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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1541 2026-02-21
Androgen Signaling in ILC2s Drives Sex Differences in Helicobacter-induced Gastric Inflammation and Atrophy
2026, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1
研究论文 本研究揭示了雄激素通过调节2型先天淋巴细胞(ILC2)的活化,在幽门螺杆菌诱导的胃部炎症中发挥保护作用,并阐明了ILC2在驱动胃部癌前病变性别差异中的关键角色 首次发现雄激素信号通过调控ILC2的活性来影响幽门螺杆菌感染的胃部炎症反应,并明确了ILC2是驱动胃部癌前病变性别差异的主要调节因子 研究主要基于小鼠模型,其在人类中的直接相关性仍需进一步验证;且未详细探讨其他性激素(如雌激素)的潜在影响 探究雄激素如何影响幽门螺杆菌感染后的胃部炎症反应,并阐明其在胃部癌前病变性别差异中的作用机制 感染幽门螺杆菌的雄性和雌性小鼠,以及经手术去势或二氢睾酮处理的模型小鼠 单细胞组学与免疫学 胃癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 未明确说明具体样本数量,但涉及多种性别和处理条件的小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1542 2026-02-21
The Glutamine Metabolic Switch Influences the Response of Neonatal Intestinal Macrophages to Breast Milk
2026, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1
研究论文 本研究探讨了谷氨酰胺和谷氨酸在新生儿坏死性小肠结肠炎(NEC)中对肠道巨噬细胞代谢重编程的双重作用及其机制 揭示了谷氨酰胺代谢开关(从谷氨酰胺酶GLS转向谷氨酸脱氢酶GLUD1)如何决定巨噬细胞的促炎或抗炎表型,并阐明了其在疾病不同阶段(预防期与进展期)产生相反效果的机制 研究主要基于新生大鼠NEC模型和体外骨髓来源巨噬细胞实验,人类数据为对已发表scRNA-seq数据的再分析,缺乏直接的人类体内验证 探究谷氨酰胺和谷氨酸在新生儿肠道炎症中的作用机制,为新生儿肠道疾病的个性化营养干预提供依据 新生大鼠坏死性小肠结肠炎(NEC)模型、骨髓来源巨噬细胞(BMDMs)、已发表的人类新生儿NEC单细胞RNA测序数据 NA 坏死性小肠结肠炎 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、流式细胞术、转录组学分析 NA 基因表达数据、流式细胞数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
1543 2026-02-21
GPR68, A Proton-sensing GPCR, Mediates Acid-induced Visceral Nociception
2026, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1
研究论文 本研究探讨了质子感应G蛋白偶联受体GPR68在酸诱导的结肠痛觉中的作用 首次发现GPR68在结肠感觉神经元中表达,并证实其在酸诱导的结肠痛觉中起关键作用 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限 探究GPR68在结肠炎症酸诱导痛觉中的机制 结肠感觉神经元、小鼠模型、人类炎症性肠病组织 NA 炎症性肠病 单细胞RNA测序、Ca2+成像、药理学研究 NA RNA-seq数据、电生理记录、Ca2+成像数据 野生型和GPR68-/-小鼠、人类炎症性肠病组织样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1544 2026-02-21
Mapping the evolution of kainate receptor research over five decades: trends, hotspots, and emerging frontiers
2026-Jan, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
综述 本文对过去五十年(1975-2024)关于红藻氨酸受体(KAR)的研究进行了全面的文献计量学分析,旨在绘制该领域的发展脉络、识别关键趋势和研究热点,并指出新兴前沿 这是首个关于KAR研究的文献计量学路线图,系统性地揭示了该领域的动态演变、全球合作模式以及未被满足的转化需求 研究挑战包括KAR调节剂的临床转化有限,以及其在精神疾病中的作用尚未完全阐明 提供一个关于KAR研究领域的系统性概述,包括其发展历程、全球贡献和转化潜力,以指导未来的研究和临床应用 红藻氨酸受体(KARs),一种离子型谷氨酸受体亚型 神经科学 癫痫等神经和精神疾病 文献计量学分析(使用CiteSpace, VOSviewer, Bibliometrix),以及cryo-electron microscopy, single-cell RNA sequencing等先进技术 NA 文献数据(出版物) 从PubMed, Web of Science, Scopus数据库中检索并去重后的11,671篇出版物 NA NA NA NA
1545 2026-02-21
Canopy2: Tumor Phylogeny Inference by Bulk DNA and Single-Cell RNA Sequencing
2026, Statistics in biosciences IF:0.8Q4
研究论文 本文提出了一种名为Canopy2的贝叶斯框架,用于通过bulk DNA和单细胞RNA测序数据推断肿瘤系统发育树并进行突变分析 Canopy2通过联合概率分布模型,首次能够解析单细胞数据中零值的不同来源(非癌性、随机性和技术性),并在低测序深度、低细胞捕获率及高度异质性肿瘤中保持高精度 方法主要基于单核苷酸变异(SNVs),未明确讨论其对拷贝数变异(CNVs)或其他结构变异的适用性 开发一种能够准确推断肿瘤系统发育树和亚群突变谱的计算方法 肿瘤细胞群体(特别是乳腺癌和胶质母细胞瘤) 计算生物学 乳腺癌, 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序, bulk DNA测序 贝叶斯框架, 马尔可夫链蒙特卡洛方法 单核苷酸变异数据, 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq, bulk DNA-seq NA NA
1546 2026-02-21
ScRNA-seq Identifies High CXCL8 Linked to Liver Fibrosis in HBeAg-negative Chronic Hepatitis B Patients With Low HBsAg
2026, Gastro hep advances
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序发现,在HBeAg阴性慢性乙型肝炎患者中,低HBsAg水平与高CXCL8表达相关,且与肝纤维化程度增加有关 首次在低HBsAg水平的HBeAg阴性慢性乙型肝炎患者中,通过单细胞RNA测序揭示了CXCL8在血浆、外周和肝内单核-巨噬细胞群体中的高表达与肝纤维化的关联,并识别了独特的CD8 T细胞簇 样本量较小(仅35名患者,其中6名进行单细胞RNA测序),且为单中心研究,可能限制结果的普遍性 探讨CXCL8在HBeAg阴性慢性乙型肝炎患者肝纤维化中的作用,特别是在不同HBsAg水平下的表达差异 HBeAg阴性、未接受治疗的慢性乙型肝炎患者,根据HBsAg水平分为低(<2000 IU/mL)和高(>2000 IU/mL)两组 单细胞组学 慢性乙型肝炎 单细胞RNA测序,组织病理学分析,血浆细胞因子分析 NA 单细胞RNA测序数据,血浆细胞因子数据,组织病理学数据 35名患者(12名低HBsAg,23名高HBsAg),其中6名进行单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1547 2026-02-21
Changes in the brain [NAD+]/[NADH] and [NADPH]/[NADP+] with aging and anti-aging dietary restriction
2026, Frontiers in aging neuroscience IF:4.1Q2
研究论文 本研究探讨了小鼠和人类大脑中NAD+/NADH和NADPH/NADP+比值随衰老和抗衰老饮食限制的变化,并分析了相关代谢通路 揭示了不同小鼠品系(C57BL/6J vs C57BL/6N)和人类大脑在衰老过程中呈现相反的氧化还原变化,并比较了禁食与生酮饮食对脑氧化还原状态的不同影响 研究主要基于代谢物比值作为间接指标,未直接测量NAD+/NADH和NADPH/NADP+的绝对浓度,且人类数据可能有限 探究大脑氧化还原状态在衰老过程中的变化机制及饮食干预(如禁食和生酮饮食)的影响 C57BL/6J和C57BL/6N小鼠大脑、人类大脑 NA 衰老相关疾病 单细胞RNA测序、批量RNA测序、蛋白质组学分析 NA 代谢物数据、转录组数据、蛋白质组数据 未明确指定样本数量,涉及小鼠和人类大脑数据 NA 单细胞RNA测序、批量RNA测序 NA NA
1548 2026-02-21
Association of Increased Nasal Fluids-Serum Concordance of Protein Profile with Prognosis in Nasal Polyps
2026, Journal of inflammation research IF:4.2Q2
研究论文 本研究首次探讨了鼻液与血清蛋白质谱一致性作为鼻息肉术后复发的预测指标 首次提出并验证了鼻液与血清蛋白质谱一致性作为鼻息肉术后复发的整合预后标志物 样本量相对较小(54例患者),且随访时间至少为6个月,可能影响长期复发预测的准确性 预测鼻息肉术后复发,通过多室分析提供更整合的预后标志 54名鼻息肉患者(包括18名复发和36名未复发)的鼻液和血清样本 数字病理学 鼻息肉 邻近延伸分析(PEA)、bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq(scRNAseq)、免疫荧光、公共数据库分析 NA 蛋白质组学数据、RNA-seq数据、免疫荧光图像 54名鼻息肉患者 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
1549 2026-02-20
zDUR: reference-free FASTQ compressor with high compression ratio and speed
2026-Jan-23, BMC bioinformatics IF:2.9Q1
研究论文 本文介绍了一种名为zDUR的无参考FASTQ压缩器,旨在高效处理来自不同平台和测序数据类型的新一代测序数据 zDUR在压缩比和速度之间实现了良好的整体平衡,并在单细胞RNA-seq和空间转录组学数据集上表现出显著的运行时性能提升 NA 开发一种高效且可扩展的无参考FASTQ压缩器,以减轻存储和传输负担 FASTQ数据,包括核苷酸序列、质量分数和读取标识符 机器学习 NA 高通量测序 NA FASTQ文件 15个代表性数据集,涵盖四种测序数据类型 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
1550 2026-02-20
3D reconstruction of spatial transcriptomics with spatial pattern enhanced graph convolutional neural network
2026-Jan-07, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 本文介绍了一种名为Spa3D的新方法,利用抗泄漏傅里叶变换和图卷积神经网络从多个2D空间转录组切片重建3D空间结构,以提升空间域识别、细胞通讯分析和发育轨迹建模的准确性 首次提出结合抗泄漏傅里叶变换和图卷积神经网络进行3D空间转录组重建,克服了现有方法仅依赖2D坐标的局限,实现了在3D空间中的更精确分析 未明确提及方法在计算资源需求、处理大规模数据时的效率或对不同组织类型的适用性限制 开发一种能从2D空间转录组数据重建3D空间结构的方法,以更准确地分析空间域、空间可变基因、细胞间通讯和发育轨迹 空间转录组数据,特别是来自多个2D切片的数据 空间转录组学 NA 抗泄漏傅里叶变换,图卷积神经网络 图卷积神经网络 空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
1551 2026-02-20
SHEST: single-cell-level artificial intelligence from haematoxylin and eosin morphology for cell-type prediction and spatial transcriptomics reconstruction
2026-Jan-07, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 本文提出了一种名为SHEST的多任务分析框架,利用H&E染色形态学图像预测细胞组成并重建单细胞分辨率的空间基因表达 开发了一个统一的可解释框架,通过四重瓦片输入捕获核与上下文信息,结合邻域感知聚类算法过滤模糊细胞信号,并采用多任务优化策略处理空间转录组数据的稀疏性 NA 整合组织形态学与空间分子图谱以全面理解癌症进展 人类肺腺癌组织 数字病理学 肺癌 空间转录组学 多任务深度学习框架(包含共享形态编码器与两个任务特定头:分类器与重建器) H&E染色形态学图像,空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
1552 2026-02-20
Decoding Vascular Cell Diversity: Single-Cell Approaches to Mechanisms of Vascular Disease
2026-Jan-02, Circulation research IF:16.5Q1
综述 本文综述了单细胞分析技术在血管细胞异质性研究中的应用,包括实验和计算方法,并探讨了这些方法如何揭示血管疾病的机制 应用单细胞或单核RNA测序技术识别罕见和疾病特异性细胞群体,结合CRISPR扰动与单细胞RNA测序数据,提供细胞类型特异性疾病机制的新见解 NA 概述单细胞分析技术及其在血管细胞和血管疾病研究中的应用 血管细胞和组织 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, CRISPR扰动, 染色质可及性分析 NA RNA测序数据, 染色质可及性数据, 空间定位数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 NA NA
1553 2026-02-20
Computational identification of necroptosis-related hub genes and therapeutic targets in dilated cardiomyopathy via integrated analysis of bulk and single-cell RNA sequencing public cohorts
2026-Jan-02, Medicine IF:1.3Q2
研究论文 本研究通过整合分析bulk和单细胞RNA测序公共队列数据,计算识别了扩张型心肌病中与坏死性凋亡相关的枢纽基因及潜在治疗靶点 首次整合bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq公共数据,系统性识别了DCM中与坏死性凋亡相关的5个枢纽基因,并构建了诊断模型和预测了潜在治疗药物 研究完全基于公开数据集,缺乏实验验证;样本来源和数量受限于公共数据库 识别与扩张型心肌病相关的坏死性凋亡枢纽基因,并预测潜在治疗药物 扩张型心肌病患者的心脏组织样本 生物信息学 心血管疾病 RNA-seq, 单细胞RNA-seq LASSO, 随机森林 基因表达数据 来自GEO数据库的公共队列数据集(GSE128095和GSE184899) NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
1554 2026-02-20
Exploring the interconnection between PANoptosis and chronic inflammatory diseases: identifying key targets and therapeutic strategies for periodontitis and ulcerative colitis
2026-Jan, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
研究论文 本研究通过生物信息学分析和实验验证,探索了PANoptosis(一种整合了细胞焦亡、凋亡和坏死性凋亡的程序性细胞死亡形式)在牙周炎和溃疡性结肠炎这两种慢性炎症性疾病中的共同分子机制,并鉴定了核心靶点基因 首次将PANoptosis概念与牙周炎和溃疡性结肠炎这两种不同解剖部位的慢性炎症性疾病联系起来,通过整合生物信息学分析、动物模型验证和单细胞RNA测序,系统性地鉴定了BAG3、LYN和APOE这三个核心靶点基因及其调控网络 研究主要基于公共数据库和动物模型,核心靶点基因在人体中的功能和治疗潜力仍需进一步的临床前和临床研究验证 识别牙周炎和溃疡性结肠炎的共同分子靶点和通路,探索PANoptosis相关基因与这两种疾病相关基因的相互作用,并预测潜在的治疗靶点和药物 牙周炎和溃疡性结肠炎相关的基因表达数据、PANoptosis相关基因、小鼠疾病模型 生物信息学 牙周炎, 溃疡性结肠炎 差异表达分析, 加权基因共表达网络分析, 蛋白质-蛋白质相互作用网络分析, GO和KEGG富集分析, LASSO和SVM-RFE算法, 单细胞RNA测序, ceRNA网络构建, 分子对接模拟 LASSO, SVM-RFE 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 来自GEO数据库的数据集(GSE16134用于牙周炎,GSE87466用于溃疡性结肠炎),以及实验性牙周炎和DSS诱导的溃疡性结肠炎小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1555 2026-02-20
Glial cells in dementia: From cellular dysfunction to therapeutic frontiers
2026 Jan-Dec, Cell transplantation IF:3.2Q2
综述 本文综述了神经胶质细胞在神经退行性痴呆中的作用,并提出了一个整合框架,探讨其从细胞功能障碍到治疗前沿的进展 提供了一个新颖的整合框架,将神经胶质细胞亚型在痴呆中的分子、细胞和环路水平病理中的相互关联角色进行映射,超越了以往孤立讨论胶质细胞功能障碍的综述 作为一篇综述,其局限性在于主要基于现有文献进行综合,未涉及新的原始实验数据或临床研究 旨在重新定义神经胶质细胞在神经退行性痴呆中的异质性和功能,并探讨靶向胶质细胞特异性通路的治疗策略 神经胶质细胞(包括星形胶质细胞、小胶质细胞和少突胶质细胞)在阿尔茨海默病和血管性痴呆等神经退行性痴呆中的作用 数字病理学 老年疾病 单细胞RNA测序、空间转录组学、胶质细胞成像 NA NA NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
1556 2026-02-20
Identification of key biomarkers of telomere-related genes in diabetic nephropathy via bioinformatic analysis
2026, Frontiers in genetics IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过生物信息学分析鉴定了糖尿病肾病中端粒相关基因的关键生物标志物 结合机器学习算法(LASSO回归和SVM-RFE)和单细胞测序技术,首次系统筛选并验证了糖尿病肾病中端粒相关基因如TRIM22、ELOVL4、NLGN4X和FOSB作为潜在诊断标志物和治疗靶点 研究主要依赖公共数据库的微阵列数据,样本来源和数量可能有限,且实验验证仅通过RT-PCR在有限样本中进行,需要更大规模的临床队列和功能实验进一步确认 探索糖尿病肾病的分子机制,以开发新的治疗靶点和诊断生物标志物 糖尿病肾病患者的基因表达数据、肾脏活检组织样本以及正常对照样本 生物信息学 糖尿病肾病 微阵列数据分析、机器学习算法(LASSO回归、SVM-RFE)、单细胞测序、RT-PCR LASSO回归、SVM-RFE 基因表达微阵列数据、单细胞测序数据 未明确指定具体样本数量,但使用了GEO数据库的微阵列数据、外部验证数据集以及DN和正常肾脏活检组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1557 2026-02-20
Macrophage Hypoxia Signaling Pathways and Their Roles in Sepsis
2026, Journal of inflammation research IF:4.2Q2
综述 本文综述了巨噬细胞缺氧信号通路(特别是HIF-1α)在脓毒症中的作用机制及潜在治疗策略 结合最新的单细胞转录组学数据和分子机制研究,系统性地探索了脓毒症的潜在治疗靶点和干预策略 关于缺氧信号通路影响巨噬细胞功能及疾病进展的具体机制和临床意义仍有许多未解之谜 总结缺氧相关信号通路对巨噬细胞功能及脓毒症病理过程的影响,为脓毒症精准治疗提供理论基础和研究方向 巨噬细胞 自然语言处理 脓毒症 单细胞转录组学 NA 文本 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1558 2026-02-20
The interaction between dendritic cells and T follicular helper cells drives inflammatory bowel disease: a review
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
综述 本文综述了树突状细胞与滤泡辅助性T细胞之间的双向相互作用在炎症性肠病发病机制中的核心作用 提出了DC-TFH细胞相互作用形成的自放大炎症回路是IBD发病的关键,并系统阐述了其分子机制及在不同疾病亚型中的特异性 该轴在疾病起始阶段的时间作用、与其他免疫通路的串扰以及从动物模型到人类疾病的转化仍存在挑战 阐明炎症性肠病的免疫发病机制,并探讨针对DC-TFH相互作用轴的治疗策略 树突状细胞、滤泡辅助性T细胞及其在肠道炎症微环境中的相互作用 NA 炎症性肠病 单细胞转录组学、空间转录组学 NA NA NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
1559 2026-02-20
Integrative bulk and single-cell transcriptomics link EZH2 to immunosuppressive programs and tumor-Treg crosstalk in castration-resistant prostate cancer
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过整合bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据,系统描绘了EZH2在去势抵抗性前列腺癌中与免疫抑制程序及肿瘤-Treg细胞互作的关联 首次在晚期前列腺癌中系统整合bulk和单细胞转录组数据,揭示EZH2高表达与恶性细胞增殖状态、免疫抑制微环境及肿瘤-Treg细胞互作增强的关联,并通过EZH2抑制剂实验验证了其对相关转录程序的调控作用 研究主要基于转录组数据分析,功能性和因果机制尚需进一步实验验证,且样本队列可能受限于现有公共数据集 探究EZH2在去势抵抗性前列腺癌中的免疫调控作用及其与肿瘤微环境的相互作用 前列腺癌患者样本(包括TCGA-PRAD队列、转移性CRPC队列)及C42细胞系 数字病理学 前列腺癌 RNA-seq, scRNA-seq, RT-qPCR NMF, 惩罚Cox模型, CellPhoneDB 转录组数据 多个bulk队列(TCGA-PRAD和独立转移性CRPC队列)及单细胞队列(GSE264573和独立CRPC队列),具体样本数未明确 NA single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
1560 2026-02-20
m6A demethylase-driven reprogramming of leukemia-associated macrophages predicts improved outcomes in acute myeloid leukemia
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序数据,揭示了m6A修饰调控因子在急性髓系白血病(AML)相关巨噬细胞重编程中的作用及其与患者预后的关联 首次在单细胞水平系统性地描绘了AML中巨噬细胞的m6A调控图谱,并阐明了不同m6A调控因子(写入器、擦除器、读取器)对巨噬细胞命运和功能极化的特异性影响,将m6A系统与肿瘤免疫微环境及临床预后联系起来 研究主要基于公共数据库的回顾性分析,需要进一步实验验证m6A调控因子的具体作用机制;样本量虽整合了多个队列,但异质性可能影响结论的普适性 探究m6A修饰调控因子在AML肿瘤免疫微环境中对巨噬细胞重编程的影响及其临床意义 急性髓系白血病(AML)患者的巨噬细胞 生物信息学 急性髓系白血病 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、RT-qPCR、生物信息学分析(Seurat、Harmony、Monocle3、CellChat、Metascape) NA 单细胞转录组数据、批量RNA测序数据、临床样本基因表达数据 整合了来自129个患者队列的公共scRNA-seq数据集,并包含临床AML样本的验证 NA 单细胞RNA-seq NA NA
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