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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1541 | 2026-01-22 |
Integrative Bioinformatics and Machine Learning Identify Novel Diagnostic Biomarkers and Molecular Mechanisms in Sjögren's Syndrome
2026, International journal of genomics
IF:2.6Q2
DOI:10.1155/ijog/5044551
PMID:41551935
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研究论文 | 本研究通过整合生物信息学和机器学习方法,识别了干燥综合征的新型诊断生物标志物并阐明了其分子机制 | 结合12种机器学习算法、加权基因共表达网络分析及单细胞RNA测序数据验证,识别出12个具有卓越诊断性能的枢纽基因,并进行了药物重定位分析 | 研究主要基于公共转录组数据集,缺乏独立的前瞻性临床队列验证,且未进行实验验证 | 识别干燥综合征的新型诊断生物标志物并阐明其分子机制 | 干燥综合征患者和健康对照者的外周血转录组数据 | 机器学习 | 干燥综合征 | 转录组测序,单细胞RNA测序 | 多种机器学习算法 | 基因表达数据 | 351名干燥综合征患者和91名健康对照者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1542 | 2026-01-21 |
Integrated multi-omics identifies MCRS1 as a causal hub linking aging, metabolic syndrome, and breast cancer progression
2026-Jan-20, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000004592
PMID:41556158
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据,识别出MCRS1是连接衰老、代谢综合征和乳腺癌进展的核心因果枢纽 | 首次通过整合乳腺癌、代谢综合征和衰老队列的转录组数据集,结合机器学习、孟德尔随机化和单细胞RNA测序,识别并验证了MCRS1作为连接这些状态的核心因果驱动因子 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,需要在人类患者中进行进一步验证 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1543 | 2026-01-21 |
Deciphering CD4+ Naive T cell-mediated divergent pathogenic links between type 2 diabetes and pathologic scarring via an integrated multi-omics approach
2026-Jan-19, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000004905
PMID:41556164
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研究论文 | 本研究通过整合多组学方法,揭示了2型糖尿病通过CD4+初始T细胞介导的免疫微环境调控,对增生性瘢痕和瘢痕疙瘩产生相反因果效应的潜在机制 | 首次采用表型范围孟德尔随机化结合单细胞RNA测序等多组学技术,系统阐明了2型糖尿病与不同病理性瘢痕之间的因果关联及CD4+初始T细胞的介导作用 | 研究主要基于遗传学和转录组学数据,缺乏直接的体内功能验证实验 | 探究糖尿病与病理性瘢痕(增生性瘢痕和瘢痕疙瘩)之间的因果关系及免疫细胞机制 | 糖尿病(1型和2型)与病理性瘢痕(增生性瘢痕和瘢痕疙瘩) | 多组学整合分析 | 糖尿病与皮肤纤维化疾病 | 单细胞RNA测序、孟德尔随机化、细胞间通讯推断、代谢通路分析、转录组差异表达分析 | 孟德尔随机化模型、伪时间轨迹分析 | 遗传数据、单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1544 | 2026-01-21 |
SHC Adaptor Protein 1 Drives Cancer-Associated Fibroblast-Mediated Immune Exclusion and Notch-Dependent Angiogenesis
2026-Jan, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.149542
PMID:41386608
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研究论文 | 本研究探讨了SHC适配蛋白1在肺腺癌肿瘤血管生成和肿瘤微环境中的作用,开发了基于液相分离风险的预测模型 | 首次将SHC1的液相分离特性与肺腺癌的血管生成和免疫微环境联系起来,并构建了基于机器学习算法的液相分离风险特征模型 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验,体内验证仅限于斑马鱼模型,缺乏更复杂的动物模型验证 | 探索SHC1在肺腺癌肿瘤血管生成和肿瘤微环境调控中的作用机制 | 肺腺癌患者、肿瘤相关成纤维细胞、肿瘤源性内皮细胞 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞转录组学、多重免疫组化、RNA测序、Western blotting | 机器学习算法组合 | 转录组数据、图像数据 | 未明确样本数量,但使用了101种机器学习算法组合进行分析 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1545 | 2026-01-21 |
Bacterial cellulose repairs asthmatic epithelial injury by reprogramming CDS1-mediated phosphatidylinositol metabolism to inhibit PI3K/AKT signaling
2026-Jan, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.149695
PMID:41407218
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研究论文 | 本研究评估了细菌纤维素(BC)通过调控CDS1介导的磷脂酰肌醇代谢来修复哮喘气道上皮损伤并抑制PI3K/AKT信号通路的治疗潜力 | 首次揭示了细菌纤维素通过下调上皮细胞CDS1,重编程磷脂酰肌醇代谢,从而抑制PI3K/AKT信号通路并修复上皮屏障的双重作用机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外样本,尚未在人类临床试验中验证BC的疗效和安全性 | 探索针对哮喘气道上皮损伤的新型治疗策略 | 屋尘螨诱导的过敏性哮喘小鼠模型以及人类哮喘患者的上皮样本 | NA | 哮喘 | 单细胞RNA测序,代谢组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1546 | 2026-01-21 |
CXCL10high Microglia in Cerebral Malaria: Toward Translational Validation
2026-Jan, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1002/cns.70742
PMID:41518083
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评论 | 本文对Wang等人关于CXCL10高表达小胶质细胞在实验性脑疟疾中驱动CD8 T细胞招募的研究进行了保守性重构,提出将其视为候选“神经免疫内型”,并强调其在人类疾病中的转化验证需求 | 提出将CXCL10小胶质细胞重新定义为需要转化验证的候选神经免疫内型,而非完全验证的新分类,并优先推荐人类尸检组织的单核与空间转录组学等验证步骤 | 研究基于实验性脑疟疾模型,其治疗推断需谨慎,转化工作需先建立可重复的人类小胶质细胞特征和临床相关性 | 探讨CXCL10高表达小胶质细胞在脑疟疾中的转化验证路径和临床相关性 | 小胶质细胞、CD8 T细胞、人类尸检组织、血浆/脑脊液生物标志物 | 神经免疫学 | 脑疟疾 | 单核转录组学、空间转录组学、生物标志物相关性分析、抗原呈递机制检测 | NA | 转录组数据、生物标志物数据 | NA | NA | 单核转录组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1547 | 2026-01-21 |
Surface Marker Identification to Capture Live Circulating Tumor Cells in Metastatic Triple-Negative Breast Cancer
2026-Jan-01, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-25-0536
PMID:41543394
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研究论文 | 本文开发了一种用于捕获活循环肿瘤细胞并进行单细胞RNA测序的工作流程,以增强转移性三阴性乳腺癌中CTC的检测 | 识别了四个新的CTC表面标志物(AHNAK2、CAVIN1、ODR4和TRIML2),结合传统标志物提高了检测灵敏度和覆盖率 | NA | 提高转移性三阴性乳腺癌中活循环肿瘤细胞的捕获和检测效率 | 转移性三阴性乳腺癌的循环肿瘤细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个TNBC小鼠模型和患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1548 | 2026-01-20 |
Angiogenic switching in cerebral cavernous malformations driven by MAP3K3-PIK3CA synergy
2026-Jan-19, Brain : a journal of neurology
IF:10.6Q1
DOI:10.1093/brain/awag017
PMID:41552909
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1549 | 2026-01-20 |
Single-Cell Transcriptome Profiling Reveals the Immune Dysregulation Characteristics of Mice Infected With Brucella abortus
2026-Jan-17, The Journal of infectious diseases
IF:5.0Q1
DOI:10.1093/infdis/jiaf522
PMID:41074555
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序揭示了布鲁氏菌感染小鼠后免疫微环境的显著改变,并深入探究了其免疫逃避机制 | 首次在单细胞水平上系统描绘了布鲁氏菌感染小鼠的免疫图谱,并发现IFN-β信号通路和NK细胞免疫检查点CD94:NKG2A在感染过程中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,结果向人类疾病的直接转化需要进一步验证 | 阐明布鲁氏菌如何颠覆免疫反应以建立持续性感染的机制 | 感染布鲁氏流产杆菌的小鼠 | 单细胞组学 | 布鲁氏菌病 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量,但使用了转基因细胞系和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1550 | 2026-01-20 |
Integrated Single-Nucleus and Spatial Transcriptomics Elucidate Heterogeneity and Hypoxia-Driven Organization of Supratentorial Ependymoma
2026-Jan-16, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-2694
PMID:41150895
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研究论文 | 本研究通过整合单核和空间转录组学,揭示了幕上室管膜瘤的异质性和缺氧驱动的空间组织 | 首次结合单核与空间转录组学分析ST-EPN,发现两个与细胞外基质重塑和ZFTA融合身份相关的新转录程序,并开发了对混合点转录组敏感的空间评分算法以识别缺氧的空间驱动作用 | 样本量相对有限(单核n=63,空间n=30),且研究聚焦于ST-EPN,结果可能不适用于其他类型脑肿瘤 | 阐明ST-EPN的分子异质性和空间组织,以促进未来靶向治疗策略的开发 | 幕上室管膜瘤(ST-EPN)肿瘤样本 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单核转录组学,空间转录组学 | 空间评分算法 | 转录组数据 | 单核样本63个,空间样本30个 | NA | 单核RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 1551 | 2026-01-20 |
Discovery of a chemical small molecule inducing umbilical cord mesenchymal stem cell differentiation to vascular endothelial cells
2026-Jan-16, Cell regeneration (London, England)
DOI:10.1186/s13619-025-00278-2
PMID:41543674
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研究论文 | 本文发现了一种名为CPP的新型小分子化学物质,可高效诱导人脐带间充质干细胞分化为功能性血管内皮细胞 | 首次通过系统筛选鉴定出CPP这一新型小分子诱导剂,能在5天内实现>90%的高效分化,并通过单细胞RNA测序揭示了分化轨迹 | 未明确说明CPP的具体化学结构、长期安全性及在大型动物模型中的验证结果 | 开发高效诱导hUC-MSCs分化为血管内皮细胞的方法,以解决血管疾病治疗中成熟内皮细胞来源不足的问题 | 人脐带间充质干细胞(hUC-MSCs) | 干细胞与再生医学 | 血管疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、体外功能验证、体内功能验证 | NA | 基因表达数据、功能实验数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1552 | 2026-01-20 |
IL-9 signaling redirects CAR T cell fate toward CD8+ memory and CD4+ cycling states, enhancing antitumor efficacy
2026-Jan-13, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2025.10.021
PMID:41274291
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研究论文 | 本研究通过赋予CAR T细胞异位IL-9信号,重塑其在抗原压力下的命运,从而增强其在实体瘤模型中的抗肿瘤疗效 | 首次证明通过共表达IL-9受体赋予CAR T细胞IL-9信号,可使其在抗原压力下避免功能障碍,转向CD8+记忆/效应状态和CD4+增殖状态,从而显著提升抗肿瘤效果 | 研究目前处于临床前模型阶段,尚未在人体临床试验中得到验证 | 克服实体瘤免疫抑制微环境对CAR T细胞疗法的限制,提升其抗肿瘤疗效 | 经过基因工程改造的CAR T细胞 | 免疫治疗 | 实体瘤 | 单细胞RNA测序 | 轨迹分析和RNA速率分析 | 单细胞转录组数据 | 临床前实体瘤模型(具体数量未明确说明) | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1553 | 2026-01-20 |
Single-cell RNA sequencing reveals the role of neutrophils in intestinal ischemia-reperfusion injury in mice
2026-Jan-13, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2026.124208
PMID:41539463
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了小鼠肠道缺血再灌注损伤中中性粒细胞的功能异质性及其通过ATF4介导的内质网应激通路驱动损伤的机制 | 首次在肠道缺血再灌注损伤中利用单细胞RNA测序技术鉴定出一个具有促炎特性的中性粒细胞亚群(C5),并阐明其通过ATF4介导的内质网应激通路加剧损伤的具体分子机制 | 研究仅使用小鼠模型,结论在人体中的适用性有待验证;单细胞测序样本量相对有限;未深入探讨其他免疫细胞亚群的可能相互作用 | 阐明中性粒细胞在肠道缺血再灌注损伤中的具体作用机制和功能异质性 | C57BL/6小鼠的肠道组织 | 单细胞组学 | 肠道缺血再灌注损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量,使用小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1554 | 2026-01-20 |
LOXL2⁺ cancer-associated fibroblasts shape WNT signaling to drive chemoresistance and poor outcomes in colorectal cancer: Insights from multi-omics and epidemiological analyses
2026-Jan-06, Neoplasia (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.neo.2025.101267
PMID:41496273
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学数据与流行病学分析,揭示了LOXL2⁺癌症相关成纤维细胞通过激活WNT信号通路驱动结直肠癌化疗耐药和不良预后的机制 | 首次系统性地将LOXL2⁺ CAFs鉴定为结直肠癌化疗耐药的关键基质决定因素,并通过空间转录组学证实了其与WNT5A阳性癌细胞的物理相互作用 | 研究主要基于回顾性队列分析,需要前瞻性临床研究进一步验证LOXL2作为生物标志物的临床效用 | 阐明癌症相关成纤维细胞亚型在结直肠癌进展和治疗反应中的分子机制及临床意义 | 结直肠癌患者组织样本、癌症相关成纤维细胞亚型 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组测序、空间转录组学、免疫荧光、功能实验 | NA | 转录组数据、空间转录组数据、临床数据 | 多个结直肠癌队列的患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1555 | 2026-01-20 |
Integration of in situ hybridization and scRNA-seq data provides a 2D topographical map of the developing retina across species
2026-Jan-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.04.697548
PMID:41509457
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研究论文 | 本研究结合多重原位杂交和单细胞转录组数据,构建了发育中视网膜的二维拓扑图,揭示了跨物种的保守轴基程序和精细空间组织差异 | 首次整合原位杂交和scRNA-seq数据进行空间重建,实现跨物种的二维基因表达拓扑映射,为研究发育组织的空间逻辑提供了通用策略 | 研究主要聚焦于脊椎动物视网膜,可能不直接适用于其他组织类型;依赖实验基准进行数据锚定,可能引入技术偏差 | 探究脊椎动物视网膜的区域模式形成和空间组织逻辑,特别是高敏锐度区域(HAA)的发育机制 | 鸡、小鼠和人类的发育中视网膜细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),多重原位杂交 | NA | 单细胞转录组数据,空间基因表达数据 | 涉及鸡、小鼠和人类多个物种的发育中视网膜样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1556 | 2026-01-20 |
Differential molecular signatures in response to CD19-CAR T cell therapy compared with conventional pharmacotherapy in systemic lupus erythematosus
2026-Jan, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2025.06.2132
PMID:40701862
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研究论文 | 本研究比较了CD19-CAR T细胞疗法与传统药物治疗在系统性红斑狼疮患者中诱导的分子特征差异 | 首次在SLE中系统比较了CD19-CAR T细胞疗法与传统药物(利妥昔单抗、贝利木单抗、环磷酰胺)诱导缓解的分子特征差异,揭示了CAR T疗法对补体激活、I型干扰素等关键免疫通路的更强抑制作用 | 样本量较小(CAR T组仅7例),观察时间点有限,主要基于转录组数据,缺乏功能验证 | 比较CD19-CAR T细胞疗法与传统药物治疗在系统性红斑狼疮中诱导的生物学特征和分子改变 | 系统性红斑狼疮患者 | 单细胞组学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序,全血转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 7例接受CD19-CAR T治疗的SLE患者(治疗前后),30例传统药物治疗缓解的SLE患者,31例接受利妥昔单抗/贝利木单抗/环磷酰胺治疗的SLE患者(治疗前及6个月后) | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1557 | 2026-01-20 |
Technology-enabled integration of single-cell transcriptomics and microbiome data identifies RNA-targetable host-microbiota networks in colorectal adenoma
2026-Jan, SLAS technology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.slast.2025.100365
PMID:41241214
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研究论文 | 本研究开发了一个可重复的计算流程,整合单细胞转录组学和微生物组数据,以识别结直肠腺瘤中可被RNA靶向的宿主-微生物网络 | 首次将单细胞RNA测序数据与平行微生物组数据集进行整合分析,并系统性地识别出可用于RNA治疗的靶点,为将转录组学转化为治疗手段提供了可重复的框架 | 研究依赖于公开数据集,可能受到原始实验设计和样本采集差异的影响;统计控制严格(FDR < 0.05)可能遗漏一些微弱的关联 | 识别结直肠腺瘤中可被RNA靶向的宿主-微生物相互作用网络,为开发精准干预措施提供基础 | 结直肠腺瘤患者 | 数字病理学 | 结直肠腺瘤 | 单细胞RNA测序,微生物组分析 | 整合分析流程(包括MaAsLin2、QIIME2/DADA2、Seurat/Harmony) | 单细胞RNA测序数据,微生物组测序数据 | 总计426,425个细胞(来自三个单细胞RNA测序数据集)和975个样本(来自三个平行微生物组数据集) | NA | 单细胞RNA-seq,微生物组测序 | NA | NA |
| 1558 | 2026-01-20 |
Deciphering OCT4A-dose-dependent transcriptional profiles associated with tumorigenic potential in somatic cancer cells
2026-Jan, SLAS technology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.slast.2025.100381
PMID:41352420
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研究论文 | 本研究揭示了转录因子OCT4A在不同蛋白丰度下调控体细胞癌细胞肿瘤发生潜力的下游基因特征 | 首次系统阐明了OCT4A蛋白水平依赖性的功能多效性及其在体细胞癌细胞中调控肿瘤发生潜力的分子特征 | 研究主要基于体外细胞系模型,体内验证和临床转化应用仍需进一步探索 | 揭示OCT4A蛋白丰度依赖性调控体细胞癌细胞肿瘤发生潜力的下游基因网络特征 | 宫颈癌(HeLa)和肝癌(HepG2, Huh7)细胞系及体细胞癌组织 | 肿瘤生物学 | 宫颈癌, 肝癌 | CRISPR-Cas9基因敲除, 多西环素诱导表达系统, 单细胞测序, 空间转录组学, 批量RNA测序, WGCNA, RT-qPCR | 加权基因共表达网络分析(WGCNA), 预后模型 | 单细胞测序数据, 空间转录组数据, 批量RNA测序数据, 生存分析数据 | 三种癌细胞系(HeLa, HepG2, Huh7)及未明确数量的体细胞癌组织样本 | NA | 单细胞测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1559 | 2026-01-20 |
Spatial transcriptomic modeling of vascular remodeling in aortic aneurysm using integrated single-cell RNA sequencing analysis
2026-Jan, SLAS technology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.slast.2025.100377
PMID:41360265
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研究论文 | 本研究开发了一个整合单细胞RNA测序与伪空间转录组推断的计算工作流,以细胞分辨率模拟主动脉瘤中的血管重塑 | 利用公开的单细胞RNA测序数据,通过伪空间转录组推断技术,首次在细胞水平上揭示了主动脉瘤形成过程中血管平滑肌细胞表型调控的空间和转录动态 | 研究基于伪空间推断而非真实的原位空间转录组数据,结果需要免疫组化和真实空间转录组学实验验证 | 探究主动脉瘤形成过程中血管平滑肌细胞表型调控的空间和转录动态 | 正常和高脂饮食小鼠升主动脉中的细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | Seurat, Tangram, Monocle3 | 单细胞RNA测序数据 | 15,698个高质量细胞,来自正常和高脂饮食小鼠的升主动脉 | Broad Institute | 单细胞RNA-seq | SCP1361数据集 | 来自Broad Institute单细胞门户的公开数据集 |
| 1560 | 2026-01-20 |
Sustained diabetes remission induced by FGF1 involves a shift in transcriptionally distinct AgRP neuron subpopulations
2026-Jan, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2025.102300
PMID:41371441
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和空间转录组学技术,揭示了FGF1诱导糖尿病持续缓解的机制,涉及AgRP神经元亚群的转录重编程 | 首次发现FGF1能诱导糖尿病状态下过度活跃的AgRP神经元亚群向野生型样静息状态转变,并揭示了空间定位特异的神经元-胶质细胞互作机制 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类中验证;机制研究主要基于转录组数据,需要进一步功能验证 | 探究FGF1诱导2型糖尿病持续缓解的神经机制 | 野生型和糖尿病(Lep)小鼠的下丘脑AgRP神经元 | 单细胞组学 | 2型糖尿病 | 单核RNA测序,空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据 | 野生型和糖尿病小鼠在注射后第5天和第14天的下丘脑样本 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |