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当前共找到 1652 篇文献，本页显示第 1281 - 1300 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1281 | 2026-01-19 |
RNAPaceDB: a dedicated database to dissect RNA velocity across diverse cell types
2026-Jan-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1045
PMID:41118514
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研究论文 | 本文介绍了RNAPaceDB，一个专门用于解析不同细胞类型中RNA速度的数据库 | 整合了来自144个数据集的单细胞RNA测序数据，涵盖超过210万个细胞，并提供了基于六种计算模型生成的4380个速度流图，首次构建了一个专门用于探索跨细胞类型RNA速度模式的综合数据库 | 数据库依赖于现有公开数据集的质量和注释，且RNA速度计算模型的准确性可能影响结果的解读 | 构建一个综合数据库以解析RNA速度模式，促进对基因表达动态时间逻辑的理解 | 单细胞RNA测序数据中的细胞 | 生物信息学 | 多种疾病（涵盖41种疾病） | 单细胞RNA测序 | 六种计算模型（未指定具体名称） | 单细胞RNA测序数据 | 超过210万个细胞，来自144个数据集，涵盖81种细胞类型和41种疾病 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1282 | 2026-01-19 |
ViMIC 2.0: an updated database of human disease-related viral mutations, integration sites, and multi-omics data
2026-Jan-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1106
PMID:41166154
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研究论文 | 本文介绍了ViMIC 2.0数据库的更新内容，该数据库整合了与人类疾病相关的病毒突变、病毒整合位点和多组学数据 | 相较于前一版本，ViMIC 2.0显著扩展了数据规模（病毒类型从8种增至28种，病毒突变条目从31,712增至64,168，相关疾病从77种增至177种，文献从2,539篇增至6,433篇），并新增了单细胞转录组测序（scRNA-seq）和基因组结合/占据谱等数据类型，同时增强了可视化分析功能 | NA | 为病毒学研究社区提供一个用户友好、更新及时且维护良好的资源数据库 | 与人类疾病相关的病毒突变、病毒整合位点及多组学数据 | 生物信息学 | 病毒相关疾病 | 单细胞转录组测序（scRNA-seq）、基因组结合/占据谱分析、ChIP-seq、ChIP-on-chip、ATAC-seq、甲基化分析 | NA | 多组学数据、序列数据、表达谱数据、甲基化数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, 甲基化分析, ChIP-seq, ATAC-seq | NA | NA |
| 1283 | 2026-01-19 |
CGRP/TSP1 Signaling Dampens Corneal Inflammation and Fibrosis by Targeting A2M During Corneal Stromal Wound Healing
2026-Jan-05, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.67.1.10
PMID:41533912
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研究论文 | 本研究探讨了血小板反应蛋白-1（TSP1）在角膜基质伤口愈合中的具体作用及其机制，揭示了CGRP/TSP1/A2M信号轴在调节炎症和纤维化中的关键角色 | 首次通过单细胞测序和转录组分析，确定了TSP1通过调控A2M表达来抑制角膜炎症和纤维化，并发现CGRP信号可诱导TSP1和A2M，为角膜修复提供了新的治疗靶点 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验，人类患者数据仅作为验证，样本量有限，且未深入探讨CGRP/TSP1/A2M轴在其他类型角膜损伤中的普适性 | 研究TSP1在角膜基质伤口愈合中的作用及其分子机制 | 小鼠角膜基质损伤模型、人类端粒酶永生化角膜细胞、以及碱烧伤或真菌感染导致角膜瘢痕的患者样本 | 数字病理 | 角膜疾病 | 单细胞测序、bulk RNA测序 | NA | 基因表达数据、组织样本 | 野生型和Thbs1缺陷型小鼠模型、人类细胞系及患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1284 | 2026-01-05 |
Single-cell RNA sequencing unveils enhanced antitumor immunity in colorectal cancer with PD-1 blockade and LINC00673 deletion
2026-Jan-03, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-025-00888-7
PMID:41484808
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1285 | 2026-01-19 |
