单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202601-202601] [清除筛选条件]
当前共找到 1921 篇文献,本页显示第 1481 - 1500 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1481 2026-01-25
Immunological microenvironment differences between left and right colon cancer: dynamic interactions of CASC15+KLK6+ epithelial subpopulation with T cells and mast cells
2026-Jan-01, International journal of surgery (London, England)
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了左右半结肠癌免疫微环境的差异,并鉴定出一个与预后不良相关的CASC15+KLK6+上皮亚群 首次在单细胞水平系统比较左右半结肠癌的免疫微环境差异,并发现了一个具有高拷贝数变异和恶性通路活性的特异性上皮亚群,其与T细胞、肥大细胞的相互作用通过MIF和CD99信号通路驱动免疫抑制 样本量较小(单细胞测序仅6例),验证队列规模有限(70例),且未进行功能性实验验证信号通路的具体机制 探究左右半结肠癌免疫微环境的差异及其对临床行为的潜在影响 左半结肠癌和右半结肠癌患者的肿瘤组织 数字病理学 结肠癌 单细胞RNA测序,免疫荧光 Seurat, inferCNV, Monocle2, GSVA, CellChat 单细胞转录组数据,图像数据 单细胞测序:3例左半结肠癌和3例右半结肠癌;验证队列:70例患者(30例左半结肠癌,40例右半结肠癌) NA 单细胞RNA-seq NA NA
1482 2026-01-25
Single-cell transcriptome analysis reveals regulatory programs associated with tumor resistance during immunotherapy in colorectal cancer
2026-Jan-01, International journal of surgery (London, England)
研究论文 本研究通过单细胞转录组分析揭示了结直肠癌免疫治疗耐药期间T细胞亚群的调控程序 首次在转移性dMMR结直肠癌患者中系统比较了耐药与敏感组的单细胞转录组差异,并识别出TSTR和γδ T细胞的转录网络失调是耐药的核心机制 研究主要基于单细胞测序数据的生物信息学分析,缺乏体内外功能实验验证;临床样本量相对有限(190例) 探究结直肠癌免疫治疗耐药的分子机制 转移性DNA错配修复缺陷(dMMR)结直肠癌患者 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据、临床组织样本 190例结直肠癌患者及其配对癌旁正常组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1483 2026-01-25
Polyethylene terephthalate microplastics exposure enhances the risk of ulcerative colitis: insights from multiomics integration, machine learning, and molecular docking reveal intestinal toxicity mechanisms
2026-Jan-01, International journal of surgery (London, England)
研究论文 本研究通过多组学整合、机器学习和分子对接揭示了聚乙烯对苯二甲酸酯微塑料暴露增加溃疡性结肠炎风险的肠道毒性机制 首次整合多组学数据、机器学习算法和分子对接技术,系统性识别了PET-MPs诱导UC的关键靶点基因,并构建了高精度的风险预测模型 研究主要基于公共数据库数据和动物模型,缺乏直接的人类临床验证,且PET-MPs暴露剂量和时长可能无法完全反映真实环境暴露情况 探究PET微塑料暴露与溃疡性结肠炎风险增加的分子机制 PET微塑料、溃疡性结肠炎相关基因靶点、动物模型肠道组织 机器学习 溃疡性结肠炎 多组学整合、机器学习、分子对接、单细胞测序分析、Western blot 多种机器学习算法(包括SHAP分析) 基因表达数据、蛋白质表达数据、分子对接模拟数据 未明确具体样本数量,但使用了公共数据库数据和动物模型 NA 单细胞测序 NA NA
1484 2026-01-25
Selenomethionine alleviates aortic dissection via PGC-1α/NRF2/TFAM-mediated mitochondrial biosynthesis against ferroptosis: an experimental study
2026-Jan-01, International journal of surgery (London, England)
研究论文 本研究探讨了硒代蛋氨酸通过PGC-1α/NRF2/TFAM轴介导的线粒体生物合成抑制铁死亡,从而缓解主动脉夹层的治疗效果和机制 首次揭示了硒代蛋氨酸通过激活PGC-1α/NRF2/TFAM轴抑制铁死亡,从而减轻主动脉夹层的具体分子机制 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,临床转化仍需进一步验证 探索硒代蛋氨酸治疗主动脉夹层的疗效及其潜在分子机制 小鼠主动脉夹层模型和血小板衍生生长因子-BB诱导的血管平滑肌细胞 心血管疾病 主动脉夹层 单细胞测序、转录组分析、小干扰RNA敲低技术 小鼠模型、细胞模型 基因表达数据、细胞表型数据 未明确指定样本数量,涉及小鼠模型和患者VSMCs NA 单细胞RNA-seq、转录组测序 NA NA
1485 2026-01-25
Metformin Restores Mitochondrial Function and Neurogenesis in POLG Patient-Derived Brain Organoids
2026-Jan, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究利用患者来源的iPSC皮质类器官模拟POLG相关神经退行性疾病,并评估了二甲双胍在恢复线粒体功能和神经发生方面的治疗潜力 首次在POLG患者来源的脑类器官模型中,通过单细胞RNA-seq揭示不同神经元亚型的特异性脆弱性,并证明二甲双胍能恢复神经元身份、线粒体功能和代谢通路 研究基于体外类器官模型,可能无法完全模拟体内复杂环境;治疗剂量和时间窗口需进一步优化;未涉及长期疗效和潜在副作用评估 探究二甲双胍对POLG相关线粒体功能障碍和神经发生损伤的治疗作用及机制 POLG患者来源的诱导多能干细胞(iPSC)皮质类器官 神经科学 线粒体疾病 单细胞RNA-seq,功能测定(线粒体膜电位、质量、氧化应激),钙测量,非靶向代谢组学 脑类器官模型 单细胞转录组数据,功能测定数据,代谢组数据 患者来源的iPSC皮质类器官 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1486 2026-01-08
Spatial transcriptomics decodes the cellular landscape of plant-pathogen interaction
2026-Jan, Nature plants IF:15.8Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
1487 2026-01-25
Integrated analysis of bulk RNA and single-cell RNA sequencing data reveals potential biomarkers and immune infiltrates associated with N7-methylguanosine in osteoarthritis
2026-Jan-01, International journal of surgery (London, England)
研究论文 本研究通过整合分析bulk RNA和单细胞RNA测序数据,揭示了与骨关节炎中N7-甲基鸟苷修饰相关的潜在生物标志物和免疫浸润特征 首次在骨关节炎中系统研究m7G修饰的作用,识别了四个关键m7G调节因子作为新型生物标志物,并探索了其与免疫浸润和软骨退化的关系 需要进一步实验来阐明骨关节炎的分子机制 识别与骨关节炎中m7G修饰相关的基因,并研究其诊断价值和免疫浸润特征 骨关节炎患者样本(106个OA样本) 生物信息学 骨关节炎 bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 LASSO回归, 无监督聚类分析 RNA测序数据 106个骨关节炎样本 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
1488 2026-01-25
Decoding the triglyceride-glucose index in metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease: integrative insights from Mendelian randomization, cross-tissue transcriptomics, and spatial multi-omics
2026-Jan-01, International journal of surgery (London, England)
研究论文 本研究通过整合孟德尔随机化、跨组织转录组学和空间多组学方法,揭示了甘油三酯-葡萄糖指数在代谢功能障碍相关脂肪性肝病中的因果机制和分子驱动因素 首次采用多组学框架结合孟德尔随机化、转录组范围关联研究和空间转录组学,系统解析了TyG指数与MASLD之间的因果关系及组织特异性表达模式 研究主要基于欧洲人群的遗传数据,可能限制了结果在其他人群中的普适性;空间转录组学数据来源于小鼠胚胎期,与人类成年期疾病状态存在差异 阐明甘油三酯-葡萄糖指数在代谢功能障碍相关脂肪性肝病发展中的因果作用机制 代谢功能障碍相关脂肪性肝病患者及小鼠模型 生物信息学 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 孟德尔随机化, 转录组范围关联研究, 空间转录组学, 单细胞测序 IVW, GSMR, JTI-PrediXcan, SMulTiXcan, FOCUS, FUSION, PoPS 基因组数据, 转录组数据, 空间转录组数据 基于UK Biobank的192个全基因组显著单核苷酸多态性 NA 单细胞空间转录组学 NA NA
1489 2026-01-25
SPP1 in notochord cells modulates intervertebral disc degeneration through CD44 recognition by macrophages based on single-cell transcriptome analysis
2026-Jan-01, International journal of surgery (London, England)
研究论文 本研究通过改进大鼠椎间盘压力模型,结合单细胞转录组分析,探讨了机械应力如何通过SPP1-CD44信号通路影响椎间盘退变 改进了大鼠椎间盘压力模型,并首次在单细胞水平揭示了机械应力下脊索细胞群的变化及SPP1-CD44信号通路在椎间盘退变中的作用 研究主要基于大鼠模型,人类数据验证部分依赖于公共数据库,缺乏直接的人类样本实验验证 探究机械应力导致椎间盘退变的分子机制 大鼠椎间盘组织及脊索细胞 单细胞转录组学 椎间盘退变 单细胞转录组测序 NA 单细胞RNA测序数据 手术组与假手术组大鼠椎间盘样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1490 2026-01-24
Single-cell transcriptomics uncovers malignant potential of gallbladder adenomyomatosis and identifies PRDX1+ immunosuppressive macrophages in gallbladder carcinoma
2026-Jan-23, International journal of surgery (London, England)
研究论文 本研究通过单细胞转录组学揭示了胆囊腺肌症的恶性潜能,并识别出胆囊癌中PRDX1+免疫抑制性巨噬细胞的关键作用 首次在单细胞水平上描绘了胆囊腺肌症的转录组景观,并发现PRDX1/PPAR-δ/CPT1A轴调控巨噬细胞免疫代谢的新机制 样本量相对较小,且功能验证主要依赖体外和体内实验,临床转化需进一步验证 评估胆囊腺肌症的恶性潜能并识别胆囊癌发生中未被认识的分子通路 胆囊慢性炎症、胆囊腺肌症和胆囊癌患者组织样本 数字病理学 胆囊癌 单细胞RNA测序, 生物信息学分析, 多重免疫组化, 体外和体内功能验证 NA 单细胞转录组数据, 批量RNA-seq数据, 免疫组化图像 9例患者用于单细胞测序, 80例公共数据集, 62例独立队列用于验证 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1491 2026-01-24
Isocucurbitacin B targets STAT3 to induce ferroptosis and promote anti-PD1 immunotherapy responses in breast cancer
2026-Jan-23, International journal of surgery (London, England)
研究论文 本研究探讨了异葫芦素B(IB)通过靶向STAT3诱导铁死亡并增强抗PD1免疫疗法在乳腺癌中的抗肿瘤机制 首次揭示IB通过直接靶向STAT3的SH2结构域抑制其激活,并发现STAT3转录激活SLC47A1导致铁死亡抵抗的新调控轴,同时证实IB与抗PD1抑制剂的协同作用 研究主要基于临床前模型(如小鼠模型和患者来源类器官),尚未进行人体临床试验,且机制验证多在细胞系中进行 探究IB在乳腺癌(特别是三阴性乳腺癌)中的抗肿瘤药理机制及其临床转化潜力 乳腺癌细胞系、MMTV-PyMT小鼠模型、患者来源类器官、4T1同基因小鼠模型 肿瘤药理学 乳腺癌 多组学整合分析(包括bulk和空间转录组学、非靶向代谢组学、蛋白质组学)、药物亲和响应靶点稳定性-质谱、染色质免疫沉淀-定量PCR、双荧光素酶报告基因检测、流式细胞术、Seahorse代谢通量分析 NA 多组学数据(转录组、代谢组、蛋白质组)、生化指标数据、影像数据 多种乳腺癌细胞系、小鼠模型及患者来源类器官,具体数量未明确说明 NA 空间转录组学, bulk RNA-seq NA NA
1492 2026-01-24
NSUN6 deficiency drives immune suppression in pancreatic cancer via the KDM5A-CCL2-macrophage axis
2026-Jan-22, Gut IF:23.0Q1
研究论文 本研究揭示了RNA甲基转移酶NSUN6通过m5C-KDM5A-CCL2轴调控胰腺癌免疫微环境的机制 首次阐明NSUN6通过m5C修饰调控KDM5A表达,进而激活CCL2转录,驱动免疫抑制性巨噬细胞极化,并证明靶向CCL2可逆转免疫检查点抑制剂耐药 研究主要基于小鼠模型和临床队列分析,需进一步在人体组织中进行功能验证;NSUN6下游的具体m5C修饰靶点图谱有待更全面解析 阐明NSUN6在胰腺癌免疫微环境中的功能作用及分子机制 胰腺导管腺癌(PDAC) 肿瘤免疫学 胰腺癌 RNA亚硫酸氢盐测序, RNA测序, 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据, 单细胞转录组数据 人类PDAC队列及小鼠PDAC模型 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
1493 2026-01-24
Integrative multi-omics analysis reveals gut-skin axis mechanisms and novel therapeutic target GALE in atopic dermatitis
2026-Jan-20, mSystems IF:5.0Q1
研究论文 本研究通过整合多组学分析揭示了特应性皮炎中肠道-皮肤轴的作用机制,并识别出新的治疗靶点GALE 结合单细胞RNA测序、细胞间通讯网络分析、伪时间轨迹推断、反向药物预测、分子对接和分子动力学模拟,首次系统阐明了肠道菌群通过维生素前体代谢途径影响特应性皮炎的机制,并发现GALE作为潜在治疗靶点 样本量较小(仅5名AD患者和4名健康对照),且研究主要基于计算模拟,缺乏实验验证 建立肠道菌群与特应性皮炎风险之间的因果关系,识别关键分子桥梁和治疗靶点 特应性皮炎患者和健康对照的皮肤活检样本 多组学分析 特应性皮炎 单细胞RNA测序,细胞间通讯网络分析,伪时间轨迹推断,反向药物预测,分子对接,分子动力学模拟 NA 单细胞RNA测序数据,分子对接数据,分子动力学模拟数据 5名特应性皮炎患者和4名健康对照的皮肤活检样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1494 2026-01-24
Circadian Control of Neutrophils Drives Collateral Perfusion and Stroke Outcome
2026-Jan-16, Circulation research IF:16.5Q1
研究论文 本研究探讨了昼夜节律对中性粒细胞功能的调控如何影响侧支灌注和卒中结局 揭示了中性粒细胞昼夜节律性活动通过NET形成调控侧支血流的新机制,为卒中治疗提供了时间依赖性靶点 研究主要基于小鼠模型,人类队列分析为观察性,需进一步验证干预效果 阐明昼夜节律如何通过中性粒细胞功能影响卒中严重程度 小鼠卒中模型和540例缺血性卒中患者 神经科学 卒中 流式细胞术、单细胞RNA测序、共聚焦显微镜、激光散斑成像 NA 生物分子数据、影像数据 小鼠模型及540例患者 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1495 2026-01-24
Single-cell landscape of immune cells in multiple autoimmune diseases
2026-Jan-16, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本研究通过整合分析六种自身免疫性疾病超过130万个细胞的单细胞RNA测序数据,揭示了疾病特异性和细胞类型特异性的转录程序,并识别了跨疾病激活的功能基因簇 首次在单细胞水平上系统比较了多种自身免疫性疾病的免疫细胞景观,识别了跨疾病保守的细胞毒性T细胞基因簇(GC40)和单核细胞相关基因簇(GC08),并构建了疾病分类器 研究样本量虽大但疾病类型有限(六种),且主要基于转录组数据,缺乏蛋白质组或表观遗传学的验证 系统表征多种自身免疫性疾病中免疫细胞的分子程序,识别跨疾病保守的调控机制 六种自身免疫性疾病患者的免疫细胞 单细胞组学 自身免疫性疾病 单细胞RNA测序 疾病分类器 单细胞转录组数据 239个样本,超过130万个细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1496 2026-01-24
Diverse Programmed Cell Death Patterns and Diagnostic Value in Osteoarthritis Analyzed by Integrative Multiomics Data
2026-Jan-14, Current stem cell research & therapy IF:2.1Q4
研究论文 本研究通过整合多组学数据分析骨关节炎中13种程序性细胞死亡模式,构建了诊断模型并验证了相关基因的表达 首次对骨关节炎中13种程序性细胞死亡模式进行综合多组学分析,并基于机器学习算法构建了高准确度的诊断模型 研究主要基于公共数据库的转录组数据,样本来源和实验验证可能有限 分析骨关节炎中程序性细胞死亡模式的多样性及其诊断价值 骨关节炎患者样本、大鼠模型以及OA软骨细胞 生物信息学 骨关节炎 转录组测序、单细胞RNA测序、机器学习算法 机器学习算法(具体未指定)、CIBERSORT算法 转录组数据、单细胞RNA测序数据 未明确指定样本数量,但使用了GEO数据库的批量转录组数据和scRNA-seq数据集GSE169454 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1497 2026-01-24
Single-Cell Regulatory Network Analysis Identifies Adjunctive Drug Candidates in Early Risankizumab-Treated Psoriasis
2026-Jan-14, Current pharmaceutical design IF:2.6Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析,在银屑病早期risankizumab治疗期间,识别了CD4⁺ T细胞中的关键转录因子及其下游基因,并预测了五种潜在的小分子辅助药物 首次在银屑病早期risankizumab治疗阶段,利用单细胞调控网络分析识别关键转录因子变化,并基于此预测辅助药物候选物 结果需在更大队列和实验模型中进一步验证 识别risankizumab的潜在替代或辅助疗法,以应对其长期使用的挑战 成熟树突状细胞和CD4⁺ T细胞 单细胞组学 银屑病 单细胞RNA测序 转录因子调控网络分析 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1498 2026-01-24
Single-cell Sequencing Reveals Key Biological Insights into Intervertebral Disc Development and Degeneration
2026-Jan-13, Current molecular medicine IF:2.2Q3
综述 本文综述了利用单细胞RNA测序技术研究椎间盘发育与退变的关键生物学见解 系统总结了scRNA-seq在椎间盘退变研究中的多方面应用,包括细胞亚群分型、转录组变化检测、信号通路调控和细胞间相互作用的阐明,并强调了其在椎间盘组织维持与修复中的潜在作用 作为一篇综述文章,未提出新的实验数据或模型,主要基于现有研究进行总结和展望 理解椎间盘退变的发生和退变过程中的生物学过程,为开发潜在治疗方法提供基础 椎间盘组织及其在发育和退变过程中的细胞 数字病理学 椎间盘退变 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1499 2026-01-24
Cabozantinib induces NLRP3-CASP1-GSDMD-dependent pyroptosis in hepatocellular carcinoma
2026-Jan-12, Life sciences IF:5.2Q1
研究论文 本研究揭示了卡博替尼通过经典NLRP3-CASP1-GSDMD通路诱导肝细胞癌细胞和髓源性抑制细胞发生焦亡的新免疫调节机制 首次阐明卡博替尼通过诱导焦亡发挥抗肿瘤和免疫调节作用的分子机制,为卡博替尼与免疫治疗的临床联合应用提供了理论依据 研究主要基于细胞系和动物模型,临床样本验证不足,且未探讨其他潜在信号通路的影响 探究卡博替尼在肝细胞癌治疗中的新型免疫调节机制,特别是其诱导焦亡的作用 肝细胞癌细胞系、髓源性抑制细胞以及免疫健全小鼠模型 肿瘤免疫学 肝细胞癌 流式细胞术、单细胞RNA测序、磷酸化蛋白质组学 基因敲除模型(Nlrp3敲除小鼠、Gsdmd敲除细胞) 单细胞转录组数据、蛋白质组学数据、流式细胞数据 未明确说明具体样本数量,涉及细胞系和动物模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1500 2026-01-24
Exploring CD4+ T Cell-Mediated Metabolism in Serous Ovarian Cancer via Mendelian Randomization and Single-Cell RNA-Sequencing
2026-Jan-12, Current topics in medicinal chemistry IF:2.9Q3
研究论文 本研究通过孟德尔随机化和单细胞RNA测序,探索了1-棕榈酰-GPG与浆液性卵巢癌之间的因果关系及CD4+ T细胞介导的代谢机制 首次结合孟德尔随机化、单细胞RNA测序和机器学习算法,系统揭示了1-棕榈酰-GPG通过初始CD4+ T细胞比例和PIGB等代谢基因表达影响浆液性卵巢癌的双重机制 研究主要基于观察性数据和计算模型,需要进一步的实验验证来确认因果机制和生物学功能 探究1-棕榈酰-GPG与浆液性卵巢癌的因果关系及其潜在的代谢和免疫机制 浆液性卵巢癌患者样本中的CD4+ T细胞及其代谢相关基因 生物信息学 卵巢癌 单细胞RNA测序,孟德尔随机化,机器学习算法 Lasso回归,CatBoost,SHAP分析 单细胞RNA测序数据,批量RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA测序,批量RNA测序 NA NA
回到顶部