 首次将ICOS作为生物标志物用于免疫PET成像,实现对免疫检查点抑制剂治疗反应的早期、非侵入性、功能性评估,并通过对人脑转移样本的单细胞RNA测序数据重分析验证其临床相关性 研究主要基于小鼠模型,人样本数据仅为转录组重分析,缺乏前瞻性临床试验验证;且文章未提及成像技术的具体分辨率和敏感性限制 开发并验证ICOS免疫PET成像技术,用于监测黑色素瘤脑转移中免疫检查点抑制剂治疗后的T细胞活化,以改善早期反应评估和患者分层 黑色素瘤脑转移小鼠模型及6例人类黑色素瘤脑转移标本 分子影像学 黑色素瘤脑转移 免疫PET成像、单细胞RNA测序 小鼠肿瘤模型 免疫PET影像数据、单细胞RNA测序数据 6例人类黑色素瘤脑转移标本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
2456 2026-08-19
Reduced Occludin expression in aortic endothelial cells mediates endothelial barrier dysfunction in aortic dissection
2026-Aug-14, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
研究论文 本研究探讨了紧密连接蛋白Occludin在主动脉夹层发病机制中的作用,发现其下调导致内皮屏障功能障碍,是AD的起始因素 首次通过单细胞RNA测序和条件性基因敲除小鼠模型,证实内皮细胞中Occludin下调直接引发主动脉夹层,并提出靶向Occludin的治疗策略 研究主要基于动物模型和体外实验,缺乏临床样本验证;且BAPN诱导的AD模型与人类AD的病理过程存在差异 阐明Occludin在主动脉夹层早期内皮屏障功能障碍中的因果作用,并评估其作为治疗靶点的潜力 人类升主动脉组织、小鼠主动脉组织、人主动脉内皮细胞 心血管疾病 主动脉夹层 单细胞RNA测序、免疫印迹、免疫组化、荧光素酶报告基因、腺相关病毒介导的基因过表达 条件性基因敲除小鼠、AAV介导的过表达小鼠 基因表达数据、组织病理图像、影像数据、体外通透性数据 人类样本数量不详;小鼠模型包括内皮特异性Ocln敲除和过表达组;体外使用HAECs 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
2457 2026-08-19
Epigenetic modulation of stromal cell states underpins pathological tissue niches in Crohn's disease
2026-Aug-12, Nature immunology IF:27.7Q1
研究论文 使用单细胞空间转录组学、RNA测序和ATAC测序技术,绘制克罗恩病肠道中18种基质细胞状态及其微环境图谱,揭示炎症成纤维细胞状态的表观遗传调控机制 首次在克罗恩病全层肠道组织中结合单细胞空间转录组、RNA-seq和ATAC-seq,鉴定18种基质细胞状态,并发现炎症成纤维细胞状态可通过组蛋白去乙酰化酶抑制剂逆转 未明确说明样本来源及患者数量,且未进行体内功能验证 探究克罗恩病中基质细胞状态的起源、表型稳定性及其表观遗传调控机制 克罗恩病患者全层肠道组织中的基质细胞 单细胞组学 克罗恩病 单细胞空间转录组学、RNA-seq、ATAC-seq NA 单细胞基因表达数据、染色质开放数据、空间转录数据 约2,500,000个细胞 NA 单细胞空间转录组学、单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序 NA NA
2458 2026-08-19
[Role and mechanism of methyltransferase-like 3 in promoting macrophage NLRP3 inflammatory responses in medication-related osteonecrosis of the jaw]
2026-Aug-09, Zhonghua kou qiang yi xue za zhi = Zhonghua kouqiang yixue zazhi = Chinese journal of stomatology
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序构建唑来膦酸诱导的颌骨坏死样病变小鼠免疫图谱,探讨METTL3在巨噬细胞NLRP3炎症反应中的作用和机制 首次在单细胞水平揭示METTL3作为关键表观遗传调控因子促进巨噬细胞NLRP3炎症反应,参与药物相关性颌骨坏死发病,并通过虚拟敲降分析预测关键基因 摘要中未提及研究局限性 探究METTL3在药物相关性颌骨坏死中调控巨噬细胞炎症反应的作用和机制 唑来膦酸诱导的颌骨坏死样病变小鼠及巨噬细胞 单细胞生物学 药物相关性颌骨坏死 单细胞RNA测序、免疫组化、蛋白质印迹 NA 单细胞转录组数据、组织图像、蛋白质表达数据 未明确样本量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
2459 2026-08-19
Age-Associated B Cells Contribute to Inflammation Via Antibody-Independent Mechanisms in Takayasu Arteritis
2026-Aug-04, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
研究论文 本研究探讨了年龄相关B细胞在Takayasu动脉炎中通过抗体非依赖机制促进炎症的作用 首次揭示TAK中ABC分化与抗体分泌细胞生成解偶联,且ABC通过促炎功能而非抗体介导炎症 未明确提及主要局限,但样本量较小(如组织学n=5,临床随访n=4) 研究TAK中B细胞激活途径及其对发病机制的贡献 Takayasu动脉炎患者及系统性红斑狼疮患者的B细胞 免疫学 Takayasu动脉炎 组织学分析、bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq、流式细胞术、体外实验 NA 基因表达数据、流式细胞术数据、组织学图像 组织学n=5,流式细胞术n=125,bulk RNA-seq n=12,体外实验n=5,功能实验n=6,体外药物实验n=15,临床随访n=4 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
2460 2026-08-19
Follicular Lymphoma Transformation is Characterized by Cytokine-associated Remodeling of Stromal and Macrophage Compartments
2026-Aug-04, Cancer discovery IF:29.7Q1
研究论文 通过多模态研究95份滤泡性淋巴瘤及转化型滤泡性淋巴瘤样本,揭示转化过程中细胞因子相关的基质和巨噬细胞区室重塑 首次通过单细胞和 bulk RNA 测序、空间转录组学和蛋白质组学的多模态整合分析,系统描绘滤泡性淋巴瘤转化过程中肿瘤微环境的细胞互作和空间分布变化 样本量有限,且未提供转化前后配对样本的动态追踪,可能限制了因果关系推断 解析滤泡性淋巴瘤向侵袭性大细胞淋巴瘤转化过程中肿瘤与微环境细胞群的相互作用 95份滤泡性淋巴瘤和转化型滤泡性淋巴瘤样本,包含肿瘤细胞及微环境中的成纤维细胞、巨噬细胞、T细胞等 数字病理学 淋巴瘤 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 空间转录组学, 蛋白质组学 NA 基因表达数据, 空间转录组数据, 蛋白质数据 95份滤泡性淋巴瘤和转化型滤泡性淋巴瘤样本 NA 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 空间转录组学, 蛋白质组学 NA NA
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