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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2026-07-25 |
Decoding early lung adenocarcinoma progression by single-cell and spatial transcriptomics reveals a CMA-related prognostic signature
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1875096
PMID:42495647
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 182 | 2026-07-25 |
Reduced CH25H expression defines a high membrane fluidity, trogocytosis active state in colon cancer stem cells
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1834358
PMID:42495718
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 183 | 2026-07-23 |
TimeVault turns vault particles into molecular memory of transcriptional states: how to decode the cellular black box
2026-Dec, Cell cycle (Georgetown, Tex.)
DOI:10.1080/15384101.2026.2639760
PMID:41789510
|
研究论文 | TimeVault通过改造穹窿体颗粒在活细胞内稳定储存内源转录组,实现转录状态的时间记忆,重构细胞分子历史 | 首次将穹窿体颗粒改造为细胞内分子记忆装置,突破传统转录组学仅能提供瞬时快照的局限,实现转录状态的长期存储和回顾性重建 | 未提及具体技术限制,可能需验证对多种细胞类型的普适性和长期存储的稳定性 | 开发细胞内转录组存档技术,连接瞬时基因表达与长期表型结果,揭示因果机制 | 细胞应激反应模型和癌症模型中的细胞转录状态历史 | 分子生物学 | 癌症 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确说明样本数量,涉及细胞应激模型和癌症模型 | NA | NA | NA | NA |
| 184 | 2026-07-23 |
Clonal analysis for understanding fate biases in developing embryos
2026-Aug, Current opinion in genetics & development
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.gde.2026.102475
PMID:42025228
|
综述 | 回顾了结合谱系追踪与单细胞转录组学在理解胚胎发育中命运偏差方面的前沿实验和计算方法 | 重点强调了新兴的空间和基于扰动的克隆生物学策略,这些策略有望揭示发育稳健性的机制 | 未明确提及,但作为综述,可能缺乏原创新发现 | 总结当前结合谱系追踪与单细胞转录组学在研究胚胎发育命运偏差方面的前沿方法 | 发育胚胎中的多能祖细胞及其克隆多样性 | 机器学习 | NA | 谱系追踪, 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 185 | 2026-07-23 |
The emergence of neurogenic lineage motifs in building the vertebrate retina
2026-Aug, Current opinion in genetics & development
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.gde.2026.102479
PMID:42054855
|
综述 | 综述了脊椎动物视网膜发生过程中神经源性谱系基序的形成机制 | 整合了跨发育阶段的单细胞测序研究,发现了具有物种保守性的神经源性谱系基序,揭示了其作为理解细胞类型特化的基本单元 | 未明确讨论其局限性 | 揭示视网膜祖细胞如何产生多样性的视网膜神经元 | 脊椎动物视网膜及其祖细胞 | 自然语言处理 | NA | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组和表观基因组数据 | 多个发育阶段的小鼠和人类视网膜样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 186 | 2026-07-23 |
Single-cell transcriptomics reveals a new marine parasite: Characterization and distribution of Rozellomyces from the Gulf of Alaska
2026 Jul-Aug, Mycologia
IF:2.6Q2
DOI:10.1080/00275514.2026.2631200
PMID:41871174
|
研究论文 | 利用单细胞转录组学描述来自阿拉斯加湾的一种新海洋寄生虫罗兹菌及其分布特征 | 首次基于238个基因的系统发育分析确认一种新的罗兹菌分离株在罗兹菌门中的独特分类地位,并提出将其建立为新属 | 未明确提及局限性,但依赖于metaPR数据库的ASV分布数据可能受限于现有采样覆盖度 | 揭示海洋寄生虫罗兹菌门的多样性、分布和生态作用 | 从阿拉斯加湾分离的新罗兹菌分离株及硅藻宿主 | 数字病理学 | 不适用 | 单细胞转录组学, 系统发育分析 | 不适用 | 转录组数据, 宏条形码序列数据 | 1个分离株及多个环境样本(来自metaPR数据库) | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 不适用 |
| 187 | 2026-07-23 |
Recent advances in multimodal approaches for investigating placental development and related diseases
2026-06-12, Placenta
IF:3.0Q2
DOI:10.1016/j.placenta.2025.05.004
PMID:40374418
|
综述 | 该综述总结了多模态方法在胎盘发育及相关疾病研究中的最新进展 | 整合了先进影像、单细胞与空间组学及人工智能的多模态策略,并重点介绍中国研究团队开发的创新平台和临床工具 | 包括数据标准化、人工智能模型的可解释性以及伦理考量等挑战 | 综述多模态方法在胎盘发育和疾病研究中的应用,推动精准产科和个体化妊娠护理 | 胎盘发育及相关疾病(如子痫前期、胎儿生长受限、胎盘植入谱系障碍) | 计算机视觉 | 子痫前期, 胎儿生长受限, 胎盘植入谱系障碍 | 超声, MRI, 单细胞转录组学, 空间组学 | NA | 影像, 文本 | NA | NA | 单细胞转录组学, 空间组学 | NA | NA |
| 188 | 2026-07-23 |
Function of chemokines in embryo implantation
2026-06-12, Placenta
IF:3.0Q2
DOI:10.1016/j.placenta.2025.07.092
PMID:40769846
|
综述 | 综述趋化因子在胚胎着床过程中的功能,包括调控免疫微环境重塑、滋养层侵袭和母胎免疫耐受 | 系统整合了趋化因子网络在胚胎着床关键过程中的作用,并强调了单细胞测序、微流控和人工智能等新技术在解码趋化因子介导的调控中的应用,为精准诊疗提供基础 | NA | 总结趋化因子在胚胎着床中的功能,揭示其在母胎免疫稳态维持中的核心作用,为生殖免疫学提供理论基础 | 胚胎着床过程中的趋化因子网络、免疫微环境、滋养层细胞、蜕膜基质细胞 | NA | 生殖疾病 | 单细胞测序、微流控、人工智能 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 189 | 2026-07-23 |
Endothelial cells recruit pro-inflammatory macrophage clusters via App-Cd74 exacerbating ICI-associated myocarditis
2026-05, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2026.111238
PMID:41905617
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示内皮细胞通过App-Cd74轴招募促炎性巨噬细胞簇加剧ICI相关心肌炎 | 首次在ICI相关心肌炎小鼠模型中鉴定出共表达Cxcl9和Cxcl10的促炎性巨噬细胞亚群,并发现内皮细胞通过App-Cd74信号轴与该亚群相互作用,为ICI心肌炎的免疫病理机制提供了新视角 | NA | 阐明ICI相关心肌炎的免疫病理机制,寻找潜在治疗靶点 | 小鼠ICI心肌炎模型的心脏组织 | 单细胞测序, 免疫学 | ICI相关心肌炎 | 单细胞RNA测序, 深度学习框架scTenifoldXct | scTenifoldXct | 单细胞转录组数据 | 小鼠ICI心肌炎模型的心脏组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 190 | 2026-07-23 |
COVARE for modeling latent random effect correlations to detect genes with specific spatial expression patterns
2026-05, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2026.111242
PMID:41941898
|
研究论文 | 提出COVARE方法,基于线性混合效应模型建模潜在随机效应相关性,以检测具有特定空间表达模式的基因 | 首次在线性混合效应模型框架下整合多种先验生物学信息并考虑协变量间的潜在交互作用,实现对基因空间表达的多因素共调控的精确分析 | 未提及具体局限性 | 开发一种能够检测空间可变基因并考虑协变量交互效应的新方法 | 基因的空间表达模式及细胞微环境中的协变量交互效应 | 机器学习 | NA | 空间转录组学 | 线性混合效应模型 | 空间转录组数据 | 使用了公共数据集进行模拟和分析,未说明具体样本量 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 191 | 2026-07-23 |
OMICX: An AI-powered web platform for integrative analysis of multi-condition single-cell transcriptomics data
2026-05, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2026.111243
PMID:41941899
|
研究论文 | 介绍了一个名为OMICX的基于AI的Web平台,用于多条件单细胞转录组数据的综合分析 | 搭载大型语言模型助手OMICX-Agent,用户可通过自然语言对话进行高级单细胞数据分析,无需编程技能 | 未明确提及局限性 | 开发一个交互式、无需编程的Web平台,使研究者能够通过自然语言对话进行单细胞数据的综合分析 | 单细胞RNA测序数据、批量RNA测序数据、GWAS汇总统计数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 大型语言模型 | 文本 | 三个真实案例研究 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 192 | 2026-07-23 |
Tumor Matrix Proteoglycan Accumulation and Processing Alter T-cell Effector Function and the Response to Immunotherapy in Patients with Oligometastatic Colorectal Cancer
2026-May-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-25-2780
PMID:41671077
|
研究论文 | 本研究探讨了肿瘤基质蛋白聚糖versican(VCAN)在少转移性结直肠癌患者中的积累和加工如何影响T细胞效应功能及免疫治疗反应 | 首次在前瞻性临床试验中评估VCAN对免疫监视和免疫治疗反应的影响,并发现VCAN的蛋白水解产物versikine与CD8+ T细胞效应表型及临床预后改善相关 | 样本量较小(15例),仅涉及微卫星稳定的少转移性结直肠癌患者,且VCAN蛋白水解表型与获益趋势的相关性未达到统计学显著性 | 评估VCAN在少转移性结直肠癌免疫监视和免疫治疗反应中的作用 | 结直肠癌患者(243例跨分期组织样本,15例微卫星稳定少转移性结直肠癌患者) | 机器学习和数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本和单细胞RNA测序数据 | 243例组织样本(跨分期)和15例微卫星稳定少转移性结直肠癌患者 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序 |
| 193 | 2026-07-23 |
CD14+CD16- monocytes exhibit NF-κB hyperactivation in biliary atresia: Clinical association and murine therapeutic validation
2026-May-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000941
PMID:41974027
|
研究论文 | 该研究探讨了胆道闭锁中经典单核细胞(CD14+CD16-)的NF-κB过度激活及其在胆管损伤中的作用,并通过小鼠模型验证了治疗潜力 | 首次揭示CD14+CD16-单核细胞在胆道闭锁患者胆管损伤区域的空间富集及其NF-κB通路的过度激活,并利用恒河猴轮状病毒诱导的BA小鼠模型验证了靶向单核细胞或NF-κB轴的治疗策略 | NA | 阐明经典单核细胞在胆道闭锁发病机制中的具体作用,尤其是NF-κB信号通路的调控机制 | 胆道闭锁患者和对照组的肝脏组织及血液样本,以及恒河猴轮状病毒诱导的BA小鼠模型 | 计算机视觉 | 胆道闭锁 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、免疫荧光、RNA测序、细胞因子分析 | NA | 基因表达数据、图像数据 | 胆道闭锁患者和对照组肝脏组织及血液样本,以及恒河猴轮状病毒诱导的BA小鼠 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium用于单细胞RNA测序, Illumina NovaSeq用于RNA测序 |
| 194 | 2026-07-23 |
The B7 family subgroup reflects tumor cell heterogeneity and patient post-operative prognosis in gallbladder cancer
2026-Apr-18, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-026-00802-7
PMID:42001193
|
research paper | 通过单细胞分辨率揭示B7家族亚群在胆囊癌中的肿瘤细胞异质性和患者术后预后 | 首次在单细胞水平上解析胆囊癌中B7家族免疫检查点分子CD276、VTCN1和HHLA2的表达及其下游信号,并构建整合这三个分子表达与肿瘤大小和分化的梯度提升机模型用于术后风险分层 | 样本量相对较小(7例原发肿瘤用于单细胞测序,188例用于生存建模),且研究仅聚焦于B7家族分子,可能未完全涵盖其他免疫相关因素 | 阐明胆囊癌细胞的生物异质性并改进术后风险分层 | 胆囊癌患者肿瘤细胞 | machine learning | gallbladder cancer | scRNA-seq | GBM | gene expression data | 7例原发肿瘤用于单细胞测序,188例手术治疗的胆囊癌患者 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 195 | 2026-07-23 |
CD73high fibroblasts orchestrate keratinocyte inflammation in the psoriasis-associated epithelial immune microenvironment
2026-Apr-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71323-0
PMID:41957361
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研究论文 | 通过对银屑病患者皮肤进行代谢组学、单细胞和空间转录组学分析,发现CD73高表达的成纤维细胞通过腺苷信号调控角质形成细胞炎症,揭示成纤维细胞-角质形成细胞互作在银屑病发病中的关键作用 | 首次揭示CD73高表达成纤维细胞通过腺苷代谢途径介导成纤维细胞与角质形成细胞间的互作,驱动银屑病上皮免疫微环境炎症,为靶向代谢微环境治疗炎症性皮肤病提供新思路 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,其结论在人体内的普适性及长期临床转化效果仍需进一步验证 | 探究银屑病上皮免疫微环境中代谢失调的免疫机制及下游后果 | 银屑病患者皮肤组织、咪喹莫特和IL-23A诱导的小鼠皮肤炎症模型 | 机器学习 | 银屑病 | 代谢组学, 单细胞转录组学, 空间转录组学, 基因敲除, 药理学抑制 | NA | 转录组数据, 图像数据 | 银屑病患者皮肤组织样本(数量未明确说明),以及咪喹莫特和IL-23A诱导的小鼠样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium用于单细胞RNA测序,10x Visium用于空间转录组学分析 |
| 196 | 2026-07-23 |
Impact of OMICS Technologies in Our Understanding of the Pathogenesis of Peri-Implantitis
2026-Apr, Clinical and experimental dental research
IF:1.7Q3
DOI:10.1002/cre2.70350
PMID:41973972
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综述 | 评估组学技术对理解种植体周围炎发病机制中宿主免疫方面的贡献 | 通过多组学整合分析揭示种植体周围炎作为宿主-微生物分子生态系统的多层特征,并识别出免疫失调、细胞外基质破坏和组织重塑等汇聚通路 | 缺乏大规模队列研究和功能验证,需要更多临床转化支持 | 从宿主免疫角度评估组学技术对理解种植体周围炎发病机制的贡献 | 种植体周围炎的发病机制及其宿主免疫反应 | 机器学习 | 口腔疾病 | 基因组学、表观基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学、RNA测序、单细胞和空间转录组学、多组学 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 197 | 2026-07-23 |
The Evolution of Spatial Omics Technologies Introduces A Novel Avenue for Lung Cancer Research
2026-Mar-27, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzag010
PMID:41619173
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综述 | 综述空间组学技术的发展及其在肺癌研究中的应用,包括肿瘤异质性、进展机制和生物标志物发现 | 系统总结了空间组学技术在肺癌研究中的最新应用,并提出了将空间组学整合到肺癌研究中的策略,为精准医学提供新视角 | 当前空间组学技术仍存在技术限制,如分辨率、通量和数据分析算法的挑战 | 探讨空间组学技术在肺癌研究中的应用,以理解肿瘤生态系统和异质性 | 肺癌肿瘤生态系统,包括肿瘤细胞和微环境 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间组学技术 | NA | 空间组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 198 | 2026-07-23 |
Metabolic RNA Labeling-Enabled Time-Resolved Single-Cell RNA Sequencing
2026-Mar-17, Accounts of chemical research
IF:16.4Q1
DOI:10.1021/acs.accounts.6c00010
PMID:41758996
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综述 | 本文综述了利用代谢RNA标记实现时间分辨单细胞RNA测序的最新进展,重点讨论了Well-TEMP-seq、scDUAL-seq和Dyna-vivo-seq等方法 | 提出基于大小排阻和局部准静态水动力学的Well-TEMP-seq方法提高了通量和效率;开发scDUAL-seq双核苷酸标记策略同步监测RNA合成与降解;开创体内代谢RNA标记的单细胞RNA测序(Dyna-vivo-seq)研究活体动物模型 | 化学工具在单细胞RNA动力学分析中仍存在局限性,需进一步改善 | 实现单细胞水平时间分辨的RNA动力学分析,揭示异质性和动态基因表达调控 | 单细胞转录组及RNA合成与降解动力学 | 数字病理学 | 不适用 | 代谢RNA标记、单细胞RNA测序 | 不适用 | RNA序列数据 | 不适用 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | Well-TEMP-seq, scDUAL-seq, Dyna-vivo-seq | 基于大小排阻和局部准静态水动力学的微孔板平台 |
| 199 | 2026-07-23 |
Tissue-Specific High-Quality Protoplast Isolation for Single-Cell Analyses in Arabidopsis
2026-02-06, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/69330
PMID:41729799
|
研究论文 | 提出一套从拟南芥多种组织中高效分离高质量原生质体的方案,为单细胞RNA测序等应用提供可靠细胞来源 | 针对不同组织(地上部分和根)的生理特性,系统优化了酶解消化和纯化步骤,确保原生质体高产且代表多种细胞类型 | NA | 建立一套可重复的原生质体分离方案,支持植物单细胞分析应用 | 拟南芥的叶片、茎、花和根组织 | 数字病理学 | NA | NA | NA | 细胞 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 200 | 2026-07-23 |
CREB5 Inhibits Neuronal Ferroptosis via Transactivating ApoL6 to Regulate Lipid Droplet Metabolism After Spinal Cord Injury
2026-02, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1002/cns.70783
PMID:41700484
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研究论文 | 该研究揭示了转录因子CREB5通过反式激活ApoL6调控脂滴代谢,从而抑制脊髓损伤后神经元铁死亡的分子机制 | 首次发现CREB5通过调控ApoL6的转录活性影响脂滴分解,进而抑制神经元铁死亡,为脊髓损伤治疗提供了新靶点 | 研究主要基于小鼠模型,在人类患者中的验证尚需进一步探索;部分机制细节如CREB5表达先升后降的调控机制未完全阐明 | 阐明CREB5在脊髓损伤后抑制神经元铁死亡中的分子和细胞机制 | 小鼠脊髓损伤模型及体外原代神经元 | 机器学习和数字病理学 | 脊髓损伤 | scRNA-seq, scATAC-seq | NA | 单细胞基因表达数据,单细胞染色质可及性数据 | 小鼠脊髓损伤模型样本及体外原代神经元实验样本(具体数量未明确提及) | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq,单细胞ATAC-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序和单细胞ATAC-seq |