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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 221 | 2026-02-10 |
Comprehensive analysis of key palmitoylation-modifying enzymes in clear cell renal cell carcinoma: implications for prognosis and therapy
2026-Jan-10, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-04155-5
PMID:41519750
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据,系统识别并验证了透明细胞肾细胞癌中关键的棕榈酰化修饰酶,探讨了其临床意义 | 首次在ccRCC中系统评估棕榈酰化修饰酶的作用,并利用PalmScore系统结合机器学习算法识别出诊断和预后关键基因 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验,缺乏体内实验验证,且临床样本的异质性可能影响结果 | 系统识别ccRCC中关键的棕榈酰化修饰酶,并探索其作为生物标志物和治疗靶点的潜力 | 透明细胞肾细胞癌(ccRCC)患者数据及细胞系 | 生物信息学 | 肾癌 | 多组学数据分析,单细胞RNA测序,siRNA敲低实验 | 机器学习算法 | 基因表达数据,临床数据 | 来自TCGA-KIRC和GEO数据集的ccRCC患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 222 | 2026-02-10 |
Differential expression analysis for spatially correlated data using smiDE
2026-Jan-10, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03867-1
PMID:41519776
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研究论文 | 本文提出了一种用于空间相关数据的差异表达分析方法,解决了空间转录组学中因分割错误和邻近细胞相关性导致的统计偏差问题 | 开发了smiDE方法,专门针对空间转录组数据中的分割误差和空间相关性进行校正,减少了假阳性发现 | NA | 改进空间转录组数据的差异表达分析,提高统计准确性 | 空间转录组数据中的细胞状态响应 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 223 | 2026-02-10 |
Mapping the secondary response to traumatic brain injury using spatial transcriptomics shows acute 4-aminopyridine treatment mitigates axonal and molecular pathology
2026-Jan-08, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-025-02219-1
PMID:41508250
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术,结合神经病理学分析,探讨了急性4-氨基吡啶治疗对创伤性脑损伤后轴突损伤和分子病理的缓解作用 | 首次将空间转录组学与临床导向的神经病理学相结合,全面分析创伤性脑损伤的次级损伤过程,并评估4-氨基吡啶作为急性治疗药物的潜力 | 研究仅使用小鼠模型,未涉及人类样本,且高剂量4-氨基吡啶可能诱发癫痫行为,限制了其临床应用 | 评估4-氨基吡啶作为急性创伤性脑损伤治疗药物,以减轻轴突损伤和促进活动依赖性修复 | 成年雄性和雌性小鼠的创伤性脑损伤模型,重点关注胼胝体轴突和皮质区域 | 空间转录组学 | 创伤性脑损伤 | 空间转录组学,免疫标记 | NA | 空间转录组数据,免疫组织化学图像 | 成年雄性和雌性小鼠,具体数量未在摘要中明确说明 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 224 | 2026-02-10 |
Tight junction-high and CDH17-positive cell population is the source of colorectal cancer liver metastases
2026-Jan-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-68169-3
PMID:41484106
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研究论文 | 本研究揭示了结直肠癌肝转移的细胞来源,发现IKKα缺失通过稳定紧密连接成分促进转移,并鉴定出CDH17⁺/CLDN2⁺上皮亚群在转移灶中的主导作用 | 意外发现IKKα缺失促进结直肠癌转移,并首次将紧密连接重塑驱动的CDH17⁺/CLDN2⁺上皮亚群确定为转移能力的来源 | 研究主要基于患者来源的类器官模型,体内验证和临床相关性需进一步探索 | 探究结直肠癌转移的细胞特征和驱动机制 | 结直肠癌患者来源的类器官、转移性病变组织 | 癌症生物学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组学、组织染色 | NA | 转录组数据、图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 225 | 2026-02-10 |
Oxidative stress and GPX2 control pancreatic vs. non-pancreatic cell fate in human endoderm
2026-Jan-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-68145-x
PMID:41484137
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研究论文 | 本研究揭示了氧化应激和GPX2在调控人类内胚层后前肠向胰腺与非胰腺细胞命运分化中的关键作用 | 首次发现谷胱甘肽过氧化物酶2(GPX2)通过调节氧化应激水平,决定人类后前肠细胞向胰腺或肝/肠谱系分化的命运选择 | 研究主要基于体外分化模型,体内生理环境中的验证尚需进一步研究 | 探究代谢产物在人类内胚层发育过程中细胞命运决定的作用机制 | 人类后前肠内胚层细胞 | 发育生物学 | NA | 批量转录组测序, 单细胞转录组测序, 染色质可及性分析 | NA | 转录组数据, 表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, ATAC-seq | NA | NA |
| 226 | 2026-02-10 |
A pan-cancer single cell landscape reveals heterogeneity and functional diversity of double-negative T cells
2026-Jan-03, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-025-02548-8
PMID:41484771
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据,揭示了双阴性T细胞在肿瘤微环境中的异质性和功能多样性 | 首次在泛癌水平构建了双阴性T细胞的单细胞图谱,识别了14个不同的亚群,并阐明了它们在肿瘤免疫治疗中的关键作用 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据,功能验证仍需进一步实验支持,且样本来源和癌症类型可能存在偏差 | 探究双阴性T细胞在肿瘤微环境中的异质性、功能多样性及其对免疫治疗反应的影响 | 双阴性T细胞(DNT细胞),包括αβ DNT和γδ T细胞亚群 | 单细胞组学 | 泛癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、多重免疫荧光、空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据、空间转录组数据 | 2,369个样本,涵盖23种癌症类型,包含157,025个高质量DNT细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 227 | 2026-02-10 |
Resolving Single-Cell Gene Expression by Pseudotemporal Integration of Transcriptomic and Proteomic Datasets
2026-Jan, Molecular & cellular proteomics : MCP
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.mcpro.2025.101475
PMID:41317903
|
研究论文 | 本研究提出了一种利用伪时间细胞排序整合单细胞RNA-Seq和单细胞蛋白质组学数据的新方法,以分析缺氧条件下的转录-翻译表达动态 | 首次使用伪时间轨迹整合单细胞转录组和蛋白质组数据,揭示转录与翻译的时序动态响应 | 仅针对缺氧条件进行研究,未涉及其他应激或疾病状态 | 整合单细胞转录组和蛋白质组数据,以理解缺氧应激下的细胞表型和转录-翻译动态 | 缺氧条件下的单细胞样本 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA-Seq, 单细胞蛋白质组学质谱 | 伪时间轨迹分析 | 转录组数据, 蛋白质组数据 | 纵向收集的单细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞蛋白质组学 | NA | NA |
| 228 | 2026-02-10 |
Multi-omics analysis reveals STING activation mediates NLRP3-related pyroptosis and exacerbates myocardial ischemia-reperfusion injury
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0341839
PMID:41650015
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了STING激活通过介导NLRP3相关的细胞焦亡,从而加剧心肌缺血再灌注损伤 | 首次整合转录组学、蛋白质组学和单细胞转录组学,系统阐明了STING-NLRP3轴在心肌缺血再灌注损伤中调控细胞焦亡的具体机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,其在人类患者中的直接适用性仍需进一步临床验证 | 探究心肌缺血再灌注损伤中细胞焦亡的分子机制,并寻找潜在的治疗靶点 | 小鼠心肌缺血再灌注模型、人心肌细胞缺氧/复氧模型 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 转录组学, 蛋白质组学, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据, 单细胞基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量,涉及小鼠模型和人心肌细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 229 | 2026-02-10 |
A multifaceted analysis of OTUD5 integrated MAVS in innate immunity of Primary Biliary Cholangitis
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0342306
PMID:41650163
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证,揭示了OTU去泛素化酶5(OTUD5)与线粒体抗病毒信号蛋白(MAVS)在原发性胆汁性胆管炎(PBC)先天免疫中的相互作用机制 | 首次结合微阵列、scRNA-seq和蛋白质组学分析,在PBC患者中鉴定出OTUD5与MAVS在单核巨噬细胞亚群11中的过表达及其相互作用,并验证了OTUD5敲低对MAVS表达的抑制作用 | 样本量相对较小(16例PBC患者组织,10例健康对照),且主要基于外周血和细胞系研究,缺乏更深入的体内功能验证 | 探索OTUD5在PBC发病机制中的作用,并开发靶向治疗策略 | 原发性胆汁性胆管炎(PBC)患者的外周血样本、肝组织以及RAW264.7细胞系 | 数字病理学 | 原发性胆汁性胆管炎 | 微阵列、RT-qPCR、免疫荧光、蛋白质组学分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据、单细胞转录组数据 | 16例PBC患者组织样本,10例健康对照组织样本,以及PBC患者和健康对照的外周血单核细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 230 | 2026-02-09 |
Myd88 and Sqstm1 as novel biomarkers for pyroptosis-driven immune checkpoint inhibitors-related myocarditis
2026-Feb-06, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.116336
PMID:41653556
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 231 | 2026-02-09 |
Breast Cancer Brain Metastases: Current Understanding and Future Directions
2026-Feb-05, Current oncology reports
IF:4.7Q1
DOI:10.1007/s11912-026-01753-y
PMID:41642399
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综述 | 本文回顾了乳腺癌脑转移的最新研究进展,重点探讨了转移机制、肿瘤微环境相互作用、受体不一致性、诊断创新和治疗策略 | 整合了JAK-STAT信号、同源重组缺陷、c-MYC、PI3K/AKT/mTOR和RET在BCBM进展中的作用,并引入了液体活检、空间转录组学和放射组学等新兴诊断工具 | 机器学习的外部验证有限,未来需要标准化诊断平台并在前瞻性试验中测试受体重新评估的生存影响 | 阐明乳腺癌脑转移的机制并指导精准管理 | 乳腺癌脑转移的分子机制、肿瘤微环境相互作用及诊断治疗策略 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 液体活检、空间转录组学、放射组学、机器学习 | 机器学习 | 分子数据、影像数据、空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 232 | 2026-02-09 |
Integrating single-nucleus barcoding with spatial transcriptomics via Stamp-seq to reveal immunotherapy response-enhancing functional modules in NSCLC
2026-Feb-05, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-025-00861-6
PMID:41644517
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研究论文 | 开发了一种名为Stamp-seq的方法,结合单核条形码与空间转录组学,以揭示非小细胞肺癌中增强免疫治疗响应的功能模块 | Stamp-seq利用定制高密度DNA测序芯片,通过限制酶可切割的空间条形码标记单核,实现单细胞分辨率、精确亚型分类和空间映射,成本降低 | 未在摘要中明确提及具体限制,但暗示传统空间转录组技术存在细胞边界推断、基因检测低和成本高的问题 | 揭示非小细胞肺癌中免疫治疗响应的空间细胞生态系统和功能模块 | 非小细胞肺癌组织中的单核细胞,特别是IGHG1浆细胞及其相关细胞群落 | 空间转录组学 | 非小细胞肺癌 | 单核条形码与空间转录组学整合技术 | NA | 空间转录组数据 | 未在摘要中指定具体样本数量 | NA | 单核条形码,空间转录组学 | 定制高密度DNA测序芯片 | Stamp-seq芯片,空间条形码分布密度为1.6微米,实现单细胞分辨率 |
| 233 | 2026-02-09 |
Single cell atlas decodes the molecular dynamics of scar repair after human rotator cuff tear
2026-Feb-05, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-025-00501-5
PMID:41644521
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序解析了人类肩袖撕裂后瘢痕修复的分子动态,揭示了纤维化瘢痕微环境的细胞和分子图谱 | 首次在人类肩袖撕裂样本中应用单细胞RNA测序技术,系统解析了纤维化瘢痕微环境的异质性细胞亚群及其分子机制,并识别了骨桥蛋白和TGF-β信号通路作为关键驱动因子 | 研究样本来源于患者手术切除组织,可能无法完全反映瘢痕形成的早期动态过程;样本量相对有限 | 探究人类肩袖撕裂后不可逆纤维化瘢痕形成的细胞和分子机制,并寻找潜在治疗靶点 | 肩袖撕裂患者的肌腱残端组织 | 数字病理学 | 肌肉骨骼疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 患者肩袖撕裂肌腱残端组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 234 | 2026-02-09 |
A peripheral glial niche orchestrates the early stages of skin wound healing
2026-Feb-05, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2025.12.015
PMID:41512873
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研究论文 | 本研究揭示了皮肤外周神经中的修复胶质细胞通过形成促修复微环境,在急性皮肤伤口愈合早期阶段调控免疫反应和成纤维细胞功能 | 首次发现外周神经中的修复胶质细胞在皮肤伤口愈合早期发挥关键调控作用,通过分泌CCL2等单核细胞趋化蛋白招募巨噬细胞,协调免疫反应和成纤维细胞转化 | 研究主要关注急性皮肤伤口模型,慢性伤口或其他组织类型的修复过程是否适用尚需验证 | 阐明皮肤伤口愈合早期阶段的细胞调控机制 | 小鼠皮肤急性伤口模型中的修复胶质细胞、巨噬细胞和成纤维细胞 | 数字病理学 | 皮肤损伤 | 多重成像、空间转录组学、单细胞RNA测序 | NA | 图像、空间转录组数据、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 235 | 2026-02-09 |
Supplementation with Lycium barbarum glycopeptide (LbGP) rescues the quality of aged oocytes
2026-Feb-04, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2026.121318
PMID:41651042
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研究论文 | 本研究探讨了枸杞糖肽(LbGP)对老龄小鼠卵巢功能和卵母细胞质量的恢复作用及其机制 | 首次系统揭示了LbGP通过同时恢复老龄卵母细胞线粒体功能和重塑卵巢微环境来延缓生殖衰老的双重作用机制 | 研究基于小鼠模型,其在人类中的疗效和安全性仍需进一步临床验证 | 探究LbGP对生殖衰老的干预作用及其分子机制 | 老龄雌性小鼠的卵巢组织、卵母细胞及早期胚胎 | 生殖医学与药理学 | 生殖衰老/卵巢功能减退 | 组织学分析、体外受精(IVF)、早期胚胎培养、活细胞成像、蛋白质组学分析、单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 组织切片图像、胚胎发育数据、蛋白质组数据、单细胞转录组数据 | 老龄雌性小鼠模型(具体数量未在摘要中明确) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 236 | 2026-02-09 |
Targeting RRBP1 reverses immune evasion and enhances immunotherapy efficacy via the CXCL10-CXCR3 axis in bladder cancer
2026-Feb-03, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-013809
PMID:41633771
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研究论文 | 本研究揭示了炎症相关基因RRBP1通过调控CXCL10-CXCR3轴,在膀胱癌中促进肿瘤恶性进展和免疫逃逸,并证实靶向RRBP1可增强抗PD-L1免疫疗法的疗效 | 首次将RRBP1鉴定为膀胱癌中连接炎症与免疫的关键基因,并阐明其通过CXCL10-CXCR3轴调控CD8+ T细胞功能的具体机制 | 动物模型与人体肿瘤微环境存在差异,RRBP1抑制剂的临床转化潜力仍需进一步验证 | 探索炎症相关基因RRBP1在调控膀胱癌恶性进展和免疫逃逸中的作用及机制 | 膀胱癌细胞、动物模型、临床样本(包括单细胞RNA测序数据) | 肿瘤免疫学 | 膀胱癌 | 转录组测序、蛋白质组学、CRISPR Cas9筛选、单细胞RNA测序、多重免疫荧光、流式细胞术、RNA测序 | 动物肿瘤模型、细胞功能实验模型 | 转录组数据、蛋白质组数据、单细胞RNA测序数据、免疫组化图像、流式细胞数据 | 未明确具体样本数量,但涉及多种实验体系(细胞、动物、临床数据) | NA | 单细胞RNA测序, RNA测序 | NA | NA |
| 237 | 2026-02-09 |
XBP1-driven proliferative B cell subcluster in Diffuse Large B Cell Lymphoma linked to altered nucleotide metabolism
2026-Feb-03, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-025-03673-2
PMID:41634749
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序识别并表征了弥漫性大B细胞淋巴瘤中一个与增殖相关的独特B细胞亚群 | 首次在DLBCL中识别出一个由XBP1驱动、与核苷酸代谢改变相关的增殖性B细胞亚群,并揭示了其与CD8+ T/NK细胞间的特定通讯通路 | 研究依赖于公共数据库GSE182434的已有数据集,未涉及新的患者样本采集或前瞻性临床验证 | 解析DLBCL中B细胞的异质性及其对疾病进展的功能影响 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤中的B细胞 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序,拷贝数变异分析,细胞间通讯分析,功能富集分析,SCENIC分析 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 基于公共数据集GSE182434(具体样本数量未在摘要中说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 238 | 2026-02-09 |
Single-cell profiling reveals reprogrammed hierarchy and disrupted immune-stromal ecosystem in TP53-mutated AML
2026-Feb-03, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-026-00751-x
PMID:41634865
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序描绘了TP53突变型急性髓系白血病(AML)的细胞图谱,揭示了其重编程的白血病细胞层级和紊乱的免疫-基质生态系统 | 首次提供了TP53突变型AML的单细胞图谱,识别了铁死亡抵抗表型作为新的预后标志,并建立了整合生态系统评分用于临床分层 | 样本量相对较小(30例),且为观察性研究,需要进一步的功能验证和更大规模的队列验证 | 阐明TP53突变型AML的耐药和复发机制,并探索潜在的治疗靶点 | 30例初诊AML患者的骨髓样本(11例TP53突变,19例TP53野生型) | 单细胞组学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 30例初诊AML患者的骨髓样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 239 | 2026-02-09 |
Unraveling dengue virus-host interactions through transcriptomics: Insights into disease progression and severity signatures
2026-Feb-02, Microbial pathogenesis
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.micpath.2026.108350
PMID:41638513
|
综述 | 本文综述了利用转录组学技术研究登革病毒与宿主相互作用的最新进展,以揭示疾病进展和严重程度的分子特征 | 整合了从微阵列到空间转录组学等多种转录组学技术的研究发现,系统阐述了登革病毒如何调控宿主基因表达,并强调了病毒包涵性单细胞RNA测序等新方法的应用 | NA | 阐明登革病毒与宿主相互作用的分子机制,为改进诊断和抗病毒治疗提供基础 | 登革病毒及其感染过程 | 自然语言处理 | 登革热 | 微阵列,bulk RNA-seq,单细胞RNA-seq,病毒包涵性单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 240 | 2026-02-09 |
A MIF-p38-GSDMD inflammatory loop in keratinocytes underlies UVB-induced cutaneous lupus
2026-Feb-02, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08443-4
PMID:41629274
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和狼疮易感小鼠模型,揭示了角质形成细胞来源的巨噬细胞迁移抑制因子(MIF)通过一个自我维持的反馈环路放大皮肤炎症,从而阐明紫外线B(UVB)诱导皮肤红斑狼疮的分子机制 | 首次发现角质形成细胞中MIF-p38-GSDMD炎症环路在UVB诱导的皮肤红斑狼疮中的关键作用,并揭示了GSDMD依赖性焦亡通过孔道而非囊泡分泌释放MIF的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,临床样本验证虽涉及主要CLE亚型,但人类患者中的直接机制验证和长期疗效仍需进一步研究 | 阐明紫外线B(UVB)触发皮肤红斑狼疮的分子基础 | 角质形成细胞、成纤维细胞、狼疮易感小鼠模型、临床皮肤样本 | 数字病理学 | 红斑狼疮 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据、图像数据 | 狼疮易感小鼠模型和临床皮肤样本,具体数量未明确 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |