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当前共找到 1921 篇文献，本页显示第 1321 - 1340 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1321 | 2026-02-08 |
Uncovering the role of integrated stress in Alzheimer's disease through single-cell and transcriptomic analysis
2026-Jan-06, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-34997-6
PMID:41495191
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞测序和转录组数据，探索阿尔茨海默病中整合应激反应的分子机制 | 结合LASSO回归和随机森林算法筛选出六个关键基因，并揭示了它们与炎症通路及免疫细胞浸润的关联 | 研究样本量有限，且主要基于公共数据集分析，需要进一步实验验证 | 探索阿尔茨海默病中整合应激反应的分子机制及其临床意义 | 阿尔茨海默病患者和正常对照的脑细胞及血液样本 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞测序, 转录组分析 | LASSO回归, 随机森林 | 基因表达数据 | GSE264648数据集49例，GSE48350数据集253例，另加临床验证样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组测序 | NA | NA |
| 1322 | 2026-01-06 |
A pseudouridine-related prognostic model of colorectal cancer based on single-cell sequencing analysis and transcriptome analysis
2026-Jan-04, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-34933-0
PMID:41486187
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1323 | 2026-02-08 |
A human pathophysiological 3D-bone marrow model reveals immune and stromal cell heterogeneity
2026-Jan-03, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-09433-6
PMID:41484482
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研究论文 | 本研究开发了一种标准化的三维人类骨髓模型，用于模拟骨髓微环境的关键特征并研究其生理和病理状态下的细胞动态 | 首次构建了能够模拟人类骨髓微环境异质性的标准化三维模型，并利用单细胞转录组学揭示了基质细胞和内皮细胞的异质性 | 模型仍需进一步验证其在更广泛疾病背景下的适用性，且长期培养效果有待更多数据支持 | 研究人类骨髓微环境中免疫细胞和基质细胞的异质性及其在病理状态下的动态变化 | 骨髓微环境中的基质细胞、内皮细胞、免疫细胞和造血祖细胞 | 单细胞组学 | 急性髓系白血病 | 单细胞转录组测序 | 三维骨髓模型 | 单细胞转录组数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1324 | 2026-02-08 |
ASTRO: Automated Spatial-Transcriptome whole RNA Output
2026-Jan-03, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf688
PMID:41495477
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研究论文 | 本文介绍了一种名为ASTRO的自动化流程，用于处理空间转录组学数据，特别优化了针对FFPE样本的全转录组分析 | 开发了首个专门针对FFPE样本空间转录组数据处理的自动化流程，能够同时检测编码和非编码RNA（如miRNA），并通过优化空间条形码识别和过滤步骤提高映射率 | 未明确说明该流程在其他样本类型或技术平台上的适用性限制 | 解决FFPE样本空间转录组数据分析的挑战，实现全转录组的空间定量分析 | 福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）组织样本 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 自动化数据处理流程 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1325 | 2026-02-08 |
scSNViz: visualization and analysis of cell-specific expressed SNVs
2026-Jan-03, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag023
PMID:41533688
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研究论文 | 介绍了一个名为scSNViz的R包，用于从单细胞RNA测序数据中探索、量化和可视化表达的单核苷酸变异 | 开发了一个专门针对单细胞水平表达SNVs的综合可视化与分析工具，填补了现有工具在单细胞变异表达模式研究方面的空白 | 未在摘要中明确提及具体限制，但可能依赖于现有单细胞分析框架的准确性 | 旨在促进对单细胞水平表达遗传变异的理解，包括转录异质性、等位基因调控和突变动力学 | 单细胞RNA测序数据中的表达单核苷酸变异 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1326 | 2026-02-08 |
Squidiff: predicting cellular development and responses to perturbations using a diffusion model
2026-Jan, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-025-02877-y
PMID:41184550
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研究论文 | 本文介绍了一种基于扩散模型的生成框架Squidiff，用于预测不同细胞类型在环境变化下的转录组变化 | Squidiff通过连续去噪和语义特征集成，学习瞬态细胞状态，并预测跨时间和条件的高分辨率转录组景观 | NA | 预测细胞在环境刺激下的转录组变化，并阐明潜在的疾病机制 | 单细胞转录组数据 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 扩散模型 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1327 | 2026-02-08 |
KRAS Withdrawal in Cholangiocarcinoma Leads to Immune Infiltration and Tumor Regression
2026-Jan, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202511312
PMID:41332325
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研究论文 | 本研究通过构建条件性KRAS基因敲除的胆管癌小鼠模型，揭示了KRAS抑制导致肿瘤显著消退并伴随免疫细胞浸润的机制 | 首次利用转座子系统与CRISPR-Cas9技术构建了条件性TRE.Kras/Trp53敲除胆管癌小鼠模型，并系统揭示了KRAS抑制通过激活CD8 T细胞和诱导细胞衰老导致肿瘤消退的免疫机制 | 研究主要基于小鼠模型，其结论在人类胆管癌中的适用性仍需进一步验证；缺乏长期疗效观察数据 | 探究KRAS抑制在胆管癌治疗中的作用机制及潜在治疗价值 | 条件性KRAS/TP53敲除胆管癌小鼠模型、TKP细胞系 | 肿瘤免疫学 | 胆管癌 | CRISPR-Cas9基因编辑、单细胞RNA测序、bulk RNA测序、免疫组化、共聚焦免疫荧光、细胞因子阵列、慢病毒过表达 | 条件性基因敲除小鼠模型、同种移植模型 | 基因表达数据、免疫染色图像、细胞因子分泌数据 | 未明确说明具体样本数量，但包含小鼠模型和细胞系实验 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1328 | 2026-02-07 |
Bulk Sequencing Combined With Single-Cell Sequencing Identifies High Expression of VCAN in Fibroblasts Promoting the Progression of High-Stemness Gastric Adenocarcinoma Cells
2026-Jan-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202502979R
PMID:41555841
|
研究论文 | 本研究通过整合bulk测序与单细胞测序，发现成纤维细胞中VCAN高表达促进高干性胃腺癌细胞的进展 | 首次结合bulk测序与单细胞测序揭示VCAN在癌症相关成纤维细胞中的特异性表达及其通过MDK-NCL和MIF-CD74-CD44信号通路促进高干性胃腺癌细胞恶性表型的作用机制 | 研究主要基于数据库分析和体外实验，缺乏体内动物模型验证；信号通路机制尚未完全阐明 | 探究VCAN在胃腺癌中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 胃腺癌组织、癌症相关成纤维细胞、高干性胃腺癌细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | bulk测序, 单细胞测序 | NA | 基因表达数据, 单细胞数据 | 多个数据库的样本（具体数量未明确说明） | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1329 | 2026-02-07 |
Mining Potential Therapeutic Targets for T Cell Exhaustion in Osteoarthritis by Integrating Mendelian Randomization and Single-Cell Sequencing
2026-Jan-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202503295R
PMID:41603583
|
研究论文 | 本研究通过整合孟德尔随机化和单细胞测序技术，挖掘骨关节炎中T细胞耗竭的潜在治疗靶点 | 首次结合孟德尔随机化与单细胞测序方法，系统鉴定骨关节炎中T细胞耗竭相关基因作为生物标志物 | 研究依赖于公共数据库数据，未进行独立队列验证实验 | 确定骨关节炎中与T细胞耗竭相关的生物标志物，为治疗和预后提供潜在靶点 | 骨关节炎患者样本数据 | 生物信息学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序，孟德尔随机化分析 | NA | 基因表达数据，单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1330 | 2026-02-07 |
Adult leptomeningeal vestigial neural crest-derived multipotent cells promote vascular repair after stroke
2026-Jan-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116747
PMID:41456275
|
研究论文 | 本研究通过谱系追踪、单细胞与空间转录组学等方法，在成年小鼠软脑膜中发现了一群神经嵴来源的多能细胞，并揭示了其在脑卒中后通过特定信号通路促进血管修复的作用机制 | 首次在成年哺乳动物软脑膜中发现并证实了胚胎神经嵴来源的多能细胞持续存在，并阐明了其在脑损伤后被重新激活、迁移至血管损伤部位并通过分泌多效蛋白等机制促进血管修复的全新生物学过程 | 研究目前仅限于小鼠模型，尚未在人类组织中验证；这些多能细胞在长期修复中的具体命运及其在其它神经系统疾病中的作用仍需进一步探索 | 探究成年大脑中是否存在胚胎神经嵴来源的残留多能细胞及其在脑卒中后血管修复中的潜在功能 | 成年小鼠软脑膜中的神经嵴来源多能细胞及其在缺血性脑卒中模型中的行为与功能 | 单细胞生物学与神经血管修复 | 脑卒中 | 神经嵴谱系追踪、单细胞转录组学、空间转录组学、相互作用组建模、活体成像 | NA | 单细胞RNA测序数据、空间转录组数据、活体成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1331 | 2026-02-07 |
Astrocytic response to traumatic brain injury to rescue neuronal mitochondrial dysfunction through mitochondrial transfer
2026-Jan-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.22.701145
PMID:41648326
|
研究论文 | 本研究探讨了创伤性脑损伤后，星形胶质细胞通过线粒体转移来拯救神经元线粒体功能障碍的内在神经保护机制 | 揭示了星形胶质细胞在TBI后通过直接接触和细胞外囊泡两种方式向神经元转移功能性线粒体，并首次证明EV介导的线粒体转移能显著改善兴奋性毒性诱导的神经元线粒体功能障碍 | 研究未观察到线粒体转移至神经元突触的增加，且主要基于急性TBI模型（24小时），长期效应和临床转化潜力仍需进一步探索 | 探究创伤性脑损伤后中枢神经系统内细胞间线粒体转移的机制及其神经保护作用 | 表达线粒体荧光标记（mtD2/mtGFP）的转基因小鼠、原代皮层星形胶质细胞和神经元 | 神经科学 | 创伤性脑损伤 | 单细胞RNA测序、线粒体生物能量学分析、共培养实验、细胞外囊泡分离 | NA | 基因表达数据、荧光成像数据、生物能量学数据 | 使用特定转基因小鼠品系（Aldh1l1-CreER; mtD2/mtGFP 和 CamK2aCre; mtD2/mtGFP）及原代细胞进行实验 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1332 | 2026-02-07 |
Uncovering the molecular logic of cortical wiring between neuronal subtypes across development through ligand-receptor inference
2026-Jan-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-68059-8
PMID:41565644
|
研究论文 | 本文通过单细胞转录组学追踪小鼠17个发育阶段主要神经元群体的基因表达动态，揭示了皮层神经元亚型间配体-受体相互作用的分子逻辑 | 识别了NEOGENIN-1作为CBLN4在围产期的主要受体，并发现钙粘蛋白超家族成员在突触特异性中的上下文依赖性作用 | 研究基于小鼠模型，可能不完全适用于人类皮层发育，且功能验证有限 | 解码皮层神经元亚型间精确连接的分子机制 | 小鼠大脑皮层中的兴奋性和抑制性神经元亚型 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 多个发育阶段的小鼠神经元群体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1333 | 2026-02-07 |
Macrophage efferocytosis mediated by the TP63-RAC2 pathway promotes immunosuppressive remodeling in esophageal cancer
2026-Jan-20, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102529
PMID:41418775
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和体内外实验，探讨了巨噬细胞胞葬作用在食管鳞状细胞癌中的作用及其免疫抑制机制 | 首次揭示了TP63和RAC2作为关键调节因子，介导巨噬细胞胞葬作用，从而促进食管癌的免疫抑制微环境重塑 | 样本量较小（仅9名患者的27个样本），且主要基于食管鳞状细胞癌，结果在其他癌症类型中的普适性有待验证 | 探究胞葬作用在食管癌肿瘤微环境中的作用机制及其对免疫反应的影响 | 食管鳞状细胞癌患者肿瘤样本中的巨噬细胞和凋亡肿瘤细胞 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 9名患者的27个样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1334 | 2026-02-07 |
Restoring immune homeostasis in atherosclerotic plaques via inorganic violet phosphorus nano-immunotherapy
2026-Jan-20, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102528
PMID:41494534
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研究论文 | 本文开发了一种无机纳米颗粒平台（聚乙二醇化紫磷纳米片），用于通过免疫调节治疗动脉粥样硬化 | 首次利用无机紫磷纳米片作为纳米免疫疗法平台，通过单细胞RNA测序揭示其调节斑块内四种关键免疫细胞群并重塑细胞间通讯的机制 | 未在人类临床试验中验证，且未详细探讨长期副作用或与其他疗法的比较 | 开发一种靶向免疫调节的纳米疗法以治疗动脉粥样硬化 | 动脉粥样硬化小鼠模型中的免疫细胞（如巨噬细胞、单核细胞、T/B细胞） | 纳米医学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确指定样本数量，但基于小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1335 | 2026-02-07 |
Imaging spatial transcriptomics reveals molecular patterns underlying accumulation of p-Ser129 α-synuclein in a transgenic mouse model
2026-Jan-16, NPJ Parkinson's disease
DOI:10.1038/s41531-025-01246-y
PMID:41545426
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研究论文 | 本研究利用成像空间转录组学结合免疫荧光技术，在转基因小鼠模型中揭示了p-Ser129 α-突触核蛋白积累的分子模式 | 首次将成像空间转录组学与下游免疫荧光技术结合，在同一组织切片中识别出易积累pSyn的神经元亚型，并揭示了Plk2和hSNCA表达在pSyn形成中的关键作用 | 研究基于转基因小鼠模型，可能无法完全模拟人类帕金森病或路易体痴呆的复杂性 | 探究帕金森病和路易体痴呆中α-突触核蛋白选择性积累的分子机制 | 转基因过表达人α-突触核蛋白的小鼠皮层和海马神经元 | 数字病理学 | 帕金森病 | 成像空间转录组学，免疫荧光 | NA | 空间转录组数据，图像数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1336 | 2026-02-07 |
Integrative Single-cell and Spatial Transcriptomic Analysis of Osteosarcoma Reveals Conserved and Distinct Ecosystems Across Sites and Species
2026-Jan-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.13.698472
PMID:41648517
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和空间转录组学分析，揭示了骨肉瘤在跨物种和不同部位间保守且独特的生态系统 | 构建了首个跨物种骨肉瘤单细胞转录组数据集，涵盖人类、犬类、PDX和同基因小鼠模型，并识别了保守的肿瘤细胞状态和肿瘤相关细胞群的重编程特征 | 研究依赖于转录组数据，可能未完全捕捉蛋白质水平或表观遗传变化，且样本来源的多样性可能引入批次效应 | 探究骨肉瘤的肿瘤微环境异质性及其在跨物种和不同解剖部位的保守与差异 | 人类、犬类骨肉瘤标本、患者来源异种移植(PDX)、同基因小鼠模型的原发（骨）和转移（肺）部位细胞 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 超过一百万个细胞/核，来自多物种和多部位样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1337 | 2026-02-07 |
A supervised ontology-aware cell annotation method for single-cell transcriptomic data
2026-Jan-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.13.699356
PMID:41648349
