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当前共找到 148 篇文献,本页显示第 1 - 20 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1 2025-12-17
Spatial single-cell proteomics landscape decodes the tumor microenvironmental ecosystem of intrahepatic cholangiocarcinoma
2026-Jan-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
研究论文 本研究利用人工智能辅助的空间多组学技术,生成了肝内胆管癌(iCCA)的全面空间图谱,揭示了肿瘤微环境(TME)的空间特征与患者预后和免疫治疗的关系 首次结合空间多组学(包括成像质谱流式、空间蛋白质组学、空间转录组学等)和深度学习系统,解析iCCA的空间TME生态系统,识别出与预后相关的空间拓扑结构和亚型 空间转录组学样本量较小(n=4),部分数据依赖公共数据库,可能影响结果的普遍性 阐明iCCA肿瘤微环境的空间特征,以改善患者预后预测和个性化治疗策略 肝内胆管癌(iCCA)患者肿瘤组织样本 数字病理学 肝内胆管癌 成像质谱流式、空间蛋白质组学、空间转录组学、多重免疫荧光、单细胞RNA测序、bulk RNA测序、bulk蛋白质组学 深度学习系统 图像、蛋白质组数据、转录组数据 超过106万个细胞,包括155个内部成像质谱流式样本、155个内部空间蛋白质组学样本、4个内部空间转录组学样本、20个内部多重免疫荧光样本、9个内部和34个公共单细胞RNA测序样本、244个公共bulk RNA测序样本、110个内部和214个公共bulk蛋白质组学样本 NA 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, bulk蛋白质组学, 空间转录组学, 空间蛋白质组学 NA NA
2 2025-12-17
Contribution of S1pr1 -featured astrocyte subpopulation to cisplatin-induced neuropathic pain in male mice
2026-Jan-01, Pain IF:5.9Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组学分析,揭示了顺铂诱导的神经病理性疼痛中S1pr1高表达星形胶质细胞亚群的作用及其通过Wnt信号通路介导的机制 首次在单细胞水平上识别了顺铂诱导的神经病理性疼痛中S1pr1高表达星形胶质细胞亚群,并发现其通过FGFR3激活Wnt信号通路的新机制 研究仅使用雄性小鼠模型,未涉及雌性动物或人类样本,且机制验证主要依赖药理学干预,缺乏遗传学证据 探究顺铂诱导的神经病理性疼痛中S1PR1下游的细胞与分子机制 雄性小鼠脊髓组织 单细胞转录组学 神经病理性疼痛 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 未明确样本数量,使用雄性小鼠脊髓组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3 2025-12-17
Application of CTC-derived spheroid for drug screening toward personalized treatment in patients with breast cancer
2026-Jan, Translational oncology IF:4.5Q1
研究论文 本研究建立了一种基于循环肿瘤细胞(CTCs)衍生的球体药物筛选工作流程,用于乳腺癌的个性化治疗 利用微流控平台从血液中分离CTCs并培养成球体进行药物筛选,结合激素受体表达、基因组突变谱和空间转录组学分析,克服了组织依赖性类器官模型的局限性 样本量较小(34例新诊断患者,其中13例进行药物筛选),且部分患者未接受建议的治疗 开发一种临床可行的、基于液体活检的工作流程,用于乳腺癌的个性化药物筛选和治疗指导 新诊断和复发转移的乳腺癌患者 数字病理学 乳腺癌 微流控分离、球体培养、药物敏感性测试、基因组测序、空间转录组学 NA 细胞计数、药物反应数据、基因表达谱、空间转录组数据 34例新诊断乳腺癌患者,其中13例复发患者进行CTC球体药物筛选 10x Genomics 空间转录组学 Xenium Xenium in situ 空间转录组分析平台
4 2025-12-17
A Glycerophospholipid Metabolism-Based Prognostic Model Guides Osteosarcoma Therapy
2026-Jan, Translational oncology IF:4.5Q1
研究论文 本研究基于甘油磷脂代谢构建了一个预后模型,用于指导骨肉瘤的治疗策略 整合了批量转录组和单细胞RNA-seq数据,首次量化了骨肉瘤中的甘油磷脂代谢活性,并构建了一个优于42个已发表特征的预后模型 样本量相对有限,且模型在外部验证中的表现未明确说明 探究甘油磷脂代谢在骨肉瘤进展、免疫和治疗中的作用,并构建预后模型 骨肉瘤患者 数字病理学 骨肉瘤 RNA-seq, 单细胞RNA-seq Lasso-Cox模型 转录组数据 TARGET队列85例,GEO队列124例,单细胞RNA-seq数据6个骨肉瘤样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
