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当前共找到 2200 篇文献,本页显示第 1521 - 1540 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1521 2026-02-26
Integrative Multi-Omics Identifies S100A4 as a Translational Hub Linking Environmental Bis(2-Ethylhexyl) Phthalate (DEHP) Exposure to Glioblastoma Risk
2026, Mediators of inflammation IF:4.4Q2
研究论文 本研究通过整合多组学计算框架,揭示了环境污染物DEHP通过S100A4蛋白及脂质代谢轴影响胶质母细胞瘤风险的潜在机制 首次整合网络毒理学、单细胞转录组学、全蛋白质组/代谢组孟德尔随机化及分子动力学模拟,系统性地将环境毒物DEHP暴露与胶质母细胞瘤风险联系起来,并识别出S100A4作为关键翻译枢纽 所提出的机制联系仍为推断性,需要未来体外和体内实验直接验证DEHP对S100A4表达、功能及下游代谢重编程的影响 系统研究环境污染物DEHP与胶质母细胞瘤风险之间的相互作用机制 胶质母细胞瘤(GBM)、环境污染物双(2-乙基己基)邻苯二甲酸酯(DEHP) 计算生物学、生物信息学 胶质母细胞瘤 网络毒理学、单细胞转录组学、孟德尔随机化、分子动力学模拟 蛋白质-蛋白质相互作用网络分析、分子对接、分子动力学模拟 基因组、转录组、蛋白质组、代谢组数据 来自TCGA、GTEx、GEO等11个独立队列的数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1522 2026-02-22
stGCL: a versatile cross-modality fusion method based on multi-modal graph contrastive learning for spatial transcriptomics
2026-Jan-28, Genome biology IF:10.1Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
1523 2026-02-24
SLC25A37 as a novel therapeutic target for benign prostatic hyperplasia: integrative analyses of single-cell RNA sequencing and genome-wide association studies
2026-Jan, Open medicine (Warsaw, Poland)
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序和全基因组关联分析,鉴定出SLC25A37是良性前列腺增生(BPH)的一个新型致病基因,并探索了其作为治疗靶点的潜力 首次将单细胞RNA测序与全基因组关联研究相结合,在BPH的经典单核细胞中鉴定出SLC25A37这一新的致病基因,并探索了靶向该基因的潜在治疗药物 未明确说明样本的具体数量,且体外实验验证可能不足以完全代表体内复杂的病理生理环境 识别良性前列腺增生(BPH)的致病基因并探索潜在的治疗靶点 良性前列腺增生(BPH)患者与健康对照者的前列腺组织 数字病理学 前列腺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq),全基因组关联研究(GWAS),孟德尔随机化(MR),贝叶斯共定位,分子对接,流式细胞术,qRT-PCR,蛋白质印迹,免疫组织化学,免疫荧光染色 NA 单细胞RNA测序数据,基因组关联数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1524 2026-02-24
Multi-scale systems toxicology defines a KLF5-centered adverse outcome pathway linking DEHP exposure to pancreatic cancer progression and signaling programs relevant to therapy tolerance
2026, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1
研究论文 本研究通过多尺度系统毒理学框架,揭示了DEHP暴露通过KLF5中心的不良结局通路促进胰腺癌进展的机制 整合了异质集成机器学习、孟德尔随机化、分子对接与动力学、单细胞转录组学等多种方法,首次提出KLF5为中心的DEHP-PDAC关联通路 研究结果主要为假设生成性质,需要进一步实验验证 阐明DEHP暴露与胰腺癌进展之间的分子机制和不良结局通路 胰腺导管腺癌(PDAC)相关基因、KLF5蛋白、PANC-1细胞系 系统毒理学 胰腺癌 单细胞转录组学、分子对接、分子动力学模拟、孟德尔随机化 TabPFN增强集成模型、异质集成机器学习 基因表达数据、单细胞RNA-seq数据、分子结构数据 未明确说明具体样本数量 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1525 2026-02-24
Multi-omics comprehensive analysis identified KIF22 and KRAS as highly synthetic lethal pairs for triple-negative breast cancer
2026, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
研究论文 本研究通过多组学分析识别出KIF22和KRAS作为三阴性乳腺癌的合成致死基因对 首次通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和批量RNA测序等多组学数据,结合机器学习方法,系统性地鉴定出三阴性乳腺癌中具有高合成致死活性的新型细胞亚型,并实验验证了KIF22和KRAS作为合成致死基因对的功能 研究主要基于生物信息学分析和体外体内实验验证,临床转化潜力尚需进一步临床试验评估 探索三阴性乳腺癌的异质性,识别与疾病进展相关的合成致死基因对,为靶向治疗提供新策略 三阴性乳腺癌细胞及其微环境细胞亚群 生物信息学 三阴性乳腺癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 随机森林, 机器学习 RNA测序数据 未明确指定具体样本数量 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq NA NA
1526 2026-02-24
ESRP1 drives epithelial-mesenchymal transition by activating EPAC-RAP1A signaling axis
2026, Frontiers in medicine IF:3.1Q1
研究论文 本研究揭示了ESRP1通过激活EPAC-RAP1A信号轴驱动上皮-间质转化,从而促进特发性肺纤维化进展 首次在单细胞水平上识别ESRP1作为EMT的关键上游调控因子,并阐明其通过EPAC-RAP1A轴的新机制 研究主要基于小鼠模型和细胞系,人类样本验证不足,且未探讨其他潜在信号通路 探究特发性肺纤维化中上皮-间质转化的分子机制 小鼠肺组织、原代肺泡上皮细胞、MLE-12肺泡上皮细胞系 单细胞转录组学 特发性肺纤维化 单细胞RNA测序、qPCR、Western blot、免疫荧光、Co-IP NA 单细胞转录组数据、基因表达数据、蛋白质互作数据 未明确样本数量,包括BLM处理的小鼠模型和细胞培养实验 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1527 2026-02-23
An integrated single-cell lung cancer atlas reveals distinct fibroblast phenotypes between adenocarcinoma and squamous cell carcinomas
2026-Jan-23, NPJ precision oncology IF:6.8Q1
研究论文 本研究通过整合公共可用的单细胞RNA测序数据,构建了一个非小细胞肺癌的综合图谱,揭示了肺腺癌和肺鳞状细胞癌之间肿瘤微环境异质性、细胞组成以及癌症相关成纤维细胞亚型的显著差异 首次通过整合大规模公共单细胞RNA测序数据,系统比较了肺腺癌和肺鳞状细胞癌中肿瘤微环境的异质性,并明确了两种亚型中占主导地位的癌症相关成纤维细胞亚型及其与预后的不同关联 研究依赖于公共数据集,可能存在批次效应;研究结果主要基于转录组数据,缺乏蛋白质水平验证;共培养实验在体外进行,可能无法完全模拟体内复杂的肿瘤微环境 探究非小细胞肺癌中肺腺癌和肺鳞状细胞癌之间肿瘤微环境,特别是癌症相关成纤维细胞亚型的差异及其与预后的关系 非小细胞肺癌患者肿瘤组织中的细胞,特别是癌症相关成纤维细胞 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 整合了公共可用的大规模单细胞RNA测序数据集(具体样本数量未在摘要中明确给出) NA 单细胞RNA-seq NA NA
1528 2026-02-23
Expression Atlas in 2026: enabling FAIR and open expression data through community collaboration and integration
2026-Jan-06, Nucleic acids research IF:16.6Q1
研究论文 本文介绍了Expression Atlas知识库在2026年的更新,包括内容扩展、功能增强和社区协作,以支持FAIR原则下的基因和蛋白质表达数据 新增了批量基线实验的标记基因分析模块,整合了单细胞RNA-seq数据集如Tabula Sapiens和GTEx单核图谱,并计划提供AI就绪数据格式 未明确提及具体的技术或数据局限性,主要关注资源更新和未来方向 通过社区协作和集成,实现FAIR和开放的表达数据,支持基础和转化研究 基因和蛋白质表达数据,涵盖组织、细胞类型、条件和多种物种 生物信息学 NA 单细胞RNA-seq,蛋白质组学 NA 基因表达数据,蛋白质表达数据 超过4500项研究,涉及67个物种,包括数百个单细胞RNA-seq实验 NA 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq NA NA
1529 2026-02-22
The clinical significance of the Mediterranean fever gene MEFV variants in Castleman disease
2026-Jan-29, Communications medicine IF:5.4Q1
研究论文 本研究探讨了地中海热基因MEFV变异在Castleman病(CD)中的临床意义,特别是在iMCD-TAFRO亚型中的作用 首次在较大队列中揭示MEFV变异在CD中的高流行率,并通过体外实验和单细胞RNA测序阐明了MEFV表达与IL-6通路激活的关联 样本量较小(37例患者),且为回顾性研究,可能限制结果的普遍性 阐明MEFV基因变异在Castleman病发病机制中的作用,特别是对iMCD-TAFRO亚型的影响 Castleman病患者(包括iMCD-TAFRO亚型)及其血液/淋巴结活检样本 单细胞组学 Castleman病 全外显子测序, 单细胞RNA测序, 定量PCR, Luminex细胞因子检测 NA 基因组数据, 转录组数据, 临床数据 37例CD患者,包括一名青少年TAFRO患者及其无症状父母和健康对照 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1530 2026-02-22
Machine learning identifies disulfidptosis-related gene signature for pancreatic cancer prognosis and immune infiltration
2026-Jan-27, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过生物信息学和单细胞分析,探索了与胰腺癌预后和免疫浸润相关的二硫死亡相关基因特征 首次将新型细胞死亡方式——二硫死亡相关基因特征应用于胰腺癌预后模型的构建,并结合单细胞RNA测序揭示了关键基因在肿瘤微环境中的表达模式 外部验证集的模型性能中等(C-index=0.6),表明模型有待进一步优化 识别胰腺癌的预后生物标志物和免疫浸润模式 胰腺癌患者 机器学习 胰腺癌 单细胞RNA测序,生物信息学分析 随机生存森林,StepCox 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1531 2026-02-22
Exploring the key molecular mechanisms and immune microenvironment of oxidative stress-related pathways in pancreatic neuroendocrine tumor combining scRNA-seq and bulk RNA
2026-Jan-27, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,系统探索了氧化应激相关通路在胰腺神经内分泌肿瘤中的关键分子机制和免疫微环境 首次结合单细胞和批量RNA测序数据,系统阐明氧化应激通路通过BCL2L1和PHGDH等关键基因调控pNET进展的分子机制和免疫微环境相互作用 研究主要基于公共数据集的分析,缺乏实验验证;单细胞数据样本量相对有限(20个样本) 阐明氧化应激相关通路如何驱动胰腺神经内分泌肿瘤进展的分子机制及其与肿瘤微环境的相互作用 胰腺神经内分泌肿瘤(pNET)样本 生物信息学 胰腺神经内分泌肿瘤 scRNA-seq, bulk RNA-seq, 差异表达分析, WGCNA, GO/KEGG富集分析, PPI网络, CIBERSORTx免疫浸润分析, ceRNA网络构建, 转录因子预测, 药物预测, 分子对接 加权基因共表达网络分析(WGCNA), 蛋白质-蛋白质相互作用网络, 预后列线图模型, ROC分析 基因表达数据(RNA-seq) 批量RNA-seq数据集GSE73338包含63个pNET样本和5个对照样本;单细胞RNA-seq数据集GSE256136包含20个样本 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
1532 2026-02-22
KIF5B-driven unfolded protein response reprograms breast cancer immunosuppressive microenvironment for single-cell guided therapeutic targeting
2026-Jan-26, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞和bulk RNA-seq数据,揭示了KIF5B在乳腺癌中作为预后生物标志物和治疗靶点的作用,并探讨了其对肿瘤免疫微环境的影响 首次通过多模态数据分析,将KIF5B与未折叠蛋白反应、免疫浸润和药物敏感性联系起来,为乳腺癌的精准治疗提供了新见解 研究主要基于生物信息学分析,缺乏实验验证;数据来源于多个数据集,可能存在批次效应 探究KIF5B在乳腺癌预后、肿瘤微环境和治疗反应中的综合作用 乳腺癌患者及其肿瘤微环境 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 hdWGCNA, 共识聚类 RNA-seq数据 多个数据集的样本,具体数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
1533 2026-02-22
Intermittent fasting inhibits Tp53-driven glioma through gut microbiota-mediated methionine-m6A regulation
2026-Jan-20, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究揭示了间歇性禁食(IF)通过肠道菌群介导的甲硫氨酸-m6A调控途径抑制Tp53驱动型胶质瘤的分子机制 首次发现IF的抗肿瘤效果与胶质母细胞瘤(GBM)亚型(Tp53型 vs CDKN2A型)相关,并通过多组学技术系统阐明了肠道菌群-甲硫氨酸-m6A修饰-TGF-β信号轴在其中的作用机制 研究主要基于小鼠模型,人体临床验证尚需开展;对CDKN2A亚型GBM中IF效果不显著的机制未深入探讨 探究间歇性禁食抑制胶质母细胞瘤的亚型特异性机制 Tp53驱动型和Cdkn2a驱动型胶质母细胞瘤小鼠模型 肿瘤生物学 胶质母细胞瘤 多组学测序(空间转录组、空间代谢组、单细胞转录组、单细胞RNA甲基化、代谢组、微生物组) 小鼠肿瘤模型 多组学数据 未明确说明 NA 空间转录组学, 空间代谢组学, 单细胞转录组学, 单细胞RNA甲基化, 代谢组学, 微生物组学 NA NA
1534 2026-02-22
Biologically interpretable deep learning-derived MRI phenotypes reveal lymph node involvement and neoadjuvant therapy response in intrahepatic cholangiocarcinoma
2026-Jan-12, Hepatology (Baltimore, Md.)
研究论文 本研究开发了一个名为SwinU-CliRad的深度学习模型,用于对肝内胆管癌的淋巴结受累风险进行分层,并评估其对新辅助治疗反应的预测能力 整合了基于Swin UNETR的MRI衍生输出与临床放射学特征,构建了可解释的深度学习模型,并探索了模型输出与肿瘤多组学特征的相关性 研究涉及多个队列,但外部验证队列样本量相对较小(n=88),且模型性能仍需在更广泛的多中心数据中进一步验证 开发一个模型以改进肝内胆管癌的淋巴结受累分层,并为治疗决策提供信息 肝内胆管癌患者 计算机视觉 肝内胆管癌 单细胞RNA测序,多组学分析 Swin UNETR,SwinU-CliRad框架 磁共振成像,临床放射学特征 发现队列682例,内部测试队列204例,外部多中心队列88例,新辅助治疗队列145例 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1535 2026-02-21
Applications of Spatial Transcriptomics in Ischemic Stroke Research
2026-Jan-31, The American journal of pathology
综述 本文综述了空间转录组学在缺血性卒中研究中的应用,重点探讨了胶质细胞在卒中病理生物学中的复杂作用 通过结合空间转录组学与单细胞及多组学方法,识别了新的治疗靶点,如不同激活状态的胶质细胞及其关键信号通路 当前研究仍面临挑战,包括需要多时间点分析、三维重建和标准化数据集以推动临床应用 探讨空间转录组学如何促进对卒中后细胞变化的理解,并推动卒中研究与治疗 缺血性卒中后的脑组织,特别是小胶质细胞、星形胶质细胞和少突胶质细胞 数字病理学 缺血性卒中 空间转录组学,单细胞多组学 NA 空间基因表达数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
1536 2026-02-21
HMGB1 affects the progression of neurofibromatosis type 1-associated malignant peripheral nerve sheath tumors through E2F2
2026-Jan-24, Cancer cell international IF:5.3Q1
研究论文 本研究揭示了HMGB1通过直接转录激活E2F2,驱动神经纤维瘤病1型相关恶性外周神经鞘瘤的细胞周期进程和肿瘤恶性进展 首次在单细胞水平上整合分析NF1-MPNST和PNF组织,阐明了HMGB1通过直接结合并激活E2F2转录来驱动肿瘤进展的新机制 研究主要基于患者来源的组织和细胞系,体内模型为异种移植小鼠模型,未来需要在更接近人类肿瘤微环境的基因工程小鼠模型中进一步验证 探究HMGB1在神经纤维瘤病1型相关恶性外周神经鞘瘤进展中的功能作用和分子机制 患者来源的NF1-MPNST和丛状神经纤维瘤组织、NF1细胞系、异种移植小鼠模型 肿瘤生物学 恶性外周神经鞘瘤 单细胞RNA测序、bulk RNA-seq、CUT&Tag、ChIP-qPCR、qPCR、Western blot NA RNA测序数据、蛋白质印迹数据、染色质免疫沉淀数据 患者来源的NF1-MPNST和PNF组织(具体数量未在摘要中明确说明) NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
1537 2026-02-21
The Camellia sinensis var. sinensis cv. Fuding Dabaicha genome unveils structural variation-driven metabolic innovation
2026-Jan-14, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞测序结合PacBio HiFi和ONT超长测序技术,构建了福鼎大白茶的高质量单倍型基因组,揭示了结构变异如何驱动茶叶代谢多样性 首次利用单细胞测序技术对茶叶精子细胞进行测序,结合长读长测序实现高精度单倍型基因组组装,并建立了基于半同胞的QTL定位平台 研究主要聚焦于福鼎大白茶品种,其他茶叶品种的基因组变异和代谢多样性可能未被全面覆盖 探究茶叶基因组结构变异与代谢多样性之间的关联 福鼎大白茶(Camellia sinensis var. sinensis cv. Fuding Dabaicha)的基因组和代谢产物 基因组学 NA 单细胞测序, PacBio HiFi测序, ONT超长测序 NA 基因组序列数据, 代谢组数据 107个精子细胞 PacBio, Oxford Nanopore Technologies 单细胞测序, 长读长测序 PacBio HiFi, ONT PacBio HiFi测序和ONT超长测序技术
1538 2026-02-21
Scar-associated macrophages and biliary epithelial cells interaction exacerbates hepatic fibrosis in biliary atresia
2026-Jan, Pediatric research IF:3.1Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和空间定位数据,揭示了胆道闭锁中疤痕相关巨噬细胞与胆道上皮细胞相互作用加剧肝纤维化的机制 首次结合单细胞和空间转录组技术,系统解析了胆道闭锁肝脏微环境异质性,并识别出促进纤维化的关键细胞互作及诊断标志物 样本量较小(仅8例组织),且缺乏长期随访数据验证治疗靶点的临床转化潜力 探究胆道闭锁肝纤维化的微环境机制并开发诊断模型 人类肝脏组织(包括正常组织、胆总管囊肿组织和胆道闭锁组织) 数字病理学 胆道闭锁 单细胞RNA测序(scRNA-seq),空间转录组学 诊断模型(基于基因特征) 单细胞转录组数据,空间定位数据 8例组织(2例正常邻近组织,2例胆总管囊肿组织,4例胆道闭锁组织) NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
1539 2026-02-21
Identifying potential therapeutic targets in periodontitis: a multi-omics approach integrating bulk and single-cell RNA sequencing with Mendelian randomization
2026-Jan, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
研究论文 本研究通过整合孟德尔随机化、单细胞RNA测序和转录组学分析,识别了与牙周炎相关的关键基因特征 采用多组学方法结合孟德尔随机化、单细胞RNA测序和转录组学分析,识别了牙周炎相关的关键基因,并发现了四个枢纽基因 研究依赖于GEO数据库的公开数据集,样本来源和数量可能有限,且未进行实验验证 识别牙周炎的潜在治疗靶点 牙周炎相关的基因表达数据 自然语言处理 牙周炎 单细胞RNA测序, 转录组学分析, 孟德尔随机化 LASSO, 随机森林 RNA测序数据 三个独立数据集(具体数量未明确) NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
1540 2026-02-21
Multi-omics genetic study revealing ferroptosis regulator CTSB driving prostate cancer progression by modulating the immune microenvironment
2026-Jan, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
研究论文 本研究利用多组学孟德尔随机化方法,揭示了铁死亡调控因子CTSB通过调节免疫微环境驱动前列腺癌进展的因果作用机制 首次提供了铁死亡-免疫相互作用在前列腺癌中因果作用的证据,并识别CTSB为关键风险因子 研究主要基于遗传学关联分析,需要进一步的实验验证来阐明具体的分子机制 探究铁死亡基因/蛋白表达与前列腺癌之间的遗传因果关系及免疫微环境的中介作用 前列腺癌 生物信息学 前列腺癌 多组学孟德尔随机化,单细胞RNA测序,基因集富集分析,免疫浸润分析 孟德尔随机化模型 基因组,转录组,蛋白组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
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