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研究论文 | 提出一种基于监督学习和本体论的细胞注释方法SOCAM，用于单细胞转录组数据，通过概率传播策略确保细胞类型分类的层次一致性 | 引入概率传播策略以强制本体一致性，无需重新训练现有模型即可提升性能，并提出了基于跳数的F1评分用于本体感知评估 | NA | 开发一种快速、可解释且本体一致的细胞注释方法，以改进单细胞RNA-seq数据的细胞类型分类 | 人类单细胞转录组数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA-seq | 逻辑回归 | 单细胞转录组数据 | 4200万个人类细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1338 | 2026-02-07 |
From glycolytic signatures to patients: A translational roadmap for reproducible, equitable deployment of multi-omics and AI in colorectal cancer
2026-Jan-13, Medical oncology (Northwood, London, England)
DOI:10.1007/s12032-026-03236-3
PMID:41528598
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综述 | 本文提出一个基于多组学和人工智能的可重复、公平部署的路线图，用于结直肠癌的精准肿瘤学 | 整合国际公认框架（TRIPOD+AI、PROBAST+AI、DECIDE-AI）以确保透明度、校准和分阶段临床评估，并强调使用代谢成像和光谱学进行正交验证 | 未具体说明数据样本量或模型类型，主要关注方法论和路线图，缺乏实证研究细节 | 为结直肠癌中多组学和人工智能的可重复、公平临床工具开发提供结构化路线图 | 结直肠癌的糖酵解异质性及相关生物标志物 | 机器学习 | 结直肠癌 | 批量转录组学、单细胞转录组学、代谢成像、光谱学 | NA | 转录组数据、成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1339 | 2026-02-07 |
Interpreting the molecular and cellular landscape of PCOS through bulk transcriptomics, single-cell transcriptomics and machine learning
2026-Jan-07, Journal of ovarian research
IF:3.8Q1
DOI:10.1186/s13048-025-01956-0
PMID:41501917
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研究论文 | 本研究通过整合bulk转录组学、单细胞转录组学和机器学习方法，揭示了多囊卵巢综合征的分子机制和细胞组成，并开发了诊断模型 | 首次结合bulk和单细胞RNA测序与机器学习，识别了PCOS中关键的颗粒细胞亚群GC9，并构建了基于三基因标志的诊断模型 | 研究样本量有限，且主要基于转录组数据，未全面探索其他分子层面如蛋白质组或代谢组 | 阐明PCOS的分子机制和细胞基础，以发现潜在治疗靶点并提高诊断准确性 | 多囊卵巢综合征患者的颗粒细胞 | 机器学习 | 多囊卵巢综合征 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, qPCR, western blotting | 机器学习算法 | RNA测序数据, 临床样本数据 | PCOS患者和对照组的临床样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1340 | 2026-02-07 |
Therapeutic potential of CDK8 inhibitor combined with sorafenib for hepatocellular carcinoma: mechanistic insights and in vitro validation
2026-Jan-07, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-025-03780-0
PMID:41501937
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研究论文 | 本研究探讨了CDK8抑制剂MSC2530818与索拉非尼联合使用对肝细胞癌的治疗潜力，通过机制分析和体外实验验证其协同抗肿瘤效果 | 首次结合单细胞RNA-seq分析揭示CDK8在肝细胞癌中的表达模式，并验证CDK8抑制剂与索拉非尼的联合治疗策略在体外模型中的协同增效作用 | 研究主要基于体外细胞实验（Huh7细胞），缺乏体内动物模型或临床样本的直接验证，且样本量有限 | 探索肝细胞癌的新型治疗靶点及联合治疗策略 | 肝细胞癌组织样本、Huh7肝癌细胞系 | 肿瘤生物学 | 肝细胞癌 | 免疫组化、RNA-seq、微阵列数据分析、单细胞RNA-seq、细胞增殖实验、划痕实验、Transwell实验 | NA | 组织样本数据、基因表达数据、单细胞转录组数据、体外细胞实验数据 | 75例肝细胞癌及癌旁组织样本，整合分析3969例肝细胞癌和3245例非肿瘤肝样本的RNA-seq和微阵列数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, 微阵列 | NA | NA |