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当前共找到 9342 篇文献，本页显示第 221 - 240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 221 | 2026-09-23 |
Eltrombopag restores T-cell homeostasis in aplastic anemia by regulating oxidative metabolism and reactive oxygen species levels
2026-May-18, Annals of hematology
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s00277-026-07060-7
PMID:42144489
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和Western blot分析，探讨艾曲泊帕通过调控氧化代谢和活性氧水平恢复再生障碍性贫血中T细胞稳态的机制 | 首次揭示艾曲泊帕通过上调ENPP1和ENTPD5调控氧化代谢通路，降低CD4⁺和CD8⁺ T细胞中ROS水平，重塑T细胞亚群组成并减弱细胞毒性，从而恢复T细胞稳态 | 研究主要基于AA小鼠模型，尚未在人类AA患者中验证；机制研究主要依赖Western blot，缺乏更深入的代谢通量分析 | 探究艾曲泊帕是否通过氧化代谢通路调节再生障碍性贫血中T细胞的功能表型 | 再生障碍性贫血小鼠模型中的T细胞 | 免疫学 | 再生障碍性贫血 | 单细胞RNA测序、Western blot | NA | 基因表达数据、蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 222 | 2026-09-23 |
BARseq3: a modular system for integrating spatial multi-omics and cellular barcoding in single cells
2026-May-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.13.724900
PMID:42182181
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研究论文 | 该文章介绍了一种模块化系统BARseq3，将细胞条形码技术与高效空间转录组学和翻译组学相结合，在组织亚细胞分辨率下实现单细胞空间多组学整合 | BARseq3是一个模块化系统，可同时整合细胞条形码、高效空间转录组学和翻译组学，兼容固定样本、免疫染色和多种物种，并可轻松扩展至其他空间检测方法 | 现有整合细胞条形码与空间组学的方法在支持的模态、灵活性和效率方面存在局限 | 实现单细胞中空间多组学与细胞条形码的整合，以多模态方式理解细胞身份 | 组织中的单细胞 | 空间多组学 | NA | 空间转录组学, 空间翻译组学, 细胞条形码技术 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 空间转录组学, 空间翻译组学 | BARseq3 | 模块化系统，结合细胞条形码与高效空间转录组学和翻译组学，亚细胞分辨率，兼容固定样本和免疫染色 |
| 223 | 2026-09-23 |
Biological foundation models illuminate annotation blind spots in evolutionarily divergent genomes
2026-May-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.15.724572
PMID:42182479
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研究论文 | 本文提出了一种混合注释框架，将基于Evo2的外显子-内含子结构预测与基于ESM-2蛋白质嵌入的结构相似性映射相结合，用于注释进化分歧较大的基因组（以海七鳃鳗为例）。 | 将基因模型发现与跨物种相似性分配解耦，利用Evo2预测外显子-内含子结构，利用ESM-2蛋白质嵌入进行结构相似性映射，从而在序列同源性极低的情况下仍能检测到保守的结构信号 | 研究结果描述的是目录位点而非经过验证的一对一人源缺失基因；在经典20-30%氨基酸同一性的 twilight zone 中，部分位点仅能获得低置信度匹配 | 解决进化分歧较大的非模式生物基因组中功能注释受限的问题，利用蛋白质结构相似性信号扩展注释范围并提升下游比较基因组学和单细胞分析能力 | 海七鳃鳗（sea lamprey）基因组及其免疫区室的单细胞转录组 | 机器学习, 计算生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 蛋白质结构预测, 蛋白质嵌入 | Evo2, ESM-2 | 基因组序列, 蛋白质序列, 单细胞转录组数据 | 73,485个Evo2衍生的翻译蛋白质模型，其中35,395个高置信度调用；31,286个去重结构目录位点，包含20,871个Ensembl基线中缺失的新增位点 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 224 | 2026-09-23 |
Single-cell RNA sequencing reveals that host Glutamine Metabolism Inhibition Enhances Macrophage Phagocytosis of Mycobacterium tuberculosis
2026-May-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.14.725218
PMID:42182385
