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当前共找到 1234 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2026-02-08 |
Hist2Cell: Deciphering fine-grained cellular architectures from histology images
2026-Jan-26, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2025.101137
PMID:41592568
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研究论文 | 本研究提出了一种名为Hist2Cell的视觉图-Transformer框架，用于直接从组织学图像中精确解析细粒度细胞类型 | Hist2Cell通过结合视觉和图Transformer技术，提高了单个基因表达预测的准确性，并能预测细粒度转录细胞类型，这是现有方法所缺乏的 | NA | 旨在从组织学图像中预测细胞表型，以支持大规模空间生物学研究和精确癌症预后 | 人类肺癌和乳腺癌数据集，以及大规模癌症基因组图谱（TCGA）队列 | 数字病理学 | 肺癌, 乳腺癌 | 空间转录组学 | 视觉图-Transformer | 组织学图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 102 | 2026-02-08 |
RBM15/IGF2BP3 promotes immune escape in bladder cancer by enhancing m6A modification of PFKFB4
2026-Jan-22, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.150142
PMID:41579989
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研究论文 | 本研究揭示了m6A修饰蛋白RBM15通过IGF2BP3依赖的机制稳定PFKFB4表达，从而促进膀胱癌糖酵解并抑制CD8 T细胞功能，靶向RBM15可增强抗PD1疗法疗效 | 首次阐明RBM15通过m6A-IGF2BP3轴调控PFKFB4的分子机制，并证明其通过调控糖酵解影响肿瘤免疫微环境，为膀胱癌免疫治疗提供新靶点 | 研究主要基于细胞和动物模型，临床样本验证相对有限；RBM15在其他癌症类型中的普适性未充分探讨 | 探究m6A修饰在膀胱癌肿瘤微环境塑造中的作用机制 | 膀胱癌细胞、小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 膀胱癌 | 单细胞测序、空间转录组学、m6A-seq、乳酸化蛋白质组学、RIP-qPCR、MeRIP-qPCR、荧光素酶报告实验 | NA | 单细胞RNA测序数据、空间转录组数据、蛋白质组数据、基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量，涉及细胞系和动物模型 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 103 | 2026-02-08 |
Deciphering the Cellular and Metabolic Landscape of Lymph Node Metastasis in Breast Cancer Using Single-Cell and Spatial Multi-Omics
2026-Jan-22, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2026.01.002
PMID:41580234
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间多组学技术，解析了乳腺癌淋巴结转移的细胞和代谢景观 | 构建了乳腺癌淋巴结转移的单细胞图谱，识别了早期播散癌细胞亚群，揭示了代谢重编程和免疫调节在转移中的作用，并通过计算药物重定位识别了潜在治疗靶点 | 样本量相对有限（78个原发肿瘤及配对淋巴结转移样本），空间转录组学验证仅基于四个淋巴结组织切片，可能影响结果的普适性 | 阐明乳腺癌淋巴结转移的微环境细胞组成、信号网络和分子机制，以指导靶向治疗策略 | 乳腺癌原发肿瘤及其配对的淋巴结转移样本中的细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据，空间转录组学数据 | 78个原发乳腺癌肿瘤及其配对淋巴结转移样本，以及四个淋巴结转移组织切片 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 104 | 2026-02-08 |
Diversity and immune dynamics of choroid plexus macrophages are shaped by distinct developmental origins
2026-Jan-21, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-025-02158-z
PMID:41566006
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学结合谱系和空间追踪方法，揭示了脉络丛巨噬细胞的发育起源、生态位特化和免疫动态 | 首次通过单细胞转录组学识别了三种生物学上不同的脉络丛巨噬细胞亚群，并阐明了它们由不同造血波产生、依赖不同生存因子以及TGFβ信号在维持其身份中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本分析相对有限，可能未完全捕捉到物种间的所有差异 | 探究脉络丛巨噬细胞的多样性、发育起源和免疫功能 | 小鼠和人类的脉络丛巨噬细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞转录组学、谱系追踪、空间追踪方法 | NA | 转录组数据、空间数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 105 | 2026-02-08 |
The vulnerabilities of chemotherapy resistant pancreatic cancer revealed by organoids of pre- and post-neoadjuvant therapy
2026-Jan-19, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2026.218252
PMID:41565051
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研究论文 | 本研究利用新辅助治疗前后的胰腺导管腺癌患者来源类器官，揭示了化疗耐药机制并发现了潜在的治疗靶点 | 建立了匹配的新辅助治疗前后患者来源类器官平台，用于追踪治疗驱动的肿瘤演变，并首次在类器官模型中证实AG化疗会激活KRAS/MAPK信号通路诱导耐药 | 样本量相对有限，类器官模型可能无法完全模拟体内肿瘤微环境的复杂性 | 揭示胰腺导管腺癌化疗耐药的分子机制并寻找潜在治疗靶点 | 胰腺导管腺癌患者来源类器官及患者组织样本 | 癌症生物学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序，转录组分析 | 患者来源类器官，异种移植模型 | 基因表达数据，测序数据 | 患者样本：AG治疗组30例，非治疗组60例；验证队列：29个类器官 | NA | 单细胞RNA测序，转录组测序 | NA | NA |
| 106 | 2026-02-08 |
Engrailed 1 promotes immune evasion and chemoresistance in glioma through single cell and CeRNA network analyses
2026-Jan-09, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-35553-y
PMID:41513764
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量转录组分析、ceRNA网络构建及实验验证，揭示了转录因子EN1在胶质瘤免疫逃逸和化疗耐药中的关键作用 | 首次系统性地将EN1与胶质瘤免疫微环境特征、化疗反应预测联系起来，并构建了一个新的NEAT1/miR-9-5p/miR-128-3p/EN1 ceRNA调控轴来解释其失调机制 | 研究主要基于公共数据库和体外细胞实验，缺乏体内动物模型验证和更大规模的临床队列验证 | 全面研究EN1在胶质瘤中的功能，特别关注其在免疫逃逸和化疗耐药中的作用 | 胶质瘤细胞、公共转录组数据集（TCGA, GTEx, CGGA, GSE182109） | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, ceRNA网络分析, Western blot, CCK-8, Transwell实验 | NA | 转录组数据, 图像, 文本 | 多个公共数据集（TCGA, GTEx, CGGA, GSE182109），具体样本数未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 107 | 2026-02-08 |
Airway immune profiles and therapeutic implications of IGF1 in eosinophilic granulomatosis with polyangiitis
2026-Jan-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-68104-6
PMID:41501017
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序比较了嗜酸性肉芽肿性多血管炎（EGPA）与重度嗜酸性哮喘（SEA）的气道免疫特征，揭示了EGPA中独特的干扰素驱动炎症机制，并发现IGF1巨噬细胞与疾病复发相关，提示IGF1作为潜在治疗靶点 | 首次在EGPA中识别出干扰素驱动的炎症通路，与SEA的TNF主导通路形成对比；发现IL1BMX1中性粒细胞促进三级淋巴结构形成；通过纵向分析揭示IGF1巨噬细胞与疾病复发的关联；在动物模型中验证IGF1阻断可减轻T2炎症 | 研究样本量未明确说明；动物模型结果需在人类临床试验中进一步验证；EGPA与SEA的病理生理差异机制仍需深入探究 | 探究EGPA与SEA的免疫特征差异，识别EGPA特有的炎症机制及潜在治疗靶点 | 嗜酸性肉芽肿性多血管炎（EGPA）和重度嗜酸性哮喘（SEA）患者的气道免疫细胞 | 单细胞组学 | 嗜酸性肉芽肿性多血管炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 108 | 2026-02-08 |
Neuro-epithelial circuits promote sensory convergence and intestinal immunity
2026-Jan-07, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09921-z
PMID:41501470
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研究论文 | 本研究揭示了TRPV1痛觉感受器通过调控上皮簇细胞，启动并驱动针对蠕虫感染的2型免疫和组织适应的神经-上皮环路机制 | 首次发现并阐明了TRPV1痛觉感受器与化学感应上皮簇细胞之间的神经-上皮环路，该环路是启动2型免疫和组织适应的关键上游决定因素，揭示了神经元、上皮细胞和免疫细胞之间复杂感觉输入的协调与整合机制 | NA | 探究神经元、上皮细胞和免疫细胞之间如何协调和整合多样化的感觉输入，以启动和调控针对蠕虫感染的2型免疫反应 | TRPV1痛觉感受器、肠道上皮簇细胞、CGRP神经纤维、上皮祖细胞、蠕虫感染模型 | NA | 蠕虫感染 | 空间转录组学分析、单细胞RNA测序分析 | NA | 空间转录组数据、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 空间转录组学、单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 109 | 2026-02-08 |
Uncovering the role of integrated stress in Alzheimer's disease through single-cell and transcriptomic analysis
2026-Jan-06, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-34997-6
PMID:41495191
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞测序和转录组数据，探索阿尔茨海默病中整合应激反应的分子机制 | 结合LASSO回归和随机森林算法筛选出六个关键基因，并揭示了它们与炎症通路及免疫细胞浸润的关联 | 研究样本量有限，且主要基于公共数据集分析，需要进一步实验验证 | 探索阿尔茨海默病中整合应激反应的分子机制及其临床意义 | 阿尔茨海默病患者和正常对照的脑细胞及血液样本 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞测序, 转录组分析 | LASSO回归, 随机森林 | 基因表达数据 | GSE264648数据集49例，GSE48350数据集253例，另加临床验证样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组测序 | NA | NA |
| 110 | 2026-01-06 |
A pseudouridine-related prognostic model of colorectal cancer based on single-cell sequencing analysis and transcriptome analysis
2026-Jan-04, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-34933-0
PMID:41486187
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 111 | 2026-02-08 |
A human pathophysiological 3D-bone marrow model reveals immune and stromal cell heterogeneity
2026-Jan-03, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-09433-6
PMID:41484482
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研究论文 | 本研究开发了一种标准化的三维人类骨髓模型，用于模拟骨髓微环境的关键特征并研究其生理和病理状态下的细胞动态 | 首次构建了能够模拟人类骨髓微环境异质性的标准化三维模型，并利用单细胞转录组学揭示了基质细胞和内皮细胞的异质性 | 模型仍需进一步验证其在更广泛疾病背景下的适用性，且长期培养效果有待更多数据支持 | 研究人类骨髓微环境中免疫细胞和基质细胞的异质性及其在病理状态下的动态变化 | 骨髓微环境中的基质细胞、内皮细胞、免疫细胞和造血祖细胞 | 单细胞组学 | 急性髓系白血病 | 单细胞转录组测序 | 三维骨髓模型 | 单细胞转录组数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 112 | 2026-02-08 |
ASTRO: Automated Spatial-Transcriptome whole RNA Output
2026-Jan-03, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf688
PMID:41495477
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研究论文 | 本文介绍了一种名为ASTRO的自动化流程，用于处理空间转录组学数据，特别优化了针对FFPE样本的全转录组分析 | 开发了首个专门针对FFPE样本空间转录组数据处理的自动化流程，能够同时检测编码和非编码RNA（如miRNA），并通过优化空间条形码识别和过滤步骤提高映射率 | 未明确说明该流程在其他样本类型或技术平台上的适用性限制 | 解决FFPE样本空间转录组数据分析的挑战，实现全转录组的空间定量分析 | 福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）组织样本 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 自动化数据处理流程 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 113 | 2026-02-08 |
scSNViz: visualization and analysis of cell-specific expressed SNVs
2026-Jan-03, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag023
PMID:41533688
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研究论文 | 介绍了一个名为scSNViz的R包，用于从单细胞RNA测序数据中探索、量化和可视化表达的单核苷酸变异 | 开发了一个专门针对单细胞水平表达SNVs的综合可视化与分析工具，填补了现有工具在单细胞变异表达模式研究方面的空白 | 未在摘要中明确提及具体限制，但可能依赖于现有单细胞分析框架的准确性 | 旨在促进对单细胞水平表达遗传变异的理解，包括转录异质性、等位基因调控和突变动力学 | 单细胞RNA测序数据中的表达单核苷酸变异 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 114 | 2026-02-08 |
Squidiff: predicting cellular development and responses to perturbations using a diffusion model
2026-Jan, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-025-02877-y
PMID:41184550
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研究论文 | 本文介绍了一种基于扩散模型的生成框架Squidiff，用于预测不同细胞类型在环境变化下的转录组变化 | Squidiff通过连续去噪和语义特征集成，学习瞬态细胞状态，并预测跨时间和条件的高分辨率转录组景观 | NA | 预测细胞在环境刺激下的转录组变化，并阐明潜在的疾病机制 | 单细胞转录组数据 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 扩散模型 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 115 | 2026-02-08 |
KRAS Withdrawal in Cholangiocarcinoma Leads to Immune Infiltration and Tumor Regression
2026-Jan, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202511312
PMID:41332325
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研究论文 | 本研究通过构建条件性KRAS基因敲除的胆管癌小鼠模型，揭示了KRAS抑制导致肿瘤显著消退并伴随免疫细胞浸润的机制 | 首次利用转座子系统与CRISPR-Cas9技术构建了条件性TRE.Kras/Trp53敲除胆管癌小鼠模型，并系统揭示了KRAS抑制通过激活CD8 T细胞和诱导细胞衰老导致肿瘤消退的免疫机制 | 研究主要基于小鼠模型，其结论在人类胆管癌中的适用性仍需进一步验证；缺乏长期疗效观察数据 | 探究KRAS抑制在胆管癌治疗中的作用机制及潜在治疗价值 | 条件性KRAS/TP53敲除胆管癌小鼠模型、TKP细胞系 | 肿瘤免疫学 | 胆管癌 | CRISPR-Cas9基因编辑、单细胞RNA测序、bulk RNA测序、免疫组化、共聚焦免疫荧光、细胞因子阵列、慢病毒过表达 | 条件性基因敲除小鼠模型、同种移植模型 | 基因表达数据、免疫染色图像、细胞因子分泌数据 | 未明确说明具体样本数量，但包含小鼠模型和细胞系实验 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 116 | 2026-02-07 |
Parthenolide Alleviates Peritoneal Fibrosis by Blocking Smad2/3 Phosphorylation via Smad Anchor for Receptor Activation
2026-Jan-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202503305R
PMID:41546557
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研究论文 | 本研究揭示了小白菊内酯通过阻断SARA介导的Smad2/3磷酸化来缓解腹膜纤维化的分子机制 | 首次阐明SARA在腹膜透析相关腹膜纤维化中的作用，并发现小白菊内酯通过特异性结合SARA的Pro788和Ser795位点，破坏其与Smad3的相互作用 | 研究主要基于细胞和小鼠模型，临床转化效果需进一步验证 | 探究小白菊内酯缓解腹膜纤维化的分子机制及SARA在其中的作用 | 腹膜透析小鼠模型、TGF-β1诱导的间皮-间质转化模型、CRISPR/Cas9敲除SARA基因的MeT-5A细胞、HMrSV5细胞 | 分子生物学 | 腹膜纤维化 | 单细胞RNA测序、CRISPR/Cas9基因编辑、分子对接、生物素下拉实验、免疫共沉淀 | 动物模型、细胞模型 | 测序数据、蛋白质相互作用数据 | 未明确样本数量，包括小鼠模型、细胞系及临床腹膜透析液样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 117 | 2026-02-07 |
Bulk Sequencing Combined With Single-Cell Sequencing Identifies High Expression of VCAN in Fibroblasts Promoting the Progression of High-Stemness Gastric Adenocarcinoma Cells
2026-Jan-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202502979R
PMID:41555841
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研究论文 | 本研究通过整合bulk测序与单细胞测序，发现成纤维细胞中VCAN高表达促进高干性胃腺癌细胞的进展 | 首次结合bulk测序与单细胞测序揭示VCAN在癌症相关成纤维细胞中的特异性表达及其通过MDK-NCL和MIF-CD74-CD44信号通路促进高干性胃腺癌细胞恶性表型的作用机制 | 研究主要基于数据库分析和体外实验，缺乏体内动物模型验证；信号通路机制尚未完全阐明 | 探究VCAN在胃腺癌中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 胃腺癌组织、癌症相关成纤维细胞、高干性胃腺癌细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | bulk测序, 单细胞测序 | NA | 基因表达数据, 单细胞数据 | 多个数据库的样本（具体数量未明确说明） | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 118 | 2026-02-07 |
Mining Potential Therapeutic Targets for T Cell Exhaustion in Osteoarthritis by Integrating Mendelian Randomization and Single-Cell Sequencing
2026-Jan-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202503295R
PMID:41603583
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研究论文 | 本研究通过整合孟德尔随机化和单细胞测序技术，挖掘骨关节炎中T细胞耗竭的潜在治疗靶点 | 首次结合孟德尔随机化与单细胞测序方法，系统鉴定骨关节炎中T细胞耗竭相关基因作为生物标志物 | 研究依赖于公共数据库数据，未进行独立队列验证实验 | 确定骨关节炎中与T细胞耗竭相关的生物标志物，为治疗和预后提供潜在靶点 | 骨关节炎患者样本数据 | 生物信息学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序，孟德尔随机化分析 | NA | 基因表达数据，单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 119 | 2026-02-07 |
Identification of potential drug targets for Alzheimer's disease from genetic insights: A Mendelian randomization study
2026-Jan-30, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000045715
PMID:41630303
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研究论文 | 本研究通过孟德尔随机化分析，从遗传学角度识别了与阿尔茨海默病相关的潜在血浆蛋白靶点，并预测了候选药物 | 结合孟德尔随机化、蛋白质相互作用网络、分子对接和单细胞测序分析，系统识别AD相关枢纽基因并预测潜在药物 | 依赖于公开的GWAS汇总统计数据，可能受限于样本异质性和潜在混杂因素 | 探索阿尔茨海默病的分子机制并识别潜在药物靶点 | 阿尔茨海默病患者相关的血浆蛋白和基因 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 孟德尔随机化分析、单细胞测序、分子对接 | NA | 基因组关联研究汇总统计数据、单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 120 | 2026-02-07 |
Integrating multi-omic QTLs and predictive models reveals regulatory architectures at immune related GWAS loci in CD4+ T cells
2026-Jan-30, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.64898/2026.01.27.26344979
PMID:41646693
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA-seq和染色质可及性的多组学QTL映射，结合深度学习模型预测的变异效应，揭示了CD4+ T细胞中免疫相关GWAS位点的调控架构 | 首次在CD4+ T细胞中整合多组学QTL数据和深度学习预测模型，系统解析遗传变异的调控机制，并量化了经验检测与预测方法在发现分子QTLs中的差异 | 仅关注CD4+ T细胞，样本量相对有限（362名供体），且深度学习模型仅能解释部分GWAS位点（4.7%） | 解析免疫相关GWAS位点的功能调控机制，提升复杂性状遗传变异的解释能力 | CD4+ T细胞中的遗传变异及其对基因表达和染色质可及性的调控影响 | 机器学习 | 免疫相关疾病 | 单细胞RNA-seq, 染色质可及性分析, QTL映射, 深度学习 | 深度学习模型 | 单细胞RNA-seq数据, 染色质可及性数据 | 362名供体的CD4+ T细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |