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当前共找到 1921 篇文献，本页显示第 1501 - 1520 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1501 | 2026-01-24 |
A Transcriptional Atlas of Endothelial Cell Zonation Along the Pulmonary Vascular Tree
2026-Jan-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.17.654540
PMID:41542612
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，构建了小鼠肺血管树内皮细胞的转录图谱，揭示了内皮细胞沿血管连续体的转录组梯度，并开发了一个分析框架来分类细胞基于血管大小和位置 | 开发了一个分析框架，利用扩散伪时间分析来描绘转录组梯度并分配血管大小评分，从而将单个内皮细胞沿血管连续体分类，包括毛细血管的动静脉极性 | 研究主要基于P3小鼠肺数据，虽然已应用于其他数据集，但可能受物种和发育阶段限制，且空间推断依赖于计算模型而非直接空间测量 | 旨在全面映射肺血管树内皮细胞的转录特征，以理解血管连续体中的细胞异性和空间组织 | 小鼠肺内皮细胞，包括动脉、静脉和毛细血管细胞 | 单细胞转录组学 | 肺血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），荧光原位杂交（FISH） | 扩散伪时间分析 | 单细胞转录组数据，图像数据 | P3小鼠肺样本，并应用于多个已发表的小鼠和人类数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1502 | 2026-01-24 |
CA9+ cancer-associated fibroblasts cooperate with SPP1+ tumor-associated macrophages driving immune resistance in triple-negative breast cancer
2026-Jan-09, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-025-06056-2
PMID:41511527
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA数据和多组学分析，揭示了CA9+癌症相关成纤维细胞与SPP1+肿瘤相关巨噬细胞在驱动三阴性乳腺癌免疫抵抗中的关键作用 | 首次识别CA9+CAF作为免疫检查点阻断非应答者的关键亚群，并发现其与SPP1+TAM通过VEGFA/NRP2轴形成基质-髓系轴促进免疫逃逸 | 研究主要基于回顾性数据分析，体内实验验证有限，临床样本量相对较小 | 探究三阴性乳腺癌免疫抵抗的肿瘤微环境机制，以改善个性化精准治疗 | 三阴性乳腺癌患者样本、人类乳腺成纤维细胞、TNBC细胞系 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、批量RNA测序、多重免疫荧光染色 | NA | 单细胞RNA数据、空间转录组数据、批量RNA数据、免疫荧光图像 | 12个TNBC队列的单细胞RNA数据，以及来自本中心的新辅助免疫治疗TNBC样本 | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学、批量RNA-seq | NA | NA |
| 1503 | 2026-01-24 |
Analyzing cell-type-specific isoform expression using IsoDiffR and long-read single-cell RNA sequencing
2026-Jan-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf664
PMID:41400872
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研究论文 | 本文介绍了IsoDiffR，一种用于分析长读长单细胞RNA测序数据中细胞类型特异性RNA异构体表达的工具 | 开发了IsoDiffR工具，专门针对长读长单细胞RNA测序技术，能够识别跨细胞类型中表达模式不同于对应基因或主要异构体的RNA异构体，支持成对和多细胞类型比较 | 未在摘要中明确提及具体限制 | 开发新型分析工具以匹配长读长单细胞RNA测序技术的快速发展，并研究基因表达调控在单细胞水平 | Macaca fascicularis的角膜缘和人类前额叶皮层的长读长单细胞RNA测序数据 | 自然语言处理 | NA | 长读长单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 未在摘要中明确提及具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1504 | 2026-01-24 |
Single-Cell transcriptomic analysis reveals distinct cellular and molecular signatures of human oral mucosa and skin
2026-Jan-02, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-025-06007-x
PMID:41483202
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序比较了人类口腔黏膜和皮肤在稳态条件下的细胞和分子特征，揭示了其与不同愈合能力相关的内在差异 | 首次在稳态条件下对人类口腔黏膜和皮肤进行单细胞转录组比较分析，构建了全面的单细胞转录组图谱，并识别出与无瘢痕愈合相关的候选靶点 | 数据来源于未受伤的组织，因此推断的调控网络与愈合行为的关联是推测性的，需要后续功能实验验证 | 探究口腔黏膜比皮肤愈合更快且瘢痕更少的细胞和分子机制 | 来自同一供体的配对、未受伤的人类口腔黏膜和皮肤组织 | 单细胞组学 | 伤口愈合 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq), RT-PCR | NA | 单细胞转录组数据 | 来自不同年龄和性别组的自体及同种异体样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1505 | 2026-01-24 |
A Dynamic DNA Nano-Antioxidant Targeting Galectin-3 Attenuates Liver Fibrosis via Reducing Macrophage Oxidative Stress
2026-Jan, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202509977
PMID:41168966
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研究论文 | 本文开发了一种动态DNA纳米抗氧化剂，靶向Galectin-3以减少巨噬细胞氧化应激，从而减轻肝纤维化 | 开发了动态DNA纳米抗氧化剂用于肝巨噬细胞特异性siRNA递送，靶向Galectin-3以降低氧化应激，并通过单细胞RNA测序分析验证了Galectin-3与巨噬细胞氧化应激的正相关性 | 研究基于小鼠模型，尚未在人体中进行验证，且长期安全性和疗效需进一步评估 | 开发靶向治疗肝纤维化的新策略，通过减少巨噬细胞氧化应激来抑制纤维化进展 | 肝巨噬细胞和Galectin-3蛋白，以及四氯化碳诱导的肝纤维化小鼠模型 | 生物医学工程 | 肝纤维化 | 单细胞RNA测序，IVIS成像，转录组分析 | NA | 基因表达数据，荧光成像数据 | 四氯化碳诱导的肝纤维化小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1506 | 2026-01-24 |
Ex Vivo Spatiotemporal Characterization of Spermatogenesis in Mouse Testicular Organoids
2026-Jan, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202512670
PMID:41173796
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研究论文 | 本研究开发了一种将新生小鼠睾丸单细胞悬液自重组为包含主要睾丸细胞类型、管状样结构并产生单倍体精子的睾丸类器官的策略 | 开发了一种能够自我重组并支持完整体外精子发生过程的睾丸类器官培养策略，其时空特征与体内睾丸相似，并能在不同遗传背景的体细胞嵌合类器官中支持生殖细胞发育 | 单倍体精子样细胞仅占总生殖细胞的约2.43%，比例相对较低 | 研究睾丸类器官的构建及其在体外精子发生和生育力保存中的应用 | 新生小鼠睾丸细胞 | 生殖生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1507 | 2026-01-24 |
Exploration of Novel Biomarkers Through a Precision Medicine Approach Using Multi-Omics and Brain Organoids in Patients With Atypical Depression and Psychotic Symptoms
2026-Jan, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202508383
PMID:41173797
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研究论文 | 本研究通过结合临床数据、白细胞单细胞RNA测序、血浆蛋白质组学和脑类器官模型，探索了伴有精神病性症状的非典型抑郁症患者的新型生物标志物 | 首次将白细胞单细胞RNA测序、血浆蛋白质组学和患者来源的脑类器官模型整合到一个精准医学框架中，以揭示该精神疾病亚型的免疫和神经学改变 | 白细胞计数在年龄调整后差异不显著，且研究样本可能有限，需要进一步验证 | 探索伴有精神病性症状的非典型抑郁症的病理生理学机制和新型生物标志物 | 伴有精神病性症状的非典型抑郁症患者 | 精准医学 | 抑郁症 | 单细胞RNA测序、血浆蛋白质组学、脑类器官模型 | 脑类器官模型 | 临床数据、scRNA-seq数据、蛋白质组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1508 | 2026-01-24 |
Single-cell transcriptome reveals that immune cells inhibit the repairment of IGFBP3 + stromal cells in thin endometrium
2026-Jan, Immunobiology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.imbio.2025.153152
PMID:41496196
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学结合组织病理学和多重免疫荧光验证，揭示了薄型子宫内膜（TE）中基质细胞修复受损和促纤维化重塑的协调失调机制 | 首次在单细胞分辨率上系统描绘了TE中基质细胞与免疫细胞的相互作用网络，识别出IGFBP3+基质细胞的修复抑制是TE的核心病理特征，并发现了GZMA-PARD3和APOE-TREM2轴抑制以及LAMA3通路过度激活等新的驱动机制 | 研究样本量相对有限，且主要基于转录组数据，功能验证和机制研究有待进一步深入 | 探究薄型子宫内膜（TE）的病理机制，寻找恢复子宫内膜修复和微环境稳态的治疗靶点 | 薄型子宫内膜（TE）患者的子宫内膜组织 | 数字病理学 | 妇科疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），多重免疫荧光（TSA），空间转录组验证 | CellChat分析 | 单细胞转录组数据，组织图像数据 | 未明确说明具体样本数量，但涉及薄型子宫内膜患者组织 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 1509 | 2026-01-24 |
Prediction of myeloid malignant cells in Fanconi anemia using machine learning
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0340578
PMID:41557613
|
研究论文 | 本研究开发了一种深度神经网络模型，用于预测范可尼贫血患者骨髓样本中是否存在AML样恶性细胞 | 首次将公开的AML患者单细胞RNA-seq数据训练的深度神经网络模型应用于范可尼贫血患者，以单细胞分辨率预测恶性细胞，并揭示了预测细胞中与恶性转化相关的转录特征和免疫逃逸线索 | 模型训练数据来源于公开的AML数据集，可能无法完全代表范可尼贫血患者中出现的所有恶性细胞亚型；需要进一步在更大的范可尼贫血患者队列中进行验证 | 开发一种早期识别范可尼贫血患者骨髓中髓系恶性细胞的机器学习方法，以改善患者监测和临床干预 | 范可尼贫血患者的骨髓样本 | 机器学习 | 范可尼贫血 | 单细胞RNA测序 | 深度神经网络 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1510 | 2026-01-24 |
Simulated Aeromedical Evacuation Causes Hippocampal Neuronal Damage in Rats With Acute Lung Injury
2026-Jan-01, Military medicine
IF:1.2Q2
DOI:10.1093/milmed/usaf377
PMID:40719041
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研究论文 | 本研究探讨了模拟航空医疗后送对急性肺损伤大鼠海马神经元的影响 | 与以往主要关注肺组织二次损伤的研究不同，本研究首次利用单细胞RNA测序技术分析了模拟航空医疗后送环境下急性肺损伤大鼠海马神经元的损伤机制，并揭示了NRG1/ErbB4信号通路在其中的潜在重要作用 | 研究仅使用大鼠模型，未涉及人类样本，且模拟环境可能无法完全复现实际航空医疗后送的所有复杂因素 | 研究低气压缺氧环境对急性肺损伤大鼠脑组织的影响 | 脂多糖诱导的急性肺损伤Sprague-Dawley大鼠 | NA | 急性肺损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 未明确指定样本数量，但使用Sprague-Dawley大鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1511 | 2026-01-23 |
ClusterGVis: An Advanced Visualization and Clustering Tool for Gene Expression Analysis
2026-Jan-22, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzag005
PMID:41569346
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研究论文 | 本文介绍了ClusterGVis，一款用于简化基因表达数据分析和可视化的高级生物信息学软件 | 开发了集成了模糊c均值和k均值聚类算法以及热图可视化功能的用户友好界面，有效揭示复杂基因表达谱中的模式和关系 | NA | 简化基因表达数据的分析和可视化，以识别潜在生物标志物并增强对基因功能和调控机制的理解 | 单细胞RNA测序和批量RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | RNA测序 | 模糊c均值聚类, k均值聚类 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1512 | 2026-01-23 |
scSemiPLC: a semi-supervised learning framework for annotating single-cell RNA-Seq data by generating pseudo-labels through clustering
2026-Jan-20, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/msystems.00223-25
PMID:41358754
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研究论文 | 本文提出了一种名为scSemiPLC的半监督学习框架，用于通过聚类生成伪标签来注释单细胞RNA-Seq数据 | scSemiPLC利用现有标签信息指导未标记数据的聚类，通过一致性正则化约束扰动数据的预测与伪标签相似，解决了固定高阈值伪标签范式导致的未标记数据利用率低的问题 | NA | 开发一个高效便捷的自动化细胞注释方法，以应对传统手动标记基因匹配方法的繁琐和耗时问题 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型注释 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | 半监督学习框架 | RNA-Seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1513 | 2026-01-23 |
Inhibition of PFKFB3 in macrophages ameliorates intestinal inflammation by modulating gut microbiota in DSS-induced colitis
2026-Jan-20, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/msystems.00632-25
PMID:41378888
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研究论文 | 本研究探讨了糖酵解关键酶PFKFB3在巨噬细胞中的作用，发现抑制PFKFB3可通过调节肠道菌群减轻DSS诱导的结肠炎 | 首次揭示了巨噬细胞中PFKFB3缺陷通过调节肠道菌群（特别是增强Akkermansia菌属）改善结肠炎的机制，并证明该菌群可水平传播产生治疗效应 | 研究主要基于小鼠模型，人体验证尚不充分；抗生素处理实验表明菌群介导效应，但具体菌种功能机制需进一步解析 | 阐明PFKFB3在溃疡性结肠炎中的作用机制，探索通过靶向巨噬细胞代谢调节肠道菌群的治疗策略 | 溃疡性结肠炎患者组织样本、DSS诱导的结肠炎小鼠模型、巨噬细胞特异性PFKFB3缺陷小鼠 | 免疫代谢与微生物组学 | 溃疡性结肠炎 | 免疫组化染色、单细胞RNA测序、流式分析、高通量转录组数据分析、Spearman相关性分析 | 小鼠基因缺陷模型（LysM-Cre介导的巨噬细胞PFKFB3敲除） | 转录组数据、单细胞测序数据、临床病理数据 | 人类UC队列组织样本、结肠炎小鼠模型、基因工程小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1514 | 2026-01-23 |
Piezo1 dictates K+ homeostasis through coordinated regulation of the ubiquitin ligase Kelch-like 3 in RBCs and the kidney
2026-Jan-20, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2513222123
PMID:41533447
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研究论文 | 本文揭示了机械传感器Piezo1通过协调红细胞和肾脏中泛素连接酶Kelch-like 3 (KLHL3)的活性，调控细胞外钾离子稳态的机制 | 首次发现Piezo1-KLHL3相互作用作为红细胞与肾脏之间的关键组织间信号机制，调控钾离子稳态，并提出了该通路作为治疗钾离子紊乱的潜在靶点 | 研究主要基于小鼠模型和人类遗传数据，需要进一步实验验证该通路在人类疾病中的具体作用机制 | 探究组织间信号在钾离子稳态中的作用，特别是Piezo1-KLHL3通路的功能 | 红细胞、肾脏、人类遗传数据（UK Biobank参与者） | 分子生物学 | 钾离子紊乱 | CRISPR基因编辑、单细胞转录组学、遗传关联分析 | NA | 遗传数据、转录组数据、生理参数 | 200,367名UK Biobank参与者、KLHL3敲入小鼠模型 | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 1515 | 2026-01-23 |
Pyrroloquinoline quinone ameliorates inflammatory responses by modulating macrophage polarization in murine models of SLE and lupus-associated diffuse alveolar hemorrhage
2026-Jan-20, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.116219
PMID:41564475
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研究论文 | 本研究评估了吡咯喹啉醌（PQQ）在系统性红斑狼疮（SLE）及其相关弥漫性肺泡出血（DAH）中的治疗效果，并探讨了其通过调节巨噬细胞极化发挥抗炎作用的机制 | 首次在SLE和SLE相关DAH模型中评估PQQ的治疗效果，并利用单细胞RNA测序和批量RNA测序技术揭示其通过调节巨噬细胞极化及ERK/MAPK信号通路发挥免疫调节作用的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和细胞系，尚未在人体中进行验证，且具体分子机制细节有待进一步深入探究 | 评估PQQ对SLE及其并发症DAH的治疗效果，并探究其对巨噬细胞极化的调节作用 | 使用Pristane诱导的DAH小鼠、狼疮易感MRL/lpr小鼠以及RAW264.7巨噬细胞系 | NA | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA测序（bulk RNA-seq），流式细胞术 | NA | RNA测序数据，流式细胞术数据 | 涉及两种小鼠模型（Pristane诱导DAH小鼠和MRL/lpr小鼠）及RAW264.7细胞系，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | NA | NA |
| 1516 | 2026-01-23 |
Interpretable trajectory inference with single-cell linear adaptive negative-binomial expression (scLANE) testing
2026-Jan-14, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1494
PMID:41533563
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研究论文 | 本文提出了一种名为scLANE的可解释轨迹推断方法，用于单细胞RNA-seq数据中的基因表达动态分析 | scLANE方法基于可解释的广义线性模型，通过经验选择的基样条处理非线性，并扩展至估计方程和混合模型，以支持复杂实验设计下的可靠轨迹测试 | NA | 开发一种可解释的轨迹推断方法，以识别与单细胞RNA-seq数据中轨迹进展显著相关的基因表达变化 | 单细胞RNA-seq数据中的基因表达动态 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA-seq | 广义线性模型（GLM） | 单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1517 | 2026-01-23 |
Unstressed cells are alike, but stressed cells differ: Environmental and single-cell heterogeneity in yeast stress responses
2026-Jan-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.12.642837
PMID:41542409
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研究论文 | 本研究通过高通量单细胞RNA测序技术，分析了酵母细胞在多种压力条件下的转录组异质性，揭示了压力响应中平均信号与单细胞水平差异之间的关键区别 | 首次在单细胞水平上系统比较了酵母压力响应中激活与抑制程序的预测能力，发现压力抑制程序（以核糖体相关基因为主）具有跨数据集的稳定预测性，而压力激活程序则高度条件特异性；同时揭示了压力细胞中经典压力程序与转座元件转录之间的互斥性细胞亚群行为 | 研究仅针对酵母模型系统，结果在更复杂生物体中的普适性有待验证；单细胞测序技术本身存在技术噪音和捕获效率限制 | 探究细胞压力响应的异质性本质，比较平均群体水平与单细胞水平在压力响应特征识别上的差异 | 酿酒酵母细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 约13,000个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1518 | 2026-01-23 |
Advancing adoptive T cell therapy in ovarian cancer: barriers, innovations, and emerging platforms
2026-Jan-09, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-013285
PMID:41513408
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综述 | 本文全面分析了卵巢癌中过继性T细胞疗法的现状、障碍、创新策略及新兴技术平台 | 系统整合了从传统TIL、TCR-T、CAR-T到新兴的双特异性T细胞衔接器分泌型T细胞、双靶向平台及合成抗原受体等多种疗法，并强调了空间转录组学、单细胞分析和机器学习等工具在优化疗法设计中的作用 | NA | 克服卵巢癌中过继性T细胞疗法的免疫障碍，加速开发更有效、持久和个性化的T细胞策略 | 卵巢癌及其他实体瘤 | NA | 卵巢癌 | 空间转录组学，单细胞分析，机器学习 | NA | NA | NA | NA | 空间转录组学，单细胞分析 | NA | NA |
| 1519 | 2026-01-23 |
Fishing with Two Lines: A Hybrid Approach to Spatial Transcriptomic Discovery
2026-Jan-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.07.698201
PMID:41542551
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研究论文 | 本文开发了一种结合高灵敏度和广覆盖的空间转录组学双重化学方法 | 提出了一种创新的双重化学方法，将10X Genomics Xenium V1定制面板的高灵敏度与Prime 5K面板的广覆盖结合在同一组织切片上 | NA | 解决空间转录组学中基因检测数量与每个基因灵敏度之间的权衡问题 | 人类肺组织微阵列 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10X Genomics Xenium V1, Prime 5K | 10X Genomics Xenium V1定制面板（最多480个基因）与Prime 5K面板（5001个基因） |
| 1520 | 2026-01-23 |
STAN, a computational framework for inferring spatially informed transcription factor activity
2026-Jan-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1473
PMID:41521668
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研究论文 | 本文介绍了一种名为STAN的计算框架，用于从空间转录组学数据中推断空间感知的转录因子活性 | 提出了一个线性混合效应计算方法，整合了TF-靶基因先验知识、mRNA表达、空间坐标和组织学特征，以预测空间感知的、点特异性的TF活性 | 未在摘要中明确说明 | 系统性地推断转录因子活性及其在细胞身份中的作用，以增强空间转录组学数据的效用 | 淋巴结、背外侧前额叶皮层、乳腺癌和胶质母细胞瘤的空间转录组学数据集 | 空间转录组学 | 乳腺癌, 胶质母细胞瘤 | 空间转录组学 | 线性混合效应模型 | mRNA表达数据, 空间坐标数据, 组织学特征数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |