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当前共找到 9342 篇文献，本页显示第 181 - 200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2026-09-23 |
Reference-informed spatial domain detection using weak supervision for spatial transcriptomics
2026-Jun-22, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.281260.125
PMID:42236081
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研究论文 | 提出GraphScrDom，一种基于参考信息的弱监督对比学习模型，结合专家标注的涂鸦和参考单细胞RNA-seq数据，用于空间转录组学的组织分割 | 首次将专家提供的涂鸦标注与参考单细胞RNA-seq数据整合到弱监督对比学习框架中，实现空间域检测，并在多种空间转录组平台和分辨率上优于现有方法 | 依赖于专家提供的涂鸦标注和参考单细胞RNA-seq数据，可能受标注质量和参考数据匹配度的影响 | 开发一种参考信息驱动的弱监督对比学习方法，用于空间转录组学中的空间域检测和组织分割 | 空间转录组数据、组织切片、专家标注、参考单细胞RNA-seq数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | 对比学习模型 | 图像、文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 182 | 2026-09-23 |
An Integrated muti-omics cell atlas of the human trabecular meshwork and ciliary body
2026-Jun-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.17.732980
PMID:42395492
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研究论文 | 该研究构建了人类小梁网和睫状体的空间多组学细胞图谱，整合了超过一百万细胞和细胞核的单细胞转录组、单核转录组、单核ATAC及空间转录组数据，揭示了眼压调控和青光眼易感性的细胞与遗传机制 | 首次构建了跨112个供体、超过一百万细胞和细胞核的人类小梁网和睫状体空间多组学图谱，整合了snRNA-seq、scRNA-seq、snATAC-seq和Xenium空间转录组，发现了未被充分表征的成纤维细胞和上皮细胞亚群，并将青光眼遗传位点与细胞类型特异性调控元件相关联 | 未在摘要中明确提及研究局限性 | 构建人类小梁网和睫状体的高分辨率多组学细胞图谱，阐明细胞异质性、调控程序及其与青光眼遗传易感性的关系 | 人类小梁网和睫状体组织，来自112个供体 | 数字病理学, 机器学习 | 青光眼 | 单核RNA测序, 单细胞RNA测序, 单核ATAC测序, 空间转录组学 | NA | 图像, 文本 | 112个供体，超过一百万细胞和细胞核 | 10x Genomics | single-cell RNA-seq, single-cell ATAC-seq, spatial transcriptomics | 10x Chromium, 10x Xenium | 10x Chromium单细胞/单核转录组和ATAC建库平台，10x Xenium空间转录组平台 |
| 183 | 2026-09-23 |
pyVIPER: a fast and scalable Python package for protein activity estimation and master regulator analysis of single-cell RNA sequencing data
2026-Jun-22, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-026-06524-x
PMID:42332576
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研究论文 | 介绍了一个基于Python的快速可扩展工具pyVIPER，用于单细胞RNA测序数据中的蛋白质活性推断和主调控因子分析 | 开发了基于Python的pyVIPER工具，支持灵活的数据转换/后处理模块、富集分析算法，具有新的基因调控网络数据结构，利用PyTorch GPU加速和优化核心操作，相比R版本VIPER运行效率提升数个数量级 | 摘要中未明确提及该工具的局限性 | 解决单细胞RNA测序数据规模增长带来的可扩展性分析需求，实现大规模单细胞数据集的蛋白质活性推断 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | VIPER算法 | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 184 | 2026-09-23 |
Spatial Orchestration of Skin Fibrosis by a CD8+ T cell- Myofibroblast Axis
2026-Jun-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.17.732787
PMID:42395449
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研究论文 | 本文通过多模态单核和空间转录组学技术，揭示了CD8+ T细胞与肌成纤维细胞轴在皮肤纤维化中的空间调控机制，并在小鼠模型中验证了CD8+ T细胞在纤维化过程中的关键驱动作用 | 首次通过多模态单核和空间转录组学揭示了CD8+ T细胞驱动的纤维化在皮肤纤维化疾病中的核心作用，发现了炎症组织域中CD8+ T细胞与ADAM12表达的炎症性成纤维细胞和肌成纤维细胞的紧密共定位关系，并证明了靶向CD8+ T细胞可改善纤维化 | 研究主要聚焦于硬斑病和嗜酸性筋膜炎，对其他类型纤维化皮肤疾病的适用性尚需进一步验证；小鼠模型采用博来霉素诱导，与人类自身免疫性纤维化的病理机制可能存在差异 | 探究纤维化皮肤疾病中免疫驱动因素以及促纤维化成纤维细胞亚群的身份和空间定位，特别是CD8+ T细胞在皮肤纤维化中的作用机制 | 硬斑病（morphea）和嗜酸性筋膜炎（EF）患者的纤维化皮肤组织样本，以及博来霉素诱导的小鼠纤维化模型 | 数字病理学 | 皮肤纤维化 | 单核RNA测序，空间转录组学 | NA | 图像，文本 | NA | 10x Genomics | single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium Single Cell 3', 10x Visium Spatial Gene Expression |
| 185 | 2026-09-23 |
Benchmarking cell type annotation in spatial transcriptomics: resolving cellular hierarchies, biological fidelity, and dynamic cell states
2026-Jun-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.16.732716
PMID:42395478
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研究论文 | 该文章对20种最先进的细胞类型注释方法在四个空间转录组学数据集上进行了系统性基准测试，评估其在细胞层级解析、生物学保真度和动态细胞状态方面的表现 | 首次在多个空间转录组学数据集上系统性地基准测试20种细胞类型注释方法，涵盖基于参考和无参考两类方法，不仅评估传统分类指标，还引入结构感知指标来评估高阶生物学组织的保留程度 | 许多方法在细粒度亚型注释和稀有细胞群恢复方面仍面临挑战，特别是在捕捉损伤、修复、发育和再生等连续细胞状态转换过程的数据集中，高分类准确率不一定对应全局细胞关系的保留或生物学连贯的下游通路分析 | 系统评估和比较当前空间转录组学中细胞类型注释方法的性能，为研究人员根据具体生物学问题、数据集特征和分析优先级选择合适方法提供实用指导 | 四个空间转录组学数据集，涵盖不同技术平台、实验条件、细胞数量和基因面板大小，所有数据集均包含专家 curated 的细胞类型标签 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | scANVI, Seurat, TACCO等多种注释模型 | 空间转录组学数据（含基因表达和空间信息） | 四个空间转录组学数据集，包含多种细胞数量和基因面板大小 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 186 | 2026-09-23 |
Macrophage EHD1 Promotes Inflammation and Stabilizes Sortilin to Accelerate Atherosclerosis
2026-Jun-19, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.125.327751
PMID:42165151
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研究论文 | 本文研究了巨噬细胞中EHD1在动脉粥样硬化中的作用，发现EHD1通过促进TNFR2的胞吞循环再循环和稳定sortilin来促进炎症和加速动脉粥样硬化 | 首次揭示EHD1在巨噬细胞中通过调控TNFR2的胞吞再循环和稳定sortilin来促进炎症和动脉粥样硬化进展的新机制 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 探索内吞调节因子EHD1在巨噬细胞免疫应答中的作用及其对动脉粥样硬化进展的贡献 | 小鼠和人类的动脉粥样硬化斑块中的巨噬细胞、骨髓来源的巨噬细胞、Ehd1-/-小鼠和Ldlr-/-小鼠 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、免疫荧光染色、骨髓移植、内吞实验 | NA | 图像、文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 187 | 2026-09-23 |
Cross-Modality Alignment of Spatial Transcriptomics, Multiplexed Imaging, and Histology with PHARAOH
2026-Jun-19, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-9954002/v1
PMID:42370255
|
研究论文 | 提出PHARAOH分层框架，实现空间转录组学、多重成像和组织学的跨模态对齐，通过全局结构对齐和自动核标志点锚定，在最小用户输入下精确转移坐标 | 结合全局结构对齐与自动核标志点锚定，无需人工标志点，实现细胞分辨率精度的跨模态对齐，并适用于相邻组织切片和多重免疫荧光成像 | 未明确说明 | 实现空间转录组学、多重成像和组织学之间的精确跨模态对齐，以支持空间背景下的分子分析 | 多种组织类型、成像平台和染色条件下的空间转录组学数据、多重成像和组织学图像 | 数字病理学, 空间转录组学 | NA | 空间转录组学, 多重成像, 组织学染色 | NA | 图像 | 多种组织类型和成像平台，具体数量未说明 | NA | 空间转录组学, 多重免疫荧光成像 | NA | NA |
| 188 | 2026-09-23 |
Dual-functional Nanocarrier for Improved Immunochemotherapy of Acute Myeloid Leukemia
2026-Jun-18, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-9901177/v1
PMID:42370261
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研究论文 | 该文章设计了一种超小尺寸（约15纳米）的基于阿糖胞苷的聚合物胶束纳米载体（PAraC），用于共递送阿糖胞苷、柔红霉素和TLR7/8激动剂R848，以改善急性髓系白血病的免疫化疗效果。 | 开发了超小尺寸（约15 nm）的PAraC聚合物胶束纳米载体，实现AraC、Daun和R848的三药智能共递送，并通过scRNA-seq和真实世界数据集分析发现恶性AML细胞中TLR7/8上调，为联合TLR7/8激动剂提供依据。 | 摘要中未明确提及研究的局限性。 | 克服急性髓系白血病治疗中的耐药性和免疫逃逸问题，提高免疫化疗效果。 | 急性髓系白血病（AML）细胞、小鼠模型、患者来源异种移植（PDX）AML模型以及AraC耐药的急性淋巴细胞白血病（ALL）模型。 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和真实世界数据集分析 | NA | 文本、图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 189 | 2026-09-23 |
A Counterfactual Framework for Directional Cell-Cell Interaction Analysis in Spatial Transcriptomics
2026-Jun-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.05.716510
PMID:42005861
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研究论文 | 提出一种基于反事实干预的框架，用于在空间转录组学中推断有向细胞-细胞影响，无需配体-受体先验知识 | 首次引入反事实干预框架推断有向细胞-细胞影响，不依赖配体-受体对，可检验发送者特异性，并定义反事实方向性评分（CDS）量化方向性影响 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 开发一种统计严谨且可扩展的有向细胞-细胞通讯分析方法，明确检验方向性 | 胆管癌组织微阵列中的肿瘤、免疫和基质细胞 | 空间转录组学 | 胆管癌 | 空间转录组学 | 邻域条件图模型 | 空间转录组数据 | 38个组织芯片核心 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium | Xenium空间转录组平台 |
| 190 | 2026-09-23 |
Deep Cellular and Spatial Profiling of the Mouse Spinal Cord Reveals Sex-Specific Neuron Types and the Ascending Projection Neuron Repertoire
2026-Jun-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.11.731752
PMID:42367914
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研究论文 | 该研究通过逆行病毒追踪、空间转录组学和多组学分析超过75万个小鼠脊髓神经元，揭示了性别特异性神经元类型和上行投射神经元库 | 识别了78个上行脊髓投射神经元类别和超过500个解剖和转录组上不同的神经元类型，发现了性别特异性脊髓神经元，并构建了细胞类型到表型的映射 | 研究仅限于小鼠模型，可能无法完全反映人类脊髓的复杂性；样本主要为小鼠，未涉及其他物种 | 定义脊髓的输出逻辑和功能细胞库，理解其细胞多样性如何实现功能 | 小鼠脊髓神经元 | 神经科学 | NA | 空间转录组学, 多组学分析, 逆行病毒追踪 | NA | 图像, 文本 | 超过750,000个小鼠脊髓神经元 | 10x Genomics | 空间转录组学, 单细胞多组学 | 10x Visium, 10x Chromium | 10x Visium 空间转录组学, 10x Chromium 单细胞多组学 |
| 191 | 2026-09-23 |
An intraocular oxygenated emulsion suppresses retinal fibrosis by inhibiting hypoxia-driven bioenergetic shifts and mesenchymal transformation
2026-Jun-12, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-9888803/v1
PMID:42326539
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和开放性眼球损伤模型，揭示了缺氧是视网膜纤维化的关键驱动因素，并证明玻璃体内注射过饱和氧乳剂可抑制缺氧驱动的生物能量转变和间充质转化，从而减轻视网膜纤维化 | 首次通过单细胞RNA测序揭示人PVR膜中主要细胞群体缺氧响应程序的汇聚激活；利用分子探针在开放性眼球损伤模型中直接验证了空间和时间上的缺氧；提出玻璃体内局部氧合（过饱和氧乳剂）作为预防纤维化视力丧失的可行治疗策略 | 摘要中未明确提及研究的具体局限性 | 探索缺氧在视网膜纤维化中的作用机制，并评估局部眼内氧合作为预防纤维化视力丧失治疗策略的可行性 | 人PVR膜、开放性眼球损伤模型、人视网膜色素上皮细胞、原代人PVR细胞培养物 | 数字病理学 | 眼科疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 192 | 2026-09-23 |
Genome-wide association and multi-omics functional screens reveal the genetic architecture of foveal development
2026-Jun-12, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.64898/2026.06.11.26355452
PMID:42326794
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研究论文 | 通过全基因组关联研究、多组学功能筛选和斑马鱼模型，揭示了中央凹发育的遗传结构。 | 首次对中央凹发育不全进行全基因组关联研究，结合多组学功能筛选和斑马鱼模型，建立了首个脊椎动物疾病模型，并整合人类胎儿单细胞和空间转录组学。 | 未明确提及 | 揭示中央凹发育的遗传结构，并建立可操作的中央凹疾病模型。 | 中央凹发育不全患者、斑马鱼、人类胎儿组织 | 机器学习 | 眼科疾病 | 全基因组关联研究, 多组学功能筛选, CRISPR敲除, 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 图像数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 193 | 2026-09-23 |
MipSScs: Artificial neural network-based data integration of 2D/3D single-cell spatial RNA sequence data from virus-infected human cerebral organoids
2026-Jun-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.08.727881
PMID:42327098
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研究论文 | 该文章利用人工神经网络（多层感知机）整合2D和3D单细胞空间RNA测序数据，研究病毒感染的人脑类器官，以推断阿尔茨海默病相关的转录组效应 | 首次使用多层感知机（MLP）进行2D/3D单细胞空间转录组数据的跨平台整合，并以交叉2D/3D平台比较作为基准评估人工神经网络模型，成功将脑类器官细胞类型映射到成人死后脑细胞类型 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 利用人工神经网络进行2D/3D单细胞空间RNA测序数据的整合，以推断与阿尔茨海默病相关的病毒感染引起的转录组效应 | HSV-1感染的2D解离人脑类器官细胞（dcOrgs）和HSV-1感染的3D人脑类器官（cOrgs），以及人胎儿脑和成人死后脑的单细胞非空间RNA测序数据 | 数字病理学, 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞非空间RNA测序, 单细胞空间RNA测序 | 多层感知机（MLP） | RNA测序数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 194 | 2026-09-23 |
Perturbation of genes linked to common schizophrenia risk variants identifies cilia programs
2026-Jun-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.09.731172
PMID:42327190
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研究论文 | 该研究在小鼠新皮质中利用CRISPR droplet测序（CROP-seq）扰动12个与精神分裂症风险变异相关的基因，并结合单细胞RNA测序，发现纤毛转录程序是汇聚的下游机制 | 首次对精神分裂症常见变异架构的功能后果进行表征，并揭示纤毛功能障碍是汇聚的下游机制 | 研究基于小鼠模型，可能无法完全反映人类精神分裂症的复杂性；仅扰动了12个风险基因 | 探究精神分裂症风险变异通过哪些靶基因、生物学通路和细胞类型发挥作用 | 出生后小鼠新皮质 | 机器学习 | 精神分裂症 | CROP-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | 12个精神分裂症风险基因的扰动实验 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 195 | 2026-09-23 |
Wnt/β-catenin signaling regulates fibrotic atrophy of intra-articular adipose tissue in post-traumatic osteoarthritis
2026-Jun-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.08.730865
PMID:42327266
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研究论文 | 该研究利用二维组织形态计量学、空间转录组学和三维锇酸增强微计算机断层扫描技术，全面分析了创伤后骨关节炎小鼠模型中关节内脂肪组织的时空、结构和转录重塑，揭示了Wnt/β-catenin信号通路和异常机械负荷在驱动关节内脂肪组织纤维化萎缩中的关键作用 | 首次综合运用空间转录组学和三维成像技术系统描绘了创伤后骨关节炎中关节内脂肪组织的动态重塑过程；发现了关节脂肪组织具有区别于皮下白色脂肪组织的独特转录特征；证明了Wnt/β-catenin信号通路的慢性激活足以独立于关节损伤而驱动脂肪组织向纤维化表型转变 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类骨关节炎样本中验证；Wnt/β-catenin信号通路与其他信号通路的交互作用尚未完全阐明；三维成像和空间转录组学的样本量可能有限 | 全面定义创伤后骨关节炎中关节内脂肪组织的时空、结构和转录重塑，并阐明驱动关节脂肪纤维化萎缩的分子机制 | 创伤后骨关节炎小鼠模型中的关节内脂肪组织、滑膜关节脂肪垫及关节来源的基质细胞 | 空间转录组学, 数字病理学 | 骨关节炎 | 空间转录组学, 二维组织形态计量学, 三维锇酸增强微计算机断层扫描 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 196 | 2026-09-23 |
Optineurin restrains IL-17-associated neuroinflammation in trigeminal ganglia to preserve sensory function after ocular HSV-1 infection
2026-Jun-07, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.1093/jimmun/vkag161
PMID:42400459
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研究论文 | 利用小鼠眼部HSV-1感染模型，发现OPTN通过抑制三叉神经节中IL-17相关神经炎症来保护感觉功能 | 首次将OPTN鉴定为神经免疫检查点，通过单细胞RNA测序揭示OPTN缺失导致三叉神经节中趋化因子/NF-κB和Th17/IL-17信号通路富集，并证明OPTN缺陷可作为HSV相关神经营养性角膜炎的可操作实验模型 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人类临床样本中验证OPTN与神经营养性角膜炎的关联 | 探究宿主程序如何决定HSV-1感染后三叉神经节是恢复还是退化，以及建立忠实再现NK样神经免疫病理的实验模型 | 小鼠眼部HSV-1感染模型中的三叉神经节、角膜和引流淋巴结 | 数字病理学 | 神经营养性角膜炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像, 文本 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 基于液滴的单细胞RNA测序 |
| 197 | 2026-09-23 |
scRNA-seq and genomics analyses reveal key mechanisms of inverted papilloma-associated sinonasal squamous cell carcinoma malignant transformation
2026-Jun-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.01.729345
PMID:42415849
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研究论文 | 该研究整合单细胞RNA测序、多重空间蛋白质组学、全外显子组测序和功能实验，揭示了鼻腔鼻窦内翻性乳头瘤（IP）向IP相关鼻腔鼻窦鳞状细胞癌（IP-SNSCC）恶性转化的关键分子和免疫机制 | 首次整合单细胞RNA测序、多重空间蛋白质组学、全外显子组测序和功能实验定义IP-SNSCC恶性转化机制；发现呼吸道上皮基底细胞为推定起源细胞；揭示CXCL14通过IDO通路依赖机制直接诱导免疫抑制性髓系表型并抑制T细胞IFNγ产生，定义了此前未被认识的CXCL14-IDO机制 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 定义IP向IP-SNSCC恶性转化的分子和免疫驱动机制 | 鼻腔鼻窦内翻性乳头瘤（IP）和IP相关鼻腔鼻窦鳞状细胞癌（IP-SNSCC）患者队列 | 单细胞组学 | 鼻腔鼻窦鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序， 多重空间蛋白质组学， 全外显子组测序， 功能实验 | NA | 单细胞转录组数据， 空间蛋白质组数据， 基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序， 空间蛋白质组学， 全外显子组测序 | NA | NA |
| 198 | 2026-09-23 |
Sex-dependent mechanisms of temporomandibular joint osteoarthritis
2026-Jun, JBMR plus
IF:3.4Q2
DOI:10.1093/jbmrpl/ziag063
PMID:42110970
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研究论文 | 本研究通过烧伤-滑膜切除术小鼠模型诱导颞下颌关节骨关节炎，结合单细胞RNA测序和组织学分析，揭示了雌性小鼠表现出更严重的软骨和软骨下骨异常，并发现了性别依赖的分子机制 | 首次使用烧伤-滑膜切除术小鼠模型研究颞下颌关节骨关节炎的性别差异，通过单细胞RNA测序揭示了雌性小鼠炎症反应增强和形态发生通路下调的分子机制 | 缺乏相关临床前模型限制了研究的转化应用，样本量有限，需要进一步验证 | 理解性别差异影响颞下颌关节骨关节炎发病机制的分子基础 | 烧伤-滑膜切除术小鼠模型的颞下颌关节骨关节炎 | 单细胞转录组学 | 颞下颌关节骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、组织学图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 199 | 2026-09-23 |
Predicting gene-specific regulation with transcriptomic and epigenetic single-cell data
2026-06-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag299
PMID:42143610
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研究论文 | 本文提出了一种名为MetaFR的新方法，通过高效的回归树从scATAC-seq数据中的开放染色质变异学习基因特异性模型，以预测scRNA-seq中的基因表达 | MetaFR能够在单细胞或元细胞水平上学习准确的表达预测模型，且元细胞模型在大多数基因上优于单细胞模型，与现有方法SCARlink相比，在运行时间和预测性能上具有优势 | 摘要中未提及 | 利用转录组和表观遗传单细胞数据预测基因特异性调控 | 单细胞ATAC-seq和RNA-seq数据 | 机器学习 | NA | single-cell ATAC-seq, single-cell RNA-seq | 回归树 | 单细胞转录组和表观遗传数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, single-cell ATAC-seq | NA | NA |
| 200 | 2026-09-23 |
Multi-omics reveals a novel Cxcr4+ subpopulation of alveolar macrophages and therapeutic effect of AMD3100 in mice with advanced silicosis
2026-06, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70705
PMID:42204838
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研究论文 | 该研究通过整合单细胞RNA测序与空间转录组学，揭示了晚期矽肺小鼠中Cxcr4+肺泡巨噬细胞新亚群及AMD3100的治疗效果 | 首次发现了Cxcr4+肺泡巨噬细胞新亚群，揭示了Cxcr4+巨噬细胞与Cxcl12+成纤维细胞之间的空间共定位模式和正反馈环路机制，并证明了AMD3100靶向Cxcl12/Cxcr4轴治疗晚期矽肺的潜力 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验，尚未在人类临床样本中验证，AMD3100的治疗效果和安全性仍需进一步临床试验评估 | 探究矽肺进展中巨噬细胞异质性和功能特化，以及AMD3100靶向Cxcr4对晚期矽肺的治疗作用及机制 | 矽肺小鼠模型的肺组织、MH-S肺泡巨噬细胞系 | 数字病理学 | 矽肺 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | Robust Cell Type Decomposition算法 | 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |