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当前共找到 2200 篇文献,本页显示第 1621 - 1640 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1621 2026-02-15
VISTA uncovers missing gene expression and spatial-induced information for spatial transcriptomic data analysis
2026-Jan-08, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 本文提出了一种名为VISTA的模型,通过整合单细胞RNA测序和亚细胞空间转录组学数据,预测空间转录组数据中未测量的基因表达 VISTA结合了变分推断、几何深度学习和不确定性量化,首次实现了在空间转录组数据中准确预测未测量基因表达,并支持多种下游分析 未明确提及模型在处理高度异质性组织或大规模数据集时的具体限制 克服空间转录组技术基因覆盖有限的缺陷,提升空间转录组数据的解释性和应用价值 空间转录组数据和单细胞RNA测序数据 空间转录组学 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 变分推断, 几何深度学习 基因表达数据, 空间数据 四个数据集 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
1622 2026-02-15
Resolving Single-Cell Gene Expression by Pseudotemporal Integration of Transcriptomic and Proteomic Datasets
2026-Jan, Molecular & cellular proteomics : MCP IF:6.1Q1
研究论文 本研究提出了一种利用伪时间细胞排序整合单细胞RNA-Seq和单细胞蛋白质组学数据的新方法,以分析缺氧条件下的转录-翻译表达动态 通过伪时间轨迹整合单细胞转录组和蛋白质组数据,揭示转录和翻译响应的时间差异,如即时转录组响应和延迟蛋白质组表达 NA 整合单细胞转录组和蛋白质组数据,构建全面的转录-翻译图谱,以理解缺氧应激下的细胞表型 单细胞样本(在缺氧条件下采集的纵向样本) 单细胞组学 NA 单细胞RNA-Seq, 单细胞蛋白质组学(质谱分析) NA 转录组数据, 蛋白质组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 单细胞蛋白质组学 NA NA
1623 2026-02-15
Gut Microbiota-Derived Metabolites Regulate CASP3 and Neuroimmune Pathways in Multiple Sclerosis: An Integrative Multiomics Study
2026, Mediators of inflammation IF:4.4Q2
研究论文 本研究通过整合网络药理学、机器学习和单细胞转录组分析,揭示了肠道菌群代谢物通过调节CASP3及神经免疫通路在多发性硬化症中的作用 首次将网络药理学、机器学习(SHAP方法)和单细胞转录组分析结合,识别出CASP3作为肠道菌群代谢物的核心靶点,并通过孟德尔随机化验证因果关系 研究结果需要进一步的实验验证来确认机制和转化潜力 探究肠道菌群代谢物在多发性硬化症发病机制中的作用,识别潜在治疗靶点 多发性硬化症相关的差异表达基因、肠道菌群代谢物及其靶点 机器学习 多发性硬化症 网络药理学、机器学习、单细胞转录组分析、孟德尔随机化、分子对接 机器学习模型(未指定具体类型,但使用了SHAP方法) 转录组数据、单细胞数据 NA NA 单细胞转录组分析 NA NA
1624 2026-02-15
Causal Association Between Plasma Proteins and Pericarditis: A Mendelian Randomization Study With Therapeutic Target Identification
2026, Mediators of inflammation IF:4.4Q2
研究论文 本研究通过孟德尔随机化分析探讨了血浆蛋白与心包炎之间的因果关系,并识别了潜在的治疗靶点 首次利用大规模血浆蛋白组GWAS数据,结合孟德尔随机化方法系统评估了血浆蛋白与心包炎的因果关联,并整合了单细胞RNA测序分析和分子对接技术来识别潜在治疗靶点和化合物 研究人群仅限于欧洲血统个体,可能限制了结果在其他人群中的普适性;孟德尔随机化分析依赖于遗传变异作为工具变量,可能存在残留混杂或水平多效性 评估血浆蛋白与心包炎之间的因果关系,并探索潜在的治疗靶点 35,559名欧洲血统个体的遗传和血浆蛋白数据,以及心包炎的遗传关联数据 生物信息学与遗传流行病学 心血管疾病 全基因组关联研究(GWAS)、孟德尔随机化(MR)、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、分子对接 逆方差加权中位数法、方差加权法、MR-Egger回归 遗传变异数据、血浆蛋白定量数据、单细胞基因表达数据 35,559名欧洲血统个体 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1625 2026-02-15
Development and validation of an interpretable machine learning model identify the lactylation-related protein SUSD3 as a prognostic and therapeutic biomarker for breast cancer
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究开发并验证了一个可解释的机器学习模型,用于识别乳酸化相关蛋白SUSD3作为乳腺癌的预后和治疗生物标志物 首次结合多种机器学习算法构建了与免疫细胞浸润、趋化因子表达和肿瘤突变负荷相关的乳酸化相关特征,并实验验证了枢纽基因SUSD3的作用 NA 探究乳酸化在乳腺癌发生发展中的作用,并开发用于预测恶性进展和免疫逃逸的风险模型 乳腺癌 机器学习 乳腺癌 单细胞RNA测序、转录组学、空间转录组学 多种机器学习算法组合 基因组数据、转录组数据 来自公共数据库(TISCH、TCGA、GEO)的大量数据集 NA 单细胞RNA-seq、空间转录组学、bulk RNA-seq NA NA
1626 2026-02-15
Integrated single-cell analysis with experimental validation reveals ANXA2 as a therapeutic target for ferroptosis in inflammatory bowel disease
2026, American journal of translational research IF:1.7Q4
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序分析与实验验证,揭示了ANXA2作为炎症性肠病中铁死亡的关键治疗靶点 首次结合单细胞RNA测序与实验验证,识别出ANXA2作为IBD中铁死亡的核心靶点,并验证其在体外和体内模型中的调控作用 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,人类样本验证有限,且铁死亡机制在IBD中的具体通路仍需进一步探索 识别与炎症性肠病中铁死亡相关的潜在治疗靶点 炎症性肠病(IBD)患者和DSS诱导的IBD小鼠模型中的结肠组织细胞 数字病理学 炎症性肠病 单细胞RNA测序,RT-qPCR,Western blotting,流式细胞术,ELISA,免疫荧光染色 NA 单细胞RNA测序数据,基因表达数据,蛋白质表达数据 28,974个细胞(来自GSE134809数据集) NA 单细胞RNA-seq NA NA
1627 2026-02-15
Utilisation of spatial methodologies for the investigation of the tumour microenvironment
2026, Methods in cell biology
综述 本章节为研究人员提供了关于空间转录组学技术的实用指南,重点介绍了三种主流平台及其在肿瘤微环境研究中的应用 系统比较了Merscope、CosMx和Xenium三种前沿空间转录组学平台的原理与差异,并提供了从样本制备到数据分析的详细实验方案与实用技巧 作为技术指南章节,未报告新的实验数据或临床验证结果,主要基于现有技术和作者经验进行总结 为研究人员提供实施空间转录组学技术的实用指导,以促进肿瘤微环境表征和精准肿瘤学研究 肿瘤微环境中的空间组织特征,特别是巨噬细胞、细胞毒性T淋巴细胞等免疫细胞的分布与相互作用 空间转录组学 癌症 空间转录组学、多重成像 NA 空间转录组数据、成像数据 NA NA 空间转录组学 Merscope, CosMx, Xenium 三种主流空间转录组学分析平台
1628 2026-02-14
Klotho protects the osteogenic function of human periodontal ligament stem cells in periodontitis by inhibiting NOX4-mediated ferroptosis
2026-Jan-16, Stem cell research & therapy IF:7.1Q1
研究论文 本研究揭示了Klotho蛋白通过抑制NOX4介导的铁死亡,保护人牙周膜干细胞在牙周炎环境中的成骨功能 首次发现Klotho在牙周炎炎症环境中通过抑制NOX4表达来对抗hPDLSCs的铁死亡,从而保护其成骨功能 研究主要在体外炎症环境和动物模型中进行,尚未在人体临床试验中验证 探究Klotho蛋白是否能在炎症环境中保护人牙周膜干细胞免受铁死亡影响并维持其成骨功能 人牙周膜干细胞(hPDLSCs) 干细胞生物学与组织工程 牙周炎 单细胞RNA测序,细胞培养,动物模型 NA 基因表达数据,细胞表型数据 C57BL/6小鼠模型及体外培养的hPDLSCs NA 单细胞RNA-seq NA NA
1629 2026-02-14
Immune dysregulation triggered by inflammatory cytokines in patients with severe respiratory infections
2026-Jan-15, Respiratory research IF:4.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组分析,揭示了重症呼吸道感染患者中由炎症细胞因子触发的免疫失调机制,并评估了高剂量重组蛋白疫苗的潜在保护作用 构建了包含299,527个PBMCs的高分辨率免疫细胞图谱,首次系统性地描绘了COVID-19不同严重程度(中度、重度、危重、恢复期)患者的免疫特征,并发现高剂量重组蛋白疫苗可抑制单细胞炎症反应、增强保护性免疫 样本量相对较小(17例患者),且为观察性研究,需要更大规模的前瞻性研究验证结论 探究重症呼吸道病毒感染中免疫失调的潜在机制,并评估疫苗接种对免疫反应的影响 17例不同严重程度(中度、重度、危重、恢复期)的COVID-19患者的外周血单个核细胞(PBMCs) 单细胞组学 呼吸道感染(COVID-19) 单细胞转录组测序 NA 单细胞RNA测序数据 17例COVID-19患者(包括中度、重度、危重及恢复期病例)的PBMCs,共299,527个细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1630 2026-02-14
Activating KRAS mutations mark premalignant cystic structures in congenital pulmonary airway malformations
2026-Jan-15, Respiratory research IF:4.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析,探讨了先天性肺气道畸形中KRAS突变作为恶性转化风险因子的作用 首次在先天性肺气道畸形中利用单细胞RNA测序结合气道类器官模型,系统比较KRAS突变与非突变区域的细胞组成和基因表达差异,揭示了KRAS突变与肺癌相似的转录组特征 样本量较小(n=3),可能限制统计功效和结论的普适性;研究基于类器官模型,可能与体内实际情况存在差异 评估KRAS突变作为先天性肺气道畸形恶性转化风险标志物的潜力,以指导临床治疗策略 先天性肺气道畸形患者的切除肺组织,包括病变区域(囊肿)和非病变区域(对照) 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序,免疫荧光染色,类器官培养 气道类器官模型 单细胞转录组数据,图像数据 3例患者(KRAS突变与非突变对比) NA 单细胞RNA-seq NA NA
1631 2026-02-14
Spatiotemporal transcriptomic mapping reveals region-specific glial activation and astrocyte shifts in epileptogenesis beyond the hippocampus
2026-Jan-15, Acta neuropathologica communications IF:6.2Q1
研究论文 本研究利用空间转录组学技术,绘制了癫痫发生过程中大鼠脑内基因表达的时空动态图谱,揭示了海马以外区域的胶质细胞激活和星形胶质细胞功能亚型转变 首次在癫痫发生模型中应用Visium空间转录组学技术,系统性地揭示了癫痫发生过程中海马以外区域(如白质束和多个丘脑核团)的胶质细胞激活和星形胶质细胞功能亚型转变,挑战了传统上以海马为中心的癫痫发生观点 研究基于锂-毛果芸香碱诱导的癫痫持续状态大鼠模型,其结果在人类颞叶癫痫中的普适性有待验证;样本量相对较小(n=16);空间转录组学技术本身的分辨率限制 探究颞叶癫痫发生过程中,大脑不同区域在分子和细胞水平上的动态变化,特别是胶质细胞的激活模式和星形胶质细胞的功能转变 锂-毛果芸香碱诱导的癫痫持续状态大鼠模型(实验组)和对照组大鼠的冠状脑切片 空间转录组学 颞叶癫痫 空间转录组学 NA 空间基因表达数据 16只大鼠(包括实验组和对照组) 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium Visium空间基因表达技术
1632 2026-02-14
Single-cell and immune-context integration identifies basement-membrane/metastasis signatures that sharpen bladder-cancer diagnosis and prognosis
2026-Jan-14, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究开发了一个基于转移-基底膜相关基因(MBRGs)的可解释预后模型,用于改善膀胱癌的临床和个性化治疗策略 通过整合单细胞和免疫背景分析,识别出基底膜/转移相关基因特征,并构建了一个六基因风险模型,该模型在TCGA和GEO队列中显示出良好的预后预测能力,并利用SHAP分析量化了特征贡献 模型在TCGA和GEO队列中的AUC值范围较宽(0.602-0.742),表明预测性能有待进一步优化,且研究主要基于公共数据库数据,缺乏前瞻性临床验证 增强膀胱癌的临床诊断和预后预测,并探索个性化治疗策略 膀胱癌患者 数字病理学 膀胱癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫组化, 功能富集分析 LASSO回归, Cox回归, 风险模型 基因表达数据, 单细胞数据, 空间转录组数据 TCGA和GEO队列中的膀胱癌患者样本 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
1633 2026-02-14
Integrating single-cell and bulk transcriptomes with machine learning reveals a CAF signature for immunotherapy response in dMMR endometrial cancer
2026-Jan-14, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞和批量转录组数据,结合机器学习方法,构建了一个基于Wnt相关癌症相关成纤维细胞(CAF)的风险特征模型,用于预测错配修复缺陷子宫内膜癌(dMMR EC)的预后和免疫治疗反应 首次在dMMR EC中系统识别Wnt相关CAF亚群,并应用包含10种算法和101种组合的机器学习框架筛选最优基因特征,构建了结合临床病理特征和风险评分的列线图模型 研究主要基于公共数据库数据,缺乏独立的前瞻性临床队列验证,且CAF功能机制需进一步实验验证 探索CAF在dMMR EC预后和免疫治疗反应中的作用,并构建预测模型 错配修复缺陷子宫内膜癌(dMMR EC)患者 机器学习 子宫内膜癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq),批量RNA测序(bulk RNA-seq),拷贝数变异(CNV)分析 CoxBoost+Enet [alpha=0.6] 模型,列线图(nomogram) 转录组数据 单细胞数据包含9,682个肿瘤细胞和5,476个正常细胞(具体患者样本数未明确说明) NA 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq NA NA
1634 2026-02-14
Single-cell and spatial transcriptomic profiling of cardiac fibroblasts following myocardial infarction
2026-Jan-13, Scientific data IF:5.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞和空间转录组学技术,揭示了心肌梗死后心脏成纤维细胞的转录动态和修复性亚群的出现过程 结合了bulk RNA测序、RNAscope原位杂交和空间转录组学,首次在解剖和时间维度上映射了心脏成纤维细胞向修复性亚群转变的基因表达变化 研究主要关注心肌梗死早期阶段,长期动态和功能验证可能不足 探究心肌梗死后心脏成纤维细胞的异质性及修复性途径 心脏成纤维细胞,特别是修复性心脏成纤维细胞亚群 单细胞生物学 心血管疾病 单细胞RNA测序,空间转录组学,RNAscope原位杂交,bulk RNA测序 NA 转录组数据,空间表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学,bulk RNA-seq NA NA
1635 2026-02-14
Combined Vibrio and nanoplastics stress promotes nanoplastic accumulation while reducing bacterial lethality in shrimp
2026-Jan-13, NPJ science of food IF:6.3Q1
研究论文 本研究首次揭示了副溶血弧菌能捕获纳米塑料并促进其在凡纳滨对虾体内的转运,同时纳米塑料通过降低病原体毒力影响感染过程 首次证明细菌可作为纳米塑料载体影响其生物转运,并发现纳米塑料能通过激活宿主能量代谢和免疫通路增强抗病能力 研究仅针对单一虾种和特定病原体,自然环境中的多因素交互作用未充分探讨 探究纳米塑料与病原细菌对水生生物的交互影响机制 凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)及其病原体副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus) 环境毒理学 细菌感染 单细胞转录组学分析 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
1636 2026-02-14
Chronic macrophage activation derails muscle repair by disrupting mannose-receptor-linked plasticity revealed by endogenous irg1/acod1 tracking
2026-Jan-07, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究利用靶向irg1/acod1的GFP敲入斑马鱼模型,追踪了在急性和慢性炎症条件下巨噬细胞状态在肌肉损伤修复过程中的动态转变,揭示了慢性巨噬细胞活化通过破坏甘露糖受体(mrc1b/cd206)相关的可塑性来损害肌肉修复的机制 首次在体内实时追踪了巨噬细胞在急性和慢性炎症下的动态状态转变,发现了混合M1/M2巨噬细胞状态的存在,并阐明了慢性炎症通过MyD88依赖性途径抑制mrc1b表达、限制巨噬细胞异质性从而损害肌肉修复的新机制 研究主要基于斑马鱼模型,其在哺乳动物中的普适性有待验证;慢性炎症模型通过基因突变诱导,可能与人类疾病中的慢性炎症状态存在差异 探究慢性炎症如何改变巨噬细胞功能并影响肌肉损伤修复过程 斑马鱼巨噬细胞在肌肉损伤修复过程中的动态行为与功能 发育生物学与免疫学 肌肉损伤与慢性炎症 GFP敲入斑马鱼模型、单细胞转录组测序、基因突变模型 斑马鱼遗传模型 活体成像数据、单细胞转录组数据、基因表达数据 未明确具体样本数量,但涉及野生型、nlrc3l突变型及慢性感染模型等多组斑马鱼 NA 单细胞转录组测序 NA NA
1637 2026-02-13
Insight into modulating osteoarthritis progression: lncRNAs and TGF-β/Smad signalling pathway
2026-Jan-28, Clinical and experimental rheumatology IF:3.4Q2
综述 本文系统探讨了长链非编码RNA通过TGF-β/Smad信号通路调节骨关节炎软骨修复的分子机制及其临床转化策略 系统总结了lncRNAs通过TGF-β/Smad通路调控骨关节炎进展的分子机制,并整合了基于lncRNA的纳米颗粒递送、基因编辑等新型临床转化策略 lncRNA疗法在靶向递送效率和特异性方面仍面临挑战 探讨lncRNAs通过TGF-β/Smad信号通路调控骨关节炎进展的分子机制及治疗潜力 长链非编码RNA、TGF-β/Smad信号通路、骨关节炎 NA 骨关节炎 单细胞测序、基因编辑 NA NA NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1638 2026-02-13
T-cell exhaustion indicator characterizes the tumor microenvironment landscape and predicts colon adenocarcinoma prognosis via integrating single-cell RNA-seq and bulk RNA-sequencing
2026-Jan-14, BMC cancer IF:3.4Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA-seq和bulk RNA测序数据,构建了一个基于T细胞耗竭相关基因的预后模型,用于预测结肠腺癌患者的生存和治疗反应,并验证了FAT4基因在COAD细胞中的功能作用 首次整合单细胞和bulk RNA测序数据,构建了基于T细胞耗竭相关基因的预后特征,并验证了FAT4基因在COAD中的调控作用 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,需要进一步的前瞻性临床研究验证 阐明T细胞耗竭与结肠腺癌预后的关系,并开发预后预测模型 结肠腺癌患者和COAD细胞系 生物信息学 结肠癌 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, 流式细胞术, RT-qPCR GSVA, 单变量Cox, LASSO, 随机森林 转录组数据 来自TCGA和GEO数据库(GSE103479, GSE17536)的结肠腺癌患者样本 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
1639 2026-02-13
A novel anoikis resistance-associated gene model for prognostic prediction and immune microenvironment characterization in lung squamous cell carcinoma
2026-Jan-13, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究构建了一个基于失巢凋亡抵抗相关基因的预后模型,用于预测肺鳞状细胞癌患者的生存结果并表征肿瘤免疫微环境 首次在肺鳞状细胞癌中构建并验证了一个基于失巢凋亡抵抗相关基因的预后模型,揭示了该模型与肿瘤免疫微环境特征及免疫治疗反应性的关联 研究主要基于回顾性队列数据,需要前瞻性临床研究进一步验证模型的预测效能和临床实用性 开发一个能够预测肺鳞状细胞癌患者预后并指导精准免疫治疗的基因模型 肺鳞状细胞癌患者及其肿瘤组织样本 生物信息学 肺癌 单细胞转录组学、通路富集分析、LASSO回归、Cox比例风险分析 预后风险评分模型 基因表达数据、临床数据 内部验证队列(TCGA-LUSC)和外部验证队列(GSE73403、GSE74777) NA 单细胞RNA-seq NA NA
1640 2026-02-13
IL-25-ILC2-IL-13 axis improves traumatic brain injury by mediating CXCL-10-dependent regulation of blood brain barrier integrity
2026-Jan-12, Journal of neuroinflammation IF:9.3Q1
研究论文 本研究揭示了IL-25通过激活ILC2细胞分泌IL-13,进而抑制CXCL-10和内皮细胞焦亡,从而改善创伤性脑损伤后血脑屏障完整性和神经功能的机制 首次阐明了IL-25-ILC2-IL-13轴在TBI后BBB修复中的保护作用,并确定了CXCL-10介导的内皮细胞焦亡是关键的调控环节 研究主要基于小鼠模型,其结论在人类中的适用性尚需进一步验证;机制研究主要在急性期进行,长期效应未明确 探究IL-25对创伤性脑损伤后血脑屏障完整性和神经功能的保护作用及其分子机制 小鼠创伤性脑损伤模型、脑微血管内皮细胞、第2组固有淋巴细胞 神经科学 创伤性脑损伤 酶联免疫吸附试验、免疫荧光染色、流式细胞术、细胞因子阵列、Western blot、单细胞RNA测序 NA 蛋白质表达数据、RNA测序数据、行为学数据、影像学数据 未明确说明具体数量的小鼠模型和细胞样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
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