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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1661 | 2026-02-10 |
Tight junction-high and CDH17-positive cell population is the source of colorectal cancer liver metastases
2026-Jan-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-68169-3
PMID:41484106
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研究论文 | 本研究揭示了结直肠癌肝转移的细胞来源,发现IKKα缺失通过稳定紧密连接成分促进转移,并鉴定出CDH17⁺/CLDN2⁺上皮亚群在转移灶中的主导作用 | 意外发现IKKα缺失促进结直肠癌转移,并首次将紧密连接重塑驱动的CDH17⁺/CLDN2⁺上皮亚群确定为转移能力的来源 | 研究主要基于患者来源的类器官模型,体内验证和临床相关性需进一步探索 | 探究结直肠癌转移的细胞特征和驱动机制 | 结直肠癌患者来源的类器官、转移性病变组织 | 癌症生物学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组学、组织染色 | NA | 转录组数据、图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1662 | 2026-02-10 |
Oxidative stress and GPX2 control pancreatic vs. non-pancreatic cell fate in human endoderm
2026-Jan-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-68145-x
PMID:41484137
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研究论文 | 本研究揭示了氧化应激和GPX2在调控人类内胚层后前肠向胰腺与非胰腺细胞命运分化中的关键作用 | 首次发现谷胱甘肽过氧化物酶2(GPX2)通过调节氧化应激水平,决定人类后前肠细胞向胰腺或肝/肠谱系分化的命运选择 | 研究主要基于体外分化模型,体内生理环境中的验证尚需进一步研究 | 探究代谢产物在人类内胚层发育过程中细胞命运决定的作用机制 | 人类后前肠内胚层细胞 | 发育生物学 | NA | 批量转录组测序, 单细胞转录组测序, 染色质可及性分析 | NA | 转录组数据, 表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, ATAC-seq | NA | NA |
| 1663 | 2026-02-10 |
A pan-cancer single cell landscape reveals heterogeneity and functional diversity of double-negative T cells
2026-Jan-03, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-025-02548-8
PMID:41484771
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据,揭示了双阴性T细胞在肿瘤微环境中的异质性和功能多样性 | 首次在泛癌水平构建了双阴性T细胞的单细胞图谱,识别了14个不同的亚群,并阐明了它们在肿瘤免疫治疗中的关键作用 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据,功能验证仍需进一步实验支持,且样本来源和癌症类型可能存在偏差 | 探究双阴性T细胞在肿瘤微环境中的异质性、功能多样性及其对免疫治疗反应的影响 | 双阴性T细胞(DNT细胞),包括αβ DNT和γδ T细胞亚群 | 单细胞组学 | 泛癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、多重免疫荧光、空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据、空间转录组数据 | 2,369个样本,涵盖23种癌症类型,包含157,025个高质量DNT细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1664 | 2026-02-09 |
Integrated Transcriptomics Reveals Evolutionary Trajectories and Cell Density-Dependent Mechanisms in Aldosterone-Producing Adenomas
2026-Jan-21, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202505410
PMID:41562146
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞/核与空间转录组学,揭示了醛固酮产生腺瘤(APAs)和微结节(APMs)的异质性、进化轨迹及细胞密度依赖性机制 | 首次利用整合单细胞/核和空间转录组学方法,揭示了APAs中两种不同的进化轨迹,并识别出KCNJ5突变APAs中的两种细胞状态,阐明了细胞密度如何通过TAZ激活调节铁死亡敏感性 | 研究主要基于转录组学数据,可能未涵盖所有分子机制;体外实验在人类肾上腺细胞中进行,但体内验证可能有限 | 探究醛固酮产生腺瘤和微结节在转录多样性、进化轨迹及细胞密度依赖性机制方面的病理发生 | 醛固酮产生腺瘤(APAs)和微结节(APMs),以及人类肾上腺细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞/核转录组学,空间转录组学 | NA | 转录组数据,空间数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 1665 | 2026-02-07 |
Deciphering the cellular basis of heterosis in pigs through single-cell transcriptomics of growth axis-related tissues
2026-Jan-09, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-026-12541-0
PMID:41514221
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1666 | 2026-02-09 |
Sbno2-mediated tissue-resident alveolar macrophages: a novel therapeutic axis for sepsis-induced acute lung injury
2026-Jan-05, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-025-02772-7
PMID:41491997
|
研究论文 | 本研究揭示了表达Sbno2的组织驻留肺泡巨噬细胞在脓毒症诱导的急性肺损伤中促进肺泡上皮细胞再生和屏障功能修复的作用 | 首次发现Sbno2在组织驻留肺泡巨噬细胞中的关键作用,并证明重组Sbno2可作为治疗急性肺损伤的潜在靶点 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体中进行验证 | 探究脓毒症诱导的急性肺损伤的修复机制并寻找新的治疗靶点 | 组织驻留肺泡巨噬细胞和肺泡上皮细胞 | 单细胞组学 | 急性肺损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1667 | 2026-02-09 |
Enhancing cell subpopulation discovery in cancer by integrating single-cell transcriptome and expressed variants
2026-Jan, Fundamental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.fmre.2025.01.001
PMID:41647537
|
研究论文 | 本文提出了一种名为scCluster的端到端深度聚类模型,通过整合单细胞基因表达谱和表达变异特征来增强癌症组织中细胞亚群的发现 | scCluster首次将单细胞基因表达谱与原始scRNA-seq数据中的表达变异特征相结合,采用基于零膨胀负二项模型的双模态自编码器和深度嵌入聚类的联合优化策略,显著提升了细胞亚群分层的准确性 | 未在摘要中明确提及 | 增强癌症单细胞研究中细胞亚群的发现能力 | 癌症组织中的单细胞 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 双模态自编码器, 深度嵌入聚类, 深度软K-means聚类, 跨实例引导对比聚类 | 基因表达谱, 表达变异特征 | 多个真实世界癌症scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1668 | 2026-02-09 |
Progress in cellular mechanisms of chronic rhinosinusitis
2026-Jan, Fundamental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.fmre.2024.10.001
PMID:41647543
|
综述 | 本文综述了慢性鼻窦炎(CRS)的细胞机制研究进展,重点探讨了单细胞测序等新技术揭示的结构细胞和免疫细胞异质性及其在疾病发病机制中的作用 | 系统总结了单细胞测序技术揭示的CRS中结构细胞和免疫细胞的广泛异质性,并强调了局部免疫球蛋白过度产生、异位淋巴组织内Tfh/Tfr细胞动态平衡以及巨噬细胞和肥大细胞在2型免疫中的新作用 | 本文为综述性文章,未报告原始实验数据或具体样本分析,主要基于现有文献进行总结 | 旨在总结慢性鼻窦炎的细胞机制研究进展,阐明其发病机理并为精准诊疗提供新见解 | 慢性鼻窦炎(CRS)患者的相关细胞和组织,包括上皮细胞、免疫细胞(如T细胞、B细胞、巨噬细胞、肥大细胞)及息肉组织 | 数字病理 | 慢性鼻窦炎 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1669 | 2026-02-09 |
The evolving landscape of spatial proteomics technologies in the AI age
2026-Jan, Fundamental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.fmre.2024.11.023
PMID:41647570
|
综述 | 本文综述了空间蛋白质组学技术在AI时代的最新进展、挑战及未来方向 | 系统分类并详细比较了基于抗体、LC-MS/MS和成像质谱的空间蛋白质组学技术,并探讨了人工智能在该领域的应用机遇 | 作为综述文章,未涉及具体实验数据或模型验证,主要基于现有文献进行归纳分析 | 概述空间蛋白质组学技术的现状、挑战及AI融合前景,以推动基础细胞生物学和临床应用发展 | 空间蛋白质组学技术及其在组织结构和生物过程研究中的应用 | 空间蛋白质组学 | NA | 抗体技术、LC-MS/MS、成像质谱 | NA | 蛋白质空间数据 | NA | NA | 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 1670 | 2026-02-08 |
Construction of a prognostic model and multidimensional analysis of hepatocellular carcinoma based on palmitoylation-related genes
2026-Jan-30, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04538-8
PMID:41618052
|
研究论文 | 本研究基于棕榈酰化相关基因构建了肝细胞癌的预后模型,并通过多维分析探索其分子机制 | 首次结合单细胞和批量转录组数据,分析肝细胞癌上皮细胞中棕榈酰化的调控网络 | NA | 构建肝细胞癌的预后模型并探索其分子机制 | 肝细胞癌上皮细胞 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞转录组测序,批量转录组测序 | LASSO回归,Cox回归,scAB反卷积算法,hdWGCNA | 转录组数据 | TCGA-LIHC和GEO数据集(包括GSE189903和GSE14520验证集) | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 1671 | 2026-02-08 |
Engrailed 1 promotes immune evasion and chemoresistance in glioma through single cell and CeRNA network analyses
2026-Jan-09, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-35553-y
PMID:41513764
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量转录组分析、ceRNA网络构建及实验验证,揭示了转录因子EN1在胶质瘤免疫逃逸和化疗耐药中的关键作用 | 首次系统性地将EN1与胶质瘤免疫微环境特征、化疗反应预测联系起来,并构建了一个新的NEAT1/miR-9-5p/miR-128-3p/EN1 ceRNA调控轴来解释其失调机制 | 研究主要基于公共数据库和体外细胞实验,缺乏体内动物模型验证和更大规模的临床队列验证 | 全面研究EN1在胶质瘤中的功能,特别关注其在免疫逃逸和化疗耐药中的作用 | 胶质瘤细胞、公共转录组数据集(TCGA, GTEx, CGGA, GSE182109) | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, ceRNA网络分析, Western blot, CCK-8, Transwell实验 | NA | 转录组数据, 图像, 文本 | 多个公共数据集(TCGA, GTEx, CGGA, GSE182109),具体样本数未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1672 | 2026-02-08 |
Airway immune profiles and therapeutic implications of IGF1 in eosinophilic granulomatosis with polyangiitis
2026-Jan-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-68104-6
PMID:41501017
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序比较了嗜酸性肉芽肿性多血管炎(EGPA)与重度嗜酸性哮喘(SEA)的气道免疫特征,揭示了EGPA中独特的干扰素驱动炎症机制,并发现IGF1巨噬细胞与疾病复发相关,提示IGF1作为潜在治疗靶点 | 首次在EGPA中识别出干扰素驱动的炎症通路,与SEA的TNF主导通路形成对比;发现IL1BMX1中性粒细胞促进三级淋巴结构形成;通过纵向分析揭示IGF1巨噬细胞与疾病复发的关联;在动物模型中验证IGF1阻断可减轻T2炎症 | 研究样本量未明确说明;动物模型结果需在人类临床试验中进一步验证;EGPA与SEA的病理生理差异机制仍需深入探究 | 探究EGPA与SEA的免疫特征差异,识别EGPA特有的炎症机制及潜在治疗靶点 | 嗜酸性肉芽肿性多血管炎(EGPA)和重度嗜酸性哮喘(SEA)患者的气道免疫细胞 | 单细胞组学 | 嗜酸性肉芽肿性多血管炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1673 | 2026-02-08 |
Uncovering the role of integrated stress in Alzheimer's disease through single-cell and transcriptomic analysis
2026-Jan-06, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-34997-6
PMID:41495191
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞测序和转录组数据,探索阿尔茨海默病中整合应激反应的分子机制 | 结合LASSO回归和随机森林算法筛选出六个关键基因,并揭示了它们与炎症通路及免疫细胞浸润的关联 | 研究样本量有限,且主要基于公共数据集分析,需要进一步实验验证 | 探索阿尔茨海默病中整合应激反应的分子机制及其临床意义 | 阿尔茨海默病患者和正常对照的脑细胞及血液样本 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞测序, 转录组分析 | LASSO回归, 随机森林 | 基因表达数据 | GSE264648数据集49例,GSE48350数据集253例,另加临床验证样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组测序 | NA | NA |
| 1674 | 2026-01-06 |
A pseudouridine-related prognostic model of colorectal cancer based on single-cell sequencing analysis and transcriptome analysis
2026-Jan-04, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-34933-0
PMID:41486187
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1675 | 2026-02-08 |
A human pathophysiological 3D-bone marrow model reveals immune and stromal cell heterogeneity
2026-Jan-03, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-09433-6
PMID:41484482
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研究论文 | 本研究开发了一种标准化的三维人类骨髓模型,用于模拟骨髓微环境的关键特征并研究其生理和病理状态下的细胞动态 | 首次构建了能够模拟人类骨髓微环境异质性的标准化三维模型,并利用单细胞转录组学揭示了基质细胞和内皮细胞的异质性 | 模型仍需进一步验证其在更广泛疾病背景下的适用性,且长期培养效果有待更多数据支持 | 研究人类骨髓微环境中免疫细胞和基质细胞的异质性及其在病理状态下的动态变化 | 骨髓微环境中的基质细胞、内皮细胞、免疫细胞和造血祖细胞 | 单细胞组学 | 急性髓系白血病 | 单细胞转录组测序 | 三维骨髓模型 | 单细胞转录组数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1676 | 2026-02-08 |
Squidiff: predicting cellular development and responses to perturbations using a diffusion model
2026-Jan, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-025-02877-y
PMID:41184550
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于扩散模型的生成框架Squidiff,用于预测不同细胞类型在环境变化下的转录组变化 | Squidiff通过连续去噪和语义特征集成,学习瞬态细胞状态,并预测跨时间和条件的高分辨率转录组景观 | NA | 预测细胞在环境刺激下的转录组变化,并阐明潜在的疾病机制 | 单细胞转录组数据 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 扩散模型 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1677 | 2026-02-08 |
KRAS Withdrawal in Cholangiocarcinoma Leads to Immune Infiltration and Tumor Regression
2026-Jan, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202511312
PMID:41332325
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研究论文 | 本研究通过构建条件性KRAS基因敲除的胆管癌小鼠模型,揭示了KRAS抑制导致肿瘤显著消退并伴随免疫细胞浸润的机制 | 首次利用转座子系统与CRISPR-Cas9技术构建了条件性TRE.Kras/Trp53敲除胆管癌小鼠模型,并系统揭示了KRAS抑制通过激活CD8 T细胞和诱导细胞衰老导致肿瘤消退的免疫机制 | 研究主要基于小鼠模型,其结论在人类胆管癌中的适用性仍需进一步验证;缺乏长期疗效观察数据 | 探究KRAS抑制在胆管癌治疗中的作用机制及潜在治疗价值 | 条件性KRAS/TP53敲除胆管癌小鼠模型、TKP细胞系 | 肿瘤免疫学 | 胆管癌 | CRISPR-Cas9基因编辑、单细胞RNA测序、bulk RNA测序、免疫组化、共聚焦免疫荧光、细胞因子阵列、慢病毒过表达 | 条件性基因敲除小鼠模型、同种移植模型 | 基因表达数据、免疫染色图像、细胞因子分泌数据 | 未明确说明具体样本数量,但包含小鼠模型和细胞系实验 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1678 | 2026-02-07 |
Bulk Sequencing Combined With Single-Cell Sequencing Identifies High Expression of VCAN in Fibroblasts Promoting the Progression of High-Stemness Gastric Adenocarcinoma Cells
2026-Jan-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202502979R
PMID:41555841
|
研究论文 | 本研究通过整合bulk测序与单细胞测序,发现成纤维细胞中VCAN高表达促进高干性胃腺癌细胞的进展 | 首次结合bulk测序与单细胞测序揭示VCAN在癌症相关成纤维细胞中的特异性表达及其通过MDK-NCL和MIF-CD74-CD44信号通路促进高干性胃腺癌细胞恶性表型的作用机制 | 研究主要基于数据库分析和体外实验,缺乏体内动物模型验证;信号通路机制尚未完全阐明 | 探究VCAN在胃腺癌中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 胃腺癌组织、癌症相关成纤维细胞、高干性胃腺癌细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | bulk测序, 单细胞测序 | NA | 基因表达数据, 单细胞数据 | 多个数据库的样本(具体数量未明确说明) | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1679 | 2026-02-07 |
Mining Potential Therapeutic Targets for T Cell Exhaustion in Osteoarthritis by Integrating Mendelian Randomization and Single-Cell Sequencing
2026-Jan-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202503295R
PMID:41603583
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研究论文 | 本研究通过整合孟德尔随机化和单细胞测序技术,挖掘骨关节炎中T细胞耗竭的潜在治疗靶点 | 首次结合孟德尔随机化与单细胞测序方法,系统鉴定骨关节炎中T细胞耗竭相关基因作为生物标志物 | 研究依赖于公共数据库数据,未进行独立队列验证实验 | 确定骨关节炎中与T细胞耗竭相关的生物标志物,为治疗和预后提供潜在靶点 | 骨关节炎患者样本数据 | 生物信息学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序,孟德尔随机化分析 | NA | 基因表达数据,单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1680 | 2026-02-07 |
Adult leptomeningeal vestigial neural crest-derived multipotent cells promote vascular repair after stroke
2026-Jan-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116747
PMID:41456275
|
研究论文 | 本研究通过谱系追踪、单细胞与空间转录组学等方法,在成年小鼠软脑膜中发现了一群神经嵴来源的多能细胞,并揭示了其在脑卒中后通过特定信号通路促进血管修复的作用机制 | 首次在成年哺乳动物软脑膜中发现并证实了胚胎神经嵴来源的多能细胞持续存在,并阐明了其在脑损伤后被重新激活、迁移至血管损伤部位并通过分泌多效蛋白等机制促进血管修复的全新生物学过程 | 研究目前仅限于小鼠模型,尚未在人类组织中验证;这些多能细胞在长期修复中的具体命运及其在其它神经系统疾病中的作用仍需进一步探索 | 探究成年大脑中是否存在胚胎神经嵴来源的残留多能细胞及其在脑卒中后血管修复中的潜在功能 | 成年小鼠软脑膜中的神经嵴来源多能细胞及其在缺血性脑卒中模型中的行为与功能 | 单细胞生物学与神经血管修复 | 脑卒中 | 神经嵴谱系追踪、单细胞转录组学、空间转录组学、相互作用组建模、活体成像 | NA | 单细胞RNA测序数据、空间转录组数据、活体成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |