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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1461 | 2026-01-27 |
GLP-1 Targeting Agents Impair Chemoimmunotherapy Effectiveness in Triple-Negative Breast Cancer
2026-Jan-09, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-8380296/v1
PMID:41542041
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研究论文 | 本研究评估了GLP-1R在多种人类肿瘤中的表达,并发现GLP-1靶向药物会通过作用于肿瘤细胞和免疫细胞,损害三阴性乳腺癌化疗免疫疗法的疗效 | 首次全面评估了GLP-1R在人类肿瘤中的表达和活性,并揭示了GLP-1暴露会重塑肿瘤微环境、促进恶性细胞间质转化并破坏巨噬细胞炎症,从而损害化疗免疫疗法效果 | NA | 研究GLP-1R靶向药物对三阴性乳腺癌化疗免疫疗法疗效的影响 | 多种人类肿瘤类型,重点关注三阴性乳腺癌 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据、临床病理数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1462 | 2026-01-27 |
Imputation integrates single-cell and spatial gene expression data to resolve transcriptional networks in barley shoot meristem development
2026-Jan, Nature plants
IF:15.8Q1
DOI:10.1038/s41477-025-02176-6
PMID:41501532
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研究论文 | 本文通过整合深度单细胞RNA测序和空间基因表达数据,研究了大麦发育过程中的转录变化,从分生组织和器官创始细胞的指定到不同花器官的起始 | 采用一种整合单细胞RNA测序与空间基因表达数据的插补方法,实现了在细胞分辨率下分析超过40,000个基因的表达谱,并通过BARVISTA网络图形界面进行虚拟微解剖 | 当前技术无法完全实现基因表达谱的精确时空信息,可能影响对局部微环境的理解 | 解析大麦分生组织发育中的转录网络,以理解复杂发育过程的遗传基础 | 大麦分生组织和器官创始细胞,包括花器官的起始和发育 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序,空间基因表达分析 | NA | 基因表达数据 | 多个大麦组织中的超过40,000个基因 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 1463 | 2026-01-26 |
Bimekizumab long-term response in psoriasis: Mechanistic insights into efficacy level and durability
2026-Jan-22, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2025.12.1013
PMID:41580158
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研究论文 | 本文评估了bimekizumab在银屑病患者中长达4年的临床反应持久性,并探讨了其分子机制 | 通过单细胞RNA测序揭示了病变皮肤中表达IL17A和/或IL17F的组织驻留记忆T细胞亚群,并发现其与bimekizumab疗效持久性相关 | 研究基于回顾性临床数据整合和转录组分析,可能受样本选择和测序技术限制 | 评估bimekizumab治疗银屑病的长期疗效持久性并探究其分子机制 | 银屑病患者 | 数字病理学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | 转录组数据 | 503名患者(来自临床试验),另加三个独立单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1464 | 2026-01-26 |
A Nanovesicle-Sericin-Based Hydrogel Scaffold for RGC Survival in Glaucoma via Regulation of Microglial Polarization
2026-Jan-21, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.5c18589
PMID:41490471
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研究论文 | 本研究开发了一种负载干细胞和纳米囊泡的丝胶基水凝胶支架,旨在通过调节小胶质细胞极化来促进青光眼模型中视网膜神经节细胞的存活 | 开发了一种新型的、集成了源自牙周膜干细胞的纳米囊泡(负载原花青素)的丝胶基光交联水凝胶支架,用于协同调节神经炎症微环境 | NA | 开发一种生物材料支架,以改善青光眼病理条件下视网膜神经节细胞的存活 | 视网膜神经节细胞、小胶质细胞、牙周膜干细胞 | 生物材料与组织工程 | 青光眼 | 单细胞RNA测序、RNA测序、超速离心、脂质体挤出 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1465 | 2026-01-26 |
APM⁺ macrophages associated with plaque vulnerability via MIF-CD74 signaling: a multi-omics study
2026-Jan-21, Human genomics
IF:3.8Q2
DOI:10.1186/s40246-025-00869-9
PMID:41566509
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研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示了与斑块脆弱性相关的APM⁺巨噬细胞及其通过MIF-CD74信号通路的作用机制 | 首次结合代谢组学、单细胞RNA测序和空间转录组学,系统性地解析了APM⁺巨噬细胞在动脉粥样硬化斑块不稳定中的核心作用 | 研究主要基于小鼠模型和有限的人类样本,临床转化需进一步验证 | 探究动脉粥样硬化与缺血性心肌病共享的代谢失调机制及斑块不稳定性的细胞基础 | 动脉粥样硬化斑块中的巨噬细胞亚群 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 代谢组学, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 机器学习 | 代谢组数据, 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 涉及ApoE-/-小鼠模型及多个队列的人类样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1466 | 2026-01-26 |
ELK1 promotes the progress of myeloid leukemia by hindering the differentiation of neutrophils
2026-Jan-20, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-025-00742-4
PMID:41559783
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研究论文 | 本研究探讨了ELK1在急性髓系白血病(AML)进展中的作用,发现其通过阻碍中性粒细胞分化促进疾病发展 | 首次揭示ELK1通过损害造血干细胞干性并阻碍中性粒细胞分化来加速KrasG12D诱导的髓系白血病发展,并证明抑制ELK1可促进白血病细胞向成熟中性粒细胞分化 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,尚未在人类临床试验中验证ELK1抑制剂的治疗效果 | 探索ELK1在AML发病机制中的作用,并评估其作为治疗靶点的潜力 | 小鼠模型(条件性Elk1和KrasG12D表达小鼠)、骨髓移植样本、未分化白血病细胞 | 分子生物学与血液肿瘤学 | 急性髓系白血病 | 条件性基因表达、骨髓移植、bulk-cell RNA测序、单细胞RNA测序、蛋白质组学 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据、细胞表型数据 | 多种转基因小鼠品系及体外培养的白血病细胞 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 1467 | 2026-01-26 |
Multi-Scale Transcriptomics Redefining the Tumor Immune Microenvironment
2026-Jan-15, Biotech (Basel (Switzerland))
DOI:10.3390/biotech15010007
PMID:41562697
|
综述 | 本文综述了批量、单细胞和空间转录组学方法在肿瘤免疫微环境研究中的原理、应用和局限性,并强调了整合分析的新兴策略 | 提出了多尺度转录组学框架,整合批量、单细胞和空间转录组数据,以更详细和机制性地理解肿瘤免疫微环境 | 综述文章未进行原始数据分析,主要总结现有方法,可能未涵盖最新技术进展 | 重新定义肿瘤免疫微环境,以支持更精确的生物技术和免疫治疗策略的开发 | 肿瘤免疫微环境 | 数字病理学 | 肿瘤 | 高通量测序技术 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1468 | 2026-01-26 |
Discovery of New Markers for Haemogenic Endothelium and Haematopoietic Progenitors in the Mouse Yolk Sac
2026-Jan-06, Journal of developmental biology
IF:2.2Q3
DOI:10.3390/jdb14010004
PMID:41562864
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研究论文 | 本研究通过重新注释小鼠卵黄囊单细胞RNA测序数据,发现了造血内皮和红系-髓系祖细胞的新分子标记物 | 通过亚聚类和拟时序分析,鉴定了造血内皮细胞和红系-髓系祖细胞的新型细胞表面标记物(FXYD5、SCARF1、FCER1G),并揭示了可能调控卵黄囊造血发生的候选信号和代谢通路 | 研究基于公开可用的单细胞RNA测序数据集,可能受限于原始数据的质量和覆盖度;研究结果主要在小鼠模型中验证,在人类或其他哺乳动物中的适用性有待进一步确认 | 阐明小鼠卵黄囊中造血内皮和红系-髓系祖细胞的起源、身份和分化动力学 | 小鼠胚胎卵黄囊中的造血-血管细胞群体 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | 拟时序分析 | 单细胞转录组数据 | 公开可用的单细胞RNA测序数据集(未指定具体样本数量) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1469 | 2026-01-26 |
GDF3 promotes adipose tissue macrophage-mediated inflammation via altered chromatin accessibility during aging
2026-Jan, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-025-01034-6
PMID:41398392
|
研究论文 | 本文揭示了巨噬细胞通过自分泌GDF3-SMAD2/3信号维持炎症表型并加剧内毒素血症的机制 | 发现GDF3-SMAD2/3轴通过限制甲基化依赖性染色质压缩驱动年龄相关染色质重塑和巨噬细胞炎症 | NA | 探究衰老过程中巨噬细胞炎症表型维持的机制及其与内毒素血症的关系 | 小鼠巨噬细胞、人类脂肪组织样本及11,084名社区动脉粥样硬化风险研究参与者 | NA | NA | 单细胞RNA测序、转座酶可及染色质测序分析 | NA | RNA测序数据、染色质可及性数据 | 人类脂肪组织样本及11,084名参与者 | NA | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq | NA | NA |
| 1470 | 2026-01-26 |
Dynamics of lung-infiltrating virus-specific T cells associated with age-dependent SARS-CoV-2 pneumonia severity
2026-Jan, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1013866
PMID:41533733
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研究论文 | 本研究利用Nr4a3-Tocky小鼠模型,探究了年龄相关的T细胞功能障碍与SARS-CoV-2肺炎严重程度之间的关联 | 建立了一种新型的鼠适应SARS-CoV-2毒株感染Nr4a3-Tocky小鼠模型,该模型能够通过荧光Timer蛋白在体内实时分析抗原反应性T细胞的动态和诱导过程 | 研究基于小鼠模型,其结果向人类临床的转化需要进一步验证 | 阐明SARS-CoV-2肺炎年龄依赖性发病的免疫学机制 | 成年和老年Nr4a3-Tocky小鼠 | 免疫学 | COVID-19肺炎 | 单细胞RNA测序,Timer蛋白荧光分析,细胞因子检测 | NA | RNA序列数据,荧光成像数据,细胞因子浓度数据 | 未明确说明具体数量,但涉及成年和老年两组小鼠,并在感染后多个时间点(1-8 d.p.i.)进行分析 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1471 | 2026-01-26 |
Immune checkpoint TIM-3 defines hyperactivated NK cells and predicts fatal outcome in severe fever with thrombocytopenia syndrome
2026-Jan, PLoS neglected tropical diseases
IF:3.4Q1
DOI:10.1371/journal.pntd.0013928
PMID:41544143
|
研究论文 | 本研究探讨了TIM-3在严重发热伴血小板减少综合征患者外周血NK细胞上的表达特征及其与疾病预后的关系 | 首次在SFTS中系统表征TIM-3⁺ NK细胞的表达谱,发现其与致死结局相关,并鉴定sTIM-3和sGalectin-9作为新型预后生物标志物 | 样本量较小(21例患者),单中心研究,需要更大规模队列验证 | 阐明TIM-3在SFTS免疫失调中的作用机制并寻找预后生物标志物 | 严重发热伴血小板减少综合征患者的外周血NK细胞及血清样本 | 免疫学 | 病毒感染性疾病 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,细胞因子检测 | 加权基因共表达网络分析 | 单细胞转录组数据,流式细胞数据,血清蛋白数据 | 21例SFTS患者和14例健康供者的外周血样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1472 | 2026-01-26 |
Integrative Multiomics Nominate GGCT as a Crucial Regulator of Immunosuppression in Colorectal Cancer
2026, International journal of genomics
IF:2.6Q2
DOI:10.1155/ijog/7013449
PMID:41573091
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量转录组数据,系统探索了结直肠癌中的免疫逃逸相关特征,并鉴定出GGCT作为一个关键的免疫抑制调节因子和预后生物标志物 | 首次在单细胞水平上系统表征结直肠癌的免疫逃逸机制,并通过多组学整合和高维加权基因共表达网络分析鉴定出GGCT作为新的预后生物标志物和治疗靶点 | 研究主要基于公共队列数据,缺乏实验验证;单细胞数据分析可能受样本异质性和批次效应影响 | 探索结直肠癌中免疫逃逸机制并鉴定关键调控因子 | 结直肠癌肿瘤微环境中的细胞群体 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 批量转录组测序 | 高维加权基因共表达网络分析 | 基因表达数据 | 多个公共队列数据(具体样本数未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1473 | 2026-01-25 |
LMTK3 regulates breast cancer angiogenesis via a context-dependent mesenchymal-epithelial transition program
2026-Jan-23, Cancer gene therapy
IF:4.8Q1
DOI:10.1038/s41417-026-01001-2
PMID:41577842
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研究论文 | 本文揭示了LMTK3通过调控间充质-上皮转化程序在乳腺癌血管生成中的关键作用 | 发现了LMTK3在乳腺癌血管生成中的“辛普森悖论”现象,即在间充质样三阴性乳腺癌中促进血管生成,而在管腔样细胞中抑制血管生成 | 研究主要基于细胞模型和单细胞测序数据,缺乏体内实验验证和临床样本的直接证据 | 探索乳腺癌血管生成的上游分子调控机制 | 乳腺癌细胞,特别是三阴性乳腺癌和管腔样乳腺癌细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1474 | 2026-01-25 |
Defining the cellular and molecular identities of histologic subtypes in lung adenocarcinoma
2026-Jan-23, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-025-00740-6
PMID:41578368
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析,揭示了肺腺癌不同组织学亚型的细胞和分子特征,特别是实体亚型中的免疫抑制微环境 | 首次整合单细胞转录组学和空间信息,识别出组织学亚型特异的癌细胞亚群和免疫抑制表型,并发现HMGA1作为实体亚型的潜在生物标志物和治疗靶点 | 样本量相对较小(18例患者),且仅针对初治肺腺癌,可能无法完全代表所有临床情况 | 探究肺腺癌组织学亚型的细胞和分子基础,以理解疾病异质性和开发亚型特异性治疗策略 | 肺腺癌患者肿瘤组织中的细胞,包括癌细胞和肿瘤微环境中的免疫细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),空间转录组学分析 | NA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据 | 18例初治肺腺癌患者,共117,266个细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组平台 |
| 1475 | 2026-01-25 |
Lenvatinib plus transarterial chemoembolization and PD-1 inhibitors as conversion therapies for unresectable intermediate-advanced hepatocellular carcinoma: a phase 2 trial and exploratory biomolecular study
2026-Jan-22, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-025-02498-z
PMID:41565617
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研究论文 | 本研究是一项前瞻性II期多中心临床试验,评估了Lenvatinib联合TACE和PD-1抑制剂(LEN-TAP方案)对比单独TACE作为转化疗法治疗不可切除的中晚期肝细胞癌的疗效和安全性 | 首次在前瞻性II期试验中系统评估了Lenvatinib、TACE和PD-1抑制剂三联方案作为转化疗法的疗效,并通过单细胞测序和流式细胞术探索了循环HLA-DR+CD38+CD8+ T细胞作为潜在生物标志物的价值 | 研究为II期试验,样本量相对有限(142例),需要更大规模的III期试验验证;LEN-TAP组3级治疗相关不良事件发生率较高(60.6%) | 评估LEN-TAP方案作为转化疗法治疗不可切除肝细胞癌的疗效和安全性,并探索相关生物标志物 | 不可切除的中晚期肝细胞癌患者 | 临床肿瘤学 | 肝细胞癌 | 单细胞测序, 流式细胞术 | NA | 临床数据, 单细胞测序数据, 流式细胞术数据 | 142例符合条件的患者(LEN-TAP组71例,TACE单药组71例) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1476 | 2026-01-25 |
Rab37-mediated OPN secretion enriches SPP1+ macrophages through autocrine-paracrine signaling to drive lung tumor progression
2026-Jan-14, Oncogenesis
IF:5.9Q1
DOI:10.1038/s41389-026-00596-3
PMID:41535255
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研究论文 | 本研究揭示了Rab37通过介导骨桥蛋白(OPN)分泌,以自分泌-旁分泌信号方式富集SPP1+巨噬细胞,从而驱动肺癌进展的机制 | 首次鉴定Rab37是重塑肺肿瘤微环境中巨噬细胞状态的关键调控因子,并阐明了其通过Rab37-OPN-STAT3信号轴调控巨噬细胞表型和功能的分子机制 | 未明确Rab37调控OPN分泌的具体分子通路,且临床样本的验证主要基于相关性分析,缺乏功能性干预实验的直接证据 | 探究肿瘤相关巨噬细胞功能异质性的分子决定因素及其在肺癌进展中的作用 | 肺癌肿瘤微环境中的巨噬细胞 | 肿瘤免疫学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 临床肺癌标本(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1477 | 2026-01-25 |
Single-cell RNA analysis reveals unexpected hemocyte plasticity and immune cell specialization in a Drosophila overgrowth model
2026-Jan-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.09.698745
PMID:41542540
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了果蝇过生长模型中的血细胞,揭示了血细胞的可塑性和免疫细胞的特化 | 发现了13种先前未知的血浆细胞亚型,并识别出表达Jonah家族丝氨酸蛋白酶的高表达基质重塑血浆细胞群体 | 研究基于果蝇模型,结果可能不完全适用于其他生物或人类疾病 | 探究先天免疫细胞如何适应慢性凋亡信号,并解析肿瘤样过生长中的免疫景观 | 果蝇幼虫中的循环和固着血细胞,特别是血浆细胞 | 单细胞转录组学 | 肿瘤样过生长 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 近50,000个血细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1478 | 2026-01-25 |
Harnessing machine learning-driven multiomics integration: deciphering programmed cell death networks for prognostication and immunotherapy prediction in lung adenocarcinoma
2026-Jan-07, Cell biology and toxicology
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s10565-025-10125-4
PMID:41501264
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研究论文 | 本研究通过整合14种程序性细胞死亡(PCD)模式,利用101种机器学习算法组合构建了一个包含7个基因的PCD特征,用于预测肺腺癌(LUAD)患者的预后和免疫治疗效果 | 首次整合多种PCD模式,并应用101种机器学习算法组合构建PCD特征,结合多组学数据(包括bulk RNA-seq和scRNA-seq)和mIHC验证,揭示了PCD特征与免疫治疗反应的关系,并识别出NAPSA作为新的免疫治疗预测标志物 | 研究主要基于回顾性数据集(如TCGA和GEO),样本量有限(如mIHC验证仅涉及38例患者),且机器学习模型组合虽多但可能未完全覆盖所有潜在算法,需要进一步前瞻性研究验证 | 通过多组学整合和机器学习,解析PCD网络以预测肺腺癌患者的预后和免疫治疗反应 | 肺腺癌(LUAD)患者,包括来自TCGA、GEO数据库的样本以及接受抗PD-1治疗的38例患者 | 机器学习 | 肺腺癌 | bulk RNA-seq, scRNA-seq, 多重免疫组化(mIHC), 免疫组化(IHC) | 101种机器学习算法组合 | 基因表达数据(RNA-seq), 单细胞RNA-seq数据, 图像数据(mIHC/IHC) | 多个数据集(TCGA和GEO)的样本,以及38例接受抗PD-1治疗的LUAD患者 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1479 | 2026-01-25 |
Integrated in vivo combinatorial functional genomics and spatial transcriptomics of tumours to decode genotype-to-phenotype relationships
2026-Jan, Nature biomedical engineering
IF:26.8Q1
DOI:10.1038/s41551-025-01437-1
PMID:40721510
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研究论文 | 本研究开发了PERTURB-CAST和CHOCOLAT-G2P方法,结合空间转录组学与体内功能基因组学,以解析肿瘤中基因型与表型的关系 | 开发了PERTURB-CAST方法,利用RNA模板连接探针和商业10X Visium平台,首次在同一组织切片中整合扰动映射与全转录组表型分析;并提出了CHOCOLAT-G2P框架,用于研究模拟肿瘤异质性的高阶组合扰动 | NA | 解码肿瘤中基因型到表型的关系,并研究组合扰动在组织水平上的表型效应 | 自发性镶嵌性肝肿瘤 | 空间转录组学 | 肝肿瘤 | 空间转录组学,RNA模板连接探针 | NA | 空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10X Visium | 商业10X Visium空间转录组学平台 |
| 1480 | 2025-09-09 |
Comments on "Tracking adipose-derived stem cell exosomes applied in a mouse crush injury model: insights from fluorescent labeling and spatial transcriptomics - an experimental study"
2026-Jan-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003382
PMID:40919925
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |