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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1701 2026-02-07
GALA: Integrating Weighted Graph Walks and Latent-Space Adversarial Training for Single-Cell Batch Alignment
2026 Jan-Feb, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
研究论文 本文提出了一种名为GALA的新型单细胞批次校正框架,通过整合加权图随机游走和潜在空间对抗训练来对齐单细胞RNA测序数据 提出了一种结合加权图互近邻模块和潜在空间对抗训练的新框架,在跨批次细胞配对多样性和覆盖率上相比传统方法有显著提升 NA 解决单细胞RNA测序数据中的批次效应问题,实现数据整合分析 单细胞RNA测序数据 机器学习 NA 单细胞RNA测序 对抗训练 基因表达数据 五个基准数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1702 2026-02-07
A Narrative Review of Synaptic Transmission and Its Role in Neurological and Psychiatric Disorders: A Molecular Perspective
2026-Jan, Cureus
综述 本文从分子角度,综述了突触传递在多种神经和精神疾病中的作用,并整合了分子遗传学、突触蛋白质组学、神经影像学和系统神经科学的最新进展,提出了一个跨诊断的系统级框架 整合了不同疾病背景下关于突触功能障碍的分散知识,提出了一个跨神经和精神疾病的、以突触为中心的系统级统一框架,并指出了具有转化潜力的新兴工具 作为一篇叙述性综述,其结论主要基于对现有文献的综合分析,而非原始研究数据,且所提出的框架仍需未来实验验证 旨在弥合关于突触功能障碍在神经和精神疾病中作用的现有知识鸿沟,提供一个整合的、跨疾病的分子视角 突触传递的分子过程及其在精神分裂症、自闭症谱系障碍、阿尔茨海默病、癫痫、重度抑郁症和帕金森病等疾病中的功能障碍 神经科学 神经和精神疾病(包括精神分裂症、自闭症谱系障碍、阿尔茨海默病、癫痫、重度抑郁症、帕金森病) 分子遗传学, 突触蛋白质组学, 神经影像学, 系统神经科学, 单细胞RNA测序, 空间蛋白质组学, 突触正电子发射断层扫描成像 NA NA NA NA 单细胞RNA测序, 空间蛋白质组学 NA NA
1703 2026-02-07
Diabetic kidney disease: integrating multi-omics insights, artificial intelligence, and novel therapeutics for precision medicine
2026, Frontiers in genetics IF:2.8Q2
综述 本文综述了糖尿病肾病研究的最新进展,重点整合了多组学见解、人工智能应用及新型治疗策略,以推动精准肾病学的发展 整合单细胞RNA测序、空间转录组学、代谢组学等多组学数据与人工智能深度学习模型,揭示了疾病异质性、早期代谢紊乱及免疫失调机制,并探讨了针对炎症、纤维化和代谢通路的新型治疗靶点 作为一篇综述文章,未涉及原始实验数据或具体模型验证,主要基于现有文献进行综合评述,可能未涵盖所有最新研究 旨在通过整合多组学技术、人工智能和新型治疗方法,实现糖尿病肾病的早期检测、精准风险分层和个性化管理 糖尿病肾病(DKD)的分子机制、生物标志物、疾病进展路径及治疗策略 数字病理学 糖尿病肾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、空间转录组学、代谢组学 深度学习模型(如DeepDKD) 图像(视网膜图像)、多组学数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
1704 2026-02-07
Synthetic Assessment of Transfer Learning Method From Cell Lines to Single-Cell on Drug Response Prediction
2026 Jan-Feb, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
研究论文 本研究首次对基于迁移学习的单细胞药物反应预测代表性模型进行了全面评估 首次系统性地比较和评估了从细胞系到单细胞的药物反应预测迁移学习方法,填补了该领域缺乏系统性评估的空白 研究依赖于公开数据集,可能无法覆盖所有临床场景;评估主要基于现有方法,未提出新的算法 评估迁移学习方法在单细胞药物反应预测中的效果,为模型选择和设计提供方法学指导 单细胞表达数据与药物敏感性预测模型 机器学习 癌症(泛指肿瘤疾病) 单细胞测序 迁移学习模型 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1705 2026-02-07
Identification of common genes and biomarkers between Dermatomyositis and rheumatoid arthritis through integrated bioinformatics
2026, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 本研究通过整合生物信息学和机器学习方法,鉴定了皮肌炎和类风湿关节炎共有的关键基因、生物标志物及免疫微环境特征 首次通过整合多组学数据、加权基因共表达网络分析和机器学习模型,系统性地揭示了皮肌炎与类风湿关节炎共有的分子机制和免疫微环境重塑特征,并识别出具有诊断潜力的核心基因 研究主要基于公共数据库的转录组数据,缺乏实验验证;样本量有限,且外部验证队列的规模有待扩大 阐明皮肌炎与类风湿关节炎共病的分子机制,并识别潜在的诊断生物标志物 皮肌炎和类风湿关节炎患者的基因表达数据及免疫微环境 生物信息学 自身免疫性疾病 微阵列基因表达分析,单细胞RNA测序,加权基因共表达网络分析,机器学习建模 LASSO回归,随机森林 基因表达数据 基于多个GEO数据集(GSE55235, GSE55457, GSE12021, GSE159117),具体样本数未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1706 2026-02-06
Ningxue shengban decoction regulates T-cell immune balance in immune thrombocytopenia via the bone marrow hematopoietic microenvironment
2026-Jan-29, Computational biology and chemistry IF:2.6Q2
研究论文 本研究探讨了宁血升板汤通过调节骨髓造血微环境中的T细胞免疫平衡来治疗免疫性血小板减少症的机制 首次结合网络药理学、单细胞RNA测序分析和分子对接技术,系统揭示了宁血升板汤通过多靶点(RELA、IKBKB、AKT1等)作用于造血干细胞,调控其向巨核细胞和T淋巴细胞分化的分子机制 研究主要在ITP小鼠模型中进行,其结论在人体中的适用性有待进一步临床验证 探索宁血升板汤治疗免疫性血小板减少症的作用机制 免疫性血小板减少症小鼠模型、骨髓造血干细胞、T淋巴细胞亚群、巨核细胞 数字病理学 免疫性血小板减少症 流式细胞术、HE染色、ELISA、质谱分析、网络药理学、单细胞RNA测序、拟时序分析、分子对接 NA 单细胞RNA测序数据、流式细胞数据、组织染色图像、血清细胞因子数据 ITP小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1707 2026-02-06
NRF2-COX2-PGE 2 axis drives immune cold tumors and predicts resistance to combination immunotherapy in hepatocellular carcinoma
2026-Jan-15, Hepatology (Baltimore, Md.)
研究论文 本研究通过整合小鼠模型和人类肝癌组织数据,揭示了NRF2-COX2-PGE2轴驱动免疫冷肿瘤微环境并介导Atezolizumab联合贝伐珠单抗耐药的新机制 首次在异质性肝癌小鼠模型中结合条形码技术、单细胞RNA测序和空间转录组学,系统鉴定了NRF2-COX2-PGE2轴作为免疫冷肿瘤和联合免疫治疗耐药的关键驱动因素,并发现血浆PGE2可作为非侵入性生物标志物 研究主要基于回顾性队列和动物模型,需要前瞻性临床试验进一步验证靶向该通路的治疗策略 鉴定驱动免疫冷肿瘤微环境和Atezolizumab联合贝伐珠单抗耐药的肿瘤内在机制 肝癌小鼠模型、人类肝癌组织样本、接受Atez/Bev治疗的晚期肝癌患者队列 数字病理学 肝癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序, 条形码分析 NA RNA测序数据, 空间转录组数据, 临床数据 小鼠模型、549名Atez/Bev治疗患者、199名手术切除患者、247名IMbrave150/GO30140试验患者 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq NA NA
1708 2026-02-06
Impaired Mitophagy-Induced Apoptosis of Gingival Fibroblasts Exacerbates Diabetic Periodontitis Via THBS-1/CD36-Dependent Macrophage Activation
2026-Jan-14, Inflammation IF:4.5Q2
研究论文 本研究揭示了糖尿病牙周炎中牙龈成纤维细胞线粒体自噬受损导致凋亡,并通过THBS-1/CD36轴激活巨噬细胞,加剧炎症和组织破坏的机制 首次通过单细胞测序分析发现糖尿病牙龈组织中牙龈成纤维细胞的凋亡激活与线粒体失调密切相关,并阐明了THBS-1/CD36依赖的巨噬细胞激活新通路 研究主要基于体外和动物模型,临床样本验证有限,且THBS-1/CD36轴在其他细胞类型中的作用未充分探索 探究高血糖如何通过线粒体功能障碍和细胞间通讯加剧糖尿病牙周炎的炎症反应 糖尿病牙周炎患者的牙龈组织、牙龈成纤维细胞和巨噬细胞 NA 糖尿病牙周炎 单细胞测序、分子建模、基因沉默 NA 单细胞测序数据、分子相互作用数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
1709 2026-02-06
Molecular characterization of directly reprogrammed neurons from human fibroblasts using single cell RNA sequencing
2026-Jan-09, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,分析了通过PTBP1敲降从人皮肤成纤维细胞直接重编程为神经元的分子特征和细胞异质性 首次在人类细胞中应用单细胞RNA测序技术系统解析直接神经元重编程过程中的细胞异质性和分子转变轨迹,并开发了适用于单样本数据的统计稳健性分析框架 研究仅基于单个时间点(第14天)的样本进行分析,未涵盖重编程全过程的动态变化 探究人类成纤维细胞直接重编程为神经元的分子机制和细胞状态转变 经过PTBP1敲降处理的人皮肤成纤维细胞及其重编程产生的神经元 单细胞组学 NA 单细胞RNA测序 伪时间分析 单细胞转录组数据 第14天处理后的单细胞样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1710 2026-02-06
Boron neutron capture therapy preserves immune cells and induces robust anti-tumour immunity in preclinical mouse model
2026-Jan-08, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究比较了硼中子俘获疗法与X射线照射对免疫细胞的影响,揭示了BNCT通过诱导免疫原性肿瘤细胞死亡和重塑肿瘤微环境来增强抗肿瘤免疫的机制 首次在临床前模型中系统比较BNCT与传统X射线放疗对免疫系统的差异影响,并利用单细胞RNA测序技术解析BNCT重塑肿瘤微环境的机制 研究仅基于小鼠肿瘤模型,尚未在人体中进行验证;BNCT的长期免疫效应仍需进一步探索 探究硼中子俘获疗法的免疫学机制及其与传统放疗的差异 小鼠肿瘤模型中的免疫细胞和肿瘤微环境 肿瘤免疫学 癌症 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 小鼠肿瘤模型(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
1711 2026-02-06
Spatial information matters: are traditional imputation methods effective for spatial transcriptomics data?
2026-Jan-07, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 本文系统评估了七种先进的插补方法在五种新兴空间转录组学平台上的表现,并提出了一种结合空间信息的新方法SpaMean-Impute以更有效地处理丢失值 首次系统评估了现有先进插补方法在新型空间转录组学技术数据上的表现,并提出了一种专门针对空间转录组学数据、结合空间信息的新插补方法SpaMean-Impute,该方法在多项评估指标上优于现有方法且计算效率更高 研究主要基于23个数据集进行评估,可能未覆盖所有类型的空间转录组学数据;新方法SpaMean-Impute虽然表现优异,但其在不同生物学场景中的普适性仍需进一步验证 评估现有插补方法在空间转录组学数据上的有效性,并开发一种专门针对此类数据的新插补方法 空间转录组学数据 空间转录组学 NA 空间转录组学技术 NA 空间转录组学数据 23个数据集 NA 空间转录组学 NA 五种新兴空间转录组学平台
1712 2026-02-06
sc-eQTL unveil immunogenetic architecture of polycystic ovary syndrome
2026-Jan-06, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过整合GWAS数据和多种免疫细胞的单细胞表达数量性状位点分析,揭示了多囊卵巢综合征在细胞水平的遗传和免疫机制 首次在单细胞分辨率下系统解析PCOS的免疫遗传结构,识别出被批量eQTL分析掩盖的T细胞亚群和NK细胞特异性因果基因 研究主要基于已有数据集的二次分析,缺乏实验验证;样本来源和种群特异性可能影响结果普适性 阐明多囊卵巢综合征的遗传基础和免疫细胞特异性机制 多囊卵巢综合征患者相关的遗传变异和免疫细胞 计算生物学 多囊卵巢综合征 全基因组关联研究,单细胞表达数量性状位点分析,单细胞RNA测序 统计遗传学模型,共定位分析 基因组数据,单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1713 2026-02-06
Novel insights into meningioma brain invasion with spatial transcriptomic profiling
2026-Jan-04, Acta neuropathologica communications IF:6.2Q1
研究论文 本研究利用空间转录组学技术探究脑膜瘤脑侵袭的分子特征,重点关注肿瘤细胞和免疫细胞在脑-瘤边界的基因表达变化 首次应用空间转录组学分析脑膜瘤脑侵袭的分子机制,揭示了KRT18、CSF1R等关键基因在侵袭过程中的空间特异性表达模式 样本量较小(16例肿瘤),需要更大规模研究验证发现;空间转录组学分辨率有限,无法达到单细胞水平 探究脑膜瘤脑侵袭的分子机制及其与预后的关系 脑膜瘤患者肿瘤组织(包括侵袭性和非侵袭性病例) 数字病理学 脑膜瘤 空间转录组学 NA 空间转录组数据 16例脑膜瘤肿瘤(8例侵袭性,8例非侵袭性) NanoString 空间转录组学 GeoMx Digital Spatial Profiling NanoString GeoMx数字空间分析平台,使用1800基因panel
1714 2026-01-04
Exploring molecular mechanisms of radioactive iodine therapy in thyroid cancer using single-cell RNA sequencing data
2026-Jan-03, Discover oncology IF:2.8Q2
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
1715 2026-02-06
Integrated experimental and computational workflows for single-cell transcriptomics in plants
2026-Jan-03, Plant methods IF:4.7Q1
研究论文 本研究通过系统性地基准测试玉米中的批量与单细胞转录组工作流程,建立了一个优化的集成框架,以解决植物单细胞转录组学中的组织制备、核分离和转录组质量挑战 开发了改进的批量RNA-seq协议作为单细胞数据集的参考,比较了原生质体、新鲜核和冷冻核三种输入类型在组织中的转录组谱可比性,并利用批量RNA-seq提供额外生物背景以验证单细胞分析结果 所有实验数据均来自玉米,可能限制了在其他植物物种中的直接适用性 优化植物单细胞转录组学的实验和计算工作流程,以解决细胞异质性解析中的挑战 玉米组织中的细胞类型,包括原生质体、新鲜核和冷冻核 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
1716 2026-02-06
Comprehensive profiling of lactylation-associated genes in pulmonary hypertension through bulk and single-cell RNA sequencing integration
2026-Jan-03, Respiratory research IF:4.7Q1
研究论文 本研究通过整合bulk和单细胞RNA测序数据,全面分析了肺动脉高压中乳酰化相关基因,并鉴定出LCP1作为核心诊断标志物 首次在肺动脉高压中整合bulk和单细胞RNA测序数据来系统研究乳酰化相关基因,并揭示了免疫细胞中的乳酰化水平变化 研究主要基于生物信息学分析,实验验证仅限于体外细胞模型,缺乏更深入的体内功能验证 探究乳酰化在肺动脉高压发生发展中的作用及其分子机制 肺动脉高压患者和对照组的bulk RNA-seq及单细胞RNA-seq数据,以及缺氧诱导的肺动脉平滑肌细胞 生物信息学 肺动脉高压 bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, RT-PCR, western blot NA RNA测序数据, 基因表达数据 来自多个数据集(GSE113439, GSE186996, GSE210248)的肺动脉高压患者和对照组样本 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
1717 2026-02-06
SLPI⁺ AT2-Like Cells Orchestrate Lung Adenocarcinoma Invasion via Wnt Pathway Activation and Stromal Crosstalk in a Spatially Defined Margin Niche
2026-Jan, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究通过整合空间转录组学和单细胞RNA测序数据,揭示了肺腺癌侵袭前沿中一种表达SLPI的AT2样细胞亚群及其与肿瘤微环境中其他细胞的相互作用机制 首次在肺腺癌侵袭边缘鉴定出表达SLPI的AT2样细胞亚群,并阐明了其通过Wnt通路激活和与基质细胞(如MRC1+巨噬细胞和肌成纤维细胞)的空间协同作用驱动肿瘤侵袭的机制 研究主要基于转录组学数据,功能验证和体内实验可能有限,且样本来源和数量未在摘要中明确说明 探究肺腺癌侵袭过程中的关键细胞类型、空间分布及其功能相互作用 肺腺癌肿瘤组织,重点关注侵袭边缘的肿瘤细胞和肿瘤微环境细胞 数字病理学 肺癌 空间转录组学,单细胞RNA测序 NA 空间转录组数据,单细胞RNA测序数据 NA NA 空间转录组学,单细胞RNA-seq NA NA
1718 2026-02-06
TMEM131-Mediated Soluble TRAIL Triggered Type II Alveolar Epithelial Cell Senescence in Radiation-Induced Lung Injury
2026-Jan, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究揭示了TMEM131介导的可溶性TRAIL通过抑制线粒体自噬导致II型肺泡上皮细胞衰老,在辐射诱导的肺损伤发病机制中起关键作用 首次发现TMEM131介导TRAIL从内质网向高尔基体的运输过程,并阐明可溶性TRAIL通过死亡受体5激活mTOR通路抑制线粒体自噬的新机制 研究主要基于小鼠模型,临床样本验证相对有限;TMEM131介导的运输机制在人体中的普适性需进一步验证 阐明辐射诱导肺损伤的发病机制并寻找潜在治疗靶点 辐射诱导肺损伤小鼠模型、II型肺泡上皮细胞、临床患者血浆样本 单细胞组学 肺损伤 单细胞RNA测序, 定量蛋白质组学, 免疫沉淀质谱 基因敲除小鼠模型 (Trail;Sftpc-Cre) 转录组数据, 蛋白质组数据, 单细胞测序数据, 免疫荧光图像 未明确样本数量,包含小鼠模型和临床患者样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1719 2026-02-06
Retinoic Acid Reprograms Mast Cells Toward a Proinflammatory State to Enhance Antitumor Immunity
2026-Jan, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据,揭示了肥大细胞在肿瘤微环境中的异质性,并发现视黄酸信号可驱动肥大细胞向促炎表型极化,从而增强抗肿瘤免疫 首次系统性地描绘了十种癌症类型中肥大细胞的转录和空间异质性图谱,并鉴定出一个具有抗原呈递特征和免疫激活潜能的促炎性肥大细胞亚群,揭示了视黄酸-RARα-CIITA信号轴在肥大细胞重编程中的关键作用 研究主要基于转录组数据,功能验证和机制细节仍需进一步实验确认;临床相关性分析为观察性结果,需前瞻性研究验证 探究肥大细胞在肿瘤微环境中的分子特征、功能多样性及其对抗肿瘤免疫的调控机制 十种人类癌症类型中的肥大细胞 数字病理学 癌症 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA 转录组数据, 空间数据 十种癌症类型的样本 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
1720 2026-02-06
High-Dimensional Profiling of Circulating Dendritic Cells and Monocytes in Atopic Dermatitis Patients by Mass Cytometry
2026-Jan, Allergy, asthma & immunology research
研究论文 本研究通过质谱流式细胞术分析了特应性皮炎患者外周血中树突状细胞和单核细胞的高维特征,揭示了cDC1频率降低和DC3特征增强的现象 首次利用质谱流式细胞术系统比较特应性皮炎患者与健康对照的循环树突状细胞和单核细胞亚群,并结合公共单细胞RNA测序数据和皮肤免疫荧光染色进行验证 样本量相对有限(48例患者和48例对照),且为横断面研究,无法确定因果关系 探究特应性皮炎中髓系细胞(特别是树突状细胞和单核细胞)在疾病发病机制中的作用 特应性皮炎患者和健康对照者的外周血单个核细胞,以及公共单细胞RNA测序数据和皮肤组织样本 免疫学 特应性皮炎 质谱流式细胞术,单细胞RNA测序,免疫荧光染色 NA 细胞计数数据,基因表达数据,图像数据 48例特应性皮炎患者和48例健康对照 NA 单细胞RNA测序 NA NA
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