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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1301 | 2026-04-06 |
Single-cell transcriptomic profiling of human fetal neural stem cells isolated from the subventricular zone
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1740851
PMID:41884782
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析,深入表征了从胎儿大脑室下区分离的人类神经干细胞,揭示了其亚群组成、分化轨迹及长期培养中的稳定性 | 首次对从胎儿大脑室下区分离的人类神经干细胞进行单细胞转录组分析,揭示了其亚群组成、分化轨迹以及长期培养中干细胞特性的保持 | 样本来源于自发流产的胎儿,可能无法完全代表正常发育情况,且样本数量有限 | 旨在解析人类胎儿神经干细胞的细胞组成和分化动态,以促进再生医学应用 | 从胎儿大脑室下区分离的人类神经干细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 单细胞RNA-seq数据 | 来自不同捐赠者的胎儿大脑样本(自发流产来源),并经过不同培养传代 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1302 | 2026-04-06 |
The role of disulfidptosis-driven tumor microenvironment remodeling in pancreatic cancer progression
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1747560
PMID:41884834
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研究论文 | 本研究开发并验证了一个基于13个关键基因的二硫死亡相关预后特征,用于胰腺导管腺癌患者的风险分层,并通过多组学分析揭示了二硫死亡与免疫抑制性肿瘤微环境之间的关联 | 首次在胰腺癌中开发了基于二硫死亡相关基因的预后特征,并通过整合多组学方法(包括单细胞转录组学和空间转录组学)系统性地揭示了二硫死亡在肿瘤免疫调节中的作用 | 研究主要基于生物信息学分析和体外功能实验,缺乏体内实验验证;UBASH3B在免疫调节中的具体机制仍需进一步研究 | 探究二硫死亡在胰腺癌进展和肿瘤免疫中的作用,并开发基于二硫死亡相关基因的预后模型 | 胰腺导管腺癌患者 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞转录组学, 空间转录组学, 功能实验 | 预后特征模型 | 转录组数据, 单细胞数据, 空间转录组数据 | 多个独立队列的胰腺癌患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1303 | 2026-04-06 |
Plasma PFDN2 suppresses head and neck squamous cell carcinoma progression by restricting CD64 on monocyte-driven inflammatory microenvironments
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1791776
PMID:41884853
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研究论文 | 本研究通过多样本孟德尔随机化分析,发现血浆蛋白PFDN2通过抑制单核细胞上的CD64来限制头颈部鳞状细胞癌的进展 | 首次将血浆蛋白PFDN2与HNSC风险通过单核细胞CD64介导的免疫微环境联系起来,并利用虚拟敲除和分子模拟验证其相互作用 | 研究主要基于遗传关联和计算模拟,需要更多实验验证PFDN2-CD64轴的功能机制 | 探究血浆蛋白对头颈部鳞状细胞癌免疫微环境的因果调控作用 | 头颈部鳞状细胞癌患者样本、血浆蛋白质组、免疫细胞表型 | 生物信息学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 孟德尔随机化、单细胞RNA测序、分子对接、分子动力学模拟、免疫荧光染色 | scTenifoldKnk虚拟敲除模型 | 蛋白质组数据、单细胞RNA测序数据、组织病理数据 | 大规模血浆蛋白质组和HNSC样本,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1304 | 2026-04-04 |
Genetic Association Between Polymyositis/Dermatomyositis and Epilepsy: Insights From Mendelian Randomization and Bioinformatic Analyses
2026-Jan, Brain and behavior
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/brb3.71148
PMID:41466027
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研究论文 | 本研究通过孟德尔随机化和生物信息学分析,探讨了多发性肌炎/皮肌炎与癫痫之间的遗传关联及免疫介导机制 | 首次结合孟德尔随机化与单细胞转录组学,揭示了多发性肌炎与癫痫之间的因果关联及免疫细胞浸润模式 | 研究主要基于公开数据库数据,缺乏大规模临床队列验证,且皮肌炎与癫痫的关联未得到证实 | 探索多发性肌炎/皮肌炎与癫痫之间的潜在因果联系及免疫介导机制 | 多发性肌炎、皮肌炎和癫痫患者相关的基因组和转录组数据 | 生物信息学 | 多发性肌炎/皮肌炎和癫痫 | GWAS, 孟德尔随机化, 转录组分析, 单细胞转录组学, PCR | NA | 基因组数据, 转录组数据 | 基于公开GWAS数据库的汇总数据,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1305 | 2026-04-04 |
The Role of Sphingolipid Metabolism and Neuron Death in Ischemic Stroke: A New Perspective from Bioinformatics
2026-Jan, Brain and behavior
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/brb3.71172
PMID:41474773
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学方法探讨了鞘脂代谢与神经元死亡在缺血性脑卒中中的作用 | 结合bulk和单细胞转录组学数据,首次系统分析了鞘脂代谢通路在缺血性脑卒中中的变化,并鉴定了与神经元死亡相关的关键基因App | 研究主要基于生物信息学分析,体内验证仅限于MCAO大鼠模型,缺乏临床样本的直接验证 | 探索鞘脂代谢与神经元死亡在缺血性脑卒中发病机制中的关系 | 缺血性脑卒中患者和小鼠模型的转录组数据,以及MCAO大鼠模型 | 生物信息学 | 缺血性脑卒中 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序, 基因集富集分析, 免疫浸润分析, 蛋白质-蛋白质相互作用网络分析 | NA | 转录组数据 | 人类外周血bulk数据(GSE16561)和MCAO小鼠外周血scRNA-seq数据(GSE225948),以及MCAO大鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1306 | 2026-04-02 |
Gut Microbiome, Immune Cells, and Heart Failure: A Multi-Omics Mendelian Randomization Study
2026-Jan-23, Cardiology
IF:1.9Q3
DOI:10.1159/000550655
PMID:41915616
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研究论文 | 本研究通过多组学孟德尔随机化分析,探讨了肠道微生物组通过免疫细胞对心力衰竭的因果影响 | 首次结合肠道微生物组、免疫细胞和心力衰竭的GWAS数据,利用单细胞RNA测序和单核RNA测序技术,通过eQTL孟德尔随机化分析揭示微生物与免疫互作在心力衰竭中的因果机制 | 研究依赖于公开的GWAS摘要数据,可能受限于样本异质性和潜在混杂因素,且因果推断基于遗传工具变量,需实验验证 | 探究肠道微生物组通过免疫调节对心力衰竭发病的因果关系 | 肠道微生物分类群、免疫细胞(如CD4+T细胞、NK/T细胞)和心力衰竭患者及健康对照 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 全基因组关联研究(GWAS)、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、单核RNA测序(snRNA-seq)、表达数量性状位点(eQTL)分析 | 孟德尔随机化(MR)模型 | 遗传摘要数据、单细胞转录组数据 | 基于公开GWAS和单细胞测序数据,具体样本数未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | NA | NA |
| 1307 | 2026-04-02 |
Loss of HOXA10 activates NLRP3 for epithelial plasticity and pyroptosis in endometrium during embryo implantation
2026-01-15, Reproduction (Cambridge, England)
DOI:10.1093/reprod/xaaf007
PMID:41575153
|
研究论文 | 本研究揭示了转录因子HOXA10通过抑制NLRP3来维持子宫内膜上皮细胞特性,其下调会激活NLRP3介导的炎症小体形成和细胞焦亡,从而为胚胎植入创造条件的分子机制 | 首次发现HOXA10通过直接调控NLRP3表达来控制胚胎植入过程中的上皮重塑,并阐明了NLRP3在诱导上皮可塑性(pEMT)和细胞焦亡中的双重功能 | 研究主要基于小鼠模型,在人类子宫内膜中的验证尚需进一步研究;NLRP3抑制剂MCC950的具体作用机制和长期影响有待深入探索 | 探究胚胎植入过程中子宫内膜上皮细胞重塑的分子调控机制 | 小鼠子宫内膜(特别是腔上皮细胞) | 生殖生物学/发育生物学 | 生殖系统疾病(胚胎植入相关) | CUT&RUN测序,单细胞RNA-seq,免疫染色 | NA | 基因组学数据,转录组数据,图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1308 | 2026-04-02 |
Single-cell transcriptome sequencing reveals hepatocyte heterogeneity in response to radiation-induced liver injury and regeneration
2026-01, Radiotherapy and oncology : journal of the European Society for Therapeutic Radiology and Oncology
IF:4.9Q1
DOI:10.1016/j.radonc.2025.111225
PMID:41429723
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了辐射诱导肝损伤后肝细胞的异质性反应与再生机制 | 首次在辐射诱导肝损伤模型中,结合单细胞和单核RNA测序以及蛋白质组学分析,系统描绘了肝细胞亚群在空间和时间上的动态响应,并验证了人类肝组织中的保守通路激活 | 研究主要基于大鼠模型,人类样本验证有限;未深入探讨长期再生效果或临床转化潜力 | 阐明辐射诱导肝损伤的分子机制及肝细胞再生过程 | 大鼠肝细胞及人类肝组织 | 数字病理学 | 肝损伤 | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 蛋白质组学分析 | NA | 转录组数据, 蛋白质组数据 | 大鼠模型及人类肝组织样本(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | NA | NA |
| 1309 | 2026-04-02 |
Integrated transcriptome and single-cell sequencing analysis identify blood-pancreas shared lncRNA biomarkers in new-onset T2DM
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0345359
PMID:41915667
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研究论文 | 本研究通过整合转录组测序和单细胞RNA测序,识别了初发2型糖尿病患者血液与胰腺共享的lncRNA作为早期生物标志物 | 首次整合外周血转录组与胰岛单细胞测序数据,识别血液与胰腺共享的lncRNA作为T2DM早期系统性生物标志物 | 样本量相对较小,且为横断面研究,需进一步纵向验证 | 识别初发2型糖尿病患者血液与胰腺共享的lncRNA作为早期生物标志物 | 初发2型糖尿病患者的外周血样本和胰岛组织 | 生物信息学 | 2型糖尿病 | 转录组测序, 单细胞RNA测序 | 加权基因共表达网络分析 | RNA-seq数据 | 初始队列:8名T2DM患者和8名对照;单细胞队列:17名T2DM供体;验证队列:85名T2DM患者和85名对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1310 | 2026-04-02 |
Single-Cell/Nucleus RNA-Sequencing for Phytohormone Signaling in Plants
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-5214-5_10
PMID:41917663
|
综述 | 本文详细介绍了单细胞/单核RNA测序技术在植物激素信号研究中的应用方法 | 利用scRNA-seq和snRNA-seq技术,在转录组水平实现细胞异质性的高分辨率映射,为植物激素信号研究提供了新方法 | NA | 研究植物激素信号传导的基因调控网络 | 植物细胞 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq | NA | NA |
| 1311 | 2026-04-02 |
Single-Cell Transcriptomics in Arabidopsis in Response to Salicylic Acid and Jasmonic Acid
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-5214-5_11
PMID:41917664
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研究论文 | 本文提供了针对拟南芥水杨酸和茉莉酸响应的单细胞核RNA测序实验方案及生物信息学分析流程 | 开发了针对植物激素处理的单细胞核RNA测序端到端实验方案,并结合计算流程实现细胞类型分辨的激素免疫响应解析 | NA | 解析水杨酸和茉莉酸在植物免疫中的细胞类型特异性响应机制 | 拟南芥 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞核RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1312 | 2026-04-02 |
Stereo-Seq Transcriptomics in Arabidopsis Leaves in Response to Salicylic Acid
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-5214-5_12
PMID:41917665
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研究论文 | 本文描述了一个完整的Stereo-seq工作流程,用于研究拟南芥叶片在响应水杨酸处理时的空间转录组变化 | 首次将Stereo-seq技术应用于拟南芥叶片响应水杨酸的空间转录组研究,并提供了从样本制备到数据分析的完整工作流程 | 未明确说明样本数量,且工作流程可能受特定平台限制 | 研究拟南芥叶片在响应水杨酸处理时的空间转录组变化 | 拟南芥叶片 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | STOmics, MGI | 空间转录组学 | STOmics V1.3 1 × 1 cm芯片, DNBSEQ平台 | STOmics V1.3 1 × 1 cm芯片用于文库构建,DNBSEQ平台用于测序 |
| 1313 | 2026-04-02 |
APOE and CCR2: Potential Macrophage-Specific Biomarkers in the Rheumatoid Arthritis Synovial Microenvironment Identified by Bioinformatics and Experimental Verification in Murine Models
2026, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S587712
PMID:41918589
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证,在类风湿关节炎滑膜微环境中识别出APOE和CCR2作为潜在的巨噬细胞特异性生物标志物 | 结合批量与单细胞RNA-seq数据,识别出在滑膜巨噬细胞中特异性高表达并与炎症反应相关的枢纽基因APOE和CCR2,并通过实验验证了其表达调控 | 需要进一步研究以阐明APOE和CCR2在类风湿关节炎中的具体作用机制 | 识别类风湿关节炎中巨噬细胞特异性的枢纽基因并研究其生物学功能 | 类风湿关节炎患者的滑膜组织及小鼠RAW264.7细胞系 | 生物信息学 | 类风湿关节炎 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, RT-qPCR, ELISA, 免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据, 单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1314 | 2026-04-02 |
Editorial: Unraveling breast cancer complexity: insights from single-cell sequencing and spatial transcriptomics
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1816191
PMID:41918756
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1315 | 2026-04-02 |
Identification of a GPR182-postive stem cell population that drives polyp progression in familial adenomatous polyposis
2026, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.20704
PMID:41918858
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量转录组数据分析,识别了家族性腺瘤性息肉病中驱动息肉异质性的关键细胞亚群——GPR182阳性息肉干细胞 | 首次在家族性腺瘤性息肉病中鉴定出GPR182阳性息肉干细胞,并揭示其在驱动息肉异质性、免疫逃逸及预后和药物反应预测中的关键作用 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据分析,缺乏前瞻性临床验证,且功能验证实验可能有限 | 解析家族性腺瘤性息肉病中息肉进展的异质性,以识别新的治疗靶点和生物标志物 | 家族性腺瘤性息肉病患者的单细胞和批量转录组数据 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞测序,批量转录组测序 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | 涉及多个公共数据集(GSE109308等),具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 1316 | 2026-04-02 |
Elevated growth differentiation factor-15 in sepsis: clinical associations and immune cell context
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1789747
PMID:41918885
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研究论文 | 本研究探讨了脓毒症患者血清中生长分化因子-15(GDF-15)水平的升高情况,及其与疾病严重程度、器官功能障碍和炎症活动的关联,并利用单细胞RNA测序数据分析了GDF15在免疫细胞中的表达模式 | 首次在脓毒症中结合临床血清GDF-15测量与公开的单细胞转录组数据,系统描述了GDF-15与疾病严重程度的关联及其在特定免疫细胞(浆细胞和单核细胞)中的表达富集,为理解其在危重疾病中的生物学背景提供了新见解 | 研究样本量较小(脓毒症患者n=19,健康对照n=23),为探索性观察研究,需要更大规模、特征明确的队列进行验证 | 阐明脓毒症中GDF-15的临床关联及其在免疫细胞中的表达背景,评估其作为反映系统生物应激的潜在生物标志物的价值 | 成人脓毒症患者和健康对照者的血清样本,以及公开的单细胞RNA测序数据集(GSE217906)中的免疫细胞 | NA | 脓毒症 | 酶联免疫吸附试验(ELISA),单细胞RNA测序数据分析 | NA | 血清蛋白浓度数据,单细胞转录组数据 | 临床队列:脓毒症患者19例,健康对照23例;生物信息学分析:公开数据集GSE217906 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1317 | 2026-04-02 |
Noninvasive assessment of core metastatic genes in lung adenocarcinoma: development of a predictive model integrating single-cell transcriptomics and radiomics
2026, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2026.1784914
PMID:41919253
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组学和CT影像组学,识别了肺腺癌转移的关键分子驱动基因,并开发了一个非侵入性的影像预测模型 | 创新性地结合单细胞RNA测序和CT影像组学来识别肺腺癌转移的核心基因并构建预测模型,实现了分子表型与影像特征的关联 | 研究基于公共数据库数据,可能需要进一步的前瞻性临床验证来确认模型的泛化能力 | 开发一个非侵入性的预测模型,用于评估肺腺癌的转移潜能和预后 | 肺腺癌(LUAD)患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、CT影像组学、免疫组织化学(IHC)、RT-qPCR | LASSO回归、影像组学模型 | 转录组数据、单细胞RNA测序数据、CT影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1318 | 2026-01-23 |
Building consensus: construction of a juvenile and adult scRNA-seq meta-atlas for dataset comparisons and harmonizing transcriptomic definitions of enteric neuron subtypes
2026-Jan-22, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-025-12283-5
PMID:41566221
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1319 | 2026-04-01 |
Endothelial CEPT1 Promotes Angiogenesis Through PPARα and VEGF-A Signaling
2026-Jan, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.125.323302
PMID:41263082
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研究论文 | 本研究探讨了内皮细胞CEPT1通过PPARα和VEGF-A信号通路促进血管生成的作用 | 首次揭示了CEPT1在糖尿病背景下通过PPARα和VEGF-A信号通路促进缺血后血管生成和恢复的机制,并利用单细胞RNA测序技术进行了验证 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,在人体中的直接功能验证尚不充分,且糖尿病模型的复杂性可能影响结果的普适性 | 探究CEPT1在糖尿病背景下促进缺血后血管生成和恢复的分子机制 | 人类外周动脉疾病患者的外周动脉样本、条件性内皮细胞特异性Cept1过表达小鼠、小鼠主动脉和内皮细胞 | 分子生物学与血管生物学 | 糖尿病与心血管疾病 | 单细胞RNA测序、分子通路分析、基因工程小鼠模型 | 条件性基因过表达小鼠模型 | 基因表达数据、蛋白质表达数据、功能实验数据 | 人类患者外周动脉样本(具体数量未明确)、C57BL/6J背景的基因工程小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1320 | 2026-04-01 |
A unique microglia subset associated with aggressive α-synucleinopathy uncovered in a rapidly progressive multiple system atrophy cerebellar type model
2026-01, Neurobiology of disease
IF:5.1Q1
DOI:10.1016/j.nbd.2025.107206
PMID:41325908
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研究论文 | 本研究通过建立快速进展型多系统萎缩小脑型小鼠模型,发现了一种与侵袭性α-突触核蛋白病相关的独特小胶质细胞亚群 | 首次在快速进展的MSA-C模型中鉴定出一个表达Tlr2、Tgm2、Msr1等基因的独特促炎性小胶质细胞亚群,该亚群位于p-α-syn聚集物附近,且不同于以往报道的保护性疾病相关小胶质细胞和边界相关巨噬细胞 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本仅来自6例尸检病例,样本量较小;CSF1R抑制剂BLZ945的预防性给药加剧了疾病表型,其治疗时间窗和剂量效应需进一步探索 | 探究多系统萎缩小脑型(MSA-C)的病理机制,特别是小胶质细胞在疾病进展中的作用 | MSA-C小鼠模型(Tet-Off系统诱导少突胶质细胞特异性过表达人A53T α-syn)以及6例人类MSA-C尸检病例 | 数字病理学 | 多系统萎缩 | 单细胞RNA测序 | 小鼠疾病模型(Tet-Off诱导型) | 单细胞转录组数据、组织病理学数据 | 小鼠模型队列及6例人类MSA-C尸检病例 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |