单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 1426 篇文献,本页显示第 1161 - 1180 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1161 2026-01-11
Pathogenic role of IFNγ from activated CD4+ T cells in lupus model mice induced by topical treatment with toll-like receptor agonist imiquimod
2026-Jan-06, Clinical and experimental immunology IF:3.4Q3
研究论文 本研究通过局部应用TLR7激动剂咪喹莫特诱导狼疮模型小鼠,揭示了活化的CD4+ T细胞产生的IFNγ在驱动B细胞分化和促进自身抗体产生中的关键致病作用 首次在咪喹莫特诱导的狼疮模型中,结合单细胞RNA测序技术,系统阐明了活化的CD4+ T细胞来源的IFNγ通过促进B细胞分化和自身抗体产生而发挥的关键致病作用 研究主要基于小鼠模型,结果向人类系统性红斑狼疮的直接转化需进一步验证 阐明活化的CD4+ T细胞在系统性红斑狼疮发病机制中的作用 野生型和IFNγ缺陷型小鼠 NA 系统性红斑狼疮 单细胞RNA测序,流式细胞术,共培养实验 NA 单细胞转录组数据,流式细胞数据 野生型和IFNγ缺陷型小鼠 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1162 2026-01-11
Microenvironment-aware spatial modeling for accurate inference of cell identity
2026-Jan-05, Nucleic acids research IF:16.6Q1
研究论文 本文提出了一种名为MEcell的无参数方法,通过整合空间上下文信息来改进细胞身份推断,并在多个空间转录组学平台和组织类型的数据集上验证了其优越性 MEcell方法首次明确整合空间微环境信息,自动调整其对细胞身份建模的贡献,弥补了传统单细胞聚类方法仅依赖内在分子特征的不足 NA 开发一种能够准确推断细胞身份的空间建模方法,以更好地理解细胞在组织中的空间异质性 空间转录组学数据中的细胞身份推断 数字病理学 NA 空间转录组学 MEcell 空间转录组学数据 90个模拟数据集和7个真实数据集,涵盖多种组织类型 Vizgen, 10x Genomics, NanoString, 10x Genomics, Broad Institute, 开放平台 空间转录组学 MERFISH, Xenium, CosMx, Visium HD, Slide-seqV2, open-ST MERFISH/Vizgen, Xenium, CosMx, Visium HD, Slide-seqV2, open-ST
1163 2026-01-11
Illustrating the functional heterogeneity of M-MDSCs to predict sepsis outcomes
2026-Jan-03, Journal of advanced research IF:11.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了脓毒症中单核髓源性抑制细胞的功能异质性,并识别了新的功能标志物以预测疾病预后 首次在脓毒症中基于单细胞RNA测序将M-MDSCs细分为五个功能亚群,并发现VSIG4作为免疫抑制M-MDSCs的新型功能标志物 研究样本量有限,且为初步结果,需要更大规模的验证 探究脓毒症中单核髓源性抑制细胞的功能异质性及其在疾病预后预测中的作用 脓毒症患者的HLA-DRhighCD14+和HLA-DRlowCD14+单核细胞 单细胞组学 脓毒症 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 未明确指定样本数量,但涉及脓毒症患者的单核细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1164 2026-01-11
SpatialRNA: a Python package for easy application of Graph Neural Network models on single-molecule spatial transcriptomics dataset
2026-Jan-02, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 本文介绍了一个名为SpatialRNA的Python软件包,用于在单分子空间转录组学数据集上轻松应用图神经网络模型 开发了一个高度可扩展的工具,能够从组织样本中轻松生成(子)图,并提供了全面的教程,便于在PyG框架下便捷高效地应用GNN模型 NA 旨在促进图神经网络模型在单分子空间转录组学数据中的应用,以识别空间域或生态位 单分子空间转录组学数据集中的RNA分子图 空间转录组学 NA 单分子空间转录组学 图神经网络 空间转录组学数据 NA NA 单分子空间转录组学 NA NA
1165 2026-01-11
Nrf2 deficiency in myeloid cells accelerates atherosclerosis by promoting the inflammatory response and impairing efferocytosis
2026-Jan-02, Journal of advanced research IF:11.4Q1
研究论文 本研究探讨了骨髓细胞中Nrf2缺失通过促进炎症反应和抑制巨噬细胞胞葬作用加速动脉粥样硬化发展的机制 首次在单细胞水平揭示Nrf2在人和小鼠动脉粥样硬化巨噬细胞中的表达上调,并阐明Nrf2通过结合Myh9启动子调控巨噬细胞胞葬作用的新机制 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限;药理学激活NRF2的长期效果和安全性未充分评估 探究骨髓细胞中NRF2在动脉粥样硬化发展中的作用机制 骨髓细胞特异性Nrf2敲除小鼠(ApoE-/-背景)、原代巨噬细胞、细胞系 生物医学研究 心血管疾病 单细胞RNA测序、转录组学、蛋白质组学、染色质免疫沉淀PCR、胞葬作用实验 基因敲除小鼠模型 基因表达数据、蛋白质数据、染色质结合数据 未明确样本数量,但涉及小鼠模型、原代细胞和细胞系实验 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1166 2026-01-11
The Alzheimer's therapeutic Lecanemab attenuates Aβ pathology by inducing an amyloid-clearing program in microglia
2026-Jan, Nature neuroscience IF:21.2Q1
研究论文 本研究揭示了阿尔茨海默病治疗药物Lecanemab通过激活小胶质细胞效应功能清除β-淀粉样蛋白(Aβ)的机制 首次在小鼠模型中证明Lecanemab通过Fc片段激活小胶质细胞,诱导特异性转录程序促进Aβ清除,并鉴定SPP1/骨桥蛋白为关键因子 研究基于人源小胶质细胞异种移植小鼠模型,可能不完全反映人类疾病复杂性;未探讨长期治疗效果或潜在副作用 阐明抗Aβ抗体Lecanemab的作用机制,为优化阿尔茨海默病治疗策略提供依据 人源小胶质细胞异种移植小鼠模型中的Aβ病理及相关神经损伤 神经科学 阿尔茨海默病 单细胞RNA测序、空间转录组学分析 NA 转录组数据、空间转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
1167 2026-01-11
Leveraging single-cell RNA-seq in helminthology
2026-Jan, Trends in parasitology IF:7.0Q1
综述 本文综述了单细胞RNA测序技术在蠕虫学领域的应用,包括其在解析蠕虫细胞异质性、发育生物学、宿主-蠕虫相互作用及免疫病理机制中的作用 系统总结了scRNA-seq在蠕虫学中的革命性应用,并展望了其与单细胞多组学等技术整合的未来潜力 存在一定的技术限制和挑战,需要进一步改进和优化 概述scRNA-seq技术并强调其在蠕虫学研究中的应用 蠕虫(寄生虫)及其与宿主的相互作用 自然语言处理 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA转录本数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1168 2026-01-11
REL overexpression and sustained NF-κB signaling associated with 2p gain induce resistance to BTK inhibitors in Chronic Lymphocytic Leukemia
2026-Jan, Leukemia IF:12.8Q1
研究论文 本研究揭示了慢性淋巴细胞白血病中2号染色体短臂增益通过导致REL过表达和持续NF-κB信号传导,从而介导对布鲁顿酪氨酸激酶抑制剂耐药的机制 首次在单细胞水平上发现2p增益导致REL过表达和NF-κB通路富集,并证明这是独立于BTK/PLCG2突变的BTKi耐药新机制 研究主要基于体外实验和细胞系模型,需要更多临床样本验证;未详细探讨2p增益导致REL过表达的具体分子机制 探究慢性淋巴细胞白血病中2号染色体短臂增益介导BTK抑制剂耐药的分子机制 慢性淋巴细胞白血病患者样本(包括2p增益和非2p增益)和B淋巴样细胞系 单细胞组学 慢性淋巴细胞白血病 单细胞RNA测序,CRISPR/Cas9基因编辑,体外功能实验 NA 单细胞转录组数据,体外实验数据 大量2p原发性CLL样本队列(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
1169 2026-01-11
Axonal Eif5a hypusination controls local translation and mitigates defects in FUS-ALS
2026-Jan, Nature neuroscience IF:21.2Q1
研究论文 本研究应用空间转录组学技术,揭示了轴突局部蛋白合成的调控机制及其在FUS-ALS中的缺陷,并通过恢复Eif5a hypusination来缓解神经退行性病变 首次在成年小鼠运动神经轴突中应用空间转录组学进行亚细胞定位,发现Eif5a hypusination在轴突局部翻译中的关键作用,并证明多胺亚精胺治疗可恢复这一过程并减轻ALS相关毒性 研究主要基于小鼠和果蝇模型,尚未在人类患者中验证;空间转录组学技术可能受限于分辨率和灵敏度 探究神经元局部蛋白合成的调控机制及其在肌萎缩侧索硬化症(ALS)中的失调 成年小鼠运动神经轴突和细胞体,以及携带FUS和TDP-43突变的果蝇模型 空间转录组学 肌萎缩侧索硬化症 空间转录组学,多重单分子空间转录组学,免疫荧光 NA 转录组数据,图像数据 成年小鼠运动神经样本和果蝇模型 NA 空间转录组学 NA NA
1170 2026-01-11
Multi-omics analysis identifies PUS7 as an immune modulator driving NETs-mediated macrophage polarization in pancreatic cancer
2026-Jan, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1
研究论文 本文通过多组学分析揭示了PUS7在胰腺癌中通过诱导中性粒细胞胞外陷阱形成,驱动巨噬细胞向M2表型极化,从而促进免疫抑制和肿瘤进展的新机制 首次将PUS7鉴定为胰腺癌中NET介导的免疫调节关键调控因子,并阐明了PUS7-NET-M2/M1轴这一新的致病机制 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类样本验证有限;PUS7的具体作用靶点和下游信号通路尚未完全阐明 探究伪尿苷合酶家族基因在胰腺癌免疫微环境中的作用机制 胰腺导管腺癌(PDAC)细胞、小鼠原位模型、肿瘤微环境中的免疫细胞 多组学分析 胰腺癌 基因组学、转录组学、单细胞RNA测序 NA 基因组数据、转录组数据、临床数据、单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1171 2026-01-10
SPP1-CD44 signaling contributes to the mechanisms and therapeutic implications in intervertebral disc degeneration
2026-Jan-25, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3
综述 本文综述了SPP1-CD44信号轴在椎间盘退变(IVDD)中的机制及治疗意义 整合了单细胞和空间转录组学等多组学研究,揭示了SPP1-CD44轴在IVDD中的动态、区域特异性表达及其在免疫调节和细胞外基质重塑中的核心作用,并探讨了靶向该轴的新型治疗策略 作为一篇综述,主要基于现有文献进行整合分析,未提供新的原始实验数据,且治疗策略的潜力仍需进一步临床验证 探讨SPP1-CD44信号轴在椎间盘退变发病机制中的作用及其作为治疗靶点的潜力 椎间盘退变(IVDD)的分子调控机制,特别是SPP1-CD44轴 数字病理学 椎间盘退变 单细胞转录组学, 空间转录组学, 免疫调节分析 NA 多组学数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
1172 2026-01-10
Alleviated T cell exhaustion and SLC1A3-mediated stroma-remodelling dictate chemoimmunotherapy efficacy in oesophageal squamous cell carcinoma
2026-Jan-08, Gut IF:23.0Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组学等方法,揭示了化疗联合抗PD-1疗法在食管鳞状细胞癌中的协同增效机制及耐药原因 发现了化疗通过减轻上皮应激肿瘤细胞与CD8+ T细胞间的免疫检查点相互作用(TIGIT-NECTIN2和NECTIN1-CD96)来防止T细胞耗竭,并首次鉴定出高表达SLC1A3的肿瘤细胞亚群通过诱导富含细胞外基质的肿瘤微环境阻碍CD8+ T细胞浸润,导致耐药 研究样本量未明确说明,且机制验证主要在临床样本和小鼠模型中进行,缺乏更大规模的临床队列验证 探究化疗增强免疫检查点阻断疗效的机制,并阐明无应答患者持续耐药的因素 接受化疗联合抗PD-1或抗PD-1单药治疗的食管鳞状细胞癌患者组织样本及小鼠模型 数字病理学 食管鳞状细胞癌 单细胞转录组学、T细胞受体谱分析、多重免疫组化 NA 转录组数据、图像数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1173 2026-01-10
Single-Cell Clonal Lineage Tracing Identifies the Transcriptional Program Controlling the Cell-Fate Decisions by Neoantigen-Specific CD8+ T Cells
2026-Jan-08, Cancer immunology research IF:8.1Q1
研究论文 本研究通过单细胞克隆谱系追踪技术,揭示了新抗原特异性CD8+ T细胞的转录程序如何调控其细胞命运决定,并与癌症患者的临床预后相关 首次结合单细胞转录组和T细胞受体谱分析,系统描绘了新抗原特异性CD8+ T细胞在肿瘤和引流淋巴结中的克隆扩增与分化轨迹,并识别了关键的转录调控程序 研究主要基于小鼠前列腺癌模型,人类临床样本的验证有限,且单细胞技术可能无法完全捕获所有细胞状态 阐明新抗原特异性CD8+ T细胞的转录程序如何控制其细胞命运决定,并探索其与癌症免疫治疗响应的关联 小鼠前列腺癌模型中的新抗原特异性CD8+ T细胞,以及癌症患者的临床样本 单细胞组学 前列腺癌 单细胞转录组测序,T细胞受体谱分析 NA 单细胞RNA-seq数据,T细胞受体序列数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1174 2026-01-10
Mass Spectrometry Imaging Combined With Single-Cell Transcriptional Profiling Reveals the Multidimensional Spatial Distributions and Biosynthetic Pathways of Medicinal Components in Andrographis paniculata
2026-Jan-08, Plant biotechnology journal IF:10.1Q1
研究论文 本研究首次在穿心莲中建立了质谱成像与单细胞RNA测序整合的系统,揭示了药用成分的多维空间分布和生物合成途径 首次在穿心莲中整合质谱成像与单细胞转录组技术,揭示了药用成分在细胞类型特异性中的精细分布和光调控的生物合成机制 研究主要聚焦于穿心莲的叶片和茎组织,可能未涵盖所有药用成分在其他组织中的分布情况 探究药用植物穿心莲中活性成分的精细空间分布和生物合成途径 穿心莲(Andrographis paniculata)的叶片和茎组织 植物代谢组学 NA 质谱成像(MSI)、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、LC-QQQ-MS/MS NA 质谱成像数据、单细胞转录组数据 穿心莲的叶片和茎组织样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1175 2026-01-10
Cellular microenvironment of erythropoietin-producing cells in hypoxic and injured mouse kidneys
2026-Jan-08, Experimental physiology IF:2.6Q2
研究论文 本研究结合空间转录组学、mRNA荧光原位杂交和连续免疫荧光技术,揭示了缺氧和损伤小鼠肾脏中促红细胞生成素产生细胞的微环境特征 首次利用空间转录组学等技术系统表征了活性REP细胞的直接邻域,揭示了其在缺氧和损伤条件下微环境的动态变化 研究仅限于小鼠模型,未在人类样本中验证;技术方法可能受限于空间分辨率 探究调控促红细胞生成素产生的机制 小鼠肾脏中的Norn细胞和肾促红细胞生成素产生细胞 空间转录组学 肾脏疾病 空间转录组学, mRNA荧光原位杂交, 连续免疫荧光 NA 空间转录组数据, 图像数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
1176 2026-01-10
IDH-mutant gliomas arise from glial progenitor cells harboring the initial driver mutation
2026-Jan-08, Science (New York, N.Y.)
研究论文 本研究通过深度测序和空间转录组学分析,确定了IDH突变胶质瘤起源于携带初始驱动突变的胶质祖细胞 首次结合细胞类型特异性突变分析、克隆进化方向、患者大脑空间转录组学和癌症小鼠模型,明确了IDH突变胶质瘤的起源细胞 样本量相对有限(70名患者),且仅针对IDH突变胶质瘤,可能不适用于其他类型脑肿瘤 探究IDH突变胶质瘤的起源细胞,以理解肿瘤进化并开发新治疗方法 IDH突变胶质瘤患者(70名)的肿瘤组织、瘤周皮质、脑室下区和血液样本 数字病理学 胶质瘤 深度测序, 空间转录组学 NA 基因组数据, 转录组数据 70名患者的142个组织样本 NA 空间转录组学 NA NA
1177 2026-01-10
CD73 blockade enhances antitumor efficacy of oHSV in solid tumors by increasing macrophage-mediated antigen presentation
2026-Jan-08, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 本研究探讨了CD73阻断如何通过增强巨噬细胞介导的抗原呈递来提高溶瘤疱疹病毒在实体瘤中的抗肿瘤疗效 揭示了免疫抑制性胞外腺苷信号是溶瘤病毒疗法的主要障碍,并证明CD73阻断可防止肿瘤免疫逃逸,支持了溶瘤病毒与CD73阻断联合策略的临床开发 研究主要基于小鼠模型和患者样本的转录组分析,尚未在大型临床试验中验证联合疗法的安全性和长期疗效 研究免疫抑制性胞外腺苷信号在调节溶瘤疱疹病毒抗肿瘤免疫疗效中的作用 实体瘤模型(包括颅内肿瘤模型)、CD73基因敲除小鼠、患者肿瘤样本 肿瘤免疫学 实体瘤 单细胞RNA测序、流式细胞术免疫表型分析、免疫荧光成像、转录组分析 CD73基因敲除小鼠模型 单细胞RNA测序数据、转录组数据、流式细胞术数据、免疫荧光图像 患者肿瘤样本(治疗前与治疗后)、CD73敲除小鼠与野生型小鼠的肿瘤样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1178 2026-01-10
Single-cell RNA sequencing reveals the therapeutic mechanism of Calvatia lilacina in promoting wound healing of anal fistula
2026-Jan-07, Chinese medicine IF:5.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了紫色秃马勃孢子促进肛瘘伤口愈合的治疗机制 首次从单细胞水平解析了紫色秃马勃孢子通过调节巨噬细胞与成纤维细胞相互作用促进肛瘘伤口愈合的分子机制 样本量较小(仅20例患者),且为单中心研究,需要更大规模的多中心验证 探究紫色秃马勃孢子促进肛瘘伤口愈合的疗效和机制 肛瘘术后患者的肉芽组织样本及小鼠皮肤成纤维细胞 数字病理学 肛瘘 单细胞RNA测序, ELISA, 免疫组化, Western blot, 免疫荧光, 流式细胞术, 细胞共培养 NA 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据, 细胞图像数据 20例肛瘘手术患者 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1179 2026-01-10
Replication stress-inducing ELF3 upregulation promotes BRCA1-deficient breast tumorigenesis in luminal progenitors
2026-Jan-07, eLife IF:6.4Q1
研究论文 本研究揭示了复制应激在BRCA1缺陷型乳腺肿瘤发生中的作用,并阐明了ELF3在促进管腔祖细胞转化中的关键机制 首次通过单细胞测序和RNA-seq技术,揭示了复制应激作为BRCA1缺陷型乳腺肿瘤发生的驱动因素,并发现ELF3在这一过程中的核心调控作用 研究主要基于人类突变乳腺癌样本和BRCA1缺陷的正常乳腺细胞,可能未完全涵盖所有肿瘤亚型或体内微环境的影响 探究BRCA1缺陷型乳腺癌在管腔祖细胞中易转化的原因 人类BRCA1突变乳腺癌样本和BRCA1缺陷的正常乳腺细胞 数字病理学 乳腺癌 单细胞测序, RNA-seq NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
1180 2026-01-10
Integrative multi-omics and radiogenomic profiling decodes NNK-related tumor remodeling and prognostic stratification in pancreatic cancer
2026-Jan-07, International journal of surgery (London, England)
研究论文 本研究通过整合多组学和放射基因组学分析,揭示了烟草特异性致癌物NNK与胰腺癌进展的关系,并开发了一个基于CT的放射组学模型,用于无创解码NNK相关的分子改变 首次将NNK暴露与胰腺癌的分子改变和影像表型联系起来,开发了基于ITGA3的放射组学模型,实现了术前风险分层 研究依赖于回顾性数据,需要前瞻性验证;放射组学模型的泛化能力有待进一步评估 阐明NNK如何促进胰腺癌进展,并开发无创的放射组学模型进行预后分层 胰腺癌患者 放射组学 胰腺癌 单细胞RNA测序,转录组分析,放射组学特征提取 多算法机器学习框架,Cox比例风险模型 CT图像,转录组数据,单细胞RNA测序数据 多个队列的胰腺癌患者,包括TCIA和独立手术队列 NA 单细胞RNA-seq NA NA
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