Detection of viral sequences at single-cell resolution identifies novel viruses associated with host gene expression changes
2026-Jan, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-025-02614-y
PMID:40263451
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研究论文 | 本文介绍了一种基于高度保守的RdRP蛋白，在批量及单细胞转录组学数据中准确快速检测病毒序列的方法，能够检测超过10万种RNA病毒物种 | 该方法不依赖参考基因组，通过细胞条形码追踪保持单细胞分辨率，首次实现单细胞水平上病毒存在与宿主基因表达的并行分析 | 方法主要针对RNA病毒检测，可能不适用于DNA病毒；在单细胞水平预测病毒存在仍需进一步验证 | 开发一种新型病毒检测方法，用于病毒多样性监测和病毒-疾病相关性研究 | 恒河猴外周血单个核细胞中的病毒序列 | 生物信息学 | 埃博拉病毒病 | 高通量测序，单细胞转录组学 | NA | 转录组测序数据 | 来自患有埃博拉病毒病的恒河猴的外周血单个核细胞数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1286 | 2026-01-19 |
Interleukin-4-mediated Pro-Regenerative Cellular Reprogramming in 3-dimensional Liver Culture
2026, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2025.101626
PMID:40907663
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研究论文 | 本研究利用小鼠精密肝切片（PCLS）这一三维组织培养系统，探究了白细胞介素-4（IL-4）在肝脏细胞重编程中的作用，并通过纵向单细胞转录组学和蛋白质水平验证，揭示了IL-4的促再生潜力 | 首次在保持肝脏复杂细胞相互作用的三维培养模型中，系统研究IL-4对肝脏细胞重编程的影响，并验证其在损伤肝脏组织中的促再生效果 | 研究基于小鼠模型，结果在人类肝脏中的适用性尚需进一步验证；三维培养系统虽能模拟体内环境，但仍与完整器官存在差异 | 探究IL-4在肝脏再生中的具体作用机制及其治疗潜力 | 小鼠精密肝切片（PCLS），包括正常和硫代乙酰胺诱导的肝坏死/纤维化模型 | 单细胞转录组学 | 肝坏死/肝纤维化 | 单核RNA测序，免疫组织化学染色，细胞内ATP检测 | NA | 单细胞转录组数据，蛋白质表达数据 | 8至10周龄C57BL/6小鼠的肝切片，培养5天，包括IL-4处理组和对照组 | NA | 单核RNA测序 | NA | NA |
| 1287 | 2026-01-19 |
Activation and Spatial Redistribution of RNA Splicing Factors Trigger Hepatic Regeneration
2026, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2025.101654
PMID:41033443
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研究论文 | 本研究通过时空测序和单细胞RNA测序揭示了剪接因子在肝脏再生中的关键作用及其空间分布变化 | 首次结合时空测序和单细胞RNA测序技术，系统阐明了剪接因子在肝脏再生启动中的空间重塑和分子机制，并识别出HNRNPU作为关键因子 | 研究主要基于小鼠模型和类器官，人类样本验证相对有限，且具体信号通路细节有待进一步探索 | 探究肝脏再生启动的精确空间和分子变化，以开发肝病潜在治疗靶点 | 再生肝脏、肝细胞类器官（Hep-Orgs）、基因敲除小鼠模型 | 单细胞测序 | 肝病 | 时空测序、单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 未明确指定具体样本数量，涉及再生肝脏、类器官和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1288 | 2026-01-19 |
Molecular Landscape and Predictive Significance of Programmed Cell Death-Related Genes in Sepsis
2026, Human mutation
IF:3.3Q2
DOI:10.1155/humu/5280021
PMID:41542228
|
研究论文 | 本研究通过转录组数据分析，揭示了程序性细胞死亡相关基因在脓毒症中的分子景观和预测意义，并构建了诊断模型 | 结合WGCNA和机器学习算法识别脓毒症相关的枢纽基因和预后相关特征基因，并在单细胞RNA-seq水平验证了特征基因，强调了S100A9和KLHL3等基因在中性粒细胞中的关联 | 研究基于公共数据库的转录组数据，可能受样本异质性和数据质量限制，且未进行实验验证 | 阐明脓毒症的转录组变化，特别是程序性细胞死亡的作用，并识别潜在的诊断生物标志物 | 脓毒症患者和对照样本的转录组数据 | 生物信息学 | 脓毒症 | 转录组测序，单细胞RNA-seq | 机器学习算法（八种） | 转录组数据 | 从GEO网站提取的脓毒症和对照样本数据，具体数量未明确 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1289 | 2026-01-19 |
Integrated Single Cell Spatial Analysis Reveals Dysregulated Basal Progenitor Cells in Ulcerative Colitis Pathogenesis: A Multi Omics Study
2026-Jan, Health science reports
IF:2.1Q3
DOI:10.1002/hsr2.71659
PMID:41542331
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞空间分析，揭示了溃疡性结肠炎发病机制中基底祖细胞的空间失调及其在疾病进展中的作用 | 首次结合单细胞RNA测序、空间转录组学和机器学习，系统解析了UC中基底祖细胞的空间动态和功能基因矩阵，特别是FABP1主导的调控网络 | 研究样本量有限，且主要基于转录组数据，缺乏蛋白质水平验证和更深入的机制研究 | 探究溃疡性结肠炎中基底祖细胞的空间动态、功能角色及其在疾病进展中的作用 | 溃疡性结肠炎患者和健康对照的肠道组织样本 | 数字病理学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 机器学习 | 机器学习模型 | 单细胞转录组数据, 空间表达数据 | UC和健康样本的单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1290 | 2026-01-18 |
TNF superfamily member 14 drives post-influenza depletion of alveolar macrophages, enabling secondary pneumococcal pneumonia
2026-Jan-16, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI185390
PMID:41252214
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研究论文 | 本文揭示了TNF超家族成员14（TNFSF14）在流感后肺泡巨噬细胞耗竭中的关键作用，从而促进继发性肺炎链球菌肺炎的发生 | 首次结合单细胞转录组学和细胞特异性PCR分析，无偏地识别TNFSF14配体/受体轴作为流感后组织驻留肺泡巨噬细胞死亡的主要驱动因素 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限，且未详细探讨TNFSF14在其他病毒性肺炎中的作用 | 阐明流感后组织驻留肺泡巨噬细胞耗竭的分子机制，并确定潜在的治疗靶点以预防继发性细菌性肺炎 | 流感A病毒感染及与肺炎链球菌共感染的小鼠模型，以及严重病毒诱导急性呼吸窘迫综合征患者的支气管肺泡灌洗液 | 免疫学 | 肺炎 | 单细胞转录组学，细胞特异性PCR分析 | NA | 转录组数据，PCR数据 | 未明确指定样本数量，但涉及小鼠模型和患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1291 | 2026-01-18 |
Integrative spatial multi-omics reveal niche-specific inflammatory signaling and differentiation hierarchies in AML
2026-Jan-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.114289
PMID:41536977
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研究论文 | 本研究通过整合空间多组学技术，揭示了急性髓系白血病（AML）在骨髓和髓外组织中的微环境特异性炎症信号和分化层次 | 开发了基于Visium的空间转录组学工作流程，结合GeoMX数字空间分析和Opal多重荧光免疫组化，首次系统性地描绘了AML在骨髓和髓外组织中的空间生物学特征 | 研究样本可能有限，未明确提及样本数量，且技术方法可能受限于空间分辨率或组织复杂性 | 探索AML在骨髓和髓外微环境中的空间组织、细胞间通讯和分化层次 | 急性髓系白血病（AML）患者的骨髓和髓外组织样本 | 数字病理学 | 白血病 | 空间转录组学、数字空间分析、多重荧光免疫组化 | NA | 空间转录组数据、免疫组化图像 | NA | 10x Genomics, NanoString | 空间转录组学, 数字空间分析 | 10x Visium, GeoMX | Visium-based spatial transcriptomics, GeoMX digital spatial profiling |
| 1292 | 2026-01-18 |
SLC39A10 drives M2 macrophage polarization and gastric cancer progression through the MAPK14(p38α) pathway
2026-Jan-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.114400
PMID:41536985
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研究论文 | 本研究揭示了锌转运蛋白SLC39A10通过激活MAPK14(p38α)通路驱动M2型巨噬细胞极化，从而促进胃癌进展的机制 | 首次在单细胞水平阐明SLC39A10通过MAPK14通路调控肿瘤细胞与巨噬细胞亚群间通讯，并鉴定出SLC39A10-MAPK14-M2巨噬细胞调控轴 | 未明确SLC39A10在其它免疫细胞亚群中的作用，且体内验证实验有待进一步完善 | 探究SLC39A10在胃癌微环境中对细胞亚群特异性调控机制及其对肿瘤进展的影响 | 胃癌细胞、肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)及其构成的肿瘤微环境 | 单细胞组学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1293 | 2026-01-18 |
POSTN+ cancer-associated fibroblasts promote bladder cancer progression via angiogenesis and immune modulation: an analysis based on single-cell Transcriptomics
2026-Jan-16, Integrative biology : quantitative biosciences from nano to macro
IF:1.5Q4
DOI:10.1093/intbio/zyag001
PMID:41544201
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析揭示了POSTN+癌症相关成纤维细胞通过促进血管生成和免疫抑制驱动膀胱癌进展的机制 | 首次在膀胱癌中系统性地鉴定并表征了POSTN+ CAFs亚群，揭示了其通过IL1B/IL1R1轴增强CAF-单核细胞通讯并促进免疫抑制微环境的新机制 | 研究主要基于公开数据库的二次分析，实验验证部分仅使用了T24细胞系和CAFs共培养系统，样本量有限且缺乏体内实验验证 | 探究POSTN+癌症相关成纤维细胞在膀胱癌进展中的作用及其分子机制 | 膀胱癌组织样本、癌症相关成纤维细胞、单核细胞、T24膀胱癌细胞系 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序、差异基因表达分析、GSVA、KEGG通路分析、CellChat、NicheNet、TCGA数据分析、细胞划痕实验、侵袭实验 | NA | 单细胞转录组数据、批量转录组数据、实验数据 | 4个膀胱癌样本和4个对照样本的单细胞数据，TCGA数据库的批量转录组数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1294 | 2026-01-18 |
LY6D identifies persistent stem-like cells driving pancreatic tumourigenesis
2026-Jan-16, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2025-336460
PMID:41545197
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，识别了LY6D作为胰腺导管腺癌早期持续存在的干细胞样细胞标志物，并揭示了其在肿瘤发生中的关键驱动作用 | 首次将LY6D识别为连接早期癌前异质性与胰腺导管腺癌发生发展的关键驱动因子，并阐明了其通过脂筏相关激酶网络驱动表观遗传-转录重编程的机制 | 研究主要基于小鼠模型和临床队列数据，需要进一步在人类原代样本中进行功能验证 | 识别和功能表征胰腺导管腺癌中的关键癌前细胞状态，以定义早期干预的新生物标志物和治疗靶点 | 胰腺导管腺癌（PDAC）的早期细胞异质性，特别是LY6D+胃样细胞状态 | 数字病理学 | 胰腺癌 | scRNA-seq, TurboID邻近蛋白质组学, 表观遗传分析, 代谢测定 | NA | 单细胞RNA测序数据, 蛋白质组学数据, 表观遗传数据, 临床队列数据 | 公共和内部胰腺肿瘤模型的scRNA-seq数据，以及人类PDAC队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1295 | 2026-01-18 |
Discovery of disease-associated cellular states using ResidPCA in single-cell RNA and ATAC sequencing data
2026-Jan-15, HGG advances
DOI:10.1016/j.xhgg.2025.100538
PMID:41157948
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研究论文 | 本文介绍了一种名为ResidPCA的稳健方法，用于从单细胞RNA和ATAC测序数据中发现与疾病相关的细胞状态 | ResidPCA通过显式建模细胞类型异质性，在检测跨多种细胞类型表达的状态方面，比传统PCA和非负矩阵分解方法具有更高的准确性 | NA | 推进对单细胞测序数据中疾病相关细胞异质性的理解 | 小鼠视觉皮层细胞和阿尔茨海默病队列的单核数据集 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, 单核ATAC测序 | ResidPCA | 单细胞RNA测序数据, 单核ATAC测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单核ATAC-seq | NA | NA |
| 1296 | 2026-01-17 |
Correction to 'inDrops-2: a flexible, versatile and cost-efficient droplet microfluidic approach for high-throughput scRNA-seq of fresh and preserved clinical samples'
2026-Jan-14, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag009
PMID:41533593
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1297 | 2026-01-18 |
NNMT inhibition counteracts tubular senescence and fibrosis in early stages of chronic kidney disease
2026-Jan-14, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116823
PMID:41543936
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研究论文 | 本文发现NNMT是肾小管衰老和肾纤维化的关键介质，并证明其抑制可减少早期慢性肾病中的衰老和纤维化 | 首次将NNMT鉴定为肾小管衰老和纤维化的关键介质，并通过空间转录组学揭示其在人类活检组织中的表达模式，同时展示选择性NNMT抑制在细胞、类器官和体内模型中的保护作用 | 研究主要基于早期慢性肾病模型，未涉及晚期疾病阶段；体内实验主要在动物模型中进行，人类临床验证有限 | 探索NNMT在慢性肾病肾小管衰老和纤维化中的作用，并评估其作为治疗靶点的潜力 | 人类慢性肾病微阵列、糖尿病肾病活检组织、小鼠模型、肾小管上皮细胞、肾脏类器官 | 数字病理学 | 慢性肾病 | 微阵列、空间转录组学、蛋白质分析 | NA | 转录组数据、蛋白质数据、空间转录组数据 | 人类活检组织、小鼠模型、细胞和类器官样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1298 | 2026-01-18 |
Myeloid-Driven Inflammation Highlights ADGRE2 as a Biomarker in Prurigo Nodularis: Integrated Multi-Omics Analysis
2026-Jan-14, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.12.023
PMID:41544890
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研究论文 | 本研究通过整合多组学分析，揭示了痒疹结节病（PN）中髓系细胞驱动的炎症特征，并鉴定出ADGRE2作为与临床瘙痒严重程度相关的生物标志物 | 首次在蛋白水平上系统比较PN与特应性皮炎（AD），并整合单细胞RNA测序数据，识别出PN特异的髓系富集分子ADGRE2，其表达与瘙痒严重程度显著相关 | 样本量相对有限，且部分数据依赖公开数据集，需要进一步功能验证和更大规模队列研究 | 阐明痒疹结节病的病理机制，特别是在蛋白水平和与特应性皮炎的对比中，寻找潜在的生物标志物和治疗靶点 | 痒疹结节病（PN）、特应性皮炎（AD）患者及健康对照（HC）的皮肤病变组织 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 4D-DIA蛋白质组学、单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组数据、单细胞RNA测序数据 | PN、AD和HC的病变组织样本（具体数量未明确），整合公开数据集如GSE222840 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1299 | 2026-01-18 |
SegJointGene: joint cell segmentation and spatial gene prioritization by information entropy guided convolutional neural networks
2026-Jan-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.08.698474
PMID:41542426
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SegJointGene的深度学习框架，该框架通过整合核图像与空间基因或蛋白质表达数据，联合执行细胞分割和空间基因优先级排序 | SegJointGene创新性地设计了一个信息熵引导的卷积神经网络，并结合计算信息丢弃评分，以识别对细胞类型特异性分割重要的基因，从而迭代优化基因优先级和细胞边界 | NA | 旨在通过整合分子信息改进复杂组织中密集细胞堆积的细胞分割准确性 | 小鼠海马体、全脑不同区域的空间转录组数据以及人类扁桃体的空间蛋白质组数据 | 计算机视觉 | NA | 空间转录组学、空间蛋白质组学 | CNN | 图像、基因表达数据、蛋白质表达数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 1300 | 2026-01-18 |
Single-cell and Bulk RNA-Seq Analyses Reveal TOMM7-mediated Multi-cell Death Mechanisms Driving Muscle-invasive Bladder Cancer Progression
2026-Jan-08, Recent patents on anti-cancer drug discovery
IF:2.5Q3
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研究论文 | 本研究通过单细胞和批量RNA-Seq分析，揭示了TOMM7介导的多细胞死亡机制在肌层浸润性膀胱癌进展中的关键作用 | 整合单细胞与批量RNA-Seq数据，结合机器学习算法构建了基于MIBC相关细胞死亡基因的预后模型，并首次发现TOMM7作为核心基因调控多种细胞死亡通路 | 研究主要基于体外细胞实验和生物信息学分析，缺乏体内动物模型验证，且临床样本队列的多样性和规模可能有限 | 探究肌层浸润性膀胱癌的分子异质性、进展机制及潜在治疗靶点 | 膀胱癌患者样本（特别是肌层浸润性亚型）及T24细胞系 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序，机器学习算法，分子对接分析 | 机器学习算法（未指定具体模型） | RNA-seq数据（单细胞和批量） | 多个患者队列（具体数量未在摘要中说明） | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |