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当前共找到 1921 篇文献，本页显示第 121 - 140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2026-07-06 |
Mechanisms of immune escape and extramedullary tropism in leukemia cutis
2026-Jan-01, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2025029121
PMID:41026928
|
研究论文 | 通过对急性髓系白血病皮肤外髓浸润（白血病皮肤）的样本进行批量及单细胞转录组分析，揭示了免疫逃逸和髓外趋向的机制 | 首次对白血病皮肤的免疫微环境和白血病表型进行深入分析，发现T细胞耗竭特征与免疫逃逸表型（HLA II类下调）相关，并识别出8种与髓外趋向相关的归巢受体分子 | 样本量较小（10名患者的23份活检样本），且连续免疫检查点阻断治疗的系列样本仅来自1名患者 | 阐明急性髓系白血病髓外趋向的机制，特别是白血病皮肤的免疫逃逸和免疫微环境特征 | 急性髓系白血病患者的皮肤和皮下组织髓外病变样本 | 数字病理学 | 急性髓系白血病 | 转录组测序, 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 10名患者的23份急性髓系白血病皮肤活检样本 | NA | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 122 | 2026-07-05 |
Integrated multi-omics and machine learning identify an interaction between SLC39A11 and phosphoinositide metabolism in deep vein thrombosis
2026-01-22, BMC medical informatics and decision making
IF:3.3Q2
DOI:10.1186/s12911-026-03342-2
PMID:41566314
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研究论文 | 通过整合多组学和机器学习方法，识别深静脉血栓中SLC39A11与磷脂酰肌醇代谢之间的相互作用 | 首次通过多组学（代谢组学和转录组学）与机器学习结合，鉴定SLC39A11和磷脂酰肌醇在深静脉血栓中的关键作用，并利用单细胞RNA测序将SLC39A11定位到M1样巨噬细胞 | 样本量较小（代谢组学62例，转录组学17例，验证集18例，单细胞RNA测序6例），可能影响结果的泛化性；未提及因果关系验证 | 探索深静脉血栓的多组学特征及其调控机制 | 深静脉血栓患者和健康对照者的外周血样本 | 机器学习 | 深静脉血栓 | 非靶向代谢组学, 转录组学, 单细胞RNA测序, 电感耦合等离子体质谱 | 双向正交偏最小二乘法, 机器学习算法 | 代谢组学数据, 转录组学数据, 单细胞RNA测序数据 | 代谢组学62例, 转录组学17例, 验证集18例, 单细胞RNA测序6例 | 未提供 | 非靶向代谢组学, 转录组学, 单细胞RNA测序 | 未提供 | 未提供 |
| 123 | 2026-07-04 |
S100A8/A9 Promotes Fibrosis in Iatrogenic Laryngotracheal Stenosis
2026-01, The Laryngoscope
DOI:10.1002/lary.70008
PMID:40776636
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和免疫荧光技术发现S100A8/A9在医源性喉气管狭窄中高表达，并在小鼠模型中证实其促进纤维化作用 | 首次通过体内实验明确S100A8/A9促进医源性喉气管狭窄纤维化的机制，并揭示其下游调控蛋白MYD88的参与 | 仅在小鼠模型验证，未在人样本中进行干预实验；样本量较小且未阐明S100A8/A9与其他免疫介质的相互作用 | 阐明S100A8/A9在医源性喉气管狭窄发病机制中的作用 | 人类喉气管狭窄组织标本及医源性喉气管狭窄诱导的小鼠模型 | 数字病理学 | 喉气管狭窄 | 单细胞RNA测序, 免疫荧光, 基因表达分析 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | 人类标本（具体数量未说明）；小鼠模型（每组数量未说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 124 | 2026-07-04 |
Artificial Intelligence in single-cell and spatial transcriptomics data analyses
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2026.01.011
PMID:41986013
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综述 | 探讨人工智能在单细胞和空间转录组学数据分析中的应用 | 系统综述了AI方法（如CNN、GNN和VAE）在预处理、降维、细胞分类、整合多组学及推断细胞轨迹中的应用，并聚焦于癌症生物学、免疫学和神经科学领域 | 存在可扩展性、可解释性和数据标准一致性不足的挑战 | 提供AI推动单细胞和空间转录组学数据解析的全面指南 | 单细胞和空间转录组学数据集及AI分析方法 | 机器学习 | 癌症、免疫疾病、神经疾病 | 单细胞转录组测序、空间转录组测序 | 卷积神经网络、图神经网络、变分自编码器 | 基因表达数据、空间转录数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 125 | 2026-07-04 |
AI-driven gene-sets, networks, pathways, and interactions analyses of multi-omics data
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2026.01.023
PMID:41986006
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研究论文 | 介绍了PAGER 3.0知识生态系统，用于分析多组学数据中的基因集、网络、通路和相互作用 | PAGER 3.0在PAGER知识生态系统中实现了重大进步，提供扩展且精心策划的通路、注释基因列表和基因签名(PAGs)集合、本体感知的知识导航、加权富集分析和结构化基于网络的优先级排序工具 | NA | 介绍PAGER 3.0的概念基础、架构和分析工作流程，并通过白血病单细胞转录组学案例研究证明其实用性 | 多组学数据中的基因集、通路、网络和相互作用 | 生物信息学 | 白血病 | 单细胞转录组学 | NA | 组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 126 | 2026-07-03 |
MicroRNAs as potential prognostic biomarkers in acute lymphoblastic leukemia: a systematic review, meta-analysis, and bioinformatics study
2026-Jan-29, Systematic reviews
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s13643-026-03083-3
PMID:41612480
|
系统综述与荟萃分析 | 通过系统综述、荟萃分析和生物信息学方法评估微小RNAs作为急性淋巴细胞白血病预后生物标志物的潜力 | 结合ceRNA网络和单细胞RNA测序分析验证的靶基因，扩展了miRNAs作为ALL预后标志物的研究 | 需要大型多中心试验确认，且miRNAs作用具有情境依赖性 | 评估微小RNAs作为急性淋巴细胞白血病预后生物标志物的价值 | ALL患者中miRNA表达与生存期的关联 | 生物信息学 | 急性淋巴细胞白血病 | 单细胞RNA测序, ceRNA网络分析 | NA | 基因表达数据 | 22项研究，共计1974例患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 127 | 2026-07-03 |
Exosome RAB10 inhibits JAK1/STAT1 to hinder macrophage M1 polarization and promote tumor immune escape
2026-Jan-26, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-026-02681-x
PMID:41588435
|
研究论文 | 研究乳腺肿瘤细胞通过外泌体传递RAB10抑制JAK1/STAT1通路，阻碍巨噬细胞M1极化并促进肿瘤免疫逃逸的机制 | 首次揭示外泌体RAB10通过结合干扰素受体IFNAR1抑制JAK1/STAT1磷酸化，调控巨噬细胞极化方向，并发现联合靶向RAB10和PD-L1可产生协同抑瘤效应 | 未详细说明RAB10在耐药乳腺癌细胞中上调的具体机制，以及外泌体RAB10对其他免疫细胞的影响 | 探讨外泌体介导的肿瘤-巨噬细胞互作机制，特别是RAB10在巨噬细胞极化及肿瘤免疫逃逸中的作用 | 乳腺癌细胞（耐药与非耐药）、巨噬细胞、CD8⁺ T细胞、小鼠肿瘤模型 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 128 | 2026-07-03 |
scSuperAnnotator: a platform for benchmarking comparison and visualizing automated cellular annotation methods for scRNA-seq data
2026-Jan-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1470
PMID:41495899
|
研究论文 | 开发了一个整合多种自动化细胞注释方法的单细胞RNA-seq数据在线平台scSuperAnnotator | 首个集成了基于标记基因和基于参考的多种细胞类型识别方法的在线平台，提供一键式注释和分析功能，无需编程知识 | 未提及具体局限性 | 为解决单细胞RNA-seq数据中自动化细胞类型注释方法缺乏集成平台的问题 | 单细胞RNA-seq数据中的细胞类型 | 机器学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 129 | 2026-07-03 |
A Transcriptional Map of Human Tonsil Architecture: Beyond the Sum of (Single Cell) Parts
2026-01, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.70121
PMID:41518352
|
研究论文 | 利用成像型空间转录组学绘制人类扁桃体结构转录图谱，超越单细胞RNA-seq的细胞组成分析 | 建立了一个强调空间组织、细胞相互作用和功能的通用分析流程，揭示了扁桃体中52个细胞亚群的空间分布和信号通路活性 | 数据仍面临分析挑战且缺乏标准化，未明确提及 | 展示成像型空间转录组学在研究组织微环境和免疫反应中的优势，并提供空间免疫学的分析框架 | 人类扁桃体组织中的200万个细胞和52个细胞亚群 | 计算病理学 | 淋巴瘤 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组图像 | 人类扁桃体组织样本 | NA | 空间转录组学 | 成像型空间转录组学平台 | 基于成像的空间转录组学技术 |
| 130 | 2026-07-03 |
Single-Cell RNA Sequencing Revealing Dysregulated Perturbations of Tregs in Psoriasis and Construction of a Treg-Related Diagnostic Model via a 101- Combination Machine Learning Computational Framework
2026, Endocrine, metabolic & immune disorders drug targets
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序揭示银屑病中调节性T细胞的失调扰动，并通过101种组合机器学习框架构建Treg相关诊断模型 | 首次整合单细胞转录组学与101种机器学习算法构建银屑病Treg相关诊断模型，揭示Treg在银屑病中的代谢重编程、分化停滞及IL-16-CD4自分泌信号等新机制 | 未提及具体局限性，但可能包括样本量有限、体外模型验证的局限性及诊断模型需进一步临床验证 | 解析银屑病中Treg的细胞异质性和功能失调，并开发基于Treg相关基因的高准确度诊断模型 | 银屑病患者皮损及健康对照皮肤的Treg细胞单细胞转录组数据 | 机器学习 | 银屑病 | scRNA-seq, LASSO, XGBoost, hdWGCNA | LASSO, XGBoost, 多种机器学习算法 | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本量，涉及银屑病患者和健康对照的皮肤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 131 | 2026-07-03 |
Mechanistic Investigation of Nitidine Chloride-Mediated Anti-Colorectal Cancer Activity: Centromere-Associated Protein E Targeting via Integrated Molecular Dynamics, Spatial Transcriptomic and Single-Cell Approaches
2026 Jan-Dec, IET systems biology
IF:1.9Q3
DOI:10.1049/syb2.70054
PMID:41607031
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研究论文 | 通过整合分子动力学模拟、空间转录组学和单细胞RNA测序技术，系统性研究氯化两面针碱通过靶向着丝粒相关蛋白E发挥抗结直肠癌活性的分子机制 | 首次综合运用单细胞RNA测序、空间转录组学、大规模mRNA队列分析和免疫组化等多种先进技术全面表征CENPE在结直肠癌中的表达模式，并结合分子动力学模拟阐明氯化两面针碱与CENPE的结合模式 | 氯化两面针碱下调CENPE mRNA和蛋白质水平的结果需在更多实验系统中进一步验证 | 阐明氯化两面针碱与着丝粒相关蛋白E之间的相互作用机制，为开发基于中药活性成分的结直肠癌精准治疗方法提供科学依据 | 氯化两面针碱与着丝粒相关蛋白E的相互作用及其在结直肠癌中的作用机制 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 分子动力学模拟, 实时定量聚合酶链反应, 免疫组化 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据 | 大规模mRNA队列分析（具体样本量未明确）、结直肠癌细胞系和异种移植模型 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 132 | 2026-07-03 |
Cancer-Associated Fibroblasts in Prostate Cancer: Unraveling Mechanisms and Therapeutic Implications
2026, Oncology research
IF:2.0Q3
DOI:10.32604/or.2025.073265
PMID:41613792
|
综述 | 综述前列腺癌中癌症相关成纤维细胞（CAFs）的起源、异质性、功能机制及治疗意义，特别关注肿瘤微环境调控与治疗抵抗 | 整合单细胞和空间转录组学最新进展，系统阐述CAFs在前列腺肿瘤微环境中的表型异质性及空间分布，并提出基质重编程作为辅助治疗的新策略 | 未提及具体的数据分析限制或研究空白，可能缺乏对CAFs靶向策略临床转化挑战的深入讨论 | 全面解析前列腺癌中CAFs的生物学机制，为靶向CAFs的治疗提供理论基础 | 前列腺癌微环境中的癌症相关成纤维细胞（CAFs） | 自然语言处理 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 133 | 2026-07-03 |
MAPRE2 is associated with macrophage-enriched innate immune dysregulation and malignant phenotypes in hepatocellular carcinoma
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1849407
PMID:42220486
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研究论文 | 通过多组学孟德尔随机化等方法，发现MAPRE2与肝细胞癌中巨噬细胞富集的先天免疫失调及恶性表型相关 | 首次整合双样本孟德尔随机化与多组学分析（包括转录组、蛋白质组、DNA甲基化和单细胞RNA测序），系统揭示MAPRE2在肝细胞癌中的风险增加作用及其与先天免疫微环境的关联 | 缺乏体内实验、移植队列和外部预后验证，且高频体细胞扩增罕见，需进一步功能验证 | 探究MAPRE2在肝细胞癌恶性行为与先天免疫微环境中的分子机制及潜在生物标志物和治疗靶点 | 肝细胞癌患者样本（包括肿瘤组织、血液）及HepG2和MHCC97细胞系 | 机器学习和生物信息学 | 肝细胞癌 | 孟德尔随机化、RNA-seq、DNA甲基化测序、单细胞RNA测序、功能缺失实验 | NA | 转录组数据、蛋白质组数据、甲基化数据、单细胞RNA测序数据 | 两个样本的孟德尔随机化使用公开eQTL和pQTL数据，肿瘤转录组学分析多个队列（具体数量未提及），单细胞RNA测序数据来自公开数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 134 | 2026-07-03 |
Immune-tumor cell ligand-receptor axes driving metabolic reprogramming and therapeutic resistance in cancer
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1864068
PMID:42382771
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综述 | 综述免疫-肿瘤细胞配体-受体轴如何驱动癌症代谢重编程和治疗耐药 | 系统阐述了免疫-肿瘤细胞配体-受体信号轴在代谢重编程和治疗耐药中的核心驱动作用，并整合单细胞转录组学、空间组学等多技术进展来揭示相关耐药微环境 | 未明确指出具体研究局限性，可能包括对配体-受体轴的机制验证不足或缺乏大规模临床转化证据 | 探讨免疫-肿瘤细胞配体-受体轴在驱动癌症代谢适应和治疗耐药中的作用及技术解析方法 | 肿瘤微环境中的免疫细胞与肿瘤细胞之间的配体-受体信号交互 | 机器学习和计算生物学 | NA | 单细胞转录组学，空间组学，多重成像，代谢组学，计算建模 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学，代谢组学 | NA | NA |
| 135 | 2026-07-03 |
Identification of MTFR1 as a Novel Prognostic Biomarker and Putative Oncogene for Breast Cancer: A Multi-Omics Analysis and in Vitro Experimental Validation
2026 Jan-Dec, IET systems biology
IF:1.9Q3
DOI:10.1049/syb2.70080
PMID:42386672
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研究论文 | 通过多组学分析、空间转录组学和单细胞测序，系统鉴定MTFR1作为乳腺癌的新型预后生物标志物和假定致癌基因，并进行了体外实验验证 | 首次全面整合多组学数据、空间转录组学和单细胞测序揭示MTFR1在乳腺癌中的功能和临床意义，并发现其在抗PD-1免疫治疗过程中的预测性能优于治疗前 | 未提及具体局限性 | 探讨MTFR1在乳腺癌中的表达模式、生物学功能及其作为预后生物标志物和治疗靶点的潜力 | 乳腺癌组织样本及恶性细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 多组学分析,空间转录组学,单细胞测序 | NA | 多组学数据,空间转录组数据,单细胞测序数据 | NA | NA | 空间转录组学,单细胞测序 | NA | NA |
| 136 | 2026-07-02 |
Single-cell spatial transcriptomics uncovers niches that govern response to PD-1/PD-L1 blockade in cutaneous squamous cell carcinoma
2026-Jan-30, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-014067
PMID:41617396
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研究论文 | 利用单细胞空间转录组学揭示决定皮肤鳞状细胞癌对PD-1/PD-L1阻断治疗反应的微环境 | 首次通过单细胞空间转录组学在1.7mm组织芯中识别出六种空间微环境，其预测免疫治疗反应的能力优于PD-L1状态 | 样本量较小（27例患者），且未说明微环境标志物在独立队列中的验证情况 | 探究皮肤鳞状细胞癌对PD-1/PD-L1阻断治疗产生耐药性的机制并预测治疗反应 | 接受新辅助PD-1/PD-L1阻断治疗的晚期皮肤鳞状细胞癌患者 | 数字病理学 | 皮肤鳞状细胞癌 | 单细胞空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 27例患者，来自两个II期试验的三个队列 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 1.7mm组织芯微阵列的单细胞空间转录组分析 |
| 137 | 2026-07-02 |
Targeting PKMYT1 enhances antitumor immune responses to PD-L1 blockade in castration-resistant prostate cancer
2026-Jan-30, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-013247
PMID:41617394
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研究论文 | 该文章研究了靶向PKMYT1增强抗肿瘤免疫反应，克服去势抵抗性前列腺癌对PD-L1免疫疗法的耐药性 | 首次揭示PKMYT1在去势抵抗性前列腺癌中作为肿瘤进展和免疫逃逸的双重调控因子，提出靶向PKMYT1联合PD-L1阻断可重新编程肿瘤免疫微环境 | 未提及具体局限性，但基于临床前模型，需进一步验证在人类患者中的疗效和安全性 | 探究PKMYT1在前列腺癌免疫逃逸中的作用机制，并开发靶向策略以增强免疫检查点阻断疗法的效果 | 去势抵抗性前列腺癌细胞系、临床标本及小鼠模型 | 机器学习 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, 免疫组化 | NA | 基因组学数据, 转录组学数据 | 公共数据库数据集及临床队列前列腺癌标本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 138 | 2026-07-02 |
Integrated single-cell and bulk RNA sequencing unravels neutrophil heterogeneity and validates SPP1 as a prognostic biomarker in cervical cancer
2026-Jan-30, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-026-15636-9
PMID:41612311
|
research paper | 通过整合单细胞和批量RNA测序，揭示了宫颈癌中中性粒细胞的异质性，并验证了SPP1作为预后生物标志物 | 首次全面描绘宫颈癌微环境中中性粒细胞的异质性，并确定SPP1-CD44轴作为中性粒细胞与肿瘤细胞交互的关键介质，同时基于风险分层构建了稳健的预后模型 | 未明确提及，但可能包括样本量有限、仅依赖公开数据库数据，以及缺乏体内功能验证 | 研究宫颈癌中中性粒细胞的异质性及其在肿瘤微环境中的作用，并识别新的预后生物标志物 | 宫颈癌组织样本的单细胞RNA测序数据和批量RNA测序数据 | machine learning, digital pathology | cervical cancer | RNA-seq, scRNA-seq, bulk RNA-seq | LASSO-Cox regression | gene expression data | GSE208653数据集包含5个宫颈癌组织的单细胞样本，TCGA-CESC和GTEx数据库的批量RNA-seq数据 | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 139 | 2026-07-02 |
Deep neural network-based biostatistical analysis for disease marker screening
2026-Jan-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-34115-y
PMID:41611762
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研究论文 | 提出一种基于深度神经网络（DNN）的新型生物标志物筛选框架，并在乳腺癌数据集上验证其优于传统统计方法，同时结合注意力机制和SHAP值分析提升模型可解释性 | 将DNN与注意力机制及SHAP值分析相结合，设计可扩展的多组学数据整合框架，提升生物标志物筛选的准确性和可解释性，并具有跨疾病应用的潜力 | 未明确说明局限，但可推断为可能依赖特定数据集、计算资源需求高或可解释性仍有提升空间 | 开发一种优于传统统计方法的深度神经网络框架，用于生物标志物筛选，并提升模型的可解释性和实际应用潜力 | 乳腺癌疾病相关的生物标志物 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞测序 | 深度神经网络 | 单细胞测序数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 140 | 2026-07-02 |
Preventing surgery-induced natural killer cell suppression and metastases by inhibiting PI3K-gamma signaling in myeloid-derived suppressor cells
2026-Jan-29, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-013304
PMID:41611243
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研究论文 | 该研究揭示了术后髓系来源的抑制细胞通过PI3K-γ信号通路抑制自然杀伤细胞活性并促进癌症转移的机制 | 首次通过单细胞RNA测序和功能实验证明PI3K-γ信号在术后MDSC介导的免疫抑制中起关键作用，并筛选出PI3K-γ抑制剂作为潜在治疗策略 | 研究主要基于体外实验和小鼠模型，临床转化仍需进一步验证；样本量有限且未涉及不同癌症类型的比较 | 阐明术后MDSC的表型及其对NK细胞的抑制作用，并探索针对性的治疗策略 | 55例接受手术的癌症患者的外周血样本及小鼠术后转移模型 | 数字病理学 | 癌症 | 多色流式细胞术、单细胞RNA测序、小分子化合物库筛选、小鼠模型分析 | NA | 基因表达数据、细胞表型数据、动物模型数据 | 55例癌症患者的外周血样本及小鼠术后转移模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |