单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202601-202601] [清除筛选条件]
当前共找到 2200 篇文献,本页显示第 1441 - 1460 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1441 2026-03-11
TDO2-Associated Tryptophan Metabolism Correlates with Impaired Tertiary Lymphoid Structure Maturation and Reduced B Cell Class Switching in Breast Cancer
2026, Oncology research IF:2.0Q3
研究论文 本研究探讨了TDO2相关的色氨酸代谢如何影响乳腺癌中三级淋巴结构的成熟和B细胞类别转换 首次将TDO2相关的色氨酸代谢与三级淋巴结构成熟缺陷及B细胞类别转换抑制联系起来,并利用空间转录组学揭示了TDO2表达与TLS核心组分的空间负相关性 空间转录组学样本量较小(n=1),部分验证样本量有限(如多重免疫荧光n=12) 研究TDO2相关的色氨酸代谢对乳腺癌三级淋巴结构成熟和B细胞功能的影响 乳腺癌患者样本 生物信息学,肿瘤免疫学 乳腺癌 bulk RNA-seq,单细胞RNA测序,空间转录组学,免疫组织化学,多重免疫荧光 基因集变异分析,免疫反卷积,空间热点分析,条件空间共现模型 转录组数据,单细胞数据,空间转录组数据,组织图像数据 TCGA-BRCA队列1055例,scRNA-seq 26例,空间转录组1例,IHC 38例,多重免疫荧光12例 NA bulk RNA-seq,单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
1442 2026-03-11
Identification of Key Genes via Integrated Multi-Omics and Machine Learning Uncovers Tumor Biological Features and Prognostic Biomarkers in Uterine Leiomyosarcoma
2026, International journal of medical sciences IF:3.2Q1
研究论文 本研究通过整合多组学数据和机器学习算法,识别了子宫平滑肌肉瘤的关键基因,构建了诊断模型,并探索了这些基因与肿瘤免疫微环境的关系 首次整合多队列数据(包括单细胞测序)和113种机器学习算法来识别子宫平滑肌肉瘤的关键基因和构建诊断模型,并应用孟德尔随机化探索基因与疾病的因果关系 孟德尔随机化分析未发现关键基因与子宫平滑肌肉瘤之间存在遗传因果关系,且研究依赖于公共数据库数据 探索子宫平滑肌肉瘤的发病机制、识别诊断生物标志物,并阐明关键基因与肿瘤免疫微环境的关系 子宫平滑肌肉瘤患者的多组学数据 机器学习 子宫平滑肌肉瘤 单细胞测序, 多组学整合分析, 机器学习, 孟德尔随机化 GBM 基因表达数据, 单细胞数据 多个公共数据集(4个GEO数据集、TCGA-SARC、单细胞测序数据) NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
1443 2026-03-11
Single-cell transcriptomics reveals cellular and genetic mechanisms of alpine adaptation in Rosa sericea
2026, Frontiers in plant science IF:4.1Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组学技术揭示了高山植物绢毛蔷薇(Rosa sericea)叶片在细胞和遗传水平上的高海拔适应机制 首次构建了绢毛蔷薇叶片的单细胞转录图谱,结合hdWGCNA、伪时间轨迹分析等多种方法,鉴定了与高海拔适应相关的细胞类型特异性基因模块和调控网络 研究仅针对叶片组织,未涵盖其他器官;功能验证实验相对有限;样本来自特定地理区域,普适性需进一步验证 探究高山植物在极端环境下的细胞与遗传适应机制 绢毛蔷薇(Rosa sericea)叶片细胞 植物生物学 NA 单细胞核RNA测序(snRNA-seq)、加权基因共表达网络分析(hdWGCNA)、基因本体富集分析、基因集富集分析(GSEA)、伪时间轨迹推断、基因过表达技术 NA 单细胞转录组数据 31,796个细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1444 2026-03-11
The mechanism of Vicenin-2 in ameliorating skin photoaging: involvement of m6A-modified macrophage polarization
2026, Frontiers in pharmacology IF:4.4Q1
研究论文 本研究探讨了天然黄酮类化合物Vicenin-2通过调节m6A修饰的巨噬细胞极化来改善皮肤光老化的机制 首次揭示了Vicenin-2通过上调m6A修饰调节因子KIAA1429,增强整体m6A RNA甲基化,并抑制NF-κB通路激活,从而促进巨噬细胞从促炎M1表型向抗炎M2表型转变,为光老化干预提供了新的潜在局部治疗剂 研究主要基于小鼠模型和RAW264.7细胞系,尚未在人体中进行验证;具体m6A修饰的靶基因及其在巨噬细胞极化中的详细作用机制有待进一步阐明 探究Vicenin-2改善皮肤光老化的作用机制,特别是其在调节巨噬细胞极化中的作用 皮肤光老化小鼠模型、LPS诱导的RAW264.7巨噬细胞 单细胞组学 皮肤光老化 单细胞测序、体内外实验 NA 单细胞测序数据、体内外实验数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1445 2026-03-11
Metabolic Adaptation of CD8⁺ T Cells Limits the Efficacy of Fatty Acid Oxidation Inhibition in Type 1 Diabetes
2026, International journal of biological sciences IF:8.2Q1
研究论文 本研究探讨了脂肪酸氧化抑制剂曲美他嗪在1型糖尿病非肥胖糖尿病小鼠模型中对CD8⁺ T细胞的代谢适应和疾病进展的影响 揭示了CD8⁺ T细胞通过上调CPT1A来适应脂肪酸氧化抑制的代谢逃逸新机制,并验证了脂肪酸氧化作为1型糖尿病治疗靶点的重要性 研究主要基于小鼠模型,临床转化效果尚需验证;长期治疗可能因代谢适应而降低疗效 评估脂肪酸氧化抑制剂曲美他嗪对1型糖尿病自身免疫反应的调控作用及潜在治疗价值 非肥胖糖尿病小鼠模型、人类CD8⁺ T细胞、胰岛浸润免疫细胞 免疫代谢学 1型糖尿病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 非肥胖糖尿病小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1446 2026-03-11
CD44/POU2F2/BCL9L axis mediates MIF-driven SPP1+TAM activation in colorectal cancer metastasis
2026, International journal of biological sciences IF:8.2Q1
研究论文 本研究揭示了在结直肠癌转移中,MIF/CD44/POU2F2/BCL9L信号轴介导SPP1+TAM激活的机制 首次发现MIF/CD44/POU2F2/BCL9L信号轴在SPP1+TAM激活和结直肠癌转移中的关键作用,并识别了潜在的治疗靶点 样本量相对较小(临床组织微阵列n=42),且机制研究主要在体外和动物模型中进行,需要进一步临床验证 探究SPP1+TAMs在结直肠癌转移中的激活机制并识别治疗靶点 结直肠癌细胞、SPP1+肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)、临床结直肠癌患者组织 单细胞组学 结直肠癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 单细胞RNA测序数据、临床组织微阵列数据 临床组织微阵列样本42例 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1447 2026-03-11
Integrated Single-Cell and Bulk RNA Sequencing Reveals the Diagnostic Value of Synovial Tissue Calprotectin and the MDSC-Associated Immune Microenvironment in Periprosthetic Joint Infection
2026, Infection and drug resistance IF:2.9Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序,揭示了钙卫蛋白在人工关节感染滑膜组织中的诊断价值及其与MDSC相关免疫微环境的关系 首次在PJI滑膜组织中全面表征S100A8和S100A9的细胞表达谱,并揭示其与MDSC介导的免疫抑制微环境的紧密关联 样本量相对有限,且主要依赖公共数据库数据,需要进一步独立队列验证 探究人工关节感染(PJI)的诊断生物标志物及其免疫微环境特征 人工关节感染(PJI)患者和对照组的滑膜组织及超声处理液样本 数字病理学 人工关节感染 批量RNA测序, 单细胞RNA测序, 免疫组织化学染色 CellChat算法 RNA测序数据, 图像数据 93例样本(53例PJI患者, 40例无菌性失败对照) NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
1448 2026-03-10
Xiangpi Shengji Ointment Accelerates Anal Fistula Healing by Regulating Macrophage-Fibroblast Crosstalk Through the Nuclear Factor Kappa B/Hypoxia-Inducible Factor Alpha/Vascular Endothelial Growth Factor Signaling Axis
2026, Molecular and cellular biology IF:3.2Q3
研究论文 本研究揭示了象皮生肌膏通过调控NF-κB/HIF-α/VEGF信号轴,促进巨噬细胞M1极化与成纤维细胞功能,从而加速肛瘘愈合的分子机制 首次结合网络药理学、转录组学及单细胞RNA测序技术,系统阐明了象皮生肌膏通过NF-κB/HIF-α/VEGF信号轴调控巨噬细胞-成纤维细胞互作促进肛瘘愈合的新机制 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,其结论在人体中的适用性及临床转化效果仍需进一步验证 探究象皮生肌膏促进肛瘘伤口愈合的分子机制 肛瘘愈合过程、巨噬细胞、成纤维细胞 生物信息学与分子生物学 肛瘘 网络药理学、转录组分析、单细胞RNA测序、CCK-8、ELISA、WB、RT-qPCR NA 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、体外细胞实验数据、体内动物模型数据 使用了公开数据集GSE28914和GSE203244,并建立了小鼠肛瘘模型进行体内验证 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
1449 2026-03-10
Cochlear neural functional competence: an integrative transcriptomic module analysis of excitability, plasticity and microenvironmental support programs
2026, Frontiers in cellular neuroscience IF:4.2Q2
研究论文 本研究通过整合分析多个耳蜗转录组数据集,构建了一个用于评估螺旋神经元功能状态的综合评分框架(CNFC) 提出了一个整合神经元兴奋性、可塑性、营养/代谢支持和损伤/炎症等转录程序的模块化分析框架,并开发了可量化的CNFC评分,超越了传统的神经元存活率预测 MSC治疗的功能性后果尚未明确建立,部分结论仍需进一步机制验证 开发一个从转录组数据中总结耳蜗神经元功能状态的透明、可生成假设的分析框架,以补充传统的存活率指标 螺旋神经元、毛细胞及耳蜗组织 转录组学 听力损失 RNA-seq, 微阵列, 空间转录组学 模块化基因评分框架 转录组数据 多个公开数据集(涵盖发育期、成年期及损伤/退化期样本) NA RNA-seq, 微阵列, 空间转录组学 NA NA
1450 2026-03-09
A spatiotemporal atlas of cerebrovascular development in zebrafish
2026-Jan-31, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究结合原位测序、单细胞转录组学和3D血管重建技术,构建了斑马鱼大脑内皮发育的时空图谱 首次将原位测序、单细胞转录组学和3D血管重建技术整合,实现了分子、细胞和结构尺度的多维度映射,并发现了三个未表征的CapEC富集基因对血管模式和血脑屏障完整性的调控作用 研究仅聚焦于斑马鱼3-11天发育阶段,未覆盖全生命周期;功能验证仅限于三个基因,可能存在其他重要调控因子未被发现 解析脊椎动物脑血管发育的分子和细胞动力学机制 斑马鱼大脑内皮细胞 空间转录组学 NA 原位测序, 单细胞转录组学, 3D血管重建 NA 空间转录组数据, 单细胞转录组数据, 3D成像数据 斑马鱼3-11天发育阶段样本 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
1451 2026-03-09
ACACA modulates R-loop homeostasis to enhance lipid metabolism and microenvironmental interactions in ccRCC
2026-Jan-31, NPJ precision oncology IF:6.8Q1
研究论文 本研究通过整合转录组和临床数据,发现ACACA通过调节R-loop稳态来增强脂质代谢和微环境相互作用,从而驱动透明细胞肾细胞癌的进展 首次揭示ACACA作为R-loop相关代谢驱动因子,连接基因组应激与脂质重编程及肿瘤微环境重塑在ccRCC中的作用机制 研究主要基于公共数据集和体外实验,缺乏大规模临床样本验证和更深入的机制探索 探究R-loop在透明细胞肾细胞癌肿瘤微环境中的作用及其与代谢重编程的关联 透明细胞肾细胞癌(ccRCC)的肿瘤微环境、R-loop结构和ACACA基因 生物信息学与计算生物学 肾细胞癌 转录组测序、单细胞转录组学、空间转录组学、ssGSEA分析 线性机器学习算法 转录组数据、临床数据、单细胞数据、空间转录组数据 公共ccRCC转录组和临床数据集(未明确具体样本数) NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq NA NA
1452 2026-03-09
Single-nucleus multiple-organ chromatin accessibility landscape in the adult rat
2026-Jan-21, GigaScience IF:11.8Q1
研究论文 本研究通过单核ATAC测序技术构建了成年大鼠多器官染色质可及性图谱,识别了77种细胞类型,并分析了细胞类型和器官特异性转录因子、内皮与基质细胞的共享与特异性特征、跨器官巨噬细胞调控状态以及跨物种基因调控程序的保守性与特异性 首次系统性地生成了大鼠多器官单核染色质可及性图谱,填补了该重要生物医学模型生物在此领域的空白,并进行了跨器官和跨物种的细胞类型注释与功能推断 NA 构建大鼠多器官染色质可及性图谱,以解析组织特异性调控机制并支持大鼠模型在系统生物学和生物医学研究中的更广泛应用 成年大鼠(Rattus norvegicus)的9个器官 基因组学 NA 单核ATAC测序(snATAC-seq) NA 染色质可及性数据 超过110,000个细胞,来自9个器官的25个文库 NA 单核ATAC-seq NA NA
1453 2026-03-09
Identification of cancer-associated fibroblasts and analysis of the association of origin with endothelial-to-mesenchymal transition in hepatocellular carcinoma
2026-01, Scandinavian journal of gastroenterology IF:1.6Q3
研究论文 本研究通过免疫组化、免疫荧光和空间转录组学技术,探讨了肝细胞癌中癌症相关成纤维细胞的起源及其与内皮-间质转化的关联 首次结合Visium和Visium HD空间转录组学技术,揭示了内皮细胞通过EndoMT转化为CAFs的潜在机制,并识别了CTGF作为关键分子决定因素 样本量较小(仅57例HCC组织),且研究主要基于间接组织分布观察和相关性分析,缺乏直接的体内功能验证 探究肝细胞癌中癌症相关成纤维细胞的细胞起源及其分子决定因素,以期为HCC的分子靶向治疗提供依据 肝细胞癌组织样本及其中的癌症相关成纤维细胞和内皮细胞 数字病理学 肝细胞癌 免疫组织化学染色、免疫荧光双染色、空间转录组学 NA 组织图像、空间转录组数据 57例肝细胞癌组织 10x Genomics 空间转录组学 Visium, Visium HD Visium和Visium HD空间转录组学平台
1454 2026-03-09
Unveiling the Role of SLC6A17 in Lung Adenocarcinoma: Prognosis, Pathways, and Therapeutic Implications
2026, Current medicinal chemistry IF:3.5Q2
研究论文 本研究通过生物信息学分析和实验验证,揭示了SLC6A17基因在肺腺癌中的异常表达、预后价值、相关通路及治疗意义 首次系统性地研究了SLC6A17在肺腺癌中的表达模式、预后关联、免疫浸润相关性及药物反应,并利用单细胞测序数据进行了深入分析 研究主要基于公共数据库和细胞系数据,缺乏大规模临床样本的直接验证,且机制研究有待进一步深入 阐明SLC6A17在肺腺癌中的作用,评估其作为预后生物标志物和免疫治疗靶点的潜力 肺腺癌患者数据、细胞系 生物信息学 肺癌 生物信息学分析、qRTPCR、单细胞测序数据分析 NA 基因表达数据、临床数据、单细胞测序数据 TCGA数据库中的肺腺癌患者数据、GSE87340数据集、多种细胞系 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1455 2026-03-09
Identification of public neoantigens with broad HLA class I coverage as candidates for off-the-shelf cancer vaccine development in colorectal cancer
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过整合TCGA突变数据和HLA I类结合预测,开发了一个结直肠癌特异性、即用型新抗原面板,并在越南患者队列中进行了功能验证 开发了一个针对亚洲和高加索人群、具有广泛HLA I类覆盖的结直肠癌即用型新抗原面板,并首次在越南患者队列中对TP53_R273H新抗原进行了功能免疫原性验证 研究队列规模有限(n=67),功能验证仅在7名患者中进行,需要更大规模、多人群的临床研究来确认面板的普适性和疗效 开发一种具有广泛人群覆盖和功能验证的即用型癌症疫苗新抗原面板,用于结直肠癌免疫治疗 结直肠癌患者,特别是亚洲和高加索人群,以及患者来源的CD8⁺ T细胞 癌症免疫学 结直肠癌 TCGA突变数据分析,HLA I类结合预测,IFN-γ ELISpot检测,单细胞RNA测序 NA 基因组突变数据,HLA分型数据,免疫反应功能数据,单细胞转录组数据 TCGA数据库的结直肠癌突变数据,越南结直肠癌患者队列(n=67),其中7名患者进行了功能验证 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1456 2026-03-09
PAH-former: Transfer learning for efficient discovery of pulmonary arterial hypertension-associated genes
2026, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 本研究开发了一个名为PAH-former的迁移学习平台,用于从有限的公开单细胞RNA测序数据中高效发现与肺动脉高压相关的基因 通过微调Geneformer深度学习模型,创建了专门针对肺动脉高压的PAH-former模型,并利用其进行计算机模拟扰动分析来识别新的疾病相关基因 研究依赖于公开可用的有限患者样本数据,且体外验证仅在人类肺动脉内皮细胞中进行 高效识别肺动脉高压的新型功能相关疾病基因 肺动脉高压相关的基因 机器学习 肺动脉高压 单细胞RNA测序 深度学习模型(基于Geneformer) 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1457 2026-03-08
Liver Macrophage Changes during Early Adaptation to Alcohol Exposure
2026-Jan, The American journal of pathology
研究论文 本研究探讨了酒精暴露早期对小鼠和人类肝脏巨噬细胞(包括Kupffer细胞和浸润巨噬细胞)的影响,揭示了其表型变化和炎症反应动态 首次通过单细胞RNA测序结合流式细胞术和体外细胞培养,系统比较了酒精暴露早期小鼠Kupffer细胞与浸润巨噬细胞的表型变化,并在人类肝脏中验证了无肝病状态下的类似表型转变 研究主要关注早期酒精暴露效应,未探讨长期酒精摄入或已形成肝病的情况,且人类样本来源于尸检和移植患者,可能无法完全代表健康人群 阐明酒精暴露早期肝脏巨噬细胞(特别是Kupffer细胞与浸润巨噬细胞)的表型变化及其在维持肝脏稳态中的作用 小鼠模型(Lieber-Decarli乙醇饮食)和人类肝脏组织(来自尸检和移植患者的不同酒精表型个体) NA 酒精相关性肝病 流式细胞术、体外细胞培养、单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据、流式细胞数据、组织学数据 未明确具体数量,包括小鼠模型和人类肝脏组织样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1458 2026-03-07
CEBPB Expression in Tumor Cells Drives Immune Evasion in Colorectal Cancer via CTLA4 Up-regulation in T Cells
2026, Cancer communications (London, England)
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了结直肠癌中CEBPB表达如何通过上调T细胞中的CTLA4驱动免疫逃逸 首次发现肿瘤细胞中CEBPB表达与T细胞CTLA4上调之间的直接关联,并阐明p53突变通过CEBPB介导的免疫抑制机制 研究主要基于小鼠模型和细胞共培养实验,人类样本验证相对有限,且机制细节需进一步探索 阐明结直肠癌免疫逃逸的分子机制 结直肠癌患者肿瘤组织、小鼠模型及细胞系 单细胞测序 结直肠癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 30名结直肠癌患者肿瘤组织及小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1459 2026-03-07
Multi-omics profiling of sodium-overload (NECSO) programs identifies NEK8 as a central driver of colorectal cancer progression through single-cell and spatial transcriptomics
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞和空间转录组学分析,揭示了钠超载细胞死亡程序在结直肠癌进展中的核心作用,并识别NEK8为关键驱动因子 首次整合单细胞RNA测序和空间转录组学来研究NECSO程序在结直肠癌中的作用,并开发了一个基于NECSO的五基因预后模型 研究主要基于TCGA和GEO数据集进行验证,可能缺乏前瞻性临床队列的独立验证 探究钠超载细胞死亡程序在结直肠癌进展中的作用及其与免疫调节的关联 结直肠癌患者样本和细胞系 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学 LASSO-Cox回归模型 基因表达数据, 空间转录组数据 TCGA和GEO数据集中的结直肠癌样本 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
1460 2026-03-07
Systematic Comparison of Droplet-Based and Microwell-Based Platforms for Comprehensive Single-Cell Transcriptomic Analysis in Clinical Samples
2026, IET nanobiotechnology IF:3.8Q3
研究论文 本研究系统比较了基于液滴和微孔板的单细胞RNA测序平台在临床样本分析中的性能,揭示了平台间在mRNA偏好、细胞类型恢复和基因表达模式等方面的差异 首次在临床样本中全面比较了基于液滴和微孔板的scRNA-seq平台,揭示了平台特异性技术偏差对数据解释的影响,为跨平台数据整合提供了新见解 研究可能未涵盖所有临床样本类型或平台变体,且批次效应校正后仍存在残留差异 比较不同单细胞RNA测序平台在临床样本分析中的性能差异,以优化平台选择和数据整合策略 临床样本(具体肿瘤类型未明确说明) 单细胞转录组学 肿瘤 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA 基于液滴和基于微孔板的scRNA-seq平台
回到顶部