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当前共找到 1234 篇文献，本页显示第 161 - 180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2026-02-07 |
NR4A1 limits CD8 + T Cell effector responses and protection in tuberculosis
2026-Jan-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.12.699051
PMID:41648508
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研究论文 | 本研究通过小鼠、猕猴和人类数据验证，发现核受体NR4A1是结核病中CD8+ T细胞免疫的关键抑制因子，并揭示NR4A1-NKG7轴可作为新的宿主导向治疗靶点 | 首次将NR4A1鉴定为结核病中CD8+ T细胞免疫的负调控因子，并发现其通过抑制NKG7表达来限制CD8+ T细胞效应功能，提出了新的宿主导向治疗策略 | 研究主要基于动物模型，人类数据验证仍需进一步扩展；NR4A1抑制剂的长期安全性和疗效尚未在临床环境中验证 | 探究结核病感染中CD8+ T细胞功能受限的分子机制，并寻找潜在的免疫治疗靶点 | 小鼠模型（包括基因敲除鼠和过继转移模型）、猕猴数据集、人类结核病数据集中的CD8+ T细胞 | 免疫学 | 结核病 | RNA测序（包括bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq）、空间分析、ChIP-qPCR、基因敲除、药理学抑制 | 动物模型（小鼠、猕猴）、计算分析模型 | 基因表达数据、空间定位数据、蛋白质结合数据 | 多种动物模型和人类数据集，具体样本数量未在摘要中明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 162 | 2026-02-07 |
Using Spatial Transcriptomics to Identify a Diagnostic Molecular Signature Associated with Reversible Dental Pulpitis
2026-Jan-12, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-7955718/v1
PMID:41646399
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术分析牙髓炎样本，旨在识别与可逆性牙髓炎相关的诊断性分子特征，以改进牙髓状态的分类和诊断方法 | 首次应用空间转录组学（Visium-CytAssist-V2）技术于牙髓炎研究，揭示了传统可逆/不可逆分类框架之外的分子亚型，并强调了免疫-成纤维细胞相互作用在牙髓炎进展中的关键作用 | 样本量较小（仅四个牙髓组织），且仅关注冠状区域邻近龋损的部位，可能限制了结果的普遍性和统计效力 | 研究牙髓炎的转录组学特征，识别炎症亚型，并改进超越传统可逆/不可逆框架的分类方法 | 牙髓组织，包括健康牙髓（HL）、可逆性牙髓炎（RP）和不可逆性牙髓炎（IP） | 数字病理学 | 牙髓炎 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学数据 | 四个牙髓组织样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium | Visium-CytAssist-V2 |
| 163 | 2026-02-07 |
Spatial transcriptomics reveals organizational properties of mouse spinal cord and alterations in neuropathic pain
2026-Jan-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.10.698734
PMID:41648549
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术，揭示了成年小鼠脊髓的组织结构和神经性疼痛模型中的转录组变化 | 首次应用空间分辨单细胞转录组分析成年小鼠脊髓，揭示了神经元亚型的空间分布、性别特异性差异以及神经性疼痛中的转录组和细胞通讯变化 | 研究基于小鼠模型，结果可能不完全适用于人类；空间转录组学技术分辨率有限，可能无法捕捉所有细胞间相互作用细节 | 解码脊髓在健康和疾病状态下的感觉与运动功能电路机制 | 成年小鼠脊髓组织 | 空间转录组学 | 神经性疼痛 | 空间转录组学，单细胞转录组分析 | NA | 空间转录组数据，单细胞转录组数据 | 成年小鼠脊髓组织样本 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 164 | 2026-02-07 |
Interpreting the molecular and cellular landscape of PCOS through bulk transcriptomics, single-cell transcriptomics and machine learning
2026-Jan-07, Journal of ovarian research
IF:3.8Q1
DOI:10.1186/s13048-025-01956-0
PMID:41501917
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研究论文 | 本研究通过整合bulk转录组学、单细胞转录组学和机器学习方法，揭示了多囊卵巢综合征的分子机制和细胞组成，并开发了诊断模型 | 首次结合bulk和单细胞RNA测序与机器学习，识别了PCOS中关键的颗粒细胞亚群GC9，并构建了基于三基因标志的诊断模型 | 研究样本量有限，且主要基于转录组数据，未全面探索其他分子层面如蛋白质组或代谢组 | 阐明PCOS的分子机制和细胞基础，以发现潜在治疗靶点并提高诊断准确性 | 多囊卵巢综合征患者的颗粒细胞 | 机器学习 | 多囊卵巢综合征 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, qPCR, western blotting | 机器学习算法 | RNA测序数据, 临床样本数据 | PCOS患者和对照组的临床样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 165 | 2026-02-07 |
Therapeutic potential of CDK8 inhibitor combined with sorafenib for hepatocellular carcinoma: mechanistic insights and in vitro validation
2026-Jan-07, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-025-03780-0
PMID:41501937
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研究论文 | 本研究探讨了CDK8抑制剂MSC2530818与索拉非尼联合使用对肝细胞癌的治疗潜力，通过机制分析和体外实验验证其协同抗肿瘤效果 | 首次结合单细胞RNA-seq分析揭示CDK8在肝细胞癌中的表达模式，并验证CDK8抑制剂与索拉非尼的联合治疗策略在体外模型中的协同增效作用 | 研究主要基于体外细胞实验（Huh7细胞），缺乏体内动物模型或临床样本的直接验证，且样本量有限 | 探索肝细胞癌的新型治疗靶点及联合治疗策略 | 肝细胞癌组织样本、Huh7肝癌细胞系 | 肿瘤生物学 | 肝细胞癌 | 免疫组化、RNA-seq、微阵列数据分析、单细胞RNA-seq、细胞增殖实验、划痕实验、Transwell实验 | NA | 组织样本数据、基因表达数据、单细胞转录组数据、体外细胞实验数据 | 75例肝细胞癌及癌旁组织样本，整合分析3969例肝细胞癌和3245例非肿瘤肝样本的RNA-seq和微阵列数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, 微阵列 | NA | NA |
| 166 | 2026-02-07 |
Transcriptomic landscape of coexisting ovarian clear cell carcinoma and endometriosis: Insights into malignant transformation
2026-Jan-07, Cancer treatment and research communications
DOI:10.1016/j.ctarc.2026.101098
PMID:41529504
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学和单细胞RNA测序整合分析，探讨了子宫内膜异位症（EMS）向卵巢透明细胞癌（OCCC）的恶性转化过程 | 通过整合空间转录组学和单细胞RNA测序数据，首次揭示了EMS与OCCC共存区域的分子连接，并识别出OCCC特异性基因在EMS上皮细胞和肿瘤微环境中的分类 | 研究样本可能有限，未涉及所有卵巢癌亚型，且机制验证需进一步实验 | 阐明子宫内膜异位症向卵巢透明细胞癌恶性转化的分子机制 | 共存子宫内膜异位症和卵巢透明细胞癌的组织区域 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 167 | 2026-02-07 |
BayesRare: Bayesian mixture model for population-level rare cell type detection in multi-subject single-cell RNA sequencing data
2026-Jan-07, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag024
PMID:41632592
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研究论文 | 本文提出了一种名为BayesRare的层次贝叶斯框架，用于在多主体单细胞RNA测序数据中进行群体水平的罕见细胞类型检测 | 通过引入罕见簇指示器，结合跨主体信息，支持联合细胞类型聚类和罕见群体识别，并量化不确定性 | 未在摘要中明确提及 | 开发一种方法以在群体水平上检测罕见细胞类型，并推断组间差异 | 多主体单细胞RNA测序数据中的罕见细胞类型 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 贝叶斯混合模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 168 | 2026-02-07 |
scGACL: a generative adversarial network with multi-scale contrastive learning for accurate single-cell RNA sequencing imputation
2026-Jan-07, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag018
PMID:41632596
|
研究论文 | 本文提出了一种结合生成对抗网络和多尺度对比学习的单细胞RNA测序数据插补方法scGACL，以解决现有方法存在的过度平滑问题 | 提出了一种集成生成对抗网络与多尺度对比学习的新框架，通过细胞级和细胞类型级对比学习协同工作，在保持细胞间异质性的同时恢复基因表达 | 未在摘要中明确说明 | 开发一种能够准确插补单细胞RNA测序数据并保持细胞异质性的计算方法 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 生成对抗网络, 对比学习 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 169 | 2026-01-07 |
Single-cell RNA sequencing elucidates potential mechanisms of endothelial cells in lung region-specific repair and remodeling in combined pulmonary fibrosis and emphysema
2026-Jan-06, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-025-03460-x
PMID:41491179
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 170 | 2026-02-07 |
Integrative analysis of single-cell and bulk RNA sequencing data for discovery of senescent TAMs prognostic characteristics in neuroblastoma
2026-Jan-06, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-15517-7
PMID:41491450
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和bulk RNA测序数据，发现神经母细胞瘤中衰老肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）的预后特征，并构建了一个7基因风险模型 | 首次在神经母细胞瘤中鉴定出具有混合M1/M2状态的衰老TAM亚群，揭示了EIF5作为TAM衰老的关键调控因子，并开发了基于衰老特征的预后模型 | 研究主要基于公共数据集分析，需要进一步实验验证衰老TAMs在神经母细胞瘤中的具体作用机制 | 探索神经母细胞瘤中衰老肿瘤相关巨噬细胞的预后特征及其在肿瘤进展中的作用 | 神经母细胞瘤样本中的肿瘤相关巨噬细胞 | 生物信息学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序 | Cox/LASSO回归模型 | RNA测序数据 | 来自GEO（GSE147766）、TARGET-NBL和E-MTAB-8248等多个队列的神经母细胞瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 171 | 2026-02-07 |
Integrative single-cell and spatial transcriptomics with explainable AI reveal lethal prognostic axis in prostate cancer
2026-Jan-06, NPJ digital medicine
IF:12.4Q1
DOI:10.1038/s41746-025-02297-4
PMID:41495164
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研究论文 | 本研究整合单细胞转录组学、空间转录组学和可解释人工智能，揭示了前列腺癌中的致死性肿瘤轴并建立了一个可解释的预后模型 | 首次整合单细胞与空间转录组数据，结合可解释机器学习识别出与前列腺癌致死性相关的C4恶性上皮亚群及其驱动的预后轴 | 研究样本主要来自特定队列，需要在更广泛的人群中进行外部验证 | 定义前列腺癌的致死性肿瘤轴并建立可解释的预后分层框架 | 前列腺癌患者组织样本 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | Lasso, PLS-Cox, SHAP | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 141,986个高质量单细胞，涵盖局限性、激素敏感性和去势抵抗性前列腺癌 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 172 | 2026-02-07 |
Single-cell profiling defines the cellular landscape of the urinary bladder: a scoping review
2026-Jan-05, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-025-03750-6
PMID:41491261
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综述 | 本文通过范围综述，总结了单细胞RNA测序技术在健康膀胱细胞异质性研究中的应用，并识别了文献中的空白以指导未来研究 | 整合了12项研究，首次系统性地绘制了膀胱细胞图谱，包括罕见和新发现的细胞类型，并讨论了单细胞与单核RNA测序的比较 | 仅纳入英文发表的研究，可能遗漏其他语言的重要文献；研究范围限定于健康膀胱，未涉及疾病状态 | 旨在评估单细胞RNA测序在健康膀胱细胞异质性研究中的应用现状，并识别文献空白 | 健康膀胱中的细胞，包括尿路上皮细胞、间质细胞、平滑肌细胞、免疫细胞、内皮细胞、间皮细胞和神经细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，单核RNA测序 | NA | 转录组数据 | 基于12项研究的综合样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq | NA | NA |
| 173 | 2026-02-07 |
Mitochondrial-related biomarkers as the diagnostic markers in sepsis induced acute respiratory distress syndrome
2026-Jan-05, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-025-03772-0
PMID:41491575
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研究论文 | 本研究旨在识别与线粒体相关的生物标志物，用于诊断脓毒症诱发的急性呼吸窘迫综合征 | 首次通过整合差异表达基因、线粒体相关基因和多种机器学习算法，识别出三个新的脓毒症诱发ARDS的生物标志物，并构建了具有良好性能的列线图诊断模型 | 研究结果仍需在更大规模的前瞻性临床队列中进行验证，以确认其诊断效能和临床应用价值 | 寻找脓毒症诱发急性呼吸窘迫综合征的诊断生物标志物 | 脓毒症诱发急性呼吸窘迫综合征患者 | 生物信息学 | 急性呼吸窘迫综合征 | 单细胞RNA测序，定量逆转录聚合酶链反应，Western blotting | 机器学习算法 | 基因表达数据，单细胞测序数据 | 未明确说明具体样本数量，使用了公共数据集和实验验证 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 174 | 2026-02-07 |
Integrative multi-omics analysis reveals gut microbiota-derived metabolites and immune regulatory pathways in osteoarthritis pathogenesis
2026-Jan-05, Journal of orthopaedic surgery and research
IF:2.8Q1
DOI:10.1186/s13018-025-06604-3
PMID:41491956
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研究论文 | 本研究通过整合多组学分析，揭示了肠道菌群衍生代谢物和免疫调控通路在骨关节炎发病机制中的作用 | 构建了连接肠道菌群、代谢物和关键基因ARG1的M-M-T网络，并利用机器学习、SHAP和孟德尔随机化等方法识别了具有药物潜力的微生物代谢物 | 研究主要基于计算和生物信息学分析，缺乏体外和体内实验验证 | 探索肠道菌群通过代谢物和免疫调控通路影响骨关节炎发病的机制 | 骨关节炎患者相关的肠道菌群、代谢物、基因和免疫通路 | 机器学习 | 骨关节炎 | 多组学分析、单细胞转录组学、机器学习、孟德尔随机化 | 机器学习模型（未指定具体类型） | 基因表达数据、代谢物数据、单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 175 | 2026-02-07 |
Downregulation of USP39 in sepsis reflects immune dysfunction and offers diagnostic and prognostic value
2026-Jan-05, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-025-03709-7
PMID:41491968
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研究论文 | 本研究分析了USP39在脓毒症中的表达下调及其与免疫功能障碍的关联，探讨了其诊断和预后价值 | 首次系统性地将USP39的表达与脓毒症的免疫细胞浸润、临床特征及预后联系起来，并通过单细胞RNA-seq数据验证其在单核细胞和T细胞中的差异表达 | 研究主要基于公共数据集和体外细胞实验，缺乏大规模的前瞻性临床队列验证，且机制研究尚不深入 | 探讨USP39在脓毒症中的表达模式、临床意义及其作为治疗靶点的潜力 | 脓毒症患者样本（来自公共RNA-seq数据集）和LPS诱导的THP-1细胞系 | 生物信息学 | 脓毒症 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 细胞培养与转染, 细胞活力与凋亡检测, 炎症因子测定 | Cox回归, ROC曲线分析, GSEA, GSVA, ssGSEA, PCA, UMAP | 基因表达数据, 单细胞数据, 实验数据 | 公共RNA-seq数据集中的脓毒症患者和对照组样本，以及单细胞RNA-seq数据集GSE175453 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 176 | 2026-01-05 |
Spatial transcriptomics of developing human lungs defines cellular phenotypes associated with age, lineage and location
2026-Jan-03, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-34594-z
PMID:41484334
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 177 | 2026-02-07 |
Functional characterization of a human epilepsy-associated gene network reveals metabolic regulation as a critical factor underlying seizure susceptibilities
2026-Jan-01, Disease models & mechanisms
IF:4.0Q1
DOI:10.1242/dmm.052307
PMID:40401642
|
研究论文 | 本研究利用果蝇全脑单细胞RNA测序技术，验证并表征了一个人类癫痫相关基因共表达网络，揭示了代谢调控在癫痫易感性中的关键作用 | 首次结合果蝇单细胞表达数据和行为分析，验证人类癫痫基因网络，并发现代谢通路和AMPK活性在癫痫易感性中的新调控机制 | 研究基于果蝇模型，结果在人类中的直接适用性需进一步验证；样本规模相对有限 | 探索癫痫的分子机制，特别是基因网络和代谢调控在癫痫易感性中的作用 | 果蝇模型和人类癫痫相关基因网络 | 神经科学 | 癫痫 | 单细胞RNA测序 | 果蝇基因敲低模型 | 基因表达数据 | 涉及26个基因的果蝇模型，具体样本数未明确 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 178 | 2026-02-07 |
scDBImpute: Dual-Branch Imputation for Single-Cell RNA-Seq Data Dropouts
2026 Jan-Feb, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2025.3636928
PMID:41289139
|
研究论文 | 本文提出了一种用于单细胞RNA测序数据中丢失值填补的双分支方法，以解决因技术限制导致的过量零值问题 | 与先前假设单一结构的方法不同，该方法结合线性和非线性关联来构建数据，通过双分支管道进行丢失值填补 | NA | 开发一种能够更准确地恢复单细胞RNA测序数据中丢失基因表达值的方法 | 单细胞RNA测序数据中的丢失值（dropouts） | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 双分支模型（结合线性和非线性管道） | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 179 | 2026-02-07 |
GALA: Integrating Weighted Graph Walks and Latent-Space Adversarial Training for Single-Cell Batch Alignment
2026 Jan-Feb, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2025.3646228
PMID:41418016
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研究论文 | 本文提出了一种名为GALA的新型单细胞批次校正框架，通过整合加权图随机游走和潜在空间对抗训练来对齐单细胞RNA测序数据 | 提出了一种结合加权图互近邻模块和潜在空间对抗训练的新框架，在跨批次细胞配对多样性和覆盖率上相比传统方法有显著提升 | NA | 解决单细胞RNA测序数据中的批次效应问题，实现数据整合分析 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 对抗训练 | 基因表达数据 | 五个基准数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 180 | 2026-02-07 |
Mechanistic Insights into Threonine Tyrosine Kinase Mediated Cell Cycle Regulation in Triple-negative Breast Cancer
2026 Jan-Feb, Cancer genomics & proteomics
IF:2.6Q3
DOI:10.21873/cgp.20563
PMID:41482351
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研究论文 | 本研究探讨了苏氨酸酪氨酸激酶（TTK）在三阴性乳腺癌（TNBC）中通过调控细胞周期和Wnt/β-catenin信号通路驱动肿瘤进展的机制 | 结合bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据，揭示了TTK在细胞周期S期和G2/M期特异性高表达，并通过维持β-catenin-Cyclin D1信号轴促进TNBC增殖的新机制 | 研究主要基于体外细胞实验和生物信息学分析，缺乏体内动物模型验证和临床样本的直接功能验证 | 阐明TTK在三阴性乳腺癌发生发展中的分子机制，并评估其作为预后生物标志物和治疗靶点的潜力 | 三阴性乳腺癌细胞系、正常乳腺上皮细胞、公共乳腺癌RNA-seq数据集（包括bulk和单细胞数据） | 癌症生物学 | 乳腺癌（三阴性亚型） | RNA测序（bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq）、siRNA敲低、细胞增殖/克隆形成/迁移实验、细胞周期分析、免疫荧光、Western blot、功能富集分析、蛋白质-蛋白质相互作用分析、拟时序轨迹分析 | NA | 基因表达数据（RNA-seq）、蛋白质表达数据、细胞功能表型数据 | 未明确指定具体样本数量，使用了公共数据集、TNBC细胞系和正常乳腺上皮细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |