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当前共找到 2200 篇文献,本页显示第 1961 - 1980 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1961 2026-01-14
Mapping somatosensory afferent circuitry to bone identifies neurotrophic signals required for fracture healing
2026-Jan-08, Science (New York, N.Y.)
研究论文 本研究通过单细胞转录组学分析,揭示了骨骼感觉神经元的神经解剖学环路及其在骨折愈合中的关键作用 首次系统性地绘制了骨骼感觉传入神经元的单细胞转录组图谱,并识别出FGF9作为骨折修复的主要调控因子 研究主要基于小鼠模型,人类样本的验证尚需进一步研究 探究骨骼感觉神经元的神经解剖学环路及其在骨折愈合中的调控机制 小鼠骨骼的背根神经节神经元 单细胞转录组学 骨折 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 未明确指定样本数量,但涉及骨折前后的小鼠背根神经节神经元 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1962 2026-01-14
Drug and single-cell gene expression integration identifies sensitive and resistant glioblastoma cell populations
2026-Jan-07, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究开发了scFOCAL平台,通过整合单细胞基因表达数据与药物数据库,识别胶质母细胞瘤中对靶向疗法敏感和耐药的细胞亚群,并预测协同治疗组合 开发了scFOCAL(单细胞组学连接与分析框架),首次将单细胞RNA测序数据与LINCS L1000药物数据库的转录反应特征进行整合,量化细胞对药物的敏感性和耐药性景观,并预测药物组合协同作用 研究主要基于转录组数据,未全面评估表观遗传、蛋白质组等其他层面的异质性;临床前验证虽涵盖体外、离体和体内模型,但尚未进行临床试验 开发一个预测平台,以解决胶质母细胞瘤肿瘤内异质性和可塑性对治疗开发的阻碍,识别对不同治疗敏感或耐药的细胞状态,并发现新的协同治疗组合 新诊断和复发性胶质母细胞瘤肿瘤样本中的肿瘤细胞 数字病理学 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序 NA 单细胞基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1963 2026-01-14
Mapping isoforms and regulatory mechanisms from spatial transcriptomics data with SPLISOSM
2026-Jan-05, Nature biotechnology IF:33.1Q1
研究论文 本文介绍了一种名为SPLISOSM的方法,用于从空间转录组学数据中检测异构体分辨率模式,并应用于小鼠大脑和人类胶质母细胞瘤的分析 SPLISOSM方法首次使用非参数核的多变量测试来处理点水平和异构体水平的依赖性,从而在稀疏数据上实现高统计功效,揭示了空间转录多样性的新调控关系 方法可能依赖于数据质量和覆盖度,且分析主要聚焦于大脑组织,在其他组织中的适用性未验证 研究旨在理解转录多样性(包括剪接和替代3'端使用)的空间协调机制及其在正常和肿瘤条件下的作用 小鼠大脑和人类胶质母细胞瘤组织 空间转录组学 胶质母细胞瘤 空间转录组学 SPLISOSM(空间异构体统计建模) 空间转录组学数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
1964 2026-01-14
Integrative Single-Cell and Machine Learning Analysis Identifies a Nucleotide Metabolism-Related Signature Predicting Prognosis and Immunotherapy Response in LUAD
2026-Jan-02, Cancers IF:4.5Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序数据和机器学习算法,构建了一个核苷酸代谢相关特征(NMRS),用于预测肺腺癌(LUAD)的预后和免疫治疗反应 首次在单细胞水平上系统描绘了肺腺癌中核苷酸代谢的异质性,并构建了一个跨队列稳健的预后和免疫治疗反应预测特征(NMRS),同时通过实验验证了关键基因ENO1的功能 研究主要基于公开的回顾性数据集,需要前瞻性临床队列进一步验证NMRS的预测效能;体外实验仅初步验证了ENO1的功能,缺乏体内模型和机制深入探索 探究肺腺癌中核苷酸代谢的细胞异质性及其对肿瘤进展、免疫微环境和治疗反应的影响,并开发相关的预后和预测标志物 肺腺癌(LUAD)患者肿瘤组织中的细胞,特别是恶性上皮细胞 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq),机器学习算法组合 多种机器学习算法组合(共101种组合),inferCNV,Monocle2,CellChat 单细胞RNA测序数据,批量RNA测序数据 来自独立LUAD患者的公开scRNA-seq数据集,TCGA-LUAD队列和多个GEO队列 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1965 2026-01-14
CausalGenDiff: Generative causal diffusion bridges scRNA-seq and spatial transcriptomics
2026-Jan, Journal of biomedical informatics IF:4.0Q2
研究论文 提出了一种名为CausalGenDiff的生成因果扩散模型,用于有效整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据 首次将扩散和自回归过程相结合以利用基因间的因果依赖关系,并将原本用于图像生成的因果注意力变换器扩展应用于高维基因表达数据,无需依赖预定义关系即可捕捉基因调控机制 未明确说明模型的计算复杂度或对计算资源的需求,也未讨论模型在更广泛组织类型或疾病状态下的泛化能力 提高单细胞RNA测序和空间转录组学数据整合的性能,以更好地理解空间背景下的基因表达 基因表达数据 计算生物学 NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 扩散模型,自回归模型,因果注意力变换器,VAE 基因表达数据 10个组织数据集 NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
1966 2026-01-14
Optimization of Brain Tissue Preservation for Nucleic Acid Stability
2026 Jan-Feb, The journal of histochemistry and cytochemistry : official journal of the Histochemistry Society
研究论文 本文通过优化脑组织保存方案,旨在提高空间转录组学研究中核酸稳定性与细胞结构完整性 首次系统比较了不同保存条件对羊脑组织RNA质量和细胞结构的影响,为空间转录组学样本制备提供实证指导 研究基于羊脑模型,尚未在人类样本中验证;冷冻方案仍需改进以达到FFPE组织的细胞结构水平 优化脑组织保存方法以提升空间转录组学研究的样本质量 羊脑组织(n=16)的FFPE和冷冻样本 空间转录组学 NA 空间转录组学、RNA完整性分析、组织形态学分析 NA RNA质量数据、组织切片图像 16个羊脑样本 NA 空间转录组学 NA NA
1967 2026-01-13
Prior high fiber intake impinges on the cellular responses of mesenteric adipose and intestinal tissues to subsequent high fat feeding
2026-Jan-10, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本研究通过饮食转换实验,利用单核及空间转录组学技术,揭示了高纤维饮食预处理如何重塑肠系膜脂肪和肠道组织对后续高脂饮食的细胞反应 首次结合单核转录组学和空间转录组学,系统描绘了饮食转换过程中脂肪和肠道组织的时空动态响应,并发现了性别二态性细胞群重塑现象 研究基于小鼠模型,人类组织的直接适用性需进一步验证;长期饮食效应的分子机制仍需深入探索 探究高纤维饮食预处理对后续高脂饮食挑战下组织特异性反应的调控机制 C57BL/6J小鼠的肠系膜白色脂肪组织和肠道组织(十二指肠和结肠) 空间转录组学 肥胖症 单核转录组测序、空间转录组测序 NA 转录组数据、空间基因表达数据 C57BL/6J小鼠群体(具体数量未在摘要中说明) NA 单核RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
1968 2026-01-13
Rumen microbiome biogeography and ventral epithelial architecture in three ruminant species
2026-Jan-10, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本研究通过多组学方法揭示了三种反刍动物(狍、梅花鹿和绵羊)瘤胃微生物组的空间生物地理分布及腹侧瘤胃上皮的遗传多样性 首次系统揭示了瘤胃微生物组的空间异质性及腹侧瘤胃上皮的单细胞转录组特征,并发现维生素B对上皮生长的促进作用 研究仅涵盖三种反刍动物,样本量有限,且未探讨环境因素对微生物组空间分布的影响 探究反刍动物瘤胃微生物组的空间分布规律及腹侧上皮的细胞功能分化 狍、梅花鹿和绵羊的瘤胃微生物组及腹侧瘤胃上皮组织 单细胞组学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、转座酶可及染色质测序(ATAC-seq)、批量RNA测序(RNA-seq) NA 单细胞转录组数据、表观基因组数据、代谢组数据 三种反刍动物的11个瘤胃囊区域样本 NA 单细胞RNA-seq, ATAC-seq, 批量RNA-seq NA NA
1969 2026-01-13
FDX1-mediated cuproptosis promotes cholestatic liver injury exacerbated by taurocholic acid-enhanced copper accumulation
2026-Jan-09, Cell death discovery IF:6.1Q1
研究论文 本研究揭示了胆汁淤积性肝损伤中铜过载通过牛磺胆酸增强和FDX1介导的铜死亡机制驱动肝损伤 首次发现胆汁淤积条件下牛磺胆酸能增强肝脏铜积累,并阐明FDX1通过稳定DLAT单体和LIAS介导的脂酰化在铜死亡中的复杂调控作用 单中心回顾性研究,样本量有限,主要基于动物和细胞模型,临床转化需进一步验证 探究铜在胆汁淤积性肝损伤中的作用及其具体分子机制 胆汁淤积患者肝组织、胆道闭锁患者肝标本、胆汁淤积大鼠模型、肝细胞 数字病理学 肝病 单细胞测序、转录组分析 NA 测序数据、临床数据、实验数据 胆汁淤积患者和胆道闭锁患者的肝组织样本,以及大鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1970 2026-01-13
Lipidomics and single-cell transcriptomics uncover aberrant lipid metabolism in metaplasia lesions during gastric carcinogenesis
2026-Jan, Journal of gastroenterology IF:6.9Q1
研究论文 本研究通过脂质组学和单细胞转录组学分析,揭示了胃黏膜肠化生病变中异常的脂质代谢特征,特别是甘油三酯和脂滴的积累,并探索了靶向脂质代谢的治疗潜力 首次结合脂质组学和单细胞转录组学技术,系统揭示了胃黏膜肠化生病变中独特的脂质代谢特征,并利用基因敲除小鼠模型和患者来源的类器官模型验证了靶向脂质代谢通路(如DGAT1)的治疗效果 研究主要基于小鼠模型和有限的临床样本,需要在更大规模的人群队列中验证脂质代谢标志物的临床意义和治疗靶点的有效性 阐明胃黏膜肠化生在胃癌发生过程中的脂质代谢特征,并探索靶向脂质代谢的预防和治疗策略 幽门螺杆菌感染的Ddit4基因敲除小鼠、人类胃黏膜肠化生组织、慢性非萎缩性胃炎组织、患者来源的胃癌类器官 数字病理学 胃癌 单细胞RNA测序、脂质组学分析、免疫组织化学、免疫荧光、BODIPY染色 NA 单细胞转录组数据、脂质组学数据、组织图像数据 未明确说明具体样本数量,但涉及小鼠模型、人类组织样本和类器官模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1971 2026-01-13
Meta single-cell atlas and xQTL post-GWAS analysis revealed the pathogenic features of thyroid cancer for target therapy: A multi-omics study
2026-Jan, Cancer gene therapy IF:4.8Q1
研究论文 本研究整合单细胞转录组学、批量转录组学和GWAS数据,通过多组学方法揭示甲状腺癌的致病特征,并构建机器学习模型用于疾病预测 首次结合单细胞图谱、xQTL后GWAS分析和多机器学习建模,系统识别甲状腺癌的致病基因和免疫亚型,并开发交互式网页应用 未明确说明样本来源的种族或地理多样性,可能影响结果的普适性 识别甲状腺癌的致病基因特征和免疫微环境,开发诊断预测模型 甲状腺癌患者样本 数字病理学 甲状腺癌 单细胞转录组学, 批量转录组学, GWAS, 免疫组化 多机器学习建模(包括glmBoost, RF等) 转录组数据, 遗传数据, 图像数据 未明确指定具体样本数量 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
1972 2026-01-13
Lung Microphysiological System Validates Novel Cell Therapy for Acute Respiratory Distress Syndrome
2026-Jan, Advanced biology IF:3.2Q3
研究论文 本研究开发了一种新型肺微生理系统来模拟急性呼吸窘迫综合征(ARDS)环境,并评估了人脐带血来源的间充质干细胞(hUCB-pMSCs)作为潜在替代疗法的疗效 开发了一种新型肺微生理系统(MPS)来模拟ARDS环境,并首次将hUCB-pMSCs与地塞米松在该系统中进行比较评估 研究基于体外微生理系统模拟,可能无法完全复制体内复杂的生理环境 评估hUCB-pMSCs作为ARDS替代治疗方法的疗效 人脐带血来源的间充质干细胞(hUCB-pMSCs)和地塞米松在模拟ARDS的肺微生理系统中的治疗效果 数字病理学 急性呼吸窘迫综合征 单细胞RNA测序,荧光成像 NA 图像,测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1973 2026-01-13
Single cell transcriptional profiling of monocytes from asthma patients show a predisposition for an inflammatory response
2026-Jan, Cytotherapy IF:3.7Q2
研究论文 本研究通过单细胞转录组分析比较了哮喘患者和健康对照者血液单核细胞的基因表达差异,并评估了γMSCs输注对哮喘患者单核细胞转录组的影响 首次在单细胞水平上揭示了哮喘患者单核细胞对干扰素反应的增强倾向,并展示了γMSCs输注能显著改变单核细胞的基因表达谱,包括降低HLA I类和干扰素信号通路基因的表达 样本量相对较小,且研究仅基于单次γMSCs输注后的观察,缺乏长期随访数据 比较哮喘患者与健康对照者血液单核细胞的转录组差异,并评估γMSCs治疗对哮喘患者单核细胞转录组的影响 哮喘患者和健康对照者的血液单核细胞 单细胞转录组学 哮喘 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 包括哮喘患者(严重和轻度)和健康对照者的血液单核细胞样本,具体数量未在摘要中明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1974 2026-01-13
Single-cell transcriptomics reveals dynamics of natural killer cell expansion in a feeder cell-free culture of peripheral blood mononuclear cells-implications for immunotherapy
2026-Jan, Cytotherapy IF:3.7Q2
研究论文 本研究利用单细胞转录组学分析外周血单个核细胞在无饲养细胞培养中自然杀伤细胞扩增的动态变化,为免疫治疗提供新见解 首次在无饲养细胞培养系统中,通过单细胞转录组学揭示NK细胞扩增的早期(培养第3至8天)关键影响因素,并识别出与CCL信号通路相关的潜在生物标志物 研究仅基于三个供体样本,样本量较小,可能限制结果的普遍性 探究影响供体间NK细胞体外扩增变异性的因素,以优化免疫治疗中的NK细胞供应 外周血单个核细胞(PBMCs)及其在体外培养中扩增的自然杀伤细胞 单细胞转录组学 癌症 单细胞转录组测序 轨迹推断和差异基因表达分析 单细胞RNA测序数据 三个供体的外周血单个核细胞样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1975 2026-01-13
Restoring NR4A3 function in neutrophils alleviates sepsis by limiting NF-κB-dependent NETs formation and organ damage
2026-Jan, Molecular immunology IF:3.2Q3
研究论文 本研究揭示了孤儿核受体NR4A3在脓毒症中通过抑制中性粒细胞NF-κB信号通路,减少NETs形成和器官损伤的保护作用 首次阐明NR4A3通过调控NF-κB信号通路抑制中性粒细胞NETosis在脓毒症中的具体机制,并证明其治疗潜力 研究主要基于细胞和小鼠模型,临床转化需进一步验证;未深入探讨NR4A3下游具体靶基因 阐明NR4A3在脓毒症中性粒细胞NETosis中的功能及治疗潜力 脓毒症患者外周血单个核细胞、ATRA分化的HL-60中性粒细胞细胞系、CLP诱导的脓毒症小鼠模型 单细胞转录组学 脓毒症 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据、组织病理学数据 来自GEO数据库的GSE175453和GSE167363数据集(脓毒症患者和对照者PBMCs)、细胞实验、小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1976 2026-01-13
LIMPACAT: Multi-omics attention transformer for immune prediction in liver cancer using whole-slide imaging
2026, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 本文介绍了一种名为LIMPACAT的深度学习框架,利用全玻片图像预测肝细胞癌中的免疫细胞水平 提出了一种结合多组学注意力的Transformer模型,首次使用全玻片图像直接预测肝癌免疫微环境中的细胞组成 研究依赖于TCGA-LIHC数据集,该数据集缺乏直接的免疫细胞组成数据,需通过反卷积方法推断 开发一个深度学习框架,从组织病理学图像中预测肝癌的免疫细胞水平,以支持预后评估和个性化治疗 肝细胞癌(HCC)的全玻片图像和相关的免疫细胞组成数据 数字病理学 肝癌 单细胞RNA测序,反卷积方法,多重实例学习 注意力Transformer,深度学习 图像,RNA-seq数据 基于TCGA-LIHC数据集,具体样本数量未在摘要中明确说明 NA 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq NA NA
1977 2026-01-12
Constructing the spatiotemporal atlas of single-cell lineage trajectories in stereotypic biological structures
2026-Jan-16, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本文开发了一种单细胞分辨率时空映射方法,用于构建生物样本在发育时间线上的空间分子图谱 整合空间转录组学和单细胞RNA测序技术,提出一种包含分层算法的数学方法,显著提升单细胞空间映射精度 NA 构建典型生物结构中单细胞谱系轨迹的时空图谱 生物样本中的单细胞 数字病理学 NA 空间转录组学, 单细胞RNA测序 3D数学模型 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据 NA NA 空间转录组学, 单细胞RNA-seq NA NA
1978 2026-01-12
Tumor-associated macrophages promote chemoresistance to Paclitaxel via activating NOTCH2-JAG1 juxtacrine signaling
2026-Jan-10, Molecular cancer IF:27.7Q1
研究论文 本研究揭示了肿瘤相关巨噬细胞通过激活NOTCH2-JAG1近分泌信号通路促进卵巢癌细胞对紫杉醇化疗耐药的分子机制 首次发现紫杉醇通过细胞质多聚腺苷酸化选择性诱导NOTCH2的翻译上调,并阐明巨噬细胞通过JAG1-NOTCH2轴形成正反馈环路驱动化疗耐药的新机制 研究主要聚焦于卵巢癌模型,在其他肿瘤类型中的普适性需要进一步验证;临床样本分析规模有限 阐明肿瘤微环境中巨噬细胞介导紫杉醇化疗耐药的具体分子机制 卵巢癌细胞、肿瘤相关巨噬细胞、小鼠移植瘤模型、患者来源异种移植模型、卵巢癌患者样本 肿瘤生物学 卵巢癌 翻译组分析、活细胞成像、基因敲除/敲低、共培养实验、单细胞RNA测序 NA 基因表达数据、成像数据、测序数据 多种卵巢癌小鼠模型(异种移植、同系移植、PDX模型)及患者样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1979 2026-01-12
MHC-II-restricted neoantigen vaccine reverses immune microenvironment and overcomes resistance to immune-checkpoint inhibitors in cold tumors
2026-Jan-09, Med (New York, N.Y.)
研究论文 本研究探讨了MHC-II限制性新抗原疫苗如何重塑冷肿瘤的免疫抑制微环境,并与TIGIT阻断剂联合使用以克服免疫检查点抑制剂耐药性 首次证明MHC-II限制性新抗原疫苗可重编程冷肿瘤的免疫抑制微环境,并通过NicheNet分析发现PVR-TIGIT轴是潜在联合治疗靶点,提出疫苗与TIGIT阻断的协同抗肿瘤策略 研究基于B16F10小鼠模型,其结论在人类肿瘤中的普适性仍需进一步验证;单细胞RNA测序样本量有限,可能未完全捕获肿瘤微环境的异质性 探究MHC-II限制性新抗原疫苗能否逆转冷肿瘤的免疫抑制微环境并克服免疫检查点抑制剂耐药性 B16F10小鼠黑色素瘤模型 肿瘤免疫学 黑色素瘤 流式细胞术,单细胞RNA测序,NicheNet分析 NA 单细胞转录组数据,流式细胞数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1980 2026-01-12
Divergent routes to specialization: Guard cells, myrosin cells, and beyond
2026-Jan-09, Current opinion in plant biology IF:8.3Q1
综述 本文探讨了植物中保守的bHLH转录因子如何通过调控不同下游靶基因,驱动保卫细胞和芥子酶细胞等不同细胞类型的特化 揭示了FAMA转录因子通过调控WSB和SCAP1等不同下游靶基因,在保卫细胞成熟和芥子酶细胞身份建立中的双重作用,并发现了拟南芥根中来源不同的意外芥子酶细胞 NA 探讨植物细胞类型多样性的转录调控机制,特别是保守转录因子的重复利用如何驱动新细胞类型的演化 植物细胞类型(保卫细胞、芥子酶细胞)、bHLH转录因子(FAMA及其同源物)、下游靶基因(WSB、SCAP1等) 植物发育生物学 NA 单细胞转录组深度测序分析 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
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