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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1501 2026-03-01
Multimodal single-cell protein and RNA profiling unveils dysregulated immature neutrophil dynamics in gestational diabetes mellitus
2026-Jan-07, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 本研究通过多模态单细胞蛋白质和RNA分析,揭示了妊娠期糖尿病中未成熟中性粒细胞动态的失调 首次结合InfinityFlow表面标记分析和单细胞RNA测序,在妊娠期糖尿病中识别出低密度未成熟中性粒细胞亚群及其与胰岛素敏感性的关联 研究样本量有限,且未深入探讨未成熟中性粒细胞功能机制 探究妊娠期糖尿病中中性粒细胞的异质性及其与疾病的关系 健康孕妇和妊娠期糖尿病孕妇的外周血中性粒细胞 数字病理学 妊娠期糖尿病 InfinityFlow表面标记分析, 单细胞RNA测序 NA 蛋白质表达数据, RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
1502 2026-03-01
Extracellular Matrix-Associated Biomarkers for Hepatocellular Carcinoma: Insights From Machine Learning and Single-Cell Analysis
2026, International journal of genomics IF:2.6Q2
研究论文 本研究通过整合组学数据和机器学习,识别了肝细胞癌中与细胞外基质相关的关键生物标志物,并利用单细胞RNA测序验证了其表达模式 结合系统生物学框架、机器学习与单细胞分析,首次识别出八个上调的ECM相关基因作为诊断生物标志物,并揭示了它们在单细胞水平上的表达特异性 研究主要基于公共数据库(如TCGA)的数据,可能需要进一步实验验证这些生物标志物的功能机制和临床适用性 识别肝细胞癌中与细胞外基质相关的生物标志物,以改善早期检测、预后评估和治疗靶向 肝细胞癌患者的基因表达和调控网络 机器学习 肝细胞癌 单细胞RNA测序 机器学习 基因表达数据 基于TCGA、GSE104310和GSE144269数据集,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1503 2026-03-01
Machine learning and single-cell RNA sequencing analyses identify MS-related monocytes and a five-gene candidate biomarker signature
2026, Frontiers in neurology IF:2.7Q3
研究论文 本研究结合机器学习与单细胞RNA测序分析,识别了与多发性硬化相关的单核细胞及一个五基因候选生物标志物签名 首次整合机器学习算法与单细胞RNA测序数据,系统性识别并验证了五个关键基因作为多发性硬化的候选生物标志物 研究主要基于实验性自身免疫性脑脊髓炎模型数据,临床样本验证有限 识别与多发性硬化相关的单核细胞生物标志物,以改善疾病诊断和风险分层 多发性硬化相关的单核细胞及基因表达 机器学习 多发性硬化 单细胞RNA测序, qRT-PCR, 免疫荧光 逻辑回归, LDA, SVM, 朴素贝叶斯, KNN, Rpart, 随机森林 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1504 2026-02-28
Differentiation in the human urothelia is defined by distinct alternative polyadenylation
2026-Jan-27, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本研究揭示了在人类输尿管尿路上皮分化过程中,选择性多聚腺苷酸化(APA)作为转录组多样性的主要来源,独立于mRNA水平变化 首次在人类尿路上皮分化中系统性地将APA与细胞状态特异性转录组多样性联系起来,并通过单细胞成像和报告基因实验验证了APA对蛋白质表达的空间特异性调控 研究主要基于单细胞RNA测序数据,可能未完全捕捉到所有APA事件的动态变化,且机制研究仍处于初步阶段 探究人类尿路上皮分化过程中转录组多样性的产生机制 人类输尿管尿路上皮细胞,包括基底祖细胞、中间细胞和终末分化的伞状细胞 自然语言处理 NA 单细胞RNA测序,单细胞成像,报告基因实验 NA 单细胞RNA测序数据,图像数据 13,544个尿路上皮细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1505 2026-02-28
Histone demethylase KDM7A negatively regulates fibrotic macrophage polarization and lung fibrosis progression
2026-Jan-23, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 本研究揭示了组蛋白去甲基化酶KDM7A通过调控TLR8表达来抑制促纤维化巨噬细胞极化,从而限制肺纤维化进展的表观遗传机制 首次发现KDM7A-TLR8轴作为抑制促纤维化巨噬细胞极化的关键表观遗传调控通路,并揭示其表达随年龄下降与临床风险模式的关联 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类样本验证相对有限;性别差异的机制尚未完全阐明 探究表观遗传机制在调控巨噬细胞极化及肺纤维化进展中的作用 Kdm7a基因敲除小鼠、肺纤维化患者肺组织、巨噬细胞体外培养体系 表观遗传学 肺纤维化 单细胞RNA测序、巨噬细胞功能实验、表观遗传分析 基因敲除小鼠模型 单细胞转录组数据、组织样本数据 基因敲除小鼠模型及肺纤维化患者组织样本(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
1506 2026-02-28
Single-cell transcriptome analysis reveals critical causative candidates for Down syndrome-related lung diseases
2026-Jan, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
研究论文 本研究通过单细胞转录组分析揭示了唐氏综合征相关肺部疾病的关键致病候选因素 利用Dp16小鼠模型结合单细胞RNA测序技术,首次系统性地探索了染色体21三体对肺部疾病的影响,并发现了APP相关相互作用增强、MHC-II信号上调等新机制 研究主要基于小鼠模型,结果在人类中的直接适用性需进一步验证;样本量相对有限 探究唐氏综合征相关肺部疾病的致病机制 Dp16小鼠模型的肺部细胞 数字病理学 肺部疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 Dp16小鼠模型(雄性和雌性)的肺部细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1507 2026-02-28
Fibroblast-driven MMP-9/TIMP-1 imbalance in bronchoalveolar lavage reflects fibrotic progression in interstitial lung disease
2026-Jan, European journal of clinical investigation IF:4.4Q2
研究论文 本研究评估了间质性肺疾病患者支气管肺泡灌洗液中MMP-9/TIMP-1比值与纤维化严重程度的关系,并确定了成纤维细胞/肌成纤维细胞是导致该失衡的主要细胞来源 首次在人类ILD患者中系统评估BAL液中MMP-9/TIMP-1比值与纤维化进展的关联,并结合原代细胞培养和单细胞RNA测序数据分析,明确了成纤维细胞是驱动该失衡的关键细胞类型 样本量较小(48例),为单中心研究,需要更大规模的多中心研究进行验证 阐明MMP-9/TIMP-1平衡在间质性肺疾病纤维化进展中的作用,并探索其作为生物标志物的潜力 间质性肺疾病患者(包括非纤维化ILD、纤维化ILD和特发性肺纤维化患者)的支气管肺泡灌洗液样本及从中分离的成纤维细胞/肌成纤维细胞 NA 间质性肺疾病 酶联免疫吸附试验、明胶酶谱法、免疫荧光、单细胞RNA测序数据分析 NA 蛋白质浓度数据、酶活性数据、免疫荧光图像、单细胞RNA测序数据 48例连续入组的ILD患者 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1508 2026-02-28
Microglial heterogeneity: influence of human 2D, 3D, and co-culture models on gene expression and immune function
2026, Frontiers in cellular neuroscience IF:4.2Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析了人类单核细胞来源的小胶质细胞在不同培养模型(2D、3D单培养及3D神经胶质共培养)中的基因表达和免疫功能异质性 首次系统比较了不同培养维度(2D vs 3D)和细胞环境(单培养 vs 共培养)对人类小胶质细胞状态组成的影响,揭示了培养架构对小胶质细胞身份和免疫反应性的决定性作用 研究基于体外培养模型,可能无法完全模拟体内复杂的微环境;样本来源和培养条件的具体细节未明确说明 探究培养模型的维度(2D/3D)和细胞环境对小胶质细胞状态异质性和功能的影响 人类单核细胞来源的小胶质细胞(MDMi) 单细胞组学 神经免疫疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 伪时间分析 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1509 2026-02-27
Peroxiredoxin 1 mediates bleomycin-induced acute lung injury in mice via macrophage NOD1/NF-κB axis
2026-Jan-30, Respiratory research IF:4.7Q1
研究论文 本研究揭示了过氧化物还原酶1(Prdx1)通过激活巨噬细胞中的NOD1/NF-κB信号通路,在博来霉素诱导的急性肺损伤中起关键作用 首次发现Prdx1作为损伤相关分子模式在博来霉素诱导的急性肺损伤中的作用机制,并证实其通过巨噬细胞NOD1/NF-κB轴介导炎症反应 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体中验证;Prdx1中和抗体的临床应用潜力需进一步评估 探究Prdx1在博来霉素诱导的急性肺损伤中的作用机制,寻找潜在治疗靶点 小鼠(包括Prdx1基因敲除小鼠) 病理生理学 急性肺损伤 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
1510 2026-02-27
Granzyme A-producing type 1 innate lymphoid cells promote salivary secretion in the aged submandibular gland
2026-Jan-29, Inflammation and regeneration IF:5.0Q1
研究论文 本文探讨了衰老过程中颌下腺唾液分泌的维持机制,发现GZMA+ ILC1细胞通过GZMA-Pard3轴促进上皮细胞功能 首次揭示了GZMA+ ILC1细胞在衰老颌下腺中通过GZMA-Pard3轴维持唾液分泌的新机制 研究主要基于小鼠模型,人类相关性需进一步验证;机制细节如GZMA-Pard3轴的具体作用途径仍需深入探究 探究衰老过程中唾液腺分泌功能维持的细胞机制 小鼠颌下腺组织、淋巴细胞簇、上皮细胞 单细胞生物学 老年疾病 单细胞RNA测序、显微切割、共培养系统、体内耗竭实验 NA 单细胞转录组数据、组织学图像 按衰老阶段分层的小鼠群体 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1511 2026-02-27
Translating spatial transcriptomic signatures in adenosquamous carcinoma into bulk prognostic biomarkers in lung adenocarcinoma: a bottom-up approach
2026-Jan-23, NPJ precision oncology IF:6.8Q1
研究论文 本研究通过空间转录组学分析肺腺鳞癌,识别出TTF-1/p40阴性肿瘤细胞群,并将其基因特征转化为肺腺癌的预后生物标志物 开发了一种自下而上的生物标志物发现策略,利用空间转录组学从腺鳞癌中识别罕见肿瘤状态,并成功将其转化为适用于肺腺癌的批量预后分层工具 研究主要基于肺腺鳞癌模型,其发现向肺腺癌的转化需进一步验证,且样本量可能有限 将空间转录组学定义的罕见肿瘤状态转化为临床相关的预后生物标志物 肺腺鳞癌和肺腺癌患者样本 数字病理学 肺癌 空间转录组学、免疫组化 RGB-UMAP 空间转录组数据、批量转录组数据、图像数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
1512 2026-02-27
Biomarkers Informed by Single-Cell and Spatial Transcriptomics-Biomarkers for Grade 3 Follicular Lymphoma
2026-Jan-09, Modern pathology : an official journal of the United States and Canadian Academy of Pathology, Inc IF:7.1Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞和空间转录组学数据,识别并验证了AID、CXCR4、CD71和Ki67作为滤泡性淋巴瘤3级的客观生物标志物,以改进风险分层 首次利用单细胞和空间转录组学数据识别滤泡性淋巴瘤3级的客观生物标志物,并验证其预后价值,提高了分级的可重复性 研究样本量有限(59例),且需在统一治疗的队列中进行进一步的临床验证 识别客观的生物标志物以改进滤泡性淋巴瘤的预后分层 正常生发中心和滤泡性淋巴瘤样本 数字病理学 滤泡性淋巴瘤 单细胞RNA测序,空间转录组学,免疫组织化学 NA 转录组数据,图像数据 59例滤泡性淋巴瘤标本(42例1-2级,17例3级)及扁桃体样本 NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
1513 2026-02-26
DNAJB6 as an immuno-oncogenic hub in liver hepatocellular carcinoma: multi-omic profiling reveals prognostic significance and therapeutic vulnerability
2026-Jan-21, Journal of molecular histology IF:2.9Q3
研究论文 本研究通过整合多组学数据,揭示了DNAJB6在肝细胞癌中的上调及其与不良预后和免疫反应的关联,并验证了其作为独立预后因子和治疗靶点的潜力 首次系统性地将DNAJB6与肝细胞癌的预后、免疫微环境(特别是髓源性抑制细胞和耗竭CD8 T细胞)及吉非替尼耐药性联系起来,并通过实验验证了其功能 研究主要基于细胞系实验和生物信息学分析,缺乏体内动物模型验证,且临床样本量可能有限,需进一步扩大验证 探索DNAJB6在肝细胞癌中的表达、预后价值、免疫关联及作为治疗靶点的潜力 肝细胞癌患者数据、HepG2细胞系、肝肿瘤组织样本 生物信息学与癌症研究 肝细胞癌 多组学数据分析、免疫组化、Western blot、siRNA干扰、细胞增殖迁移实验、凋亡检测 NA 多组学数据、图像数据、蛋白质数据、细胞实验数据 未明确指定样本数量,涉及肝细胞癌患者数据、HepG2细胞系和肝肿瘤组织 NA 单细胞测序 NA NA
1514 2026-02-26
DWGCN: distance-weighted graph convolutional network for robust spatial domain identification in spatial transcriptomics
2026, Frontiers in genetics IF:2.8Q2
研究论文 本文提出了一种距离加权图卷积网络(DWGCN),用于改进空间转录组学中的空间域识别,通过逆距离加权和点归一化增强局部敏感聚合 DWGCN创新性地用逆距离加权和点归一化替代了传统均匀邻居分配,增强了局部敏感聚合,保留了自环优势,从而恢复空间图中的距离感知结构 NA 改进空间转录组学中的空间域识别,以更精确地描绘组织边界 空间转录组学数据中的空间域 空间转录组学 NA 空间转录组学 图卷积网络(GCN) 空间转录组学数据 四个真实和四个模拟空间转录组学数据集 NA 空间转录组学 NA NA
1515 2026-02-26
From polygenic risk to digital twins: the future of personalised cardiovascular medicine
2026, Frontiers in cardiovascular medicine IF:2.8Q2
综述 本文综述了个性化心血管医学在基因组学、多组学、数字技术和治疗领域的进展,并讨论了转化差距及伦理与实施挑战 整合多组学平台、人工智能及新兴技术(如CRISPR基因编辑、单细胞测序和数字孪生模型),推动心血管医学从通用策略转向个性化主动预防与治疗 实际应用受限于监管不确定性、数据整合挑战、成本问题以及公平性和可及性担忧 探讨精准心脏病学如何利用基因组、分子和计算创新实现个体化心血管疾病护理 心血管疾病(CVD)的个性化预防、诊断和治疗策略 机器学习 心血管疾病 多组学平台(转录组学、蛋白质组学、代谢组学)、人工智能、机器学习、CRISPR基因编辑、单细胞测序、数字孪生建模 数字孪生模型 基因组数据、多组学数据、心血管影像、电子健康记录、可穿戴设备数据 NA NA 单细胞测序 NA NA
1516 2026-02-26
Correction: Single-cell transcriptome analysis profiles cellular dynamics and transcriptional changes in diabetic wound tissues following ESWT treatment
2026, Frontiers in physiology IF:3.2Q2
correction 本文是对一篇关于单细胞转录组分析在糖尿病伤口组织中ESWT治疗后细胞动态和转录变化研究的文章的更正 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
1517 2026-02-26
Divergent CD45+ immune landscapes shape the lung tumor microenvironment
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了两种不同肺癌模型中CD45+免疫细胞的组成、转录程序、代谢状态和细胞间通讯网络的差异 首次在单细胞分辨率下比较了两种不同基因型(LLC1和KrasLA2)肺癌模型中CD45+免疫细胞的免疫景观差异,并识别了基因型特异性的免疫脆弱性 研究仅基于小鼠模型,结果在人类肺癌中的适用性有待验证;样本量相对有限 阐明CD45+免疫细胞在肺癌肿瘤微环境中的异质性作用及其对肿瘤生物学的影响 来自健康肺、LLC1原位肿瘤和KrasLA2基因工程肿瘤的CD45+免疫细胞 单细胞组学 肺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 来自三种条件(健康肺、LLC1肿瘤、KrasLA2肿瘤)的CD45+免疫细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1518 2026-02-26
Integrated single-cell and spatial transcriptomics reveal the differentiation drivers of gastric epithelial lineage progression
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究整合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,揭示了胃癌发展过程中胃上皮谱系分化的驱动因素,特别是UPP1在连接幽门螺杆菌驱动的炎症与WNT介导的分化中的关键作用 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学,系统描绘了从慢性胃炎到肠化生再到胃癌的谱系进展,并识别出UPP1作为上皮重编程和肠化生的关键调节因子 研究样本可能有限,且机制验证主要在细胞系和类器官中进行,需进一步在体内模型中确认 阐明胃癌发展过程中分子介导因子,特别是炎症与恶性转化之间的关联 胃黏膜样本,包括萎缩性胃炎、肠化生和胃癌病例,涵盖幽门螺杆菌阳性和阴性情况 数字病理学 胃癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA RNA测序数据, 空间转录组数据 来自萎缩性胃炎、肠化生和胃癌的胃黏膜样本,包括幽门螺杆菌阳性和阴性病例 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
1519 2026-02-26
Identification of Monocyte CD11c as a Potential Biomarker for Distinguishing Sepsis From Non-Infectious Inflammation and Predicting the Outcome of Sepsis
2026, Journal of inflammation research IF:4.2Q2
研究论文 本研究探讨了单核细胞CD11c作为区分脓毒症与非感染性炎症及预测脓毒症预后的潜在生物标志物 首次通过CyTOF、单细胞RNA测序和流式细胞术多技术结合,验证了mCD11c在脓毒症诊断和预后中的优越性能,其AUC值(0.939)显著优于传统标志物 研究为单中心观察性队列,样本量有限,需更大规模的多中心研究验证结果并探索干预潜力 评估mCD11c作为脓毒症诊断和预后生物标志物的有效性 脓毒症患者、轻度感染患者、心血管手术后患者、康复脓毒症患者及健康对照者 数字病理学 脓毒症 CyTOF, 单细胞RNA测序, 流式细胞术 NA 外周血样本 发现队列和验证队列(具体人数未明确) NA 单细胞RNA-seq NA NA
1520 2026-02-26
Single-cell RNA sequencing and integrated bioinformatics reveal new mitochondrial biomarkers in sarcopenia
2026, Frontiers in molecular biosciences IF:3.9Q2
研究论文 本研究通过整合分析公共转录组数据集和单细胞RNA测序,发现了一个与线粒体功能相关的三基因标志物(CHCHD10、SAMM50、MDH2),可作为肌少症的早期诊断生物标志物 首次通过整合多组学数据和机器学习方法,鉴定出一个在多个独立队列中保守的、与线粒体功能障碍相关的三基因标志物,并构建了具有高诊断准确性的列线图预测模型 研究主要基于公共数据集进行生物信息学分析,尽管进行了体外验证,但缺乏大规模临床队列的直接验证 发现肌少症的早期诊断生物标志物 肌少症患者及对照的转录组数据、C2C12成肌细胞 生物信息学 老年疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、差异基因表达分析、加权基因共表达网络分析(WGCNA)、机器学习、定量PCR 列线图预测模型 转录组数据、单细胞RNA测序数据 多个公共数据集(GSE1428, GSE117525, GSE167186, GSE111006, GSE111010, GSE111016),具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
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