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当前共找到 5215 篇文献，本页显示第 221 - 240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 221 | 2026-05-12 |
Dynamics of severity-associated immune remodeling by granulocytes and macrophages in acute lung injury
2026-May-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.115816
PMID:42111184
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 222 | 2026-05-12 |
iS2C2: a cointelligent platform for mechanistic discovery of disease cellular crosstalk
2026-May-11, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-026-02691-8
PMID:42108258
|
研究论文 | iS2C2是一个结合数学算法与大语言模型的协同智能平台，用于从单细胞和空间转录组数据中自动生成疾病细胞互作的生物学假设 | 首次将严格数学计算算法与大语言模型上下文推理能力协同整合，实现了从多模态组学数据到生物学假设的完全自动化解读，无需人工专家干预 | 对大规模组学数据的直接解读能力受限，依赖算法与LLM的整合来提取可解释的生物学意义 | 建立全自动且可解释的生物学发现平台，用于揭示疾病微环境中细胞间信号通路的机制 | 阿尔茨海默病和癌症数据集中的细胞间通讯 | 机器学习 | 阿尔茨海默病, 癌症 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 大语言模型（LLM） | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 223 | 2026-05-12 |
Spatiotemporal regulation of arbuscular mycorrhizal symbiosis at cellular resolution
2026-May-11, The Plant cell
DOI:10.1093/plcell/koag133
PMID:42108419
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研究论文 | 通过单细胞分辨率下的空间转录组学和阶段特异性TRAP-seq技术，解析水稻与丛枝菌根真菌共生过程中时空调控机制 | 首次在单细胞分辨率下结合空间转录组学和阶段特异性TRAP-seq技术，揭示了宿主细胞在不同共生阶段的转录和翻译异质性，以及丛枝发育过程中养分转运蛋白和细胞壁基因的精细调控模式 | 未涉及对真菌基因功能的直接验证，且研究局限于水稻单一物种，可能缺乏跨物种的通用性 | 阐明丛枝菌根共生建立过程中的细胞动态调控机制，特别是营养交换和真菌发育的时空协调 | 水稻根组织及丛枝菌根真菌根内球囊霉 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学, TRAP-seq | NA | 转录组数据 | 水稻根组织样本（具体数量未提及） | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 224 | 2026-05-12 |
Combining Spatial Multi-Omics Data to Decipher Spatial Domains and Elucidate Cell Heterogeneity Based on Self-Supervised Graph Learning
2026-May-11, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.75533
PMID:42109219
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研究论文 | 提出SOTMGF，一种自监督多视图图融合框架，用于整合空间多组学数据以识别空间域和分析细胞异质性 | 首次在统一框架中联合分析空间转录组学和空间蛋白质组学数据，通过自训练和图表征迭代优化，并计算生成空间ATAC-seq数据以重建空间伪表达并识别暗基因/蛋白 | NA | 改进空间多组学数据整合方法，提升空间域识别和数据去噪能力，促进分子调控机制和治疗靶点发现 | 空间多组学数据（空间转录组学、空间蛋白质组学、空间ATAC-seq） | 机器学习 | NA | 空间转录组学、空间蛋白质组学、空间ATAC-seq | 图神经网络、自监督学习 | 多模态空间数据（分子表达、空间位置、微环境、分子关联） | NA | NA | 空间转录组学、空间蛋白质组学、空间ATAC-seq | NA | NA |
| 225 | 2026-05-12 |
Low-Strength Type I Interferon Signaling Promotes CAR T Cell Treatment Efficacy
2026-May-11, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-25-0691
PMID:42112708
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了低强度I型干扰素信号可增强CAR T细胞治疗效果，并提出了一种新的体外生产策略 | 首次发现低强度I型干扰素信号能增强CAR T细胞对B细胞淋巴瘤和白血病的细胞毒性及治疗效果，且利用已获FDA批准的药物，避免了体内干扰素相关毒性 | 未提及具体局限性 | 揭示CD19靶向CAR T细胞疗法疗效的决定因素，并开发提高疗效的新策略 | 8例接受axicabtagene ciloleucel治疗的复发/难治性弥漫大B细胞淋巴瘤患者的输注产品 | 机器学习 | 弥漫大B细胞淋巴瘤, B细胞淋巴瘤, 白血病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 8例复发/难治性弥漫大B细胞淋巴瘤患者的输注产品 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 226 | 2026-05-12 |
Correction to: Spatial transcriptomics in the human adult ovary: insights into key signalling pathways during follicular atresia
2026-May-11, Human reproduction (Oxford, England)
DOI:10.1093/humrep/deag080
PMID:42112982
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 227 | 2026-05-12 |
Molecular mechanisms linking cadmium chloride exposure to ankylosing spondylitis: an integrative network-based study
2026-May-11, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-026-05394-7
PMID:42113191
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研究论文 | 采用网络毒理学框架，整合多机器学习和单细胞转录组分析，揭示氯化镉暴露与强直性脊柱炎之间的分子机制 | 首次通过网络毒理学结合多种机器学习算法（LASSO、SVM、随机森林和XGBoost）鉴定氯化镉暴露与强直性脊柱炎的核心共靶基因，并利用孟德尔随机化和单细胞RNA-seq虚拟敲除验证ETFA的因果作用 | 研究基于公开数据库和计算分析，缺乏大规模的队列验证和深入的体内实验验证 | 阐明氯化镉慢性暴露通过免疫调控异常参与强直性脊柱炎发病的分子机制 | 氯化镉暴露相关的毒理学靶点与强直性脊柱炎患者差异表达基因的交集基因 | 机器学习 | 强直性脊柱炎 | NGS, RNA-seq, 单细胞RNA-seq | LASSO, SVM, 随机森林, XGBoost | 基因表达数据 | GSE73754数据集（AS相关DEGs）、GSE194315数据集（单细胞RNA-seq） | NA | NA | NA | NA |
| 228 | 2026-05-12 |
Identification of ATF3 as a Potential Key Biomarker for Hypertensive Nephropathy via Single-Cell Transcriptome Sequencing
2026-May-11, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-026-02515-5
PMID:42113322
|
研究论文 | 通过单细胞转录组测序鉴定ATF3作为高血压肾病的关键生物标志物 | 首次利用单细胞RNA测序整合分析，鉴定出ATF3作为高血压肾病的潜在关键生物标志物，并揭示其通过FOSB调控氧化应激信号通路的机制 | 未在更大规模临床样本中验证ATF3的诊断价值，且机制研究主要基于体内外模型，需进一步在人体中验证 | 寻找高血压肾病的早期诊断生物标志物并阐明其分子病理机制 | 高血压肾病患者及健康对照的肾组织样本 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | 非负矩阵分解 | 基因表达数据 | 高血压肾病患者和健康对照的肾组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 229 | 2026-05-12 |
STAID: A Self-Refining Deep Learning Framework for Spatial Cell-Type Deconvolution with Biologically Informed Modeling
2026-May-10, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.75607
PMID:42107049
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研究论文 | 提出STAID框架，通过迭代伪点优化与图信号处理，实现空间转录组数据中细胞类型组成的精确去卷积 | 将伪点生成与深度学习训练结合形成自强化循环，并利用图信号处理捕捉基因间高阶关系，显著提升空间细胞类型去卷积准确性 | 未明确说明局限性（但作为新方法可能依赖参考数据质量和计算资源需求较高） | 开发空间转录组数据中高分辨率细胞类型去卷积方法 | 空间转录组数据中的组织切片和细胞类型组成 | 机器学习, 数字病理学 | 乳腺癌, 克罗恩病 | 空间转录组学 | 深度学习框架（含图信号处理组件） | 空间转录组数据 | 包含乳腺癌临床切片、人类胚胎肢体数据集和克罗恩病样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 230 | 2026-05-12 |
G6PC Downregulation Promotes Renal Calcium Oxalate Stone Formation via Lactate-Induced SNAIL1 K206 Lactylation and Epithelial-Mesenchymal Transition
2026-May-10, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.75585
PMID:42107057
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研究论文 | 利用单细胞转录组学揭示G6PC下调通过乳酸诱导的SNAIL1 K206乳酰化促进肾草酸钙结石形成和上皮-间质转化 | 首次阐明G6PC-乳酸-SNAIL1轴在肾结石形成中的作用，发现乳酸通过乳酰化修饰SNAIL1的K206位点激活TGF-β信号，连接代谢紊乱与上皮重塑 | NA | 研究肾草酸钙结石形成中肾小管上皮细胞的代谢重编程及其分子机制 | 小鼠肾结石模型的肾近端小管上皮细胞 | 机器学习和单细胞转录组学 | 肾结石 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠肾结石模型样本（具体数量未提供） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒 |
| 231 | 2026-05-12 |
Identification of PRRG1 as a possible molecular target of pancreatic cancer
2026-May-10, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08832-9
PMID:42108282
|
研究论文 | 本研究探讨了PRRG1在胰腺癌中的表达模式、生物学功能和分子机制，发现其通过PI3K-Akt通路驱动肿瘤进展，低剂量华法林可抑制其促肿瘤作用 | 首次鉴定PRRG1为胰腺癌潜在分子靶点，并揭示KLF4转录因子调控其表达以及低剂量华法林的抑制效应 | 未提及具体局限性，但可能包括样本量有限或缺乏临床验证 | 阐明PRRG1在胰腺癌发病中的角色及其作为治疗靶点的潜力 | 胰腺癌组织样本、胰腺癌细胞系（CFPAC-1和PATU-8988T）、皮下异种移植小鼠模型 | 分子生物学 | 胰腺癌 | RNA测序、单细胞测序、免疫组化、慢病毒转导 | NA | RNA-seq数据、单细胞测序数据 | 人胰腺癌组织样本和正常胰腺组织（具体数量未明确）、两种胰腺癌细胞系、小鼠模型 | NA | RNA-seq、单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 232 | 2026-05-12 |
Single-cell and bulk omics uncover fibroblast heterogeneity and HSPH1 as a key driver in Barrett's esophagus to esophageal adenocarcinoma progression
2026-May-10, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-026-04319-x
PMID:42108450
|
研究论文 | 本研究整合单细胞和批量组学数据，揭示了食管腺癌进展过程中成纤维细胞的异质性，并识别HSPH1为关键驱动因子 | 首次通过整合单细胞RNA测序与批量转录组数据，系统解析了从巴雷特食管到食管腺癌进展中成纤维细胞异质性及上皮-间质串扰，并利用多机器学习算法确立HSPH1为核心预后基因 | NA | 探究从巴雷特食管到食管腺癌进展的分子机制，识别诊断生物标志物和治疗靶点 | 食管腺癌及其癌前病变巴雷特食管中的成纤维细胞异质性和上皮-间质相互作用 | 机器学习, 数字病理学 | 食管腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量转录组测序, 免疫组化, 体外实验 | 机器学习算法 | 单细胞转录组数据, 批量转录组数据, 图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 233 | 2026-05-12 |
anndataR improves interoperability between R and Python in single-cell transcriptomics
2026-May-09, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag288
PMID:42108549
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研究论文 | anndataR 软件包实现了单细胞转录组学数据在 R 和 Python 之间的互操作性 | 提供原生读写 H5AD 文件、与 SingleCellExperiment 或 Seurat 对象互相转换的功能，并确保语言间长期兼容性 | NA | 改善单细胞转录组学数据在 R 和 Python 之间的互操作性 | H5AD 格式的单细胞转录组学数据集 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组学数据 | NA | NA | 单细胞 RNA-seq | NA | NA |
| 234 | 2026-05-12 |
Deciphering the immunological landscape of HR + metastatic breast cancer: insights from single-cell transcriptomics
2026-May-08, Human cell
IF:3.4Q3
DOI:10.1007/s13577-026-01384-2
PMID:42101520
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序揭示激素受体阳性转移性乳腺癌的免疫微环境特征 | 首次专注于HR+乳腺癌卵巢转移的肿瘤微环境单细胞转录组分析，鉴定出与巨噬细胞功能相关的五个关键基因（GPR183、BHLHE41、CD83、SLC25A37和SELL） | 样本量较小，仅10例卵巢转移乳腺癌患者的临床样本用于体内验证 | 表征HR+乳腺癌肿瘤微环境，尤其是卵巢转移中的免疫细胞组成和关键基因 | HR+乳腺癌患者的原发肿瘤组织和配对的正常组织 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、免疫组化 | NA | 单细胞转录组数据、临床样本病理图像 | 10例HR+乳腺癌伴卵巢转移患者的原发肿瘤及配对正常组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 235 | 2026-05-12 |
Persistence of alveolar fibroblast-derived ADAMTS4+ cells in a preclinical model of delayed pulmonary fibrosis resolution
2026-May-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-72419-3
PMID:42103706
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研究论文 | 通过谱系追踪和单细胞转录组学方法，研究肺泡成纤维细胞来源的ADAMTS4+细胞在迟发性肺纤维化消退过程中的持续存在及其机制 | 首次发现脂成纤维细胞向肌成纤维细胞的可逆转换在纤维化消退中起关键作用，并鉴定ADAMTS4+细胞为延迟消退的潜在治疗靶点 | 主要基于小鼠模型，人类样本验证有限；结论可能受模型和样本量的影响 | 探究肺纤维化消退的机制，特别是脂成纤维细胞向肌成纤维细胞转化及其退行过程 | 老年小鼠的肺泡成纤维细胞和ADAMTS4+细胞，以及人类肺移植组织 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 谱系追踪、单细胞转录组学、组织学分析、外植模型 | 卷积神经网络 | 转录组数据、组织图像 | 老年小鼠（数量未明确）及人类肺移植组织样本 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 不适用 |
| 236 | 2026-05-12 |
A stem and progenitor cell-derived gene expression signature is prognostic for survival in myelofibrosis
2026-May-07, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2025030094
PMID:41481381
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研究论文 | 通过分析骨髓纤维化患者的造血干祖细胞转录组特征，开发了一种24基因加权表达评分（MPN24），该评分能独立于现有风险分层模型预测患者总生存期 | 首次利用单细胞RNA测序数据指导构建基于bulk RNA-seq的预后模型，揭示了造血干祖细胞来源的基因表达特征在骨髓纤维化风险分层中的独立预后价值，并证明其能显著提升现有临床-基因组风险模型的预测能力 | 研究未明确MPN24评分在动态监测治疗反应或指导治疗决策中的应用价值，且样本均来自同一机构可能存在选择偏倚 | 探索造血干祖细胞转录组特征是否能改善骨髓纤维化的风险分层 | 骨髓纤维化患者的血液样本及Lin-CD34+造血干祖细胞 | 机器学习 | 骨髓纤维化 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, NanoString | 加权基因表达评分模型 | 基因表达数据 | 358例骨髓纤维化患者（训练+测试队列），两个独立验证队列共270例患者 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 237 | 2026-05-12 |
Hopx(+) optic nerve head-astrocytes counter neuronal stress and glaucoma damage
2026-May-05, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2515277123
PMID:42044330
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研究论文 | 该研究发现视神经头内的Hopx阳性星形胶质细胞通过分泌细胞外囊泡增强视网膜神经节细胞存活，并在青光眼模型中发挥保护作用，其丢失与年龄相关视神经疾病有关 | 首次揭示Hopx阳性视神经头星形胶质细胞通过细胞外囊泡分泌因子与视网膜神经节细胞双向通讯，并证明其年龄相关丢失是视神经疾病的关键因素，提出替代视神经头相关因子的治疗范式转变 | 未提供明确的局限性说明，但可能包括动物模型与人类疾病的差异、细胞外囊泡临床应用转化复杂性等 | 探究视神经头星形胶质细胞在青光眼等视神经疾病中的作用机制及潜在治疗策略 | 年轻大鼠视神经头Hopx阳性星形胶质细胞及视网膜神经节细胞 | 机器学习 | 青光眼 | 单细胞RNA测序、细胞外囊泡蛋白质组学分析 | NA | 基因表达数据 | 大鼠模型，包括对照组和视神经挫伤组 | 10x Genomics, Broad Institute | 单细胞RNA测序, 细胞外囊泡蛋白质组学 | 10x Chromium, Broad Institute在线数据库 | 大鼠视神经头单细胞RNA测序与在线Broad研究所scRNA-seq数据库分析 |
| 238 | 2026-05-12 |
In Vitro Single-Cell Transcriptomic Profiling of Cultured Stem Cells From Apical Papilla and Dental Pulp Stem Cells: Unveiling Cellular Heterogeneity
2026-May-05, International dental journal
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.identj.2026.109577
PMID:42090950
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序比较培养的根尖乳头干细胞和牙髓干细胞的转录组图谱，揭示细胞异质性 | 首次在单细胞水平上对培养的根尖乳头干细胞和牙髓干细胞进行详细比较，鉴定出先前未描述的NOTCH3+/PDGFRB+前体样细胞亚群 | 基于培养细胞的转录组相似性构建的伪时间轨迹仅为假设生成模型，未经验证的谱系关系，需要功能性验证 | 通过单细胞RNA测序比较根尖乳头干细胞和牙髓干细胞的细胞组成，鉴定其差异性再生行为背后的细胞亚群和相关标志物 | 来自3名人类供体的根尖乳头干细胞和牙髓干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 3名人类供体的根尖乳头干细胞和牙髓干细胞样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒 |
| 239 | 2026-05-12 |
Viral orchitis and male infertility: A comprehensive review of pathogenic mechanisms and outcomes
2026-May-05, Journal of reproductive immunology
IF:2.9Q2
DOI:10.1016/j.jri.2026.104910
PMID:42107396
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综述 | 全面综述病毒性睾丸炎导致男性不育的发病机制及最新治疗策略 | 系统整合病毒性睾丸炎从流行病学到分子机制的证据，并引入单细胞测序、多组学技术和睾丸类器官模型等新兴转化研究方法 | 当前抗病毒和抗炎药物疗效欠佳，且缺乏针对病毒介导睾丸损伤的特定治疗策略 | 阐明病毒性睾丸炎影响男性生育力的致病机理并展望未来干预方向 | 病毒性睾丸炎及相关男性不育的病理机制 | 自然语言处理 | 男性不育症 | 单细胞测序、多组学技术 | 睾丸类器官模型 | 文本 | 不适用 | 不适用 | 单细胞RNA测序, 多组学技术 | 不适用 | 不适用 |
| 240 | 2026-05-12 |
InSituPREP enables 3D single-cell mapping of interaction-associated gene programs in the breast cancer tumor microenvironment
2026-May-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag406
PMID:42109251
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研究论文 | 提出InSituPREP计算框架，用于在三维组织中单细胞分辨率下量化空间环境与转录状态的关系 | 首次实现三维肿瘤微环境中单细胞分辨率的邻近关联基因程序定量解析，并整合空间RNA速度分析揭示细胞间距离对转录轨迹的影响 | 当前仅应用于10例乳腺癌活检组织及299个癌症相关基因，样本量和基因覆盖有限；依赖Expansion Sequencing技术可能引入特定技术偏倚 | 建立计算框架量化三维组织中空间环境对单细胞转录状态的影响 | 10例乳腺癌活检组织中的细胞及其microenvironment相互作用 | 计算生物学 | 乳腺癌 | Expansion Sequencing, RNA速度分析, 线性建模 | 线性模型 | 基因表达数据 | 10例乳腺癌活检组织 | NA | 空间转录组学 | Expansion Sequencing | Expansion Sequencing技术用于三维空间基因表达谱分析 |