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序和代谢组学揭示了谷氨酰胺代谢抑制剂JHU083通过代谢重编程增强巨噬细胞对结核分枝杆菌的吞噬功能 | 首次利用单细胞RNA测序结合LS-MS/MS代谢组学揭示JHU083介导的谷氨酰胺代谢抑制可增加结核感染肺中间质巨噬细胞群体，并使其代谢重编程为增强脂质利用和吞噬活性的状态 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类结核病患者中验证；对JHU083重编程巨噬细胞的具体分子机制尚未完全阐明 | 探究谷氨酰胺代谢抑制对结核分枝杆菌感染肺部巨噬细胞群体、炎症特征、代谢状态及吞噬功能的影响 | 结核分枝杆菌感染小鼠模型中的肺部巨噬细胞 | 单细胞转录组学、免疫代谢 | 结核病 | 单细胞RNA测序、LS-MS/MS代谢组学 | NA | 单细胞转录组数据、代谢组数据、图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序、bulk代谢组学 | NA | NA |
| 225 | 2026-09-23 |
Immune cells during compensatory renal hypertrophy after unilateral nephrectomy
2026-May-15, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-9568023/v1
PMID:42183369
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研究论文 | 该研究通过对小鼠进行单侧肾切除术后，利用流式细胞术和单细胞RNA测序技术，分析了残余肾脏中免疫细胞在代偿性肾脏肥大过程中的动态变化及其对肾小球滤过率的影响 | 揭示了单侧肾切除后代偿性肾脏肥大过程中免疫细胞的多阶段动态变化特征，包括固有免疫细胞的快速激活、适应性免疫细胞的逐步调节以及免疫检查点水平的转变，并首次探讨了适应性免疫细胞在肾小球滤过率变化中的作用 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类活体肾捐献者中验证；观察时间限于8周，长期免疫变化未明确；未深入探讨免疫细胞变化与肾功能恢复之间的因果关系 | 探究单侧肾切除后代偿性肾脏肥大过程中免疫细胞的动态变化及其对肾功能（特别是肾小球滤过率）的影响 | 野生型小鼠和Rag1基因敲除小鼠的残余肾脏 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 图像, 文本 | 野生型小鼠和Rag1基因敲除小鼠，观察时间长达8周 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 226 | 2026-09-23 |
Spatial transcriptomics implicates the thalamus and cortex in autism and schizophrenia
2026-May-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.15.724759
PMID:42182261
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研究论文 | 本文利用空间转录组学技术分析成年小鼠脑矢状面中部区域，发现自闭症和精神分裂症相关基因在丘脑和皮层中富集 | 提出了基因分数富集评分（GFES）这一新的统计方法，能够控制不同脑区神经元比例差异，并进行系统性的多区域空间转录组分析 | 研究基于小鼠模型，结果可能无法完全反映人类大脑的复杂性；摘要中未提及样本量的具体信息 | 探究自闭症谱系障碍和精神分裂症相关基因在大脑中的空间表达模式，特别是涉及哪些脑区 | 成年小鼠脑矢状面中部区域 | 空间转录组学 | 自闭症谱系障碍, 精神分裂症 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 227 | 2026-09-23 |
Spatiotemporal analysis of autism gene enrichment implicates cortex, thalamus, and hypothalamus
2026-May-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.14.724487
PMID:42182223
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研究论文 | 该文章开发了STARMAPS框架，整合超过一百万个单细胞RNA测序数据，对自闭症相关基因在发育中人脑中的时空富集模式进行了分析 | 提出STARMAPS新框架，能够校正区域和发育相关的基因表达扰动，实现稳健的跨区域比较，并揭示了自闭症相关基因在皮层下结构（丘脑和下丘脑）中的富集 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 揭示自闭症相关基因通过哪些特定脑区影响神经发育，并精细映射发育中人脑的分子脆弱性 | 发育中人脑（受孕后4-23周）的20个脑区 | 单细胞转录组学 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞RNA测序 | STARMAPS（稀疏任务特异性分析框架） | 单细胞基因表达数据 | 超过一百万个单细胞RNA测序图谱，来自发育中人脑的20个脑区（受孕后4-23周） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 228 | 2026-09-23 |
Endocrine therapy-specific lineage and partial epithelial-mesenchymal reprogramming defines divergent resistant cell-states in ER+ breast cancer
2026-May-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.11.724242
PMID:42182314
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研究论文 | 该研究通过多组学整合分析，系统比较了ER+乳腺癌对他莫昔芬（SERM）、氟维司群（SERD）耐药及ESR1突变驱动的内分泌治疗耐药机制，揭示了SERM耐药特异的谱系重塑和部分上皮-间质转化（pEMT）程序 | 首次系统比较了不同内分泌治疗方式（SERM、SERD、ESR1突变）驱动的耐药轨迹差异，发现SERM耐药伴随高阶基因组重排（A-to-B区室转换）、ERα和FOXA1结合重分布及pEMT程序激活，并揭示了SERM诱导的免疫逃逸新模式——MHC I类抗原提呈协调性丢失而非经典T细胞耗竭 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 系统比较选择性雌激素受体调节剂（SERM，如他莫昔芬）、降解剂（SERD，如氟维司群）及组成性ESR1突变驱动的适应性耐药机制，表征ERα扰动方式如何影响谱系身份和上皮-间质状态 | ER+乳腺癌细胞模型及患者队列 | 机器学习, 数字病理学 | 乳腺癌 | bulk转录组测序, 单细胞转录组测序, Hi-C染色质构象捕获, 染色质免疫沉淀测序 | NA | 转录组数据, 染色质构象数据, 表观遗传数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, Hi-C, ChIP-seq | NA | NA |
| 229 | 2026-09-23 |
WATER reveals heterochrony of molecular programs underlies developmental failure caused by minor spliceosome inhibition
2026-May-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.08.723603
PMID:42182497
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研究论文 | 该研究开发了WATER框架，通过独立重建不同条件下的基因表达时间轨迹，揭示了小型剪接体抑制导致小鼠前肢发育失败是由于分子程序时序错乱而非程序缺失 | 首次提出WATER（加权窗口时间表达分配）框架，能够独立重建每种条件下的时间基因表达轨迹，实现野生型与扰动系统之间时间程序架构的直接比较；揭示了发育失败源于完整分子程序的时序错位部署，而非程序本身缺失；证明了Eed缺失足以独立于其他剪接缺陷产生时间程序重分布 | 研究主要基于小鼠前肢发育模型，WATER框架在其他发育系统和物种中的普适性有待验证；对时间轨迹重建的精度可能受限于采样时间点的密度；未完全阐明小型剪接体抑制与p53凋亡检查点之间的精确分子机制 | 开发新的计算框架以解析和比较不同条件下基因表达的时间动态，并阐明小型剪接体抑制导致发育失败的时间分子机制 | U11缺失小鼠前肢发育过程及Eed敲除干细胞 | 机器学习, 计算生物学, 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | 基因表达数据, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 230 | 2026-09-23 |
GatorDuo: Global-Consistency Dual-Graph Refinement With Pseudo-Label Agreement for Spatial Transcriptomics
2026-May-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.10.724039
PMID:42182473
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研究论文 | 提出GatorDuo，一种拓扑感知的双图对比自监督框架，通过全局一致性图细化和伪标签一致性掩码抑制跨域捷径边，结合上下文赌博机强化学习自适应选择聚类粒度，并使用混合路由的专家混合模块整合视图特异性嵌入，用于空间转录组学的空间域识别 | 引入基于全局一致性的图细化方法，利用伪标签一致性掩码在基因表达相似性图和空间邻近图中同时抑制跨域捷径边，稳定邻域拓扑；采用上下文赌博机强化学习策略自适应选择聚类粒度，避免手动调参；使用混合路由的专家混合模块整合双视图嵌入，并设计MoE对齐项增强对比学习目标 | 摘要中未明确提及局限性 | 实现稳健的空间域识别，提升空间转录组学中组织区域聚类的准确性和鲁棒性 | 空间转录组学数据，涵盖基于测序和基于成像的技术，包括spot分辨率和单细胞分辨率的数据 | 空间转录组学，机器学习 | NA | 空间转录组学 | 图神经网络，对比学习，专家混合模型，强化学习 | 空间转录组数据（基因表达矩阵和空间坐标） | 八个公开基准数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 231 | 2026-09-23 |
δ-catenin controls layer-specific transcriptional maturation of astrocytes via Zbtb20
2026-May-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.12.724361
PMID:42182221
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研究论文 | 该研究揭示δ-catenin通过调控Zbtb20依赖的转录程序，协调不同神经细胞类型的转录成熟，特别是控制星形胶质细胞层特异性身份的建立 | 首次发现δ-catenin作为黏附连接组分将细胞间相互作用与转录调控联系起来，并鉴定Zbtb20为胶质细胞富集的BTB/POZ转录因子，是层特异性星形胶质细胞身份的关键调控因子 | 摘要中未明确提及研究的具体局限性 | 探究神经细胞类型转录成熟同步化的机制，特别是细胞间相互作用如何调控转录程序以协调皮层回路发育 | 小鼠皮层神经细胞（特别是星形胶质细胞），δ-catenin缺失模型 | 神经科学、单细胞转录组学、空间转录组学 | 神经发育障碍 | 单核RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞核RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 232 | 2026-09-23 |
Dogcatcher2: Improved statistical detection of transcriptional readthrough and repetitive element analysis across sequencing platforms
2026-May-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.07.723642
PMID:42182342
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研究论文 | 本文提出了Dogcatcher2，一种改进的统计检测方法，用于从短读长RNA-seq中检测转录通读（DoG），并分析了其与重复元件和双链RNA生成的关系 | Dogcatcher2采用基因体归一化的覆盖度谱和统计检测方法，克服了现有基于绝对阈值和滑动窗口方法的深度敏感性，在低测序深度下仍保持高精度，并首次系统揭示了DoG区域中Alu元件（特别是可形成双链RNA的倒置Alu对）的富集以及转座元件表达升高 | 摘要中未明确说明研究局限性 | 改进转录通读（DoG）的统计检测方法，并探究DoG区域与重复元件及双链RNA生成之间的关系 | 多种测序平台产生的RNA-seq数据集（包括短读长和长读长数据）、人类DoG区域、重复元件（Alu元件、转座元件） | 机器学习 | 癌症 | 短读长RNA-seq, 长读长RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq | NA | 文本 | NA | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, single-nucleus RNA-seq | NA | NA |
| 233 | 2026-09-23 |
Quantifying Cross-Modal Association Confidence for Single-Cell RNA-ATAC Integration
2026-May-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.07.723400
PMID:42182231
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研究论文 | 本文提出了一种跨模态关联置信度评分（CLIC），用于量化基因表达与染色质可及性之间的关联可靠性，并基于该评分提出混合特征选择策略，以提高单细胞RNA-ATAC数据整合的准确性和鲁棒性 | 首次提出了CLIC评分，一种基于多组学数据定量衡量基因表达与附近染色质可及性经验一致性的指标，并利用该评分进行特征选择，改进了跨模态整合方法 | CLIC评分依赖于ENCODE项目的多组学数据集，可能受限于数据覆盖度和细胞类型特异性；特征选择策略仅在公开数据集上验证，未在更多新生成的数据集上测试 | 提高单独测量的单细胞RNA-seq和ATAC-seq数据整合的准确性和可靠性 | 单细胞RNA-seq和ATAC-seq数据，以及单细胞多组学数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | NA | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | 来自ENCODE项目的多种单细胞多组学数据集，以及多个公开可用的单细胞和空间数据集，具体样本数未在摘要中说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 234 | 2026-09-23 |
Influenza-induced tuft cell expansion alters ILC-mediated inflammation
2026-May-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.08.723776
PMID:42182319
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研究论文 | 本研究探讨了流感感染后小鼠远端气道中异位簇细胞（tuft cells）如何通过调控固有淋巴样细胞（ILCs）来塑造固有免疫应答 | 揭示了簇细胞与ILC2之间的相互调控轴，即IFNγ抑制簇细胞分化而ILC2驱动簇细胞扩增，并发现簇细胞缺失小鼠在流感损伤消退后表现出嗜酸性炎症减少及ILC1s和ILC3s扩增 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中验证；单细胞RNA-seq仅分析了全肺组织，未对特定细胞亚群进行深入功能验证 | 探究流感感染后异位簇细胞在塑造固有免疫和维持炎症平衡中的功能 | 流感感染小鼠模型中的远端气道异位簇细胞及固有淋巴样细胞（ILC1s、ILC2s、ILC3s） | 免疫学 | 流感病毒感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 235 | 2026-09-23 |
Identification of ATF3 as a Potential Key Biomarker for Hypertensive Nephropathy via Single-Cell Transcriptome Sequencing
2026-May-11, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-026-02515-5
PMID:42113322
|
研究论文 | 通过对高血压肾病患者和健康对照的肾脏组织进行单细胞RNA测序分析，并结合体内外实验验证，鉴定出ATF3作为高血压肾病潜在的关键生物标志物 | 首次通过单细胞转录组测序整合分析，在高血压肾病肾小管上皮细胞中发现了以ATF3为中心的调控网络，并揭示其可能通过FOSB调控氧化应激信号通路参与疾病进展 | 摘要中未明确说明研究的局限性 | 鉴定能够早期检测肾损伤并反映分子病理特征的高血压肾病特异性生物标志物 | 高血压肾病患者的肾脏组织样本及健康对照的肾脏组织样本 | 数字病理学 | 高血压肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 236 | 2026-09-23 |
Lense: Optimizing data preprocessing in single-cell omics using LLMs
2026-May-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.07.723465
PMID:42182127
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研究论文 | 提出了一种利用语言模型自动选择单细胞组学数据预处理流程的方法 Lense，通过比较不同流程变体的低维表示图来优化预处理 | 利用语言模型自动比较可视化图来选择最优预处理流程，无需手动调参，并集成到 Seurat 中 | 未提及具体性能评估和大规模验证 | 优化单细胞组学数据预处理，特别是针对空间转录组等新兴平台的数据 | 单细胞组学数据（包括空间转录组数据） | 机器学习 | NA | 单细胞组学 | 语言模型（LLM） | 图像（低维表示图）、文本（预处理步骤描述） | NA | NA | NA | NA | NA |
| 237 | 2026-09-23 |
A Perturb-seq screen guided by species divergence uncovers pathways for collateral artery formation
2026-May-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.29.721711
PMID:42146601
|
研究论文 | 本研究通过比较豚鼠和小鼠的单细胞RNA测序数据，识别与侧支动脉发育相关的内皮细胞基因表达模式，并利用Perturb-seq平台在小鼠中测试这些基因的功能，从而发现调控侧支动脉形成的新通路 | 首次结合物种差异引导的Perturb-seq筛选策略，发现豚鼠具有密集侧支动脉网络是由于动脉抑制通路和缺氧反应活性降低，并鉴定了促进侧支动脉形成的新靶点 | 研究主要基于小鼠模型验证，豚鼠中的发现是否完全适用于人类仍需进一步研究；Perturb-seq筛选可能未涵盖所有相关基因和通路 | 揭示侧支动脉发育的分子机制，并寻找刺激侧支动脉生长的治疗靶点 | 豚鼠和小鼠的组织样本，以及小鼠模型中的内皮细胞 | 单细胞组学、功能基因组学 | 中风、冠状动脉疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、Perturb-seq | NA | 单细胞转录组数据、基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、Perturb-seq | NA | NA |
| 238 | 2026-09-23 |
Heterogeneous, population-level drug-tolerant persisters exhibit ion-channel remodeling and ferroptosis susceptibility
2026-May-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2022.02.03.479045
PMID:42039444
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研究论文 | 该研究通过单细胞转录组学和谱系条形码技术，揭示药物耐受持留细胞（DTPs）并非单一细胞状态，而是由多个具有不同分裂和死亡速率的亚状态组成的异质性群体，并发现其存在离子通道重塑和对铁死亡敏感性增加的特征。 | 提出DTPs并非单一细胞状态，而是由多个亚状态组成的异质性群体，这些亚状态的分裂和死亡速率平衡产生接近零的净群体增长；发现idling DTPs存在离子通道活性改变，且对铁死亡表现出更高的敏感性。 | 摘要中未明确提及研究的具体局限性。 | 探究药物耐受持留细胞（DTPs）的异质性本质，揭示其亚状态组成、谱系来源、离子通道重塑及对铁死亡的敏感性，提出群体水平的肿瘤药物耐受新观点。 | 药物耐受持留细胞（DTPs），特别是称为“idling”的群体水平DTP | 单细胞转录组学 | 癌症 | 单细胞转录组学，谱系条形码 | NA | 转录组数据，条形码数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 239 | 2026-09-23 |
BART-spatial unravels biologically significant transcriptional regulators from spatial omics data
2026-May-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.05.723027
PMID:42146333
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研究论文 | 开发了一种名为BART-spatial的计算方法，从空间组学数据中推断功能性转录调控因子，并在多个空间数据集上验证了其优越性 | 首次将空间变异性和伪时间信息与公开的TR结合谱整合，专门用于从空间组学数据中推断功能性TR，克服了TR低表达和TR活性与mRNA水平不直接相关的问题，并兼容空间表观组学数据实现交叉验证 | 摘要中未明确提及局限性 | 从空间组学数据中识别功能性转录调控因子，以理解发育、组织组织和疾病中的基因调控程序 | 空间转录组学和空间表观组学数据 | 空间组学分析 | NA | 空间转录组学, 空间表观组学, 空间RNA-ATAC-seq | NA | 空间组学数据 | 多个空间数据集 | 10x Genomics, Atera | 空间转录组学, 空间ATAC-seq | 10X Visium, Visium HD, Atera | 10X Visium, Visium HD, Atera, 空间RNA-ATAC-seq |
| 240 | 2026-09-23 |
Flow Matching for Count Data
2026-May-08, ArXiv
PMID:42147731
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研究论文 | 提出了一种基于连续时间生灭过程的流匹配框架 count-FM，用于计数数据的生成与传输建模 | 基于连续时间生灭过程与局部单位跳跃，在计数空间直接进行无模拟训练，实现任意计数分布源与目标群体之间的高效迁移 | 未明确提及 | 为高维计数数据（如单细胞 RNA 测序和神经脉冲序列）构建高效且可解释的流匹配生成模型 | 单细胞 RNA 测序数据、神经脉冲序列数据 | 机器学习 | NA | 单细胞 RNA 测序 | 流匹配 | 计数数据 | NA | NA | 单细胞 RNA 测序 | NA | NA |