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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2301 | 2026-04-02 |
Gut Microbiome, Immune Cells, and Heart Failure: A Multi-Omics Mendelian Randomization Study
2026-Jan-23, Cardiology
IF:1.9Q3
DOI:10.1159/000550655
PMID:41915616
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研究论文 | 本研究通过多组学孟德尔随机化分析,探讨了肠道微生物组通过免疫细胞对心力衰竭的因果影响 | 首次结合肠道微生物组、免疫细胞和心力衰竭的GWAS数据,利用单细胞RNA测序和单核RNA测序技术,通过eQTL孟德尔随机化分析揭示微生物与免疫互作在心力衰竭中的因果机制 | 研究依赖于公开的GWAS摘要数据,可能受限于样本异质性和潜在混杂因素,且因果推断基于遗传工具变量,需实验验证 | 探究肠道微生物组通过免疫调节对心力衰竭发病的因果关系 | 肠道微生物分类群、免疫细胞(如CD4+T细胞、NK/T细胞)和心力衰竭患者及健康对照 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 全基因组关联研究(GWAS)、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、单核RNA测序(snRNA-seq)、表达数量性状位点(eQTL)分析 | 孟德尔随机化(MR)模型 | 遗传摘要数据、单细胞转录组数据 | 基于公开GWAS和单细胞测序数据,具体样本数未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | NA | NA |
| 2302 | 2026-04-02 |
Loss of HOXA10 activates NLRP3 for epithelial plasticity and pyroptosis in endometrium during embryo implantation
2026-01-15, Reproduction (Cambridge, England)
DOI:10.1093/reprod/xaaf007
PMID:41575153
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研究论文 | 本研究揭示了转录因子HOXA10通过抑制NLRP3来维持子宫内膜上皮细胞特性,其下调会激活NLRP3介导的炎症小体形成和细胞焦亡,从而为胚胎植入创造条件的分子机制 | 首次发现HOXA10通过直接调控NLRP3表达来控制胚胎植入过程中的上皮重塑,并阐明了NLRP3在诱导上皮可塑性(pEMT)和细胞焦亡中的双重功能 | 研究主要基于小鼠模型,在人类子宫内膜中的验证尚需进一步研究;NLRP3抑制剂MCC950的具体作用机制和长期影响有待深入探索 | 探究胚胎植入过程中子宫内膜上皮细胞重塑的分子调控机制 | 小鼠子宫内膜(特别是腔上皮细胞) | 生殖生物学/发育生物学 | 生殖系统疾病(胚胎植入相关) | CUT&RUN测序,单细胞RNA-seq,免疫染色 | NA | 基因组学数据,转录组数据,图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2303 | 2026-04-02 |
Single-cell transcriptome sequencing reveals hepatocyte heterogeneity in response to radiation-induced liver injury and regeneration
2026-01, Radiotherapy and oncology : journal of the European Society for Therapeutic Radiology and Oncology
IF:4.9Q1
DOI:10.1016/j.radonc.2025.111225
PMID:41429723
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了辐射诱导肝损伤后肝细胞的异质性反应与再生机制 | 首次在辐射诱导肝损伤模型中,结合单细胞和单核RNA测序以及蛋白质组学分析,系统描绘了肝细胞亚群在空间和时间上的动态响应,并验证了人类肝组织中的保守通路激活 | 研究主要基于大鼠模型,人类样本验证有限;未深入探讨长期再生效果或临床转化潜力 | 阐明辐射诱导肝损伤的分子机制及肝细胞再生过程 | 大鼠肝细胞及人类肝组织 | 数字病理学 | 肝损伤 | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 蛋白质组学分析 | NA | 转录组数据, 蛋白质组数据 | 大鼠模型及人类肝组织样本(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | NA | NA |
| 2304 | 2026-04-02 |
Integrated transcriptome and single-cell sequencing analysis identify blood-pancreas shared lncRNA biomarkers in new-onset T2DM
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0345359
PMID:41915667
|
研究论文 | 本研究通过整合转录组测序和单细胞RNA测序,识别了初发2型糖尿病患者血液与胰腺共享的lncRNA作为早期生物标志物 | 首次整合外周血转录组与胰岛单细胞测序数据,识别血液与胰腺共享的lncRNA作为T2DM早期系统性生物标志物 | 样本量相对较小,且为横断面研究,需进一步纵向验证 | 识别初发2型糖尿病患者血液与胰腺共享的lncRNA作为早期生物标志物 | 初发2型糖尿病患者的外周血样本和胰岛组织 | 生物信息学 | 2型糖尿病 | 转录组测序, 单细胞RNA测序 | 加权基因共表达网络分析 | RNA-seq数据 | 初始队列:8名T2DM患者和8名对照;单细胞队列:17名T2DM供体;验证队列:85名T2DM患者和85名对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2305 | 2026-04-02 |
Single-Cell/Nucleus RNA-Sequencing for Phytohormone Signaling in Plants
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-5214-5_10
PMID:41917663
|
综述 | 本文详细介绍了单细胞/单核RNA测序技术在植物激素信号研究中的应用方法 | 利用scRNA-seq和snRNA-seq技术,在转录组水平实现细胞异质性的高分辨率映射,为植物激素信号研究提供了新方法 | NA | 研究植物激素信号传导的基因调控网络 | 植物细胞 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq | NA | NA |
| 2306 | 2026-04-02 |
Single-Cell Transcriptomics in Arabidopsis in Response to Salicylic Acid and Jasmonic Acid
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-5214-5_11
PMID:41917664
|
研究论文 | 本文提供了针对拟南芥水杨酸和茉莉酸响应的单细胞核RNA测序实验方案及生物信息学分析流程 | 开发了针对植物激素处理的单细胞核RNA测序端到端实验方案,并结合计算流程实现细胞类型分辨的激素免疫响应解析 | NA | 解析水杨酸和茉莉酸在植物免疫中的细胞类型特异性响应机制 | 拟南芥 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞核RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2307 | 2026-04-02 |
Stereo-Seq Transcriptomics in Arabidopsis Leaves in Response to Salicylic Acid
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-5214-5_12
PMID:41917665
|
研究论文 | 本文描述了一个完整的Stereo-seq工作流程,用于研究拟南芥叶片在响应水杨酸处理时的空间转录组变化 | 首次将Stereo-seq技术应用于拟南芥叶片响应水杨酸的空间转录组研究,并提供了从样本制备到数据分析的完整工作流程 | 未明确说明样本数量,且工作流程可能受特定平台限制 | 研究拟南芥叶片在响应水杨酸处理时的空间转录组变化 | 拟南芥叶片 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | STOmics, MGI | 空间转录组学 | STOmics V1.3 1 × 1 cm芯片, DNBSEQ平台 | STOmics V1.3 1 × 1 cm芯片用于文库构建,DNBSEQ平台用于测序 |
| 2308 | 2026-04-02 |
APOE and CCR2: Potential Macrophage-Specific Biomarkers in the Rheumatoid Arthritis Synovial Microenvironment Identified by Bioinformatics and Experimental Verification in Murine Models
2026, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S587712
PMID:41918589
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证,在类风湿关节炎滑膜微环境中识别出APOE和CCR2作为潜在的巨噬细胞特异性生物标志物 | 结合批量与单细胞RNA-seq数据,识别出在滑膜巨噬细胞中特异性高表达并与炎症反应相关的枢纽基因APOE和CCR2,并通过实验验证了其表达调控 | 需要进一步研究以阐明APOE和CCR2在类风湿关节炎中的具体作用机制 | 识别类风湿关节炎中巨噬细胞特异性的枢纽基因并研究其生物学功能 | 类风湿关节炎患者的滑膜组织及小鼠RAW264.7细胞系 | 生物信息学 | 类风湿关节炎 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, RT-qPCR, ELISA, 免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据, 单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 2309 | 2026-04-02 |
Editorial: Unraveling breast cancer complexity: insights from single-cell sequencing and spatial transcriptomics
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1816191
PMID:41918756
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2310 | 2026-04-02 |
Identification of a GPR182-postive stem cell population that drives polyp progression in familial adenomatous polyposis
2026, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.20704
PMID:41918858
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量转录组数据分析,识别了家族性腺瘤性息肉病中驱动息肉异质性的关键细胞亚群——GPR182阳性息肉干细胞 | 首次在家族性腺瘤性息肉病中鉴定出GPR182阳性息肉干细胞,并揭示其在驱动息肉异质性、免疫逃逸及预后和药物反应预测中的关键作用 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据分析,缺乏前瞻性临床验证,且功能验证实验可能有限 | 解析家族性腺瘤性息肉病中息肉进展的异质性,以识别新的治疗靶点和生物标志物 | 家族性腺瘤性息肉病患者的单细胞和批量转录组数据 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞测序,批量转录组测序 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | 涉及多个公共数据集(GSE109308等),具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 2311 | 2026-04-02 |
Elevated growth differentiation factor-15 in sepsis: clinical associations and immune cell context
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1789747
PMID:41918885
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研究论文 | 本研究探讨了脓毒症患者血清中生长分化因子-15(GDF-15)水平的升高情况,及其与疾病严重程度、器官功能障碍和炎症活动的关联,并利用单细胞RNA测序数据分析了GDF15在免疫细胞中的表达模式 | 首次在脓毒症中结合临床血清GDF-15测量与公开的单细胞转录组数据,系统描述了GDF-15与疾病严重程度的关联及其在特定免疫细胞(浆细胞和单核细胞)中的表达富集,为理解其在危重疾病中的生物学背景提供了新见解 | 研究样本量较小(脓毒症患者n=19,健康对照n=23),为探索性观察研究,需要更大规模、特征明确的队列进行验证 | 阐明脓毒症中GDF-15的临床关联及其在免疫细胞中的表达背景,评估其作为反映系统生物应激的潜在生物标志物的价值 | 成人脓毒症患者和健康对照者的血清样本,以及公开的单细胞RNA测序数据集(GSE217906)中的免疫细胞 | NA | 脓毒症 | 酶联免疫吸附试验(ELISA),单细胞RNA测序数据分析 | NA | 血清蛋白浓度数据,单细胞转录组数据 | 临床队列:脓毒症患者19例,健康对照23例;生物信息学分析:公开数据集GSE217906 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2312 | 2026-04-02 |
Noninvasive assessment of core metastatic genes in lung adenocarcinoma: development of a predictive model integrating single-cell transcriptomics and radiomics
2026, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2026.1784914
PMID:41919253
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组学和CT影像组学,识别了肺腺癌转移的关键分子驱动基因,并开发了一个非侵入性的影像预测模型 | 创新性地结合单细胞RNA测序和CT影像组学来识别肺腺癌转移的核心基因并构建预测模型,实现了分子表型与影像特征的关联 | 研究基于公共数据库数据,可能需要进一步的前瞻性临床验证来确认模型的泛化能力 | 开发一个非侵入性的预测模型,用于评估肺腺癌的转移潜能和预后 | 肺腺癌(LUAD)患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、CT影像组学、免疫组织化学(IHC)、RT-qPCR | LASSO回归、影像组学模型 | 转录组数据、单细胞RNA测序数据、CT影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2313 | 2026-04-01 |
Integrative bulk and single-cell transcriptome analyses reveal RNA modification-related biomarkers of spinal cord injury
2026-Jul-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-25-00080
PMID:41914077
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2314 | 2026-04-01 |
LAMC3 promotes the development of prostate cancer via modulating the cell cycle progression
2026-May-15, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.116544
PMID:41864013
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研究论文 | 本研究探讨了LAMC3通过调节细胞周期进程促进前列腺癌发展的分子机制 | 首次建立并验证了与衰老相关分泌表型相关的基因特征,并揭示了LAMC3通过PI3K/Akt通路调控细胞周期的新机制 | 研究主要基于体外和动物实验,临床样本验证有限,且未深入探讨LAMC3在其他癌症类型中的作用 | 阐明LAMC3在前列腺癌发病机制中的具体作用及其作为治疗靶点的潜力 | 前列腺癌患者血清样本、良性前列腺增生对照样本以及前列腺癌细胞系 | 数字病理学 | 前列腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, CCK-8, 集落形成, EdU检测 | NA | RNA-seq数据, 单细胞RNA-seq数据, 实验数据 | 多个批量RNA-seq数据集和两个单细胞RNA-seq队列,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 2315 | 2026-04-01 |
Repurposing Azilsartan medoxomil attenuates periodontitis by targeting SERPINB9 to promote apoptosis of IL1B+ macrophages
2026-May-15, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.116523
PMID:41864017
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组数据和机器学习算法,发现SERPINB9是调控牙周炎中促炎性IL1B+巨噬细胞存活的关键因子,并筛选出阿齐沙坦酯作为其潜在抑制剂,在实验性牙周炎模型中验证了其治疗潜力 | 首次将SERPINB9鉴定为牙周炎中IL1B+巨噬细胞存活的关键调控因子,并通过药物重定位筛选发现阿齐沙坦酯可作为其抑制剂,为牙周炎提供了新的生物标志物和治疗靶点 | 研究主要基于实验性动物模型和体外验证,临床转化效果仍需进一步人体试验证实 | 探索牙周炎中巨噬细胞存活的分子机制,并寻找新的治疗靶点和药物 | 牙周炎中的巨噬细胞,特别是IL1B+巨噬细胞亚群 | 生物信息学与计算生物学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序,机器学习算法,药物重定位筛选 | 五种机器学习算法(未具体说明) | 单细胞转录组数据 | 多个来自GEO数据库的单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2316 | 2026-04-01 |
CD19 chimeric antigen receptor T-cell therapy for the treatment of a patient with refractory Burkitt lymphoma after kidney transplant
2026-May, Cytotherapy
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.jcyt.2026.102055
PMID:41762962
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研究论文 | 本文报告了一例肾移植后难治性伯基特淋巴瘤患者在接受CD19 CAR T细胞治疗后使用环孢素A的可行性研究 | 首次在肾移植后淋巴增殖性疾病患者中,结合CD19 CAR T细胞疗法与环孢素A使用,并通过单细胞RNA测序分析其影响 | 仅为单病例报告,样本量小,需要更大规模研究验证 | 评估CD19 CAR T细胞疗法后使用环孢素A降低移植排斥风险的可行性 | 肾移植后难治性伯基特淋巴瘤患者 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 1例患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2317 | 2026-04-01 |
Cytotoxic T cell recognition of α-synuclein drives pathogenic immune responses in multiple system atrophy
2026-Apr-07, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2537271123
PMID:41911451
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学、流式细胞术和抗原特异性功能实验,揭示了多系统萎缩(MSA)患者外周和中枢T细胞对α-突触核蛋白的细胞毒性识别,驱动了致病性免疫反应 | 首次证明MSA患者的外周T细胞被激活并偏向细胞毒性和炎症表型,且CD4和CD8 T细胞以HLA I/II依赖方式识别α-突触核蛋白单体及原纤维,导致克隆扩增和细胞毒性特征获得 | 研究主要基于患者样本和死后脑组织,未涉及动物模型验证,且样本量相对有限,需进一步扩大以确认普遍性 | 探究多系统萎缩(MSA)中适应性免疫机制,特别是T细胞对α-突触核蛋白的识别及其在神经炎症和疾病进展中的作用 | 多系统萎缩(MSA)患者、帕金森病(PD)患者和健康对照者的外周和中枢T细胞 | 免疫学 | 多系统萎缩 | 单细胞转录组学、流式细胞术、抗原特异性功能实验 | NA | 转录组数据、流式细胞数据、功能实验数据 | MSA患者、PD患者和健康对照者队列,具体样本数未明确 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2318 | 2026-04-01 |
Dissociable perfusion chip (DPC): perfusable microfluidic chip for single-cell screening of anti-cancer drugs in live glioblastoma explants
2026-Mar-31, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d5lc01105a
PMID:41778300
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研究论文 | 本研究介绍了一种可拆卸灌注芯片,用于在活体胶质母细胞瘤组织切片中进行单细胞水平的抗癌药物筛选 | 开发了一种新型微流控芯片,通过机械夹层而非化学附着的方式固定组织切片,实现了正压灌注和非破坏性组织解离,从而允许对厚组织切片进行并行培养、药物扰动以及下游单细胞RNA测序 | 这是一项概念验证工作,未来需要用于多种药物的筛选,并在更多新鲜人源胶质母细胞瘤切片上进行进一步验证 | 开发一种能够直接在人源肿瘤组织中快速、高分辨率地识别细胞类型特异性药物反应的新方法 | 人源胶质母细胞瘤手术切除的新鲜组织切片 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,微流控技术 | NA | 单细胞RNA测序数据,荧光测定数据 | 来自人类患者和小鼠模型的胶质母细胞瘤组织切片 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2319 | 2026-04-01 |
Human Papillomavirus (HPV) Infected Epithelial Cells and FBLN1+ Fibroreticular Cells Govern the Immunogenic Tumor Microenvironment in HPV-Associated Oropharyngeal Squamous Cell Carcinoma
2026-Mar-31, Clinical and experimental otorhinolaryngology
IF:2.9Q1
DOI:10.21053/ceo.2025-00282
PMID:41913707
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析,揭示了HPV相关口咽鳞状细胞癌中FBLN1+纤维网状细胞在塑造免疫原性肿瘤微环境中的关键作用 | 首次在HPV相关口咽鳞状细胞癌中鉴定出FBLN1+纤维网状细胞亚群,并通过空间定位分析揭示了其与肿瘤细胞和免疫细胞的密切关联,阐明了其通过表达SLIT2分子促进免疫细胞招募的机制 | 样本量相对较小(10个样本),未进行功能验证实验,研究结果需要在更大队列中验证 | 探究HPV相关口咽鳞状细胞癌预后较好的肿瘤微环境机制 | 口咽鳞状细胞癌患者组织样本(包括HPV阳性和阴性)及正常扁桃体组织 | 数字病理学 | 口咽鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 10个样本(2个非HPV相关OPSCC, 5个HPV相关OPSCC, 3个正常扁桃体) | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2320 | 2026-04-01 |
Spatial omics insights into tumor myeloid cells: roles in tumorigenesis, prognosis, and therapy
2026-Mar-31, Molecular biology reports
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s11033-026-11758-2
PMID:41915288
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综述 | 本文综述了空间组学技术在肿瘤相关髓系细胞研究中的应用,探讨了其在肿瘤发生、预后和治疗中的作用 | 整合了新兴的空间蛋白质组学和转录组学研究,识别了调控肿瘤发生、预后和治疗反应的重复性空间结构,并提出了将空间模式转化为机制理解的分析框架 | NA | 探讨肿瘤相关髓系细胞在肿瘤进化、临床结果和治疗反应中的空间组织作用 | 肿瘤相关髓系细胞,包括巨噬细胞、单核细胞、中性粒细胞、树突状细胞及其相关谱系 | 数字病理学 | 癌症 | 空间组学技术,包括空间蛋白质组学和转录组学 | NA | RNA和蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |