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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1181 | 2026-05-02 |
Disulfidptosis-related genes define a prognostic signature and novel therapeutic targets in Ewing's sarcoma through transcriptomic analysis and experimental validation
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1722729
PMID:42064080
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研究论文 | 通过转录组分析和实验验证,鉴定与二硫化物凋亡相关的基因在尤文肉瘤中的预后特征和潜在治疗靶点 | 首次建立与二硫化物凋亡相关的尤文肉瘤预后特征,并通过单细胞RNA测序分析揭示其代谢异质性和微环境相互作用 | 未提及具体限制 | 评估二硫化物凋亡相关基因在尤文肉瘤中的预后意义和潜在治疗靶点 | 尤文肉瘤组织和细胞系(RD-ES细胞) | 数字病理学 | 尤文肉瘤 | 转录组分析,单细胞RNA测序 | Cox回归,LASSO | 基因表达数据 | 分析四个GEO数据集 | Illumina | 单细胞RNA测序 | Illumina NovaSeq | 进行单细胞RNA测序分析 |
| 1182 | 2026-05-02 |
SpatialFinder: a human-in-the-loop vision-language framework for prioritizing high-value regions in spatial transcriptomics
2026, Frontiers in bioinformatics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fbinf.2026.1746714
PMID:42064250
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研究论文 | 提出SpatialFinder框架,结合生物医学视觉语言模型与人在回路优化流程,从常规H&E组织切片中预测基因表达异质性并排序高价值区域,以提高空间转录组学的成本效益 | 首次将视觉语言模型与人机交互优化结合用于空间转录组学中的感兴趣区域优先排序,可在无转录组数据的情况下仅凭H&E图像识别高信息区域,并支持临床医生自定义微环境偏好 | 评估仅在Visium HD组织的四种类型上进行,可能需进一步验证其他平台和组织的普遍适用性;研究中未涉及真实临床场景的长期经济性评估 | 开发一种经济有效的空间转录组学分析框架,通过优先分析高价值感兴趣区域降低实验成本,同时保持生物学发现能力 | 四种Visium HD组织类型的H&E组织切片及其空间转录组数据 | 计算机视觉、自然语言处理、数字病理学 | 未明确指定疾病类型,涉及通用组织微环境研究 | 空间转录组学(Space Transcriptomics)、H&E染色、视觉语言模型(VLM) | 生物医学视觉语言模型 | 组织切片图像(H&E染色)、空间转录组表达数据 | 四种Visium HD组织类型,具体样本数未在摘要中说明 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium HD | 10x Visium HD空间转录组学平台 |
| 1183 | 2026-05-02 |
Cisplatin resistance in oral squamous cell carcinoma: mechanisms, reversal strategies, and emerging technologies
2026, Frontiers in physiology
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fphys.2026.1790855
PMID:42064548
|
综述 | 系统审查了口腔鳞状细胞癌中顺铂耐药的多维机制及克服耐药性的策略 | 整合纳米技术、免疫疗法、代谢靶向、类器官模型、单细胞技术和人工智能等新兴研究范式,提出克服顺铂耐药的个性化联合疗法 | 综述未涵盖临床前到临床转化的具体挑战和成本效益分析 | 阐明口腔鳞状细胞癌中顺铂耐药的机制并探索逆转策略 | 口腔鳞状细胞癌中的耐药细胞及其微环境 | 机器学习 | 口腔癌 | 单细胞测序 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1184 | 2026-05-02 |
Integrating bulk RNA-seq and ScRNA-seq to identify manganese metabolism-related subtypes and immunoregulatory mechanisms in liver hepatocellular carcinoma
2026-Jan, Open life sciences
IF:1.7Q3
DOI:10.1515/biol-2025-1298
PMID:42064840
|
研究论文 | 整合批量RNA-seq和单细胞RNA-seq数据,识别肝细胞癌中锰代谢相关亚型及免疫调控机制 | 首次将锰代谢基因与肝细胞癌亚型分类和预后模型相结合,利用单细胞数据分析免疫细胞通讯 | 未明确提及外部验证或机制实验验证,可能依赖公共数据库的回顾性分析 | 研究锰代谢在肝细胞癌中的分子亚型及免疫调控机制,以指导精准诊断和免疫治疗 | 肝细胞癌肿瘤样本(来自TCGA和GEO数据库) | 自然语言处理, 机器学习, 数字病理学 | 肝癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | LASSO, 多变量Cox回归 | 基因表达数据 | TCGA和GEO数据库中的多个肝细胞癌样本(具体数量未提及) | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1185 | 2026-05-02 |
Integrative Machine Learning and Experimental Validation Identify MYBL2 as a Prognostic Biomarker and Therapeutic Target in Hepatocellular Carcinoma
2026, Oncology research
IF:2.0Q3
DOI:10.32604/or.2026.075284
PMID:42065054
|
research paper | 通过整合机器学习和实验验证,确定MYBL2作为肝细胞癌的预后生物标志物和治疗靶点 | 系统验证了MYBL2在肝细胞癌中的临床意义,利用多种机器学习及实验技术,并揭示了miR-29a对MYBL2的调控机制 | 研究主要基于公开数据集和有限体外实验,临床应用验证不足 | 验证MYBL2在肝细胞癌中的临床意义,阐明其功能及上游调控机制 | 肝细胞癌样本、细胞系及小鼠模型 | machine learning | liver cancer | RNA-seq, single-cell transcriptomics, iTRAQ proteomics, CRISPR knockout | LASSO | transcriptomic data, proteomic data, clinical data | TCGA和GEO队列样本 | Illumina | RNA-seq, single-cell RNA-seq | Illumina NovaSeq | TCGA和GEO平台的RNA-seq数据 |
| 1186 | 2026-05-02 |
Identify MTDH as a Key Gene of Radio-Resistance in Colorectal Cancer Based on Multi-Omics and Experimental Validation
2026, Oncology research
IF:2.0Q3
DOI:10.32604/or.2026.075314
PMID:42065055
|
research paper | 基于多组学和实验验证,确定MTDH为结直肠癌放疗抵抗的关键基因 | 结合14种机器学习算法和SHAP可解释性分析,从多组学数据中识别MTDH与放疗抵抗的关联,并通过单细胞RNA测序和临床样本验证其在恶性二倍体单细胞亚群中的上调表达 | 未提及具体局限性 | 探究MTDH在结直肠癌放疗抵抗中的精确作用机制 | MTDH基因及其在结直肠癌放疗抵抗中的作用 | machine learning | colorectal cancer | RNA-seq, single-cell RNA sequencing | NA | gene expression data, single-cell transcriptomic data | 82名直肠癌患者的组织样本 | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1187 | 2026-05-02 |
Navigating the Labyrinth of Hepatocellular Carcinoma: Leveraging AI/ML for Precision Oncology
2026, Oncology research
IF:2.0Q3
DOI:10.32604/or.2026.074185
PMID:42065059
|
综述 | 系统评估人工智能与机器学习在肝细胞癌精准肿瘤学中整合多组学数据、识别生物标志物和优化治疗决策的作用 | 创新性提出了AI驱动框架在解码肿瘤微环境相互作用和空间异质性中的转化潜力,特别是结合空间转录组学、数字病理学和单细胞技术的综合策略 | 文中未明确讨论具体局限,但综述性质可能受限于当前AI模型的可解释性、数据标准化及临床验证不足 | 评估AI/ML作为整合工具在肝细胞癌管理中转化高维多组学数据为临床可操作见解的能力 | 肝细胞癌的分子靶点、组合治疗策略、多组学数据(基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学、表观基因组学) | 机器学习 | 肝癌 | NA | NA | 文本、图像(数字病理学)、空间转录组学数据、单细胞数据 | NA | NA | 空间转录组学, 数字病理学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1188 | 2026-05-02 |
CDKN1A/p21 Influences the Survival and Expansion of Breast Cancer Stem Cells after Oxidative Damage
2026, Oncology research
IF:2.0Q3
DOI:10.32604/or.2026.074965
PMID:42065068
|
研究论文 | 本研究探讨了CDKN1A/p21在氧化损伤后乳腺癌干细胞存活与扩增中的作用 | 首次揭示CDKN1A/p21通过直接结合CD44、SPP1和TMSB10启动子调控其表达,影响乳腺癌干细胞存活,为克服治疗耐药和转移提供了新靶点 | 研究主要基于体外三维模型,缺乏体内验证,且未深入探讨p21调控的具体信号通路机制 | 探索CDKN1A/p21在乳腺癌干细胞存活和扩增中的功能及其分子机制 | 乳腺癌干细胞(BCSCs) | 机器学习 | 乳腺癌 | 空间转录组学,染色质免疫沉淀定量PCR | NA | 图像,文本 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学平台用于基因表达谱分析 |
| 1189 | 2026-05-01 |
Single-cell multimodal analysis reveals the dynamic immunopathogenesis of HBV-ACLF progression
2026-Jan-08, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2024-333308
PMID:40841166
|
研究论文 | 单细胞多模态分析揭示HBV-ACLF进展的动态免疫发病机制 | 首次通过单细胞RNA测序和蛋白质组学纵向多组学分析,绘制HBV-ACLF病程中免疫应答的动态轨迹,并识别出具有疾病预后和治疗指导价值的免疫细胞模块 | 未提及具体限制 | 全面描绘HBV相关慢加急性肝衰竭(HBV-ACLF)疾病过程中免疫应答的动态演变 | 45份住院患者(进展/稳定/恢复期HBV-ACLF各6/5/6例)和15例对照(肝硬化、慢性乙肝、健康对照各5例)的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 肝脏疾病, HBV-ACLF | 单细胞RNA测序, 单细胞蛋白质组学 | NA | 单细胞转录组数据, 单细胞蛋白质组数据 | 45份样本(17例患者)和15例对照 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 单细胞蛋白质组学 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序和单细胞蛋白质组学 |
| 1190 | 2026-05-01 |
Reduced Intestinal GLP-1+ Cell Numbers Are Associated With an Inflammation-related Epithelial Metabolic Signature
2026, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2025.101656
PMID:41047099
|
研究论文 | 该研究探讨了肠道炎症中GLP-1+细胞数量减少与上皮代谢特征改变的关系 | 首次揭示GLP-1+细胞减少是肠道炎症的普遍特征,并发现其与上皮细胞代谢重编程相关,而非仅因功能受损 | 尚未明确GLP-1+细胞减少的具体分子机制及因果关系;人类数据仅来自Crohn病患者,未涵盖其他IBD亚型 | 探究肠内分泌细胞特别是GLP-1+细胞在肠道炎症中的作用机制 | 肠内分泌细胞(EECs)中的L细胞及GLP-1+细胞 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序、转录组分析、类器官培养 | NA | 单细胞RNA测序数据、组织切片 | 4种小鼠炎症模型、IL-10缺乏小鼠、ClpPΔIEC小鼠、人类Crohn病患者黏膜活检、人类及小鼠肠道类器官 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 单细胞RNA测序平台(具体产品未在摘要中明确) |
| 1191 | 2026-05-01 |
Integrative single-cell and bulk RNA sequencing unravels the role of ACTN1 in promoting lung cancer with brain metastasis and epidermal growth factor receptor-tyrosine kinase inhibitor resistance
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1738641
PMID:42058147
|
研究论文 | 整合单细胞和批量RNA测序揭示ACTN1在促进肺癌脑转移及EGFR-TKI耐药中的作用 | 首次通过整合scRNA-seq和批量RNA测序构建肺癌脑转移微环境图谱,并识别出ACTN1+上皮细胞亚群与EGFR-TKI耐药和脑转移的关联 | 基于公开数据集,可能未完全涵盖所有患者异质性;体外实验需进一步在体内模型中验证 | 探讨ACTN1在肺癌脑转移和EGFR-TKI耐药中的功能及机制 | 肺癌脑转移病灶中的肿瘤微环境细胞及EGFR-TKI耐药的肺癌细胞系 | 数字病理学,机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序,高维加权基因共表达网络分析,机器学习 | NA | 基因表达数据 | 整合公开的scRNA-seq数据集及细胞系样本 | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 1192 | 2026-05-01 |
LGMN+ macrophage promotes the formation of a tumor-supportive microenvironment in gastric cancer
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1810794
PMID:42058204
|
研究论文 | 发现LGMN+巨噬细胞通过促进血管生成和建立免疫抑制微环境驱动胃癌进展 | 通过单细胞RNA测序揭示LGMN+巨噬细胞在胃癌中的富集及其与不良预后的关联,并利用巨噬细胞特异性LGMN条件性敲除小鼠证实其促癌机制 | NA | 评估LGMN+巨噬细胞对胃癌进展的影响并阐明其潜在机制 | 胃癌组织中的肿瘤相关巨噬细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 基因敲除 | NA | 基因表达数据 | 公共数据库中的胃癌样本及巨噬细胞特异性LGMN条件性敲除小鼠模型 | Illumina | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | Illumina NovaSeq | NA |
| 1193 | 2026-05-01 |
The AhR-TLR4 axis in non-IgE-mediated Cow's milk allergy: a systematic review with integrated multi-omics corroboration
2026, Frontiers in allergy
IF:3.3Q2
DOI:10.3389/falgy.2026.1789143
PMID:42058623
|
系统综述 | 系统综述结合多组学验证,探究非IgE介导的牛奶蛋白过敏中AhR-TLR4轴的作用及相关生物标志物和治疗策略 | 首次通过系统综述与单细胞RNA测序数据的整合分析,阐明非IgE介导的牛奶蛋白过敏中由肠道菌群失调驱动的AhR-TLR4致病轴,并验证B/E比值作为早期风险分层标志物的潜力 | 纳入研究的异质性可能影响结论的普适性,单细胞RNA测序数据来源为公开数据集且样本量有限 | 阐明非IgE介导的牛奶蛋白过敏中肠道菌群失调驱动的AhR-TLR4致病轴,并评估相关预测性生物标志物和潜在治疗方法 | 0-3岁经医生确诊的非IgE介导的牛奶蛋白过敏婴儿 | 机器学习和生物信息学 | 牛奶蛋白过敏 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、临床数据 | 39项研究汇总,单细胞RNA测序整合分析基于公开数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1194 | 2026-05-01 |
Molecular mechanisms underlying psoriasis and depression: an integrated analysis using mendelian randomization, transcriptomics, and single-cell sequencing
2026, Frontiers in molecular medicine
DOI:10.3389/fmmed.2026.1770665
PMID:42058679
|
研究论文 | 通过孟德尔随机化、转录组学和单细胞测序的整合分析,探究银屑病与抑郁症共病的分子机制 | 首次整合孟德尔随机化、转录组学和单细胞组学三种方法,系统揭示银屑病与抑郁症共病的共享基因和通路 | 主要基于公开数据库分析,缺乏独立临床样本验证;孟德尔随机化结果需进一步实验验证 | 探究银屑病与抑郁症共病的分子机制,寻找潜在治疗靶点 | 银屑病和抑郁症患者 | 数字病理学 | 银屑病, 抑郁症 | 孟德尔随机化, 转录组学, 单细胞测序 | LASSO回归模型 | eQTL数据, 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1195 | 2026-02-26 |
Single-cell RNA sequencing reveals disease associated changes in brain endothelial cells in the 5XFAD mouse
2026-Jan-30, Fluids and barriers of the CNS
IF:5.9Q1
DOI:10.1186/s12987-026-00766-w
PMID:41618410
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1196 | 2026-04-30 |
Differential Hes1 activation defines neural stem cell lineage commitment and niche maintenance in embryonic and adult mouse cortex
2026-Jan-27, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2511800123
PMID:41557790
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research paper | 利用单细胞转录组学和条件敲除小鼠模型,研究Hes1差异激活在胚胎和成年小鼠皮层神经干细胞谱系特化及生态位维持中的作用 | 首次区分了Notch非依赖性表达Hes1的神经干细胞与Notch依赖性表达的放射状胶质细胞,并证明了NIHes1神经干细胞是产生其他神经前体细胞的祖先前体细胞 | 未明确提及具体限制 | 阐明Hes1差异激活在神经干细胞谱系特化和生态位维持中的功能和机制 | 小鼠胚胎和成年皮层神经干细胞/祖细胞 | machine learning | NA | 单细胞转录组学, 条件敲除小鼠模型 | NA | 单细胞转录组数据, 基因表达数据 | 胚胎和成年小鼠皮层样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1197 | 2026-04-30 |
Indomethacin exerts both cyclooxygenase inhibition-dependent and independent mechanisms to enhance chemo-immunotherapy in mice
2026-Jan-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.07.698231
PMID:41542639
|
研究论文 | 该论文研究了吲哚美辛通过COX抑制依赖和非依赖两种机制增强化疗联合免疫治疗在小鼠模型中的抗肿瘤效果 | 首次揭示吲哚美辛不仅通过抑制COX/PGE2通路增强化疗效果,还能通过抑制肿瘤内在的RAS信号通路发挥COX非依赖的联合增强作用 | 研究仅在小鼠肿瘤模型中进行,缺乏临床试验验证;且对不同肿瘤类型间的效果差异机制尚未完全阐明 | 探究吲哚美辛联合环磷酰胺化疗在多种小鼠肿瘤模型中的抗肿瘤效应及其免疫机制 | CT26、MC38、4T1、A20等多种小鼠肿瘤模型 | 免疫肿瘤学 | 多种癌症(结直肠癌、乳腺癌等) | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多种小鼠肿瘤模型(CT26、MC38、4T1、A20) | 10x Genomics | 单细胞转录组学 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序 |
| 1198 | 2026-04-30 |
Integrated single-cell transcriptomics and proteomics elucidate the molecular mechanisms and detoxification strategy of rifampicin-induced hepatotoxicity
2026, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.109757
PMID:41362738
|
研究论文 | 整合单细胞转录组学和蛋白质组学揭示了利福平诱导肝毒性的分子机制及解毒策略 | 首次结合单细胞RNA测序、批量RNA测序和基于质谱的蛋白质组学与代谢组学,系统揭示利福平诱导肝毒性的区域特异性肝细胞损伤机制,并发现维甲酸具有潜在治疗作用 | 基于小鼠模型,结论向人类转化的适用性需进一步验证 | 阐明利福平诱导肝毒性的细胞和分子机制,并寻找高效低毒的治疗干预措施 | 利福平诱导肝毒性的小鼠模型 | 机器学习 | 肝脏疾病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 质谱蛋白质组学, 代谢组学 | NA | 基因表达数据, 蛋白质组数据, 代谢组数据 | 小鼠肝组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1199 | 2026-04-30 |
Integrated Machine Learning and Multi-Omics Analysis Identifies Mitophagy-Related Core Genes and Mechanisms in Non-Alcoholic Fatty Liver Disease
2026, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S575586
PMID:41907204
|
研究论文 | 通过整合机器学习和多组学分析,系统筛选非酒精性脂肪肝病(NAFLD)中线粒体自噬相关核心基因及其调控网络和免疫微环境机制 | 首次结合11种机器学习算法和SHAP模型可解释性分析,从多转录组和单细胞数据中筛选NAFLD线粒体自噬核心基因,并深入解析其与免疫微环境重塑的关联 | 缺乏大规模临床队列验证,体外实验仅使用细胞模型,未在动物体内验证核心基因功能及靶向治疗潜力 | 阐明NAFLD中线粒体自噬相关核心基因的分子调控网络及其在免疫微环境中的功能机制,为疾病诊断和治疗提供新靶点 | 非酒精性脂肪肝病(NAFLD)患者的转录组数据和单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 非酒精性脂肪肝病 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 生物信息学分析, 机器学习, SHAP模型解释, 分子对接, Western Blot, qRT-PCR, JC-1染色 | WGCNA, 11种机器学习算法, SHAP | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 多个NAFLD转录组数据集(GEO数据库)及单细胞RNA测序数据,具体样本数量未明确 | NA | NA | NA | NA |
| 1200 | 2026-04-30 |
ECM remodeling features in reparative chondrocytes during knee osteoarthritis
2026, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2026.1773139
PMID:42051458
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序数据整合分析,揭示膝关节骨关节炎中修复性软骨细胞的细胞外基质重塑特征 | 首次从伪时间轨迹框架揭示KOA中修复性软骨细胞(RepC)在ECM重塑中的动态变化,并验证FN1和TGF-β1信号对其诱导作用 | 依赖公开数据集,体外实验仅验证部分信号通路,未在体内模型中验证RepC的功能 | 阐明膝关节骨关节炎中修复性软骨细胞的ECM重塑特征及其动态转变机制 | 人类膝关节软骨细胞(对照和KOA样本) | 单细胞转录组学 | 膝关节骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个公开单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |