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当前共找到 9441 篇文献,本页显示第 2381 - 2400 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
2381 2026-08-20
Single-cell transcriptome reveals keratinocyte subclusters contributing to altered differentiation and inflammatory responses in atopic dermatitis
2026-Jul-14, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析,揭示了特应性皮炎中角质细胞亚群对分化和炎症反应的异常贡献 首次在特应性皮炎中揭示角质细胞分化的逆转终末过渡,主要由DK7细胞驱动,并识别出LAD特异性调控因子(APOD、LYZ、SERPINB4)及TWEAK信号通路 未提及 阐明特应性皮炎中角质细胞亚群在分化障碍和炎症反应中的作用机制 42名特应性皮炎患者的皮损和非皮损皮肤组织,以及23名健康对照的皮肤组织 单细胞转录组学、空间转录组学 特应性皮炎 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA 单细胞转录组数据、空间转录组数据 42名AD患者(皮损和非皮损样本)和23名健康对照,共65例样本 NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
2382 2026-08-20
A machine learning-guided epithelial plasticity score refines prognostication and immune-context stratification in muscle-invasive bladder cancer
2026-Jul-13, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 开发了一种基于机器学习的上皮可塑性评分(EPRS),用于改善肌层浸润性膀胱癌的预后预测和免疫微环境分层。 首次将上皮可塑性轴与机器学习模型结合,构建EPRS评分,并通过多队列验证和单细胞分析揭示其与恶性上皮状态及免疫逃逸微环境的关系。 未提及具体限制,但可能受限于回顾性数据、样本异质性及外部验证队列的可用性。 开发上皮可塑性相关风险评分(EPRS),评估其在MIBC中的预后价值、生物学意义和免疫相关性。 肌层浸润性膀胱癌(MIBC)患者样本,包括TCGA-MIBC队列(368例)及外部验证队列GSE32894和GSE13507。 机器学习 膀胱癌 RNA测序、单细胞RNA测序、加权基因共表达网络分析、免疫去卷积 Ridge回归模型 基因组数据(RNA-seq)、单细胞转录组数据 368例TCGA-MIBC病例,以及外部验证队列GSE32894和GSE13507(具体数量未在摘要中说明) NA RNA-seq、单细胞RNA-seq NA NA
2383 2026-08-20
Transcriptomic analysis of tissue-resident memory T cells of the fallopian tube reveals a precursor immune surveillance network for ovarian cancer prevention
2026-Jul-13, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序和配对T细胞受体测序,分析输卵管组织驻留记忆样T细胞的转录组,揭示其作为卵巢癌预防的前体免疫监视网络 首次对输卵管组织驻留记忆样T细胞进行全面转录组分析,发现其与肿瘤浸润细胞存在显著克隆重叠,并鉴定出一个新的SIK3高表达亚群,具有表观遗传可塑性和代谢适应特征 样本量有限,功能验证主要基于类器官共培养实验,需进一步体内验证 阐明输卵管组织驻留记忆样T细胞在卵巢癌发生中的免疫监视作用及其治疗潜力 患者来源的配对的非癌性输卵管、转移性肿瘤和周围血中的组织驻留记忆样T细胞 单细胞转录组学 高级别浆液性卵巢癌 单细胞RNA测序、配对T细胞受体测序 NA 单细胞转录组和T细胞受体序列数据 未提供具体样本数量,涉及配对的输卵管、转移性肿瘤和血样 NA 单细胞RNA测序 NA NA
2384 2026-08-20
Single cell multiomics unravel the transcription networks controlling the different EMT tumor states
2026-Jul-11, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞多组学方法描绘了皮肤鳞状细胞癌中不同上皮间质转化肿瘤状态的转录和染色质景观,并鉴定了调控各状态的关键转录因子 结合单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序,首次系统描绘了不同EMT状态的转录和染色质景观,并通过CRISPR/Cas9敲除功能研究鉴定出状态特异性的转录因子,揭示了它们在转移中的关键作用 研究主要基于小鼠模型,人类癌症中的验证较为初步,EMT动态过程的时序机制仍需进一步探索 解析皮肤鳞状细胞癌中EMT不同状态的转录调控网络,鉴定状态特异性转录因子及其在转移中的作用 小鼠皮肤鳞状细胞癌模型,以及小鼠胰腺腺癌和人类癌症样本 单细胞多组学 皮肤鳞状细胞癌 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序、CRISPR/Cas9基因编辑 NA 基因组数据 小鼠皮肤鳞状细胞癌模型,以及小鼠胰腺腺癌和人类癌症样本(具体数量未提供) 10x Genomics 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序 10x Chromium 10x Chromium 单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序
2385 2026-08-20
FcγR- and CD9-dependent synapse-engulfing microglia in the thalamus drive cognitive impairment following cortical brain damage in mice
2026-Jul-09, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 该研究报道了小鼠皮层脑损伤后,丘脑中依赖FcγR和CD9的吞噬突触的小胶质细胞驱动认知障碍 首次揭示丘脑而非海马中的反应性小胶质细胞变化在慢性期损害识别记忆,并发现CD9阳性小胶质细胞通过IgG/FcγRIII信号通路介导突触吞噬,为脑损伤后认知障碍提供新机制 研究主要在雌性小鼠中进行,可能未涵盖性别差异;机制验证依赖抗体阻断和基因操作,可能未完全模拟人类病理 探究皮层脑损伤后丘脑区域特异性小胶质细胞重塑如何导致认知功能障碍 小鼠模型中的丘脑和皮层小胶质细胞、突触和认知行为 神经科学 创伤性脑损伤 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 未提供具体样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
2386 2026-08-20
Single-cell spatial transcriptomics reveals hepatocyte reprogramming in Fontan-associated liver disease
2026-Jul-08, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究利用单细胞空间转录组学技术,分析了Fontan相关肝病(FALD)患者的肝脏组织,揭示了肝细胞重编程及其在疾病进展中的作用 首次将单细胞空间转录组学应用于FALD研究,发现了具有细胞应激和冗余区域特征的肝细胞亚群,并识别出异位WNT2信号作为驱动肝细胞区域化破坏的关键因素 样本量较小,仅包含两名FALD患者(早期和晚期纤维化各一例)用于单细胞空间转录组学分析,可能限制结果的普遍性 探究FALD进展的病理生理机制,特别是肝细胞区域化改变和细胞应激在疾病发展中的作用 FALD患者的肝脏外植体组织样本 空间转录组学、数字病理学 Fontan相关肝病 单细胞空间转录组学(CosMx空间分子成像)、原位杂交、免疫荧光 无特定模型(使用CellChat进行细胞通讯分析) 空间基因表达数据、免疫荧光图像 两例用于单细胞空间转录组学(早期和晚期纤维化各一例),另外18例用于免疫荧光验证 NanoString 空间转录组学 CosMx空间分子成像 CosMx空间分子成像系统,使用6000个基因的原位杂交
2387 2026-08-20
Pulmonary mRNA-LNP vaccines for rapid and durable protection against bacterial infection
2026-Jul-08, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究报道了一种肺部递送的mRNA-LNP疫苗,能快速激活先天免疫并诱导适应性免疫,为细菌性肺部感染提供即时和持久的保护 设计了一种可电离脂质用于局部高表达,实现双阶段免疫应答(早期抗原非依赖性清除和后期抗原特异性保护),范式性地整合先天和适应性免疫 研究仅在雌性小鼠中进行,未涉及人体临床试验,且主要针对铜绿假单胞菌,对其他病原体的效果需进一步验证 开发一种肺部mRNA-LNP疫苗,以弥补疫苗接种后的免疫空白期,并提供快速和持久的抗菌保护 雌性小鼠及铜绿假单胞菌(实验室和临床耐药菌株) 免疫学 细菌性肺部感染 mRNA疫苗、脂质纳米颗粒(LNP)、单细胞转录组学、免疫分析 NA 单细胞转录组数据、免疫谱数据 雌性小鼠(具体数量未提及) NA 单细胞RNA测序 NA NA
2388 2026-08-20
Targeting Cystine Addiction Suppresses Breast Cancer Lung Metastasis
2026-Jul-07, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 本研究利用体内和体外MYC驱动的乳腺癌肿瘤模型,结合稳定同位素标记代谢组学、质谱成像和单细胞RNA测序,发现肺转移癌细胞通过增加胱氨酸摄取和谷胱甘肽合成来适应新微环境,并证实靶向胱氨酸/半胱氨酸代谢可增强放疗效果,抑制肺转移。 首次揭示乳腺肿瘤肺转移细胞对胱氨酸/半胱氨酸的依赖性增强,这种代谢脆弱性是由于转硫途径下调导致细胞内半胱氨酸合成减少,并证明胱(c)氨酸酶与放疗联合能有效减少肺转移负担。 摘要中未提及研究的具体局限性。 探索MYC驱动的乳腺癌肺转移过程中的关键代谢变化,并评估靶向这些代谢依赖性作为治疗策略的潜力。 MYC驱动的乳腺肿瘤细胞及其肺转移灶。 癌症代谢组学 乳腺癌 稳定同位素标记代谢组学、质谱成像、单细胞RNA测序、放疗 NA 代谢组学数据、质谱成像数据、单细胞转录组数据 未明确说明具体样本数量。 10x Genomics 单细胞RNA测序、稳定同位素标记代谢组学、质谱成像 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序用于转录组分析;质谱成像用于代谢物空间分布;稳定同位素标记代谢组学用于代谢通量分析。
2389 2026-08-20
STRESS: spatial transcriptomics resolution enhancing method based on the state-space model
2026-Jul-03, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 提出一种基于状态空间模型的空间转录组分辨率增强方法STRESS,以提升空间表达模式分析的连续性 无需依赖组织学图像或单细胞参考,仅利用基因表达谱和空间坐标即可实现空间表达细化,采用3D状态空间建模同时捕捉空间依赖性和转录关系 未提及具体局限性,可能包括依赖基因表达和空间坐标的精度、未使用组织图像信息可能影响某些场景下的效果 开发一种无需参考数据的空间转录组分辨率增强框架,提高下游空间域鉴定的准确性和稳定性 不同平台和组织类型的空间转录组数据集 深度学习 不适用 空间转录组学 状态空间模型 基因表达谱和空间坐标数据 多个数据集,具体数量未提及 不适用 空间转录组学 不适用 不适用
2390 2026-08-20
Influenza-induced tuft cell expansion is associated with changes in ILC2 populations in the distal lungs of mice
2026-Jul, Physiological reports IF:2.2Q3
研究论文 本文研究了流感感染后小鼠远端肺中异位簇细胞与ILC2群体的变化及其相互调节关系 首次揭示流感损伤后远端肺异位簇细胞与ILC2之间存在双向调节轴,并发现簇细胞缺失可改变ILC1和ILC3的扩增 结果仅基于小鼠模型,需进一步验证在人类中的适用性 探究流感损伤后远端肺异位簇细胞在塑造固有免疫反应中的功能 小鼠远端肺组织及免疫细胞群体(簇细胞、ILC1、ILC2、ILC3) 数字病理学 流感 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 小鼠肺组织样本,具体数量未在摘要中给出 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium 单细胞3' 试剂盒
2391 2026-08-20
An integrative framework combining Mendelian randomization, single-cell profiling, and experimental validation identifies FTMT as a mitochondrial-immune regulator in non-small cell lung cancer
2026-Jun-16, Cancer cell international IF:5.3Q1
研究论文 本研究整合孟德尔随机化、单细胞分析和实验验证,发现FTMT通过调控MICB发挥对非小细胞肺癌的保护作用,并涉及线粒体-免疫轴。 创新性地结合遗传证据、肿瘤微环境单细胞转录组和细胞实验,首次揭示FTMT作为线粒体-免疫调节因子在非小细胞肺癌中的因果保护作用,并阐明其与MICB的关联。 研究依赖血液中的遗传代理指标,可能无法完全反映肿瘤组织中的真实调控情况,且体外实验仅使用一种细胞系,需进一步体内验证。 评估FTMT与非小细胞肺癌风险的因果关系,并探索其通过MICB介导的线粒体-免疫调控机制。 非小细胞肺癌患者及A549肺腺癌细胞系 基因组学、单细胞生物学、肿瘤免疫学 非小细胞肺癌 孟德尔随机化、单细胞RNA-seq、qPCR、Western blotting IVW回归模型(孟德尔随机化) 血浆蛋白质组学数据、GWAS汇总数据、单细胞RNA-seq数据、药物基因组学数据 基于UK Biobank Pharma Proteomics Project和FinnGen R12的公开数据,具体样本量未在摘要中提及;体外实验使用A549细胞系 NA RNA-seq NA NA
2392 2026-08-20
Fibronectin 1 mediates pressure-induced aggressive phenotypes in colorectal cancer cells and cancer stem cells
2026-Jun-12, Cancer cell international IF:5.3Q1
研究论文 本研究通过荟萃分析和体外压力模型,探讨纤连蛋白1在结直肠癌中受机械压力影响的作用机制。 首次揭示纤连蛋白1与机械压力在结直肠癌进展中的交互作用,并结合荟萃分析和单细胞RNA测序。 体外压力模型可能无法完全模拟体内复杂微环境,且样本量有限。 评估纤连蛋白1在结直肠癌中的预后作用及其与机械压力的相互作用。 结直肠癌细胞和癌症干细胞。 数字病理学 结直肠癌 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 荟萃分析 NA 基因表达数据, 组织样本 荟萃分析包含结直肠癌患者和对照;组织样本n=19;单细胞数据GSE302903 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
2393 2026-08-20
Single-cell RNA sequencing reveals immune-peritubular myoid cell crosstalk driving testicular interstitial fibrosis in idiopathic non-obstructive azoospermia
2026-Jun-12, Cell & bioscience
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了特发性非梗阻性无精子症中免疫-睾丸肌样细胞相互作用驱动睾丸间质纤维化的机制 首次通过单细胞RNA测序解析iNOA中肌样细胞与免疫细胞的相互作用,并利用网络药理学和分子对接预测瑞戈非尼作为潜在治疗药物 研究样本量有限,需要更多临床样本和功能实验验证;瑞戈非尼的治疗效果尚未在体内模型中验证 揭示特发性非梗阻性无精子症的发病机制,探索潜在诊断和治疗靶点 特发性非梗阻性无精子症患者和健康对照者的睾丸组织 单细胞转录组学 特发性非梗阻性无精子症 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 患有iNOA的患者和健康对照者的睾丸组织样本(具体数量未在摘要中提供) NA 单细胞RNA测序 NA NA
2394 2026-08-20
MZB1 Modulates Inflammatory Severity in Severe Acute Pancreatitis through an IgA-Associated Intestinal Barrier Axis
2026-Jun-12, Inflammation IF:4.5Q2
研究论文 本研究通过纵向单细胞RNA测序分析轻度和重度急性胰腺炎患者外周血单核细胞,发现MZB1通过IgA相关的肠道屏障轴调节炎症严重程度 首次在急性胰腺炎中揭示适应性体液免疫,特别是MZB1在浆细胞分化和IgA产生中的作用,及其对肠道屏障完整性和巨噬细胞驱动炎症的调节 摘要未提供明确的局限性信息 探究适应性体液免疫在急性胰腺炎炎症调控中的作用,特别是MZB1的功能 轻度和重度急性胰腺炎患者的外周血单核细胞,以及实验性胰腺炎小鼠模型 单细胞转录组学、免疫学 急性胰腺炎 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据、小鼠模型数据 未明确说明样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
2395 2026-08-20
CAF-derived PTGDS drives pancreatic cancer neuroendocrine differentiation and chemoresistance via PAQR9-MAPK
2026-Jun-11, Oncogenesis IF:5.9Q1
研究论文 本研究揭示了癌症相关成纤维细胞分泌的PTGDS通过PAQR9-MAPK信号轴驱动胰腺导管腺癌的神经内分泌分化及化疗耐药 首次发现CAF源性PTGDS通过其膜受体PAQR9激活MAPK信号通路,促进胰腺癌神经内分泌分化和化疗耐药,提出新的CAFs/PTGDS-PAQR9-MAPK信号轴 摘要中未提及研究的局限性 探究胰腺导管腺癌微环境中癌症相关成纤维细胞如何调控神经内分泌分化及其对化疗耐药的影响 胰腺导管腺癌临床样本、转录组数据集、癌细胞系及癌症相关成纤维细胞 数字病理学 胰腺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、转录组测序(RNA-seq) NA 单细胞转录组数据、转录组数据、临床标本 摘要中未明确样本量 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium 单细胞3'文库制备
2396 2026-08-20
ScEnsemble: weighted hypergraph ensemble clustering for single-cell RNA sequencing
2026-Jun-11, BMC bioinformatics IF:2.9Q1
研究论文 提出ScEnsemble,一种基于质量的加权超图集成聚类框架,用于单细胞RNA测序数据的细胞聚类 通过质量权重整合多个基础聚类算法,利用超图表示聚类共分配关系,并结合多种共识算法,优于单一算法和未加权的集成方法 未明确提及,但可能包括对计算资源的较高需求以及在不同数据类型上的泛化性需进一步验证 解决单细胞RNA测序数据中聚类算法选择的不确定性问题,提供稳定且高质量的细胞聚类方法 单细胞RNA测序数据中的细胞群体 机器学习 乳腺癌 单细胞RNA测序 超图集成聚类 基因表达数据 五个单细胞RNA测序数据集及一个乳腺癌肿瘤微环境数据集 NA 单细胞RNA测序 NA NA
2397 2026-08-20
Integrated single cell and spatial transcriptomics reveals the cellular and molecular mechanisms underlying UCMSCs treatment of ovarian aging in tree shrews
2026-Jun-11, Stem cell research & therapy IF:7.1Q1
研究论文 本研究通过单细胞和空间转录组学技术,揭示了脐带间充质干细胞治疗树鼩卵巢衰老的细胞和分子调控机制 首次整合单细胞和空间转录组学,系统解析了UCMSCs治疗卵巢衰老的细胞空间图谱和分子机制,并发现UBB作为潜在治疗靶点 UCMSCs治疗未能完全恢复年轻组水平,且研究仅在树鼩模型中进行 阐明UCMSCs治疗卵巢衰老的细胞和分子调控机制,探索潜在治疗靶点 老年雌性树鼩的卵巢和外周血 数字病理学 卵巢衰老 单细胞RNA测序、空间转录组学、HE染色、ELISA、免疫组化、免疫荧光 NA 基因表达数据、图像、文本 老年雌性树鼩(具体数量不详),分为治疗组和年轻对照组 10x Genomics 单细胞RNA-seq、空间转录组学 10x Chromium、10x Visium 10x Chromium Single Cell 3'、10x Visium
2398 2026-08-20
Single-cell RNA sequencing reveals chemotherapy-induced apoptosis in acute myeloid leukemia via B cell depletion and M2 to M1 macrophage repolarization
2026-Jun-11, Human genomics IF:3.8Q2
研究论文 该研究利用单细胞RNA测序技术探讨了急性髓系白血病化疗过程中免疫微环境的动态变化,揭示了化疗通过B细胞耗竭和M2到M1巨噬细胞重极化诱导细胞凋亡的机制 首次通过单细胞RNA测序揭示了化疗期间AML免疫微环境中B细胞和肿瘤相关巨噬细胞的动态变化,并识别出MCM7和SPINK2作为化疗期间的潜在靶向基因 样本量较小,且研究基于转录组数据,未进行功能验证实验 探究急性髓系白血病化疗期间免疫微环境的动态变化,以揭示化疗耐药机制 急性髓系白血病患者骨髓样本 数字病理学 急性髓系白血病 单细胞RNA测序 未指定 基因表达数据 6个骨髓样本 未指定 单细胞RNA测序 未指定 未指定
2399 2026-08-20
Constitutive interferon epsilon expression shapes antiviral epithelial states in the female reproductive tract and intestine
2026-06-10, mBio IF:5.1Q1
研究论文 本研究利用小鼠模型和单细胞RNA测序技术,揭示了干扰素ε在女性生殖道和肠道黏膜表面的组成型表达及其在抗病毒防御中的作用。 首次系统阐明IFNε在肠道中的表达模式和功能,发现其在小肠绒毛顶端肠上皮细胞中高表达,维持炎症性肠上皮亚群和III型干扰素表达,并证明其缺失增加肠道病毒感染易感性。 研究主要基于小鼠模型,人类相关验证有限,且未深入探讨IFNε在人类肠道中的具体作用。 明确IFNε在不同黏膜表面(女性生殖道和肠道)的表达特征及其在抗病毒免疫中的功能。 小鼠和人类女性生殖道及肠道来源的细胞。 免疫学 感染性疾病 单细胞RNA测序 小鼠模型 基因表达数据 小鼠和人类细胞样本(具体数量未提供) NA 单细胞RNA测序 NA NA
2400 2026-08-20
Multi-omics Integration of Single-cell and Spatial Transcriptomics with Tissue and Urine Proteomics Identifies TRIM28 as a Translationally Relevant Candidate Regulator in Acute Kidney Injury
2026-Jun-10, Inflammation IF:4.5Q2
研究论文 构建跨尺度多组学图谱,整合单细胞、空间转录组及组织和尿液蛋白质组,识别出TRIM28作为急性肾损伤的候选调节因子,并提名HY-N10592作为潜在化合物工具 首次整合人类单细胞、空间转录组与小鼠肾组织蛋白质组及临床尿液蛋白质组的跨尺度多组学方法,通过随机森林排序候选因子并结合结构虚拟筛选和CETSA验证药物靶点结合 未进行体内药效学评估,HY-N10592的治疗潜力需进一步动物模型验证;尿液蛋白检测的临床样本量及特异性未详述 整合多组学数据以识别连接肾损伤机制和尿液可检测信号的候选调节因子,并探索治疗靶向性 急性肾损伤患者样本、小鼠肾缺血再灌注损伤模型、HK-2细胞缺氧/复氧模型 数字病理学 急性肾损伤 单细胞转录组学、空间转录组学、蛋白质组学、随机森林模型、结构虚拟筛选、分子对接、分子动力学模拟、CETSA 随机森林模型 单细胞转录组数据、空间转录组数据、蛋白质组数据、尿液蛋白质组数据 人类样本数未明确,涉及小鼠RIRI模型及HK-2细胞模型 NA 单细胞RNA-seq、空间转录组学、蛋白质组学 NA NA
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