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当前共找到 3672 篇文献,本页显示第 2221 - 2240 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
2221 2026-02-17
Dysregulated TGFβ-ERK Signaling Drives Aberrant Extracellular Matrix Production in Noonan Syndrome-Associated Pulmonary Valve Stenosis
2026-Jan-20, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究利用人iPSC瓣膜分化平台,揭示了Noonan综合征相关肺动脉瓣狭窄中TGFβ-ERK信号失调驱动细胞外基质异常产生的分子机制 首次建立人iPSC瓣膜分化平台模拟NS相关PVS,结合单细胞转录组学和磷酸化蛋白质组学揭示TGFβ信号通路异常激活是导致ECM病理改变的核心机制 研究样本量有限(仅两个NS婴儿瓣膜组织验证),iPSC模型可能无法完全模拟体内复杂微环境 阐明Noonan综合征相关肺动脉瓣狭窄的分子发病机制 CRISPR编辑的iPSC衍生的瓣膜间质细胞亚型(纤维层和海绵层VICs),NS婴儿的狭窄肺动脉瓣组织 发育生物学与疾病建模 先天性心脏病(肺动脉瓣狭窄) iPSC分化、CRISPR基因编辑、单细胞RNA测序、磷酸化蛋白质组学(质谱)、组织病理学分析 人iPSC疾病模型 单细胞转录组数据、磷酸化蛋白质组数据、组织病理图像 CRISPR编辑的多种基因型iPSC系,两个NS婴儿的肺动脉瓣组织样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2222 2026-02-17
Multimodal single-cell and spatial profiling reveals altered T cell-mediated immunity and B-cell follicular architecture in non-metastatic lymph nodes of patients with aggressive non-small cell lung cancer
2026-Jan-18, medRxiv : the preprint server for health sciences
研究论文 本研究通过多模态单细胞和空间分析,揭示了侵袭性非小细胞肺癌患者非转移性区域淋巴结中T细胞介导的免疫和B细胞滤泡结构的改变 首次结合CITE-seq、scRNA-seq和成像质谱流式细胞术,在侵袭性NSCLC患者的非转移性区域淋巴结中识别出免疫抑制微环境和B细胞滤泡结构异常 样本量较小(36个淋巴结来自11名患者),且仅针对非转移性淋巴结进行研究,可能未涵盖转移性淋巴结的免疫特征 探究侵袭性非小细胞肺癌患者非转移性区域淋巴结中的免疫失调机制 非小细胞肺癌患者的区域淋巴结 数字病理学 肺癌 CITE-seq, scRNA-seq, 成像质谱流式细胞术 NA 单细胞RNA测序数据、蛋白质表达数据、空间成像数据 36个淋巴结来自11名患者 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
2223 2026-02-17
Uniform pre-processing of bacterial single-cell RNA-seq
2026-Jan-16, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了一种针对细菌单细胞RNA测序数据的统一预处理方法,通过改进kallisto-bustools工具套件以适应细菌基因组的特性 将原本用于真核生物scRNA-seq的kallisto-bustools工具套件进行优化,使其能够处理细菌的操纵子结构和更短的基因长度分布,实现了细菌scRNA-seq数据的高效准确量化 未明确说明该方法在具体细菌种类或实验条件下的性能限制,也未与其他预处理方法进行广泛比较 开发一种统一、高效的细菌单细胞RNA测序数据预处理方法,以促进微生物单细胞转录组学的标准化分析 细菌单细胞RNA测序数据 自然语言处理 NA 单细胞RNA测序 NA 测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
2224 2026-02-17
Defects in tissue-resident macrophages lead to smaller eardrums and abnormal neurovascular networks with increased middle-ear infection
2026-Jan-14, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究揭示了组织驻留巨噬细胞在耳鼓膜发育和神经血管网络形成中的关键作用 首次发现耳鼓膜组织驻留巨噬细胞的异质性来源,并证明其缺失会导致耳鼓膜变小、神经血管网络异常及中耳感染风险增加 NA 探究组织驻留巨噬细胞在耳鼓膜发育和先天免疫保护中的作用 小鼠耳鼓膜组织驻留巨噬细胞 单细胞测序 中耳感染 命运图谱、单细胞RNA测序、巨噬细胞耗竭 NA 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
2225 2026-02-17
Spatiotemporal transcriptomic and metabolomic landscapes of wild soybean seed development reveal regulatory mechanisms of nutrient accumulation
2026-Jan-12, Plant communications IF:9.4Q1
研究论文 本研究结合空间转录组学和代谢组学,解析了野生大豆种子发育中期细胞分化和营养积累的时空动态机制 首次在野生大豆中整合空间转录组学和代谢组学,揭示了胚胎中背腹侧薄壁细胞在蛋白质和脂质代谢途径上的空间差异,并鉴定出关键调控基因GsMAPK23-4 研究仅聚焦于野生大豆种子发育中期阶段,未涵盖整个发育过程,且功能验证仅基于敲除突变体 揭示野生大豆种子发育过程中细胞分化和营养积累的时空调控机制,以提升大豆产量和品质 野生大豆(Glycine soja)种子 空间转录组学 NA 空间转录组学, 代谢组学 NA 转录组数据, 代谢组数据 未明确指定样本数量,但基于野生大豆种子发育中期阶段 NA 空间转录组学 NA NA
2226 2026-02-17
Quantifying uncertainty in RNA velocity
2026-Jan-06, Biometrics IF:1.4Q2
研究论文 本文提出了一种贝叶斯分层模型来估计RNA速度,通过结合马尔可夫链蒙特卡洛和共识方法进行全贝叶斯推断,实现了校准良好的不确定性量化 首次在RNA速度估计中引入时间依赖性转录速率和非平凡初始条件,并讨论了模型参数的可识别性,包括潜在时间的较大值,这是以往未涉及的 模型可能仍受限于单细胞RNA测序数据的固有噪声和稀疏性,且计算复杂度较高 量化单细胞RNA测序数据中RNA速度的不确定性,以提取更可靠的动态信息 小鼠胚胎干细胞 单细胞组学 NA 单细胞RNA测序 贝叶斯分层模型 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
2227 2026-02-17
Single-cell RNA Sequencing Analysis Reveals the Regulatory Functions of Copines Family Genes in Testicular Cancer Progression
2026, Endocrine, metabolic & immune disorders drug targets
研究论文 本研究基于单细胞转录组数据,揭示了Copines家族基因在睾丸癌不同细胞亚群中的表达模式及其通过调控PI3K-Akt信号通路和细胞周期驱动癌症进展的潜在分子机制 首次在单细胞水平上系统分析Copines家族基因在睾丸癌中的表达和调控功能,并识别出关键信号通路如PI3K-Akt,为精准治疗提供了新靶点 研究基于单细胞转录组数据,未进行实验验证,且样本量未明确说明,可能限制结论的普适性 探究Copines家族基因在睾丸癌细胞亚群中的表达模式及其调控癌症进展的机制 睾丸癌的单细胞转录组数据,包括NK/T细胞、肿瘤细胞、B细胞和巨噬细胞等亚群 数字病理学 睾丸癌 单细胞RNA测序 聚类分析、差异表达分析、功能富集分析、伪时间分析 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
2228 2026-02-17
Prognostic Value and Immune Characterization of Genes Associated with Childhood Acute Leukemia applying Single-Cell RNA Sequencing
2026, Endocrine, metabolic & immune disorders drug targets
研究论文 本研究整合单细胞和批量转录组数据,识别儿童急性淋巴细胞白血病中的关键B细胞亚群和分子标志物,并构建预后风险模型 首次结合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,识别cALL中与增殖相关的B细胞C2亚群,并基于四个标记基因构建具有高预测精度的预后模型 研究样本量较小(仅2名cALL患者和3名健康对照),且仅针对B细胞起源的cALL,未涵盖其他亚型 探究儿童急性淋巴细胞白血病的免疫特征,并开发预后预测模型 儿童急性淋巴细胞白血病患者及健康儿童的骨髓样本 数字病理学 白血病 单细胞RNA测序,批量RNA测序 Cox回归,LASSO回归 RNA测序数据 2名cALL患者和3名健康儿童的骨髓样本(单细胞数据),511名cALL样本(批量数据) NA 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq NA NA
2229 2026-02-16
Immune dysfunction contributes to comorbid depression in patients with multiple sclerosis
2026-May-15, Journal of affective disorders IF:4.9Q1
研究论文 本研究通过整合基因组学和单细胞数据,探讨了免疫功能障碍在多发性硬化症患者并发抑郁症中的作用 首次整合GWAS和单细胞RNA测序数据,揭示了CD8+ T细胞通过HLA-B限制性靶向表达5-HT1F的神经元在MS相关抑郁症中的潜在机制 样本量较小(仅4名MS患者进行scRNA-seq),且未能通过孟德尔随机化证实因果关系 探究多发性硬化症患者并发抑郁症的免疫病理机制 多发性硬化症患者(伴有和不伴有抑郁症) 数字病理学 多发性硬化症 全基因组关联研究(GWAS)、连锁不平衡评分回归(LDSC)、双向双样本孟德尔随机化(2SMR)、GWAS多性状分析(MTAG)、单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因组数据、单细胞转录组数据 GWAS汇总统计数据(来自IMSGC和PGC),以及4名MS患者的外周血单个核细胞(PBMCs)进行scRNA-seq NA 单细胞RNA-seq NA NA
2230 2026-02-16
Integrative functional genomics and fine-mapping identify regulatory mechanisms of multivariate obesity GWAS and its cardiometabolic implications
2026-Apr, Metabolism: clinical and experimental
研究论文 本研究通过整合多变量肥胖GWAS与功能基因组学数据,揭示了肥胖的跨组织神经-脂肪调控轴及其心脏代谢影响 采用基因组结构方程模型构建多变量肥胖表型,结合多组学数据(染色质可及性、增强子-启动子互作、eQTL、TWAS、PWAS)进行精细定位和共定位分析,首次系统识别了肥胖相关的神经-脂肪调控机制 研究主要基于欧洲人群数据,可能限制其跨人群普适性;功能验证实验不足,机制结论仍需进一步实验证实 解析肥胖的共享遗传结构和关键调控机制,特别是非编码变异的作用,及其对心脏代谢特征的影响 五种肥胖相关性状(体重指数、腰围、内脏脂肪、肝脏脂肪、体脂百分比)的GWAS数据,脂肪组织多组学数据,以及心脏代谢特征 基因组学 肥胖症 GWAS, 基因组结构方程建模, 染色质可及性分析, 增强子-启动子互作分析, eQTL分析, TWAS, PWAS, 精细定位, 共定位分析, 单细胞分析 基因组结构方程模型, MAGMA, scPagwas 基因组数据, 表观基因组数据, 转录组数据, 蛋白质组数据, 单细胞数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
2231 2026-02-16
Myd88 and Sqstm1 as novel biomarkers for pyroptosis-driven immune checkpoint inhibitors-related myocarditis
2026-Mar-15, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序和bulk RNA测序数据,鉴定并验证了Myd88和Sqstm1作为免疫检查点抑制剂相关心肌炎中焦亡的关键基因和潜在生物标志物 首次在单细胞水平上揭示了焦亡在免疫检查点抑制剂相关心肌炎发病机制中的作用,并鉴定出Myd88和Sqstm1两个新型生物标志物 研究主要基于生物信息学分析和动物模型验证,尚未在临床患者样本中进行大规模验证 阐明免疫检查点抑制剂相关心肌炎的发病机制,并寻找可用于临床诊断的生物标志物 免疫检查点抑制剂相关心肌炎 生物信息学 心血管疾病 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 实时定量PCR, 蛋白质印迹分析 NA RNA测序数据 未明确说明样本数量,但使用了小鼠模型 NA 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 NA NA
2232 2026-02-16
ResiDUBs: A deubiquitinating enzyme-based prognostic model identifies UBXN1 driving sorafenib resistance in liver cancer
2026-Mar-15, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 本研究构建了一个基于去泛素化酶的预后模型ResiDUBs,用于预测肝癌对索拉非尼的耐药性,并鉴定出UBXN1是驱动耐药的关键基因 首次构建了基于去泛素化酶的肝癌索拉非尼耐药预测模型,并通过多组学分析鉴定出UBXN1的关键作用及其通过PI3K/AKT通路和巨噬细胞极化介导耐药的机制 模型仅在回顾性数据中验证,需要前瞻性临床研究进一步确认;UBXN1的具体作用机制仍需深入探索 探究去泛素化酶在肝癌索拉非尼耐药中的作用,并构建预后预测模型 肝癌细胞、肝癌患者样本 生物信息学与计算生物学 肝癌 加权基因共表达网络分析、差异表达分析、多变量Cox回归分析、单细胞RNA测序、空间转录组学、批量RNA测序、体内实验 预后预测模型(基于多变量Cox回归) 基因表达数据、转录组数据 未明确说明具体样本数量,但涉及患者分组和细胞实验 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 NA NA
2233 2026-02-16
SARS-CoV-2 E protein reduces PPARA activity in colonic and pulmonary epithelial cells, driving diarrhea and pneumonia in COVID-19
2026-Mar-15, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 本研究通过临床数据和单细胞RNA测序,揭示了SARS-CoV-2 E蛋白通过抑制PPARA活性,导致结肠和肺上皮细胞中膜转运蛋白表达下调,从而引发COVID-19相关腹泻和肺炎的机制 首次发现SARS-CoV-2 E蛋白通过抑制PPARA活性,在结肠和肺上皮细胞中共同驱动腹泻和肺炎,并提出了PPARA激动剂作为潜在治疗策略 单细胞RNA测序仅基于一名死亡COVID-19腹泻患者的结肠组织样本,样本量较小,且体外细胞模型可能无法完全模拟体内复杂环境 阐明SARS-CoV-2诱导腹泻和肺炎的分子机制,并探索潜在治疗靶点 COVID-19患者(临床数据)及结肠和肺上皮细胞(体外模型) 单细胞组学 COVID-19 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、基因调控网络分析、体外细胞培养实验 NA 临床数据、单细胞RNA测序数据、体外实验数据 3023名患者的临床数据,以及一名死亡COVID-19腹泻患者的结肠组织进行scRNA-seq NA 单细胞RNA-seq NA NA
2234 2026-02-16
Autophagy-driven CCL7+ monocyte terminal differentiation program fuels CD8+ T cell-mediated cardiac injury in Sepsis
2026-Mar-15, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 本研究揭示了自噬驱动的CCL7+单核细胞终末分化程序通过CCL7介导的免疫激活促进CD8+ T细胞介导的心脏损伤,为脓毒症心肌病提供了新的免疫代谢机制 首次鉴定出具有高自噬通量和CCL7表达的C6单核细胞亚群,并阐明了其通过CCL7-CCR1/CCR2-PI3K-AKT信号轴促进CD8+ T细胞活化和心肌损伤的新机制 研究主要基于生物信息学分析和动物模型,临床验证有限,且未深入探讨其他免疫细胞亚群的具体作用 揭示自噬依赖性单核细胞重编程在脓毒症心肌病中的作用及其通过CCL7介导的免疫激活机制 脓毒症患者样本、LPS诱导的脓毒症小鼠模型、体外共培养系统 单细胞转录组学 脓毒症心肌病 单细胞RNA测序、批量转录组分析、WGCNA、伪时间轨迹推断、CellChat通讯分析、流式细胞术、ELISA、Western blot NA 转录组数据、单细胞RNA测序数据 来自公共数据库GSE65682、GSE152363、GSE167363的脓毒症患者数据,以及LPS诱导的脓毒症小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq、批量RNA-seq NA NA
2235 2026-02-16
Multi-omics profiling of intercellular immunometabolic heterogeneity highlights in lung cancer: Crosstalk mechanisms and resistance in the tumor-immune interface
2026-Mar, Critical reviews in oncology/hematology
综述 本文综述了肺癌肿瘤微环境中恶性细胞与免疫细胞之间的代谢串扰机制,及其如何驱动免疫逃逸、异质性和免疫治疗耐药,并整合多组学数据定义了相关的免疫代谢表型和治疗策略 独特地整合了2009-2025年的最新文献,利用多组学数据(单细胞转录组学、蛋白质组学、代谢组学、空间分析)来定义肺癌中的免疫代谢表型(如LM-high、CD73^high、KEAP1/NRF2突变)和相关通路,并强调了靶向这些通路的治疗策略 本文为综述性文章,未进行原始数据研究,其结论基于对现有文献的综合分析 阐明肺癌肿瘤微环境中肿瘤细胞与免疫细胞之间的免疫代谢串扰机制,及其对免疫治疗耐药的影响,并探索基于多组学分析的精准治疗策略 肺癌的肿瘤微环境,特别是其中的恶性细胞和免疫细胞(如细胞毒性T细胞、树突状细胞、调节性和抑制性免疫亚群) 数字病理学 肺癌 单细胞转录组学,蛋白质组学,代谢组学,空间分析 NA 多组学数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
2236 2026-02-16
Interpretable Aging Signatures in Human Retinal Cell Types Revealed by Single-Cell RNA Sequencing and Sparse Logistic Regression
2026-Mar, Ophthalmology science IF:3.2Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和稀疏逻辑回归,揭示了中国人群视网膜细胞类型中可解释的衰老特征 首次在中国人群中利用机器学习模型推导出细胞类型特异性的视网膜衰老特征,揭示了保守的分子标志和独特的细胞脆弱性 样本量相对较小(18个视网膜,12名捐赠者),且为横断面研究,无法追踪个体衰老动态 表征人类视网膜衰老过程中的细胞类型特异性转录变化,并开发用于细胞年龄判别的机器学习模型 人类视网膜细胞 数字病理学 老年疾病 单细胞RNA测序 L1正则化逻辑回归加递归特征消除 单细胞转录组数据 18个未冷冻视网膜,来自12名中国捐赠者(9名年轻,34-55岁;9名老年,68-92岁),共223,612个细胞 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3' v3.1
2237 2026-02-16
Developing a Single-Cell Spatial Transcriptomics Workflow for In Vivo Evaluation of Implanted Biomaterials
2026-Feb-15, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本文开发了一个用于Xenium平台的空间转录组学工作流程,以评估植入生物材料的体内反应 开发了一个新的生物信息学工作流程,将空间转录组学应用于生物材料评估,揭示了传统组织学无法检测的细胞动态和空间组织 工作流程目前仅应用于小鼠皮下植入的PCL支架,可能需进一步验证于其他生物材料或体内模型 评估植入生物材料的体内反应,以促进基于生物学的生物材料设计 植入小鼠皮下的电纺聚己内酯支架 数字病理学 NA 空间转录组学 NA 空间基因表达数据 NA 10x Genomics 空间转录组学 Xenium Xenium平台用于高分辨率空间转录组学分析
2238 2026-02-16
DSG2+ Cancer Stem Cells Co-Located With FAP+ Myofibroblasts in the Tumor Boundary That Determines the Efficacy of Immunotherapy in Non-Small Cell Lung Cancer
2026-Feb-15, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学,系统定义了非小细胞肺癌中与癌症干细胞相关的表型,并揭示了DSG2+癌症干细胞与FAP+肌成纤维细胞在肿瘤边界共定位的空间生态位对治疗抵抗的作用 首次整合单细胞RNA测序与空间转录组学系统定义NSCLC中的CSC表型;发现DSG2作为主导标志物;揭示了DSG2+CSC与FAP+肌成纤维细胞在肿瘤边界共定位的空间组织模式及其通过MMP依赖机制增强CSC表型的功能 未明确提及 阐明非小细胞肺癌中癌症干细胞的转录程序和空间组织,及其对治疗抵抗的影响 非小细胞肺癌 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 加权基因共表达网络分析, 多重免疫荧光, 功能共培养实验 NA 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 临床蛋白质组数据集, 免疫荧光图像 未明确提及 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
2239 2026-02-16
Gut-Heart Axis in Myocardial Repair: Mechanisms, Cross-Organ Networks, and Therapeutic Opportunities
2026-Feb-13, Circulation research IF:16.5Q1
综述 本文综述了肠道微生物群通过多器官网络(如肠-脑-心轴)调节心肌损伤、修复和再生的机制,并探讨了其作为疾病驱动因素和治疗靶点的潜力 整合了肠道微生物群在心肌修复和再生中的新兴作用,强调了跨器官网络(如肠-脑-心轴)和免疫代谢信号,并提出了结合多组学与机制模型用于精准心血管医学的新策略 NA 探讨肠道微生物群在心肌损伤、修复和再生中的作用机制,以及其作为治疗靶点的潜力 肠道微生物群及其代谢物,以及它们与心肌健康相关的跨器官网络 NA 心血管疾病 宏基因组学、代谢组学、单细胞转录组学 NA NA NA NA NA NA NA
2240 2026-02-16
COPD reshapes the tumor microenvironment of NSCLC and enhances anti-PD-1 therapy response
2026-Feb-13, Med (New York, N.Y.)
研究论文 本研究探讨了慢性阻塞性肺疾病(COPD)如何重塑非小细胞肺癌(NSCLC)的肿瘤微环境并增强抗PD-1疗法的疗效 揭示了COPD通过诱导上皮重塑,扩增具有祖细胞特征的基底样肿瘤细胞群,并激活CXCL14-CXCR4信号轴招募产生CXCL9的巨噬细胞,从而建立有利于细胞毒性T细胞浸润的局部微环境,这为COPD增强PD-1阻断疗效提供了机制性解释 研究主要基于临床队列和体外功能验证,缺乏体内模型的直接验证,且样本来源可能受限于特定患者群体 探究COPD作为NSCLC共病如何影响肿瘤微环境并增强抗PD-1免疫疗法的反应 非小细胞肺癌(NSCLC)患者,特别是伴有COPD的患者,以及新鲜手术肿瘤标本 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多重免疫荧光 NA 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 免疫荧光图像 三个临床队列,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
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