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当前共找到 7593 篇文献，本页显示第 2141 - 2160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2141 | 2026-06-17 |
ecPICK: A deep learning-enabled spatial diagnostic platform for direct ecDNA identification and clinical prognosis across pan-cancer histopathology
2026, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.134316
PMID:42244994
|
研究论文 | 开发一种名为ecPICK的深度学习框架，通过常规H&E染色全切片图像直接识别和定位染色体外DNA，并评估其在泛癌病理中的诊断和预后价值 | 首次将深度学习应用于常规病理切片的ecDNA空间诊断，无需昂贵测序即可实现ecDNA定性和定量分析，并揭示ecDNA富集区域的独特肿瘤微环境特征 | 需要进一步验证模型在不同染色条件和扫描仪下的一致性，以及更大规模临床队列的泛化能力 | 开发一种经济高效、可临床转化的ecDNA诊断平台，实现常规病理样本中的ecDNA定量和空间定位 | 来自20种不同癌症的4280张H&E染色全切片图像及其对应的ecDNA状态 | 数字病理学 | 泛癌（肺癌、前列腺癌等20种癌症） | 深度学习、荧光原位杂交、空间转录组学 | 深度卷积神经网络 | 图像（H&E染色全切片图像） | 4280张来自20种癌症的H&E染色图像 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2142 | 2026-06-17 |
CLIC6 and ANLN: novel exosome-related prognostic markers and therapeutic targets in lung adenocarcinoma
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1756058
PMID:41948338
|
研究论文 | 本研究基于CLIC6和ANLN等外泌体相关基因构建肺腺癌预后模型，并评估其免疫特征和治疗价值 | 首次鉴定CLIC6和ANLN为外泌体相关新型预后标志物，并结合免疫浸润和单细胞分析揭示其在肺腺癌中的免疫调控机制 | 仅基于TCGA和GEO公共数据库，缺乏多中心外部验证队列；ANLN功能验证仅在有限细胞系中进行 | 探索肺腺癌中外泌体相关基因的预后价值及免疫治疗反应预测潜力 | 肺腺癌肿瘤样本（TCGA和GEO公共数据）、A549和NCI-H838肺腺癌细胞系 | 机器学习 | 肺癌 | RNA-seq, scRNA-seq, qRT-PCR | LASSO回归， 共识聚类 | 基因表达数据， 单细胞转录组数据 | 未明确说明（利用TCGA和GEO公共数据库，样本量需参考原文） | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2143 | 2026-06-17 |
Integrative profiling of lactylation reveals prognostic biomarkers and an immunosuppressive niche in acute myeloid leukemia
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1765979
PMID:41948341
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研究论文 | 通过整合分析急性髓系白血病中乳酰化修饰谱，鉴定出预后生物标志物并揭示免疫抑制微环境 | 首次系统构建急性髓系白血病的乳酰化相关基因图谱，结合机器学习算法和多组学数据鉴定出GZMB和LSP1两个关键基因，并通过孟德尔随机化验证其因果关系 | 研究主要基于公开数据库的转录组数据，缺乏多中心独立验证队列，且乳酰化修饰的机制验证主要限于体外实验 | 阐明急性髓系白血病中乳酰化修饰的调控景观，发现预后生物标志物和潜在治疗靶点 | 急性髓系白血病患者样本及细胞系（Kasumi-1细胞） | 机器学习 | 急性髓系白血病 | RNA-seq， 单细胞测序， 免疫组化， 分子对接 | LASSO-logistic， SVM-RFE， Boruta， GLM， CIBERSORT | 转录组数据， 单细胞测序数据 | 来自GEO和TCGA数据库的公开数据集，具体样本量未明确说明 | NA | RNA-seq， 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2144 | 2026-06-17 |
Identification of CCND1 and IL7R as core JAK-STAT pathway genes promoting hepatitis B-related liver fibrosis
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1776431
PMID:41948344
|
研究论文 | 通过整合生物信息学分析，识别出CCND1和IL7R作为JAK-STAT通路核心基因，并验证其在乙肝相关肝纤维化中的促进作用 | 首次结合WGCNA、机器学习诊断模型构建、孟德尔随机化因果推断和单细胞RNA测序验证，多维度鉴定CCND1和IL7R为JAK-STAT通路在乙肝相关肝纤维化中的核心基因 | 基于公开数据库分析，样本量和数据来源有限；实验验证仅在蛋白和mRNA水平进行，缺乏功能实验和体内动物模型验证 | 识别JAK-STAT通路中促进乙肝相关肝纤维化的核心基因并探索其生物学功能 | 乙肝病毒感染患者的肝纤维化组织样本 | 机器学习 | 肝纤维化 | RNA-seq | 机器学习诊断模型 | 基因表达数据 | GSE84044数据集（具体样本数未明确给出） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2145 | 2026-06-17 |
S100A4 characterize antigen-presenting cancer-associated fibroblasts and predicts surgical outcomes in relapsed ovarian cancer
2026, Therapeutic advances in medical oncology
IF:4.3Q2
DOI:10.1177/17588359261436959
PMID:41948466
|
研究论文 | 该研究通过多平台整合分析，鉴定了复发性卵巢癌中S100A4+抗原呈递癌症相关成纤维细胞亚群及其与手术结局的关联 | 首次在复发性卵巢癌中描绘S100A4+ CAFs的异质性，并发现抗原呈递S100A4+apCAFs亚群与完全手术切除及良好免疫微环境密切相关 | 样本量相对较小，需在更大队列中验证；功能性验证实验未直接在文中提及 | 阐明复发性卵巢癌中癌症相关成纤维细胞的异质性及其对手术预后和免疫调节的影响 | 复发性卵巢癌肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 多重免疫组化、空间数字表型分析、单细胞RNA测序、转录组荟萃分析 | NA | 空间图像、单细胞转录组数据、批量转录组数据 | 31个肿瘤切片（多重免疫组化），11个肿瘤（单细胞RNA测序），多个外部转录组数据集 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 2146 | 2026-06-17 |
Activation of endogenous retroviruses in tumor cells and their immunomodulatory mechanisms: from molecular basis to clinical translation
2026, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2026.1752231
PMID:41948490
|
综述 | 系统解析内源性逆转录病毒在肿瘤微环境中异常激活的分子机制及其免疫调节双重作用，并探讨其在肿瘤诊断与免疫治疗中的转化潜力 | 整合单细胞多组学和空间转录组学技术揭示ERV在肿瘤异质性中的动态表达模式，并首次提出利用时空精准基因编辑和AI驱动的ERV活性预测模型突破现有研究瓶颈 | 未提供具体实验验证数据，主要基于现有文献综述，缺乏对ERV激活与临床预后之间因果关系的直接证据 | 系统阐述ERV异常激活在肿瘤发生、进展和免疫逃逸中的分子机制，并评估其作为肿瘤诊断和免疫治疗靶点的临床转化可行性 | 内源性逆转录病毒在肿瘤细胞中的激活机制及其免疫调节作用 | 自然语言处理 | 恶性肿瘤 | 单细胞多组学、空间转录组学 | NA | 临床前和临床试验数据 | NA | NA | 单细胞多组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2147 | 2026-06-17 |
Immunomodulatory Roles and Clinical Significance of GZMM and DDX24 in Sepsis: A Multiomics Integrative Analysis With Experimental Validation
2026, Human mutation
IF:3.3Q2
DOI:10.1155/humu/4951633
PMID:41948606
|
研究论文 | 通过多组学整合分析和实验验证，揭示了GZMM和DDX24在脓毒症中的免疫调节作用及临床意义 | 首次利用多组学整合分析结合机器学习方法鉴定DDX24和GZMM作为脓毒症诊断和预后的关键基因，并通过单细胞RNA测序揭示其在T细胞和NK细胞中的表达模式 | 初步验证样本量有限，且未深入探讨基因调控的分子机制 | 探索脓毒症免疫功能障碍的分子机制并鉴定新的诊断和预后标志物 | 从GEO数据集获取的脓毒症转录组数据及临床样本 | 机器学习 | 脓毒症 | RNA-seq | 机器学习算法 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 2148 | 2026-06-17 |
Integrative single-cell analysis reveals immunogenic cell death-associated heterogeneity and identifies a robust prognostic signature in osteosarcoma with experimental validation
2026, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2026.1792174
PMID:41948724
|
研究论文 | 通过整合单细胞分析揭示骨肉瘤中免疫原性细胞死亡相关的异质性，并构建具有实验验证的稳健预后特征 | 首次在单细胞分辨率下表征骨肉瘤中免疫原性细胞死亡特征的细胞类型特异性分布，并基于此构建预后模型，结合多种实验验证了关键基因NAP1L1的作用 | 需要进一步的前瞻性验证来确认该预后特征的临床应用价值 | 探索骨肉瘤中免疫原性细胞死亡相关的细胞异质性及其临床意义，并构建预后模型 | 骨肉瘤患者样本中的肿瘤细胞、巨噬细胞、免疫细胞及间质细胞 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序、转录组分析、机器学习 | 加权基因共表达网络分析、集成机器学习 | 基因表达数据、临床随访数据 | 11例骨肉瘤样本（单细胞RNA测序）；训练集TCGA-TARGET、验证集GSE16091与GSE21257 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2149 | 2026-06-17 |
Decoding the human PBMC isonome: isoform-level resolution with single-cell long-read transcriptomics
2026, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2026.1782221
PMID:42283034
|
研究论文 | 利用单细胞长读长转录组学解析人类PBMC异构体组（isonome） | 首次使用改良的微流控-free PIPseq流程与牛津纳米孔长读长测序技术，构建了迄今最大规模的单个供体人类外周血单核细胞长读长单细胞数据集，能够检测到巨核细胞；发现了126个来自已知和新基因的新型异构体，并揭示了它们在不同细胞类型中的特异性表达模式 | NA | 在异构体水平上研究人类免疫细胞的多样性和疾病机制，并定义细胞类型 | 人类外周血单核细胞（PBMCs） | 数字病理学 | NA | 单细胞长读长RNA测序 | NA | 转录组数据 | 单个供体的PBMC样本 | Oxford Nanopore Technologies | 单细胞RNA测序 | Oxford Nanopore MinION/GridION | 改良的PIPseq工作流程结合牛津纳米孔长读长测序 |
| 2150 | 2026-06-16 |
Ligand-based directed differentiation to produce granulosa-like cells expressing steroidogenic enzyme genes
2026-Aug, Stem cell research
IF:0.8Q4
DOI:10.1016/j.scr.2026.103978
PMID:41966789
|
研究论文 | 报道一种基于配体的快速分化方案，将人类诱导多能干细胞分化为表达类固醇生成酶基因的颗粒样细胞 | 提出5天快速分化方案，通过配体诱导实现hiPSC向颗粒样细胞分化，并利用单细胞RNA测序鉴定细胞标志物和新基因 | HSD17B1表达水平低，表明产生的是未成熟颗粒细胞表型 | 生成颗粒样细胞以模拟人类性腺发育和测试药物对卵巢的影响 | 人类诱导多能干细胞（hiPSCs） | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 未具体说明样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2151 | 2026-06-16 |
Targeting keratin 6 A overcomes gemcitabine resistance by restoring equilibrative nucleoside transporter 1 and TAM-mediated metabolic compensation in pancreatic cancer
2026-Jul, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy
IF:15.8Q1
DOI:10.1016/j.drup.2026.101404
PMID:42013581
|
研究论文 | 本研究发现角蛋白6A通过抑制ENT1介导的药物摄取和促进MIF-CD74/CD44轴驱动的TAM-M2极化及胞苷富集微环境，驱动胰腺癌吉西他滨耐药，并开发了靶向递送siKRT6A的脂质纳米载体以恢复化疗敏感性 | 首次揭示KRT6A通过调控ENT1和TAM介导的代谢补偿双重机制驱动吉西他滨耐药，并开发了cRGD修饰的脂质纳米载体实现肿瘤靶向siRNA递送 | TAM-M2或胞苷的拯救实验仅部分逆转抗肿瘤效果，提示可能存在其他耐药机制；临床样本量较小（n=90） | 鉴定胰腺癌吉西他滨耐药的关键驱动因子并开发靶向增敏策略 | 吉西他滨耐药胰腺癌细胞、胰腺癌患者组织样本（含90例吉西他滨治疗队列）、异种移植模型小鼠 | 机器学习 | 胰腺癌 | 空间转录组学,单细胞转录组学,RT-qPCR,组织芯片分析,多组学分析 | NA | 基因表达数据,空间转录组数据,单细胞转录组数据 | 90例吉西他滨治疗患者组织样本 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2152 | 2026-06-16 |
Sonodynamic Therapy Attenuates TLR4/NF-κB Signaling in Epicardial Adipose Tissue of Atrial Fibrillation: Insights From Animal Models, scRNA-seq, and Mendelian Randomization
2026-Jun-01, Journal of cardiovascular pharmacology
IF:2.6Q2
DOI:10.1097/FJC.0000000000001825
PMID:41955609
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研究论文 | 本研究通过动物模型、单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析，探讨了声动力疗法通过调节TLR4/NF-κB信号通路减轻心房颤动患者心外膜脂肪组织炎症的机制 | 首次将声动力疗法用于靶向心外膜脂肪组织炎症以治疗心房颤动，并结合单细胞测序和孟德尔随机化验证关键靶基因CXCL8与AF风险的因果关系 | NA | 探究声动力疗法通过减少巨噬细胞介导的心外膜脂肪组织炎症来缓解心房颤动的效果及临床转化潜力 | 兔心房颤动模型的心外膜脂肪组织以及人类心外膜脂肪和右心耳组织 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、孟德尔随机化分析 | NA | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | 兔模型（伪手术组、起搏组和声动力治疗组）及人类心外膜脂肪组织和右心耳样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'转录组测序 |
| 2153 | 2026-06-16 |
Single-cell transcriptomics and machine learning identify RNF144B and C5AR1 as immune-related molecular signatures and therapeutic targets in myocardial infarction
2026-Jun, Genes & genomics
IF:1.6Q3
DOI:10.1007/s13258-026-01753-z
PMID:41984330
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research paper | 结合单细胞转录组学与机器学习，鉴定了心肌梗死中RNF144B和C5AR1作为免疫相关分子标志物及治疗靶点 | 通过整合多个转录组数据集与机器学习方法，识别出13个关键基因特征，并利用单细胞数据揭示髓系细胞在心肌梗死发病中的突出作用，以及分子对接预测CCX168为潜在靶向药物 | 转录组数据整合可能受批次效应影响，且动物模型验证结果向临床转化仍需更多验证 | 识别心肌梗死的关键调控基因，阐明其作用机制，并促进诊断和治疗应用 | 心肌梗死患者及小鼠模型的转录组数据和单细胞数据 | machine learning | cardiovascular disease | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | LASSO回归 | 基因表达数据 | 多个转录组数据集及11种心脏细胞类型，小鼠模型 | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2154 | 2026-06-16 |
DGAE: Dynamic Graph Convolutional Network for Multi-Slice Spatial Transcriptomics Alignment and Enhancement
2026 May-Jun, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2026.3682296
PMID:41950130
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研究论文 | 提出基于动态图卷积网络的多切片空间转录组学对齐与增强框架DGAE | 首次将动态图卷积神经网络用于多切片空间转录组学数据对齐和增强，通过K近邻和r半径构建混合图实现跨切片信息融合 | 未明确说明，但动态图结构可能增加计算复杂度和对超参数的敏感性 | 开发一种多切片空间转录组学数据对齐与增强的统一框架 | 多切片空间转录组学数据及其空间分布模式 | 机器学 | NA | 空间转录组学 | 动态图卷积神经网络 | 空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2155 | 2026-06-16 |
The crosstalk between epigenetics and metabolism in the malignant cell
2026-Apr-27, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05082-1
PMID:42043678
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2156 | 2026-06-16 |
Single-cell profiling reveals distinct populations of tumor-associated macrophages and metastatic tumor cells in breast cancer brain metastasis
2026-Apr-25, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08807-w
PMID:42034645
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析乳腺癌脑转移的肿瘤免疫微环境，鉴定与脑转移进展相关的候选调节因子 | 首次在单细胞分辨率下全面解析乳腺癌脑转移中肿瘤相关巨噬细胞和转移性肿瘤细胞的异质性，并发现GABRB3和NRXN1基因突变与患者生存率降低相关 | 样本量较小（7例患者用于单细胞测序，47例用于批量DNA测序），且功能实验仅基于异种移植模型 | 阐明乳腺癌脑转移的分子机制，识别潜在生物标志物和治疗靶点 | 乳腺癌脑转移患者、异种移植小鼠模型 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、批量DNA测序 | NA | 基因组数据、转录组数据 | 7例患者的脑转移组织、邻近肿瘤组织、脑脊液和循环肿瘤细胞；47例患者的原发乳腺肿瘤、外周血和脑转移组织；共131,880个单细胞 | Illumina | 单细胞RNA测序、批量DNA测序 | Illumina NovaSeq | NA |
| 2157 | 2026-06-16 |
Establishment of a prognostic model for hepatocellular carcinoma patients based on bioinformatics analysis and exploration of prognostic biomarker EPPK1
2026-Apr-25, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-48984-4
PMID:42031825
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研究论文 | 基于生物信息学分析建立肝细胞癌预后模型并探索预后生物标志物EPPK1 | 通过整合转录组、蛋白质组和单细胞测序数据，首次发现并验证EPPK1在肝细胞癌中的特异性高表达及其与免疫浸润和空间转录组学的关联 | 研究主要基于公开数据库（如TCGA-LIHC）进行生物信息学分析，体外功能实验验证相对有限，未涉及大规模临床样本的独立验证 | 利用生物信息学方法识别肝细胞癌预后相关基因EPPK1，并评估其作为诊断和预后生物标志物的潜在价值 | 肝细胞癌患者，包括转录组、蛋白质组和单细胞测序数据 | 生物信息学 | 肝癌 | 生物信息学分析, 单细胞测序, 空间转录组学, 免疫浸润分析, 虚拟扰动技术 | NA | 转录组数据, 蛋白质组数据, 单细胞测序数据, 空间转录组数据 | 基于TCGA-LIHC数据集，具体样本数量未在摘要中明确给出 | NA | 单细胞测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2158 | 2026-06-16 |
A tumor microenvironment integrated (TMI) staging system for pancreatic ductal adenocarcinoma based on cancer-associated fibroblast and molecular consensus signatures
2026-Apr-25, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05091-0
PMID:42033556
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研究论文 | 基于癌症相关成纤维细胞和分子共识特征，提出胰腺导管腺癌的肿瘤微环境整合分期系统 | 将肿瘤分子亚型、基质肌成纤维细胞CAF比例与临床分期整合，首次提出TMI分期系统，优于传统AJCC分期，并发现FN1是关键信号蛋白 | TMI分期在风险一致性上弱于AJCC分期，且可能需更大规模验证 | 改进胰腺导管腺癌预后预测系统的准确性 | 胰腺导管腺癌患者的肿瘤组织样本及相关分子数据 | 机器学习 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、分子特征聚类 | NA | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 发现队列320例，验证队列156例 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2159 | 2026-06-16 |
CD71+ erythroid progenitor cells with mitochondrial retention were associated with inferior prognosis among patients with end-stage renal disease
2026-Apr-25, BMC nephrology
IF:2.2Q2
DOI:10.1186/s12882-026-05009-6
PMID:42035018
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研究论文 | 探索终末期肾病（ESRD）患者中CD71+红系祖细胞（EPC）与不良预后（包括心血管疾病和死亡率）的关联 | 首次揭示CD71+EPC在ESRD中通过线粒体滞留和功能障碍参与无效的代偿性髓外造血，并与不良预后相关 | 研究主要基于患者样本和小鼠模型，需要进一步验证结果在更大人群中的适用性 | 阐明ESRD贫血的机制及其与不良预后的关联 | 终末期肾病患者、5/6部分肾切除（PNx）小鼠 | 数字病理学 | 终末期肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据、病理影像 | ESRD患者与健康对照者 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 2160 | 2026-06-16 |
Bibliometric analysis of single-cell RNA sequencing in tumor microenvironment
2026-Apr-24, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05073-2
PMID:42032150
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文献计量学分析 | 对单细胞RNA测序在肿瘤微环境研究中的文献进行计量学分析 | 首次对1999年至2024年间单细胞RNA测序在肿瘤微环境领域的187篇文献进行系统文献计量学分析，揭示了国家、机构和关键词的分布格局 | 仅基于Web of Science核心合集数据库，且数据截止至2024年7月，可能遗漏其他来源的新近文献 | 分析单细胞RNA测序在肿瘤微环境研究中的应用现状，识别研究热点和未来方向 | 187篇关于单细胞RNA测序在肿瘤微环境中应用的文献 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 文献元数据 | 187篇文献 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |