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当前共找到 2200 篇文献，本页显示第 1941 - 1960 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1941 | 2026-01-17 |
Curriculum-guided divergence scheduling improves single-cell clustering robustness
2026-Jan-09, Neural networks : the official journal of the International Neural Network Society
IF:6.0Q1
DOI:10.1016/j.neunet.2026.108592
PMID:41534329
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研究论文 | 本文提出了一种名为DAGCL的动态图嵌入框架，通过课程学习引导的调度机制，提高了单细胞RNA-seq数据聚类的鲁棒性 | 提出动态注意力增强图嵌入框架，将表示学习重构为从粗到细的进化过程，采用课程引导的调度机制动态调节注意力强度和监督严格度 | 未在摘要中明确说明 | 提高单细胞RNA-seq数据深度聚类的准确性和鲁棒性 | 单细胞RNA-seq数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA-seq | 动态图嵌入框架（DAGCL） | 基因表达数据 | 27个基准数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1942 | 2026-01-17 |
Adaptive multi-view information bottleneck for multi-omics data clustering
2026-Jan-07, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf717
PMID:41527852
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研究论文 | 本文提出了一种基于信息瓶颈原理的自适应多视图聚类框架（scAMVIB），用于解决多组学数据聚类任务 | 利用信息瓶颈原理学习多视图组学表示，同时捕获组学间关联和组学特定模式，并通过自适应权重分配优化聚类性能 | NA | 解决多组学数据聚类中互补信息有效整合与权重分配的挑战 | 单细胞多组学数据 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 自适应多视图信息瓶颈框架 | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 多组学 | NA | NA |
| 1943 | 2026-01-17 |
CSRefiner: a lightweight framework for fine-tuning cell segmentation models with small datasets
2026-Jan-07, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf718
PMID:41527855
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研究论文 | 本文提出了一个名为CSRefiner的轻量级框架，用于在小数据集上微调细胞分割模型，以提升全组织单细胞空间表达分析的精度 | CSRefiner是一个轻量级且高效的微调框架，支持微调空间组学领域广泛使用的分割模型，并能在标注数据非常有限的情况下实现高精度，同时兼容多种主流模型 | 未在摘要中明确说明 | 解决现有微调方法通常需要大量重新训练或局限于特定模型架构的问题，为实际应用中的全组织单细胞空间表达分析提供一种实用解决方案 | 细胞分割模型 | 数字病理学 | NA | 空间组学技术 | 深度学习分割模型 | 图像（核或膜染色图像） | 小数据集（具体数量未在摘要中说明） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1944 | 2026-01-17 |
Integrating single-cell and bulk transcriptomes identifies B cell features associated with neoadjuvant chemoradiotherapy sensitivity in rectal cancer
2026-Jan-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-31068-0
PMID:41484196
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量转录组数据，识别了与直肠癌新辅助放化疗敏感性相关的B细胞亚群及其特征基因 | 应用Scissor算法整合单细胞RNA-seq和批量转录组数据，首次在直肠癌中鉴定出与nCRT反应相关的特定B细胞亚群，并基于此开发了机器学习预测模型 | 研究样本量有限，验证队列仅64例样本，且未进行实验验证B细胞亚群的功能机制 | 探究B细胞在直肠癌新辅助放化疗反应中的作用，并开发预测模型 | 直肠癌患者样本 | 生物信息学 | 直肠癌 | 单细胞RNA-seq，批量转录组测序 | 机器学习模型 | 转录组数据 | 未明确总样本数，验证队列包含64例样本 | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |
| 1945 | 2026-01-17 |
Chronic Alcohol Consumption Enhances the Differentiation Capacity of Hematopoietic Stem and Progenitor Cells into Osteoclast Precursors
2026-Jan, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2025.06.010
PMID:40683559
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研究论文 | 本研究探讨了长期酒精摄入如何增强造血干细胞和祖细胞向破骨细胞前体分化的能力，揭示了酒精导致骨密度降低和骨骼脆性的机制 | 首次在恒河猴模型中结合谱系流式细胞术和单细胞RNA测序，系统分析了长期酒精摄入对造血干细胞和祖细胞向破骨细胞分化能力的影响，并识别了相关的转录组和表观遗传变化 | 研究基于动物模型，结果可能不完全适用于人类；样本量未明确说明，可能影响统计效力；未探讨长期酒精摄入对其他骨细胞类型的影响 | 探究长期酒精摄入如何通过影响造血干细胞和祖细胞的分化能力，导致骨密度降低和骨骼疾病 | 恒河猴模型中的造血干细胞和祖细胞及其分化的单核细胞/巨噬细胞和破骨细胞前体 | 单细胞组学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序，谱系流式细胞术，集落形成单位分析，抗酒石酸酸性磷酸酶染色 | NA | 单细胞转录组数据，流式细胞数据，功能实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1946 | 2026-01-17 |
Network models for bridging denoising and identifying spatial domains of spatially resolved transcriptomics
2026-Jan, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013867
PMID:41529048
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研究论文 | 本文提出了一种名为stACN的集成网络模型，用于联合去噪空间转录组数据并识别空间域 | 首次通过图噪声模型学习干净的双细胞网络，并利用联合张量分解提取兼容的细胞特征，实现了去噪与空间域识别的统一框架 | 未明确说明模型对特定噪声类型或组织复杂度的适应性限制 | 解决空间转录组数据中技术噪声干扰与空间域识别分离处理导致的性能限制问题 | 空间转录组学数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学技术 | 图神经网络、张量分解 | 基因表达空间数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1947 | 2026-01-16 |
A standardized approach for the isolation of vascular smooth muscle cells from carotid atherosclerotic plaques
2026-Jan-10, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-24161-x
PMID:41519833
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研究论文 | 本文优化了一种从人类颈动脉粥样硬化斑块中分离高活性血管平滑肌细胞的酶消化方案，并通过单细胞转录组分析验证了其有效性 | 开发了一种简化的酶消化方案，能够高效分离高活性的血管平滑肌细胞，适用于单细胞研究，并通过单细胞RNA测序验证了细胞身份和表型转换 | 样本量较小，仅涉及四个颈动脉斑块（两个稳定和两个不稳定），且来自特定患者群体，可能限制结果的普遍性 | 优化从人类颈动脉粥样硬化斑块中分离血管平滑肌细胞的方案，以支持下游细胞培养分析和单细胞研究 | 人类颈动脉粥样硬化斑块中的血管平滑肌细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | Harmony集成分析、伪时间轨迹推断 | 单细胞转录组数据 | 四个颈动脉斑块（两个稳定、两个不稳定），来自男性和女性患者，共23,661个细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10X Genomics Chromium | 10X Genomics Chromium平台用于单细胞RNA测序 |
| 1948 | 2026-01-16 |
Single-Cell Analysis Combined with Mendelian Randomization Identifies Genes Associated with Prostate Cancer Cells
2026-Jan, The world journal of men's health
DOI:10.5534/wjmh.240298
PMID:40583027
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞测序数据与孟德尔随机化分析，识别了与前列腺癌细胞相关的基因，特别是TMEM59在疾病进展中的潜在作用 | 首次结合单细胞测序与孟德尔随机化分析来识别前列腺癌预后相关基因，并验证了TMEM59作为保护性因子的功能 | 样本量较小（仅6例前列腺癌病例），且依赖于公共数据库数据，可能限制结果的普遍性 | 研究前列腺癌包膜侵犯相关的预后基因 | 前列腺癌细胞 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞测序, 孟德尔随机化分析, 免疫组织化学, 细胞功能实验 | hdWGCNA, Seurat, Cox回归 | 单细胞RNA-seq数据, SNP数据, 临床数据 | 6例前列腺癌病例的单细胞数据，以及TCGA和GEO的临床与基因表达数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1949 | 2026-01-15 |
Machine learning and multi-omics integration identifies immunological predictors and mechanistic insights in autoimmune encephalitis
2026-Jan-14, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.]
IF:4.8Q2
DOI:10.1007/s00011-025-02180-8
PMID:41533076
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研究论文 | 本研究利用免疫指标和机器学习算法开发了自身免疫性脑炎的预后预测模型，并通过多组学方法探讨了核磷蛋白1在疾病发病机制中的潜在作用 | 首次整合了临床免疫指标、多种机器学习算法、SHAP可解释性分析、单细胞RNA测序、空间转录组学和表型全基因组关联研究，构建了可解释的预后预测模型并提出了新的潜在治疗靶点 | PAIA治疗的证据仅来自单个患者，NPM1作为治疗靶点的安全性仍需进一步验证，PheWAS仅为初步安全性评估 | 开发自身免疫性脑炎的预后预测模型并探索疾病发病机制 | 抗体阳性自身免疫性脑炎患者及实验性自身免疫性脑脊髓炎模型 | 机器学习 | 自身免疫性脑炎 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 表型全基因组关联研究 | RF, XGBoost, LGBM | 临床免疫指标数据, 单细胞RNA测序数据, 空间转录组学数据 | 未明确患者数量，包含独立验证队列 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1950 | 2026-01-15 |
D-Mannose-Modified M2 Macrophage Membrane-Derived Decoy Nanovesicles for Synergistic Immunotherapy of Asthma
2026-Jan-13, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.5c04996
PMID:41441854
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于M2巨噬细胞膜的纳米诱饵，用于协同免疫治疗哮喘 | 利用M2巨噬细胞膜衍生的纳米诱饵高效捕获多种2型细胞因子，并通过D-甘露糖修饰增强细胞因子清除，实现协同免疫抑制 | 研究基于小鼠模型，尚未在人体中进行验证 | 开发一种针对哮喘的纳米技术免疫疗法 | 哮喘（特别是嗜酸性粒细胞性哮喘） | NA | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1951 | 2026-01-15 |
Single-cell integration and multi-modal profiling reveals phenotypes and spatial organization of neutrophils in colorectal cancer
2026-Jan-12, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2025.12.003
PMID:41529665
|
研究论文 | 本研究通过单细胞整合与多模态分析，揭示了结直肠癌中中性粒细胞的表型、空间组织及其在肿瘤微环境中的免疫调节作用 | 构建了包含427万单细胞的大规模图谱，结合空间转录组学和蛋白质谱数据，首次识别出具有抗原呈递特性的中性粒细胞亚群，并揭示了KRAS依赖的中性粒细胞促肿瘤极化及IL-1信号介导的中性粒细胞-成纤维细胞相互作用 | NA | 探究结直肠癌肿瘤微环境中免疫细胞的组成、表型及空间相互作用，以理解其对治疗反应的影响 | 结直肠癌患者样本中的单细胞，包括中性粒细胞等免疫细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 蛋白质谱分析 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 蛋白质数据 | 1,670例患者样本（含4.27百万单细胞），补充了266例患者的单细胞谱，以及3.7百万细胞的空间转录组和0.7百万细胞的蛋白质谱 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 1952 | 2026-01-15 |
Identification of Crohn's disease subtypes in single-cell RNA sequencing signatures of treatment-naive samples across the pediatric gastrointestinal tract
2026-Jan-09, Journal of Crohn's & colitis
DOI:10.1093/ecco-jcc/jjaf225
PMID:41369126
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，在未接受治疗的儿童克罗恩病患者中，识别了跨胃肠道多个区域的疾病亚型 | 开发了聚类稳定性评估工作流程以确保结果的稳健性，并首次在未治疗儿科队列中应用张量分解技术来识别疾病亚型 | 研究样本仅限于未接受治疗的儿童患者，且炎症对细胞比例的影响因供体和组织异质性而较弱 | 研究克罗恩病的发病机制，识别疾病亚型以推动个性化医疗 | 未接受治疗的儿童克罗恩病患者的回肠、结肠和直肠活检样本 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序 | 张量分解 | 单细胞转录组数据 | 一个未治疗儿科克罗恩病队列的多个胃肠道区域活检样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1953 | 2026-01-15 |
A co-evolutionary perspective on humans and Mycobacterium tuberculosis in the era of systems biology
2026-Jan-07, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.108175
PMID:41499279
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综述 | 本文从系统生物学的角度探讨了人类与结核分枝杆菌的共进化关系，强调了宿主-病原体相互作用的复杂性 | 提出单一免疫机制研究阻碍进展，倡导采用系统生物学方法（如单细胞和空间转录组学）来全面理解结核病的多路径发病机制 | 未具体说明如何在实际研究中整合这些新兴方法以克服现有分析的缺陷 | 理解人类与结核分枝杆菌在共进化背景下的宿主-病原体相互作用，以推动结核病防控 | 人类与结核分枝杆菌（Mtb）的共进化关系及免疫学过程 | 系统生物学 | 结核病 | 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1954 | 2026-01-15 |
Cigarette smoke-mediated YTHDC2 suppression drives macrophage senescence and a tumor-promoting microenvironment in lung cancer
2026-Jan, Immunology and cell biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1111/imcb.70068
PMID:41292214
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研究论文 | 本研究揭示了香烟烟雾通过抑制m6A阅读器YTHDC2诱导巨噬细胞衰老，从而在肺癌中形成促肿瘤微环境的机制 | 首次发现YTHDC2在香烟烟雾诱导的巨噬细胞衰老及促肿瘤微环境形成中的关键调控作用 | 研究主要基于体外实验和动物模型，尚未在人体临床试验中验证 | 探究香烟烟雾如何通过调控YTHDC2影响巨噬细胞功能及肺癌微环境 | 肺癌组织、巨噬细胞、香烟烟雾暴露模型 | 肿瘤免疫学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 吸烟者与非吸烟者的肺癌组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1955 | 2026-01-15 |
Single-cell transcriptome analysis reveals macrophage-specific apolipoprotein C1 as a key regulator of polarization and progression in triple-negative breast cancer
2026-Jan, Immunology and cell biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1111/imcb.70066
PMID:41294154
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了载脂蛋白C1（APOC1）在调控三阴性乳腺癌中肿瘤相关巨噬细胞极化和促进肿瘤进展中的关键作用 | 首次在单细胞水平上系统解析了三阴性乳腺癌中巨噬细胞的异质性，并鉴定出APOC1作为调控巨噬细胞向促肿瘤M2表型极化的关键分子，其通过激活糖酵解通路发挥作用 | 研究主要基于体外细胞实验和单细胞测序数据分析，缺乏体内动物模型的直接验证；APOC1调控糖酵解的具体下游分子机制尚未完全阐明 | 探究三阴性乳腺癌中肿瘤相关巨噬细胞的异质性及其促进肿瘤进展的分子机制 | 三阴性乳腺癌组织中的巨噬细胞（特别是脂质相关巨噬细胞LA-TAMs） | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1956 | 2026-01-15 |
Co-targeting MRPS7-23 synergistically enhances cisplatin efficacy to suppress nasopharyngeal carcinoma growth and metastasis
2026, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.115523
PMID:41522354
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学分析，揭示了MRPS7和MRPS23通过稳定β-catenin驱动鼻咽癌顺铂耐药的新机制，并发现靶向其上游调控因子USP10可协同增强顺铂疗效 | 首次鉴定出线粒体核糖体蛋白MRPS7和MRPS23是鼻咽癌顺铂耐药的关键驱动因子，并阐明了其通过抑制β-catenin泛素化促进癌症干细胞特性和上皮-间质转化的分子机制，同时发现了USP10作为上游调控因子的新作用 | 研究主要基于细胞和动物模型，临床转化效果仍需进一步验证；耐药机制可能涉及其他未被发现的通路 | 阐明鼻咽癌顺铂耐药的分子机制，并寻找逆转耐药的治疗策略 | 鼻咽癌细胞系、动物模型以及相关的分子通路 | 癌症生物学 | 鼻咽癌 | 整合多组学分析、单细胞RNA测序、质谱分析、功能研究 | NA | 基因组学数据、转录组学数据、蛋白质组学数据 | 未在摘要中明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1957 | 2026-01-15 |
Dual Phosphorylation of STAT1 at Y701/S727 by TNFα Drives AIM2-Mediated PANoptosis of Renal Tubular Epithelial Cells and Fibrotic Progression in Renal Allografts
2026, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.123441
PMID:41522348
|
研究论文 | 本研究揭示了TNF-α通过双重磷酸化STAT1激活AIM2，驱动肾小管上皮细胞发生PANoptosis，进而促进肾移植间质纤维化的分子机制 | 首次阐明了TNF-α/STAT1/AIM2轴在触发PANoptosis及其下游EMT-纤维化级联反应中的作用，为慢性移植肾功能障碍提供了新的治疗靶点 | NA | 探究慢性移植肾功能障碍中肾移植间质纤维化的分子机制 | 肾移植组织、肾小管上皮细胞 | 数字病理 | 慢性移植肾功能障碍 | 单细胞测序 | NA | 测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1958 | 2026-01-15 |
Acute anti-Aβ antibody exposure induces microglial changes and significantly alters chemokine signaling
2026 Jan-Mar, Alzheimer's & dementia (New York, N. Y.)
DOI:10.1002/trc2.70201
PMID:41522370
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析，探讨了抗淀粉样蛋白β抗体（3D6）急性暴露对大脑免疫反应的影响，特别是小胶质细胞的变化和趋化因子信号通路的改变 | 首次在急性时间点（3天）通过单细胞测序揭示抗Aβ抗体如何快速改变小胶质细胞亚型和趋化因子信号，特别是CCL通路靶向稳态小胶质细胞而非疾病相关亚型的新发现 | 研究仅基于短期（3天）观察，未评估长期效应；颅内注射模型可能无法完全模拟临床免疫治疗的实际给药方式 | 阐明抗淀粉样蛋白β抗体治疗阿尔茨海默病时大脑的即时免疫反应机制 | 小鼠大脑皮层组织中的小胶质细胞 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞测序分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本数量，但涉及3D6抗体注射组和IgG对照组的小鼠大脑皮层 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1959 | 2026-01-14 |
Detection of pleiotropic genetic factors and critical brain cell types linking insomnia with psychiatric disorders
2026-Jan-13, Sleep
IF:5.3Q1
DOI:10.1093/sleep/zsaf317
PMID:41065713
|
研究论文 | 本研究通过分析失眠症与12种精神疾病的遗传关联，揭示了它们之间共享的遗传结构和神经生物学机制 | 首次系统地识别了失眠症与多种精神疾病共享的70个基因组位点，并确定了GABA能突触信号通路和特定皮质神经元亚型在共病机制中的核心作用 | 研究主要基于欧洲血统人群的GWAS数据，可能限制了结果在其他人群中的普适性；功能验证和因果推断需要进一步实验研究 | 探究失眠症与精神疾病之间的遗传重叠、生物学通路和脑细胞类型关联 | 失眠症和12种精神疾病（包括ADHD、厌食症、焦虑症、自闭症谱系障碍、双相情感障碍、重度抑郁症和精神分裂症）的基因组数据 | 遗传学与神经科学 | 精神疾病与睡眠障碍 | 全基因组关联研究（GWAS）、单细胞RNA测序 | bivariate MiXeR、conjFDR、ASSET、MAGMA、SEISMIC | 基因组关联数据、单细胞转录组数据 | 失眠症样本量314,149；精神疾病样本量12,783至449,855不等 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1960 | 2026-01-14 |
GraphSTAR: Proximal Operator-Based Graph Neural Network Enhanced by Dynamic Graph Aggregation for Spatial Transcriptomics
2026-Jan-12, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2025.3644379
PMID:41525646
|
研究论文 | 本文提出了一种名为GraphSTAR的新方法，用于整合空间转录组学中的空间坐标和基因表达数据，以改进空间域识别和细胞类型注释任务 | GraphSTAR通过将空间和基因表达数据编码为无向图，并利用动态图聚合结合近端算子，有效建模局部邻域关系和长程功能关联，克服了现有方法在探索长程关系方面的不足 | NA | 解决空间转录组学中原始空间坐标与高维基因表达谱在原生特征空间中的整合挑战，以更好地解析基因的空间表达模式 | 空间转录组学数据，包括空间坐标和基因表达谱 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学技术 | 图神经网络（GNN） | 空间坐标和基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |