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当前共找到 7593 篇文献，本页显示第 2101 - 2120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2101 | 2026-06-17 |
Aberrant STAT signaling and T cell dysregulation define a targetable pediatric sepsis endotype
2026-Jun-09, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI202867
PMID:42262868
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研究论文 | 该研究通过整合深度免疫表型分析、血浆蛋白质组学、单细胞转录组学和磷酸流式细胞术，在前瞻性队列中识别出儿科脓毒症的一种异常STAT信号和T细胞失调的内型 | 首次定义了由IL-6和IFN-γ驱动的儿科脓毒症T细胞功能障碍内型，并揭示JAK/STAT轴作为免疫调节治疗的潜在靶点 | 信息未明确提供 | 阐明儿科脓毒症中免疫异质性的机制并寻找可靶向治疗的内型 | 88名危重病患儿的免疫细胞和血浆样本 | 数字病理学 | 儿科脓毒症 | 血浆蛋白质组学、单细胞RNA测序、磷酸流式细胞术 | 无监督聚类（对血浆细胞因子进行聚类） | 转录组数据、蛋白质组数据、流式细胞术数据 | 88名危重病患儿 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2102 | 2026-06-17 |
Single-cell spatial transcriptomics of formalin-fixed, paraffin-embedded biopsies reveals colitis-associated cell networks
2026-Jun-09, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI202488
PMID:42262875
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研究论文 | 利用成像型单细胞空间转录组学对福尔马林固定石蜡包埋活检组织进行分析，揭示了与结肠炎相关的细胞网络 | 首次将成像型单细胞空间转录组学应用于临床福尔马林固定石蜡包埋黏膜活检样本，并识别出与维多珠单抗治疗反应相关的两种不同抗性原型 | 未提供 | 探究溃疡性结肠炎病理机制并识别治疗反应生物标志物 | 溃疡性结肠炎患者、免疫检查点抑制剂诱导性结肠炎患者和健康对照者的福尔马林固定石蜡包埋黏膜活检组织 | 数字病理学 | 溃疡性结肠炎 | 成像型单细胞空间转录组学 | 未提供 | 图像 | 包括溃疡性结肠炎患者、免疫检查点抑制剂诱导性结肠炎患者和健康对照者的福尔马林固定石蜡包埋黏膜活检样本 | 10x Genomics | 单细胞空间转录组学 | 10x Xenium | 自定义Xenium基因面板 |
| 2103 | 2026-06-17 |
Single-cell and spatial transcriptomics unveil myeloid-lymphoid cross talk and the dermal immune niche underlying palmoplantar pustulosis
2026-Jun, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2026.01.028
PMID:41740929
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序和空间转录组学揭示掌跖脓疱病中髓系-淋巴系交叉对话及其皮肤免疫微环境 | 首次通过单细胞转录组与空间转录组联合分析，系统描绘PPP进展过程中的免疫动态网络，并鉴定出CCL19+真皮上层淋巴样免疫微环境及CXCL1/6/8-ACKR1信号在诱导中性粒细胞募集中的关键作用 | 样本仅来自足部病变，未涉及手掌部位；功能验证和药物预测尚需进一步实验证实 | 探究掌跖脓疱病的免疫微环境及其发病机制 | 掌跖脓疱病患者的脓疱及非脓疱足部病灶样本 | 数字病理学 | 掌跖脓疱病 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据，空间转录组数据 | 来自PPP患者的脓疱及非脓疱足部病变组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 10x Chromium，10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序平台用于单细胞RNA测序，10x Visium用于高分辨率空间转录组分析 |
| 2104 | 2026-06-17 |
Spatially resolved ex vivo drug response profiling in SMARCB1-deficient sinonasal carcinoma
2026-Jun, EMBO molecular medicine
IF:9.0Q1
DOI:10.1038/s44321-026-00437-1
PMID:42070010
|
研究论文 | 结合单核RNA测序、空间转录组学和离体患者来源组织切片培养，解析SMARCB1缺陷型鼻腔鼻窦癌的瘤内异质性、微环境组织及治疗脆弱性，并发现mTOR抑制剂Sapanisertib能诱导肿瘤坏死并消耗特定恶性细胞亚群 | 首次为SMARCB1缺陷型鼻腔鼻窦癌建立了综合性的离体药物反应图谱，结合单核RNA测序、空间转录组学和患者来源组织切片培养，揭示了肿瘤内异质性和微环境组织，并鉴定出对mTOR抑制剂Sapanisertib敏感的恶性细胞亚群 | 研究主要基于一个指标病例，虽然补充了12例回顾性队列，但样本量仍然较小，可能无法完全代表该罕见肿瘤的多样性 | 解析SMARCB1缺陷型鼻腔鼻窦癌的瘤内异质性和微环境组织，并评估其治疗脆弱性 | SMARCB1缺陷型鼻腔鼻窦癌的肿瘤组织和细胞 | 数字病理学 | 鼻腔鼻窦癌 | snRNAseq, 空间转录组学, 离体组织切片培养 | NA | 单核RNA测序数据, 空间转录组学数据, 组织切片培养数据 | 1例指标病例和12例回顾性队列 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2105 | 2026-06-17 |
anndataR improves interoperability between R and Python in single-cell transcriptomics
2026-Jun-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag288
PMID:42108549
|
研究论文 | anndataR 提升了单细胞转录组学中 R 和 Python 之间的互操作性 | 提供了一个原生 R 包，允许 R 用户直接读取和写入 H5AD 文件，并轻松转换为 SingleCellExperiment 或 Seurat 对象，无需依赖 Python 环境 | 仅描述了对兼容性的严格测试，未明确提及潜在的性能瓶颈或功能局限性 | 解决单细胞转录组数据在 R 和 Python 之间互操作性困难的问题 | H5AD 文件格式及 R 语言环境中的数据处理对象 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞 RNA-seq | NA | NA |
| 2106 | 2026-06-17 |
CeSpGRN: inferring cell-specific gene regulatory networks from single-cell multi-omics and spatial data
2026-Jun-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag324
PMID:42225598
|
研究论文 | 提出了从单细胞多组学和空间数据推断细胞特异性基因调控网络的方法CeSpGRN | 利用核加权高斯图模型实现细胞级别的基因调控网络推断，能有效整合多组学和空间位置信息 | 未明确说明局限性，但可能对数据质量要求高且计算复杂度较大 | 开发可从单细胞RNA-seq、配对scRNA-seq与scATAC-seq或空间转录组数据中推断细胞特异性基因调控网络的方法 | 单细胞多组学和空间转录组数据中的基因调控关系 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA-seq，单细胞ATAC-seq，空间转录组学 | 核加权高斯图模型 | 基因表达、染色质可及性和空间位置数据 | 模拟数据集和多个真实数据集 | NA | 单细胞RNA-seq，单细胞ATAC-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 2107 | 2026-06-17 |
Optimized Preparation of Whole Murine Tumor-Bearing Lung Tissue for Flow Cytometry and Single-Cell RNA-Sequencing
2026-May-22, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/70452
PMID:42258443
|
研究论文 | 提出了一种从荷瘤小鼠肺组织中制备高质量单细胞悬液用于流式细胞术和单细胞RNA测序的优化方案 | 针对肿瘤形成过程中肺组织纤维化和异质性特点，优化了组织灌注、酶消化、机械解离等步骤，实现了>85%的细胞活性率，并有效分离tdTomato标记的肿瘤细胞 | 未提及 | 开发从健康及荷瘤小鼠肺组织中高效制备高活性单细胞悬液的标准化流程 | Kras; tdTomato报告基因小鼠模型中的健康及荷瘤肺组织 | 单细胞转录组学 | 非小细胞肺癌 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据 | Kras; tdTomato报告基因小鼠模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | NA |
| 2108 | 2026-06-17 |
Machine learning-based study on Xin-Pi simultaneous treatment formula via drug nanodelivery systems regulating macrophage polarization and TEAD2/PKM2 synergistic repair strategy in myocarditis
2026-May-17, SLAS technology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.slast.2026.100433
PMID:42150704
|
研究论文 | 利用机器学习与药物纳米递送系统研究心脾同治法通过调控巨噬细胞极化和TEAD2/PKM2协同修复策略治疗心肌炎的分子机制 | 首次系统阐明心脾同治法结合纳米载药系统通过调控巨噬细胞M1/M2极化平衡和TEAD2/PKM2代谢重编程网络修复心肌炎损伤的分子机制，并整合机器学习、单细胞测序、空间转录组学等多维技术 | 研究仅在动物模型中进行，尚需在人类队列和临床试验中验证其临床转化可行性 | 分析心脾同治方纳米载药系统通过调控巨噬细胞极化和TEAD2/PKM2信号通路治疗心肌炎的分子机制 | 心肌炎小鼠模型 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 代谢组学, 蛋白质组学, 网络药理学 | 随机森林, 支持向量机, XGBoost | 图像, 文本 | 心肌炎小鼠模型（具体样本数未提及） | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2109 | 2026-06-17 |
Spatiotemporal dynamics of adoptively transferred stem-like CD8+ T cells in the tumor microenvironment following vaccination
2026-May-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.12.724323
PMID:42182429
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研究论文 | 本研究开发了一种优化过继性T细胞疗法的方法，并利用空间转录组学揭示疫苗接种后干细胞样和效应CD8 T细胞在肿瘤微环境中差异介导肿瘤控制的机制 | 首次结合干细胞样CD8 T细胞过继转移与静脉疫苗接种，利用空间转录组学揭示肿瘤微环境的转录组重塑机制 | NA | 优化过继性T细胞疗法，解析干细胞样CD8 T细胞在肿瘤微环境中的空间动态调控机制 | 肿瘤特异性CD8 T细胞、肿瘤微环境 | 数字病理学 | 癌症 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学平台 |
| 2110 | 2026-06-17 |
Histone H3 lysine 18 lactylation-mediated SULF1 transcription promotes atherosclerosis by regulating endothelial-to-mesenchymal transition
2026-May-13, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvag078
PMID:42126087
|
研究论文 | 该论文研究了组蛋白H3赖氨酸18乳酰化介导的SULF1转录通过调控内皮-间充质转化促进动脉粥样硬化的机制 | 揭示了氧化应激下代谢与表观遗传通过H3K18la和HDAC3的精确串扰调控SULF1转录及EndMT的新机制 | 未提及具体限制 | 探讨SULF1在氧化应激诱导的内皮-间充质转化及动脉粥样硬化中的作用机制 | 内皮细胞、动脉粥样硬化斑块、小鼠模型 | 数字病理学 | 动脉粥样硬化 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 人类颈动脉粥样硬化核心样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2111 | 2026-06-17 |
δ-catenin controls layer-specific transcriptional maturation of astrocytes via Zbtb20
2026-May-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.12.724361
PMID:42182221
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研究论文 | 该研究鉴定了δ-连环蛋白通过Zbtb20控制星形胶质细胞层特异性转录成熟的机制 | 首次揭示δ-连环蛋白作为黏附连接组分连接细胞间相互作用与转录调控，协调神经细胞类型转录成熟，特别是星形胶质细胞的层特异性身份建立 | 未提及具体局限性 | 研究δ-连环蛋白在哺乳动物皮层回路发育中协调神经细胞类型转录成熟的机制 | δ-连环蛋白、Zbtb20转录因子、星形胶质细胞、皮层回路 | 机器学习 | 神经发育障碍 | 单核RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 单核RNA测序、空间转录组学 | 10x Chromium | 10x Chromium单核RNA测序和空间转录组学平台 |
| 2112 | 2026-06-17 |
Integrating single-cell multi-omics and machine learning to reveal triaptosis heterogeneity in clear cell renal cell carcinoma
2026-May-07, Human genomics
IF:3.8Q2
DOI:10.1186/s40246-026-00982-3
PMID:42098870
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研究论文 | 通过整合单细胞多组学和机器学习，揭示透明细胞肾细胞癌中triaptosis异质性，并开发预后基因签名 | 首次在单细胞分辨率下描绘透明细胞肾细胞癌中triaptosis的异质性景观，结合空间转录组学和机器学习构建预后模型 | 未提及具体局限性 | 探究透明细胞肾细胞癌中triaptosis的异质性及其临床意义 | 透明细胞肾细胞癌患者样本中的单细胞、空间转录组及大块转录组数据 | 机器学习 | 肾细胞癌 | 单细胞转录组测序、空间转录组测序、大块转录组分析 | 机器学习 | 单细胞转录组数据、空间转录组数据、大块转录组数据 | 单细胞、空间转录组和大块转录组样本，具体数量未说明 | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 2113 | 2026-06-17 |
Loss of PINK1 impairs mitophagy and accelerates ovarian aging independent of Parkin
2026-05, Free radical biology & medicine
|
研究论文 | 本研究揭示PINK1缺失通过损害线粒体自噬加速卵巢衰老，而Parkin对卵巢生理影响甚微 | 首次发现PINK1独立于Parkin调控卵巢衰老，明确了PINK1缺失导致线粒体自噬障碍和卵巢功能衰退的机制 | 研究基于小鼠模型，尚需在人类卵巢组织中验证PINK1的作用 | 探究PINK1和Parkin在卵巢生理和衰老中的具体作用 | Pink1基因敲除小鼠和Parkin基因敲除小鼠 | 机器学 | 卵巢衰老 | Bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | Pink1敲除小鼠和Parkin敲除小鼠的卵巢组织样本 | NA | Bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2114 | 2026-06-17 |
Exploring the causal relationship between plasma proteins and obstructive sleep apnea: a study using genome-wide Mendelian randomization, single-cell RNA sequencing analysis, and network pharmacology
2026-May, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-026-05087-1
PMID:41711838
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研究论文 | 通过孟德尔随机化、单细胞RNA测序和网络药理学，探索血浆蛋白与阻塞性睡眠呼吸暂停之间的因果关系 | 首次结合双向孟德尔随机化、单细胞转录组测序和网络药理学策略，系统评估血浆蛋白与阻塞性睡眠呼吸暂停的因果关系，并发现62个候选治疗靶点及潜在药物分子 | 未提及具体局限性 | 揭示血浆蛋白与阻塞性睡眠呼吸暂停的因果关系并发现潜在治疗靶点 | 阻塞性睡眠呼吸暂停患者及欧洲人群队列 | 自然语言处理 | 阻塞性睡眠呼吸暂停 | 基因组关联研究,单细胞RNA测序,分子对接模拟 | NA | 基因组数据,转录组数据,蛋白质组数据 | 血浆蛋白数据来自35559人，OSA相关数据来自芬兰生物样本库的欧洲人群 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2115 | 2026-06-17 |
Environmental PET-microplastic exposure and risk of non-alcoholic fatty liver disease: An integrated computational toxicology and multi-omics study
2026-May, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-026-05115-0
PMID:41731169
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研究论文 | 采用综合计算毒理学与多组学方法，系统阐明PET微塑料暴露与非酒精性脂肪性肝病（NAFLD）之间的分子机制关联 | 首次整合网络毒理学、多组学数据和机器学习框架，系统揭示PET纳米塑料暴露与NAFLD发病机制之间的分子联系，并通过SHAP分析和单细胞转录组学识别关键基因及细胞类型特异性表达模式 | 目前公共数据库中缺乏同时包含微塑料暴露测量和转录组谱的临床队列，研究依赖于计算毒理学框架和生物信息学分析 | 阐明PET纳米塑料暴露与非酒精性脂肪性肝病（NAFLD）之间的分子机制关系 | PET微塑料暴露与NAFLD的分子关联机制 | 机器学习 | 非酒精性脂肪性肝病 | 网络毒理学、多组学分析、分子对接、分子动力学模拟 | 机器学习算法（11种算法） | 多组学数据（转录组、单细胞转录组） | 训练集和独立验证集 | NA | NA | NA | NA |
| 2116 | 2026-06-17 |
Guidelines for evaluating endothelial function in vascular tissue
2026-05-01, American journal of physiology. Heart and circulatory physiology
DOI:10.1152/ajpheart.00656.2025
PMID:41801061
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指南 | 本文提供了评估血管组织中内皮功能的指南，整合传统功能检测与现代分子方法 | 首次结合传统肌电图技术与现代组学方法（如单细胞转录组学、蛋白质组学）制定内皮功能评估的统一指南 | 未提及具体局限性，但可能面临技术整合的复杂性和不同实验室之间的标准化挑战 | 建立评估内皮功能的最佳实践，提高研究的严谨性、可重复性和发现能力 | 内皮细胞和血管组织 | 数字病理学 | 心血管疾病 | NA | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 2117 | 2026-06-17 |
A Novel Low-Dimensional Sparse and Low-Rank Representation Method for Single-Cell RNA Sequencing Data Clustering
2026 May-Jun, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2026.3674992
PMID:41843533
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研究论文 | 提出一种名为LDSLRR的新方法，通过整合降维、自表示矩阵构建和聚类过程到端到端模型中，实现单细胞RNA测序数据的精确聚类 | 将降维、自表示矩阵构建和聚类过程整合为一个端到端模型，同时优化三个模块以提高聚类准确性 | 未提及 | 提高单细胞RNA测序数据聚类的准确性 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 不适用 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 低秩表示(LRR)、稀疏约束、非负矩阵分解(NMF) | 基因表达数据 | 不适用 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 不适用 |
| 2118 | 2026-06-17 |
Rudolf Buchheim Award 2026: Toward a ToxAtlas of carbon-based nanomaterials: single-cell RNA sequencing reveals initiating cell circuits in pulmonary inflammation
2026-May, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-026-05170-7
PMID:41848856
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研究论文 | 该论文利用单细胞RNA测序技术构建碳基纳米材料肺部炎症起始细胞图谱 | 首次在单细胞分辨率下系统解析碳基纳米材料暴露后肺部炎症的起始事件及涉及的细胞类型，建立理化性质与细胞特异性炎症反应的关联图谱 | NA | 揭示碳基纳米材料引发呼吸道炎症的起始机制及关键细胞类型 | 碳基纳米材料（类烟尘碳纳米颗粒、柔性双壁碳纳米管、针状多壁碳纳米管）暴露的小鼠肺部细胞 | 数字病理学 | 肺部炎症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 2119 | 2026-06-17 |
Defocus coding and transcriptomic remodeling in the mouse myopic retina
2026-05-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00011.2026
PMID:41910002
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研究论文 | 本研究通过全细胞记录和单细胞RNA测序，揭示了小鼠视网膜如何感知光学离焦并将其转化为调节生长的遗传信号 | 首次发现外侧视网膜的水平细胞而非内侧视网膜的AII无长突细胞对光学离焦有反应，并揭示多巴胺能无长突细胞在不同聚焦状态下受到差异性调控，以及透镜诱导近视视网膜中细胞类型特异性的基因表达重塑 | 未明确指出限制，但研究仅在小鼠模型中进行，可能不完全适用于人类；此外，透镜诱导近视模型可能不能完全模拟自然条件下近视发展的复杂性 | 探究视网膜如何感知聚焦与离焦信号，并将其转化为调控生长的遗传信号，以理解近视的视觉引导性眼球生长机制 | 小鼠视网膜细胞，包括水平细胞、AII无长突细胞、多巴胺能无长突细胞等 | 机器学习 | 近视 | 全细胞记录、单细胞RNA测序 | NA | 电生理数据、单细胞转录组数据 | 小鼠视网膜样本，具体数量在摘要中未明确说明 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 2120 | 2026-06-17 |
Renal involvement in systemic sclerosis
2026-May, Best practice & research. Clinical rheumatology
DOI:10.1016/j.berh.2026.102138
PMID:41946628
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综述 | 系统综述系统性硬化症肾受累的流行病学、病理生理、临床表现、诊断与管理策略，并探讨精准医学、单细胞测序等新兴研究方向 | 整合单细胞测序、分子分型及补体靶向治疗等前沿技术，提出系统性硬化症肾受累的精准医疗新方向 | 未明确说明具体研究样本量及数据来源，可能受限于综述类型对原始数据的整合深度 | 系统性分析系统性硬化症肾受累的全方位特征，指导临床优化管理 | 系统性硬化症患者的肾并发症（包括硬皮病肾危象、肾衰竭、继发性肾损伤） | 数字病理学 | 风湿免疫病 | 单细胞测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |