单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202601-202601] [清除筛选条件]
当前共找到 2200 篇文献,本页显示第 1601 - 1620 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1601 2026-02-16
Integrated Multi-Omics and Spatial Transcriptomics Identify FBLL1 as a Malignant Transformation Driver in Hepatocellular Carcinoma
2026-Jan-27, Cells IF:5.1Q2
研究论文 本研究通过整合多组学与空间转录组学数据,识别出FBLL1作为肝细胞癌恶性转化的关键驱动因子 首次将FBLL1鉴定为肝细胞癌中与恶性状态转换相关的新调控因子,揭示了其通过协同上调c-Myc和EGFR配体来激活EGFR-MAPK信号通路的机制 研究主要基于TCGA和ICGC队列数据,样本来源可能有限;体内外功能验证虽充分,但临床转化潜力需进一步探索 探究肝细胞癌中核糖体生物合成失调的具体分子驱动因子及其在肿瘤发生发展中的作用 肝细胞癌患者样本、HCC细胞系及小鼠异种移植模型 数字病理学 肝细胞癌 单细胞RNA测序、空间转录组学、转录组分析、Western blotting NA 多组学数据、单细胞RNA测序数据、空间转录组学数据 TCGA和ICGC队列的肝细胞癌患者样本 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
1602 2026-02-16
Loss of biomechanical features reveals smooth muscle disruption and disease progression in prostate cancer
2026-Jan-20, Cancer cell international IF:5.3Q1
研究论文 本研究通过整合多组学数据,揭示了生物力学特征丧失与平滑肌破坏在前列腺癌进展中的作用,并开发了一个预后指数MRPX用于风险分层和治疗指导 首次系统性地将生物力学特征与前列腺癌进展联系起来,通过整合大量转录组和单细胞数据定义了生物力学亚型,并开发了具有临床实用性的预后指数MRPX 研究主要基于回顾性队列数据,需要进一步的前瞻性验证;体外实验模型可能无法完全模拟体内复杂的肿瘤微环境 阐明生物力学特征在前列腺癌进展中的作用及其潜在机制 前列腺癌患者和细胞系 生物信息学 前列腺癌 转录组测序,单细胞RNA测序,RT-qPCR,机器学习,共培养模型 机器学习模型(具体类型未明确指定) 转录组数据,单细胞RNA测序数据 1693名前列腺癌患者(来自10个公共队列)和19个前列腺癌样本的单细胞数据 NA 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq NA NA
1603 2026-02-16
Current Overview of Multi-omics Analyses in Microscopic Polyangiitis and Granulomatosis with Polyangiitis
2026-Jan-15, Internal medicine (Tokyo, Japan)
综述 本文综述了多组学分析在显微镜下多血管炎和肉芽肿性多血管炎中的最新进展 整合了基因组学、表观基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学等多组学数据,以全面理解AAV的复杂病理生理学,并强调了单细胞RNA测序和空间转录组学等新技术在揭示基因表达谱和细胞相互作用中的应用 作为一篇综述,未涉及原始研究数据,可能未涵盖所有最新研究,且依赖于现有文献的总结 旨在通过多组学分析开发基于AAV分子和遗传特征的个性化诊断和治疗策略 抗中性粒细胞胞浆抗体相关血管炎(AAV),特别是显微镜下多血管炎和肉芽肿性多血管炎 自然语言处理 自身免疫性疾病 多组学分析,包括基因组学、表观基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、空间转录组学 NA 文本 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
1604 2026-02-16
Multi-omics characterization of RNA modification enzymes identifies NAT10 as a functionally validated prognostic biomarker in hepatocellular carcinoma
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过整合多组学分析,揭示了RNA修饰酶在多种癌症中的失调模式,并建立了诊断和预后模型 首次全面描绘了RNA修饰酶在泛癌中的拷贝数变异相关失调景观,并利用机器学习识别出12个可靠的肿瘤诊断标志物,同时通过单细胞转录组分析揭示了其在肿瘤微环境中的异质性表达 研究主要基于关联分析,功能验证仅针对NAT10进行,其他RNA修饰酶的具体生物学机制仍需进一步实验探索 系统表征RNA修饰酶在癌症中的全局调控模式及其临床相关性 多种癌症类型中的RNA修饰酶 生物信息学 肝细胞癌 多组学分析、单细胞RNA测序、机器学习、LASSO回归、EdU实验、qRT-PCR、免疫组化 LASSO回归模型 基因表达数据、拷贝数变异数据、临床数据、单细胞转录组数据 多个独立队列的癌症样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1605 2026-02-16
Prognostic gene screening and experimental validation in renal clear cell carcinoma based on spatial transcriptomics and single-cell sequencing
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据,筛选出七个预后基因并构建风险模型,用于肾透明细胞癌的风险分层和生存预测,并鉴定ATP1A1为潜在治疗靶点 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学数据识别肾透明细胞癌的预后基因,并构建了包含七个基因的风险模型和列线图,提高了生存预测的准确性 研究依赖于公共数据库(TCGA和ICGC)的回顾性数据,缺乏前瞻性临床验证,且功能分析主要基于生物信息学方法,实验验证有限 识别肾透明细胞癌的可靠预后生物标志物和治疗靶点,以改善患者分层和个性化治疗 肾透明细胞癌(ccRCC)患者 数字病理学 肾癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq),空间转录组学(ST) 风险模型,列线图(nomogram) 基因表达数据,空间转录组数据 TCGA和ICGC数据集中的肾透明细胞癌患者样本 NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
1606 2026-02-16
Transcriptome and single-cell RNA sequencing analysis with 101 machine learning combinations and experimental verification reveals the mechanism of action of mannose metabolism in bladder cancer
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过转录组和单细胞RNA测序分析结合101种机器学习组合及实验验证,揭示了甘露糖代谢在膀胱癌中的作用机制 首次系统整合101种机器学习算法组合来识别膀胱癌中与甘露糖代谢相关的预后基因,并通过单细胞分析确认巨噬细胞为关键细胞类型 研究主要基于公共数据库数据,需要更多独立队列验证;单细胞分析样本量可能有限 探究甘露糖代谢对膀胱癌预后的影响机制 膀胱癌患者样本及相关基因 生物信息学 膀胱癌 转录组测序, 单细胞RNA测序, RT-qPCR, Western blotting, 免疫组化 机器学习算法组合, 回归分析 基因表达数据, 单细胞数据 未明确具体样本数量,使用公共数据库数据集 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
1607 2026-02-16
PSMA4 as a Druggable Target in Hidradenitis Suppurativa: Evidence From Mendelian Randomization and Single-Cell Transcriptomics
2026, Mediators of inflammation IF:4.4Q2
研究论文 本研究通过药物基因组范围的孟德尔随机化分析,结合单细胞转录组学,识别了化脓性汗腺炎(HS)的潜在治疗靶点PSMA4和MAST3 首次整合孟德尔随机化、共定位分析和单细胞RNA测序,揭示PSMA4在CD4 T细胞中的富集及其通过TNF通路促进炎症的作用,为HS提供了新的治疗靶点 研究主要基于遗传和转录组数据,缺乏实验验证靶点功能的具体机制,且样本来源和疾病异质性可能影响结果普适性 识别化脓性汗腺炎的新型治疗靶点 化脓性汗腺炎患者 自然语言处理 皮肤炎症性疾病 孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序、共定位分析、细胞间通讯分析 NA 遗传数据、转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1608 2026-02-15
Integrated single-cell and transcriptomic analysis of CD8+CD101+TIM3+ T cells in hepatocellular carcinoma: implications for tumor microenvironment and prognostic modeling
2026-Jan-31, Translational cancer research IF:1.5Q4
研究论文 本研究通过整合单细胞和转录组学分析,揭示了肝细胞癌中CD8+CD101+TIM3+ T细胞的功能、分化机制及其在肿瘤微环境中的作用,并构建了一个预后模型 首次在肝细胞癌中系统研究了CD8+CD101+TIM3+ T细胞的功能、分化轨迹及其与肿瘤微环境的相互作用,并基于此构建了一个新的预后预测模型 研究主要基于公共数据库和单细胞测序数据,缺乏体内实验验证;预后模型在验证队列中的表现略低于训练队列 探究肝细胞癌中特定T细胞亚群的功能、分化机制及其对免疫治疗和预后的影响 肝细胞癌组织中的CD8+CD101+TIM3+ T细胞及其前体细胞 数字病理学 肝细胞癌 单细胞RNA测序,转录组分析 Cox回归模型,LASSO回归模型 单细胞RNA测序数据,临床数据,转录组数据 来自TCGA和GEO数据库的肝细胞癌样本数据 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1609 2026-02-15
Prognostic value of palmitoylation-regulated mechanisms in glioblastoma: integrated multi-omics analysis via least absolute shrinkage and selection operator (LASSO) regression and single-cell sequencing
2026-Jan-31, Translational cancer research IF:1.5Q4
研究论文 本研究通过整合多组学分析和单细胞测序,系统探讨了棕榈酰化相关基因在胶质母细胞瘤中的预后价值 结合LASSO回归和单细胞RNA测序分析,识别出与患者总生存期显著相关的核心基因,并揭示了它们在关键致癌通路中的富集和异质表达模式 研究主要基于公共数据库(如TCGA和GTEx)的转录组数据,可能未涵盖所有临床或分子亚型,且功能验证仅限于细胞系实验 系统研究棕榈酰化相关基因在胶质母细胞瘤中的预后意义 胶质母细胞瘤组织和正常脑组织 生物信息学 胶质母细胞瘤 转录组分析、单细胞RNA测序、LASSO回归、Kaplan-Meier生存分析 LASSO回归 RNA-seq数据、单细胞RNA-seq数据 基于TCGA和GTEx数据库的胶质母细胞瘤与正常组织样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1610 2026-02-15
Single-cell analysis reveals the prognostic role of immune escape in the colorectal cancer microenvironment
2026-Jan-31, Translational cancer research IF:1.5Q4
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析结直肠癌肿瘤微环境中的免疫逃逸相关细胞亚型,揭示了其在预后和免疫治疗中的潜在作用 首次系统性地对结直肠癌肿瘤微环境中的免疫逃逸相关细胞亚型进行新型分类,并利用CellChat和伪时序分析探索其细胞间相互作用和分化途径 研究主要基于单细胞RNA测序数据,需要通过多重免疫组化等技术进一步验证,且样本量可能有限 探索结直肠癌中免疫逃逸相关亚型的新型分类,阐明其机制,并评估其对免疫治疗和预后的价值 结直肠癌肿瘤微环境中的免疫逃逸相关细胞亚型,包括癌症相关成纤维细胞、CD8+ T细胞、巨噬细胞和B细胞等 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序, 多重免疫组化 非负矩阵分解聚类, CellChat, 伪时序分析, SCENIC, Cox比例风险回归, Kaplan-Meier生存分析 单细胞RNA测序数据, 免疫组化图像数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1611 2026-02-15
Single-patient single-cell RNA sequencing reveals neuroendocrine predominance and immunosuppression in small-cell lung cancer
2026-Jan-31, Translational cancer research IF:1.5Q4
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析小细胞肺癌患者的肿瘤组织,揭示了神经内分泌细胞占主导和免疫抑制的肿瘤微环境特征 首次在单患者水平使用scRNA-seq深入解析SCLC的瘤内异性和免疫微环境,并识别BEX1和MAP1b作为新的治疗靶点 研究仅基于单个患者样本,结果需在更大队列中验证;BEX1和MAP1b的临床实用性尚待后续研究确认 表征小细胞肺癌的瘤内异性和免疫抑制肿瘤微环境,并探索潜在治疗靶点 小细胞肺癌患者的原发肿瘤组织及相邻非癌组织 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 1例SCLC患者的原发肿瘤和相邻非癌组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1612 2026-02-15
Key genes and pathway differences between serrated polyps and conventional adenomas: insights from multi-omics
2026-Jan-31, Translational cancer research IF:1.5Q4
研究论文 本研究通过多组学方法揭示了锯齿状息肉与传统腺瘤在关键细胞类型和基因上的差异 首次整合CRC GWAS数据与单细胞测序,识别出锯齿状特异性细胞(SSC)作为CRC遗传风险的关键上皮细胞群,并鉴定出六个稳健的风险基因 NA 探究锯齿状息肉和传统腺瘤恶性转化过程中的关键细胞类型和基因 结直肠癌(CRC)中的锯齿状息肉和传统腺瘤 生物信息学 结直肠癌 单细胞测序, GWAS, TWAS, 精细定位, 孟德尔随机化 scPagwas, SMR 基因组, 转录组, 单细胞测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1613 2026-02-15
Novel fatty acid metabolism-related molecular subtyping and prognostic signature for breast cancer
2026-Jan-31, Translational cancer research IF:1.5Q4
研究论文 本研究开发了一种与脂肪酸代谢相关的基因预后模型,用于乳腺癌的风险分层和预后预测 首次整合十种机器学习方法构建脂肪酸代谢相关基因预后模型,并结合单细胞RNA测序和空间转录组学分析验证模型基因的功能和空间表达模式 研究主要基于TCGA数据库的回顾性数据,需要前瞻性临床研究进一步验证模型的预测效能 识别与脂肪酸代谢相关的有效生物标志物,以改善乳腺癌患者的风险分层和治疗选择 乳腺癌患者 机器学习 乳腺癌 单细胞RNA测序,空间转录组学,基因表达分析 CoxBoost,随机生存森林 基因表达数据 1,217名乳腺癌患者(TCGA数据库),26名乳腺癌患者(单细胞RNA测序数据) NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
1614 2026-02-15
GNAL-driven calcium signaling reshapes the spatiotemporal immune landscape in ER+ breast cancer: causal insights and prognostic implications
2026-Jan-31, Translational cancer research IF:1.5Q4
研究论文 本研究通过整合孟德尔随机化、单细胞RNA测序和空间转录组学,系统探讨了GNAL在ER+乳腺癌中的生物学功能、分子机制及预后相关性,揭示了其通过钙信号和干细胞样分化调控肿瘤免疫微环境的时空重塑 首次系统研究GNAL在ER+乳腺癌中的作用,结合因果推断、单细胞和空间分析,构建了多组学预后模型,并发现GNAL通过MIF-CD74轴招募B细胞 研究主要基于生物信息学分析,需要进一步实验验证GNAL的具体调控机制 探究GNAL在ER+乳腺癌内分泌抵抗中的生物学功能、分子机制及预后价值 ER+乳腺癌患者样本 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 孟德尔随机化, 分子对接 多组学预后模型 基因表达数据, 空间转录组数据 TCGA和GEO队列中的多个患者样本 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
1615 2026-02-15
Identification and verification of SPP1 in anoikis as a prognostic biomarker for intestinal metaplasia and gastric cancer
2026-Jan-20, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究探讨了失巢凋亡相关基因SPP1在肠化生和胃癌中的表达、免疫学作用及其作为预后生物标志物的潜力 首次将SPP1与肠化生/胃癌关联,并整合多组学分析、单细胞RNA测序及体外实验验证其在肿瘤进展和免疫微环境中的作用 研究主要基于公共数据库和体外实验,缺乏大规模临床队列验证,免疫治疗相关性需进一步研究 探索SPP1在肠化生至胃癌进展中的表达特征、免疫学功能及其作为预后生物标志物的价值 胃癌、肠化生组织样本及细胞系 生物信息学 胃癌 RNA-seq, scRNA-seq, RT-qPCR, Western blot Cox比例风险回归, ROC曲线分析, WGCNA, ceRNA网络 转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 蛋白质印迹数据 32例人体组织样本 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
1616 2026-02-15
Single-cell profiling of immunogenic cell death in melanoma reveals prognostic signatures and therapeutic targets
2026-Jan-16, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过整合批量转录组数据和单细胞RNA测序数据,开发了一个基于免疫原性细胞死亡的预后模型,并探讨了其在黑色素瘤中的临床相关性 首次在黑色素瘤中整合批量与单细胞数据构建基于ICD的预后模型,并识别出MYO10作为关键基因与免疫逃逸相关 研究主要依赖于公共数据库数据,缺乏独立的前瞻性队列验证,且单细胞数据样本来源有限 研究免疫原性细胞死亡在黑色素瘤中的作用,开发预后模型并探索治疗靶点 黑色素瘤患者样本 数字病理学 黑色素瘤 单细胞RNA测序, 批量转录组测序 机器学习算法 转录组数据 来自TCGA、GEO和GSE215120的多个队列样本 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
1617 2026-01-18
Single-cell sequencing-based analysis of CD4 + T-cell and B-cell heterogeneity in patients with lupus nephritis
2026-Jan-15, BMC medical genomics IF:2.1Q3
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
1618 2026-02-15
Recent Advances in Single-Cell Analysis of Atherosclerotic Plaque Biology
2026-Jan-15, JMA journal IF:1.5Q2
综述 本文综述了单细胞和空间转录组学技术在动脉粥样硬化斑块生物学研究中的最新进展,揭示了斑块内免疫细胞的异质性和空间组织 利用单细胞和空间转录组学技术,首次在动脉粥样硬化斑块中识别出多种先前未知的免疫细胞亚群(如TREM2泡沫样巨噬细胞亚群和CD163巨噬细胞亚群,包括血红蛋白刺激的巨噬细胞[M(Hb)]表型),并揭示了斑块内免疫细胞的空间特异性炎症生态位和纤维帽动态 本文为综述文章,未直接进行实验研究,因此未涉及具体的技术平台或样本量细节,且依赖于现有研究的局限性 总结单细胞和空间转录组学技术在动脉粥样硬化斑块生物学研究中的应用,以推动对动脉粥样硬化发病机制的理解和精准免疫治疗策略的开发 动脉粥样硬化斑块,特别是斑块内的免疫细胞(如巨噬细胞和T细胞) 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞T细胞受体测序 NA 转录组数据, 空间数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
1619 2026-02-15
Unveiling personalised targets of PD-1 blockade hyperprogression in a cervical adenocarcinoma via longitudinal single-cell and spatial monitoring
2026-Jan-13, NPJ precision oncology IF:6.8Q1
研究论文 本研究通过纵向单细胞和空间转录组学分析,揭示了一例宫颈腺癌患者在PD-1阻断治疗后出现超进展疾病的个性化分子机制 首次在单个宫颈腺癌病例中,通过纵向整合单细胞RNA测序、T细胞受体分析和空间转录组学,实时揭示了PD-1阻断后超进展疾病的适应性机制,并提出了LAG3和IGF1R作为潜在治疗靶点 研究仅基于单个病例,结果需要更大样本量的队列研究进行验证 探究宫颈腺癌患者对PD-1免疫检查点抑制剂产生超进展反应背后的分子和细胞机制 一例接受抗PD-1免疫治疗后出现超进展疾病的宫颈腺癌患者及其肿瘤微环境 数字病理学 宫颈癌 单细胞RNA测序, T细胞受体分析, 空间转录组学 NA 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 1例宫颈腺癌患者(纵向监测) NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
1620 2026-02-15
Genital herpes shedding episodes associate with altered spatial organization and activation of mucosal immune cells
2026-Jan-09, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究探讨了HSV-2感染期间病毒脱落对宫颈阴道黏膜免疫细胞空间组织和活化的影响 首次结合空间转录组学、流式细胞术和免疫荧光成像,系统揭示了活动性HSV-2脱落期间阴道黏膜免疫细胞的空间重编程和激活状态变化 研究为横断面设计,无法确定观察到的免疫变化与病毒脱落之间的因果关系;样本量虽大但可能未涵盖所有临床亚群 探究HSV-2感染对宫颈阴道黏膜免疫的影响机制 HSV-2血清阳性和阴性参与者的宫颈阴道组织和血液样本 空间转录组学 生殖器疱疹 流式细胞术、免疫荧光成像、可溶性免疫因子分析、空间转录组学 NA 组织样本、血液样本、空间转录组数据、成像数据 232名参与者(包括HSV-2血清阳性和阴性个体) NA 空间转录组学 NA NA
回到顶部