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当前共找到 9441 篇文献，本页显示第 2361 - 2380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2361 | 2026-08-20 |
Identifying head and neck squamous cell carcinoma: HPV-associated signature by integrating bulk and single-cell sequencing data
2026-Aug-14, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000050218
PMID:42601707
|
研究论文 | 通过整合 bulk 和单细胞测序数据，利用 Scissor 算法构建了预测头颈部鳞状细胞癌 HPV 状态的评分模型 | 首次结合 Scissor 算法与 bulk 和单细胞测序数据，构建了基于 43 个特异表达基因的 HPV 状态预测模型，其准确性优于大多数现有生物标志物 | 未明确提及局限性 | 构建一个能准确预测头颈部鳞状细胞癌患者 HPV 状态的模型 | 头颈部鳞状细胞癌患者的 bulk 和单细胞测序数据 | 机器学习 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞测序、bulk 测序 | Scissor 算法、基因集变异分析 | 测序数据 | 未明确提及具体样本数量，但包括发现集和验证集 | NA | 单细胞 RNA 测序、bulk RNA 测序 | NA | NA |
| 2362 | 2026-08-20 |
Prognostic Modeling of Ovarian Cancer Based on Perioperative Anesthesia-Related Drug Target Genes: A Bioinformatics Approach
2026-Aug-14, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/72629
PMID:42611564
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研究论文 | 本研究基于围手术期麻醉相关药物靶基因开发卵巢癌预后模型，并整合多组学数据评估其临床意义 | 首次基于围手术期麻醉相关药物靶基因构建卵巢癌预后特征，并整合多组学数据及构建列线图以提升预后性能 | 未明确提及，但可能包括样本量有限及模型需进一步前瞻性验证 | 开发基于PARDTGs的卵巢癌预后模型，并探讨其在风险分层和免疫治疗反应预测中的价值 | 卵巢癌患者（基于TCGA-OV及三个外部验证队列） | 生物信息学 | 卵巢癌 | 多组学整合（bulk转录组、单细胞RNA测序、空间转录组） | Cox比例风险模型（stepAIC） | 转录组数据、单细胞RNA-seq数据、空间转录组数据 | TCGA-OV及GSE26193、GSE30161、GSE63885（具体样本数未提供） | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组 | NA | NA |
| 2363 | 2026-08-20 |
scOPE identifies which driver-associated expression programs transfer from bulk tumors to single cells
2026-Aug-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.07.24.740598
PMID:42539254
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研究论文 | 提出scOPE方法，学习源自肿瘤组织的驱动基因相关表达程序并将其迁移至单细胞转录组，并评估其迁移能力和适用条件 | 首次系统性评估驱动基因相关表达程序从实体瘤到单细胞数据的迁移选择性，并提出一种无金标准的置信度评分来指示迁移程序的可靠性 | 无法直接判定等位基因变异，仅恢复连续、突变相关的转录特征，且多数可评估的驱动基因模型未能达到预定的高AUROC阈值 | 开发从批量肿瘤转录组学习癌症特异、驱动基因相关的表达程序并迁移到单细胞数据的方法，以在缺乏变异信息时辅助读取细胞状态 | 来自七种恶性肿瘤的158个驱动基因-癌症配对模型，以及AML、胶质母细胞瘤、胰腺癌等数据 | 单细胞组学及计算生物学 | 急性髓系白血病、胶质母细胞瘤、胰腺癌等恶性肿瘤 | scRNA-seq、CNV推断、批量RNA-seq | 机器学习模型，涉及预测器和置信度评分方法 | 单细胞转录组数据、批量肿瘤转录组数据、患者突变注释 | 158个驱动基因-癌症配对模型，涉及12个可评估的AML驱动基因，包含多个患者样本 | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 2364 | 2026-08-20 |
CCL4 as a Potential Immune-Metabolic Biomarker in Acute Myocardial Infarction via Machine Learning and Single-Cell Transcriptomics
2026-Aug-11, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/72480
PMID:42611748
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研究论文 | 通过整合批量与单细胞转录组数据及机器学习方法，识别与急性心肌梗死相关的钙调节蛋白基因，并探索其免疫代谢特征，提出CCL4作为潜在诊断生物标志物 | 首次结合批量与单细胞转录组数据及多种机器学习算法筛选出与AMI相关的六个关键钙调节蛋白基因，并特别指出CCL4在T和NK细胞中的表达显著降低，作为潜在诊断标志物 | 研究基于公开数据集和局部队列验证，样本量有限，且功能验证仅通过qPCR，缺乏蛋白水平和功能实验的深入验证 | 识别急性心肌梗死相关的钙调节蛋白基因，并探索其免疫代谢特征，以发现新的补充性生物标志物 | 急性心肌梗死样本中的钙调节蛋白相关基因及其在免疫细胞中的表达模式 | 机器学习 | 心血管疾病 | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序, qPCR | 机器学习算法（具体未提及，但包括多种算法） | 转录组数据 | 未明确提及样本数量，但包括多个独立数据集和一个局部队列 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2365 | 2026-08-20 |
S100P as a Shared Biomarker in Inflammatory Bowel Disease, Colorectal Cancer, and Pancreatic Adenocarcinoma: An Integrated Transcriptomic Analysis
2026-Aug-11, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/71735
PMID:42611775
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研究论文 | 通过整合转录组分析，识别炎症性肠病、结直肠癌和胰腺导管腺癌共有的生物标志物S100P，并验证其与免疫相关特征 | 首次通过多疾病整合转录组分析，发现S100P作为三种疾病共有的生物标志物，并阐明了其与免疫细胞浸润和炎症通路的关系 | 研究主要基于公共数据库的转录组数据，实验验证仅限于体外细胞模型，缺乏体内实验和临床样本的进一步验证 | 识别炎症性肠病、结直肠癌和胰腺导管腺癌共有的分子特征和生物标志物，探索其共享的生物学通路 | 炎症性肠病、结直肠癌和胰腺导管腺癌的基因表达数据集，以及脂多糖刺激的结肠上皮细胞 | 机器学习 | 炎症性肠病、结直肠癌、胰腺导管腺癌 | 转录组分析、加权基因共表达网络分析、差异表达分析、单细胞RNA测序 | 加权基因共表达网络分析模型 | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | 共使用162个疾病相关基因，涉及多个公共数据集样本，具体数量未在标题和摘要中提供 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2366 | 2026-08-20 |
Loom: Multi-Region Analysis of Spatial Transcriptomics with Local Neighborhoods and Global Trajectories
2026-Aug-08, ArXiv
PMID:42539149
|
研究论文 | 介绍了Loom，一个空间转录组学可视化计算系统，用于分析伪时间轨迹、跨样本比较和局部微环境中的空间结构过程 | 结合新型字形和计算后端，支持局部微环境的详细伪时间探索、跨样本比较以及时空生物机制研究 | 摘要中未提及明确的局限性 | 支持空间转录组学数据的伪时间轨迹分析、样本间比较和局部微环境研究 | 空间转录组学数据，包括组织病理学和肿瘤学专家使用的案例 | 可视化计算 | 未指明 | 空间转录组学 | 未指明 | 空间转录组学数据 | 未指明 | 未指明 | 空间转录组学 | 未指明 | 未指明 |
| 2367 | 2026-08-20 |
Endoplasmic Reticulum Stress-Related Immune Signature in Atrial Fibrillation: Machine Learning and Single-Cell Transcriptomics
2026-Aug-07, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/71532
PMID:42611890
|
研究论文 | 本研究描述了一个可重复的计算流程，通过整合批量转录组学、机器学习、免疫浸润分析和单细胞转录组学，识别心房颤动中内质网应激相关的基因特征。 | 创新性地整合了多种机器学习算法与单细胞转录组学，构建了内质网应激相关基因模型，并利用SHAP分析识别关键基因，将基因特征映射到单核细胞-巨噬细胞谱系，揭示了其在房颤免疫重塑中的潜在作用。 | 未明确提及局限性，但可能包括依赖公共数据集、样本量有限、模型泛化性需进一步验证。 | 识别心房颤动中内质网应激相关的基因特征，并阐明其与免疫细胞群体的关联。 | 心房颤动患者及对照的批量转录组和单细胞转录组数据。 | 生物信息学、机器学习 | 心房颤动 | 转录组测序，单细胞转录组，批量转录组 | 弹性网络（Enet）、机器学习模型 | 基因表达数据 | 使用多个公开数据集，包括训练集和验证集（GSE115574、GSE14975），具体样本数未在摘要中提及。 | NA | 批量RNA-seq、单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2368 | 2026-08-20 |
CD177+ neutrophils drive extracellular matrix remodelling and HGF-alpha release in ALPPS-induced liver regeneration
2026-Aug-06, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2025-336300
PMID:41390175
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和空间转录组学揭示了ALPPS术后肝脏再生中CD177+中性粒细胞通过促进细胞外基质重塑和HGF-α释放驱动再生的免疫机制 | 首次在ALPPS患者和动物模型中阐明CD177+中性粒细胞通过CD177-PECAM1相互作用促进内皮迁移、通过MMP9介导ECM降解和HGF-α释放来驱动肝脏再生的具体机制，并验证了CD177+中性粒细胞输注的治疗潜力 | 研究主要基于观察性和功能验证实验，尚未在大型多中心临床试验中验证CD177+中性粒细胞输注的疗效和安全性 | 阐明ALPPS术后肝脏再生过程中免疫系统的变化及中性粒细胞介导的再生机制 | ALPPS患者残余肝组织、小鼠ALPPS模型中的中性粒细胞亚群及相关细胞 | 数字病理学 | 肝脏疾病 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、流式细胞术、组织学分析、基因敲除 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据、图像数据 | 世界最大ALPPS临床队列及小鼠模型，具体样本数量未在摘要中提供 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 10x Chromium、10x Visium | 10x Chromium单细胞3'转录组和10x Visium空间转录组平台 |
| 2369 | 2026-08-20 |
Targeting cancer stem cells enhances multikinase inhibitor therapy in metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease-related hepatocellular carcinoma
2026-Aug-06, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2025-336527
PMID:41448879
|
研究论文 | 本研究旨在表征代谢功能障碍相关脂肪肝病相关肝细胞癌（MASLD-HCC）中的癌症干细胞（CSCs），并探讨其在肿瘤发生和治疗反应中的作用，提出了靶向CD133联合多激酶抑制剂的新型治疗策略。 | 首次在MASLD-HCC中系统表征CD133+ CSCs，揭示其通过CD133-MYH9/β-catenin轴促进肿瘤发生的机制，并开发了CD133靶向siRNA纳米颗粒增强多激酶抑制剂疗效的新策略。 | 摘要未提及具体限制，但可能包括样本量有限、临床转化尚需验证等。 | 阐明MASLD-HCC中癌症干细胞的特性及其对肿瘤发生和治疗反应的影响，并评估靶向CD133的治疗潜力。 | 人类MASLD-HCC肿瘤及邻近正常组织样本（29对），以及小鼠模型中的CD133+细胞。 | 癌症研究 | 代谢功能障碍相关脂肪肝病相关肝细胞癌 | 表达谱分析、单细胞RNA测序、体内遗传谱系追踪、质谱分析、siRNA纳米颗粒递送 | 小鼠模型（肝细胞特异性CD133过表达模型） | 基因表达数据、单细胞转录组数据、蛋白质相互作用数据 | 29对人类肿瘤及邻近正常组织样本，以及多种小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序、质谱分析 | NA | NA |
| 2370 | 2026-08-20 |
A tolerogenic mRNA-LNP vaccine alleviates neuroinflammation and demyelination in experimental autoimmune encephalomyelitis
2026-Aug-05, Science bulletin
IF:18.8Q1
DOI:10.1016/j.scib.2026.08.017
PMID:42613282
|
研究论文 | 开发了一种编码三种髓鞘抗原表位串联融合的mRNA-LNP疫苗，在实验性自身免疫性脑脊髓炎中减轻神经炎症和脱髓鞘 | 首次将mRNA-LNP疫苗用于多发性硬化的抗原特异性耐受诱导，并通过单细胞转录组学揭示其重塑微环境的机制 | 主要基于小鼠EAE模型，需要进一步验证在人类MS中的安全性和有效性 | 开发并评估一种抗原特异性mRNA-LNP疫苗对多发性硬化的治疗效果及其免疫机制 | 实验性自身免疫性脑脊髓炎小鼠模型的脊髓组织 | 数字病理学 | 多发性硬化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3' |
| 2371 | 2026-08-20 |
Single-cell analysis reveals a LAMB3-dependent immunosuppressive environment in gallbladder neck/cystic duct carcinoma
2026-Aug, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2026.101860
PMID:42002036
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析，揭示了胆囊颈/胆囊管癌中LAMB3依赖的免疫抑制微环境，并与胆囊底/体癌的免疫活化微环境进行了对比 | 首次在单细胞水平上系统描绘了起源于胆囊颈/胆囊管的胆囊癌（GBCN/CD）与胆囊底/体癌（GBCF/B）之间的肿瘤微环境异质性，并鉴定LAMB3+肿瘤细胞作为GBCN/CD中的核心免疫调节因子，驱动巨噬细胞浸润和T细胞功能障碍，提出LAMB3可作为GBCN/CD的潜在治疗靶点 | 结论主要基于单细胞转录组和功能实验，尚需进一步的体内外验证及临床前瞻性研究来确认LAMB3靶向治疗的有效性和安全性 | 探讨胆囊癌不同发生部位（胆囊底/体 vs 颈/胆囊管）的肿瘤微环境差异及其分子机制，为部位特异性精准治疗策略提供依据 | 569,736个细胞，来源于38例胆囊底/体癌（GBCF/B）和17例胆囊颈/胆囊管癌（GBCN/CD）样本 | 单细胞转录组学 | 胆囊癌 | 单细胞转录组测序、全外显子测序、单细胞T细胞受体测序、空间转录组学、多重免疫组化 | NA | 单细胞基因表达数据、外显子测序数据、空间转录组数据、免疫组化图像 | 55个胆囊癌样本（38例GBCF/B和17例GBCN/CD），包括569,736个细胞 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序、单细胞T细胞受体测序、空间转录组学、全外显子测序 | 10x Chromium, 10x Visium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium单细胞3'转录组测序、10x Visium空间转录组、Illumina NovaSeq全外显子测序 |
| 2372 | 2026-08-20 |
Recapitulation of bile acid metabolism in hepatobiliary organoids derived from hiPSC
2026-Aug, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2026.101884
PMID:42092618
|
研究论文 | 本研究开发了一种源于人类诱导多能干细胞（hiPSC）的胆酸肝胆类器官（BA-HBOs），这些类器官能够复现胆汁酸代谢的关键方面，为肝脏疾病研究和药物筛选提供了更接近生理和病理状态的平台。 | 该研究首次通过优化成熟方案（加入柴胡皂苷A）和转化生长因子-β处理，生成胆酸肝胆类器官，并利用单细胞RNA测序和代谢组学验证了其转录和代谢组特征，成功复现了胆汁酸代谢、肝细胞分区及纤维化相关功能异常。 | 摘要未明确提及相关限制。 | 生成能够复现人类肝脏胆汁酸代谢的hiPSC来源胆酸肝胆类器官，用于研究肝病机制和药物筛选。 | 人类诱导多能干细胞来源的胆酸肝胆类器官（BA-HBOs）及纤维化类器官（FiBA-HBOs）。 | 数字病理学 | 肝脏疾病 | 单细胞RNA测序，液相色谱-质谱联用代谢组学 | 类器官模型 | 基因表达数据，代谢组学数据 | 至少3个独立样本（n ≥ 3） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2373 | 2026-08-20 |
SKIM: A fast sketching strategy integrated with model's dynamic-feedback for large-scale single-cell transcriptomic analysis
2026-Aug, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1014638
PMID:42574452
|
研究论文 | 提出了一种结合模型动态反馈的快速草图策略SKIM，用于大规模单细胞转录组分析，以提高数据缩减效率并保留关键生物信号。 | 首次将模型训练过程中的动态反馈（重建损失序列）用于草图选择，提供多尺度视图，并识别和移除异常细胞，优于现有几何距离方法。 | 未明确讨论对极端异质性数据或超高维特征的适应性，且依赖训练过程可能增加计算开销。 | 开发一种高效且准确的大规模单细胞转录组数据集草图方法，以平衡计算负担和生物信息保留。 | 单细胞RNA测序数据（scRNA-seq）中的细胞子集。 | 机器学习 | NA | scRNA-seq | 自编码器（基于训练损失动态反馈） | 单细胞转录组表达谱（数值矩阵） | 九个基准数据集，包含216,611个细胞（用于10%草图生成）。 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2374 | 2026-08-20 |
scKanFormer: A Transformer-KAN framework with biologically informed attention for cell type annotation in large-scale scRNA-seq data
2026-Aug, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1014607
PMID:42599963
|
研究论文 | 提出了一种基于Transformer-KAN框架的监督方法scKanFormer，用于大规模单细胞RNA测序数据的细胞类型注释，结合生物信息注意力机制以提高准确性和可解释性。 | 采用Transformer框架避免降维，实现从注意力层到原始输入特征的追溯；集成生物信息、局部与全局注意力机制以及KAN网络，增强细胞特征识别和解释；结合CNN与Transformer以减轻批次效应。 | 文中未明确提及局限性。 | 解决scRNA-seq数据中细胞类型注释面临的批次效应和大规模数据处理问题，提高注释的准确性、鲁棒性和可解释性。 | 大规模多类别scRNA-seq数据中的细胞。 | 自然语言处理、机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | Transformer、KAN、CNN、注意力机制 | 基因表达数据 | 基准数据集（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2375 | 2026-08-20 |
A single-cell transcriptomic atlas reveals the emergence of medusa-specific cell states in the scyphozoan Aurelia coerulea
2026-Aug, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3003931
PMID:42599956
|
研究论文 | 本研究提供了海月水母的单细胞转录组图谱，揭示了从水螅体到水母阶段转变过程中细胞类型多样性的增加和特定细胞状态的出现 | 首次构建了钵水母纲海月水母的单细胞转录组图谱，并揭示了神经和肌肉细胞谱系的进化保守性及基因复制在细胞复杂性增加中的作用 | 未提及 | 研究钵水母纲海月水母从水螅体到水母阶段转变过程中细胞类型组成的变化及其分子机制 | 海月水母（Aurelia coerulea）的细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 海月水母的细胞（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2376 | 2026-08-20 |
Alterations in chromatin organization promote totipotent-like features in a DPPA2/DUX-dependent manner
2026-Aug, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-026-00853-6
PMID:42426342
|
研究论文 | 本文揭示了染色质组织结构改变通过依赖于DPPA2/DUX轴的方式促进小鼠胚胎干细胞向具有全能性特征的2细胞样细胞转化 | 首次证明CTCF和WAPL的耗竭通过破坏高级染色质组织结构来诱导2CLC重编程，而非CTCF的特异性功能，并鉴定ARID3A为调控因子，且发现该过程依赖于DPPA2/DUX轴和核仁完整性 | 人类ESC中WAPL或CTCF耗竭诱导的转录变化不类似于早期人类胚胎发生的转录程序，提示进化保守性有限 | 探究染色质高级组织结构破坏是否及如何促进小鼠胚胎干细胞向2细胞样细胞（全能性状态）的重编程 | 小鼠胚胎干细胞（ESC）和人类胚胎干细胞（hESC） | 表观遗传学、基因组学 | NA | 单细胞RNA-seq、单细胞ATAC-seq | NA | 基因表达数据、染色质可及性数据 | 小鼠ESC（CTCF/WAPL耗竭及对照）和人类ESC（WAPL或CTCF耗竭） | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq、单细胞ATAC-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 和 ATAC-seq 试剂盒 |
| 2377 | 2026-08-20 |
CDK8 remodels the tumor microenvironment and promotes resistance to KRASG12D inhibitors and daraxonrasib in PDAC
2026-Aug, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-026-00854-5
PMID:42436354
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研究论文 | 本研究通过整合空间转录组学、单细胞RNA测序和CODEX空间蛋白组学分析，揭示了CDK8通过重塑肿瘤微环境促进PDAC对KRASG12D抑制剂和daraxonrasib的耐药性。 | 首次发现CDK8通过诱导CXCL2趋化因子分泌、抑制FAS表达及重塑肿瘤微环境导致PDAC对KRAS抑制剂的获得性耐药，并证明靶向CDK8可克服耐药，为联合治疗提供新策略。 | 研究基于小鼠模型和PDX样本，人类患者中的验证尚有限；未深入探究CDK8调控免疫逃逸的完整分子机制。 | 阐明PDAC中肿瘤微环境对KRAS抑制剂疗效持续性的贡献及耐药机制，寻找克服耐药的靶点。 | PDAC小鼠模型、PDX肿瘤样本及KRAS突变的肿瘤细胞和免疫细胞。 | 数字病理学 | 胰腺导管腺癌 | 空间转录组学、单细胞RNA测序、CODEX空间蛋白组学 | NA | 空间转录组数据、单细胞转录组数据、空间蛋白组数据 | NA | 10x Genomics, Akoya Biosciences | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 空间蛋白组学 | 10x Visium, 10x Chromium, CODEX | 10x Visium空间转录组, 10x Chromium单细胞RNA测序, CODEX空间蛋白组分析 |
| 2378 | 2026-08-20 |
A Reproducible Seurat-Based Protocol for Single-Cell RNA Sequencing Analysis of Peripheral Blood Mononuclear Cell CD4+ T Cells During Malaria Reinfection
2026-Jul-31, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/70858
PMID:42612107
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研究论文 | 本文介绍了一种基于Seurat的可重复协议，用于分析疟疾再感染过程中外周血单核细胞CD4+ T细胞的单细胞RNA测序数据。 | 提供了一个统一的计算框架，整合了标准化预处理、整合、聚类和下游转录组分析，并针对疟疾再感染时间点进行了优化。 | 未提及明确的局限性。 | 开发可重复的Seurat协议，以分析疟疾再感染期间CD4+ T细胞的单细胞RNA测序数据，揭示动态转录变化。 | 外周血单核细胞中的CD4+ T细胞，使用两个代表性公开数据集（GSE233703和GSE233713）进行验证。 | 生物信息学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | Seurat工作流 | 单细胞转录组数据 | 两个公开数据集，具体样本数量未提及。 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2379 | 2026-08-20 |
GNAS drives gastric cancer progression via pyrimidine metabolic reprogramming and immune-microenvironment remodeling
2026-Jul-28, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-026-02412-0
PMID:42517951
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研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序、空间转录组和批量RNA测序数据，揭示了GNAS通过嘧啶代谢重编程和免疫微环境重塑驱动胃癌进展的机制 | 首次鉴定GNAS为胃癌嘧啶代谢重编程的核心代谢枢纽基因，并阐明其通过ATF3-JUN-ETS1转录网络调控肿瘤恶性表型及空间协调肿瘤微环境重塑的新机制 | 研究主要依赖细胞系和异种移植模型，缺乏临床样本的进一步验证；嘧啶代谢干预策略的临床转化仍需更多研究 | 阐明胃癌中嘧啶代谢重编程的核心分子决定因素及其对肿瘤微环境的影响，并探索靶向治疗策略 | 胃癌恶性上皮细胞、癌症相关成纤维细胞、胃癌细胞系及异种移植模型 | 基因组学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、批量RNA测序、假时间分析、药理学干预 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据、图像数据 | 未明确样本数量，涉及胃癌细胞系和异种移植模型 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学、批量RNA测序 | NA | NA |
| 2380 | 2026-08-20 |
Periductal Fibroblast Density Defines Lymphocyte Exclusion via a CD44-Dependent Stromal Checkpoint in Pancreatic Cancer
2026-Jul-24, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-25-1481
PMID:42497294
|
研究论文 | 本研究通过分析胰腺导管腺癌样本，揭示了癌相关成纤维细胞分层的导管空间结构是免疫排斥的关键决定因素，并发现了CD44依赖性基质检查点。 | 首次将恶性胰腺导管上皮导管区域作为关键空间单位，结合成像质谱流式、多重免疫组化和单细胞RNA测序，建立成纤维细胞密度与免疫细胞定位之间的直接联系，并识别出CD44作为可靶向的基质检查点。 | 摘要未提及明确局限性。 | 阐明胰腺导管腺癌中纤维化如何影响导管空间结构和免疫细胞定位，并探索克服免疫排斥的策略。 | 胰腺导管腺癌患者样本中的恶性导管区域、癌相关成纤维细胞和白细胞。 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 成像质谱流式、多重免疫组化、单细胞RNA测序 | NA | 图像和转录组数据 | 三个独立队列的治疗初治患者样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间蛋白组学 | NA | 成像质谱流式、多重免疫组化和单细胞RNA测序平台的具体配置未在摘要中说明 |