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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1241 2026-04-24
Interferon regulatory factors: the next prospective targets for tissue ischemia-reperfusion injury?
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
综述 系统阐述干扰素调节因子(IRFs)在多系统和器官组织缺血再灌注损伤中的调控机制与研究进展,并提出了“动态调控网络”和“器官-IRF轴”两个创新理论框架 首次提出“动态调控网络”和“器官-IRF轴”两个理论框架,揭示了IRFs功能异质性的分子基础,并前瞻性地提出整合单细胞测序、类器官模型和人工智能预测的未来研究方向 IRFs的潜在调控机制仍需进一步研究和阐明,且存在转化瓶颈的挑战 系统阐述IRFs及其相关通路在组织缺血再灌注损伤中的调控机制和研究进展,从病理生理学和分子生物学角度提供理论基础 干扰素调节因子(IRFs)家族及其在心血管系统、中枢神经系统、肾脏、肝脏和肠道等器官中的生物学功能 自然语言处理 心血管疾病 NA NA 文本 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
1242 2026-04-24
Integrative analysis of transcriptomics, single-cell RNA sequencing, and GraphBAN identifies de novo lipogenesis-associated genes and their potential roles in diabetic retinopathy
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 整合转录组学、单细胞RNA测序和GraphBAN模型,识别了与新生脂肪生成相关的基因及其在糖尿病视网膜病变中的潜在作用 首次结合GraphBAN模型预测基因与化合物相互作用,并在单细胞水平上解析了DC2和经典单核细胞在DR相关通路中的转录活性 该研究为探索性研究,初步发现需进一步验证,且样本量可能有限 识别与新生脂肪生成和糖尿病视网膜病变相关的特征基因,并探索其在疾病发病机制中的作用 糖尿病视网膜病变患者和对照组的血液样本及公开数据库中的转录组和单细胞数据 计算机视觉 糖尿病视网膜病变 RNA-seq, 单细胞RNA测序, RT-qPCR, 分子对接 GraphBAN 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 糖尿病视网膜病变患者与对照组血液样本(具体数量未说明) NA 单细胞RNA测序, 转录组测序 NA NA
1243 2026-04-23
Microglial polarization pathways and therapeutic drugs targeting activated microglia in traumatic brain injury
2026-01-01, Neural regeneration research IF:5.9Q1
综述 本文综述了创伤性脑损伤中,小胶质细胞的起源、分类、动态变化、极化通路以及靶向活化小胶质细胞的治疗药物 系统性地梳理了调控促炎与抗炎小胶质细胞的关键信号通路,并总结了基于这些通路的药物和细胞替代治疗等新兴策略 药物和间充质干细胞治疗策略在应用中仍面临许多挑战,需要进一步研究解决 阐明创伤性脑损伤后小胶质细胞的极化机制,并探索靶向活化小胶质细胞的治疗策略 小胶质细胞及其在创伤性脑损伤中的作用 NA 创伤性脑损伤 单细胞RNA测序,转录组分析 NA NA NA NA NA NA NA
1244 2026-04-23
Changes in border-associated macrophages after stroke: Single-cell sequencing analysis
2026-01-01, Neural regeneration research IF:5.9Q1
研究论文 本研究通过单细胞测序分析,揭示了缺血性中风后边界相关巨噬细胞的动态转录变化及其在神经炎症中的作用 首次对中风后边界相关巨噬细胞进行全面的单细胞转录组分析,揭示了其通过激活肿瘤坏死因子通路参与神经炎症,并发现Stat3信号上调可能成为治疗靶点 研究主要基于小鼠模型和公共数据库的测序数据,其发现需要在人体样本和临床环境中进一步验证 探究中风后边界相关巨噬细胞的转录变化、细胞通讯网络及其在神经炎症中的作用机制 小鼠边界相关巨噬细胞 数字病理学 中风 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 基于GEO数据库中的两个数据集(GSE174574和GSE225948) NA 单细胞RNA-seq NA NA
1245 2026-04-23
The Application of Omics Technologies in Type II Diabetes Mellitus Research
2026, Current diabetes reviews IF:2.4Q3
综述 本文综述了组学技术在2型糖尿病研究中的应用,包括单细胞测序、蛋白质组学和代谢组学的最新进展 整合多组学数据以揭示2型糖尿病的复杂分子网络,并探索其在精准医疗中的应用潜力 未具体说明数据整合的技术挑战或现有研究的样本局限性 探讨组学技术如何推动2型糖尿病的基础研究和临床转化 2型糖尿病的分子机制、生物标志物和治疗靶点 NA 2型糖尿病 单细胞测序、液相色谱-质谱联用技术 NA 多组学数据 NA NA 单细胞RNA-seq、蛋白质组学、代谢组学 NA NA
1246 2026-04-23
Exploring the common ferroptosis-related genes and molecular mechanisms in periodontitis and systemic sclerosis via integrated bioinformatics and experimental analysis
2026, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1
研究论文 本研究通过整合生物信息学和实验分析,探索牙周炎和系统性硬化症之间共同的铁死亡相关基因和分子机制 首次使用双向孟德尔随机化分析评估牙周炎和系统性硬化症的潜在因果关系,并结合多种机器学习算法识别共享枢纽基因,同时进行体外实验验证 研究结果主要基于生物信息学分析和初步实验验证,需要进一步的机制和临床研究来确认 揭示牙周炎和系统性硬化症之间共同的铁死亡相关分子机制 牙周炎和系统性硬化症患者的数据集及铁死亡相关基因 生物信息学 牙周炎和系统性硬化症 双向孟德尔随机化分析、差异表达分析、WGCNA、机器学习算法(LASSO、SVM-RFE、随机森林)、免疫浸润分析、单细胞RNA测序、调控网络分析、药物预测与分子对接、体外实验 LASSO、SVM-RFE、随机森林 基因表达数据 从GEO数据库检索的牙周炎和系统性硬化症基因表达数据集 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1247 2026-04-23
Machine learning approaches for biomarker discovery using single-cell RNA sequencing
2026, Frontiers in bioinformatics IF:2.8Q2
综述 本文全面概述了机器学习方法在单细胞RNA测序数据中用于生物标志物发现的研究现状 系统梳理了机器学习在单细胞转录组学生物标志物发现中的应用方法多样性,包括发现层级、监督学习算法选择、特征选择方法、分类指标和下游生物分析等多个维度 作为综述文章,未提出新的算法或进行实证数据验证,主要侧重于现有方法的归纳总结 为研究人员提供关于机器学习在单细胞RNA测序生物标志物发现领域的完整和详细理解 单细胞RNA测序数据 机器学习 NA 单细胞RNA测序 监督学习算法 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1248 2026-04-23
cGAS inhibitor IMSB301 modifies interferon signalling in peripheral mononuclear cells of SAMHD1 genetic interferonopathy in vitro
2026, Clinical & translational immunology IF:4.6Q2
研究论文 本文通过单细胞RNA测序评估了cGAS抑制剂IMSB301对SAMHD1基因突变患者外周血单个核细胞中干扰素信号通路的调节作用 首次在体外模型中验证了新型临床阶段cGAS抑制剂IMSB301对遗传性干扰素病SAMHD1突变患者免疫细胞的特定干扰素信号通路抑制作用 研究仅基于单个患者样本,样本量有限,且为体外实验,未进行体内验证 评估cGAS抑制剂IMSB301对遗传性干扰素病(Aicardi-Goutières综合征)患者免疫细胞干扰素信号通路的调节潜力 SAMHD1双等位基因致病突变患者的PBMCs与年龄性别匹配的健康对照 单细胞组学 遗传性干扰素病(Aicardi-Goutières综合征) 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 1例SAMHD1突变患者和1例健康对照的PBMCs NA 单细胞RNA-seq NA NA
1249 2026-04-23
Integration of single-cell and bulk transcriptomics reveals the association of manganese metabolism-related genes with prognosis and immune infiltration in lung adenocarcinoma
2026, Clinical & translational immunology IF:4.6Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞和批量转录组数据,揭示了锰代谢相关基因与肺腺癌预后及免疫浸润的关联,并构建了一个基于9个基因的预后特征模型 首次整合单细胞RNA测序和TCGA数据系统研究锰代谢相关基因在肺腺癌中的预后价值,并验证了JQ1与PTMA抑制的协同抗肿瘤效应 研究主要基于回顾性数据,需要前瞻性临床研究进一步验证模型的预测效能和治疗指导价值 探究锰代谢相关基因在肺腺癌预后评估和免疫治疗中的潜在价值 肺腺癌患者 生物信息学 肺癌 单细胞RNA测序,批量RNA测序 Cox回归模型,LASSO回归 转录组数据 TCGA数据库中的肺腺癌样本及单细胞RNA测序数据 NA 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq NA NA
1250 2026-04-23
Multi-Omics Analysis Reveals m7G Methylation-Related Genes May Be Involved in TGF-β Signaling-Mediated Anti-PD-L1 Response in Bladder Cancer
2026, ImmunoTargets and therapy IF:6.2Q1
研究论文 本研究通过多组学分析,揭示了m7G甲基化相关基因可能通过调控TGF-β信号通路参与膀胱癌抗PD-L1免疫治疗的耐药过程 首次整合bulk、单细胞和空间转录组数据,结合机器学习,系统研究了m7G甲基化相关基因在膀胱癌免疫治疗耐药中的作用,并鉴定出关键基因NUDT10 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,实验验证仅限于体外细胞模型,缺乏体内实验和更大规模的临床队列验证 探究m7G甲基化相关基因在膀胱癌免疫治疗耐药中的潜在作用机制 膀胱癌 生物信息学 膀胱癌 多组学分析(转录组学、甲基化分析)、机器学习、siRNA转染、qRT-PCR、Western blot、免疫组化、CCK-8、伤口愈合实验 机器学习模型 转录组数据(bulk、单细胞、空间)、甲基化数据 来自多个公共数据库(TCGA、GEO、IMvigor210)的膀胱癌队列数据,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq NA NA
1251 2026-04-21
Gene editing and multi-omics approaches to study early embryogenesis in cattle
2026-Jan-09, Reproduction, fertility, and development
综述 本文综述了多组学分析和靶向分子功能工具在牛早期胚胎发育研究中的应用与进展 整合了单细胞多组学技术(如scRNA-seq、ATAC-seq)与基因编辑功能工具(如CRISPR-Cas9、碱基编辑),以高分辨率解析牛早期胚胎发育的复杂动态 NA 通过多组学与功能工具的结合,深入理解牛早期胚胎发育机制,以改善牛生育力 牛早期胚胎(第一周胚胎发育阶段) 多组学与发育生物学 生育力障碍 单细胞RNA-seq、单细胞ATAC-seq、代谢组学、蛋白质组学、CRISPR-Cas9、RNA编辑、碱基编辑、Trim-Away NA 多组学数据(转录组、表观基因组、代谢组、蛋白质组) NA NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 代谢组学, 蛋白质组学 NA NA
1252 2026-04-21
CD4+ Effector Memory T Cells Related Marker Gene Signatures in Osteoporosis and Aging: Insight From Single-Cell Analysis and Mendelian Randomization
2026, Combinatorial chemistry & high throughput screening IF:1.6Q3
研究论文 本研究通过整合单细胞数据、孟德尔随机化分析和动物实验,探讨了骨质疏松症与衰老之间的关系及共享分子机制,识别了CD4+效应记忆T细胞作为核心细胞亚群,并揭示了KLRB1、NR4A2和S100A4基因在骨质疏松症发生中的因果作用 首次结合单细胞RNA测序与孟德尔随机化分析,系统性地识别了骨质疏松症和衰老共享的核心细胞亚群(CD4+效应记忆T细胞)及其关键基因(KLRB1、NR4A2、S100A4),并通过动物实验验证了NR4A2的下调,为骨质疏松症的分子靶向和免疫治疗提供了新见解 研究样本可能有限,单细胞数据仅来自外周血,未涉及骨组织或其他相关组织;孟德尔随机化分析依赖于公开的遗传数据,可能存在混杂因素;动物模型的结果需在人类中进一步验证 探讨骨质疏松症与衰老之间的关系及共享分子机制 骨质疏松症患者、衰老个体、健康对照者的外周血单细胞数据,以及大鼠骨质疏松模型 数字病理学 骨质疏松症 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、孟德尔随机化(MR)分析、RT-qPCR NA 单细胞RNA测序数据、遗传数据、基因表达数据 骨质疏松症患者、衰老个体和健康对照者的外周血单细胞数据(具体样本数未明确),以及大鼠骨质疏松模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1253 2026-04-21
Preliminary Study on GZMA- and GSDMB-Associated Pyroptosis and CD8+ T Cell-Mediated Immune Evasion in Skin Cutaneous Melanoma
2026, Current topics in medicinal chemistry IF:2.9Q3
研究论文 本研究基于皮肤黑色素瘤中的细胞焦亡特征,探讨了GZMA和GSDMB相关焦亡及CD8+ T细胞介导的免疫逃逸机制 结合单细胞和批量RNA-seq数据,首次揭示了GZMA在CD8+ T细胞中的特异性过表达及其通过CD99-CD99和HLA-C-KIR2DL3配体-受体对与黑色素细胞的相互作用,为肿瘤免疫逃逸提供了新见解 研究未检测到显著的焦亡相关差异表达基因,且焦亡通路在肿瘤组中未激活,样本来源依赖于公共数据库,实验验证仅限于体外细胞模型 揭示皮肤黑色素瘤基于焦亡特征的潜在发病机制,特别是免疫逃逸过程 皮肤黑色素瘤患者样本及细胞系 生物信息学 皮肤黑色素瘤 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, qRT-PCR, CCK-8, 伤口愈合实验, Transwell实验 NA RNA-seq数据, 临床信息 来自TCGA和GEO数据库的皮肤黑色素瘤患者数据 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
1254 2026-04-21
Single-Cell Maps Reveal Novel Mechanisms of Ferroptosis and Biomarkers in Diabetic Nephropathy
2026, Current medicinal chemistry IF:3.5Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析糖尿病肾病小鼠肾脏组织,筛选了早期诊断生物标志物,并揭示了铁死亡在疾病发展中的新机制 首次在糖尿病肾病病理状态下发现系膜上皮细胞与移行上皮细胞间细胞通讯增强,并揭示了热休克蛋白家族成员通过调控GPX4促进铁死亡经典表型脂质过氧化的新机制 研究结果需要进一步的临床验证才能实现临床转化 在单细胞水平筛选糖尿病肾病的潜在生物标志物并揭示其新的分子发病机制 对照组和糖尿病肾病小鼠的肾脏组织 单细胞组学 糖尿病肾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 对照组和糖尿病肾病小鼠肾脏组织(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
1255 2026-04-21
Construction of an E3 Ubiquitin Ligase Gene Model to Predict the Prognosis of Idiopathic Pulmonary Fibrosis Patients Using Integrated Bioinformatics Analysis
2026, Current medicinal chemistry IF:3.5Q2
研究论文 本研究通过整合生物信息学分析,构建了一个基于E3泛素连接酶基因的风险特征模型,用于预测特发性肺纤维化患者的预后 首次开发了一个基于5个E3泛素连接酶基因(CDCA3、TRIM47、SH3RF1、SPAG16、LONRF3)的预后特征模型,并利用单细胞RNA-seq分析揭示了肺泡上皮细胞与巨噬细胞之间的强相互作用,以及这些基因在IPF中的潜在作用 研究依赖于公开的GEO数据库数据,样本量可能有限,且模型需要进一步在独立队列中进行验证 开发一个基于E3泛素连接酶基因的风险特征模型,以预测特发性肺纤维化患者的预后 特发性肺纤维化患者 生物信息学 特发性肺纤维化 生物信息学分析、LASSO回归、多变量Cox回归分析、功能富集分析、免疫细胞浸润分析、共识聚类分析、单细胞RNA-seq分析、Western blot 预后特征模型 基因表达数据 使用GSE70866数据集,具体样本数量未在摘要中明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1256 2026-04-20
upsML: A high-accuracy machine learning classifier for predicting Plasmodium falciparum var gene upstream groups
2026, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 本文开发了一个名为upsML的高精度机器学习分类器,用于预测恶性疟原虫var基因的上游分组 upsML基于2,530个经过筛选的var基因训练,能基于不同部分基因区域的序列特征准确分配上游分组,在DBLα标签序列上达到83%的准确率,在全长PfEMP1序列上达到92%的准确率,显著优于现有工具 NA 开发一个高精度的机器学习分类器,以改进恶性疟原虫var基因上游分组的预测,从而更好地理解寄生虫生物学和临床结果 恶性疟原虫的var基因家族,特别是其上游分组(upsA、upsB、upsC、upsE) 机器学习 疟疾 RNA-seq 支持向量机、随机森林、XGBoost、HMMER 序列数据 2,530个经过筛选的var基因 NA NA NA NA
1257 2026-04-18
Single cell RNA sequencing analysis and molecular biology experiments identify NAFLD-related fibroblasts and highlights seven hub genes in NAFLD
2026, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析结合分子生物学实验,识别了与非酒精性脂肪肝病相关的成纤维细胞亚群,并鉴定了七个关键基因 首次利用单细胞RNA测序数据结合多种机器学习方法,识别了NAFLD中独特的成纤维细胞亚群及其相关基因,并通过湿实验验证了这些基因的表达差异 研究依赖于公开数据集GSE182365,样本量可能有限,且湿实验验证主要在模型中进行,需要进一步临床验证 探索非酒精性脂肪肝病的发病机制,识别关键的成纤维细胞亚群和相关基因 健康和非酒精性脂肪肝病患者的肝脏样本 数字病理学 非酒精性脂肪肝病 单细胞RNA测序, 高维加权基因共表达网络分析, 机器学习算法, 分子生物学实验 多种机器学习方法 单细胞RNA测序数据 来自GSE182365数据集的健康和非酒精性脂肪肝病患者肝脏样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1258 2026-04-18
Single-Cell Transcriptomics Reveals Riluzole as an Osteoarthritis Candidate Drug via OB-NE Signaling Modulation and CTSS/NOS1 Inhibition
2026, Drug design, development and therapy
研究论文 本研究通过单细胞转录组学分析,揭示了骨关节炎中成骨细胞与中性粒细胞信号通路的关键作用,并利用药物重定位方法鉴定出利鲁唑为潜在治疗药物 首次通过单细胞转录组学结合药物重定位和孟德尔随机化分析,系统揭示了骨关节炎中成骨细胞-中性粒细胞信号轴的作用,并鉴定出利鲁唑通过抑制CTSS/NOS1靶点发挥治疗潜力 样本量相对较小,且需要在临床环境中进行进一步的转化验证 探索骨关节炎的发病机制并寻找潜在的治疗药物 人股骨头组织、三氯卡班诱导的斑马鱼骨关节炎模型 数字病理学 骨关节炎 单细胞RNA测序、孟德尔随机化分析、网络药理学、分子对接、转录组测序 NA 单细胞转录组数据、基因组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1259 2026-04-18
Aflatoxin B1 Impairs TACE Efficacy Through Downregulated Carbonic Anhydrase 2: A Bioinformatics Analysis
2026, International journal of genomics IF:2.6Q2
研究论文 本研究通过整合转录组分析、单细胞RNA测序、免疫浸润分析和分子对接技术,揭示了黄曲霉毒素B1通过下调碳酸酐酶2表达,从而影响肝细胞癌经动脉化疗栓塞疗效的分子机制 首次系统阐明了环境致癌物AFB1对TACE治疗反应的影响机制,并确定了CA2作为连接AFB1暴露与TACE无应答的核心分子,提出了CA2作为潜在生物标志物和基因开关模式的新见解 研究主要基于公共数据库和生物信息学分析,缺乏体内实验验证;样本量有限,且未考虑其他环境致癌物的潜在影响 探究AFB1暴露与肝细胞癌患者对TACE治疗无应答之间的分子机制,并寻找可靠的预测生物标志物 肝细胞癌患者样本、AFB1处理的肝细胞、公共数据库(GSE104580、TCGA-LIHC)中的转录组数据 生物信息学 肝细胞癌 转录组分析、单细胞RNA测序、免疫浸润分析、分子对接 生物信息学分析模型 转录组数据、单细胞RNA测序数据 来自公共数据库GSE104580和TCGA-LIHC的样本,具体数量未明确说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1260 2026-04-18
Meningeal macrophages regulate fibroblasts to influence meningeal lymphatic function following traumatic brain injury
2026, Theranostics IF:12.4Q1
研究论文 本研究揭示了脑膜巨噬细胞通过PDGF-C/PDGFRα轴调控成纤维细胞产生VEGF-C,从而影响脑膜淋巴功能,为创伤性脑损伤后的神经修复提供了新的治疗策略 首次发现并鉴定了一群分泌VEGF-C的脑膜成纤维细胞,并阐明了脑膜常驻巨噬细胞通过PDGF-C调控该细胞群进而影响脑膜淋巴功能的分子机制 研究主要聚焦于TBI早期阶段,对长期影响及在其他神经系统疾病中的普适性仍需进一步探索 探究创伤性脑损伤后脑膜免疫细胞如何调控脑膜淋巴功能 小鼠脑膜中的成纤维细胞和常驻巨噬细胞 单细胞组学 创伤性脑损伤 单细胞RNA测序, 共聚焦显微镜, 流式细胞术 NA 单细胞转录组数据, 图像数据 未明确说明具体样本数量的小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
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