单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202601-202612] [清除筛选条件]
当前共找到 3672 篇文献,本页显示第 2161 - 2180 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
2161 2026-02-18
Muscularis Macrophage-Derived ApoE is Dispensable for Maintaining Gut Motility in Mice
2026-Feb, Neurogastroenterology and motility IF:3.5Q2
研究论文 本研究探讨了肌肉层巨噬细胞来源的ApoE在小鼠肠道运动调控中的作用 首次通过单细胞RNA测序揭示了肌肉层巨噬细胞中ApoE的高表达及其在肠道操作后的上调,并利用骨髓嵌合体和巨噬细胞特异性ApoE缺陷小鼠模型,系统评估了ApoE在生理和应激条件下对肠道运动的影响 研究主要基于小鼠模型,结果可能无法直接外推至人类;且仅关注了ApoE在肌肉层巨噬细胞中的功能,未全面探讨其他细胞类型中ApoE的可能作用 探究肌肉层巨噬细胞来源的ApoE在维持肠道运动中的功能角色 小鼠(包括全局ApoE敲除小鼠、骨髓嵌合体小鼠和巨噬细胞特异性ApoE缺陷小鼠) NA 术后肠梗阻 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
2162 2026-02-18
Multimodal single-cell network analysis uncovers BSG/CD147 as an early biomarker and signaling hub in hepatocellular carcinoma
2026-Jan-27, Research square
研究论文 本研究通过多模态单细胞网络分析,揭示了BSG/CD147作为肝细胞癌早期生物标志物和信号枢纽的作用 首次将单细胞RNA测序与高维加权基因共表达网络分析结合,识别出BSG/CD147作为早期肝细胞癌的关键枢纽基因,并验证其在小于2厘米病灶中的诊断价值 研究基于两个公开数据集,样本量有限;需要进一步在更大队列和前瞻性研究中验证BSG/CD147的临床实用性 识别肝细胞癌早期恶性转化的分子标志物,改善早期诊断 肝细胞癌组织与非肿瘤肝组织 数字病理学 肝细胞癌 单细胞RNA测序, 定量免疫荧光 高维加权基因共表达网络分析, CellChat, 伪时间分析 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据 两个独立scRNA-seq数据集(GSE149614和GSE189903),包含非肿瘤和HCC组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2163 2026-02-18
Intracerebral hemorrhage induces monocyte TNF signaling that is suppressed by Siponimod (BAF312): a single-cell transcriptomics study in patients
2026-Jan-27, medRxiv : the preprint server for health sciences
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和血浆细胞因子分析,探讨了免疫调节药物BAF312(Siponimod)对脑出血患者外周血免疫反应的影响 首次在脑出血患者中应用单细胞转录组学分析BAF312对单核细胞TNF信号通路的抑制作用,并揭示了单核细胞在疾病亚急性期的复杂作用 研究样本量较小,且未评估BAF312对血浆细胞因子或趋化因子浓度的影响 研究脑出血后免疫反应及BAF312的免疫调节作用 脑出血患者的外周血样本 单细胞转录组学 脑出血 单细胞RNA测序,血浆细胞因子分析 NA 单细胞RNA测序数据,血浆细胞因子数据 脑出血患者的外周血样本,在出血后第1、3、7天采集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2164 2026-02-18
ICI-induced Granulomatous Sialadenitis is Responsive to Prednisone
2026-Jan-26, medRxiv : the preprint server for health sciences
研究论文 本文报告了首例免疫检查点抑制剂诱导的肉芽肿性涎腺炎病例,并通过整合分析揭示了其发病机制及对皮质类固醇治疗的反应 首次报道免疫检查点抑制剂诱导的肉芽肿性涎腺炎病例,并利用单细胞RNA测序和空间转录组学进行整合分析 仅基于单个病例报告,且尽管治疗,广泛的纤维化持续存在 研究免疫检查点抑制剂引起的免疫相关不良事件(irAEs)的病理机制及治疗反应 一名患有BRAF-V600E突变乳头状甲状腺癌的中年男性患者 数字病理学 甲状腺癌 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA 组织学图像,单细胞RNA测序数据,空间转录组学数据 1例患者 NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
2165 2026-02-18
Distinct Endothelial Phenotype Associates with Macrophage-Enriched Microenvironments in Triple-Negative Breast Cancer
2026-Jan-23, Research square
研究论文 本研究探讨了三阴性乳腺癌中巨噬细胞富集微环境与血管状态之间的关联,揭示了巨噬细胞如何影响肿瘤血管正常化和免疫活性 首次通过单细胞RNA测序揭示巨噬细胞富集微环境中内皮细胞的炎症表型和静脉样状态,并验证其在人类TNBC中的保守性 研究主要基于小鼠模型和现有人类数据集,缺乏直接临床干预验证 探究巨噬细胞富集微环境对三阴性乳腺癌血管状态和免疫-血管协调动态的影响 三阴性乳腺癌小鼠模型和人类单细胞数据集中的肿瘤内皮细胞与巨噬细胞 单细胞组学 乳腺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 基于已建立的小鼠TNBC模型和人类TNBC单细胞数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2166 2026-02-18
3D reconstruction of spatial transcriptomics with spatial pattern enhanced graph convolutional neural network
2026-Jan-14, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了一种名为Spa3D的方法,利用反泄漏傅里叶变换和图卷积神经网络模型从多个2D空间转录组学切片重建3D空间结构,以克服现有方法在三维空间分析中的限制 Spa3D通过结合反泄漏傅里叶变换和图卷积神经网络,首次从多个2D SRT切片重建3D空间结构,提升了空间域识别、细胞通讯分析和发育轨迹建模的准确性 NA 开发一种能够从二维空间转录组学数据重建三维空间结构的方法,以更准确地分析空间域、空间可变基因、细胞间通讯和发育轨迹 空间转录组学数据 空间转录组学 NA 空间转录组学 图卷积神经网络 空间转录组学数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
2167 2026-02-18
Intranasal Human NSC-Derived EVs Therapy Can Restrain Inflammatory Microglial Transcriptome, and NLRP3 and cGAS-STING Signaling, in Aged Hippocampus
2026-Jan-14, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究探讨了鼻内给予人诱导多能干细胞来源的神经干细胞外泌体对老年小鼠海马神经炎症的影响 首次证明hiPSC-NSC-EVs中的特定miRNA(miRNA-30e-3p和miRNA-181a-5p)能分别抑制NLRP3炎症小体和STING通路的激活,并通过单细胞RNA测序揭示了其对小胶质细胞转录组的广泛调控作用 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类中验证;治疗效果的长期持续性未知;特定miRNA的作用机制需进一步阐明 评估hiPSC-NSC-EVs疗法对老年海马神经炎症的抑制作用及其认知功能改善效果 18月龄的雄性和雌性C57BL6/J小鼠以及基因工程RAW细胞 神经科学 老年疾病 单细胞RNA测序,体外功能验证 动物模型(小鼠),细胞模型(RAW细胞) RNA测序数据,蛋白质表达数据,行为学数据 未明确具体数量,但涉及18月龄C57BL6/J小鼠的雄性和雌性个体 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2168 2026-02-18
Spatial transcriptomics reveals organizational properties of mouse spinal cord and alterations in neuropathic pain
2026-Jan-12, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究利用空间转录组学技术,揭示了小鼠脊髓的组织特性及其在神经性疼痛模型中的变化 首次应用空间分辨的单细胞转录组分析,系统描绘了成年小鼠脊髓的神经元亚型空间分布、性别差异及在神经性疼痛中的转录组变化 研究主要基于小鼠模型,结果向人类转化需进一步验证;空间转录组技术分辨率可能受限于当前平台 解码脊髓在健康和疾病状态下的感觉与运动功能电路机制 成年小鼠脊髓组织 空间转录组学 神经性疼痛 空间分辨单细胞转录组学 NA 空间转录组数据 未明确指定样本数量,但基于成年小鼠脊髓 NA 空间转录组学 NA NA
2169 2026-02-18
Transcriptomic signature-guided depletion of intermediate alveolar epithelial cells ameliorates pulmonary fibrosis in mice
2026-Jan-10, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术识别了肺纤维化中的中间上皮细胞状态,并开发了一种RNA感应依赖的蛋白质翻译技术,选择性靶向并耗竭这些细胞,从而在小鼠模型中减轻了肺纤维化 引入了RNA感应依赖的蛋白质翻译技术,能够选择性靶向并耗竭Krt8+肺泡分化中间细胞,首次证明了这些过渡性上皮细胞在肺纤维化中的致病驱动作用 研究主要基于小鼠模型,人类细胞的应用和临床转化仍需进一步验证 探究肺纤维化中中间上皮细胞的功能贡献,并开发靶向治疗策略 小鼠模型中的Krt8+肺泡分化中间细胞及人类KRT5-/KRT17+异常基底样细胞 数字病理学 肺纤维化 单细胞RNA测序,RNA感应依赖的蛋白质翻译技术 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
2170 2026-02-18
Multiomics analysis of polyamine metabolism in colorectal cancer, highlighting the key role of extracellular putrescine in impairing CXCR6+CD8+ T cell anti-tumor activity
2026, PeerJ IF:2.3Q2
研究论文 本研究通过多组学分析揭示了结直肠癌中多胺代谢,特别是细胞外腐胺,如何通过损害CXCR6+CD8+ T细胞的抗肿瘤活性来促进肿瘤进展 定义了新的“Pi值”来量化CXCR6+CD8+ T细胞周围的局部腐胺积累,并揭示了细胞外腐胺直接抑制这些T细胞毒性功能的新机制 研究主要基于体外实验和动物模型,其在人类患者中的直接临床转化仍需进一步验证 阐明腐胺代谢在结直肠癌肿瘤免疫监视受损中的作用机制 结直肠癌患者样本、结直肠癌细胞系(HCT-116和RKO)、CXCR6+CD8+ T细胞、DSS诱导的结肠炎小鼠模型 多组学分析 结直肠癌 单细胞RNA测序,多组学分析 NA 单细胞转录组数据,基因表达数据 来自131名受试者的221个样本,共计517,191个细胞;两个独立队列 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2171 2026-02-17
Single-cell transcriptomics combined with spatial proteomics defines phagocytes type-specific immune regulation in diabetic cataract
2026-Apr, Experimental eye research IF:3.0Q1
研究论文 本研究结合单细胞转录组学和空间蛋白质组学,定义了糖尿病性白内障中吞噬细胞类型特异性的免疫调节机制 首次在糖尿病性白内障中结合单细胞RNA测序和基于串联质量标签的定量蛋白质组学,系统揭示了单核吞噬细胞在疾病发展中的关键作用,并发现了MIF蛋白作为重要巨噬细胞趋化因子的上调 研究样本主要来自大鼠模型和有限的患者样本,需要更大规模的人类队列研究来验证结果;免疫细胞的具体功能机制仍需进一步探索 研究糖尿病性白内障中免疫细胞的特征及其潜在机制,以寻找潜在的治疗靶点 糖尿病大鼠的晶状体样本、糖尿病性白内障患者和年龄相关性白内障患者的前囊膜样本 数字病理学 糖尿病性白内障 单细胞RNA测序,基于串联质量标签的定量蛋白质组学,免疫荧光染色,前节光学相干断层扫描 NA 单细胞转录组数据,蛋白质组数据,图像数据 糖尿病大鼠和正常大鼠的晶状体样本,糖尿病性白内障患者和年龄相关性白内障患者的前囊膜样本 NA 单细胞RNA测序,定量蛋白质组学 NA NA
2172 2026-02-17
The CD74-MIF axis contributes to acute uveitic injury by upregulating proinflammatory cytokine secretion in murine cytomegalovirus intracameral infection mouse models
2026-Apr, Experimental eye research IF:3.0Q1
研究论文 本研究通过小鼠巨细胞病毒前房内感染模型,探讨了CD74-MIF轴在急性葡萄膜炎损伤中的作用机制 首次在小鼠巨细胞病毒前房内感染模型中,通过单细胞测序揭示了CD74在C57BL/6小鼠眼内CD45免疫细胞中的显著上调,并证实CD74-MIF轴通过促进促炎细胞因子分泌驱动眼部炎症 研究主要基于小鼠模型,结果向人类临床转化的适用性需进一步验证;体外实验使用原代外周血单个核细胞,可能无法完全模拟体内复杂微环境 探究CD74-MIF轴在小鼠巨细胞病毒前房内感染诱导的急性葡萄膜炎损伤中的作用机制 C57BL/6和BALB/c小鼠,以及原代外周血单个核细胞 数字病理学 葡萄膜炎 单细胞测序,细胞因子检测,体外细胞培养 NA 测序数据,细胞计数数据,细胞因子浓度数据 C57BL/6和BALB/c小鼠模型,具体数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2173 2026-02-17
ERBB2 amplification is a late event in the pathogenesis of high-grade endometrial carcinomas with heterogeneous HER2 expression
2026-Mar, The Journal of pathology IF:5.6Q1
研究论文 本研究通过空间组学分析,揭示了高级别子宫内膜癌中HER2异质性的分子发病机制和进化轨迹 首次通过空间分辨的测序技术,揭示了ERBB2扩增是高级别子宫内膜癌肿瘤进化过程中的晚期事件,而非驱动肿瘤发生的早期事件 样本量较小(n=9),空间转录组学分析仅为探索性,需要更大规模的研究验证 阐明HER2异质性高级别子宫内膜癌的分子发病机制和肿瘤进化轨迹 高级别子宫内膜癌(HG-EC)肿瘤组织 数字病理学 子宫内膜癌 下一代测序(NGS),空间转录组学 NA 基因组数据,转录组数据 9个肿瘤的空间区分样本(全外显子组测序n=7,靶向panel测序n=2) NA 全外显子组测序,靶向测序,空间转录组学 NA NA
2174 2026-02-17
Uncovering the potential of pathomics: prognostic prediction and mechanistic investigation of pancreatic cancer
2026-Mar, The Journal of pathology IF:5.6Q1
研究论文 本研究探讨了基于机器学习的病理组学模型在预测胰腺癌患者术后总生存期中的价值及其生物学意义 结合肿瘤和瘤周区域的病理组学参数,利用五种机器学习方法计算最优病理组学评分,并与临床参数整合构建综合列线图,同时通过多组学数据探索其与免疫状态的关联 研究为回顾性分析,样本量相对有限(173例患者),且仅来自两个中心,可能存在选择偏倚 评估病理组学模型在预测胰腺导管腺癌患者术后总生存期及探究其生物学机制中的应用 173例接受手术并持续随访的胰腺导管腺癌患者 数字病理学 胰腺癌 机器学习、多路免疫荧光、空间分析、单细胞测序 LASSO、机器学习模型 病理图像、临床数据、基因组数据 173例胰腺导管腺癌患者 NA 单细胞测序 NA NA
2175 2026-02-17
An Extracellular Matrix-Producing Subset of Cancer-Associated Fibroblasts Drives Chemoresistance in Breast Cancer via SRC Activation and G0S2 Upregulation
2026-Feb-16, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 本研究通过结合TNBC患者数据分析与肿瘤芯片技术,揭示了细胞外基质产生的肌成纤维细胞(ECM-myCAF)亚群通过激活SRC激酶和上调G0S2驱动三阴性乳腺癌化疗耐药性的独特机制 首次鉴定出ECM-myCAF这一特定CAF亚群在TNBC化疗耐药中的关键作用,并发现G0S2作为耐药性的核心调控因子 研究主要基于体外模型和单细胞测序数据,缺乏大规模临床队列验证 解析三阴性乳腺癌化疗耐药的具体机制,并识别驱动耐药的关键CAF亚群 三阴性乳腺癌患者样本、肿瘤芯片模型中的癌细胞与癌症相关成纤维细胞 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序、肿瘤芯片技术、高级细胞成像、功能实验 NA 单细胞RNA测序数据、图像数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
2176 2026-02-17
Deep-Learning Tool ScVital Enables Species-Agnostic Integration of Cancer Cell States
2026-Feb-16, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 本研究开发了一个名为scVital的深度学习工具,用于跨物种整合单细胞RNA测序数据,以识别癌症中保守的细胞状态 开发了scVital工具,利用变分自编码器和判别器将scRNA-seq数据嵌入到物种无关的潜在空间中,以克服批次效应并识别物种间共享的细胞状态;同时提出了潜在空间相似性评分作为评估批次校正准确性的新指标 未明确说明工具在处理高度异质性肿瘤或低质量数据时的性能限制 开发一种计算工具,用于跨物种整合单细胞转录组数据,以增强小鼠癌症模型的转化研究能力 基因工程小鼠模型(GEMM)和原发性患者样本中的癌细胞状态 机器学习 胰腺导管腺癌, 肺腺癌, 未分化多形性肉瘤 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 变分自编码器(VAE) 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
2177 2026-02-17
CanSig Benchmarks Methods for Reproducible Cancer Cell State Discovery from Single-Cell Transcriptomic Data
2026-Feb-16, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 本文介绍了一个名为CanSig的基准测试工具,用于评估从单细胞转录组数据中发现癌症细胞状态的方法,旨在提高签名检测的可重复性 开发了首个综合基准测试工具CanSig,整合了批次校正、生物信号保存和转录签名相关性指标,以标准化评估方法在癌症细胞状态发现中的性能 仅评估了13种方法在12个数据集上的表现,可能未覆盖所有现有方法或癌症类型,且依赖于特定数据集的质量和代表性 评估和标准化从单细胞转录组数据中发现癌症细胞状态的计算方法,以提高其可重复性和临床相关性 单细胞RNA测序数据中的恶性细胞,来自五种人类癌症类型(胶质母细胞瘤、乳腺癌、肺腺癌、横纹肌肉瘤和皮肤鳞状细胞癌)的185名患者和174,000个细胞 单细胞转录组学 癌症(包括胶质母细胞瘤、乳腺癌、肺腺癌、横纹肌肉瘤和皮肤鳞状细胞癌) 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 185名患者,174,000个恶性细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2178 2026-02-17
Cancer-Associated Fibroblasts Promote Imatinib Resistance in Gastrointestinal Stromal Tumors through PGK1-Mediated Metabolic Reprogramming
2026-Feb-16, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 本研究揭示了癌症相关成纤维细胞(CAF)通过PGK1介导的代谢重编程促进胃肠道间质瘤(GIST)对伊马替尼产生耐药性的机制 首次发现CAF通过TGFβ1/CCN2/Rack1/PGK1信号轴介导代谢重编程驱动GIST耐药,超越了以往主要关注遗传驱动因素的研究视角 研究主要基于共培养模型和单细胞测序,需要进一步的体内实验验证和临床样本验证 探究胃肠道间质瘤对伊马替尼耐药的肿瘤微环境机制 胃肠道间质瘤(GIST)细胞和癌症相关成纤维细胞(CAF) 肿瘤生物学 胃肠道间质瘤 单细胞RNA测序 共培养模型 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
2179 2026-02-17
Dissection of Gαs and Hedgehog Signaling Cross-talk Reveals Therapeutic Opportunities to Target Hedgehog-Dependent Tumors
2026-Feb-16, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 本研究通过组织学、批量RNA测序和单细胞RNA测序,揭示了Gαs信号通路失活与经典Hedgehog信号通路在驱动小鼠基底细胞癌样肿瘤中的相似性,并提出了通过激活Gαs偶联的腺苷2B受体来靶向治疗BCC的潜在策略 首次发现Gαs通路失活可导致与经典Hedgehog信号通路相似的BCC样肿瘤,并证明这些肿瘤独立于SMO和GPR161,为SMO非依赖性致癌Hedgehog信号提供了新模型,同时提出激活腺苷2B受体可抑制肿瘤生长 研究主要基于小鼠模型,人类BCC中Gαs和PKA活性降低的突变证据有限,且治疗策略的临床转化潜力尚未验证 探究Gαs与Hedgehog信号通路的交叉调控机制,并寻找靶向Hedgehog依赖性肿瘤的治疗机会 小鼠基底细胞癌样肿瘤和人类基底细胞癌 数字病理学 基底细胞癌 组织学分析、批量RNA测序、单细胞RNA测序 NA 图像、RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
2180 2026-02-17
Protumor Macrophage Polarization Mediated by BMP2/4-ACVR1 Signaling Orchestrates an Immunosuppressive Microenvironment during Tumor Initiation
2026-Feb-16, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了EGFR驱动肺腺癌起始阶段中,肿瘤细胞通过BMP2/4-ACVR1信号通路诱导巨噬细胞向促肿瘤表型极化,从而形成免疫抑制性肿瘤微环境的机制 首次在EGFR突变肺腺癌起始阶段,利用单细胞RNA测序技术动态解析了促肿瘤巨噬细胞通过BMP2/4-ACVR1信号轴介导免疫抑制性肿瘤微环境形成的时序过程,并验证了ACVR1抑制剂作为治疗策略的潜力 研究主要基于小鼠模型和有限的患者样本,人类肿瘤微环境的异质性可能未被完全捕捉,且ACVR1抑制剂的临床转化效果需进一步验证 探究肿瘤起始阶段免疫抑制性肿瘤微环境的形成机制,并寻找针对EGFR突变肺腺癌的免疫治疗新靶点 EGFR驱动肺腺癌的小鼠模型和EGFR突变肺腺癌患者样本 单细胞转录组学 肺腺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
回到顶部