5 2025-12-17
Magrolimab (Hu5F9-G4) promotes macrophage M1 polarization and is associated with enhanced autophagy in colorectal cancer
2026-Jan, Translational oncology IF:4.5Q1
研究论文 本研究探讨了巨噬细胞免疫检查点抑制剂Hu5F9-G4(Magrolimab)在结直肠癌中通过促进M2d向M1极化、抑制肿瘤进展并影响自噬通路所展现的治疗潜力 首次揭示了Hu5F9-G4在结直肠癌中通过促进巨噬细胞M1极化并增强自噬发挥抗肿瘤作用的机制,并鉴定出CDKN1A和MAP1LC3B作为潜在的自噬相关治疗靶点 研究样本量有限(73例),且临床前模型结果需在更大规模临床试验中进一步验证 探究巨噬细胞免疫检查点抑制剂Hu5F9-G4对结直肠癌免疫微环境、巨噬细胞行为及肿瘤进展的影响,以确定潜在治疗靶点 结直肠癌组织样本、体外培养的巨噬细胞与CRC细胞、荷瘤小鼠模型 肿瘤免疫学 结直肠癌 单细胞转录组分析、生物信息学分析、临床验证 NA 转录组数据、临床数据、实验观测数据 73例CRC样本、体外细胞实验、小鼠体内实验 NA 单细胞RNA-seq NA NA
6 2025-12-17
Development of a single-cell derived MDSCs signature score for prognostic risk stratification and therapeutic decision guidance in breast cancer
2026-Jan, Translational oncology IF:4.5Q1
研究论文 本研究开发了一个基于单细胞来源的MDSCs特征评分系统,用于乳腺癌的预后风险分层和治疗决策指导 首次系统性地表征了乳腺癌中新的MDSCs基因特征,并建立了一个具有多方面临床转化能力的MDSCs相关标记评分框架 NA 开发用于乳腺癌预后风险分层和治疗决策指导的MDSCs特征评分系统 乳腺癌患者 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序 机器学习 RNA测序数据 整合了单细胞数据集GSE161529和GSE176078,识别了12,767个MDSCs NA 单细胞RNA-seq NA NA
7 2025-12-17
Single-cell RNA sequencing analysis identified GARP-expressing myeloid cells that deteriorate postinfarct myocardial remodeling
2026-Jan-01, American journal of physiology. Heart and circulatory physiology
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析,鉴定出一种表达GARP的髓系细胞群(GEM细胞),并揭示了其在心肌梗死后通过调节中性粒细胞浸润和心肌细胞凋亡来恶化心脏重塑的作用机制 首次通过靶向单细胞RNA测序技术鉴定出表达GARP的髓系细胞群(GEM细胞),并阐明其来源于心脏驻留的纤维细胞,通过GARP/TGF-β轴调控中性粒细胞浸润和心肌细胞凋亡,从而恶化心肌梗死后心脏重塑 研究主要基于小鼠模型,虽然人类Visium数据提示GARP+CD11b+细胞存在于梗死心肌中,但GEM细胞在人类心肌梗死中的具体功能和临床相关性仍需进一步验证 阐明心肌梗死后心脏重塑的调控机制,特别是髓系细胞在其中的具体作用 小鼠心肌梗死模型中的髓系细胞(特别是GARP表达髓系细胞)以及人类心肌梗死患者的心肌组织 单细胞组学 心血管疾病 单细胞RNA测序(scRNA-Seq),空间转录组学(Visium) NA 单细胞基因表达数据,空间基因表达数据 NA 10x Genomics 单细胞RNA测序,空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 用于scRNA-Seq的10x Chromium单细胞平台,以及用于空间转录组学分析的10x Visium平台
8 2025-12-17
Multi-omics analysis reveals the heterogeneity and interactions among stromal and tumor cells in gastric cancer
2026-Jan, Translational oncology IF:4.5Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学等多组学分析,揭示了胃癌中癌症相关成纤维细胞和平滑肌细胞的异质性及其与恶性上皮细胞的相互作用 首次在胃癌中系统描绘了CAFs和SMCs的异质性谱系,并通过轨迹推断、调控网络分析和空间映射揭示了肿瘤-基质间的不对称信号串扰 研究结果需要进一步的实验验证,特别是配体-受体对和空间决定因素的功能验证 探究胃癌肿瘤微环境中基质细胞的异质性及其与肿瘤细胞的相互作用,以识别潜在的治疗靶点 胃癌组织中的癌症相关成纤维细胞、平滑肌细胞和恶性上皮细胞 数字病理学 胃癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 轨迹推断, 调控网络分析, 配体-受体相互作用建模 NA 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
9 2025-12-17
The prognostic value of tumor macroscopic morphology in colorectal cancer
2026-Jan, Translational oncology IF:4.5Q1
研究论文 本研究评估了结直肠癌肿瘤宏观形态的预后价值,并探讨了不同形态背后的分子机制 提出了修订的结直肠癌肿瘤宏观形态分类系统,并发现浸润型与不良临床结局相关,其特征是癌症相关成纤维细胞浸润增加和血管生成增强 NA 评估结直肠癌肿瘤宏观形态的预后价值并理解其分子机制 结直肠癌患者 数字病理学 结直肠癌 bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, 免疫组织化学 NA RNA测序数据, 单细胞数据, 图像数据 642名合格患者(前瞻性研究335名,回顾性研究307名) NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
10 2025-12-17
Tumor-Derived CXCL10 and CCL20 Polarize the Immune Microenvironment in Nasopharyngeal Carcinoma via Competitive Recruitment of Effector T Cells and Tregs
2026, International journal of medical sciences IF:3.2Q1
研究论文 本研究整合单细胞RNA测序和患者样本验证,揭示了鼻咽癌中肿瘤源性趋化因子CXCL10和CCL20通过竞争性招募效应T细胞和调节性T细胞来极化肿瘤免疫微环境 首次在鼻咽癌中明确了CXCL10和CCL20作为肿瘤源性趋化因子的拮抗作用,并阐明了它们通过竞争性招募不同免疫细胞亚群来极化肿瘤免疫微环境的机制 研究主要基于观察性数据和体外/体内模型验证,缺乏直接的临床干预试验来验证其治疗潜力 探究鼻咽癌肿瘤免疫微环境的极化机制,寻找预后生物标志物和治疗靶点 鼻咽癌组织和患者样本 单细胞组学 鼻咽癌 单细胞RNA测序,体外趋化实验,体内异种移植模型,多组学分析 NA 单细胞RNA测序数据,批量RNA测序数据,免疫组化数据 109例原发性患者样本 NA 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq NA NA
11 2025-12-16
Spatial transcriptomics expression prediction from histopathology based on cross-modal mask reconstruction and contrastive learning
2026-Feb, Medical image analysis IF:10.7Q1
研究论文 本研究开发了一种基于对比学习的深度学习方法,用于从全切片图像预测空间转录组基因表达 提出了一种结合跨模态掩码重建与对比学习的框架,无需大规模预训练数据集或抽象语义表示,即可在特征空间建立组织病理学形态与空间基因表达的对应关系 未明确提及方法在更广泛疾病类型或更大规模数据集上的泛化能力 从组织病理学图像预测空间转录组基因表达,以克服空间转录组数据获取成本高、规模有限的挑战 肿瘤微环境分析及组织病理学的分子图谱 数字病理学 肿瘤 空间转录组学 基于对比学习的深度学习模型 图像(全切片图像)、空间转录组数据 六个不同疾病数据集 NA 空间转录组学 NA NA
12 2025-12-16
Magnifying Glass on Sinonasal NUT Carcinoma Heterogeneity via Spatial Transcriptomics
2026-Jan, Head & neck
研究论文 本研究利用空间转录组学技术探索了鼻腔鼻窦NUT癌的肿瘤异质性 首次将空间转录组学应用于鼻腔鼻窦NUT癌,揭示了其肿瘤内和肿瘤间的细胞类型多样性 样本量较小(仅3例),行为相关性仅为推测性 阐明NUT癌的肿瘤异质性及其潜在治疗意义 鼻腔鼻窦NUT癌的福尔马林固定石蜡包埋组织样本 数字病理学 鼻腔鼻窦癌 空间转录组学测序 图神经网络 空间转录组数据 3例NUT癌病例 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium 10X Genomics Visium Spatial Gene Expression分析
13 2025-12-16
Multi-omics analysis unveils tumor heterogeneity and immunotherapy predictive model in breast cancer for precision medicine and early detection
2026-Jan, Neoplasia (New York, N.Y.)
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和bulk RNA-seq反卷积等多组学方法,揭示了乳腺癌的肿瘤异质性,并开发了一个用于预测患者生存和免疫治疗反应的稳健预后模型 首次将单细胞RNA测序、空间转录组学和bulk RNA-seq反卷积整合,系统描绘乳腺癌肿瘤亚群,并利用CoxBoost+GBM算法构建了预测免疫治疗反应的预后模型 研究依赖于公共数据库(TCGA和GEO)的数据,可能受限于样本的临床信息完整性和批次效应 阐明乳腺癌肿瘤异质性对治疗抵抗和免疫逃逸的影响,并开发精准的预后和免疫治疗预测工具 乳腺癌肿瘤组织 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学, bulk RNA-seq CoxBoost, GBM 基因表达数据 TCGA和GEO队列的整合数据(具体样本数未明确说明) NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq NA NA
14 2025-12-16
Fibroblast-derived NEU1 as a therapeutic target for improving cortical bone integrity and fracture healing
2026, Theranostics IF:12.4Q1
研究论文 本研究揭示了成纤维细胞来源的NEU1通过去唾液酸化作用调控破骨细胞活性,从而改善皮质骨完整性和骨折愈合 首次发现NEU1通过去唾液酸化α2,3-连接的唾液酸残基破坏细胞间识别,维持破骨细胞单核状态,并证实靶向抑制NEU1可加速骨折愈合 研究主要基于小鼠模型,人类临床转化需进一步验证 探索调控骨代谢和修复的分子机制,开发新型治疗策略 小鼠后肢骨组织、人类骨膜细胞 数字病理学 老年疾病 免疫组化染色、单细胞RNA测序 NA 图像、单细胞转录组数据 未明确样本数量,涉及小鼠模型和人类骨膜样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
15 2025-12-16
The China Brain Multi-omics Atlas Project (CBMAP)
2026-Jan, Molecular psychiatry IF:9.6Q1
研究论文 中国脑多组学图谱项目(CBMAP)旨在生成超过1000个人类大脑的全面分子参考图谱,整合基因组、表观基因组、转录组、蛋白质组和代谢组数据,以解决东亚人群在脑研究中代表性不足的问题 首次针对东亚人群生成大规模脑多组学图谱,整合空间转录组学、蛋白质组学和单核3D染色质结构分析等先进技术,提供全面的分子参考资源 NA 研究衰老相关脑表型和神经精神疾病的分子基础,加速脑部疾病的药物发现和精准医疗 超过1000个人类大脑样本,覆盖广泛年龄范围和多个中国地区 数字病理学 神经精神疾病 基因组学、表观基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学、空间转录组学、单核3D染色质结构分析 NA 多组学数据 超过1000个人类大脑样本 NA 空间转录组学, 单核3D染色质结构分析 NA NA
16 2025-12-16
A New Orthotopic Mouse Model of Laryngeal Squamous Cell Carcinoma
2026-Jan, Head & neck
研究论文 本研究建立了一种新型可重复的喉鳞状细胞癌原位小鼠模型,以促进喉癌相关研究 开发了一种新型可重复的喉鳞状细胞癌原位小鼠模型,能更真实地模拟人体免疫系统反应和肿瘤生物学进化过程 NA 建立一种新型可重复的喉鳞状细胞癌原位小鼠模型,以促进喉癌相关研究 C57BL/6小鼠(n=16)和喉癌患者样本 数字病理学 喉癌 单细胞测序 NA 图像、测序数据 16只C57BL/6小鼠及喉癌患者样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
17 2025-12-15
EnsembleRegNet: Interpretable deep learning for transcriptional network inference from single-cell RNA-seq
2026-Feb, Computational biology and chemistry IF:2.6Q2
研究论文 本文提出了EnsembleRegNet,一种用于从单细胞RNA测序数据推断基因调控网络的深度学习框架 通过集成编码器-解码器和多层感知机架构,结合Hodges-Lehmann估计器二值化、案例删除分析、RcisTarget基序富集和AUCell调控子活性评分,增强了模型的鲁棒性和生物学可解释性 未明确提及具体限制 从高维单细胞RNA测序数据中准确推断基因调控网络结构 转录因子与靶基因关系 机器学习 NA 单细胞RNA测序 集成编码器-解码器, 多层感知机 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
18 2025-12-15
Single-cell sequencing analysis reveals CHURC1 as a non-canonical oncoprotein governing goblet cell-driven colorectal tumorigenesis
2026-Feb, Cellular signalling IF:4.4Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析结直肠癌样本,发现杯状细胞是结直肠癌的潜在细胞起源,并鉴定出CHURC1作为一种新型致癌基因,促进结直肠癌增殖和转移 首次将杯状细胞确定为结直肠癌的潜在细胞起源,并发现CHURC1作为一种非经典致癌蛋白,影响肿瘤免疫微环境中的免疫细胞因子释放 样本量较小(仅4名患者的14个样本),且研究未涉及更广泛的验证队列或功能机制深度探索 探究结直肠癌的细胞起源和致癌机制,以寻找新的治疗靶点 结直肠癌肿瘤、肠道息肉及癌旁正常组织样本 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 4名患者的14个样本(包括肿瘤、息肉和正常组织) NA 单细胞RNA-seq NA NA
19 2025-12-15
Transcriptional and post-transcriptional convergence of HES1 and IGF2BP2 sustains CSF2-dependent metabolic adaptability in gastric Cancer
2026-Feb, Cellular signalling IF:4.4Q2
研究论文 本研究通过整合转录组学和功能分析,揭示了一个驱动胃癌进展的层级信号轴,即HES1-IGF2BP2-CSF2轴,该轴通过转录和转录后调控汇聚,维持CSF2依赖的代谢适应性 首次阐明HES1通过转录激活IGF2BP2,后者再通过m6A修饰稳定CSF2 mRNA,从而将转录因子调控与m6A表观转录组学及糖酵解重编程整合成一个新的信号级联,驱动胃癌进展 研究主要基于细胞系和异种移植模型,缺乏在更复杂的人体肿瘤微环境或临床队列中的直接验证,且对轴上游的调控机制和下游更广泛的代谢网络探索有限 探究驱动胃癌进展的关键分子机制,特别是转录与转录后调控如何协同影响肿瘤代谢和恶性表型 胃癌细胞、胃癌异种移植模型 癌症生物学、分子生物学 胃癌 单细胞测序、染色质免疫沉淀、双荧光素酶报告基因检测、RNA免疫沉淀、mRNA衰变动力学分析、免疫组织化学 NA 转录组数据、单细胞测序数据、TCGA公共数据库数据、功能实验数据 NA NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
20 2025-12-15
Caveolin-1 drives vasculogenic mimicry in lung adenocarcinoma through autophagy-mediated glycolytic reprogramming
2026-Feb, Cellular signalling IF:4.4Q2
研究论文 本研究揭示了Caveolin-1通过自噬介导的糖酵解重编程驱动肺腺癌血管生成拟态形成的机制 首次阐明Cav-1通过激活自噬促进糖酵解重编程,进而驱动肺腺癌血管生成拟态形成的分子轴,并提出联合靶向自噬和糖酵解的治疗策略 研究主要基于细胞和动物模型,临床转化效果需进一步验证;联合治疗策略的具体剂量和毒性需深入评估 探究Caveolin-1在肺腺癌血管生成拟态形成中的作用及分子机制 肺腺癌细胞、肿瘤微环境 肿瘤生物学 肺腺癌 单细胞测序、空间转录组学分析 NA 基因表达数据、空间转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
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