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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2361 | 2026-02-13 |
Querying functional drivers in primary murine naïve and memory T cells using RNP-mediated CRISPR-Cas9 Gene Deletion
2026-Feb-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.05.704062
PMID:41676462
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研究论文 | 本文提出了一种基于RNP介导的CRISPR-Cas9基因删除技术,用于在原发性小鼠幼稚和记忆T细胞中快速评估候选基因的功能作用 | 开发了一种无需生殖系基因敲除小鼠的快速CRISPR-Cas9协议,可直接在激活效应、静止幼稚和记忆CD8 T细胞中进行基因删除,适用于急性和慢性感染模型 | 未明确提及样本量或技术验证的局限性,可能依赖于体外模型 | 研究CD8 T细胞在感染和癌症中的功能驱动基因,以加速免疫疗法和疫苗设计 | 原发性小鼠CD8 T细胞,包括幼稚、记忆和效应亚群 | 免疫学 | 癌症 | CRISPR-Cas9基因编辑,微阵列,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2362 | 2026-02-13 |
Exacerbated salmonellosis in poly(ADP-ribose) polymerase 14-deficient mice
2026-Feb-03, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.02971-25
PMID:41468544
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研究论文 | 本研究探讨了PARP14蛋白在小鼠沙门氏菌感染模型中的作用,发现PARP14缺失会加剧肠道炎症和组织损伤 | 首次揭示了PARP14在沙门氏菌感染中作为多细胞类型多效性调节因子的作用,特别是在Th17反应和上皮细胞转录组特征中的关键功能 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类中验证;PARP14的具体作用机制仍需进一步探究 | 探究PARP14蛋白在沙门氏菌感染引起的黏膜炎症中的功能 | 小鼠模型中的沙门氏菌感染及PARP14缺失小鼠 | 分子生物学与免疫学 | 感染性疾病(沙门氏菌感染) | RNA-Seq, 单细胞RNA-Seq, TaqMan qPCR, 免疫组织化学 | NA | 转录组数据, 单细胞转录组数据, 基因表达数据 | 未明确指定样本数量,但涉及PARP14缺失小鼠和对照小鼠的组织分析 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2363 | 2026-02-13 |
RNA Quality Control Enables Antibiotic Tolerance
2026-Feb-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.02.703294
PMID:41676483
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研究论文 | 本研究通过实验进化方法探索了细菌在抗生素和免疫压力下的适应机制,揭示了RNA质量控制如何驱动抗生素耐受性 | 首次发现RNA降解酶RNase Y的突变通过bet-hedging策略调控RNA周转,作为可调的主调节器来应对抗生素和免疫的联合压力 | 研究主要基于实验进化模型,可能未完全反映真实宿主环境中的复杂相互作用 | 探究细菌在抗生素和免疫压力下的适应机制及RNA质量控制的作用 | 细菌种群 | 微生物学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2364 | 2026-02-13 |
Maternal Obesity Reprograms Differentiation Trajectories of Fetal Hematopoietic Stem and Progenitor Cells Through Altered Inflammatory Signaling
2026-Feb-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.29.702548
PMID:41676530
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研究论文 | 本研究通过非人灵长类模型,揭示了母体肥胖如何通过改变炎症信号重编程胎儿造血干细胞和祖细胞的分化轨迹 | 首次在非人灵长类模型中系统研究母体肥胖对胎儿骨髓造血的影响,结合光谱流式细胞术、单细胞RNA测序和功能分化实验,揭示了HSPC成熟改变、谱系轨迹重编程和炎症偏向的机制 | 研究基于非人灵长类模型,结果向人类直接外推需谨慎;未探讨母体肥胖的具体分子机制或长期后效 | 探究母体肥胖对胎儿免疫系统发育的影响,特别是对胎儿骨髓造血干细胞和祖细胞分化轨迹的调控 | 非人灵长类(猕猴)胎儿骨髓中的造血干细胞和祖细胞(HSPCs) | 单细胞组学 | 肥胖相关疾病 | 单细胞RNA测序,光谱流式细胞术,功能分化实验 | NA | 单细胞转录组数据,流式细胞数据 | 非人灵长类胎儿骨髓样本(肥胖母体与瘦对照组后代) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2365 | 2026-02-13 |
Histotripsy-initiated immune response synergizes with chemotherapy in a neuroblastoma murine model
2026-Feb-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.30.702878
PMID:41676730
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研究论文 | 本研究探讨了组织超声消融术(Histotripsy)在神经母细胞瘤小鼠模型中引发的免疫反应,及其与化疗的协同抗肿瘤效应 | 首次证明组织超声消融术不仅能局部消融肿瘤,还能诱导全身性抗肿瘤免疫反应,从而增强化疗对远端转移灶的疗效 | 研究基于小鼠模型,结果需在人体临床试验中验证;未详细探讨组织超声消融术的最佳参数与长期免疫记忆效应 | 探究组织超声消融术对神经母细胞瘤肿瘤微环境的免疫调节作用,及其与化疗联用的协同治疗效果 | 神经母细胞瘤小鼠模型(Neuro-2a细胞系) | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,免疫组织化学 | NA | 测序数据,图像数据,流式数据 | 雌性A/J小鼠,双侧接种1×10⁶ Neuro-2a细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2366 | 2026-02-13 |
hSNMF: Hybrid Spatially Regularized NMF for Image-Derived Spatial Transcriptomics
2026-Feb-02, ArXiv
PMID:41675352
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研究论文 | 本研究提出了一种用于高分辨率空间转录组学数据(如Xenium平台数据)的混合空间正则化非负矩阵分解方法,以改善表示学习和聚类效果 | 提出了两种空间正则化的NMF变体:轻量级的空间NMF(SNMF)和混合空间NMF(hSNMF),后者通过可调参数α整合空间邻近性和转录组相似性,并在Leiden聚类前进行空间正则化 | 方法仅在胆管癌数据集上进行了评估,其普适性有待在其他组织和疾病类型中进一步验证 | 解决高分辨率空间转录组学数据因维度极高而带来的表示学习和聚类挑战 | 来自Xenium平台的肿瘤微阵列组织高分辨率图像数据 | 空间转录组学 | 胆管癌 | 空间转录组学 | 非负矩阵分解,Leiden聚类 | 图像,细胞-基因矩阵 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium | Xenium平台,用于捕获肿瘤微阵列组织的高分辨率图像并生成细胞-基因矩阵 |
| 2367 | 2026-02-13 |
Forward Programming Identifies Inducers of Blood-Brain Barrier Properties in Human Pluripotent Stem Cell-Derived Endothelial Cells
2026-Feb-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.02.699492
PMID:41676611
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序挖掘转录因子,并利用正向编程技术诱导人多能干细胞来源的内皮细胞获得血脑屏障特性 | 首次结合单细胞RNA测序数据挖掘和正向编程方法,系统识别并验证了能诱导血脑屏障特性的转录因子组合 | 研究基于体外细胞模型,可能无法完全模拟体内血脑屏障的复杂微环境 | 探索血脑屏障特性在发育过程中的诱导机制,并开发用于建模和药物筛选的细胞工具 | 人多能干细胞来源的内皮细胞 | 单细胞组学 | 神经血管疾病 | 单细胞RNA测序 | 正向编程 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2368 | 2026-02-13 |
Modeling cell-cell interactions to advance drug discovery in Idiopathic Pulmonary Fibrosis
2026-Feb-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.29.702646
PMID:41676623
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研究论文 | 本研究开发了一种基于支架的人源共培养肺泡类器官模型,用于模拟特发性肺纤维化(IPF)的起始和进展过程 | 开发了首个利用健康与IPF患者原代肺成纤维细胞及携带家族性IPF突变(SFTPC 173T)的iPSC来源肺泡II型细胞构建的三维共培养类器官模型,以模拟纤维化过程中的上皮-间质细胞通讯 | 模型虽能模拟疾病进展的关键特征,但仍为体外系统,可能无法完全复制体内复杂的微环境及全身性因素 | 开发一种能有效模拟特发性肺纤维化(IPF)起始与进展的体外模型,以研究其发病机制并评估抗纤维化药物的疗效 | 健康及IPF患者的人原代肺成纤维细胞、携带SFTPC 173T突变(家族性IPF)或同基因校正对照的诱导多能干细胞(iPSC)来源的肺泡II型(iAT2)细胞 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 三维共培养类器官模型 | 基因表达数据(单细胞水平) | 未明确具体样本数量,但使用了来自健康个体和IPF患者的原代细胞以及基因工程改造的iPSC系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2369 | 2026-02-13 |
scPER: A Rigorous Computational Approach to Determine Cellular Subtypes in Tumors Aligned With Cancer Phenotypes From Total RNA Sequencing
2026-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202514502
PMID:41309494
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研究论文 | 提出了一种名为scPER的计算方法,用于从总RNA测序数据中估计肿瘤微环境细胞组成并识别与表型相关的细胞亚群 | 结合对抗自编码器和极端梯度提升技术,整合多个scRNA-seq数据集构建综合参考面板,有效分离混杂因素与真实信号 | NA | 开发一种计算方法来估计肿瘤微环境中的细胞比例并识别与癌症表型相关的细胞亚群 | 肿瘤微环境中的细胞亚型 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞RNA测序,总RNA测序 | 对抗自编码器,极端梯度提升 | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,总RNA-seq | NA | NA |
| 2370 | 2026-02-13 |
Mapping heterogeneity in the tumor microenvironment of renal cell carcinoma through single-cell omics
2026-Feb, Trends in cancer
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.trecan.2025.11.001
PMID:41339185
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综述 | 本文综述了单细胞组学技术在揭示肾细胞癌肿瘤微环境异质性方面的应用与发现 | 整合多种单细胞技术(scRNA-seq、snRNA-seq、scATAC-seq、scTCR-seq和成像质谱流式)的系统性综述,首次全面定义RCC中CD8 T细胞亚群、耗竭轨迹及多种免疫细胞(如TAMs、DCs、NK细胞、CAFs)的起源、表型多样性和功能状态 | 作为综述文章,未涉及原始实验数据,结论依赖于已发表研究的整合分析 | 解析肾细胞癌肿瘤微环境的细胞与分子异质性,为精准免疫治疗提供依据 | 肾细胞癌的肿瘤微环境细胞(包括恶性细胞、CD8 T细胞、肿瘤相关巨噬细胞、树突状细胞、自然杀伤细胞、癌症相关成纤维细胞等) | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序、单核RNA测序、转座酶可及染色质测序、T细胞受体测序、成像质谱流式 | NA | 单细胞组学数据、空间多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2371 | 2026-02-13 |
ADME Profiling of Quantum Dots and Immune Responses: Impact of Dynamic Inflammatory Mediator Changes on the Nervous System
2026-Feb, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202510266
PMID:41457817
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研究论文 | 本文系统评估了CdTe量子点在体内的分布、神经行为效应及细胞响应,揭示了其诱导神经毒性的多细胞机制 | 首次通过单细胞RNA测序技术,在单细胞分辨率下揭示了量子点暴露后海马组织中微胶质细胞、少突胶质前体细胞和内皮细胞在炎症、氧化和细胞应激通路中的协同作用 | 研究仅使用小鼠模型,结果可能不完全适用于人类;且仅评估了短期暴露效应,长期神经毒性影响尚不明确 | 评估CdTe量子点的神经毒性及其潜在机制,为纳米材料的生物医学应用安全性提供依据 | 小鼠(经尾静脉注射巯基丙酸修饰的CdTe量子点) | 神经科学 | 神经毒性 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确样本数量,但基于小鼠海马组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2372 | 2026-02-13 |
Tissue-Derived Extracellular Vesicles Define Diagnostic Biomarkers for Renal Cell Carcinoma
2026-Feb, Journal of extracellular vesicles
IF:15.5Q1
DOI:10.1002/jev2.70221
PMID:41656939
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研究论文 | 本研究通过分析组织来源的细胞外囊泡,鉴定出肾细胞癌不同亚型的诊断生物标志物 | 首次利用组织来源的细胞外囊泡作为肾细胞癌亚型分化的诊断标志物,并通过单细胞测序数据揭示了这些标志物的细胞来源 | 研究样本量未在摘要中明确说明,且外部验证队列的详细信息未提供 | 探索组织来源的细胞外囊泡作为肾细胞癌亚型诊断生物标志物的价值 | 肾细胞癌患者的配对肿瘤和正常组织及其对应的组织来源细胞外囊泡 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞测序 | NA | 生物分子数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2373 | 2026-02-13 |
Integrated transcriptomic analysis reveals mitochondrial dysregulation and macrophage heterogeneity associated with MTHFD2 in glioblastoma
2026-Jan-31, Brain research bulletin
IF:3.5Q2
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研究论文 | 本研究通过整合转录组分析,揭示了线粒体功能障碍和与MTHFD2相关的巨噬细胞异质性在胶质母细胞瘤中的关键作用 | 首次将MTHFD2鉴定为胶质母细胞瘤的诊断性线粒体枢纽基因,并利用单细胞RNA测序揭示了其在肿瘤相关巨噬细胞中的高表达和功能,关联了线粒体活性、巨噬细胞亚群分化状态与肿瘤进展 | 研究主要基于转录组数据集和体外实验,缺乏体内模型验证;单细胞分析的数据集可能有限,需要更多独立队列验证 | 探究胶质母细胞瘤中线粒体基因改变及其细胞特异性,特别是巨噬细胞异质性在肿瘤进展和免疫调节中的作用 | 胶质母细胞瘤患者样本(来自TCGA-GBM、GSE66354数据集)及体外培养的胶质母细胞瘤细胞和巨噬细胞 | 生物信息学与计算生物学 | 胶质母细胞瘤 | 转录组分析、单细胞RNA测序、Cox回归分析、功能富集分析、伪时间分析、体外功能实验(细胞增殖、侵袭、集落形成、迁移实验) | NA | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 基于TCGA-GBM和GSE66354数据集,具体样本数量未在摘要中明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2374 | 2026-02-13 |
Insight into modulating osteoarthritis progression: lncRNAs and TGF-β/Smad signalling pathway
2026-Jan-28, Clinical and experimental rheumatology
IF:3.4Q2
DOI:10.55563/clinexprheumatol/tefop2
PMID:41678186
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综述 | 本文系统探讨了长链非编码RNA通过TGF-β/Smad信号通路调节骨关节炎软骨修复的分子机制及其临床转化策略 | 系统总结了lncRNAs通过TGF-β/Smad通路调控骨关节炎进展的分子机制,并整合了基于lncRNA的纳米颗粒递送、基因编辑等新型临床转化策略 | lncRNA疗法在靶向递送效率和特异性方面仍面临挑战 | 探讨lncRNAs通过TGF-β/Smad信号通路调控骨关节炎进展的分子机制及治疗潜力 | 长链非编码RNA、TGF-β/Smad信号通路、骨关节炎 | NA | 骨关节炎 | 单细胞测序、基因编辑 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2375 | 2026-02-13 |
4D multimodal wound healing atlas reveals organ-level controls of repair phase transitions
2026-Jan-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.15.699736
PMID:41648423
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研究论文 | 本研究通过构建一个4D多模态伤口愈合图谱,揭示了器官水平上控制修复阶段转换的分子逻辑 | 首次创建了器官尺度的4D多模态伤口愈合图谱,整合了snRNA-seq、scRNA-seq、CITE-seq和高清空间转录组学,克服了传统图谱的技术限制,发现了之前被遗漏的关键角质形成细胞亚群及其在协调修复中的核心作用 | 研究主要基于小鼠模型,虽然进行了跨物种验证,但人类数据可能仍受解离诱导的伪影影响 | 解码哺乳动物伤口愈合在器官尺度的系统级原则,揭示修复阶段转换的分子控制机制 | 小鼠皮肤伤口愈合过程中的细胞状态和组织系统 | 空间转录组学 | 伤口愈合障碍 | snRNA-seq, scRNA-seq, CITE-seq, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 超过725,000个小鼠单细胞和空间转录组 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2376 | 2026-02-13 |
Unveiling cholesterol metabolism-related gene ACOX2: a multi-omics discovery of a novel biomarker in IgA nephropathy
2026-Jan-15, Hereditas
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s41065-026-00639-0
PMID:41540492
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研究论文 | 本研究通过多组学整合分析,揭示了胆固醇代谢相关基因ACOX2在IgA肾病中的保护性作用,并探索了其作为新型生物标志物的潜力 | 首次将GWAS、SMR、贝叶斯共定位、scRNA-seq、分子对接和分子动力学模拟等多组学方法整合,系统性地识别了IgA肾病中胆固醇代谢的关键调控基因ACOX2,并发现其与疾病风险的负相关关系 | 研究主要基于遗传和转录组数据,缺乏直接的体内功能验证实验,且分子对接结果需进一步实验证实 | 探究胆固醇代谢在IgA肾病中的作用机制,并识别关键调控基因作为潜在生物标志物 | IgA肾病(IgAN)患者及相关遗传和转录组数据 | 生物信息学 | 肾脏疾病 | GWAS, SMR, 贝叶斯共定位, scRNA-seq, 分子对接, 分子动力学模拟 | NA | 遗传数据, 转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2377 | 2026-02-13 |
T-cell exhaustion indicator characterizes the tumor microenvironment landscape and predicts colon adenocarcinoma prognosis via integrating single-cell RNA-seq and bulk RNA-sequencing
2026-Jan-14, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-15535-5
PMID:41530714
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA-seq和bulk RNA测序数据,构建了一个基于T细胞耗竭相关基因的预后模型,用于预测结肠腺癌患者的生存和治疗反应,并验证了FAT4基因在COAD细胞中的功能作用 | 首次整合单细胞和bulk RNA测序数据,构建了基于T细胞耗竭相关基因的预后特征,并验证了FAT4基因在COAD中的调控作用 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,需要进一步的前瞻性临床研究验证 | 阐明T细胞耗竭与结肠腺癌预后的关系,并开发预后预测模型 | 结肠腺癌患者和COAD细胞系 | 生物信息学 | 结肠癌 | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, 流式细胞术, RT-qPCR | GSVA, 单变量Cox, LASSO, 随机森林 | 转录组数据 | 来自TCGA和GEO数据库(GSE103479, GSE17536)的结肠腺癌患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2378 | 2026-01-16 |
stRGAT: identifying spatial domains in spatial transcriptomics via a relational graph attention network
2026-Jan-14, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07676-9
PMID:41535938
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2379 | 2026-02-13 |
A novel anoikis resistance-associated gene model for prognostic prediction and immune microenvironment characterization in lung squamous cell carcinoma
2026-Jan-13, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04395-5
PMID:41530460
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研究论文 | 本研究构建了一个基于失巢凋亡抵抗相关基因的预后模型,用于预测肺鳞状细胞癌患者的生存结果并表征肿瘤免疫微环境 | 首次在肺鳞状细胞癌中构建并验证了一个基于失巢凋亡抵抗相关基因的预后模型,揭示了该模型与肿瘤免疫微环境特征及免疫治疗反应性的关联 | 研究主要基于回顾性队列数据,需要前瞻性临床研究进一步验证模型的预测效能和临床实用性 | 开发一个能够预测肺鳞状细胞癌患者预后并指导精准免疫治疗的基因模型 | 肺鳞状细胞癌患者及其肿瘤组织样本 | 生物信息学 | 肺癌 | 单细胞转录组学、通路富集分析、LASSO回归、Cox比例风险分析 | 预后风险评分模型 | 基因表达数据、临床数据 | 内部验证队列(TCGA-LUSC)和外部验证队列(GSE73403、GSE74777) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2380 | 2026-02-13 |
NR4A1 limits CD8+ T Cell effector responses and protection in tuberculosis
2026-Jan-13, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-8363336/v1
PMID:41646403
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研究论文 | 本研究通过小鼠、猕猴和人类数据验证,发现核受体NR4A1是结核病中CD8 T细胞免疫的关键抑制因子,并揭示了NR4A1-NKG7轴作为新的宿主导向治疗靶点 | 首次将NR4A1鉴定为结核病中CD8 T细胞免疫的负调控因子,并通过空间分析、ChIP-qPCR和药理学抑制验证了其作用机制 | 研究主要基于动物模型和体外实验,人类数据验证可能有限,且药理学抑制的长期效果和安全性未充分评估 | 探究NR4A1在结核病感染期间对CD8 T细胞效应功能和免疫保护的调控作用 | 小鼠、猕猴和人类数据集中的CD8 T细胞 | 免疫学 | 结核病 | 单细胞RNA测序、空间分析、ChIP-qPCR、药理学抑制 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据 | 涉及小鼠、猕猴和人类数据集,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |