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当前共找到 1921 篇文献,本页显示第 1381 - 1400 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1381 2026-02-05
Hypoxia-Induced Osteopontin-Positive Glioma-Associated Macrophages Facilitate Glioma Mesenchymal Transition via NF-κB Pathway Activation
2026, Cancer communications (London, England)
研究论文 本研究揭示了缺氧诱导的骨桥蛋白阳性胶质瘤相关巨噬细胞通过NF-κB通路促进胶质母细胞瘤间质转化的机制 首次发现缺氧通过H3K4me3-WDR5表观遗传轴诱导巨噬细胞表达骨桥蛋白,并阐明这些OPN阳性GAMs通过分泌OPN激活CD44/NF-κB/PD-L1通路促进胶质瘤间质转化 研究主要基于体外和动物模型,临床样本验证相对有限,且未深入探讨其他缺氧相关因子在GAMs调控中的作用 阐明缺氧条件下胶质瘤相关巨噬细胞促进胶质母细胞瘤进展的分子机制 胶质母细胞瘤细胞、胶质瘤相关巨噬细胞、临床胶质瘤样本 数字病理学 胶质母细胞瘤 转录组测序、单细胞RNA测序、空间转录组分析、染色质免疫沉淀、实时定量PCR、Western印迹、免疫荧光 NA RNA测序数据、空间转录组数据、蛋白质印迹数据、免疫荧光图像 未明确说明具体样本数量,但包含临床样本和体内模型 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
1382 2026-02-05
CXCL8/SDC1 axis mediates tumor stem cell interactions to drive remote transfer in thyroid cancer
2026-Jan, Journal of pharmaceutical analysis IF:6.1Q1
研究论文 本研究通过单细胞和空间转录组测序,揭示了CXCL8/SDC1轴通过激活JAK-STAT信号通路驱动甲状腺癌干细胞自我更新和远处转移的分子机制 首次在甲状腺癌中利用单细胞和空间转录组测序技术,结合功能实验和动物模型,系统阐明了CXCL8/SDC1轴介导肿瘤干细胞与单细胞互作网络促进远处转移的新机制 研究主要基于体外细胞系和动物模型,临床样本验证的队列规模未明确说明,且缺乏对CXCL8/SDC1轴靶向治疗的深入药效学评估 探究甲状腺癌远处转移的分子机制,并寻找潜在的治疗靶点 甲状腺癌患者肿瘤样本、FTC-238细胞系、裸鼠模型 数字病理学 甲状腺癌 单细胞RNA测序、空间转录组测序、肿瘤组织转录组分析、ELISA、Western blotting、球体形成实验、集落形成实验、CCK-8实验、Transwell实验 NA 单细胞转录组数据、空间转录组数据、批量转录组数据、临床数据 甲状腺癌患者肿瘤样本(具体数量未明确)、FTC-238细胞系、裸鼠模型 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
1383 2026-02-05
IER3 Promotes Malignant Progression of Colorectal Cancer Through the NF-κB Pathway
2026, International journal of genomics IF:2.6Q2
研究论文 本研究揭示了应激反应基因IER3通过激活NF-κB通路,驱动结直肠癌恶性进展并重塑免疫抑制性肿瘤免疫微环境 首次在单细胞分辨率上鉴定出与侵袭性疾病和不良预后相关的IER3表达恶性亚群,并阐明IER3通过FN1-CD44轴重塑免疫微环境的机制 未明确IER3表达调控的具体上游机制,临床样本量可能有限,动物模型验证需进一步扩展 探究IER3在结直肠癌发病机制和免疫调节中的功能作用 结直肠癌临床样本及体外/体内模型 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 临床样本(具体数量未明确) NA 单细胞RNA-seq NA NA
1384 2026-02-05
Construction of a Mitochondria-Related Gene Diagnostic Model Based on Integrated Multiomics Data and Functional Validation of ANK2 as a Key Regulator in Colorectal Cancer
2026, International journal of genomics IF:2.6Q2
研究论文 本研究通过整合多组学数据,构建了一个基于线粒体相关基因的结直肠癌诊断模型,并验证了ANK2作为关键调控因子的功能 整合TCGA和多个GEO公共数据集的转录组数据与MitoCarta3.0数据库的线粒体相关基因数据,利用LASSO回归和SVM-RFE两种机器学习算法识别关键基因并构建诊断模型,并结合单细胞RNA测序数据和分子生物学实验进行功能验证 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,需要前瞻性临床队列进一步验证模型的诊断效能 开发一种基于线粒体相关基因的新型、高效的结直肠癌分子诊断方法 结直肠癌组织和细胞系 生物信息学 结直肠癌 转录组测序,单细胞RNA测序,qRT-PCR,Western blotting,免疫组化 LASSO回归,SVM-RFE 基因表达数据,单细胞数据 1174个样本(来自TCGA和GEO数据集:GSE21510,GSE44076,GSE9348),以及单细胞数据集GSE245552 NA bulk RNA-seq,单细胞RNA-seq NA NA
1385 2026-02-05
Multi-Omics Evidence Based on Spatial Transcriptomics Data Reveals the Therapeutic Value of Copper Death Genes in Glioblastoma
2026, International journal of genomics IF:2.6Q2
研究论文 本研究基于空间转录组学数据,通过多组学分析揭示了铜死亡基因在胶质母细胞瘤中的治疗价值 首次构建了基于铜死亡相关microRNAs的预后特征模型,并验证其在低级别胶质瘤预后预测和免疫治疗评估中的新框架 研究主要依赖于TCGA和CGGA等公共数据库数据,需要进一步实验验证临床适用性 探索铜死亡相关基因在胶质瘤预后预测和免疫治疗评估中的价值 低级别胶质瘤患者和胶质母细胞瘤细胞 生物信息学 胶质瘤 空间转录组学,多组学分析,单变量Cox回归,Lasso回归,多变量Cox回归,Kaplan-Meier生存分析,基因集富集分析,基因集变异分析 预后特征模型 转录组数据,临床数据,突变数据 TCGA数据库和CGGA外部验证队列的低级别胶质瘤患者样本 NA 空间转录组学 NA NA
1386 2026-02-03
Multi-omics prediction of key proteases regulating scar formation and neural repair after spinal cord injury
2026-Jan-27, Neural regeneration research IF:5.9Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞测序和bulk RNA测序数据,识别了脊髓损伤后调控疤痕形成和神经修复的关键蛋白酶及其作用机制 首次结合多组学数据(单细胞测序与bulk RNA测序)系统识别脊髓损伤后关键蛋白酶,并通过体内外实验验证了选择性抑制关键蛋白酶(如Mmp12和Adam17)可减轻轴突脱髓鞘和纤维疤痕形成,为脊髓损伤治疗提供了新的治疗靶点 研究主要基于小鼠模型,其在人类中的转化应用仍需进一步验证;蛋白酶抑制剂的长期安全性和特异性有待评估 识别调控脊髓损伤后疤痕形成和神经修复的关键蛋白酶及其作用机制,并探索其作为治疗靶点的潜力 脊髓损伤小鼠模型、巨噬细胞、成纤维细胞、单核细胞等免疫与基质细胞 计算生物学与生物信息学 脊髓损伤 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 基因集变异分析, LASSO回归, 随机森林, 加权基因共表达网络分析, 分子对接, 体内外实验 LASSO回归, 随机森林, 机器学习算法 基因表达数据(单细胞与bulk RNA-seq) NA NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
1387 2026-02-03
BMP6 as a therapeutic target for preeclampsia: enhancing trophoblast invasion and vascular mimicry
2026-Jan-23, Cellular and molecular life sciences : CMLS IF:6.2Q1
研究论文 本研究探讨了BMP6通过ID1介导的SERPINE2和PlGF上调促进滋养层细胞侵袭和血管拟态,并发现早期补充BMP6可缓解大鼠子痫前期模型的相关表型 揭示了BMP6通过ID1-SERPINE2/PlGF轴调控滋养层细胞侵袭的新机制,并首次在体内模型中证明早期补充BMP6对子痫前期具有治疗潜力 研究主要基于体外细胞模型和啮齿动物模型,在人类妊娠早期的直接证据尚不充分 阐明BMP6在滋养层细胞侵袭和血管拟态中的调控机制,评估其作为子痫前期治疗靶点的潜力 人原代滋养层细胞、HTR8/SVneo细胞系、子痫前期患者胎盘组织、Ad Flt1诱导的子痫前期大鼠模型 生殖医学与发育生物学 子痫前期 RNA-seq, scRNA-seq, 腺病毒载体技术 NA 基因表达数据、蛋白质数据、生理表型数据 未明确样本数量,包含人类胎盘组织和大鼠模型 NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA NA
1388 2026-02-03
Decoding metabolic reprogramming heterogeneity across bladder cancer stages using single-cell and spatial multi-omics approaches
2026-Jan-21, Computer methods and programs in biomedicine IF:4.9Q1
研究论文 本研究利用单细胞和空间多组学方法解码膀胱癌不同阶段的代谢重编程异质性 首次结合单细胞测序、空间转录组和批量RNA测序数据,系统分析膀胱癌不同阶段代谢重编程异质性,并识别出核黄素代谢通路中的关键预后生物标志物 研究主要基于现有测序数据,实验验证部分相对有限,且样本量可能不足以覆盖所有膀胱癌亚型 分析膀胱癌不同阶段的代谢重编程及其对患者生存的影响 膀胱癌患者的上皮细胞及其亚群 数字病理学 膀胱癌 单细胞测序, 空间转录组测序, 批量RNA测序, RT-qPCR, 孟德尔随机化, 共定位分析 NA 单细胞测序数据, 空间转录组数据, 批量RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq NA NA
1389 2026-02-03
scXDR: drug response prediction across single-cell datasets via heterogeneous network transfer learning
2026-Jan-08, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 本研究提出了一种名为scXDR的异质网络迁移学习模型,用于跨单细胞数据集的药物反应预测 通过异质网络整合药物、基因和细胞间的特征与关联,进行消息传递、特征与结构对齐、结构重建和药物-细胞评分预测,避免了传统方法依赖批量RNA测序与单细胞RNA测序数据整合的局限性 未明确提及模型在处理大规模数据集时的计算效率或对罕见细胞类型的预测能力 提高单细胞水平药物反应预测的准确性,为药物开发和精准治疗提供指导 药物、基因、细胞(包括个体细胞和细胞群) 机器学习 黑色素瘤 单细胞RNA测序 异质网络迁移学习模型 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1390 2026-02-03
Type I interferon drives dysfunction of a distinct CD8+ HLA-DRB1+ T cell subset in systemic lupus erythematosus
2026-Jan-03, medRxiv : the preprint server for health sciences
研究论文 本研究全面表征了系统性红斑狼疮中一个独特的CD8+ HLA-DRB1+ T细胞亚群,揭示了I型干扰素如何驱动其功能失调状态 首次全面表征了SLE中一个独特的CD8+ HLA-DRB1+ T细胞亚群,揭示了I型干扰素通过促进耗竭和损害脱颗粒来驱动其功能失调的机制 研究主要基于外周血样本,对肾脏浸润细胞的验证依赖于现有数据集分析 旨在全面表征系统性红斑狼疮中CD8+ HLA-DRB1+ T细胞的功能和分子特征 系统性红斑狼疮患者和健康对照者的外周血CD8+ T细胞 免疫学 系统性红斑狼疮 流式细胞术、单细胞RNA测序、TCR测序 NA 单细胞转录组数据、TCR序列数据、流式细胞数据 SLE患者和健康对照者的外周血CD8+ T细胞样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1391 2026-02-02
COL14A1 drives ischemic cardiac injury in PCOS: an artificial intelligence-identified biomarker
2026-Jan-31, QJM : monthly journal of the Association of Physicians
研究论文 本研究通过整合多组学数据与人工智能方法,鉴定出COL14A1是多囊卵巢综合征与缺血性心肌病共享的关键生物标志物,并揭示了其在免疫-纤维化轴中的作用机制 首次通过整合多组学数据与105种机器学习模型组合,系统鉴定出连接PCOS与缺血性心脏损伤的共享生物标志物COL14A1,并利用单细胞及空间转录组学解析其细胞特异性与组织定位 研究结论主要基于生物信息学分析与体外数据,缺乏体内实验验证;候选药物罗非昔布的疗效尚未经过临床验证 鉴定PCOS与缺血性心肌病之间的共享诊断生物标志物并阐明其生物学基础 多囊卵巢综合征患者与缺血性心肌病患者的转录组数据 机器学习 心血管疾病 转录组测序,单细胞RNA测序,空间转录组学,分子对接 Elastic Net 基因表达数据 来自多个GEO队列的PCOS与ICM转录组数据集 NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
1392 2026-02-02
Stem cell specification and niche formation in developing incisor require actomyosin forces
2026-Jan-29, Stem cells (Dayton, Ohio)
研究论文 本研究探讨了小鼠切牙发育过程中干细胞规范和生态位形成的精确时间,揭示了肌动球蛋白网络在维持干细胞未分化状态中的作用 首次发现表达Sox2的干细胞样群体在功能生态位形成之前就已存在,并揭示了肌动球蛋白网络产生的收缩张力在限制干细胞位置和维持其干性中的关键作用 研究主要基于小鼠模型,结果在人类或其他物种中的普适性尚不明确,且对肌动球蛋白网络的具体调控机制仍需进一步探索 探究小鼠切牙发育过程中干细胞规范和生态位形成的时间关系及其调控机制 小鼠胚胎切牙的牙上皮组织 发育生物学 NA 遗传谱系追踪,单细胞RNA测序 NA 遗传谱系数据,单细胞RNA测序数据 不同发育阶段的小鼠胚胎切牙样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1393 2026-02-02
Generation of thymus-reconstituting T cell progenitors from human pluripotent stem cells
2026-Jan-26, Cell reports methods IF:4.3Q2
研究论文 本文描述了从人类多能干细胞生成能够直接并长期重建胸腺的T细胞祖细胞的方法 首次在体外从人类多能干细胞工程化出具有胸腺重建能力的T细胞祖细胞,为研究T细胞发育机制和CAR-T细胞疗法提供了新模型 未明确提及实验的局限性,可能包括体内功能验证的深度或长期安全性评估 旨在生成大量能够重建受体免疫系统的T细胞祖细胞,以推进癌症免疫治疗 人类多能干细胞(hPSC)及其衍生的T细胞祖细胞 再生医学 癌症 单细胞转录组分析 NA 转录组数据 NA NA NA NA NA
1394 2026-02-02
Advancing spatial cellular communication inference with ligand diffusion and transport model
2026-Jan-07, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 本研究提出了一种名为SCILD的基于优化框架,用于从空间转录组学数据中以单细胞分辨率推断空间细胞通讯 SCILD整合了配体扩散、竞争性配体-受体结合和浓度衰减,构建了一个统一的优化模型,并利用神经网络建模和计算机扰动预测下游靶基因 NA 开发一种工具以从空间转录组学数据中推断单细胞水平的空间细胞通讯 细胞通讯中的配体-受体相互作用 空间转录组学 NA 空间转录组学 优化框架与神经网络 空间转录组学数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
1395 2026-02-02
Biological and prognostic relevance of A-to-I RNA editing across consensus molecular subtypes of colon cancer
2026-Jan-06, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究探讨了A-to-I RNA编辑在结肠癌共识分子亚型(CMS)中的生物学和预后相关性 首次在结肠癌CMS亚型中系统分析RNA编辑事件,揭示了亚型特异性编辑特征、ceRNA网络及其与肿瘤微环境和化疗耐药性的关联 研究基于100例患者的bulk RNA-seq数据,样本量相对有限;单细胞分析仅来自独立队列的II期患者,可能未覆盖所有疾病阶段 阐明RNA编辑在结肠癌发生发展中的调控作用及其作为生物标志物和治疗靶点的潜力 100例不同疾病阶段的结肠癌患者,以及独立队列的II期结肠癌患者单细胞数据 生物信息学 结肠癌 RNA-seq, 单细胞RNA-seq 多变量Cox比例风险模型, ceRNA网络分析 转录组数据 100例结肠癌患者(bulk RNA-seq)和独立队列的II期结肠癌患者(单细胞RNA-seq) NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
1396 2026-02-02
CellCraft: an extensible visual programming application for gene regulatory network inference
2026-Jan-02, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 本文介绍了一个名为CellCraft的基于Web的应用程序,旨在简化从单细胞RNA测序数据中推断基因调控网络的工作流程 CellCraft提供了直观的图形用户界面和可视化编程接口,简化了复杂多步骤分析的设计与执行,并采用模块化插件架构确保可扩展性 NA 开发一个用户友好且可扩展的应用程序,用于单细胞RNA测序数据集的整合基因调控网络分析 单细胞RNA测序数据 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 基因调控网络推断工具(包括TENET等) 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1397 2026-02-02
Unravelling the progression of the zebrafish primary body axis with reconstructed spatiotemporal transcriptomics
2026-Jan-02, Genome biology IF:10.1Q1
研究论文 本研究提出了一个名为Palette的流程,用于从bulk RNA-seq数据推断详细的空间基因表达模式,并构建了斑马鱼时空表达谱(zSTEP)资源 开发了Palette流程,通过平滑、插值和调整基因表达,利用现有空间转录组数据作为唯一参考,从bulk RNA-seq数据重建高分辨率时空表达谱 方法依赖于现有空间转录组数据作为参考,且当前空间转录组技术本身存在测序深度低和基因检测有限的问题 研究斑马鱼胚胎发育过程中基因表达的时空动态,特别是前后轴发育的调控机制 斑马鱼胚胎 空间转录组学 NA bulk RNA-seq, 空间转录组学 机器学习 RNA-seq数据, 空间转录组数据, 图像数据 三个发育阶段的53个连续切片bulk RNA-seq数据 NA bulk RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
1398 2026-02-02
Tumor-associated macrophage-specific SERPING1 contributes to M1-phenotype transition and suppress colorectal cancer tumorigenesis via NF-κB pathway
2026-Jan, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1
研究论文 本研究探讨了丝氨酸蛋白酶抑制剂SERPING1通过抑制NF-κB通路,促进肿瘤相关巨噬细胞向M1表型极化,从而抑制结直肠癌发生发展的机制 首次揭示了SERPING1在肿瘤相关巨噬细胞中的特异性表达及其通过调控NF-κB通路影响巨噬细胞表型转换的新机制 研究主要基于细胞实验和小鼠模型,临床样本验证和具体信号通路细节有待进一步深入 阐明巨噬细胞在结直肠癌发生发展中的作用机制,特别是SERPING1对肿瘤相关巨噬细胞表型调控的功能 结直肠癌组织、肿瘤相关巨噬细胞、HCT116细胞系、小鼠肿瘤模型 肿瘤免疫学 结直肠癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据、细胞功能实验数据 基于公共单细胞RNA-seq数据集和细胞系实验 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1399 2026-02-02
Multi-omics integration defines an ECM-associated intratumoral heterogeneity signature enabling prognosis assessment and therapeutic stratification in hepatocellular carcinoma
2026-Jan, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1
研究论文 本研究开发了一个基于多组学的肿瘤内异质性评分系统,用于改善肝细胞癌患者的风险分层和指导精准治疗 通过整合体细胞突变数据和单细胞RNA测序数据,建立了一个转录组为基础的肿瘤内异质性特征,并揭示了细胞外基质重塑与高异质性肿瘤的关联 样本量相对有限,单细胞RNA测序仅涉及20个样本,且主要依赖公共数据库和回顾性数据,需要进一步的前瞻性验证 量化肝细胞癌的肿瘤内异质性,以改善患者预后评估和治疗分层 肝细胞癌患者,包括来自TCGA数据库的361例患者和单细胞RNA测序的20个样本 数字病理学 肝细胞癌 单细胞RNA测序,体细胞突变分析,转录组分析 稳健排序聚合 基因组数据,转录组数据 361例TCGA患者和20个单细胞RNA测序样本 NA 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq NA NA
1400 2026-02-02
Exploring the relationship between metabolism and immune microenvironment in breast cancer bone metastasis based on metabolic pathways
2026, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 本研究基于代谢通路探索乳腺癌骨转移中代谢与免疫微环境的关系 从代谢-免疫相互作用角度揭示乳腺癌骨转移的预后代谢通路和关键靶基因,并构建了代谢相关风险模型作为预后预测工具 研究主要依赖于公共数据库的回顾性数据,缺乏实验验证,且样本量有限 阐明乳腺癌骨转移中代谢通路与免疫微环境之间的动态相互作用及其对预后的影响 乳腺癌骨转移患者的RNA-seq数据和临床信息 生物信息学 乳腺癌 RNA-seq, 单细胞RNA测序 风险模型 基因表达数据 来自GEO数据库的乳腺癌骨转移患者样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
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