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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
2381 2026-02-13
Maternal Trypanosoma cruzi infection is associated with significant placental remodeling regardless of vertical transmission
2026-Jan-13, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究探讨了母体克氏锥虫感染对胎盘微环境和全身生理的影响,及其与先天性传播的关联 将先天性恰加斯病的概念框架从以传播为中心转变为认识到感染驱动的胎盘损伤是一个病理谱,并确定外周血作为预测不良妊娠结局生物标志物的非侵入性来源 先天性恰加斯传播的机制仍不完全清楚,需要进一步应用单细胞分辨率方法来完善发病机制模型 探究母体克氏锥虫感染是否改变胎盘微环境和全身生理,以及这些改变是否与先天性传播相关 感染克氏锥虫的孕妇及其胎盘组织 空间转录组学 恰加斯病 bulk RNA测序, 蛋白质组学, 空间转录组学 NA RNA序列数据, 蛋白质数据, 空间转录组数据 NA NA 空间转录组学, bulk RNA-seq NA NA
2382 2026-02-13
A technical comparison of spatial transcriptomics platforms across six cancer types
2026-Jan-12, Genome biology IF:10.1Q1
研究论文 本研究系统性地比较了五种商业空间转录组学平台在六种癌症类型FFPE样本中的技术性能 首次在相同FFPE肿瘤样本上同时评估基于测序和基于成像的空间转录组学平台,并首次比较Xenium Multi-Tissue与Xenium Prime在同一样本上的表现 研究主要关注商业平台的技术比较,可能未涵盖所有新兴技术或非商业方法 为空间转录组学社区提供FFPE肿瘤高通量空间分析的技术基准和设计参考 六种癌症类型的匹配FFPE人类肿瘤切片 空间转录组学 多种癌症类型 空间转录组学 NA 空间转录组数据、蛋白质数据 六种癌症类型的匹配FFPE肿瘤切片 10x Genomics, NanoString 空间转录组学, 空间多组学 Visium v1, Visium v2/CytAssist, Visium HD, Xenium, CosMx Visium v1, Visium v2/CytAssist, Visium HD, Xenium Multi-Tissue (377基因), Xenium Prime (5,000基因), CosMx
2383 2026-02-13
Intracellular microbial signals in the gastrointestinal tract of dairy cattle
2026-Jan-12, Microbiome IF:13.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞分析揭示了奶牛胃肠道细胞内微生物信号的存在及其与瘤胃发育的潜在关联 首次在奶牛胃肠道上皮细胞中应用单细胞宿主-微生物互作分析(SAHMI),并识别出与特定微生物物种相关的细胞内微生物信号 研究样本数量有限,仅包括新生和成年奶牛,且微生物信号的功能验证仍需进一步实验 探究奶牛胃肠道细胞内微生物的存在及其对瘤胃发育的影响 奶牛胃肠道组织,包括十种组织类型,来自新生和成年个体 单细胞组学 NA 单细胞RNA测序,细菌荧光原位杂交(FISH) NA 单细胞RNA测序数据,图像数据 来自新生和成年奶牛的十种胃肠道组织类型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2384 2026-02-13
IL-25-ILC2-IL-13 axis improves traumatic brain injury by mediating CXCL-10-dependent regulation of blood brain barrier integrity
2026-Jan-12, Journal of neuroinflammation IF:9.3Q1
研究论文 本研究揭示了IL-25通过激活ILC2细胞分泌IL-13,进而抑制CXCL-10和内皮细胞焦亡,从而改善创伤性脑损伤后血脑屏障完整性和神经功能的机制 首次阐明了IL-25-ILC2-IL-13轴在TBI后BBB修复中的保护作用,并确定了CXCL-10介导的内皮细胞焦亡是关键的调控环节 研究主要基于小鼠模型,其结论在人类中的适用性尚需进一步验证;机制研究主要在急性期进行,长期效应未明确 探究IL-25对创伤性脑损伤后血脑屏障完整性和神经功能的保护作用及其分子机制 小鼠创伤性脑损伤模型、脑微血管内皮细胞、第2组固有淋巴细胞 神经科学 创伤性脑损伤 酶联免疫吸附试验、免疫荧光染色、流式细胞术、细胞因子阵列、Western blot、单细胞RNA测序 NA 蛋白质表达数据、RNA测序数据、行为学数据、影像学数据 未明确说明具体数量的小鼠模型和细胞样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
2385 2026-02-13
Zebrafish radial glia orchestrate vascular regeneration: implications for bionic therapy of spinal cord injury
2026-Jan-09, Stem cell research & therapy IF:7.1Q1
研究论文 本研究利用斑马鱼模型,揭示了放射状胶质细胞在脊髓损伤后血管再生中的关键调控作用及其潜在信号通路 首次在斑马鱼脊髓损伤模型中,通过化学消融放射状胶质细胞,明确了其在调控血管再生中的核心作用,并揭示了Vegfa-PI3K/Akt-mTOR和Notch信号通路可能参与此过程 研究基于斑马鱼模型,其结论向哺乳动物(如人类)的转化应用仍需进一步验证 探究脊髓损伤后血管再生的调控模式,为仿生治疗脊髓损伤提供新思路 斑马鱼(特别是Tg(gfap: NTR-mCherry)报告品系)的脊髓血管系统和放射状胶质细胞 NA 脊髓损伤 活体成像、化学消融(使用甲硝唑或硝呋吡醇)、单细胞测序数据分析、抑制剂实验 NA 图像数据、表达谱数据、公开的单细胞测序数据集 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
2386 2026-02-13
Disruption of bile acid homeostasis potentiates Paneth cell ablation by activating the intestinal Farnesoid X receptor in necrotizing enterocolitis
2026-Jan-08, NPJ biofilms and microbiomes IF:7.8Q1
研究论文 本研究揭示了胆汁酸稳态失衡通过激活肠道法尼醇X受体导致潘氏细胞丢失,从而在坏死性小肠结肠炎发病机制中的作用 首次阐明严重NEC中次级胆汁酸积累通过激活肠道FXR抑制Wnt/PCP信号通路,进而导致潘氏细胞丢失的具体分子机制,并发现通过下调FGFR4破坏肠-肝轴可改善这一过程 研究主要基于动物模型和单细胞测序数据,尚未在临床患者中进行大规模验证 探究胆汁酸稳态失衡在坏死性小肠结肠炎发病机制中的作用 坏死性小肠结肠炎模型中的肠道组织、潘氏细胞、肠道干细胞 单细胞组学 坏死性小肠结肠炎 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
2387 2026-02-13
Organoid Modeling and Single-Cell Profiling Reveal Smooth Muscle Cell Migration in Moyamoya Disease
2026-Jan-07, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 本研究通过蛋白质组学、类器官模型和单细胞RNA测序,揭示了烟雾病中血管平滑肌细胞迁移的分子机制 首次结合血清蛋白质组学、iPSC来源的血管类器官和单细胞RNA测序,系统阐明了TUBA4A和TUBB4B通过GJA1/PI3K/AKT/KLF4通路驱动烟雾病血管重塑的新机制 样本量相对有限(40例患者和20例对照),且类器官模型可能无法完全模拟体内复杂的脑血管环境 探究烟雾病的发病机制,特别是血管平滑肌细胞在病理血管重塑中的作用 烟雾病患者血清样本、健康对照血清样本、iPSC来源的血管类器官、颞浅动脉组织 数字病理学 烟雾病 数据非依赖性采集蛋白质组学、ELISA、组织学染色、转录组学、单细胞RNA测序 NA 蛋白质组数据、RNA测序数据、组织图像 40例烟雾病患者和20例健康对照的血清样本,另加45例队列用于ELISA验证 NA 单细胞RNA测序 NA NA
2388 2026-02-13
Functional characterization of a human epilepsy-associated gene network reveals metabolic regulation as a critical factor underlying seizure susceptibilities
2026-Jan-01, Disease models & mechanisms IF:4.0Q1
研究论文 本研究利用果蝇全脑单细胞RNA测序技术,验证了一个人类癫痫相关基因共表达网络,揭示了代谢调控在癫痫易感性中的关键作用 首次结合果蝇单细胞表达数据和行为学分析,验证人类癫痫相关基因网络,并发现代谢通路通过AMPK调节癫痫易感性 研究基于果蝇模型,结果在人类中的直接适用性需进一步验证;样本规模相对有限 探究癫痫的分子机制,特别是基因网络和代谢调控在癫痫易感性中的作用 果蝇(Drosophila)作为模型生物,聚焦于一个包含26个基因的保守共表达模块 神经科学 癫痫 单细胞RNA测序 基因敲低模型 RNA测序数据 涉及多个果蝇基因敲低模型,具体样本数未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2389 2026-02-13
Interplay of Molecular Subtypes Associated with Butyrate Metabolism Elucidates Clinical Characteristics and Tumor Microenvironment in Prostate Cancer
2026-Jan, Applied biochemistry and biotechnology IF:3.1Q2
研究论文 本研究通过分析前列腺癌患者的转录组数据,揭示了丁酸代谢相关基因亚型与肿瘤微环境及临床特征的关联,并建立了基于机器学习的预后模型 首次将丁酸代谢相关基因分为两个亚型,并利用机器学习构建了高精度的生化复发预测模型,同时揭示了FOS-miR-27b轴作为潜在治疗靶点 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,缺乏前瞻性临床验证,且功能实验仅限于体外细胞模型 阐明丁酸代谢在前列腺癌发生发展中的作用机制,并探索其作为预后标志物和治疗靶点的潜力 前列腺癌患者(来自TCGA和GEO数据库)及前列腺癌细胞系 生物信息学 前列腺癌 单细胞转录组分析,荧光素酶报告基因检测,qRT-PCR,FISH 随机生存森林(RSF)和梯度提升机(GBM) 转录组数据,单细胞RNA-seq数据 来自TCGA和GEO数据库的前列腺癌患者样本(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
2390 2026-02-13
Single-cell analysis of lung cancer metabolism and its clinical implications
2026, Cancer treatment and research communications
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,系统探索了肺癌肿瘤微环境中不同细胞类型的代谢通路,并鉴定了具有诊断和预后意义的潜在生物标志物 首次在单细胞分辨率下对肺癌恶性细胞的代谢特征进行全面探索,并根据代谢活性将恶性细胞分为高、中、低代谢三个亚群,揭示了低代谢状态与免疫信号通路及癌症干细胞样特征的关联 未明确说明样本来源的具体类型(如组织来源、患者队列特征)及样本量大小,也未提及所采用的具体单细胞测序平台或技术细节 系统探索肺癌肿瘤微环境中不同细胞类型的代谢通路,并鉴定具有诊断和预后意义的生物标志物 肺癌肿瘤微环境中的不同细胞类型,特别是根据代谢活性分类的恶性细胞亚群 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
2391 2026-02-13
Exosomal heterogeneity and functional zonation in cancer drug resistance
2026-Jan, Drug discovery today IF:6.5Q1
综述 本文探讨了肿瘤微环境中外泌体的异质性及其在功能分区中对癌症耐药性的作用 强调了外泌体在肿瘤功能分区中的异质性及其通过特定分子货物介导的时空通信网络在耐药性中的新机制 NA 阐明外泌体异质性在肿瘤微环境中的功能分区如何促进癌症耐药性 肿瘤微环境中的外泌体及其在功能分区中的异质性 NA 癌症 单细胞测序、微芯片3D肿瘤培养、先进光谱学方法、空间生物学平台 NA NA NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
2392 2026-02-13
Transcriptomic landscape of coexisting ovarian clear cell carcinoma and endometriosis: Insights into malignant transformation
2026, Cancer treatment and research communications
研究论文 本研究通过空间转录组学和单细胞RNA测序整合分析,探讨了子宫内膜异位症(EMS)向卵巢透明细胞癌(OCCC)恶性转化的分子机制 首次结合空间转录组学和单细胞RNA测序技术,系统揭示了EMS与OCCC共存区域的共享分子特征和转录组学进展路径 样本量有限,未涉及其他卵巢癌亚型的全面比较,且机制验证有待进一步实验研究 阐明子宫内膜异位症向卵巢透明细胞癌恶性转化的分子连接和转录组学基础 共存EMS和OCCC区域的卵巢组织 数字病理学 卵巢癌 空间转录组学, 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 未明确指定具体样本数量,但涉及共存EMS和OCCC的组织 NA 空间转录组学, 单细胞RNA测序 NA NA
2393 2026-02-13
LRRC15 in tumorigenesis, progression, and therapy
2026, Cancer treatment and research communications
综述 本文系统总结了跨膜蛋白LRRC15的分子特征、在肿瘤微环境中的调控功能,及其作为诊断生物标志物和治疗靶点的潜力 整合了基因组学、蛋白质组学、单细胞测序和临床转化研究的最新进展,全面阐明了LRRC15在肿瘤发生、转移、免疫调节和治疗抵抗中的多面性机制 讨论了当前研究的局限性,但未在摘要中具体说明 为精准肿瘤学提供多维度的理论和实践见解 跨膜蛋白LRRC15及其在多种实体瘤中的作用 NA 实体瘤 基因组学, 蛋白质组学, 单细胞测序 NA NA NA NA NA NA NA
2394 2026-02-12
Consensus machine learning identifies cell death gene signature for carotid artery stenosis diagnosis
2026-Feb-20, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本研究通过整合多组学数据与机器学习方法,开发了一个基于细胞死亡基因的共识诊断分类器,用于颈动脉狭窄的早期检测 首次整合了内部RNA-seq队列与八个公共数据集,结合十种机器学习算法构建了105个模型配置,并识别出IRF1、FYCO1和FDFT1组成的诊断签名,通过单细胞测序和功能实验验证了FYCO1的下调及其在自噬和炎症信号中的作用 研究依赖于多个公共数据集,可能存在批次效应或数据异质性,且样本量相对有限(共696个样本),需要进一步在独立队列中验证MLDS的临床适用性 开发一种分子工具以改善颈动脉狭窄的早期诊断 颈动脉狭窄患者样本及相关分子数据 机器学习 心血管疾病 RNA-seq, 蛋白质组学分析, RT-qPCR, 单细胞测序, 基因沉默实验 逻辑回归, 共识机器学习(结合十种算法) RNA-seq数据, 蛋白质组数据, 单细胞测序数据, 实验验证数据 696个样本(整合一个内部队列和八个公共数据集) NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学(未明确指定,但涉及单细胞分析) NA NA
2395 2026-02-12
Pre-operative risk assessment of HCC recurrence in liver transplant recipients by non-invasive detection of pre-existing genetic lesions
2026-Feb-11, Clinical and molecular hepatology IF:14.0Q1
研究论文 本研究通过液体活检开发了一种基于无细胞DNA(cfDNA)拷贝数变异(CNA)特征的术前风险分层模型,用于预测肝细胞癌(HCC)患者肝移植后的复发风险 整合了cfDNA CNA特征与单细胞转录组数据,揭示了复发相关的cfDNA来源于肿瘤内特定恶性细胞亚群,并开发了结合传统临床因素和cfDNA CNA特征的ZJU Criteria风险预测工具 研究样本量相对有限(260例),且依赖于多中心数据,可能存在异质性 开发一种基于液体活检的术前风险分层模型,以预测HCC患者肝移植后的复发风险 260例HCC患者,包括临床数据、血浆cfDNA、匹配的肿瘤和非肿瘤组织 数字病理学 肝细胞癌 低覆盖度全基因组测序、全外显子测序、单核RNA测序、空间转录组学 风险分层模型(ZJU Criteria) 基因组数据、转录组数据、空间数据 260例HCC患者 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 全基因组测序, 全外显子测序 NA NA
2396 2026-02-12
Osteoarthritis and chondrosarcoma: Bioinformatics analysis based on single-cell RNA sequencing and molecular docking
2026-Feb-11, Advances in clinical and experimental medicine : official organ Wroclaw Medical University IF:2.1Q3
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和分子对接技术,分析了骨关节炎和软骨肉瘤的细胞异质性和分子机制,以识别潜在的治疗靶点 结合单细胞RNA测序和分子对接方法,首次在单细胞水平上比较骨关节炎和软骨肉瘤的细胞亚群分布和基因表达差异,并探索天然化合物与DAP3蛋白的相互作用 研究依赖于公开的单细胞RNA测序数据集,可能受数据质量和样本来源限制;分子对接结果为计算模拟,需实验验证 探究骨关节炎和软骨肉瘤的细胞异质性和分子机制,识别潜在治疗靶点 骨关节炎和软骨肉瘤的细胞亚群,包括神经元、软骨细胞和免疫细胞 生物信息学 骨关节炎,软骨肉瘤 单细胞RNA测序,分子对接 t-SNE,UMAP 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
2397 2026-02-12
Exploring adenoid basal carcinoma to squamous cell carcinoma of the uterine cervix transformation using spatial transcriptomics
2026-Feb-11, The Journal of pathology IF:5.6Q1
研究论文 本研究利用空间转录组学探索了子宫颈腺样基底癌向鳞状细胞癌转化的分子机制 首次使用数字空间谱分析技术,在混合肿瘤中识别出区分过渡巢与其他亚型的关键差异表达基因CK13和SCCA2,并揭示了BCL-2在基底样细胞中的表达模式 样本量有限,仅对4例病例进行了DSP分析,未来需要更大规模的研究来指导临床决策 阐明子宫颈腺样基底癌与鳞状细胞癌之间的转化关系,以指导有效的治疗策略 20例子宫颈腺样基底癌病例,其中多数伴有鳞状细胞癌、过渡巢和高级别鳞状上皮内病变 数字病理学 宫颈癌 空间转录组学,免疫组织化学 NA 空间转录组数据,组织学图像 20例ABC病例,其中4例进行了DSP分析 NA 空间转录组学 NA 数字空间谱分析
2398 2026-02-12
Multi-omics characterization of benzo[a]pyrene toxicity networks identifies SERPINE1 and STK3 as prognostic biomarkers and therapeutic targets in head and neck squamous cell carcinoma
2026-Feb-11, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
研究论文 本研究通过多组学分析揭示了苯并[a]芘在头颈鳞状细胞癌中的毒性网络,并鉴定出SERPINE1和STK3作为预后生物标志物和治疗靶点 首次系统整合了机器学习、空间转录组学、单细胞RNA测序和分子对接模拟,全面解析了BaP诱导的毒性分子网络,并识别出核心毒性靶点 研究主要基于公共数据库和计算分析,缺乏体内实验验证;样本来源和数量可能限制结论的普适性 阐明苯并[a]芘在头颈鳞状细胞癌中的毒性机制,并寻找预后生物标志物和治疗靶点 头颈鳞状细胞癌患者样本及相关分子数据 生物信息学 头颈鳞状细胞癌 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 基因集富集分析, 分子对接, 分子动力学模拟 随机森林, 支持向量机 基因表达数据, 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据 GSE30784数据集和TCGA-HNSC队列(具体样本数未明确说明) NA 空间转录组学, 单细胞RNA测序 NA NA
2399 2026-02-12
Distinct mural cells and fibroblasts drive fibrochondrogenesis in retrodiscal tissue following temporomandibular joint disc displacement
2026-Feb-10, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究利用猪模型和单细胞RNA测序技术,揭示了颞下颌关节盘前移位后盘后组织适应性重塑的细胞和分子机制,并筛选出潜在治疗化合物 首次通过单细胞RNA测序识别了盘后组织重塑中的关键成纤维细胞亚群FB2和壁细胞亚群MC4,并揭示了它们通过FGF2/BMP5信号通路的互作机制 研究基于猪模型,结果向人类临床转化的有效性需进一步验证 探究颞下颌关节盘前移位后盘后组织适应性重塑的细胞动力学和分子机制 猪颞下颌关节盘前移位模型中的盘后组织 单细胞组学 颞下颌关节疾病 单细胞RNA测序 P-NET, Seurat 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
2400 2026-02-12
The single-cell transcriptional landscape of the pediatric cystic fibrosis lung from minimally invasive respiratory specimens
2026-Feb-10, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,揭示了儿童囊性纤维化肺部存在以中性粒细胞为主的失调性炎症和促炎性气道上皮细胞状态 首次在儿童囊性纤维化患者中,利用微创呼吸道标本进行单细胞转录组分析,揭示了疾病早期的共同病理程序 样本量较小(仅包含一名婴儿和一名青少年),且为观察性研究,难以确定因果关系 探究儿童囊性纤维化肺部的细胞组成、功能和细胞间通讯的异常变化 儿童囊性纤维化患者的呼吸道标本 单细胞转录组学 囊性纤维化 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 2名儿童囊性纤维化患者(一名婴儿和一名青少年) NA 单细胞RNA-seq NA NA
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