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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1221 | 2026-04-27 |
Distinct diversity of skin cell populations of rhinophyma and hypertrophic scar illustrated by scRNA-seq
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1703469
PMID:41909715
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示酒渣鼻和肥厚性疤痕皮肤细胞群体的独特多样性 | 首次通过单细胞转录组学比较酒渣鼻与肥厚性疤痕的细胞和分子差异,解释为何酒渣鼻术后能恢复正常而不复发疤痕 | 文中未明确提及研究限制 | 利用单细胞测序技术揭示两种病理状态的细胞和分子差异,以解决临床悖论 | 酒渣鼻和肥厚性疤痕组织中的单细胞 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1222 | 2026-04-27 |
Identification and Experimental Verification Reveal SLC2A3 Associated With Prognosis and Immune Infiltration in Colon Adenocarcinoma
2026, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/mi/8383379
PMID:42029110
|
研究论文 | 通过整合转录组分析鉴定与结肠腺癌预后和免疫浸润相关的parthanatos相关基因,并实验验证SLC2A3的作用 | 首次系统表征parthanatos相关基因在结肠腺癌中的分子亚型,构建基于parthanatos的预后评分系统,并实验验证SLC2A3对肿瘤细胞增殖和侵袭的促进作用 | 体外实验发现SLC2A3可能促进结肠腺癌细胞增殖和侵袭,但需要在其他模型中进行验证 | 阐明parthanatos在结肠腺癌中的临床相关性,并提供新的预后评估和治疗靶向框架 | 结肠腺癌患者 | 机器学习 | 结肠腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | 转录组数据 | TCGA和GEO队列的多个样本 | Illumina | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | Illumina NovaSeq | NA |
| 1223 | 2026-04-27 |
Reappraisal of profibrotic phenotype and cell-cycle state of renal tubular epithelium after ischemia-reperfusion injury
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0347835
PMID:42030280
|
研究论文 | 重新评估肾小管上皮细胞在缺血再灌注损伤后的促纤维化表型和细胞周期状态 | 发现肾小管上皮细胞的促纤维化表型并非仅由G2/M期阻滞细胞获得,正常细胞周期中的静息G0/G1期细胞也可获得此表型 | 基于小鼠模型和体外实验,可能不完全代表人类慢性肾病的复杂病理过程 | 探究肾小管上皮细胞在缺血再灌注损伤后促纤维化表型与细胞周期阻滞的关系,并为慢性肾病治疗提供新思路 | 肾小管上皮细胞 | 机器学习 | 慢性肾病 | 单细胞RNA测序、体外细胞实验 | NA | 基因表达数据 | γGT.Fucci2aR小鼠单侧缺血再灌注损伤模型;人肾-2细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 使用公开的小鼠单细胞RNA测序数据 |
| 1224 | 2026-04-25 |
5-FU Resistance Facilitates Immune Evasion in Esophageal Squamous Cell Carcinoma Through ADAM10-Mediated PD-L1 Shedding and Tumour Microenvironment Remodelling
2026-01, Immunology
IF:4.9Q2
DOI:10.1111/imm.70038
PMID:40958168
|
研究论文 | 揭示5-氟尿嘧啶耐药性通过ADAM10介导的PD-L1脱落和肿瘤微环境重塑促进食管鳞状细胞癌免疫逃逸的机制 | 首次发现ADAM10在5-FU耐药食管鳞状细胞癌中显著上调,通过促进可溶性PD-L1释放限制CD8+ T细胞浸润,揭示耐药驱动免疫抑制的新机制 | NA | 阐明5-FU耐药性如何重新编程肿瘤微环境并促进免疫逃逸的分子机制 | 5-FU耐药的AKR小鼠食管鳞状细胞癌细胞系及其亲本对照细胞 | 数字病理学 | 食管鳞状细胞癌 | 第三代DNA测序, 蛋白质组学分析, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据, 蛋白质组数据, 单细胞转录组数据 | 5-FU耐药AKR小鼠ESCC细胞系及亲本细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1225 | 2026-04-25 |
Decoding adenomyosis pathogenesis using an assembloid model
2026-01, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-025-2981-1
PMID:40889046
|
研究论文 | 利用类组装体模型解码子宫腺肌症的发病机制 | 首次建立能模拟月经周期子宫内膜动态的类组装体模型,并通过单细胞转录组学揭示异位细胞在分泌期向管腔优势、腺体缺陷转录谱转变的分子机制,以及BMP/WNT信号通路失衡在疾病中的作用 | 未提及具体局限性 | 构建生理相关的体外模型以研究子宫腺肌症发病机制并探索潜在治疗靶点 | 子宫内膜类组装体模型及其异位病变细胞 | 数字病理学 | 子宫腺肌症 | 单细胞转录组学 | 类组装体 | 单细胞转录组数据 | 未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1226 | 2026-04-25 |
Single-cell multiomics data analysis of potential receptors and therapeutic drugs for epilepsy patients comorbid with depression
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0347526
PMID:42018591
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研究论文 | 通过单细胞多组学数据分析癫痫合并抑郁症的潜在受体和治疗药物,发现Ziprasidone可能通过靶向NLGN3蛋白发挥治疗作用 | 首次从单细胞水平揭示少突胶质前体细胞在癫痫和抑郁症共病中的关键作用,并发现NLGN3-NRXN信号通路是潜在治疗靶点,Ziprasidone通过与NLGN3蛋白稳定结合激活该通路,为共病治疗提供新策略 | 研究数据来源于公共数据集可能引入偏差;药物效果仅通过分子动力学模拟和细胞热稳定性迁移实验验证,缺乏体内动物模型和临床试验进一步确认 | 探索癫痫和抑郁症共病的分子机制并发现潜在治疗药物 | 癫痫患者和重度抑郁症患者的少突胶质前体细胞 | 机器学习 | 癫痫,抑郁症 | 单细胞RNA测序,分子动力学模拟,细胞热稳定性迁移实验 | NA | 单细胞基因表达数据 | 未在摘要中明确提供样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1227 | 2026-04-25 |
Single-Cell Sequencing and Mendelian Randomization Reveal T Cell Nuclear Factor Genes in Hepatocellular Carcinoma Progression
2026, Human mutation
IF:3.3Q2
DOI:10.1155/humu/7446280
PMID:42022794
|
研究论文 | 整合单细胞RNA测序与孟德尔随机化方法揭示T细胞核因子相关基因在肝细胞癌进展中的作用 | 首次将单细胞转录组学与孟德尔随机化相结合,以优先筛选肝细胞癌中NFAT相关因果基因,并构建具有高诊断效能的列线图 | 依赖于公共数据集,可能受样本量和批次效应影响;因果推断基于eQTL数据,需进一步功能验证 | 阐明NFAT相关基因在肝细胞癌进展中的免疫调节机制,并开发早期诊断工具 | 肝细胞癌患者肿瘤组织中的免疫细胞与肿瘤细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序、孟德尔随机化、eQTL分析 | NA | 基因表达数据 | GSE162616数据集(具体样本数未明确),TCGA-LIHC队列 | Illumina | 单细胞RNA测序 | Illumina NovaSeq | GSE162616数据集基于10x Genomics平台进行单细胞RNA测序,但具体配置未在摘要中提供 |
| 1228 | 2026-04-25 |
The Role of Genomics in the Development and Treatment of Multiple Myeloma: Understanding the Challenges and Opportunities
2026, OncoTargets and therapy
IF:2.7Q3
DOI:10.2147/OTT.S595435
PMID:42027619
|
综述 | 综述多发性骨髓瘤基因组学的最新进展及其临床意义 | 系统阐述了关键驱动基因突变、拷贝数变异、表观遗传失调及非编码RNA在多发性骨髓瘤发病机制中的作用,并展望了基因组学指导下的靶向和免疫治疗策略以及液体活检用于微小残留病监测 | NA | 提供多发性骨髓瘤基因组学进展的全面概述,并探讨其临床应用前景 | 多发性骨髓瘤及其基因组异常 | 基因组学 | 多发性骨髓瘤 | 高通量测序, 下一代测序, 单细胞测序, 生物信息学 | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1229 | 2026-04-25 |
Integration of Multi-Omics Data Identifies the Role of the Selenium-Related Gene PNPO and Pre-exhausted CD127- CD8+ T Cells in Laryngeal Carcinoma
2026, Cancer informatics
IF:2.4Q3
DOI:10.1177/11769351261438477
PMID:42027653
|
研究论文 | 通过整合孟德尔随机化、批量转录组和单细胞分析,揭示了硒相关基因PNPO及预耗竭性CD127- CD8+ T细胞在喉癌中的作用 | 首次通过多组学整合分析(孟德尔随机化、批量转录组和单细胞测序)系统阐明了硒相关基因PNPO与喉癌风险及免疫特征之间的因果关系,并发现了一个具有独特分子和功能特征的预耗竭性CD127- CD8+ T细胞亚群 | 需要进一步的机制验证和潜在治疗探索 | 阐明硒指标、硒相关基因与喉癌免疫特征之间的机制联系 | 喉癌患者的肿瘤样本及免疫细胞,包括恶性上皮细胞和CD8+ T细胞 | 机器学习和生物信息学 | 喉癌 | 孟德尔随机化、批量RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | 使用了TCGA和GEO队列数据,以及单细胞RNA测序数据(具体样本数量未提供) | NA | 批量RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1230 | 2026-04-25 |
Monocyte cluster identification during the early stage of fracture healing in an ovariectomized mouse model
2026, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2026.1803265
PMID:42027820
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序分析去卵巢小鼠模型早期骨折愈合过程中的单核细胞亚群 | 首次在骨质疏松性骨折背景下对单核细胞亚群进行详细功能分类,揭示了单核细胞在早期骨折愈合中的高度功能异质性,并阐明了其在炎症反应向组织修复转变中的关键作用 | 研究仅限于小鼠模型,结果可能不完全适用于人类;未深入探讨单核细胞亚群减少的分子机制 | 研究骨质疏松性骨折早期单核细胞亚群的功能及其在骨折愈合中的作用 | 去卵巢(OVX)C57BL/6J小鼠的股骨骨折部位单核细胞 | 数字病理学 | 骨质疏松性骨折 | scRNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | OVX小鼠和假手术对照组小鼠各若干只(具体数量未说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1231 | 2026-04-25 |
The Multiscale Heterogeneity of Adipose Tissue in Health and Disease
2026, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.1261
PMID:42027994
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综述 | 本文提出一个多尺度、基于功能的框架,将脂肪组织异质性转化为精确风险管理和脂肪库靶向治疗,涵盖被忽视的脂肪库并整合单细胞测序发现 | 提出将脂肪异质性转化为精准风险管理和靶向治疗的功能性框架,整合空间转录组学、类器官技术和AI驱动成像分析等新兴技术 | 未明确说明局限性,但作为综述可能受限于现有研究的证据强度和从临床前验证到临床实施的转化瓶颈 | 系统总结脂肪组织异质性的核心特征及其在健康和疾病中的部位特异性作用,并提出转化框架以推动个性化管理 | 脂肪组织异质性(包括血管周围、心外膜和骨髓脂肪组织)及新型细胞亚群 | 机器学习 | 慢性代谢疾病 | 单细胞测序、空间转录组学、类器官技术 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 1232 | 2026-04-24 |
Mesenchymal Stem Cell-Derived Extracellular Vesicles Modulate the Course of Peritoneal Inflammation Through Metabolic and Epigenetic Regulation
2026-Jan, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202508645
PMID:41293953
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研究论文 | 揭示乳酸积累通过组蛋白H3K18乳酰化促进腹膜纤维化的代谢-表观遗传机制,并证明间充质干细胞来源细胞外囊泡可通过调控该通路改善腹膜损伤 | 首次发现乳酸诱导的组蛋白乳酰化在腹膜纤维化中的关键作用,并揭示间充质干细胞来源细胞外囊泡通过代谢-表观遗传调控抑制巨噬细胞招募的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,临床转化仍需进一步验证;未探讨其他可能参与纤维化的代谢通路或细胞类型 | 阐明腹膜纤维化的代谢-表观遗传机制并评估间充质干细胞来源细胞外囊泡的治疗潜力 | 人骨髓间充质干细胞来源细胞外囊泡、小鼠腹膜纤维化模型、腹膜间皮细胞 | 机器学习 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠腹膜纤维化模型(使用氯己定葡萄糖酸盐或腹膜透析液诱导) | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium 单细胞3'测序 |
| 1233 | 2026-04-24 |
Optimized Retinal Cell Dissociation for Downstream Analysis of Cone Photoreceptors
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-5198-8_3
PMID:42020900
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研究论文 | 开发了一种优化的视网膜细胞解离方案,用于下游锥体感光细胞的分子分析 | 提出了一种改进的视网膜细胞解离方法,使用木瓜蛋白酶消化、机械解离和过滤,提高了锥体感光细胞的活性和质量 | 未提及具体限制,但可能包括解离效率对不同视网膜细胞类型的差异及对脆弱细胞的潜在影响 | 开发一种可靠高效的视网膜细胞解离方法,以改善锥体感光细胞的下游分子分析 | 视网膜细胞,特别是锥体感光细胞 | 数字病理学 | 视网膜退行性疾病 | 单细胞测序、转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1234 | 2026-04-24 |
FUNCellA: A Tool for Single-Sample Enrichment Analysis and Relative Pathway Activity Estimation in Single-Cell RNA Sequencing Data
2026, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.34133/csbj.0053
PMID:42021835
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研究论文 | 提出FUNCellA工具,用于单细胞RNA测序数据的单样本富集分析和相对通路活性评估 | 整合7种单样本富集算法与新颖的相对激活阈值方法,利用无监督工具(k-means和高斯混合模型)进行单通路活性向量聚类,实现细胞亚群功能分类 | 未提及具体局限性 | 开发一种针对单细胞RNA测序数据的相对通路活性评分框架,解决数据稀疏性和噪声问题,并支持单通路活性向量聚类以发现亚群 | 单细胞RNA测序数据(包括真实和模拟数据)以及批量RNA测序和微阵列转录组数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq)、批量RNA测序(bulk RNA-Seq)、微阵列 | k-means、高斯混合模型 | 基因表达数据 | 单细胞RNA测序数据集(真实和模拟)、批量RNA测序和微阵列转录组数据 | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 1235 | 2026-04-24 |
Osteopontin-expressing valvular interstitial cell subpopulation as a driver of extracellular matrix remodeling in aortic valve disease
2026, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2026.1755830
PMID:42022532
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研究论文 | 通过生物信息学再分析公开的单细胞RNA测序数据,鉴定出骨桥蛋白表达阳性的瓣膜间质细胞亚群,该亚群通过细胞外基质重塑驱动主动脉瓣疾病进展 | 首次在主动脉瓣疾病中鉴定出Spp1+瓣膜间质细胞亚群,并揭示其通过细胞外基质重构参与早期瓣膜硬化的分子机制 | 研究基于公开数据集的小鼠模型再分析,缺乏人类样本验证和功能实验 | 探究主动脉瓣疾病中致病性瓣膜间质细胞亚群及其细胞间通讯网络 | Apoe-/-和Ldlr-/-小鼠主动脉瓣组织的单细胞转录组数据 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1236 | 2026-04-24 |
From genes to clinical application: a circulating four-gene signature for early diagnosis model of refractory Mycoplasma pneumoniae pneumonia
2026, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2026.1741058
PMID:42022810
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研究论文 | 基于外周血单个核细胞中四个基因标志物建立难治性肺炎支原体肺炎早期诊断模型 | 首次结合单细胞RNA测序与RT-qPCR筛选出四个特异性上调基因(IGHM, NEAT1, IL32, ACTG1)并构建三分类逻辑回归模型,实现难治性肺炎支原体肺炎的早期鉴别诊断 | 研究样本量相对有限,外部验证队列仅54例,且模型基于单一中心数据,可能影响泛化性 | 识别难治性肺炎支原体肺炎的早期诊断生物标志物并构建诊断模型 | 儿童外周血单个核细胞 | 机器学习 | 肺炎支原体肺炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), RT-qPCR | 多项逻辑回归模型 | 基因表达数据 | 349名儿童(117名健康对照,123名普通MPP,109名RMPP),其中8名用于scRNA-seq发现队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1237 | 2026-04-24 |
Integrated profiling of RUNX3 in intratumoral NK cells activity through bulk and single-cell transcriptomic analysis
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1787302
PMID:42023209
|
研究论文 | 通过整体和单细胞转录组分析,探究RUNX3在肿瘤内NK细胞活性中的综合作用 | 首次揭示RUNX3在肿瘤微环境中对NK细胞功能的调控作用,并利用单细胞RNA测序分析其表达与分化的关系 | 研究主要基于公共数据库和体外实验,缺乏体内模型验证,且样本量有限 | 阐明RUNX3在NK细胞介导的抗肿瘤免疫中的生物学作用 | RUNX3基因、NK细胞、肿瘤微环境 | 机器学习 | 肺癌, 肝癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用TCGA数据库的泛癌样本,具体数量未明确 | NA | 单细胞RNA测序, 整体RNA测序 | NA | NA |
| 1238 | 2026-04-24 |
Single cell transcriptomics reveals dendritic cell subsets in bovine afferent lymph and immune cell-resolved responses to BCG vaccination
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1764014
PMID:42023217
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序技术揭示牛传入淋巴树突状细胞亚群及其对BCG疫苗接种的免疫细胞响应 | 首次在牛模型中通过单细胞转录组学系统解析传入淋巴树突状细胞(ALDC)的亚群(cDC1和cDC2)及其对BCG疫苗接种的差异化响应,揭示了亚群特异性基因功能 | 样本量较小(3头牛),且仅关注皮肤引流淋巴结的ALDCs,未涉及其他组织或长期免疫应答 | 探究BCG疫苗接种后牛树突状细胞亚群的转录组变化及其在抗结核免疫中的作用 | 牛传入淋巴树突状细胞(ALDCs)及其他免疫细胞(单核细胞、T细胞、B细胞、NK细胞) | 单细胞转录组学 | 肺结核 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 3头牛,共20,761个细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 1239 | 2026-04-24 |
Integrating bulk, single-cell, and spatial transcriptomics to identify a novel pyroptosis-related gene signature for predicting prognosis and tumor immune landscape in triple-negative breast cancer
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1743222
PMID:42023218
|
研究论文 | 通过整合批量、单细胞和空间转录组学数据,构建一种新的焦亡相关基因特征,用于预测三阴性乳腺癌的预后和肿瘤免疫景观 | 首次结合多组学数据(批量RNA-seq、单细胞RNA-seq和空间转录组学)全面识别三阴性乳腺癌中的焦亡相关基因,并构建预后特征,揭示了这些基因在肿瘤免疫微环境中的细胞和空间异质性 | 未提及 | 开发一种可靠的焦亡相关基因预后特征,用于预测三阴性乳腺癌的预后和免疫景观 | 三阴性乳腺癌患者 | 机器学习 | 乳腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫组化 | LASSO算法 | 转录组数据, 基因表达数据, 空间转录组数据, 图像数据 | 48个临床三阴性乳腺癌样本 | Illumina | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | Illumina NovaSeq | TCGA和GEO数据库中的转录组数据,单细胞RNA测序和空间转录组学平台未明确指定 |
| 1240 | 2026-04-24 |
Acylation modification mediated post-translational modifications learning signature reveals ZDHHC18 promotes progression of lung adenocarcinoma by attenuating immunocyte activation
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1802631
PMID:42023227
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研究论文 | 该研究构建了酰化修饰(AM)学习签名AM.score,并发现ZDHHC18通过减弱免疫细胞激活促进肺腺癌进展 | 首次整合12种酰化修饰类型,利用多组学共识聚类和机器学习建立跨癌种免疫治疗预测评分系统,并验证ZDHHC18作为关键分子靶点的作用 | 具体机制尚未完全阐明,且需更多独立队列验证AM.score的临床适用性 | 探索酰化修饰相关的新型治疗途径,为肺腺癌精准治疗提供预测生物标志物 | 肺腺癌患者及免疫治疗队列,包括1720名患者和8个验证队列 | 机器学习 | 肺腺癌 | 多组学共识聚类、机器学习、单细胞RNA测序、空间转录组学 | AM.score学习签名(基于机器学习算法) | 转录组数据、多组学数据、免疫治疗响应数据 | 1720名肺腺癌患者(主队列)及8个独立队列 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |